Το σύνολο των Πιστωτικών Μονάδων (), που απαιτούνται για την απόκτηση του Μ.Δ.Ε., ανέρχονται σε 120. Αναλυτικότερα το πρόγραμμα των μαθημάτων διαμορφώνεται ανά κατεύθυνση ως εξής: 1. ΚΑΤΕΥΘΥΝΣΗ ΒΙΒΛΙΚΩΝ ΣΠΟΥΔΩΝ ΚΑΙΝΗ ΔΙΑΘΗΚΗ - Ειδικά θέματα Εισαγωγής και Ερμηνείας της Κ.Δ. - Ειδικά θέματα Χριστολογίας - Ειδικά Θέματα Πατερικών και Ερμηνευτικών προσεγγίσεων της Αποκάλυψης και των αποκαλυπτικών κινημάτων του 1 ου αι. μ.χ. - Π.Δ. Ειδικά Θέματα Βιβλικής Αρχαιολογίας & Θεσμολογίας - Ειδικά θέματα Θεολογίας Κ.Δ. «Ιωάννεια Γραμματεία» - Ειδικά θέματα Ερμηνείας καί Ερμηνευτικής της Κ.Δ. - Ειδικά Θέματα Ιστορίας της Εποχής της Καινής Διαθήκης - Π.Δ. Ειδικά Θέματα Βιβλικής Θεολογίας & Ιστορίας της Π.Δ. - Ο Απόστολος των Εθνών Παύλος και η Ελλάδα - Π.Δ. Ειδικά Θέματα Ερμηνευτικής καί Ερμηνείας Π.Δ. εκ του Πρωτοτύπου
- Π.Δ. Ειδικά θέματα Εισαγωγής στην Έρευνα του Ιουδαϊσμού 2. ΚΑΤΕΥΘΥΝΣΗ ΕΚΚΛΗΣΙΑΣΤΙΚΗΣ ΓΡΑΜΜΑΤΕΙΑΣ - Ειδικά θέματα Πατρολογίας - Ειδικά θέματα Ελληνικής Εκκλησιαστικής Γραμματολογίας - Ειδικά θέματα Ιστορίας Δογμάτων - Ειδικά θέματα Ερμηνείας Πατέρων-Πατερικής Θεολογίας - Ειδικά θέματα Ερμηνείας - Διδασκαλίας Οικουμενικών Συνόδων - Ειδικά θέματα Κριτικής Έκδοσης Κειμένων - Μεταβυζαντινά κείμενα (θεολογικά, εκκλησιαστικά)
- Ορθόδοξη Πνευματικότητα και σύγχρονος κόσμος - Ειδικά θέματα Ιστορίας και Γραμματείας της Εκκλησίας της Ελλάδος - Ειδικά θέματα Βυζαντινής Θεολογίας - Χειρόγραφη Παράδοση-Συγκέντρωση πηγαίου υλικού - Ησυχαστικές Έριδες και Γρηγόριος Παλαμάς - Ειδικά Θέματα Ορθόδοξης Εκκλησιαστικής Γραμματείας - Ειδικά Θέματα προαγωγής ψυχικής υγείας στην ορθόδοξη εκκλησιαστική γραμματεία 3. ΚΑΤΕΥΘΥΝΣΗ ΘΡΗΣΚΕΙΟΛΟΓΙΑΣ - Διαθρησκειακή Βιοηθική - Νέα θρησκευτικά κινήματα - Γνωσιακή Ψυχολογία της Θρησκείας - Βιβλικά θέματα στη Λογοτεχνία - Ο Θεός των φιλοσόφων - Γυναικεία θρησκευτικότητα
- Διαθρησκειακή Συγκριτική της Τέχνης - Η θρησκευτικότητα στο έργο του Ν. Καζαντζάκη - Αναγεννησιακή Εικονογραφία - Η θέση της γυναίκας στις θρησκείες - Η θέση της θρησκείας στη σύγχρονη κοινωνία - Μεθοδολογία της θρησκειολογικής έρευνας - Πολιτισμική Ψυχολογία της Θρησκείας - Συγκριτική θρησκευτική Λογοτεχνία - Εναλλακτική πνευματικότητα και Ψυχολογία - Ανθρωπολογία της Θρησκείας - Η θρησκευτικότητα στο έργο του Φ. Ντοστογιέφσκι - Μουσειοδιδακτική: θεωρία και πράξη - Ανατολικές θρησκείες στη Δύση - Εκκλησία και Οικονομία - Ο Χριστιανισμός και οι άλλες θρησκείες - Παραφυσικά φαινόμενα - Ιστορία της Νεοελληνικής Λογοτεχνίας - Θρησκευτικός τουρισμός
4. ΚΑΤΕΥΘΥΝΣΗ ΚΑΝΟΝΙΚΟΥ ΔΙΚΑΙΟΥ - Ειδικά θέματα Ερμηνείας Ιερών Κανόνων - Ειδικά θέματα Κανονικού Δικαίου (Ειδικό Μέρος) - Ιεροί Κανόνες και Δόγματα - Ειδικά θέματα Ποινικού Δικαίου της Εκκλησίας - Δογματική και κανονική θεώρηση του μυστηρίου του Γάμου - Ειδικά θέματα Κανονικού Δικαίου (Γενικό Μέρος) - Ειδικά θέματα Οικογενειακού Δικαίου και ισότητας των δύο φύλων - Ειδικά θέματα Ελληνικού Εκκλησιαστικού Δικαίου - Ειδικά θέματα Διδασκαλίας Οικουμενικών Συνόδων
- Ειδικά θέματα Πρακτικών των Οικουμενικών Συνόδων - Μεταβυζαντινά Κανονικά-Ποιμαντικά Κείμενα - Ειδικά θέματα Εγκληματολογίας Θυματολογίας. Θεολογική θεώρηση. - Ειδικά θέματα Γενικής Εκκλησιαστικής Ιστορίας 5. ΚΑΤΕΥΘΥΝΣΗ ΧΡΙΣΤΙΑΝΙΚΗΣ ΑΓΩΓΗΣ, ΠΟΙΜΑΝΤΙΚΗΣ και ΕΠΙΚΟΙΝΩΝΙΑΣ Οι μεταπτυχιακοί φοιτητές και φοιτήτριες της κατεύθυνσης «Χριστιανική Αγωγή, Ποιμαντική και Επικοινωνία» μετά από συνεννόηση με τον/την επιβλέποντα/ουσα και έγκριση του Διευθυντή του ΜΠ θα μπορούν να αντικαταστήσουν ένα (1) από τα μαθήματα του Β και Γ εξαμήνου από άλλη κατεύθυνση Π.Μ.Σ. - Ιστορικοκοινωνικές προϋποθέσεις και θεολογικές τάσεις της Χριστιανικής Αγωγής - Σύγχρονες θεωρίες επικοινωνίας και ορθόδοξη πνευματικότητα - Η συμβουλευτική ψυχολογία στη χριστιανική αγωγή και την ποιμαντική - Φιλοκαλική Ποιμαντική
- Φιλοσοφικές και ψυχοπαιδαγωγικές τάσεις της σύγχρονης σχολικής θρησκευτικής αγωγής - Διαστάσεις κοσμικής και θεολογικής επικοινωνίας - Διάλογος Θεολογίας και Ψυχολογίας - Θεολογία της Ποιμαντικής - Θέματα διδακτικής (θεωρία και πράξη) τού μαθήματος των Θρησκευτικών - Θεολογικές ερμηνείες σε κινηματογραφικά έργα - Ο γάμος και η οικογένεια σ ένα συνεχώς μεταβαλλόμενο κόσμο - Ποιμαντική των κρατουμένων 6. ΚΑΤΕΥΘΥΝΣΗ ΧΡΙΣΤΙΑΝΙΚΗΣ ΛΑΤΡΕΙΑΣ Οι μεταπτυχιακοί φοιτητές και φοιτήτριες της κατεύθυνσης «Χριστιανική Λατρεία» μετά από συνεννόηση με τον/την επιβλέποντα/ουσα και έγκριση του Διευθυντή του Μ.Π. θα μπορούν να επιλέξουν μέχρι δύο (2) μαθήματα από άλλη κατεύθυνση Π.Μ.Σ.
- Πηγές της Λειτουργικής - Πηγές Αγιολογίας - Πηγές της Εκκλησιαστικής Υμνογραφίας - Βυζαντινός Λειτουργικός Τύπος Ευχολόγιο - Βιβλική και εσχατολογική διάσταση της λατρείας - Αγιολογική Αφηγηματολογία - Θεολογία των Εκκλησιαστικών Ύμνων - Ακολουθίες του Νυχθημέρου Ωρολόγιο - Ιστορία και θεολογία του Εορτολογίου - Εκκλησιαστικοί Υμνογράφοι - Ερμηνεία της Θείας Λειτουργίας της Κων/πόλεως