Παρασκευή N. Πολυμενάκου. Προσωπικές πληροφορίες. Ατομικές δεξιότητες και ικανότητες. Γλώσσες

Transcript

1 Παρασκευή N. Πολυμενάκου Προσωπικές πληροφορίες Διεύθυνση Ελληνικό Κέντρο Θαλασσίων Ερευνών Τ.Θ.2214, Ηράκλειο, Κρήτη, Ελλάδα Τηλέφωνο (-α) Ηλεκτρονικό ταχυδρομείο Φαξ Υπηκοότητα (ες) Ελληνική Ημ.γέννησης 22 Σεπτεμβρίου 1975 Φύλο Θήλυ Ατομικές δεξιότητες και ικανότητες Γλώσσες Μητρική (-ες) γλώσσα (-ες): Ελληνική Κατανόηση Προφορικός λόγος Γραπτός Λόγος Ελληνικά Άριστο Άριστο Άριστο Αγγλικά Άριστο Άριστο Άριστο Σελίδα 1/11 - Βιογραφικό

2 Εκπαίδευση και κατάρτιση : Διδακτορικός Τίτλος στον Τομέα Περιβαλλοντικής Οργανικής Χημείας και Θαλάσσιας Μικροβιολογίας, Τμήμα Χημείας, Πανεπιστήμιο Κρήτης Θέμα: Περιβαλλοντική μελέτη της βακτηριακής ποικιλότητας και των σχετιζομένων με αυτή μοριακών δεικτών σε ιζήματα της Ανατολικής Μεσογείου Επιβλέπων Καθηγητής: Καθ. E. Στεφάνου 2003: Επισκέπτης/Ερευνητής στο Τμήμα Οικολογίας και Εξέλιξης του Πανεπιστημίου της Ουψάλας (Ουψάλα, Σουηδία) με θέμα: Βακτηριακή σύσταση και ποικιλότητα σε ιζήματα της Μεσογείου με την υποστήριξη του Ιδρύματος Κρατικών Υποτροφιών (ΙΚΥ), του Συμβουλίου Έρευνας της Σουηδίας (Swedish Research Council (grant to S.B.) και του Swedish Research Council for Environment, Agricultural Sciences and Special Planning (grant to S.B.). Εκπαίδευση σε τεχνικές μοριακής βιολογίας για προσδιορισμό βακτηριακής ποικιλότητας και στο φυλογενετικό πρόγραμμα ARB Ιουλ. 2002: Συμμετοχή και παρακολούθηση των εντατικών μαθημάτων της American Chemical Society και της Agilent Technologies με τίτλο How to develop, validate and troubleshoot GC methods : Μεταπτυχιακός Τίτλος Ειδίκευσης στις Επιστήμες και Μηχανική Περιβάλλοντος, Τμήμα Χημείας, Σχολή Θετικών Επιστημών, Πανεπιστήμιο Κρήτης Θέμα: Κινητική βιοαποδόμησης της φαινόλης με χρήση ενός νέου βακτηρίου Επιβλέπων Καθηγητής: Καθ. E. Στεφάνου Αύγ. 1999: Συμμετοχή στο Endangered European Environment Master Program, Πανεπιστήμιο της Ουψάλας (Ουψάλα, Σουηδία) με την υποστήριξη του Ιδρύματος Κρατικών Υποτροφιών (ΙΚΥ) και παρακολούθηση των εντατικών μεταπτυχιακών μαθημάτων: Environmental Policies and Law Environmental History, Environmental Philosophy Biodiversity, Climate Change, Ozone Heavy Metals, Industrial Pollution, Transport/Aircraft Emission Environmental Management Systems, Ecosystems: structure and interactions Basics of biogeochemical cycles. Marine Ecology Systems Water use/water quality : Πτυχίο Τμήματος Βιολογίας, Σχολή Θετικών Επιστημών, Πανεπιστήμιο Κρήτης Θέμα διπλωματικής: Ένα μοτίβο συντηρημένο στους μεταφορείς νουκλεοβάσεων: λειτουργική ανάλυση στον οργανισμό Aspergillus nidulans Επιβλέποντες: Καθ. N. Πανόπουλος, Δρ. Γ. Διαλυνάς Σελίδα 2/11 - Βιογραφικό

3 ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΗ ΤΑΥΤΟΤΗΤΑ Επιστημονική Επαγγελματική Εμπειρία (των τελευταίων 5 ετών) 2007-παρόν: Ερευνήτρια του Ινστιτούτου Θαλάσσιας Βιολογίας και Γενετικής του Ελληνικού Κέντρου Θαλασσίων Ερευνών, Παράρτημα Κρήτης (ΕΛ.ΚΕ.Θ.Ε.) : Ερευνήτρια του Ινστιτούτου Ωκεανογραφίας του Ελληνικού Κέντρου Θαλασσίων Ερευνών, Παράρτημα Κρήτης (ΕΛ.ΚΕ.Θ.Ε.) 2003: Βοηθός Έρευνας στο Τμήμα Οικολογίας και Εξέλιξης του Πανεπιστημίου της Ουψάλας στη Σουηδία. Υπεύθυνος: Dr. Stefan Bertilsson : Τεχνικός Επιστήμονας στο Τμήμα Ωκεανογραφίας του Ινστιτούτου Θαλάσσιας Βιολογίας Κρήτης (Ι.ΘΑ.ΒΙ.Κ.). Υπεύθυνος: Δρ. Αναστάσιος Τσελεπίδης παρόν: Οργάνωση και λειτουργία του Εργαστηρίου Βενθικής Μικροβιακής Οικολογίας (αίθουσες 143α, 147β στα κτίρια του ΕΛΚΕΘΕ Κρήτης) - Προσδιορισμός προκαρυωτικής (βακτήρια, αρχαία) ποικιλότητας και μικροβιακής σύστασης σε ιζήματα, έδαφος και ατμόσφαιρα με ανάλυση του 16S ribosomal DNA και κατασκευή βιβλιοθηκών κλώνων - Τεχνικές αποτύπωσης βακτηριακών κοινωνιών με την τεχνική Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP) - Κατασκευή φυλογενετικών δέντρων με χρήση του προγράμματος ARB (Linux) - Μεταγονιδιωματική ανάλυση σε συνεργασία με το Joint Genome Institute, Department of Energy, USA (Dr. N. Kyrpides) - Βακτηριακές αφθονίες με τη μέθοδο φθορίζουσας μικροσκοπίας σε ιζήματα - Πειράματα προσδιορισμού εξωκυτταρικής ενζυματικής δραστηριότητας για πρωτεΐνες και υδατάνθρακες σε ιζήματα με φασματοφωτόμετρο φθορισμού (Spectrofluorometer) - Πειράματα προσδιορισμού ρυθμών στοιχειοποίησης οργανικού υλικού σε ιζήματα με GC/TCD, GC/FID - Ανάλυση μικροβιακών βιοδεικτών και προέλευσης οργανικού υλικού σε ιζήματα με χρήση αέριας χρωματογραφίας συνδεδεμένης με φασματομετρία μαζών (Gas Chromatography Mass Spectrometry) - Λειτουργία και Συντήρηση των εργαστηριακών οργάνων: Hitachi F-2000 Spectrofluorometer HP5890 Gas Chromatographer Thermal Conductivity Detector Flame Ionization Detector HP6890 Gas Chromatographer Mass Spectrometer Συμμετοχή σε ωκεανογραφικές αποστολές στα πλαίσια των ευρωπαϊκών προγραμμάτων INTERPOL, ADIOS, CYCLOPS, BIODEEP, ANREC, HERMES, HERMIONE, REDECO του Ελληνικού Κέντρου Θαλασσίων Ερευνών και CYBO (Cyprus Basin Oceanography) του Κέντρου Ωκεανογραφίας του Πανεπιστημίου της Κύπρου Σεπτέμβριος 2010: Συμμετοχή στην αποστολή SORCERER II GLOBAL OCEAN SAMPLING EXPEDITION (C. VENTER INSTITUTE). Σελίδα 3/11 - Βιογραφικό

4 Συμμετοχή σε ερευνητικά προγράμματα (από το 2000 και μετά) : ΠΕΝΕΔ. Συμμετοχή σε Πρόγραμμα Ενίσχυσης Ερευνητικού Δυναμικού χρηματοδοτούμενο από το Υπουργείο Ανάπτυξης (Γενική Γραμματεία Έρευνας και Τεχνολογίας) και την Ευρωπαϊκή Ένωση. Υπεύθυνοι: Καθ. Νίκος Πανόπουλος, Τμήμα Βιολογίας, Παν/μιο Κρήτης, Ινστιτούτο Μοριακής Βιολογίας και Βιοτεχνολογίας, Ι.Τ.Ε., Καθ. Ευριπίδης Στεφάνου, Τμήμα Χημείας, Πανεπιστήμιο Κρήτης. Ρόλος: Μελέτη της βιοαποδόμησης μίγματος επικίνδυνων για τον άνθρωπο ουσιών που βρίσκονται στο περιβάλλον με τη χρήση ενός νέου βακτηρίου. Τα αποτελέσματα της συγκεκριμένης έρευνας δημοσιεύθηκαν στο διεθνές επιστημονικό περιοδικό Biodegradation (vol. 16: pages ). CYCLOPS (EU - DG XII, EVK3 CT ): CYCLing Of PhosphoruS in the Mediterranean Υπεύθυνος: Δρ. Α. Τσελεπίδης. Ρόλος: Συμμετοχή στην 20ήμερη ωκεανογραφική αποστολή με το ερευνητικό σκάφος «Αιγαίο» του ΕΛ.ΚΕ.Θ.Ε. Πραγματοποίηση αναλύσεων Χημικής Ωκεανογραφίας και βακτηριακής ποικιλότητας σε ιζήματα. Τα αποτελέσματα της συγκεκριμένης έρευνας δημοσιεύθηκαν στο διεθνές επιστημονικό περιοδικό Microbial Ecology (vol. 49, pages ) του ISME (International Society for Microbial Ecology). CYBO: Cyprus Basin Oceanography Υπεύθυνος: Δρ. Γ. Ζοδιάτης, Πανεπιστήμιο Κύπρου. Ρόλος: Συμμετοχή σε ωκεανογραφική αποστολή με το ερευνητικό σκάφος «ΑΙΓΑΙΟ» του ΕΛ.ΚΕ.Θ.Ε. που πραγματοποιήθηκε στη θάλασσα της Λεβαντίνης. Συλλογή δειγμάτων νερού με την τεχνική του φιλτραρίσματος για ανάλυση χλωροφυλλών. ADIOS (EU - DG XII, EVK ): Atmospheric Deposition and Impact of pollutants, key elements and nutrients on the Open Mediterranean Sea. Υπεύθυνος βιολογικής ωκεανογραφίας: Δρ. Α. Τσελεπίδης. Ρόλος: Συμμετοχή στην ωκεανογραφική αποστολή με το ερευνητικό σκάφος «ΑΙΓΑΙΟ» του ΕΛ.ΚΕ.Θ.Ε. που πραγματοποιήθηκε στο Νότιο Ιόνιο Πέλαγος. Συλλογή δειγμάτων ιζημάτων με χρήση δειγματολήπτη τύπου Box corer καθώς και Multi-corer στα οποία πραγματοποιήθηκαν μια σειρά γεωχημικών αναλύσεων, βακτηριακής ποικιλότητας με χρήση τεχνικών αποτύπωσης και κατασκευής μεγάλων βιβλιοθηκών κλώνων του γονιδίου 16S rrna και ανίχνευσης του γονιδίου της διοξυγενάσης για μελέτη της φυσικής ικανότητας βιοεπαναφοράς. Τα αποτελέσματα της συγκεκριμένης έρευνας δημοσιεύθηκαν στο διεθνές επιστημονικό περιοδικό Microbial Ecology (vol. 49, pages και vol. 50, pages ) του ISME (International Society for Microbial Ecology). BIODEEP (EU - DG XII, EVK ): BIOtechnologies from the DEEP. Υπεύθυνος ΕΛΚΕΘΕ: Δρ. Α. Τσελεπίδης. Ρόλος: Συμμετοχή σε 20ήμερη ωκεανογραφική αποστολή με το Ιταλικό ωκεανογραφικό σκάφος Urania. Πραγματοποίηση λεπτομερούς χημικής και μικροβιολογικής μελέτης του χημειοοκλινούς της ανοξικής λεκάνης Bannock που βρίσκεται στο Νότιο Ιόνιο Πέλαγος. Συλλογή ιζημάτων με χρήση δειγματολήπτη τύπου Multi-corer, στα οποία πραγματοποιήθηκαν μια σειρά χημικών αναλύσεων (οργανικού άνθρακα, αλειφατικών υδρογονανθράκων), και αναλύσεων των φωσφολιπιδίων (για τον προσδιορισμό των λειτουργικών ομάδων των μικροβίων). Τα αποτελέσματα της συγκεκριμένης έρευνας δημοσιεύθηκαν στα εξής διεθνή επιστημονικά περιοδικά: 1. Nature (vol. 440, pages ) με τίτλο «Stratified prokaryote network in the oxic-anoxic transition of a deep-sea halocline». 2. Geomicrobiology Journal (vol. 24, pages 19-29) με τίτλο «Organic matter preservation and microbial community accumulations in deephypersaline anoxic basins». 3. Proceeding of the National Academy of Sciences of USA (volume 106, pages ) με τίτλο «Sulfur cycling and methanogenesis drive microbial colonization of the highly sulfidic Urania deep hypersaline basin» Σελίδα 4/11 - Βιογραφικό

5 INTERPOL (EU - DG XII, EVK ): Impact of Natural and Trawling Events on Resuspension, dispersion and fate of POLlutants ( Υπεύθυνοι: Δρ. Β. Λυκούσης, (υπεύθυνος βιολογικής ωκεανογραφίας: Δρ. Α. Τσελεπίδης). Ρόλος: Συμμετοχή σε τρείς ωκεανογραφικές αποστολές που πραγματοποιήθηκαν το Σεπτέμβριο και Οκτώβριο 2001 και Φεβρούαριο Συλλογή δειγμάτων ιζημάτων με χρήση δειγματολήπτη τύπου Box corer καθώς και Multi-corer. Πραγματοποιήθηκαν μετρήσεις στοιχειοποίησης του οργανικού υλικού στο ίζημα καθώς και μετρήσεις εξωκυτταρικής ενζυματικής δραστηριότητας για πρωτεΐνες και υδατάνθρακες. Επίσης πραγματοποιήθηκαν μια σειρά γεωχημικών αναλύσεων και βακτηριακής ποικιλότητας με χρήση τεχνικών αποτύπωσης και κατασκευής μεγάλων βιβλιοθηκών κλώνων του γονιδίου 16S rrna Τα αποτελέσματα της συγκεκριμένης έρευνας δημοσιεύθηκαν στα εξής διεθνή επιστημονικά περιοδικά: 1. Continental Shelf Research με τίτλο «Benthic microbial abundance and activities in an intensively trawled ecosystem (Thermaikos Gulf, Aegean Sea)» vol. 25: pages Continental Shelf Research με τίτλο «Effects of bottom trawling on quantity and biochemical composition of organic matter in coastal marine sediments (Thermaikos Gulf, Aegean Sea, Greece)» vol. 25: pages Microbial Ecology (vol. 49, pages ) του ISME (International Society for Microbial Ecology) με τίτλο «Links between geographic location, environmental factors and microbial community composition in sediments of the Eastern Mediterranean Sea», 4. Microbial Ecology (vol. 50, pages ) του ISME (International Society for Microbial Ecology) με τίτλο «Bacterial community composition in sediments from the Eastern Mediterranean Sea: a comparison of four 16S rdna clone libraries». ANREC (EU - DG XII, QLRT ): Association of physical and biological processes acting on recruitment and post-recruitment of Anchovy Yπεύθυνος: Δρ. Α. Καλλιανιώτης, Διευθυντής Ινστιτούτου Αλιευτικών Ερευνών, Καβάλα, υπεύθυνος Βιολογικής Ωκεανογραφίας: Δρ. Α. Τσελεπίδης. Ρόλος: Συμμετοχή στις 3 ωκεανογραφικές αποστολές του προγράμματος που πραγματοποιήθηκαν με το ερευνητικό σκάφος «ΑΙΓΑΙΟ» την περίοδο Συλλογή ιζημάτων για γεωχημικές αναλύσεις (οργανικού και στοιχειακού άνθρακα, αλειφατικών υδρογονανθράκων), αναλύσεις των φωσφολιπιδίων (για τον προσδιορισμό των λειτουργικών ομάδων των μικροβίων στα ιζήματα) καθώς και ολικών και ενεργών βακτηρίων με χρήση μικροσκοπίου φθορισμού. Τα αποτελέσματα της συγκεκριμένης έρευνας δημοσιεύθηκαν στο διεθνές επιστημονικό περιοδικό Marine Pollution Bulletin με τίτλο «Carbon speciation and composition of natural microbial communities in polluted and pristine sediments of the Eastern Mediterranean Sea». HERMES (GOCE CT ): Hotspot Ecosystem Research on the Margins of European Sea. Υπεύθυνοι: Δρ. Β. Λυκούσης, υπεύθυνος Βιολογικής Ωκεανογραφίας: Δρ. Α. Τσελεπίδης Ρόλος: Υπεύθυνη Mικροβιακής Oικολογίας των WP1 & 5 της Ανατολικής Μεσογείου. Τα αποτελέσματα δημοσιεύθηκαν στα επιστημονικά περιοδικά Deep-Sea Research Part I (με τίτλο: Exo-enzymatic activities and organic matter properties in deep-sea canyon and slope systems off the southern Cretan margin) και Systematic and Applied Microbiology (με τίτλο: Phylogenetic diversity of sediment bacteria from the southern Cretan margin, Eastern Mediterranean Sea). CAREX (EU-FP ). Coordination action for research activities on life in extreme environments (as associated partner) ΗΕΡΜΙΟΝΕ (EU-FP ). Hotspot ecosystem research and man s impact on European Seas (ως Επιστημονικός Υπεύθυνος του Ινστιτούτου Γενετικής - ΕΛΚΕΘΕ) ISO-SOIL (EU-FP ). Contaminant-specific isotope analysis as sharp environmental-forensics tools for site characterisation, monitoring and source apportionment of pollutants in soil (ως Επιστημονικός Υπεύθυνος του ΕΛΚΕΘΕ) Σελίδα 5/11 - Βιογραφικό

6 Συμμετοχή σε Δίκτυα: MARBEF: MARine Biodiversity and Ecosystem Functioning. EU Network of Excellence ( Το πρόγραμμα MARBEF είναι ένα δίκτυο αριστείας χρηματοδοτούμενο από την Ευρωπαϊκή Ένωση στο οποίο συμμετέχουν 82 Ερευνητικά Ινστιτούτα Θαλάσσιας Έρευνας. Σκοπός του συγκεκριμένου προγράμματος είναι η οργάνωση και διασπορά των γνώσεων που έχουν αποκτηθεί στον τομέα της θαλάσσιας βιοποικιλότητας. ΚΜ3ΝΕΤ Τα κύρια αντικείμενα του κοινοτικού προγράμματος Km3Net (διάρκειας 36 μηνών, με έναρξη την ) είναι ο σχεδιασμός και η ανάπτυξη ενός Ευρωπαϊκού υποθαλάσσιου τηλεσκοπίου ανίχνευσης νετρίνο που θα καλύπτει χώρο 1 km3 το οποίο θα εδράζεται στο βυθό και θα είναι καλωδιωμένο με παράκτιες εργαστηριακές εγκαταστάσεις καθώς και η περιβαλλοντική μελέτη των προτεινόμενων περιοχών (Τουλών, Ακρωτήριο Πασσέρο/ ΝΑ Σικελία, Πύλος-Μεθώνη). ESONET NoE: European Sea Floor Observatory NETwork. Το ESONET είναι μια στοχοθετημένη δράση που χρηματοδοτείται από την Ευρωπαϊκή Ένωση που έχει ως σκοπό τη στρατηγική και μακρόχρονη παρακολούθηση των Ηπειρωτικών Περιθωρίων της Ευρώπης. Επιστημονικός Υπεύθυνος Ευρωπαϊκών Προγραμμάτων (Principal Investigator): ISO-SOIL (EU-FP ): Contaminant-specific isotope analysis as sharp environmental-forensics tools for site characterisation, monitoring and source apportionment of pollutants in soil. Allocated Budget for P.I.: 190,138 euros Σελίδα 6/11 - Βιογραφικό

7 Συμμετοχή σε Επιτροπές, Συνέδρια, Ομάδες Εργασίας (από το 2000 και μετά) Παρουσιάσεις σε Επιστημονικά Συνέδρια με Κριτές Π December Polymenakou, P.N., Kyrpides, N., Mandalakis, M., Alexandri, S Metagenomic exploration of the newly discovered hydrothermal vent sites in the submarine Kolumbo volcano (Santorini, Greece). 2 nd National Mikrobiokosmos Conference, Caravel Hotel, Athens. Π December Polymenakou, P.N., Mandalakis, M., isosoil Scientific Party Contaminant-specific isotope analyses as sharp environmental-forensics tools for site characterisation, monitoring and source apportionment of pollutants in soil: the isosoil project. 2 nd National Mikrobiokosmos Conference, Caravel Hotel, Athens. Π December Polymenakou, P.N., Lampadariou, N., Mandalakis, M., Kouridaki, I., Gontikaki, E., Alexandri, S., Tselepides, A., Lykousis, V Exploring the deep-sea microbial habitats of the Eastern Mediterranean Sea. 1 st National Mikrobiokosmos Conference, Demokritos Athens. Π December Gontikaki, E., Mayor, D.J., Polymenakou, P.N., Witte, U Deep-sea benthic community response to a simulated sedimentation event in two contrasting sites. 1 st National Mikrobiokosmos Conference, Demokritos Athens. Π September Borin, S., Tamburini, C., Polymenakou, P.N. Biotechnology potential of the deep Mediterranean Sea. 2 nd Euro- Mediterranean Symposium, Hotel Hilton, Portorosa-Furnari, Messina, Italy. Inivited Talk from Pro. C. Corselli. Π June Polymenakou, P.N., Lampadariou, N., Mandalakis, M., Tselepides, A The unique bacterial diversity of the Eastern Mediterranean deep-sea oxic sediments. EMBO Workshop: Microbial diversity and metagenomics: science, technology, applications and regulatory affairs, Porto Carras Resort, Chalkidiki, Greece. EMBO poster prize: invited talk. Π7. 29 July 3 August Lampadariou, N., Polymenakou, P.N., Tselepides, A Metazoan meiofauna in the Samaria Canyon (Crete, Eastern Mediterranean) and adjacent open slope systems. 13 th International Meiofauna Conference (THIRIMCO), Recife, Pernambuco, Brazil. Π April 2007: Tselepides, A., Lampadariou, N., Polymenakou, P.N. Benthic community structure and function of the deep Eastern Mediterranean Sea. Rapp. Comm. Int. Mer. Medit th CIESM Congress,, Istanbul, Turkey. Π July 2006: Polymenakou, P.N., Tselepides, A. The magnitude of prokaryotic diversity in deep-sea sediments. 11 th Deep-Sea Biology Symposium, Southampton, UK Π June 2006: Fragkioudaki, G., Polymenakou, P.N., Tselepides, A. Environmental control on the distribution of total and active bacteria in sediments of the Thracian Sea. 8 th Pan-Hellenic Symposium of Oceanography & Fisheries, Thessaloniki, Greece Π June 2006: Polymenakou, P.N., Tselepides, A., Stephanou, E.G., Bertilsson, S. Microbial life markers in the deep hypersaline anoxic basins (DHABs) of the South Ionian Sea. 8 th Pan-Hellenic Symposium of Oceanography & Fisheries, Thessaloniki, Greece Π June 2005: Polymenakou, P.N., Bertilsson, S., Tselepides, A., Stephanou, E.G. High bacterial diversity in different sediments of the Eastern Mediterranean Sea: comparison of community composition using molecular-based techniques. American Society for Limnology and Oceanography (ASLO) Summer Meeting 2005, Santiago de Compostela, Spain Π June 2004: Polymenakou, P.N., Bertilsson, S., Tselepides, A., Stephanou, E.G. Comparison of microbial community composition from different sediments of the Eastern Mediterranean Sea using T-RFLP, DGGE and PLFA analysis. Rapp. Comm. Int. Mer. Medit. v. 37, p th CIESM Congress, Barcelona, Spain Π September 2003: Polymenakou, P.N., Bertilsson, S., Tselepides, A., Stephanou, E.G. High bacterial diversity in different sediments of the Eastern Mediterranean Sea: environmental control of community composition. International Symposium Chemistry & Biology of Marine Organisms, Kolympari, Crete, Greece Π May 2003: Polymenakou, P.N., Hatziyanni, E., Tselepides, A., Stephanou, E.G. Effect of incubation experiments on the distribution of different lipid classes (aliphatic hydrocarbons, diglycerides, free fatty acids, glycolipids, phospholipids) in sediments of the Cretan Sea. 7 th Symposium of Oceanography & Fisheries, Hersonissos, Crete, Greece Π September 1998: Goulas, A., Polymenakou, V., Diallinas, G. Molecular determinants involved in function and specificity of nucleobase transporters are conserved in bacteria, fungi, plants and metazoa. Proceedings of the 16 th SMYTE, Small Meeting on Yeast Transport and Energetics, Costa-Papiernicka, Slovakia Σελίδα 7/11 - Βιογραφικό

8 Προσκεκλημένες Ομιλίες June Polymenakou, P.N., Lampadariou, N., Mandalakis, M., Tselepides, A The unique bacterial diversity of the Eastern Mediterranean deep-sea oxic sediments. EMBO Workshop: Microbial diversity and metagenomics: science, technology, applications and regulatory affairs, Porto Carras Resort, Chalkidiki, Greece. The submitted abstract awarded the EMBO poster prize: invited talk September Borin, S., Tamburini, C., Polymenakou, P.N. Biotechnology potential of the deep Mediterranean Sea. 2 nd Euro- Mediterranean Symposium, Hotel Hilton, Portorosa-Furnari, Messina, Italy (invitation from Prof. Ceasare Corselli). 24 October Polymenakou, P.N. Deep-Sea Microbial diversity and ecosystems: The uniqueness of the Eastern Mediterranean Sea. Department of Biological Sciences, University of Cyprus (invitation from lecturer Dr. V. Promponas). 6-7 November Polymenakou, P.N., Mandalakis M. Bacterial pathogens transported with Saharan dust fine particles. Department of Civil, Environmental & Geomatic Engineering, University College London, UK, Working Group on Outdoor Airborne Pathogens and Human Health (invitation from lecturer Dr. Kai-Ma Lai) October Polymenakou P.N. Exploring the deep sea microbial communities of the Eastern Mediterranean Sea. MicrobeGr- Workshop: Molecular approaches to unravel the hidden microbial work, University of Ioannina, Agrinio, Greece. Συμμετοχή σε Επιτροπές 1. Εθνική Πρωτοβουλία Μικροβιόκοσμος: Ταμίας του Διοικητικού Συμβουλίου της Ελληνικής Επιστημονικής Εταιρείας Μικροβιόκοσμος ( 2. Μέλος της Οργανωτικής και Επιστημονικής Επιτροπής του 1 ου, 2ου και 3 ου Συνεδρίου της Επιστημονικής Εταιρείας Μικροβιόκοσμος. 3. Μέλος της Διοικητικής Επιτροπής (steering committee) του Ευρωπαϊκού Ερευνητικού Προγράμματος isosoil (EU-FP ) 4. Οργάνωση της 2 ης Συνάντησης Εργασίας του Ευρωπαϊκού Ερευνητικού Προγράμματος isosoil (EU-FP ) που πραγματοποιήθηκε στις Σεπτεμβρίου 2009 στο Ηράκλειο Κρήτης, Ελλάδα (Ξενοδοχείο Lato) Σελίδα 8/11 - Βιογραφικό

9 Επιλεγμένες Επιστημονικές Δημοσιεύσεις (Περιοδικά, Εφημερίδες, Βιβλία, Ανακοινώσεις. Ειδικές εκδόσεις κα) Δημοσιεύσεις σε Διεθνή Επιστημονικά Περιοδικά με Δείκτη Βαρύτητας 1. Mandalakis, M., Apostolaki, M., Tziaras, T., Polymenakou, P., Stephanou, E.G Free and combined amino acids in marine background atmospheric aerosols over the Eastern Mediterranean. Atmospheric Environment, in press. 2. Kouridaki, I., Polymenakou, P.N.*, Tselepides, A., Mandalakis, M., Smith, K Phylogenetic diversity of sediment bacteria from the deep Northeastern Pacific Ocean: a comparison to the deep Eastern Mediterranean Sea. International Microbiology, 13: Danovaro, R.*, Company, J.B., Corinaldesi, C., D Onghia, G., Galil, B., Gambi, C., Gooday, A.J., Lampadariou, N., Luna, G.-M., Morigi, C., Olu. K., Polymenakou, P., Ramierz-Llodra, E., Sabbatini, A., Sardá, F., Sibuet, M., Tselepides, A Deep-sea biodiversity in the Mediterranean Sea: the known, the unknown and the unknowable. Plos One, 5: e Borin, S., Brusetti, L., Mapelli, F., D Auria, G., Brusa, T., Marzorati, M., Rizzi, A. Yakimov, M., Marty, D., DeLange, G., Van der Wielen, P., Bolhuis, H., McGenity, T., Polymenakou, P.N., Malinverno, E., Giuliano, L., Corselli, C., Daffonchio, D.* Sulfur cycling and methanogenesis primarily drive microbial colonization of the highly sulfidic Urania deep hypersaline basin. Proceedings of the National Academy of Sciences of USA, 106: Polymenakou, P.N., Lampadariou, N., Mandalakis, M., Tselepides, A Phylogenetic diversity of sediment bacteria from the southern Cretan margin (Eastern Mediterranean Sea), Systematic and Applied Microbiology, 32: Polymenakou, P.N., Mandalakis, M., Tselepides, A., Stephanou, E.G Particle size distribution of airborne microorganisms and pathogens during an intense African dust event in the Eastern Mediterranean. Environmental Health Perspectives, 116: (In Science Selection to 2008 March issue of EHP) 7. Polymenakou, P.N., Lampadariou, N., Tselepides, A Exo-enzymatic activities and organic matter parameters in deep-sea canyon and slope systems off the southern Cretan margin. Deep-Sea Research Part I, 55: Polymenakou, P.N., Stephanou, E.G., Tselepides, A., Bertilsson, S Organic matter preservation and microbial community accumulations in deep-hypersaline anoxic basins. Geomicrobiology Journal, 24: Polymenakou, P.N., Fragkioudaki, G., Tselepides, A Bacterial and organic matter distribution in the sediments of the Thracian Sea (NE Aegean). Continental Shelf Research, 27: Daffonchio, D., Borin, S., Brusa, T., Brusetti, L., van der Wielen, P.W., Bolhuis, H., Yakimov, M.M., D'Auria, G., Giuliano, L., Marty, D., Tamburini, C., McGenity, T.J., Hallsworth, J.E., Sass, A.M., Timmis, K.N., Tselepides, A., de Lange, G.J., Hübner, A., Thomson, J., Varnavas, S.P., Gasparoni, F., Gerber, H.W., Malinverno, E., Corselli, C., & Biodeep Scientific Party: Garcin, J., McKew, B., Golyshin, P.N., Lampadariou, N., Polymenakou, P., Calore, D., Cenedese, S., Zanon, F., Hoog, S Stratified prokaryote network in the oxic-anoxic transition of a deep-sea halocline. Nature, 440: Polymenakou, P.N., Stephanou, E.G., Tselepides, A., Bertilsson, S Carbon speciation and composition of natural microbial communities in polluted and pristine sediments of the Eastern Mediterranean Sea. Marine Pollution Bulletin, 52: Polymenakou, P.N., Stephanou, E.G Effect of temperature and additional carbon sources on phenol degradation by an indigenous soil Pseudomonad. Biodegradation, 16: Polymenakou, P.N., Bertilsson, S., Tselepides, A., Stephanou, E.G Links between geographic location, environmental factors and microbial community composition in sediments of the Eastern Mediterranean Sea. Microbial Ecology, 49: Polymenakou, P.N., Tselepides, A., Stephanou, E.G Study of the mineralization effect on the distribution of lipids in sediments from the Cretan Sea: Evidence for hydrocarbon degradation and starvation stress. Continental Shelf Research, 25: Pusceddu, A., Fiordelmondo, C., Polymenakou, P., Polychronaki, T., Tselepides, A., Danovaro, R Effects of bottom trawling on quantity and biochemical composition of organic matter in coastal marine sediments (Thermaikos Gulf, Aegean Sea, Greece). Continental Shelf Research, 25: Polymenakou, P.N., Pusceddu, A., Tselepides, A., Polychronaki, T., Giannakourou, A., Fiordelmondo, C., Hatziyanni, E., Danovaro, R Benthic microbial abundance and activities in an intensively trawled ecosystem (Thermaikos Gulf, Aegean Sea). Continental Shelf Research, 25: Polymenakou, P.N., Bertilsson, S., Tselepides, A., Stephanou, E.G Bacterial community composition in sediments from the Eastern Mediterranean Sea: a comparison of four 16S rdna clone libraries. Microbial Ecology, 50: Σελίδα 9/11 - Βιογραφικό

10 Διατριβές 1. Polymenakou, P PhD: Environmental control on microbial community composition in different sediments from the Eastern Mediterranean Sea: evaluation of the associated molecular markers. Department of Chemistry, University of Crete, Greece. 2. Polymenakou, P MSc: Kinetics of phenol degradation using a new soil bacterium isolate. Department of Chemistry, University of Crete, Greece. 3. Polymenakou, P Diploma: Construction of a chimeric purine transporter in Aspergillus nidulans. Department of Biology, University of Crete, Greece. Επιστημονικά Ενδιαφέροντα Μικροβιόκοσμος ( Μικροβιακή Ποικιλότητα και Λειτουργία Οικοσυστημάτων / Microbial diversity and ecosystem functioning Μοριακή Μικροβιακή Οικολογία / Molecular microbial ecology Εξερεύνηση Ζωής σε Ακραία Περιβάλλοντα Θαλάσσια Βιοτεχνολογία και Μεταγονιδιωματική / Life in Extreme Environments - Marine Biotechnology and Metagenomics Τεχνολογίες Βαθιών Θαλασσών / Deep-sea Technologies Βιοαποδόμηση Οργανικών Ρυπαντών / Biodegradation of organic pollutants Αεροβιολογία: Κλιματικές Αλλαγές και Υγεία / Aerobiology: climate change and health Εκπαιδευτικές Δραστηριότητες 2007-παρόν: Υπεύθυνη μαθήματος «Περιβαλλοντική Μικροβιολογία» στο μεταπτυχιακό προγράμμα σπουδών Επιστήμες και Μηχανική Περιβάλλοντος του Τμήματος Χημείας, Πανεπιστήμιο Κρήτης 2009: Σεμινάριο στα πλαίσια του προπτυχιακού μαθήματος «Θαλάσσια Βιοτεχνολογία» στο Τμήμα Βιολογίας, Πανεπιστήμιο Κρήτης (υπεύθυνη καθηγήτρια: Μ. Κεντούρη) 2007: Επίβλεψη Διατριβής Μεταπτυχιακού Τίτλου Ειδίκευσης Φοιτητών: Ιωάννα Κουριδάκη «Μελέτη της σύστασης των μικροβιακών κοινωνιών σε βαθιά θαλάσσια ιζήματα του Ειρηνικού Ωκεανού», Πανεπιστήμιο Κρήτης, Τμήμα Χημείας : Επίβλεψη Διατριβής Μεταπτυχιακού Τίτλου Ειδίκευσης Φοιτητών: Φραγκιουδάκη Γλυκερία «Μελέτη της κάθετης κατανομής των μικροβιακών κοινωνιών και των περιβαλλοντικών παραμέτρων που τις επηρεάζουν σε ιζήματα του Θρακικού Πελάγους», Πανεπιστήμιο Κρήτης, Τμήμα Βιολογίας 2004: Επίβλεψη Εργαστηριακής Άσκησης (Rotation) Μεταπτυχιακού Φοιτητή: Φραγκιουδάκη Γλυκερία «Προσδιορισμός οργανικού υλικού σε ιζήματα του Θρακικού Πελάγους», Πανεπιστήμιο Κρήτης, Τμήμα Βιολογίας 2002: Επίβλεψη Εργαστηριακής Άσκησης (Rotations) Μεταπτυχιακού Φοιτητή: Μαδή Κατερίνα «Κοκκομετρική ανάλυση ιζημάτων και Υγρή Χρωματογραφία Υψηλής Απόδοσης (High Performance Liquid Chromatography, HPLC)», Πανεπιστήμιο Κρήτης, Τμήμα Βιολογίας : Βοηθός Διδασκαλίας του προπτυχιακού μαθήματος Βιοχημεία στο Τμήμα Χημείας του Πανεπιστημίου Κρήτης Σελίδα 10/11 - Βιογραφικό

11 Άλλες δραστηριότητες 1. Κριτής Εργασιών σε Διεθνή Επιστημονικά Περιοδικά Marine Pollution Bulletin International Journal of Environment and Waste Management Marine Biology Biodegradation Bioremediation Journal Microbial Ecology ISME Journal Saline Systems Canadian Journal of Microbiology Research in Microbiology Marine Ecology Progress Series Environmental Health Perspectives Continental Shelf Research Aquatic Microbial Ecology 2. Συγγραφή Τεχνικού Εργαστηριακού Βιβλίου Συμμετοχή στη συγγραφή του εργαστηριακού βιβλίου «Handbook of Methods for Microbial Ecology used to Study the Biodiversity and Function of Microbial Habitats» στα πλαίσια του προγράμματος Hermes (Yπεύθυνος Prf John Fry, Cardiff University, UK) 3. Αναφορά στον Κυριακάτικο Τύπο Το ΒΗΜΑ ΤΗΣ ΚΥΡΙΑΚΗΣ: ΒΗΜΑ SCIENCE Μην τραγουδάτε στη λασποβροχή: Ποιους κινδύνους για την υγεία μας κρύβει η σκόνη της Σαχάρας που κάθε τόσο κατακλύζει τη χώρα μας. Δημοσιογράφος: Δρ. Ιωάννα Σουφλέρη Σελίδα 11/11 - Βιογραφικό