cobas 4800 CT/NG Test

Transcript

1 cobas 4800 CT/NG Test ΓΙΑ IN VITRO ΔΙΑΓΝΩΣΤΙΚΗ ΧΡΗΣΗ. cobas 4800 System Sample Preparation Kit c4800 SMPL PREP 960 Tests P/N: Tests P/N: cobas 4800 CT/NG Amplification/Detection Kit c4800 CT/NG AMP/DET 960 Tests P/N: Tests P/N: cobas 4800 CT/NG Controls Kit c4800 CT/NG CTLS 10 Sets P/N: cobas 4800 System Control Diluent Kit c4800 CDIL 10 Sets P/N: cobas 4800 System Wash Buffer Kit c4800 WB 960 Tests P/N: Tests P/N: cobas 4800 System Liquid Cytology c4800 LIQ CYT 960 Tests P/N: Preparation Kit 240 Tests P/N: ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Η αγορά του παρόντος προϊόντος επιτρέπει στον αγοραστή τη χρήση του για ενίσχυση και ανίχνευση αλληλουχιών νουκλεϊκών οξέων με αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (PCR) και σχετικές διαδικασίες για in vitro διάγνωση σε δείγματα ανθρώπινης προέλευσης. Διά του παρόντος δεν παρέχεται κανένα δικαίωμα ευρεσιτεχνίας γενικού τύπου ή άλλη άδεια οποιουδήποτε τύπου εκτός από το παρόν ειδικό δικαίωμα χρήσης από την αγορά του προϊόντος. ΠΡΟΒΛΕΠΟΜΕΝΗ ΧΡΗΣΗ Το cobas 4800 CT/NG Test είναι μια in vitro εξέταση ενίσχυσης νουκλεϊκού οξέος για την ποιοτική ανίχνευση του Chlamydia trachomatis (CT) και/ή του Neisseria gonorrhoeae (NG) σε δείγματα ασθενών. Η εξέταση χρησιμοποιεί την ενίσχυση του DNA στόχου με αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (PCR) και υβριδισμό νουκλεϊκού οξέος για την ανίχνευση DNA του Chlamydia trachomatis και του Neisseria gonorrhoeae σε ενδοτραχηλικά δείγματα από στυλεό, κολπικά δείγματα από στυλεό που συλλέγονται από τον ιατρό, κολπικά δείγματα από στυλεό που συλλέγονται από το ίδιο το άτομο κατόπιν οδηγιών του ιατρού, καθώς και ούρα ανδρών και γυναικών σε cobas PCR Μέσα (Roche Molecular Systems, Inc.) και τραχηλικά δείγματα που έχουν συλλεχθεί σε Διάλυμα PreservCyt (Hologic, Inc.). Η παρούσα εξέταση προορίζεται για χρήση ως διαγνωστικό εργαλείο καθώς και ως τεστ ελέγχου σε συμπτωματικό και ασυμπτωματικό πληθυσμό. ΣΥΝΟΨΗ ΚΑΙ ΕΠΕΞΗΓΗΣΗ ΤΗΣ ΕΞΕΤΑΣΗΣ Τα Chlamydia είναι αρνητικά κατά gram, μη κινητικά βακτήρια που υπάρχουν ως υποχρεωτικά ενδοκυτταρικά παράσιτα στα ευκαρυωτικά κύτταρα. Το γένος Chlamydia αποτελείται από τέσσερα αναφερόμενα είδη: C. trachomatis, C. psittaci, C. pecorum και C. pneumoniae (TWAR). Το C. psittaci είναι κυρίως ζωικό παθογόνο και ο παθογόνος ρόλος του C. pecorum δεν είναι σαφής 1. Το C. trachomatis αποτελείται από δεκαπέντε κύριες ορολογικές ποικιλίες που μπορούν να προκαλέσουν νόσο στον άνθρωπο. Η λοίμωξη από Chlamydia trachomatis (CT) είναι το πιο συχνά αναφερόμενο σεξουαλικά μεταδιδόμενο βακτηριακό νόσημα (ΣΜΝ) στις Ηνωμένες Πολιτείες 1,2 και η δεύτερη κυριότερη αιτία σεξουαλικά μεταδιδόμενων νοσημάτων παγκοσμίως με περίπου 89,1 εκατομμύρια περιστατικά ετησίως 2. Σύμφωνα με το Παράρτημα της Έκθεσης Παρακολούθησης Σεξουαλικά Μεταδιδόμενων Νοσημάτων 2008 των Κέντρων Ελέγχου Νοσημάτων (CDC) έχουν αναφερθεί λοιμώξεις από CT σε 50 πολιτείες. 3 Το Εθνικό Πρόγραμμα Εξέτασης Υγείας και Διατροφής των Η.Π.Α. αναφέρει ότι Αμερικανοί πολίτες ηλικίας είναι φορείς του CT 4. Το CT είναι ο αιτιολογικός λοιμώδης παράγοντας για διάφορες νόσους στους άνδρες: ουρηθρίτιδα, πρωκτίτιδα, επιπεφυκίτιδα, επιδιδυμίτιδα και Σύνδρομο Reiter. Στις γυναίκες, οι επιπτώσεις των χλαμυδιακών λοιμώξεων είναι σοβαρές, αν δεν υπάρξει άμεση αντιμετώπιση. Καθώς περίπου οι μισές από αυτές τις λοιμώξεις είναι ασυμπτωματικές, πολλά περιστατικά δεν ανιχνεύονται και δεν αντιμετωπίζονται, με αποτέλεσμα να προκαλούνται πρόσθετα προβλήματα, ειδικά στις εγκύους. Επίσης, αν οι σεξουαλικοί σύντροφοι δεν υποβληθούν σε θεραπεία, παρατηρούνται συχνά επαναλοιμώξεις. 5 Η λοίμωξη από CT μπορεί να προκαλέσει ουρηθρίτιδα, τραχηλίτιδα, πρωκτίτιδα, επιπεφυκίτιδα, ενδομητρίτιδα, σαλπιγγίτιδα (με επακόλουθη στειρότητα ή εκτοπική εγκυμοσύνη) και περιηπατίτιδα. Τα βρέφη από μητέρες που έχουν μολυνθεί μπορεί να εμφανίσουν επιπεφυκίτιδα, φαρυγγίτιδα και πνευμονία. 6 Τα Neisseria gonorrhoeae (γονόκοκκοι) είναι ο αιτιολογικός παράγοντας της γονόρροιας. Τα N. gonorrhoeae είναι αρνητικοί κατά gram διπλόκοκκοι, θετικοί στην οξειδάση κυτοχρώματος, μη κινητικοί και δεν σχηματίζουν σπόρια. Το 2008 αναφέρθηκαν συνολικά περιστατικά λοίμωξης από NG στα Κέντρα Ελέγχου Νοσημάτων 7 και εκτιμάται ότι περισσότερα από άτομα μολύνονται κάθε χρόνο. Μετά από πολλά χρόνια με σταθερά ποσοστά λοιμώξεων, παρατηρήθηκε μείωση 5,4%, με 111,5 περιστατικά ανά άτομα στις Η.Π.Α. από το Οι κλινικές εκδηλώσεις των λοιμώξεων από NG είναι πολυάριθμες. Στους άνδρες, εμφανίζεται οξεία ουρηθρίτιδα μετά από περίοδο επώασης 1-10 ημερών με ουρηθρικό έκκριμα και δυσουρία. 9 Μόνο ένα μικρό ποσοστό των ανδρών παραμένουν ασυμπτωματικοί χωρίς συμπτώματα ουρηθρίτιδας. 10 Η οξεία επιδιδυμίτιδα είναι η πιο συχνή επιπλοκή, ειδικά σε νεαρούς άνδρες. Στις γυναίκες, η κύρια εστία της λοίμωξης είναι ο ενδοτράχηλος. Παρατηρείται υψηλός επιπολασμός συλλοιμώξεων με CT, Trichomonas vaginalis και βακτηριακή κολπίτιδα. Πολλές γυναίκες παραμένουν ασυμπτωματικές και, συνεπώς, δεν υποβάλλονται σε θεραπεία. Τα κύρια συμπτώματα είναι αυξημένο έκκριμα, δυσουρία και αιμορραγία μεταξύ έμμηνων ρύσεων. 11 Στο 10%-20% των γυναικών μπορεί να παρατηρηθεί φλεγμονώδης πυελική νόσος, σε συνδυασμό με ενδομητρίτιδα, σαλπιγγίτιδα, σαλπιγγοωοθηκικό απόστημα, πυελική περιτονίτιδα και περιηπατίτιδα. 12 Άλλες εστίες της γονοκοκκικής λοίμωξης είναι το ορθό, ο φάρυγγας, ο επιπεφυκότας, ενώ η νόσος εμφανίζεται σε μικρότερο βαθμό ως διάχυτη γονοκοκκική λοίμωξη. 13 Τα βρέφη από μητέρες που έχουν μολυνθεί μπορεί να εμφανίσουν επιπεφυκίτιδα. 13 Η ενότητα «Πληροφορίες Αναθεώρησης Εγγράφου» βρίσκεται στο τέλος του παρόντος εγγράφου EL 1 Doc Rev. 9.0

2 Η πιθανή διάγνωση της γονόρροιας βασίζεται: (1) στην παρατήρηση αρνητικών κατά gram ενδοκυτταρικών διπλόκοκκων σε επιχρίσματα gram χρώσης ουρηθρικών εκκριμάτων από άνδρες και ενδοτραχηλικών εκκρίσεων από γυναίκες, (2) στην ανάπτυξη των N. gonorrhoeae από την ουρήθρα (άνδρες) ή τον ενδοτράχηλο σε επιλεγμένα μέσα καλλιέργειας, που συνοδεύεται από την εκδήλωση τυπικής αποικιακής μορφολογίας, δραστηριότητας της θετικής οξειδάσης και τυπικής αρνητικής κατά gram διπλοκοκκικής μορφολογίας και/ή (3) στην ανίχνευση των N. gonorrhoeae με εργαστηριακές εξετάσεις χωρίς καλλιέργεια. Για οριστική διάγνωση της γονόρροιας απαιτείται (1) απομόνωση των Neisseria gonorrhoeae από τις εστίες έκθεσης με καλλιέργεια (καλλιέργειες ωρών σε επιλεγμένο μέσο), εκδήλωση τυπικής αποικιακής μορφολογίας, δραστηριότητας της θετικής οξειδάσης, τυπικής αρνητικής κατά gram μορφολογίας και (2) επιβεβαίωση των απομονωμένων στελεχών καλλιέργειας των N. gonorrhoeae με ειδικές μεθόδους ταυτοποίησης (παραγωγή οξέος από υδατάνθρακες, γρήγορες εξετάσεις ενζύμων, ορολογικές αναλύσεις, εξετάσεις για ειδικό νουκλεϊκό οξύ) Η καλλιέργεια απαιτείται για τον καθορισμό της αντιμικροβιακής ευαισθησίας. Οι προβλεπόμενοι στόχοι για το cobas 4800 CT/NG Test είναι οι δεκαπέντε κύριες ορολογικές ποικιλίες Chlamydia trachomatis, η Σουηδική παραλλαγή C. trachomatis (nvct) και οι αλληλουχίες άγριου τύπου (wild-type) και DR-9 των Neisseria gonorrhoeae. ΒΑΣΙΚΕΣ ΑΡΧΕΣ ΤΗΣ ΔΙΑΔΙΚΑΣΙΑΣ Το cobas 4800 CT/NG Test για Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae βασίζεται σε 2 κύριες διαδικασίες: (1) αυτόματη προετοιμασία δειγμάτων για λήψη νουκλεϊκών οξέων, συμπεριλαμβανομένου DNA των CT και NG, (2) ταυτόχρονη ενίσχυση PCR αλληλουχιών DNA στόχου χρησιμοποιώντας ειδικά ζεύγη συμπληρωματικών εκκινητών CT και NG και ανίχνευση ειδικών διασπώμενων ολιγονουκλεοτιδικών ιχνηθετών ανίχνευσης CT και NG με φθορίζουσα επισήμανση σε πραγματικό χρόνο. Εσωτερικό Πρότυπο Ελέγχου, που περιέχει DNA των CT και NG, προστίθεται σε όλα τα δείγματα κατά την αυτόματη προετοιμασία των δειγμάτων και υποβάλλεται σε ταυτόχρονη ενίσχυση και ανίχνευση με κάθε δείγμα για παρακολούθηση ολόκληρης της διαδικασίας. Η προετοιμασία των δειγμάτων για το cobas 4800 CT/NG Test εκτελείται αυτόματα χρησιμοποιώντας το cobas x 480 όργανο. Τα δείγματα υποβάλλονται σε λύση στη συσκευή συλλογής ή κατά την προετοιμασία του δείγματος από το χαοτροπικό παράγοντα στα cobas PCR Μέσα και το Ρυθμιστικό Διάλυμα Λύσης, αντίστοιχα. Τα απελευθερωμένα νουκλεϊκά οξέα, καθώς και το DNA του Εσωτερικού Προτύπου Ελέγχου CT/NG που έχει προστεθεί, υποβάλλονται σε κάθαρση μέσω απορρόφησης στα μαγνητικά σωματίδια γυαλιού, σε πλύση και τέλος διαχωρίζονται από τα σωματίδια αυτά, ώστε να είναι έτοιμα για ενίσχυση PCR και ανίχνευση. Το αντιδραστήριο Κύριου Μίγματος περιέχει ειδικά ζεύγη εκκινητών και ιχνηθέτες για το DNA κρυπτικού πλασμιδίου του CT, το γενομικό DNA του γονιδίου πρωτεΐνης ompa του CT, το DNA στόχο άγριου τύπου (wild-type) και παραλλαγής του NG εντός της περιοχής DR-9, καθώς και για το DNA του Εσωτερικού Προτύπου Ελέγχου των CT και NG. Ενίσχυση PCR Επιλογή Στόχου Εκτός από το χρωμοσωμικό DNA, το C. trachomatis περιέχει κρυπτικό πλασμίδιο περίπου ζευγών βάσεων που είναι κοινό σε όλες τις ορολογικές ποικιλίες του C. trachomatis. 18,19 Το cobas 4800 CT/NG Test χρησιμοποιεί τους εκκινητές CT CP102 και CP103 για τον προσδιορισμό μιας αλληλουχίας περίπου 206 νουκλεοτιδίων στο DNA κρυπτικού πλασμιδίου του C. trachomatis. Επίσης, το cobas 4800 CT/NG Test χρησιμοποιεί τους εκκινητές CT CTMP101 και CTMP102 για τον προσδιορισμό μιας αλληλουχίας περίπου 182 νουκλεοτιδίων στο χρωμοσωμικό DNA του C. trachomatis. Η τοποθεσία στόχος των N. gonorrhoeae είναι μια περιοχή άμεσης επανάληψης που έχει συντηρηθεί σε μεγάλο βαθμό και ονομάζεται DR-9. Το cobas 4800 CT/NG Test χρησιμοποιεί τους εκκινητές NG NG514 και NG519 για τον προσδιορισμό μιας αλληλουχίας περίπου 190 νουκλεοτιδίων από την περιοχή αυτή. Επιπρόσθετα, το cobas 4800 CT/NG Test χρησιμοποιεί ακόμη ένα σετ εκκινητών NG, τους εκκινητές NG552 και NG579, για τον προσδιορισμό μιας δεύτερης αλληλουχίας περίπου 215 νουκλεοτιδίων που ταυτοποιούνται ως παραλλαγές της συντηρημένης αλληλουχίας από την περιοχή αυτή. Ενίσχυση Στόχου Τα επεξεργασμένα δείγματα προστίθενται στο μίγμα ενίσχυσης σε μια πλάκα μικροβυθισμάτων, στην οποία πραγματοποιείται η ενίσχυση PCR. Το μίγμα αντίδρασης θερμαίνεται για διαχωρισμό του απομονωμένου δίκλωνου DNA και έκθεση των αλληλουχιών στόχων εκκινητή. Καθώς το μίγμα ψύχεται, οι εκκινητές υβριδίζονται στο DNA στόχο. Η Z05 DNA πολυμεράση, με την παρουσία Mn 2+ και πλεονάσματος dntps, επεκτείνει τους υβριδισμένους εκκινητές κατά μήκος των προτύπων στόχων για τη δημιουργία δίκλωνου DNA. Με τον τρόπο αυτό, ολοκληρώνεται ο πρώτος κύκλος της PCR, δημιουργώντας ένα δίκλωνο αντίγραφο DNA των περιοχών στόχων του DNA CT και/ή NG και του DNA Εσωτερικού Προτύπου Ελέγχου CT/NG. Η επανάληψη της διαδικασίας αυτής οδηγεί σε ενίσχυση του DNA μεταξύ των αλληλουχιών στόχων εκκινητή, δημιουργώντας ένα μόριο δίκλωνου DNA που ονομάζεται κλώνος (amplicon). Ο cobas z 480 αναλυτής επαναλαμβάνει αυτόματα τη διαδικασία αυτή για έναν καθορισμένο αριθμό κύκλων, καθένας από τους οποίους προορίζεται για διπλασιασμό του DNA κλώνου (amplicon). Ο απαιτούμενος αριθμός κύκλων προγραμματίζεται εκ των προτέρων στο cobas 4800 Λογισμικό. Η ενίσχυση πραγματοποιείται μόνο στους ειδικούς στόχους CT και/ή NG μεταξύ των αντίστοιχων εκκινητών τους. Δεν ενισχύεται ολόκληρο το κρυπτικό πλασμίδιο ή το γονιδίωμα CT και/ή NG. Ενίσχυση Εσωτερικού Προτύπου Ελέγχου Το Εσωτερικό Πρότυπο Ελέγχου CT/NG είναι ένας συνδυασμός δύο μη μολυσματικών, ανασυνδυασμένων DNA πλασμιδίου, καθένα από τα οποία με περιοχές δέσμευσης εκκινητή πανομοιότυπες με εκείνες των γενομικών αλληλουχιών στόχων είτε του C. trachomatis είτε των N. gonorrhoeae. Και τα δύο ανασυνδυασμένα DNA πλασμιδίου έχουν πανομοιότυπη, τυχαία εσωτερική αλληλουχία στόχου και μια μοναδική περιοχή δέσμευσης ιχνηθέτη που διαφοροποιεί το Εσωτερικό Πρότυπο Ελέγχου CT/NG από τον κλώνο (amplicon) στόχο. Τα χαρακτηριστικά αυτά επιλέχθηκαν ώστε να διασφαλίζεται ανεξάρτητη ενίσχυση του Εσωτερικού Προτύπου Ελέγχου CT/NG και των DNA στόχων των C. trachomatis και N. gonorrhoeae. Το Αντιδραστήριο Εσωτερικού Προτύπου Ελέγχου CT/NG περιλαμβάνεται στο cobas 4800 CT/NG Test και προστίθεται σε κάθε δείγμα στο cobas x 480 όργανο κατά την επεξεργασία των δειγμάτων EL 2 Doc Rev. 9.0

3 Επιλεκτική Ενίσχυση Η επιλεκτική ενίσχυση του νουκλεϊκού οξέος στόχου από το δείγμα επιτυγχάνεται στο cobas 4800 CT/NG Test με τη χρήση του ενζύμου AmpErase (ουρακίλη-n-γλυκοζυλάση) και της τριφωσφορικής δεοξυουριδίνης (dutp). Το ένζυμο AmpErase αναγνωρίζει και καταλύει τη διάσπαση των κλώνων DNA που περιέχουν δεοξυουριδίνη 20, αλλά όχι του DNA που περιέχει δεοξυθυμιδίνη. Η δεοξυουριδίνη δεν απαντάται στο φυσικό DNA, αλλά υπάρχει πάντα στον κλώνο (amplicon) λόγω της χρήσης τριφωσφορικής δεοξυουριδίνης αντί της τριφωσφορικής θυμιδίνης ως ενός από τα dntp του αντιδραστηρίου Κύριου Μίγματος. Για το λόγο αυτό, μόνο οι κλώνοι (amplicon) περιέχουν δεοξυουριδίνη. Η δεοξυουριδίνη καθιστά το μολυσματικό κλώνο (amplicon) ευαίσθητο στη διάσπαση από το ένζυμο AmpErase πριν από την ενίσχυση του DNA στόχου. To ένζυμο AmpErase, που περιλαμβάνεται στο αντιδραστήριο Κύριου Μίγματος, καταλύει τη σχάση του DNA που περιέχει δεοξυουριδίνη στα ιζήματα της δεοξυουριδίνης ανοίγοντας την αλυσίδα της δεοξυριβόζης στη θέση C1. Όταν θερμαίνεται στο πρώτο βήμα θερμοκυκλοποίησης στο αλκαλικό ph του Κύριου Μίγματος, η αλυσίδα DNA του κλώνου (amplicon) διασπάται στη θέση της δεοξυουριδίνης, καθιστώντας το DNA μη ενισχύσιμο. Το ένζυμο AmpErase είναι αδρανές σε θερμοκρασία άνω των 55 C, δηλαδή σε όλα τα βήματα της θερμοκυκλοποίησης και, συνεπώς, δεν καταστρέφει τον κλώνο (amplicon) στόχο. Το cobas 4800 CT/NG Test έχει αποδειχτεί ότι αδρανοποιεί τουλάχιστον 10 3 αντίγραφα κλώνου (amplicon) CT/NG που περιέχουν δεοξυουριδίνη σε κάθε PCR. Ανίχνευση Προϊόντων PCR στο cobas 4800 CT/NG Test Το cobas 4800 CT/NG Test χρησιμοποιεί τεχνολογία PCR πραγματικού χρόνου 21,22. Η χρήση ιχνηθετών με φθορίζουσα επισήμανση επιτρέπει την ανίχνευση της συσσώρευσης προϊόντων PCR σε πραγματικό χρόνο, παρακολουθώντας την ένταση εκπομπής των φθοριζουσών χρωστικών που απελευθερώνονται κατά τη διαδικασία της ενίσχυσης. Οι ιχνηθέτες περιλαμβάνουν ειδικά ολιγονουκλεοτίδια για το κρυπτικό πλασμίδιο CT, την πρωτεΐνη ompa CT, το NG DR-9, το NG DR-9var και το Εσωτερικό Πρότυπο Ελέγχου CT/NG, τα οποία επισημαίνονται με χρωστική αναφοράς (reporter) και παρεμποδιστή (quencher). Όταν οι επισημασμένοι με φθορίζουσα χρωστική ιχνηθέτες είναι ανέπαφοι, ο φθορισμός της χρωστικής αναφοράς (reporter) καταστέλλεται από την εγγύτητα της χρωστικής παρεμποδιστή (quencher) λόγω των φαινομένων μεταφοράς ενέργειας τύπου Förster. Στη διάρκεια της PCR, οι ιχνηθέτες υβριδίζονται στην αντίστοιχη αλληλουχία στόχο και διασπώνται από την 5' έως την 3' δραστηριότητα νουκλεάσης της θερμοσταθερής Z05 DNA πολυμεράσης. Όταν διαχωριστεί η χρωστική αναφοράς (reporter) και ο παρεμποδιστής (quencher), τερματίζεται η παρεμπόδιση και η φθορίζουσα εκπομπή των χρωστικών αναφοράς (reporter) αυξάνεται. Η ενίσχυση των στόχων CT, των στόχων NG και του Εσωτερικού Προτύπου Ελέγχου CT/NG μετρώνται ανεξάρτητα και σε διαφορετικά μήκη κύματος. Η διαδικασία αυτή επαναλαμβάνεται για έναν καθορισμένο αριθμό κύκλων, καθένας από τους οποίους αυξάνει την ένταση εκπομπής των μεμονωμένων χρωστικών αναφοράς (reporter). ΑΝΤΙΔΡΑΣΤΗΡΙΑ cobas 4800 System Sample Preparation Kit Κιτ Προετοιμασίας Δειγμάτων cobas 4800 Συστήματος c4800 SMPL PREP 240 Εξετάσεις (P/N: ) MGP 10 x 4,5 ml (Μαγνητικά Σωματίδια Γυαλιού cobas 4800 Συστήματος) Μαγνητικά σωματίδια γυαλιού 93% Ισοπροπανόλη Xi 93% (w/w) Ισοπροπανόλη Ερεθιστικό F 93% (w/w) Ισοπροπανόλη Πολύ Εύφλεκτο R: , S: /25-26 EB (Ρυθμιστικό Διάλυμα Έκλουσης cobas 4800 Συστήματος) Ρυθμιστικό διάλυμα Τris-HCI 0,09% Αζίδιο του νατρίου 10 x 18 ml EL 3 Doc Rev. 9.0

4 cobas 4800 System Sample Preparation Kit Κιτ Προετοιμασίας Δειγμάτων cobas 4800 Συστήματος (P/N: ) MGP (Μαγνητικά Σωματίδια Γυαλιού cobas 4800 Συστήματος) Μαγνητικά σωματίδια γυαλιού 93% Ισοπροπανόλη Xi 93% (w/w) Ισοπροπανόλη c4800 SMPL PREP 960 Εξετάσεις 10 x 13,5 ml Ερεθιστικό F 93% (w/w) Ισοπροπανόλη Πολύ Εύφλεκτο R: , S: /25-26 EB (Ρυθμιστικό Διάλυμα Έκλουσης cobas 4800 Συστήματος) Ρυθμιστικό διάλυμα Τris-HCI 0,09% Αζίδιο του νατρίου cobas 4800 System Wash Buffer Kit Κιτ Ρυθμιστικού Διαλύματος Πλύσης cobas 4800 Συστήματος (P/N: ) WB (Ρυθμιστικό Διάλυμα Πλύσης cobas 4800 Συστήματος) Διένυδρο κιτρικό νάτριο 0,05% N-μεθυλισοθειαζολόνη-HCl cobas 4800 System Wash Buffer Kit Κιτ Ρυθμιστικού Διαλύματος Πλύσης cobas 4800 Συστήματος (P/N: ) WB (Ρυθμιστικό Διάλυμα Πλύσης cobas 4800 Συστήματος) Διένυδρο κιτρικό νάτριο 0,05% N-μεθυλισοθειαζολόνη-HCl cobas 4800 System Liquid Cytology Preparation Kit Κιτ Προετοιμασίας Κυτταρολογίας Υγρής Φάσης cobas 4800 Συστήματος (P/N: ) PK (cobas 4800 Πρωτεϊνάση Κ) Ρυθμιστικό διάλυμα Τris-HCI EDTA Γλυκερόλη Χλωριούχο ασβέστιο Οξικό ασβέστιο < 2% Πρωτεϊνάση K SDS (Αντιδραστήριο SDS cobas 4800 Συστήματος) Ρυθμιστικό διάλυμα Τris-HCI 0,2% SDS 0,09% Αζίδιο του νατρίου c4800 WB c4800 WB c4800 LIQ CYT 10 x 18 ml 240 Εξετάσεις 10 x 55 ml 960 Εξετάσεις 10 x 200 ml 240 Εξετάσεις 10 x 0,9 ml 10 x 3 ml EL 4 Doc Rev. 9.0

5 LYS (Ρυθμιστικό Διάλυμα Λύσης cobas 4800 Συστήματος) Ρυθμιστικό διάλυμα Τris-HCI 37% (w/w) Γουανιδίνη HCl < 5% πολυδοκανόλη 10 x 10 ml Xn 37% (w/w) Γουανιδίνη HCl Επιβλαβές R: 22-36/38, S: N < 5% Πολυδοκανόλη Επικίνδυνο για το περιβάλλον R: , S: cobas 4800 System Liquid Cytology Preparation Kit Κιτ Προετοιμασίας Κυτταρολογίας Υγρής Φάσης cobas 4800 Συστήματος (P/N: ) PK (cobas 4800 Πρωτεϊνάση Κ) Ρυθμιστικό διάλυμα Τris-HCI EDTA Γλυκερόλη Χλωριούχο ασβέστιο Οξικό ασβέστιο < 2% Πρωτεϊνάση K SDS (Αντιδραστήριο SDS cobas 4800 Συστήματος) Ρυθμιστικό διάλυμα Τris-HCI 0,2% Θειικό δωδεκυλικό νάτριο 0,09% Αζίδιο του νατρίου LYS (Ρυθμιστικό Διάλυμα Λύσης cobas 4800 Συστήματος) Ρυθμιστικό διάλυμα Tris-HCl 37% (w/w) Γουανιδίνη HCl < 5% πολυδοκανόλη c4800 LIQ CYT 960 Εξετάσεις 20 x 1,2 ml 10 x 9 ml 10 x 36 ml Xn 37% (w/w) Γουανιδίνη HCl Επιβλαβές R: 22-36/38, S: N < 5% Πολυδοκανόλη Επικίνδυνο για το περιβάλλον R: , S: cobas 4800 CT/NG Amplification/Detection Kit cobas 4800 Κιτ Ενίσχυσης/Ανίχνευσης CT/NG c4800 CT/NG AMP/DET (P/N: ) CT/NG MMX (cobas 4800 Κύριο Μίγμα CT/NG) Ρυθμιστικό διάλυμα Tricine Οξικό κάλιο Υδροξείδιο του καλίου Γλυκερόλη < 0,01% datp, dctp, dgtp, dutp < 0,01% Νοηματικοί και αντινοηματικοί εκκινητές CT και NG < 0,01% Ιχνηθέτες CT και NG με φθορίζουσα επισήμανση < 0,01% Ιχνηθέτες Εσωτερικού Προτύπου Ελέγχου με φθορίζουσα επισήμανση < 0,01% Ολιγονουκλεοσιδικό απταμερές < 0,10% Z05 DNA πολυμεράσης (μικροβιακό) < 0,10% Ένζυμο AmpErase (ουρακίλη-n-γλυκοζυλάση) (μικροβιακό) 0,09% Αζίδιο του νατρίου 240 Εξετάσεις 10 x 0,5 ml EL 5 Doc Rev. 9.0

6 CT/NG Mn (cobas 4800 Διάλυμα Μαγγανίου CT/NG) < 1,0% Οξικό μαγγάνιο < 0,02% Παγόμορφο οξικό οξύ 0,09% Αζίδιο του νατρίου cobas 4800 CT/NG Amplification/Detection Kit cobas 4800 Κιτ Ενίσχυσης/Ανίχνευσης CT/NG c4800 CT/NG AMP/DET (P/N: ) CT/NG MMX (cobas 4800 Κύριο Μίγμα CT/NG) Ρυθμιστικό διάλυμα Tricine Οξικό κάλιο Υδροξείδιο του καλίου Γλυκερόλη < 0,01% datp, dctp, dgtp, dutp < 0,01% Νοηματικοί και αντινοηματικοί εκκινητές CT και NG < 0,01% Ιχνηθέτες CT και NG με φθορίζουσα επισήμανση < 0,01% Ιχνηθέτες Εσωτερικού Προτύπου Ελέγχου με φθορίζουσα επισήμανση < 0,01% Ολιγονουκλεοσιδικό απταμερές < 0,10% Z05 DNA πολυμεράσης (μικροβιακό) < 0,10% Ένζυμο AmpErase (ουρακίλη-n-γλυκοζυλάση) (μικροβιακό) 0,09% Αζίδιο του νατρίου CT/NG Mn (cobas 4800 Διάλυμα Μαγγανίου CT/NG) < 1,0% Οξικό μαγγάνιο < 0,02% Παγόμορφο οξικό οξύ 0,09% Αζίδιο του νατρίου cobas 4800 System Control Diluent Kit Κιτ Αραιωτικού Ορών Ελέγχου cobas c4800 CDIL 4800 Συστήματος (P/N: ) CDIL (Αραιωτικό Ορών Ελέγχου cobas 4800 Συστήματος) Ρυθμιστικό διάλυμα Τris-HCI 37% Γουανιδίνη HCl Xn 37% (w/w) Γουανιδίνη HCl 10 x 1,5 ml 960 Εξετάσεις 20 x 1,0 ml 10 x 1,5 ml 10 Σετ 10 x 4,3 ml Επιβλαβές R: 22-36/38, S: cobas 4800 CT/NG Controls Kit cobas 4800 Κιτ Ορών Ελέγχου CT/NG c4800 CT/NG CTLS 10 Σετ (P/N: ) CT/NG (+) C 10 x 0,5 ml (cobas 4800 Θετικός Ορός Ελέγχου CT/NG) Ρυθμιστικό διάλυμα Τris-HCI EDTA 0,05% Αζίδιο του νατρίου < 0,002% Poly ra RNA (συνθετικό) < 0,01% Μη μολυσματικό DNA πλασμιδίου (μικροβιακό) που περιέχει αλληλουχίες C. trachomatis < 0,01% Μη μολυσματικό DNA πλασμιδίου (μικροβιακό) που περιέχει αλληλουχίες N. gonorrhoeae ( ) C 10 x 0,5 ml (Αρνητικός Ορός Ελέγχου cobas 4800 Συστήματος) Ρυθμιστικό διάλυμα Τris-HCI EDTA 0,05% Αζίδιο του νατρίου < 0,002% Poly ra RNA (συνθετικό) EL 6 Doc Rev. 9.0

7 CT/NG IC (cobas 4800 Εσωτερικό Πρότυπο Ελέγχου CT/NG) Ρυθμιστικό διάλυμα Τris-HCI EDTA 0,05% Αζίδιο του νατρίου < 0,002% Poly ra RNA (συνθετικό) < 0,01% Μη μολυσματικό DNA πλασμιδίου (μικροβιακό) που περιέχει αλληλουχίες δέσμευσης εκκινητή C. trachomatis και μια μοναδική περιοχή δέσμευσης ιχνηθέτη < 0,01% Μη μολυσματικό DNA πλασμιδίου (μικροβιακό) που περιέχει αλληλουχίες δέσμευσης εκκινητή N. gonorrhoeae και μια μοναδική περιοχή δέσμευσης ιχνηθέτη 10 x 0,3 ml ΠΡΟΕΙΔΟΠΟΙΗΣΕΙΣ ΚΑΙ ΠΡΟΦΥΛΑΞΕΙΣ A. ΓΙΑ IN VITRO ΔΙΑΓΝΩΣΤΙΚΗ ΧΡΗΣΗ. B. Η εξέταση αυτή προορίζεται για χρήση με ενδοτραχηλικά και κολπικά δείγματα από στυλεό που έχουν συλλεχθεί χρησιμοποιώντας το cobas PCR Κιτ Δειγμάτων Γυναικών από Στυλεό, ούρα ανδρών και γυναικών που έχουν συλλεχθεί χρησιμοποιώντας το cobas PCR Κιτ Δειγμάτων Ούρων και τραχηλικά δείγματα που έχουν συλλεχθεί σε διάλυμα PreservCyt. Γ. Μην εκτελείτε αναρρόφηση με πιπέτα από το στόμα. Δ. Απαγορεύεται η κατανάλωση τροφίμων και ποτών και το κάπνισμα στους χώρους εργασίας των εργαστηρίων. Φοράτε προστατευτικά γάντια μίας χρήσης, ποδιές εργαστηρίου και προστατευτικά γυαλιά κατά το χειρισμό δειγμάτων και αντιδραστηρίων των κιτ. Πλένετε καλά τα χέρια σας μετά το χειρισμό δειγμάτων και αντιδραστηρίων εξέτασης. E. Αποφεύγετε τη μόλυνση των αντιδραστηρίων από μικρόβια και DNA. ΣΤ. Η απόρριψη μη χρησιμοποιημένων αντιδραστηρίων και απορριμμάτων πρέπει να γίνεται σύμφωνα με τους κρατικούς και τοπικούς κανονισμούς. Ζ. Μη χρησιμοποιείτε τα αντιδραστήρια μετά την ημερομηνία λήξης τους. H. Μη συνδυάζετε αντιδραστήρια. Θ. Διατίθενται Δελτία Δεδομένων Ασφάλειας (SDS), κατόπιν αιτήματος από τα γραφεία της Roche στην περιοχή σας. Ι. Πρέπει να φοράτε γάντια και να τα αλλάζετε πριν από το χειρισμό δειγμάτων και cobas 4800 αντιδραστηρίων, ώστε να αποφευχθεί τυχόν μόλυνση. ΙΑ. Τα δείγματα πρέπει να αντιμετωπίζονται ως μολυσματικά και ο χειρισμός τους πρέπει να γίνεται με ασφαλείς εργαστηριακές διαδικασίες, όπως αυτές που περιγράφονται στην τεκμηρίωση Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories 23 και στο έγγραφο CLSI M29-A3 24. ΙΒ. Τα cobas PCR Μέσα (από κύρια σωληνάρια δείγματος) και τα LYS και CDIL περιέχουν υδροχλωρική γουανιδίνη. Η υδροχλωρική γουανιδίνη δεν πρέπει να έρθει σε άμεση επαφή με το υποχλωριώδες νάτριο (λευκαντικό) ή με άλλα ιδιαίτερα δραστικά αντιδραστήρια, όπως οξέα ή βάσεις. Tα μείγματα αυτά μπορεί να απελευθερώσουν ένα επιβλαβές αέριο. Σε περίπτωση διαρροής του υγρού που περιέχει υδροχλωρική γουανιδίνη, καθαρίστε με κατάλληλο εργαστηριακό απορρυπαντικό και νερό. Αν το υγρό που έχει διαρρεύσει περιέχει δυνητικά μολυσματικούς παράγοντες, καθαρίστε ΑΡΧΙΚΑ τη μολυσμένη περιοχή με εργαστηριακό απορρυπαντικό και νερό και, στη συνέχεια, με υποχλωριώδες νάτριο 0,5%. ΙΓ. Το MGP περιέχει ισοπροπανόλη και είναι πολύ εύφλεκτο. Φυλάσσετε το προϊόν μακριά από γυμνές φλόγες και περιβάλλον όπου μπορεί να δημιουργηθούν σπινθήρες. ΙΔ. Τα EB, SDS, CT/NG MMX, CT/NG Mn, ( ) C, CT/NG (+) C και CT/NG IC περιέχουν αζίδιο του νατρίου. Το αζίδιο του νατρίου μπορεί να αντιδράσει με το μόλυβδο και το χαλκό των σωληνώσεων και να δημιουργήσει υψηλής εκρηκτικότητας αζίδια μετάλλου. Κατά την απόρριψη διαλυμάτων που περιέχουν αζίδιο του νατρίου στους νεροχύτες των εργαστηρίων, ρίχνετε άφθονη ποσότητα κρύου νερού για να αποφευχθεί η συσσώρευση αζιδίου. ΙΕ. Φοράτε προστατευτικά γυαλιά, ποδιές εργαστηρίου και γάντια μίας χρήσης κατά το χειρισμό αντιδραστηρίων. Αποφεύγετε την επαφή των υλικών αυτών με το δέρμα, τα μάτια ή τους βλεννογόνους. Σε περίπτωση επαφής, ξεπλύνετε αμέσως με άφθονη ποσότητα νερού. Αν δεν υπάρξει άμεση αντιμετώπιση, μπορεί να προκληθούν εγκαύματα. Σε περίπτωση διαρροής αντιδραστηρίου, αραιώστε με νερό πριν το σκουπίσετε. ΙΣΤ. Όλα τα αναλώσιμα στοιχεία προορίζονται για μία χρήση. Μην τα επαναχρησιμοποιείτε. ΙΖ. Μη χρησιμοποιείτε διάλυμα υποχλωριούχου νατρίου (χλωρίνη) για τον καθαρισμό του cobas x 480 οργάνου ή του cobas z 480 αναλυτή. Καθαρίστε το cobas x 480 όργανο ή τον cobas z 480 αναλυτή σύμφωνα με τις διαδικασίες που περιγράφονται στο Εγχειρίδιο Χειριστή του cobas 4800 Συστήματος. ΙΗ. Για επιπλέον προειδοποιήσεις, προφυλάξεις και διαδικασίες σχετικά με τη μείωση του κινδύνου μόλυνσης για το cobas x 480 όργανο ή τον cobas z 480 αναλυτή, ανατρέξτε στο Εγχειρίδιο Χειριστή του cobas 4800 Συστήματος EL 7 Doc Rev. 9.0

8 ΑΠΟΘΗΚΕΥΣΗ ΚΑΙ ΑΠΑΙΤΗΣΕΙΣ ΧΕΙΡΙΣΜΟΥ A. Μην καταψύχετε τα αντιδραστήρια. B. Αποθηκεύετε το Κιτ Προετοιμασίας Δειγμάτων (MGP, EB), το Κιτ Προετοιμασίας Κυτταρολογίας Υγρής Φάσης (PK, SDS, LYS), το Κιτ Ενίσχυσης/Ανίχνευσης CT/NG (CT/NG MMX, CT/NG Mn) και το Κιτ Ορών Ελέγχου CT/NG (CT/NG (+) C, ( ) C και CT/NG IC) στους 2-8 C. Τα αντιδραστήρια αυτά παραμένουν σταθερά μέχρι την αναγραφόμενη ημερομηνία λήξης. Γ. Αποθηκεύετε το Κιτ Ρυθμιστικού Διαλύματος Πλύσης (WB) και το Κιτ Αραιωτικού Ορών Ελέγχου (CDIL) στους C. Τα αντιδραστήρια αυτά παραμένουν σταθερά μέχρι την αναγραφόμενη ημερομηνία λήξης. ΠΑΡΕΧΟΜΕΝΑ ΥΛΙΚΑ A. cobas 4800 System Sample Preparation Kit Κιτ Προετοιμασίας Δειγμάτων cobas 4800 Συστήματος c4800 SMPL PREP 240 Εξετάσεις (P/N: ) MGP (Μαγνητικά Σωματίδια Γυαλιού cobas 4800 Συστήματος) EB (Ρυθμιστικό Διάλυμα Έκλουσης cobas 4800 Συστήματος) Β. cobas 4800 System Sample Preparation Kit Κιτ Προετοιμασίας Δειγμάτων cobas 4800 Συστήματος c4800 SMPL PREP 960 Εξετάσεις (P/N: ) MGP (Μαγνητικά Σωματίδια Γυαλιού cobas 4800 Συστήματος) EB (Ρυθμιστικό Διάλυμα Έκλουσης cobas 4800 Συστήματος) Γ. cobas 4800 System Wash Buffer Kit Κιτ Ρυθμιστικού Διαλύματος Πλύσης cobas c4800 WB 4800 Συστήματος 240 Εξετάσεις (P/N: ) WB (Ρυθμιστικό Διάλυμα Πλύσης cobas 4800 Συστήματος) Δ. cobas 4800 System Wash Buffer Kit Κιτ Ρυθμιστικού Διαλύματος Πλύσης cobas c4800 WB 4800 Συστήματος 960 Εξετάσεις (P/N: ) WB (Ρυθμιστικό Διάλυμα Πλύσης cobas 4800 Συστήματος) E. cobas 4800 System Liquid Cytology Preparation Kit Κιτ Προετοιμασίας Κυτταρολογίας Υγρής Φάσης cobas c4800 LIQ CYT 4800 Συστήματος 240 Εξετάσεις (P/N: ) PK (cobas 4800 Πρωτεϊνάση Κ) SDS (Αντιδραστήριο SDS cobas 4800 Συστήματος) LYS (Ρυθμιστικό Διάλυμα Λύσης cobas 4800 Συστήματος) ΣΤ.cobas 4800 System Liquid Cytology Preparation Kit Κιτ Προετοιμασίας Κυτταρολογίας Υγρής Φάσης cobas 4800 Συστήματος c4800 LIQ CYT 960 Εξετάσεις (P/N: ) PK (cobas 4800 Πρωτεϊνάση Κ) SDS (Αντιδραστήριο SDS cobas 4800 Συστήματος) LYS (Ρυθμιστικό Διάλυμα Λύσης cobas 4800 Συστήματος) Ζ. cobas 4800 CT/NG Amplification/Detection Kit cobas c4800 CT/NG AMP/DET 4800 Κιτ Ενίσχυσης/Ανίχνευσης CT/NG 240 Εξετάσεις (P/N: ) CT/NG MMX (cobas 4800 Κύριο Μίγμα CT/NG) CT/NG Mn (cobas 4800 Διάλυμα Μαγγανίου CT/NG) EL 8 Doc Rev. 9.0

9 Η. cobas 4800 CT/NG Amplification/Detection Kit cobas 4800 Κιτ Ενίσχυσης/Ανίχνευσης CT/NG (P/N: ) CT/NG MMX (cobas 4800 Κύριο Μίγμα CT/NG) CT/NG Mn (cobas 4800 Διάλυμα Μαγγανίου CT/NG) Θ. cobas 4800 System Control Diluent Kit Κιτ Αραιωτικού Ορών Ελέγχου cobas 4800 Συστήματος (P/N: ) CDIL (Αραιωτικό Ορών Ελέγχου cobas 4800 Συστήματος) Ι. cobas 4800 CT/NG Controls Kit cobas 4800 Κιτ Ορών Ελέγχου CT/NG (P/N: ) CT/NG (+) C (cobas 4800 Θετικός Ορός Ελέγχου CT/NG) ( ) C (Αρνητικός Ορός Ελέγχου cobas 4800 Συστήματος) CT/NG IC (cobas 4800 Εσωτερικό Πρότυπο Ελέγχου CT/NG) 960 Εξετάσεις ΑΠΑΙΤΟΥΜΕΝΑ ΜΗ ΠΑΡΕΧΟΜΕΝΑ ΥΛΙΚΑ Χειρισμός Δειγμάτων και Αντιδραστηρίων cobas PCR Κιτ Δειγμάτων Γυναικών από Στυλεό (Roche P/N ) cobas PCR Κιτ Δειγμάτων Ούρων (Roche P/N ) Ακροφύσια CO-RE, 1000 µl, υποδοχέας 96 ακροφυσίων (Roche P/N ή Hamilton P/N ) Δοχείο Αντιδραστηρίων 50 ml (Roche P/N ) Δοχείο Αντιδραστηρίων 200 ml (Roche P/N ) Πλάκα Εκχύλισης (βυθίσματα μεγάλου βάθους) cobas 4800 Συστήματος (Roche P/N ) Πλάκα (μικροβυθισμάτων) AD 0,3 ml και Μεμβράνη Σφράγισης cobas 4800 Συστήματος (Roche P/N ) Σάκος στερεών αποβλήτων [Roche P/N (μικρός) ή (μεγάλος)] Πλαστικός Αγωγός Hamilton STAR (Roche P/N ) Σωληνάρια Στρογγυλής Βάσης 13 ml (Sarstedt P/N ), για χρήση ως δευτερεύοντα σωληνάρια δείγματος Πώματα, ουδέτερου χρώματος (Sarstedt P/N ), για κλείσιμο των δειγμάτων μετά την ανάλυση στα σωληνάρια Στρογγυλής Βάσης 13 ml Sarstedt Γάντια μίας χρήσης, χωρίς πούδρα Όργανα και Λογισμικό cobas x 480 όργανο cobas z 480 αναλυτής Μονάδα Ελέγχου cobas 4800 Συστήματος με Λογισμικό Συστήματος, έκδοσης 2.1 ή νεότερης ΠΡΟΑΙΡΕΤΙΚΟΣ ΕΞΟΠΛΙΣΜΟΣ ΚΑΙ ΥΛΙΚΑ Πιπέτες: με δυνατότητα χορήγησης 1000 µl Ακροφύσια φραγής αερολυμάτων χωρίς DNase: με δυνατότητα χορήγησης 1000 µl Φυγόκεντρος με ρότορα περιστρεφόμενου κάδου και τουλάχιστον 1500 RCF Ανεξάρτητη μαγνητική πλάκα (Roche P/N ) Αναδευτήρας τύπου Vortex (ενός σωληναρίου) Αναδευτήρας τύπου Vortex πολλαπλών σωληναρίων [π.χ. VWR P/N ] c4800 CT/NG AMP/DET c4800 CDIL c4800 CT/NG CTLS 10 Σετ 10 Σετ EL 9 Doc Rev. 9.0

10 ΣΥΛΛΟΓΗ, ΜΕΤΑΦΟΡΑ ΚΑΙ ΑΠΟΘΗΚΕΥΣΗ ΔΕΙΓΜΑΤΩΝ ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Όλα τα δείγματα πρέπει να θεωρούνται μολυσματικά και ο χειρισμός τους πρέπει να είναι ανάλογος. A. Συλλογή Δειγμάτων Ενδοτραχηλικά και κολπικά δείγματα από στυλεό που έχουν συλλεχθεί χρησιμοποιώντας το cobas PCR Κιτ Δειγμάτων Γυναικών από Στυλεό, ούρα ανδρών και γυναικών που έχουν συλλεχθεί χρησιμοποιώντας το cobas PCR Κιτ Δειγμάτων Ούρων και τραχηλικά δείγματα που έχουν συλλεχθεί σε διάλυμα PreservCyt έχουν εγκριθεί για χρήση με το cobas 4800 CT/NG Test. Ακολουθήστε τις οδηγίες του κατασκευαστή για τη συλλογή ενδοτραχηλικών και κολπικών δειγμάτων από στυλεό και δειγμάτων ούρων με το cobas PCR Κιτ Δειγμάτων Γυναικών από Στυλεό και το cobas PCR Κιτ Δειγμάτων Ούρων, αντίστοιχα. Ακολουθείτε τις οδηγίες του κατασκευαστή για τη συλλογή τραχηλικών δειγμάτων σε διάλυμα PreservCyt. B. Μεταφορά Δειγμάτων Τα ενδοτραχηλικά και κολπικά δείγματα από στυλεό που έχουν συλλεχθεί χρησιμοποιώντας το cobas PCR Κιτ Δειγμάτων Γυναικών από Στυλεό, τα ούρα ανδρών και γυναικών που έχουν συλλεχθεί χρησιμοποιώντας το cobas PCR Κιτ Δειγμάτων Ούρων και τα τραχηλικά δείγματα που έχουν συλλεχθεί σε διάλυμα PreservCyt μπορούν να μεταφερθούν στους 2-30 C. Η μεταφορά των δειγμάτων CT/NG στα cobas PCR Μέσα και το διάλυμα PreservCyt πρέπει να πληροί τους κρατικούς και τοπικούς κανονισμούς για τη μεταφορά αιτιολογικών παραγόντων 25. Γ. Αποθήκευση Δειγμάτων Ενδοτραχηλικά δείγματα από στυλεό και κολπικά δείγματα από στυλεό που συλλέχθηκαν με το cobas PCR Κιτ Δειγμάτων Γυναικών από Στυλεό και δείγματα ούρων ανδρών και γυναικών που συλλέχθηκαν με το cobas PCR Κιτ Δειγμάτων Ούρων μπορούν να αποθηκευτούν στους 2-30 C για έως και 12 μήνες εφόσον τα δείγματα έχουν σταθεροποιηθεί σε cobas PCR Μέσα. Τα τραχηλικά δείγματα που συλλέγονται σε διάλυμα PreservCyt μπορούν να αποθηκευτούν στους 2-30 C για 12 μήνες. ΟΔΗΓΙΕΣ ΧΡΗΣΗΣ ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Όλα τα αντιδραστήρια, εκτός από τα CT/NG MMX και CT/NG Mn, πρέπει να βρίσκονται σε θερμοκρασία περιβάλλοντος πριν τοποθετηθούν στο cobas x 480 όργανο. Τα CT/NG MMX και CT/NG Mn πρέπει να μεταφέρονται απευθείας από το χώρο αποθήκευσης θερμοκρασίας 2-8 C στο όργανο, καθώς θα περιέλθουν σε θερμοκρασία περιβάλλοντος στο cobas x 480 όργανο μέχρι να χρησιμοποιηθούν στη διαδικασία. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Τα δείγματα σε cobas PCR Μέσα και διάλυμα PreservCyt πρέπει να περιέλθουν και να παραμείνουν σε θερμοκρασία περιβάλλοντος για τουλάχιστον 30 λεπτά πριν τοποθετηθούν στο cobas x 480 όργανο. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Αν απαιτείται μεταφορά των δειγμάτων από το κύριο σωληνάριο συλλογής των cobas PCR Μέσων σε δευτερεύοντα σωληνάρια με κατάλληλο γραμμωτό κώδικα, χρησιμοποιήστε συσκευές πιπέτας με ακροφύσια φραγής αερολυμάτων ή θετικής μετατόπισης για χειρισμό των δειγμάτων. Απαιτείται ιδιαίτερη προσοχή για την αποφυγή μόλυνσης. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Για λεπτομερείς οδηγίες λειτουργίας, ανατρέξτε στο Εγχειρίδιο Χειριστή του cobas 4800 Συστήματος. Μέγεθος Ανάλυσης: Το cobas 4800 σύστημα έχει σχεδιαστεί για την υποστήριξη του cobas 4800 CT/NG Test με μεγέθη αναλύσεων από 1 έως 94 δείγματα και ορούς ελέγχου (έως 96 εξετάσεις ανά ανάλυση). Κάθε Κιτ Προετοιμασίας Δειγμάτων cobas 4800 συστήματος, Κιτ Προετοιμασίας Κυτταρολογίας Υγρής Φάσης cobas 4800 συστήματος και Κιτ Ρυθμιστικού Διαλύματος Πλύσης cobas 4800 συστήματος περιέχει επαρκή αντιδραστήρια για 10 αναλύσεις είτε 24 εξετάσεων (240 εξετάσεις ανά κιτ) είτε 96 εξετάσεων (960 εξετάσεις ανά κιτ). Το cobas 4800 Κιτ Ενίσχυσης/Ανίχνευσης CT/NG περιέχει επαρκή αντιδραστήρια για 10 αναλύσεις είτε 24 εξετάσεων (240 εξετάσεις ανά κιτ) είτε 96 εξετάσεων (960 εξετάσεις ανά κιτ). Μπορούν να χρησιμοποιηθούν πολλαπλά κιτ 240 εξετάσεων για τη βελτιστοποίηση της χρήσης των αντιδραστηρίων για 48 ή 72 εξετάσεις. Το Κιτ Αραιωτικού Ορών Ελέγχου cobas 4800 συστήματος και το Κιτ Ορών Ελέγχου CT/NG cobas 4800 συστήματος περιέχουν επαρκή αντιδραστήρια για 10 αναλύσεις συνολικά (10 σετ ανά κιτ). Το ελάχιστο μέγεθος ανάλυσης στο cobas 4800 σύστημα είναι 1 δείγμα και οροί ελέγχου. Για κάθε ανάλυση εξέτασης απαιτείται ένα αντίγραφο του Αρνητικού Ορού Ελέγχου [( ) C] του cobas 4800 συστήματος και ένα αντίγραφο του cobas 4800 Θετικού Ορού Ελέγχου CT/NG [CT/NG (+) C] (ανατρέξτε στην ενότητα «Ποιοτικός Έλεγχος»). Ροή Εργασιών: ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Ένα Κιτ 960 Εξετάσεων Προετοιμασίας Δειγμάτων Συστήματος μπορεί να χρησιμοποιηθεί για μια ανάλυση 24 δειγμάτων και ένα Κιτ 960 Εξετάσεων Ενίσχυσης/Ανίχνευσης CT/NG μπορεί να χρησιμοποιηθεί για μια ανάλυση 24, 48 ή 72 δειγμάτων, παρόλο που κάτι τέτοιο δεν αποτελεί βέλτιστη χρήση των αντιδραστηρίων. Το cobas 4800 CT/NG Test μπορεί να εκτελεστεί χρησιμοποιώντας μία από τις δύο ροές εργασιών, οι οποίες αναφέρονται ως «Full Workflow» (Πλήρης Ροή Εργασιών) ή «Recovery Workflow» (Ροή Εργασιών Ανάκτησης) στο cobas 4800 λογισμικό. Πλήρης Ροή Εργασιών CT/NG: Η «Πλήρης ροή εργασιών CT/NG» περιλαμβάνει την προετοιμασία των δειγμάτων στο cobas x 480 όργανο και, στη συνέχεια, την εκτέλεση ενίσχυσης/ανίχνευσης στον cobas z 480 αναλυτή. Ανατρέξτε στην παρακάτω ενότητα «Εκτέλεση Πλήρους Ροής Εργασιών» και στο Εγχειρίδιο Χειριστή του cobas 4800 συστήματος για λεπτομέρειες. Ροή Εργασιών Ανάκτησης CT/NG: Η «Ροή Εργασιών Ανάκτησης CT/NG» περιλαμβάνει τη χειροκίνητη διαμόρφωση της πλάκας PCR με χρήση εκλούσματος από την επεξεργασμένη πλάκα βυθισμάτων μεγάλου βάθους ακολουθούμενη από ενίσχυση/ανίχνευση στον cobas z 480 αναλυτή. Ανατρέξτε στην παρακάτω ενότητα «Εκτέλεση Ροής Εργασιών Ανάκτησης» και στο Εγχειρίδιο Χειριστή του cobas 4800 συστήματος για λεπτομέρειες EL 10 Doc Rev. 9.0

11 Δείγματα: Οι παρακάτω τύποι δειγμάτων έχουν εγκριθεί χρησιμοποιώντας το cobas 4800 CT/NG Test: α) ενδοτραχηλικά δείγματα από στυλεό σε cobas PCR Μέσα (στυλεός), β) κολπικά δείγματα από στυλεό που συλλέγονται από τον ιατρό και κολπικά δείγματα από στυλεό που συλλέγονται από το ίδιο το άτομο κατόπιν οδηγιών του ιατρού σε cobas PCR Μέσα (στυλεό), γ) δείγματα ούρων ανδρών και γυναικών που έχουν σταθεροποιηθεί σε cobas PCR Μέσα (ούρα) και δ) τραχηλικά δείγματα που έχουν συλλεχθεί σε διάλυμα PreservCyt (PC). Τα ενδοτραχηλικά δείγματα, τα κολπικά δείγματα και τα δείγματα ούρων πρέπει να τοποθετούνται σε σωληνάρια των cobas PCR Μέσων με κατάλληλο γραμμωτό κώδικα ή σε ένα σωληνάριο στρογγυλής βάσης 13 ml Sarstedt με κατάλληλο γραμμωτό κώδικα για επεξεργασία στο cobas x 480 όργανο. Τα τραχηλικά δείγματα πρέπει να τοποθετούνται στο κύριο σωληνάριο διαλύματος PreservCyt με κατάλληλο γραμμωτό κώδικα ή σε ένα σωληνάριο στρογγυλής βάσης 13 ml Sarstedt με κατάλληλο γραμμωτό κώδικα για επεξεργασία στο cobas x 480 όργανο. Ανατρέξτε στο Εγχειρίδιο Χειριστή του cobas 4800 Συστήματος για τη σωστή διαδικασία τοποθέτησης του γραμμωτού κώδικα και τη λίστα αποδεκτών γραμμωτών κωδίκων για το cobas 4800 Σύστημα. Ενδοτραχηλικά και Κολπικά Δείγματα από Στυλεό: ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Στα κιτ αντιδραστηρίων που απαιτούνται για την επεξεργασία ενδοτραχηλικών και κολπικών δειγμάτων από στυλεό στο cobas x 480 όργανο περιλαμβάνονται τα εξής: Κιτ Προετοιμασίας Δειγμάτων cobas 4800 Συστήματος, Κιτ Αραιωτικού Ορών Ελέγχου cobas 4800 Συστήματος, Κιτ Ρυθμιστικού Διαλύματος Πλύσης cobas 4800 Συστήματος, cobas 4800 Κιτ Ενίσχυσης/Ανίχνευσης CT/NG και cobas 4800 Κιτ Ορών Ελέγχου CT/NG. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Χρησιμοποιείτε μόνο το cobas PCR Κιτ Δειγμάτων Γυναικών από Στυλεό για τη συλλογή ενδοτραχηλικών και κολπικών δειγμάτων από στυλεό για το cobas 4800 CT/NG Test. Το cobas 4800 CT/NG Test δεν έχει εγκριθεί για χρήση με άλλες συσκευές συλλογής δειγμάτων από στυλεό ή άλλους τύπους μέσων. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Για να αποφευχθεί η διασταυρούμενη μόλυνση επεξεργασμένων δειγμάτων, θα πρέπει να χρησιμοποιούνται πρόσθετα πώματα cobas PCR Μέσων με διαφορετικό χρώμα (ουδέτερο, βλ. «Απαιτούμενα Μη Παρεχόμενα Υλικά») για το κλείσιμο των δειγμάτων μετά την επεξεργασία. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Τα ενδοτραχηλικά και κολπικά δείγματα από στυλεό με ένα μόνο στυλεό στο σωληνάριο των cobas PCR Μέσων μπορούν να υποβληθούν απευθείας σε επεξεργασία στο cobas 4800 Σύστημα. Αν απαιτείται, ο στυλεός μπορεί να αφαιρεθεί πριν από την τοποθέτηση του σωληναρίου δείγματος στο όργανο (ανατρέξτε στο Εγχειρίδιο Χειριστή του cobas 4800 Συστήματος για λεπτομέρειες). ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Ένα ενδοτραχηλικό ή κολπικό δείγμα από στυλεό που έχει συλλεχθεί σωστά πρέπει να έχει ένα μόνο στυλεό με τη λαβή σπασμένη στη γραμμή κοπής. Οι λαβές στυλεών που έχουν σπάσει πάνω από τη γραμμή κοπής θα έχουν μεγαλύτερο μήκος από το κανονικό και μπορεί επίσης να λυγίσουν ώστε να τοποθετηθούν στο σωληνάριο των cobas PCR Μέσων. Στην περίπτωση αυτή, μπορεί να παρεμποδίσουν τη λειτουργία του συστήματος, με αποτέλεσμα να χαθούν τα αποτελέσματα εξέτασης. Αν η λαβή σε ένα δείγμα από στυλεό δεν έχει σπάσει σωστά, αφαιρέστε το στυλεό πριν από την επεξεργασία του δείγματος στο cobas x 480 όργανο. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Τα εισερχόμενα κύρια σωληνάρια ενδοτραχηλικών και κολπικών δειγμάτων χωρίς στυλεό ή με δύο στυλεούς δεν έχουν συλλεχθεί σύμφωνα με τις οδηγίες στο cobas PCR Κιτ Δειγμάτων Γυναικών από Στυλεό και δεν πρέπει να υποβάλλονται σε εξέταση. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Μην υποβάλλετε σε επεξεργασία ενδοτραχηλικά και κολπικά δείγματα από στυλεό με αίμα ή σκούρο καφέ χρώμα. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Ορισμένες φορές, τα εισερχόμενα σταθεροποιημένα ενδοτραχηλικά ή κολπικά δείγματα από στυλεό περιέχουν υπερβολική ποσότητα βλέννας, η οποία μπορεί να οδηγήσει στην εμφάνιση σφάλματος κατά την έγχυση με πιπέτα (π.χ. θρόμβος ή άλλο εμπόδιο) στο cobas x 480 όργανο. Πριν από την επανεξέταση δειγμάτων που παρουσίασαν θρόμβους κατά την αρχική επεξεργασία, αφαιρέστε και απορρίψτε το στυλεό, τοποθετήστε ξανά τα πώματα στα σωληνάρια και στροβιλίστε τα δείγματα αυτά για 30 δευτερόλεπτα, ώστε να διασκορπιστεί η υπερβολική ποσότητα βλέννας. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Τα ενδοτραχηλικά και κολπικά δείγματα από στυλεό μπορούν να υποβληθούν σε ανάλυση δύο φορές στο cobas x 480 όργανο, με το στυλεό στο σωληνάριο συλλογής. Αν απαιτείται επιπλέον εξέταση ή αν η πρώτη εξέταση είναι ανεπιτυχής λόγω σφάλματος κατά την έγχυση του δείγματος με πιπέτα (π.χ. θρόμβος ή άλλο εμπόδιο), ο στυλεός πρέπει να αφαιρεθεί και το υπολειπόμενο υγρό πρέπει να έχει ελάχιστο όγκο 1,0 ml. Το πώμα του σωληναρίου των cobas PCR Μέσων που περιλαμβάνει το δείγμα από στυλεό μπορεί να αφαιρεθεί και το σωληνάριο μπορεί να τοποθετηθεί απευθείας στο cobas x 480 όργανο ή μπορεί να διοχετευτεί ένα κλάσμα του δείγματος τουλάχιστον 1,0 ml σε ένα σωληνάριο στρογγυλής βάσης 13 ml Sarstedt με κατάλληλο γραμμωτό κώδικα και, στη συνέχεια, να τοποθετηθεί στο cobas x 480 όργανο. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Απαιτείται προσοχή κατά τη μεταφορά δειγμάτων από τα κύρια σωληνάρια στα δευτερεύοντα σωληνάρια στρογγυλής βάσης 13 ml. Αναμίξτε τα κύρια δείγματα πριν από τη μεταφορά. Αλλάζετε τα ακροφύσια πιπέτας για κάθε δείγμα EL 11 Doc Rev. 9.0

12 Δείγματα Ούρων Ανδρών και Γυναικών: ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Στα κιτ αντιδραστηρίων που απαιτούνται για την επεξεργασία δειγμάτων ούρων στο cobas x 480 όργανο περιλαμβάνονται τα εξής: Κιτ Προετοιμασίας Δειγμάτων cobas 4800 Συστήματος, Κιτ Αραιωτικού Ορών Ελέγχου cobas 4800 Συστήματος, Κιτ Ρυθμιστικού Διαλύματος Πλύσης cobas 4800 Συστήματος, cobas 4800 Κιτ Ενίσχυσης/Ανίχνευσης CT/NG και cobas 4800 Κιτ Ορών Ελέγχου CT/NG. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Χρησιμοποιείτε μόνο το cobas PCR Κιτ Δειγμάτων Ούρων για τη συλλογή δειγμάτων ούρων για το cobas 4800 CT/NG Test. Το cobas 4800 CT/NG Test δεν έχει εγκριθεί για χρήση με άλλες συσκευές συλλογής ούρων ή άλλους τύπους μέσων. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Για να αποφευχθεί η διασταυρούμενη μόλυνση επεξεργασμένων δειγμάτων, θα πρέπει να χρησιμοποιούνται πρόσθετα πώματα cobas PCR Μέσων με διαφορετικό χρώμα (ουδέτερο, βλ. «Απαιτούμενα Μη Παρεχόμενα Υλικά») για το κλείσιμο των δειγμάτων μετά την επεξεργασία. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Στα δείγματα ούρων που δεν έχουν εξεταστεί, η στάθμη του υγρού πρέπει να βρίσκεται ανάμεσα στις δύο μαύρες γραμμές στο παράθυρο ετικέτας του σωληναρίου των cobas PCR Μέσων. Αν η στάθμη υγρού είναι πάνω ή κάτω από αυτές τις γραμμές, το δείγμα δεν έχει συλλεχθεί σωστά και δεν μπορεί να χρησιμοποιηθεί για εξέταση. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Μην υποβάλλετε σε επεξεργασία δείγματα ούρων με αίμα ή σκούρο καφέ χρώμα. Το πώμα του σωληναρίου των cobas PCR Μέσων που περιλαμβάνει το δείγμα ούρων μπορεί να αφαιρεθεί και το σωληνάριο μπορεί να τοποθετηθεί απευθείας στο cobas x 480 όργανο ή μπορεί να διοχετευτεί ένα κλάσμα του δείγματος τουλάχιστον 1,5 ml σε ένα σωληνάριο στρογγυλής βάσης 13 ml Sarstedt με κατάλληλο γραμμωτό κώδικα και, στη συνέχεια, να τοποθετηθεί στο cobas x 480 όργανο. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Απαιτείται προσοχή κατά τη μεταφορά δειγμάτων από τα κύρια σωληνάρια στα δευτερεύοντα σωληνάρια στρογγυλής βάσης 13 ml. Αναμίξτε τα κύρια δείγματα πριν από τη μεταφορά. Αλλάζετε τα ακροφύσια πιπέτας για κάθε δείγμα. Μια μεμονωμένη ανάλυση μπορεί να έχει οποιονδήποτε συνδυασμό ενδοτραχηλικών, κολπικών δειγμάτων και δειγμάτων ούρων, ενώ κάθε δείγμα μπορεί να υποβληθεί σε εξέταση για CT ή NG ή για CT και NG. Τραχηλικά Δείγματα: ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Στα κιτ αντιδραστηρίων που απαιτούνται για την επεξεργασία τραχηλικών δειγμάτων στο cobas x 480 όργανο περιλαμβάνονται τα εξής: Κιτ Προετοιμασίας Δειγμάτων cobas 4800 Συστήματος, Κιτ Προετοιμασίας Κυτταρολογίας Υγρής Φάσης cobas 4800 Συστήματος, Κιτ Ρυθμιστικού Διαλύματος Πλύσης cobas 4800 Συστήματος, cobas 4800 Κιτ Ενίσχυσης/Ανίχνευσης CT/NG και cobas 4800 Κιτ Ορών Ελέγχου CT/NG. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Το cobas 4800 CT/NG Test έχει εγκριθεί για χρήση με τραχηλικά δείγματα που έχουν συλλεχθεί σε διάλυμα PreservCyt. Το cobas 4800 CT/NG Test δεν έχει εγκριθεί για χρήση με τραχηλικά δείγματα από άλλους τύπους μέσων. Αν το cobas 4800 CT/NG Test χρησιμοποιηθεί με άλλους τύπους μέσων, μπορεί να προκύψουν ψευδώς αρνητικά, ψευδώς θετικά και/ή άκυρα αποτελέσματα. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Το cobas 4800 Σύστημα μπορεί να υποβάλει σε επεξεργασία τραχηλικά δείγματα σε πρωτογενή και δευτερογενή σωληνάρια. Κατά την κλασματοποίηση δειγμάτων από κύρια σωληνάρια σε σωληνάρια στρογγυλής βάσης 13 ml Sarstedt με γραμμωτό κώδικα για επεξεργασία στο cobas x 480 όργανο, χρησιμοποιείτε συσκευές πιπέτας με ακροφύσια φραγής αερολυμάτων ή θετικής μετατόπισης για το χειρισμό των δειγμάτων. Για να αποφευχθεί η διασταυρούμενη μόλυνση, θα πρέπει να χρησιμοποιούνται πρόσθετα πώματα για τα σωληνάρια αυτά με διαφορετικό χρώμα (ουδέτερο, βλ. ενότητα «Απαιτούμενα Μη Παρεχόμενα Υλικά») για κλείσιμο των δειγμάτων μετά την επεξεργασία. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Απαιτείται προσοχή κατά τη μεταφορά δειγμάτων από τα κύρια σωληνάρια στα δευτερεύοντα σωληνάρια στρογγυλής βάσης 13 ml. Στροβιλίστε τα κύρια δείγματα πριν από τη μεταφορά. Αλλάζετε τα ακροφύσια πιπέτας μετά από κάθε δείγμα. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Μην υποβάλλετε σε επεξεργασία δείγματα που έχουν συλλεχθεί σε διάλυμα PreservCyt και έχουν αίμα ή σκούρο καφέ χρώμα. Για τα τραχηλικά δείγματα, ο ελάχιστος απαιτούμενος όγκος για τα κύρια σωληνάρια διαλύματος PreservCyt είναι 3,0 ml. Για δευτερεύοντα σωληνάρια στρογγυλής βάσης 13 ml ο ελάχιστος όγκος πλήρωσης είναι 1,0 ml και ο μέγιστος όγκος πλήρωσης 10 ml. Μια μεμονωμένη ανάλυση τραχηλικών δειγμάτων μπορεί να έχει οποιοδήποτε συνδυασμό υποδοχέων κύριων ή δευτερευόντων σωληναρίων και κάθε δείγμα μπορεί να ελεγχθεί για CT ή NG ή για CT και NG. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Τα τραχηλικά δείγματα δεν είναι δυνατό να υποβληθούν σε επεξεργασία με ενδοτραχηλικά ή κολπικά δείγματα ή δείγματα ούρων στην ίδια ανάλυση. Για βελτιστοποίηση της χρήσης των αντιδραστηρίων, χρησιμοποιείτε παρτίδες των 22 εξετάσεων τραχηλικών δειγμάτων ανά ανάλυση (συν έναν αρνητικό ορό ελέγχου cobas 4800 Συστήματος και έναν cobas 4800 θετικό ορό ελέγχου CT/NG) χρησιμοποιώντας κιτ 240 Εξετάσεων ή παρτίδες 94 εξετάσεων τραχηλικών δειγμάτων ανά ανάλυση (συν έναν αρνητικό ορό ελέγχου cobas 4800 Συστήματος και έναν cobas 4800 θετικό ορό ελέγχου CT/NG) χρησιμοποιώντας κιτ 960 Εξετάσεων EL 12 Doc Rev. 9.0

13 Ροές Εργασιών Εκτέλεση Πλήρους Ροής Εργασιών: Α. Το cobas 4800 CT/NG Test μπορεί να χρησιμοποιηθεί για αναλύσεις 1 έως 94 δειγμάτων με έναν αρνητικό ορό ελέγχου cobas 4800 συστήματος και έναν cobas 4800 θετικό ορό ελέγχου CT/NG. Β. Εκτελέστε τη διαδικασία εκκίνησης και συντήρησης του συστήματος ακολουθώντας τις οδηγίες στο Εγχειρίδιο Χειριστή του cobas 4800 συστήματος. Γ. Ξεκινήστε μια νέα ανάλυση κάνοντας κλικ στο κουμπί «New run». Δ. Στο παράθυρο «Select test» επιλέξτε τον τύπο ροής εργασιών «Full» και στη συνέχεια επιλέξτε την εξέταση «CT/NG». Ε. Πληκτρολογήστε ένα όνομα ανάλυσης ή αφήστε το προεπιλεγμένο όνομα ανάλυσης και κάντε κλικ στο «OK» για να συνεχίσετε. ΣΤ. Ακολουθήστε τον οδηγό λογισμικού για τη φόρτωση των δειγμάτων. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Τα ενδοτραχηλικά δείγματα, τα κολπικά δείγματα και τα δείγματα ούρων μπορούν να τοποθετηθούν με οποιαδήποτε σειρά σε κύρια ή δευτερεύοντα σωληνάρια με γραμμωτό κώδικα. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Τα τραχηλικά δείγματα σε διάλυμα PreservCyt πρέπει να υποβάλλονται σε επεξεργασία σε υποδοχείς πρωτογενών φιαλιδίων δείγματος ή δευτερογενών σωληναρίων στην ίδια ανάλυση. Εάν χρησιμοποιείτε πρωτογενή φιαλίδια PreservCyt για την επεξεργασία, στροβιλίστε κάθε φιαλίδιο πριν από την τοποθέτηση. Ζ. Επιλέξτε τον τύπο δείγματος για κάθε δείγμα. Επιλέξτε «Swab» για εντολή ενδοτραχηλικών δειγμάτων από στυλεό και κολπικών δειγμάτων από στυλεό Επιλέξτε «Urine» για εντολή δειγμάτων ούρων Επιλέξτε «PC» για εντολή δειγμάτων σε PreservCyt Η. Επιλέξτε το ζητούμενο αποτέλεσμα για κάθε δείγμα. Επιλέξτε το ζητούμενο αποτέλεσμα «CT/NG» για αναφορά αποτελεσμάτων εξέτασης CT και NG. Επιλέξτε το ζητούμενο αποτέλεσμα «CT» για αναφορά μόνο αποτελεσμάτων εξέτασης CT. Επιλέξτε το ζητούμενο αποτέλεσμα «NG» για αναφορά μόνο αποτελεσμάτων εξέτασης NG. Θ. Ακολουθήστε τον οδηγό λογισμικού για την τοποθέτηση όλων των αναλώσιμων. Ι. Ακολουθήστε τον οδηγό λογισμικού για την τοποθέτηση όλων των αντιδραστηρίων. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Οι οροί ελέγχου [CT/NG (+) C, CT/NG IC και ( ) C] δεν τοποθετούνται μαζί με τα δείγματα. Τοποθετούνται στο φορέα αντιδραστηρίων κατά την τοποθέτηση των αντιδραστηρίων. Δύο θέσεις (A1 και B1) στην πλάκα εκχύλισης και στην πλάκα AD προορίζονται για τους ορούς ελέγχου CT/NG (+) και ( ) αντίστοιχα. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Το cobas 4800 σύστημα διαθέτει εσωτερικό ρολόι για παρακολούθηση του χρονικού διαστήματος παραμονής των αντιδραστηρίων στο σύστημα. Μετά τη σάρωση του WB, πρέπει να ολοκληρώσετε τη διαδικασία τοποθέτησης και να κάνετε κλικ στο κουμπί Start εντός 1 ώρας. Ο χρονοδιακόπτης αντίστροφης μέτρησης εμφανίζεται στην καρτέλα «Workplace». Το σύστημα δεν θα επιτρέψει την έναρξη της ανάλυσης αν το χρονικό διάστημα παραμονής στο σύστημα έχει λήξει. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Για να διασφαλιστεί η σωστή μεταφορά του MGP, στροβιλίστε ή ανακινήστε έντονα το φιαλίδιο MGP πριν από τη διοχέτευση στο δοχείο αντιδραστηρίου. Κ. Τοποθετήστε τα αντιδραστήρια προετοιμασίας δειγμάτων (WB, MGP, EB, SDS και LYS) στα δοχεία αντιδραστηρίων με γραμμωτό κώδικα χρησιμοποιώντας τη μέθοδο «σάρωση-σάρωση-προσθήκη-τοποθέτηση»: Σαρώστε το γραμμωτό κώδικα της φιάλης αντιδραστηρίου Σαρώστε το γραμμωτό κώδικα του δοχείου αντιδραστηρίου Προσθέστε το αντιδραστήριο στο δοχείο Τοποθετήστε το γεμάτο δοχείο αντιδραστηρίου στο φορέα αντιδραστηρίων Λ. Τα δοχεία αντιδραστηρίων διατίθενται σε δύο μεγέθη: 200 ml και 50 ml. Ακολουθήστε τον οδηγό λογισμικού για την επιλογή των κατάλληλων μεγεθών των δοχείων αντιδραστηρίων. Οι γραμμωτοί κώδικες των δοχείων αντιδραστηρίων πρέπει να είναι στραμμένοι προς τα δεξιά του φορέα. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Τα αντιδραστήρια ενίσχυσης/ανίχνευσης (CT/NG MMX και CT/NG Mn), οι Οροί Ελέγχου [CT/NG (+) C, CT/NG IC και ( ) C] και το Αραιωτικό Ορών Ελέγχου (CDIL) τοποθετούνται απευθείας στο φορέα αντιδραστηρίων και σαρώνονται αυτόματα από το cobas x 480 όργανο. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Όλα τα αντιδραστήρια και τα δοχεία αντιδραστηρίων έχουν γραμμωτό κώδικα και προορίζονται για μία χρήση. Το cobas 4800 λογισμικό παρακολουθεί τη χρήση των αντιδραστηρίων και των δοχείων αντιδραστηρίων και απορρίπτει τα ήδη χρησιμοποιημένα αντιδραστήρια ή δοχεία αντιδραστηρίων. Επίσης, το λογισμικό ελέγχει αν έχουν τοποθετηθεί στο όργανο επαρκή αντιδραστήρια. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Το cobas 4800 λογισμικό παρακολουθεί την ημερομηνία λήξης όλων των αντιδραστηρίων. Αντιδραστήρια των οποίων η ημερομηνία λήξης έχει παρέλθει δεν θα γίνονται αποδεκτά για χρήση με το cobas 4800 σύστημα. Μ. Ξεκινήστε την προετοιμασία των δειγμάτων κάνοντας κλικ στο «Start Run». Ν. Μετά την επιτυχή ολοκλήρωση της προετοιμασίας των δειγμάτων**, κάντε κλικ στο «Unload» για αφαίρεση του φορέα πλακών. ** Μπορείτε να ελέγξετε την κατάσταση της προετοιμασίας των δειγμάτων στο σημείο αυτό, πριν κάνετε κλικ στο «Unload». Ανατρέξτε στο Εγχειρίδιο Χειριστή του cobas 4800 συστήματος EL 13 Doc Rev. 9.0

14 Ξ. Ακολουθήστε τις οδηγίες του Εγχειριδίου Χειριστή του cobas 4800 συστήματος για σφράγιση της πλάκας μικροβυθισμάτων στον cobas z 480 αναλυτή και έναρξη της ανάλυσης ενίσχυσης και ανίχνευσης. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Το cobas 4800 σύστημα διαθέτει εσωτερικό ρολόι για παρακολούθηση του χρονικού διαστήματος μετά την προσθήκη των προετοιμασμένων δειγμάτων στο κύριο μίγμα εργασίας. Η ενίσχυση και η ανίχνευση πρέπει να ξεκινήσουν το συντομότερο δυνατό, ωστόσο έως 90 λεπτά μετά το τέλος της ανάλυσης στο cobas x 480 όργανο. Ο χρονοδιακόπτης αντίστροφης μέτρησης εμφανίζεται στην καρτέλα «Workplace». Το σύστημα θα ακυρώσει την ανάλυση εάν σημειωθεί λήξη χρονικού ορίου του χρονοδιακόπτη. Ο. Όταν ολοκληρωθεί η ανάλυση ενίσχυσης και ανίχνευσης, αφαιρέστε την πλάκα μικροβυθισμάτων από τον cobas z 480 αναλυτή. Π. Ακολουθήστε τις οδηγίες του Εγχειριδίου Χειριστή του cobas 4800 συστήματος για αναθεώρηση και αποδοχή των αποτελεσμάτων. Εκτέλεση Ροής Εργασιών Ανάκτησης: ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Η Ροή Εργασιών Ανάκτησης διατίθεται ως επιλογή ανάκτησης σε περίπτωση μη ολοκλήρωσης της πλήρους ροής εργασιών λόγω καταστάσεων που δεν υπάγονται στον έλεγχο του χειριστή (π.χ. διακοπή ρεύματος κατά την ανάλυση ενίσχυσης/ανίχνευσης). ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Μόνο τα δείγματα που έχουν υποβληθεί σε επιτυχή επεξεργασία στο cobas x 480 όργανο μπορούν να ενισχυθούν/ανιχνευτούν χρησιμοποιώντας την ανάλυση Ανάκτησης. Η παρακολούθηση των αντιδραστηρίων και των αναλώσιμων από το σύστημα είναι περιορισμένη κατά τη διάρκεια της ανάλυσης Ανάκτησης. Η θέση των δειγμάτων δεν παρακολουθείται κατά τη χρήση της ροής εργασιών Ανάκτησης ο χειριστής πρέπει να διασφαλίσει ότι η πραγματική θέση ενός δείγματος στην πλάκα μικροβυθισμάτων αντιστοιχεί σε εκείνη που έχει καθοριστεί στο αρχείο Εντολής Εργασίας Αναφοράς Διάταξης της Πλάκας Ανάκτησης. Απαιτείται εξαιρετική προσοχή κατά την προετοιμασία της πλάκας μικροβυθισμάτων, για να διασφαλιστεί η σωστή προετοιμασία της PCR και να αποφευχθεί τυχόν μόλυνση. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Τα δείγματα που έχουν υποβληθεί σε επεξεργασία στο cobas x 480 όργανο έχουν περιορισμένη σταθερότητα. Πρέπει να ενισχυθούν/ανιχνευτούν χρησιμοποιώντας τη ροή εργασιών Ανάκτησης εντός 24 ωρών, αν αποθηκεύονται στους 2 C έως 30 C. Α. Ξεκινήστε μια ανάλυση Ανάκτησης κάνοντας κλικ στο κουμπί «New run». Β. Στο παράθυρο «Select test» επιλέξτε τον τύπο ροής εργασιών «Recovery» και στη συνέχεια επιλέξτε την εξέταση «CT/NG». Γ. Πληκτρολογήστε ένα όνομα ανάλυσης ή αφήστε το προεπιλεγμένο όνομα ανάλυσης και κάντε κλικ στο «OK» για να συνεχίσετε. Δ. Επιλέξτε μια ανάλυση για ανάκτηση. Ε. Εισάγετε το νέο MWP ID. ΣΤ. Εισάγετε το ID του Κύριου Μίγματος και των Μεταλλικών Ιόντων για όλα τα φιαλίδια ενίσχυσης/ανίχνευσης του κιτ. Ζ. Προετοιμάστε το cobas 4800 κύριο μίγμα εργασίας CT/NG: α. Για ένα κιτ 240 εξετάσεων, προσθέστε 240 µl CT/NG Mn σε ένα φιαλίδιο CT/NG MMX (φιαλίδιο 0,5 ml από κιτ 240 εξετάσεων). β. Για ένα κιτ 960 εξετάσεων, προσθέστε 450 µl CT/NG Mn σε καθένα από τα δύο φιαλίδια CT/NG MMX (φιαλίδια 1,0 ml από κιτ 960 εξετάσεων). ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Η ανάλυση Ανάκτησης πρέπει να ξεκινήσει εντός 90 λεπτών από την προσθήκη του CT/NG Mn στο CT/NG MMX. Το σύστημα δεν παρακολουθεί το χρονικό διάστημα παραμονής μετά την προσθήκη των προετοιμασμένων δειγμάτων στο κύριο μίγμα εργασίας στη ροή εργασιών Ανάκτησης. Ο τελικός χρήστης θα πρέπει να διασφαλίσει ότι η ενίσχυση και η ανίχνευση θα ξεκινήσουν εντός του προκαθορισμένου χρόνου. Η. Αναμίξτε καλά το κύριο μίγμα εργασίας αναστρέφοντας προσεκτικά το φιαλίδιο. Μη στροβιλίζετε το κύριο μίγμα εργασίας. Θ. Μεταφέρετε 25 µl του κύριου μίγματος εργασίας στα απαιτούμενα βυθίσματα της πλάκας μικροβυθισμάτων. I. Τοποθετήστε την πλάκα εκχύλισης από την ανάλυση που πρέπει να επαναληφθεί στην ανεξάρτητη μαγνητική πλάκα. K. Μεταφέρετε χειροκίνητα 25 µl του προϊόντος έκλουσης από τα βυθίσματα της πλάκας εκχύλισης στα αντίστοιχα βυθίσματα στην πλάκα μικροβυθισμάτων. Βεβαιωθείτε ότι οι θέσεις των βυθισμάτων είναι ίδιες (π.χ. το προϊόν έκλουσης στο βύθισμα A1 της πλάκας εκχύλισης έχει μεταφερθεί στη θέση A1 στην πλάκα μικροβυθισμάτων). Βεβαιωθείτε ότι δεν έχει μεταφερθεί MGP στην πλάκα μικροβυθισμάτων. Λ. Ακολουθήστε τις οδηγίες του Εγχειριδίου Χειριστή του cobas 4800 Συστήματος για σφράγιση της πλάκας μικροβυθισμάτων. M. Φυγοκεντρίστε την πλάκα μικροβυθισμάτων χρησιμοποιώντας ένα ρότορα περιστρεφόμενου κάδου για τουλάχιστον 5 δευτερόλεπτα στα 1500 RCF. N. Μεταφέρετε την πλάκα στον cobas z 480 αναλυτή και ξεκινήστε την ανάλυση ενίσχυσης και ανίχνευσης. Ξ. Όταν ολοκληρωθεί η ανάλυση ενίσχυσης και ανίχνευσης, αφαιρέστε την πλάκα μικροβυθισμάτων από τον cobas z 480 αναλυτή. Ο. Ακολουθήστε τις οδηγίες του Εγχειριδίου Χειριστή του cobas 4800 Συστήματος για αναθεώρηση και αποδοχή των αποτελεσμάτων. Ερμηνεία των Αποτελεσμάτων ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Η επαλήθευση όλων των εξετάσεων και αναλύσεων καθορίζεται από το cobas 4800 Λογισμικό. ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Μια έγκυρη ανάλυση μπορεί να περιλαμβάνει έγκυρα και άκυρα αποτελέσματα δειγμάτων. Για μια έγκυρη ανάλυση, τα αποτελέσματα δειγμάτων ερμηνεύονται όπως φαίνεται στον Πίνακα 1: Πίνακας EL 14 Doc Rev. 9.0