ΕΘΝΙΚΟ ΚΕΝΤΡΟ ΕΡΕΥΝΑΣ ΚΑΙ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΗΣ ΑΝΑΠΤΥΞΗΣ (Ε.Κ.Ε.Τ.Α.) / Ινστιτούτο Εφαρμοσμένων Βιοεπιστημών (ΙΝΕΒ) Θεσσαλονίκη, 07--06 Αριθμ. Πρωτ.: 0000 ΠΡΟΣΚΛΗΣΗ ΕΝΔΙΑΦΕΡΟΝΤΟΣ KAI ΚΑΤΑΘΕΣΗΣ ΠΡΟΣΦΟΡΩΝ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΑΘΕΣΗ ΤΗΣ ΠΡΟΜΗΘΕΙΑΣ «Προμήθεια αντιδραστηρίων και αναλωσίμων» Το Εθνικό Κέντρο Έρευνας και Τεχνολογικής Ανάπτυξης (ΕΚΕΤΑ) / Ινστιτούτο Εφαρμοσμένων Βιοεπιστημών (ΙΝΕΒ), νομικό πρόσωπο ιδιωτικού δικαίου, μη κερδοσκοπικού χαρακτήρα, που εδρεύει στη Θέρμη Θεσσαλονίκης, 6ο χλμ. Οδού Χαριλάου-Θέρμης, προσκαλεί κάθε ενδιαφερόμενο (φυσικό ή νομικό πρόσωπο, ή ενώσεις και κοινοπραξίες αυτών) να υποβάλει πρόταση προσφορά, μη δεσμευτική για το ΕΚΕΤΑ, σύμφωνα με τις τεχνικές προδιαγραφές της παρούσας πρόσκλησης, για την ανάθεση της προμήθειας : «Προμήθεια αντιδραστηρίων και αναλωσίμων» Η συνολική δαπάνη της προμήθειας δεν πρέπει να υπερβαίνει τις δέκα χιλιάδες οκτακόσια ευρώ (0.800,00 ) μη συμπεριλαμβανομένου του ΦΠΑ, ήτοι: δύο χιλιάδες εννιακόσια ευρώ (.900,00 ) μη συμπεριλαμβανομένου του ΦΠΑ για την Ομάδα Α, χίλια πεντακόσια ευρώ (.500,00 ) μη συμπεριλαμβανομένου του ΦΠΑ για την Ομάδα Β, χίλια οκτακόσια ευρώ (.800,00 ) μη συμπεριλαμβανομένου του ΦΠΑ για την Ομάδα Γ, τρεις χιλιάδες τετρακόσια ευρώ (.400,00 ) μη συμπεριλαμβανομένου του ΦΠΑ για την Ομάδα Δ και χίλια διακόσια ευρώ (.00,00 ) μη συμπεριλαμβανομένου του ΦΠΑ για την Ομάδα Ε. Οι υποψήφιοι θα πρέπει να έχουν αποδεδειγμένη επαγγελματική εμπειρία στην υλοποίηση αντίστοιχων προμηθειών και η προσφορά τους να πληροί τις Τεχνικές Προδιαγραφές της παρούσας Πρόσκλησης. Οι ενδιαφερόμενοι παρακαλούνται όπως υποβάλουν κλειστό (σφραγισμένο) φάκελο έγγραφης προσφοράς. Προσφορές μπορούν να υποβληθούν είτε για το σύνολο κάθε ομάδας (για μία ή περισσότερες ομάδες), είτε για το σύνολο της προμήθειας, που αποτελεί αντικείμενο της παρούσας πρόσκλησης όπως προσδιορίζεται ειδικότερα στις τεχνικές προδιαγραφές αυτής με τα εξής στοιχεία: ΠΡΟΣΦΟΡΑ για «Προμήθεια αντιδραστηρίων και αναλωσίμων» Ομάδα Α ή Ομάδα Β ή Ομάδα Γ ή Ομάδα Δ ή Ομάδα Ε Οι προσφορές πρέπει να υποβληθούν μέχρι την Τρίτη, Δεκεμβρίου 06 και ώρα :00 μμ στην ακόλουθη διεύθυνση: ΕΚΕΤΑ / ΙΝΕΒ Θεσσαλονίκη: 6ο χλμ. Χαριλάου-Θέρμης, 5700 Θέρμη Θεσσαλονίκης Γραμματεία ΙΝΕΒ Υπεύθυνος παραλαβής προσφορών: κα Φωτεινή Κοπάνη, τηλ. +0 04987 Για τη λήψη της τελικής απόφασης και επιλογής, μεταξύ των προσφορών που πληρούν τις τεχνικές προδιαγραφές της παρούσας Πρόσκλησης, θα συνεκτιμηθούν: α) Το ύψος της οικονομικής προσφοράς β) H πληρότητα και αρτιότητα της πρότασης γ) Η τεχνική και επαγγελματική ικανότητα των υποψηφίων δ) Η διάρκεια εγγύησης (εφόσον παρέχεται)
ε) Η διαθεσιμότητα στ) Ο χρόνος παράδοσης Η υποβολή της προσφοράς συνεπάγεται την πλήρη και ανεπιφύλακτη αποδοχή από τον υποψήφιο Ανάδοχο όλων των όρων της παρούσας πρόσκλησης. Ο Ανάδοχος υποχρεούται να προσκομίσει φορολογική και ασφαλιστική ενημερότητα για την εξόφλησή του. Επί του αρχικού συμβατικού τμήματος, χωρίς ΦΠΑ και κατά την πληρωμή της σύμβασης παρακρατείται 0,06% υπέρ της Ενιαίας Ανεξάρτητης Αρχής Δημοσίων Συμβάσεων (ΕΑΑΔΗΣΥ), σύμφωνα με το άρθρο 4 παρ. του Ν. 40/0, όπως τροποποιήθηκε και ισχύει. Στοιχεία επικοινωνίας για πληροφορίες και διευκρινήσεις: Αντώνης Μακρής τηλ. +0 5754, email: makris@certh.gr και Αναγνώστης Αργυρίου τηλ. +0 0498475, fax 70, email: argiriou@certh.gr Για το ΕΚΕΤΑ / ΙΝΕΒ Κωνσταντίνος Σταματόπουλος Διευθυντής ΙΝΕΒ
Τεχνικές Προδιαγραφές αντιδραστηρίων και αναλωσίμων Το Ινστιτούτο Εφαρμοσμένων Βιοεπιστημών (ΙΝΕΒ) του Εθνικού Κέντρου Έρευνας και Τεχνολογικής Ανάπτυξης (ΕΚΕΤΑ), στα πλαίσια του ερευνητικού έργου «AgroCycle - Sustainable techno-economic solutions for the agricultural value chain» επιθυμεί να προμηθευτεί τα αναλώσιμα και αντιδραστήρια που περιγράφονται παρακάτω: ΟΜΑΔΑ Περιγραφή CPV Προϋπολογισμός χωρίς ΦΠΑ ( ) Προϋπολογισμός με ΦΠΑ ( ) Α Αντιδραστήρια για κλωνοποίηση και ένζυμα 696500-0.900.596 Β Υλικά απομόνωσης - καθαρισμού DNA 696500-0.500.860 Γ Θρεπτικά - Υλικά 696500-0.800. Δ Αναλώσιμα αλληλούχισης και ολιγονουκλεοτίδια 696500-0.400 4.6 Ε Αναλώσιμα γυαλικά 79000-5.00.488
Ομάδα A: Αντιδραστήρια για κλωνοποίηση και ένζυμα Συνολικός Προϋπολογισμός: Δύο χιλιάδες εννιακόσια ευρώ (.900,00 ) μη συμπεριλαμβανομένου Φ.Π.Α. ή τρεις χιλιάδες πεντακόσια ενενήντα έξι ευρώ (.596,00 ) συμπεριλαμβανομένου Φ.Π.Α. A/A Gibson Assembly Cloning Kit: Κιτ που επιτρέπει την κλωνοποίηση-"συναρμολόγηση" πολλαπλών αλληλοεπικαλυπτόμενων μορίων DNA ανεξαρτήτου μήκους ή συμβατότητας των άκρων, σε ισοθερμική αντίδραση σε ένα σωληνάριο. Περιλαμβάνει Master mix με τις διάφορες ενζυμικές δράσεις που απαιτούνται στο ίδιο ένα ρυθμιστικό διάλυμα (exonuclease proprietary DNA polymerase and DNA ligase). Στο τέλος προκύπτει ένα δίκλωνο απόλυτα σφραγισμένο μόριο DNA για τις εξής εφαρμογές: template for PCR, RCA, direct transformation κ.α. Περιεχόμενα του Kit: Gibson Assembly Master Mix X Gibson Assembly Positive Control X NEB 5-alpha Competent E. coli (High Efficiency) SOC Outgrowth Medium X puc9 Transformation Control Plasmid -0 0.05 ng/μl. ΙΚΑΝΟ ΓΙΑ 0 ΑΝΤΙΔΡΑΣΕΙΣ. κιτ 4 κιτ OneTaq DNA Polymerase: Ειδικό βελτιστοποιημένο μείγμα πολυμερασών Taq και Deep Vent για χρήση στην διεξαγωγή της "δύσκολης" PCR (αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης). Να παρέχεται μαζί με διάλυμα ρυθμιστικό 5Χ αλλά και διάλυμα ειδικό για την χρήση σε PCR όταν υπάρχει υψηλό ποσοστό GC (Γουανιδίνης-Κυτοσίνης) καθώς και ενισχυτικό High GC Enhancer solution. SUPPLIED WITH two 5X buffers: (Standard and GC), as well as a High GC Enhancer solution. 00 units Vent DNA Polymerase: DNA πολυμεράση υψηλής πιστότητας και υψηλής θερμοανθεκτικότητας (high-fidelity thermophilic DNA polymerase High Thermostability: half-life of 6.7 hours at 95 C). Να συνοδεύεται από 0X reaction buffer και 00 mm MgSO4, 00 units 4 LongAmp Taq Reaction Buffer Pack 5 Χ and Magnesium Sulfate (MgSO4) Solution 00mM., 6ml
5 RNase H, recombinant. 5,000 units/ml Να συνοδεύεται από RNase H Reaction Buffer 0Χ (X composition: 50 mm Tris-HCl 75 mm KCl mm MgCl 0 mm DTT ph 8. @ 5 C). Να μπορεί να απενεργοποιηθεί θερμικά στους 65oC 0min, 50 units τεμ. τεμ. 6 NotI-HF (High Fidelity) 500 units. High Fidelity Recombinant Restriction enzyme genetically engineered to reduce Star activity. Ανασυνδυασμένο και γενετικά τροποποιημένο περιοριστικό ένζυμο NotI. Η γενετική τροποποίηση να έχει οδηγήσει στην μείωση της Υπερδραστικότητας (reduced Star Activity). Να συνοδεύεται από το ρυθμιστικό διάλυμα πέψης τύπου CutSmart που επιτρέπει την ταυτόχρονη χρήση πολλών ενζύμων και πλήρη κοπή σε max. 5' αλλά και ολονύκτια κοπή χωρίς απώλεια του δείγματος. Να μπορεί να απενεργοποιηθεί στους 65 o C 0min. 7 Quick-Load -Log DNA Ladder 0.-0.0 kb. Μάρτυρας μοριακών βαρών, συνδυασμός του 00bp DNA Ladder και του kbp DNA Ladder με εύρος από 0.-0.0 kb. Να είναι προαναμεμειγμένος με το Loading Dye και έτοιμος προς χρήση. Ικανό για 50 φορτώσεις. 8 AciI, recombinant conc. 0,000 units/ml. Να συνοδεύεται από το ρυθμιστικό διάλυμα πέψης τύπου CutSmart που επιτρέπει την ταυτόχρονη χρήση πολλών ενζύμων και πλήρη κοπή σε max. 5', 00 units τεμ. τεμ. 9 Tsp45I: Να συνοδεύεται από το ρυθμιστικό διάλυμα πέψης τύπου CutSmart που επιτρέπει την ταυτόχρονη χρήση πολλών ενζύμων, 00 units 0 Monarch PCR & DNA Cleanup Kit (5μg). Πλήρες Κιτ καθαρισμού με στήλες για ταχύτατο καθαρισμό έως 5 μg συμπυκνωμένου, υψηλής ποιότητας DNA από PCR- ή άλλες ενζυματικές αντιδράσεις, με ελάχιστους χρόνους επώασης και φυγοκέντρησης. Οι στήλες να εξασφαλίζουν μηδενική κατακράτηση ρυθμιστικού διαλύματος και να επιτρέπεται η έκλουση του δείγματος σε όγκους τόσο χαμηλούς όσο 6 μl. 50 στήλες κιτ κιτ Shrimp Alkaline Phosphatase (rsap), recombinant, u/μl Να μπορεί να απενεργοποιηθεί στους 65 ο C. Να είναι δοκιμασμένο ένζυμο για καθαρισμό προϊόντων PCR για Downstream Sequencing, να συνοδεύεται από Application Note, 500 units
Exonuclease I, recombinant, 0u/μl. Να μπορεί να απενεργοποιηθεί στους 80 ο C. Να είναι δοκιμασμένο ένζυμο για καθαρισμό προϊόντων PCR για Downstream Sequencing από Application Note, 000 units NEBNext for Illumina: Προετοιμασία από genomic ή CHIP DNA, βιβλιοθήκης θραυσμάτων DNA για αλληλούχηση επόμενης γενιάς, συμβατό με την τεχνολογία Illumina. Να επιτρέπει τη δημιουργία βιβλιοθήκης υψηλής ποιότητας από μικρή ποσότητα DNA ( 500 pg) καθώς και από δύσκολα δείγματα DNA που είναι πλούσια σε GCs ή προέρχονται από παραφινωμένους ιστούς (FFPE). Η προετοιμασία των θραυσμάτων DNA να βασίζεται στη χρήση προσαρμογέων σε σχήμα θηλιάς (loop adaptors). Η δημιουργία της βιβλιοθήκης να περιλαμβάνει την επιδιόρθωση και προετοιμασία των DNA θραυσμάτων για την ακόλουθη σύνδεση των adaptors σε αυτά καθώς και master mix με hotstart πολυμεράση υψηλής πιστότητας (τουλάχιστον 00 φορές μικρότερο ποσοστό σφάλματος από την Taq DNA Polymerase) για την ενσωμάτωση των barcodes και των P5/P7 sequences στα θραύσματα καθώς και για την αύξηση της ποσότητας της παραγόμενης βιβλιοθήκης. Να επιτρέπει τη χρήση barcodes για την ταυτόχρονη αλληλούχηση δειγμάτων. κιτ κιτ 4
Ομάδα Β: Υλικά απομόνωσης - καθαρισμού DNA Συνολικός Προϋπολογισμός: Χίλια πεντακόσια ευρώ (.500,00 ) μη συμπεριλαμβανομένου Φ.Π.Α. ή χίλια οκτακόσια εξήντα ευρώ (.860,00 ) συμπεριλαμβανομένου Φ.Π.Α. Α/Α Κιτ απομόνωσης DNA από αντίδραση PCR ή πήκτωμα αγαρόζης Καθαρισμός PCR προϊόντος και gel extraction να επιτυγχάνονται με το ίδιο kit χρησιμοποιώντας το ίδιο buffer. Η διαδικασία να επιτυγχάνεται σε λιγότερο από 5 λεπτά. Να παρέχει υψηλή ανάκτηση DNA ακόμα και από πολύ μικρά κομμάτια (>65 bp). Να επιτυγχάνεται πλήρης απομάκρυνση των primers. Να είναι δυνατοί μικροί όγκοι έκλουσης (μικρότεροι από 0 μl) και μέχρι 00 μl. Να χρησιμοποιεί τεχνολογία Silica Membrane με spin columns. Να παρέχει DNA έτοιμο προς χρήση, κατάλληλο για κλωνοποίηση, sequencing, PCR, transformation, restriction analysis. Να είναι δυνατή η απομόνωση ssdna και SDS-containing samples. Να περιλαμβάνει διάλυμα δέσμευσης του DNA με δείκτη ph για βέλτιστη απόδοση του kit. Να περιλαμβάνει Gel Extraction and PCR Clean. Για 50 απομονώσεις. κιτ 5 κιτ 4 Κιτ για απομόνωση γενομικού DNA από φυτικά κύτταρα και ιστούς ποσότητας έως 00mg. Να παρέχεται υψηλής καθαρότητας και υψηλής συγκέντρωσης DNA έως 0μg. Ο όγκος έκλουσης να είναι 50 μl. Η διαδικασία να ολοκληρώνεται σε λιγότερο από 0 λεπτά. Η συσκευασία να περιλαμβάνει δύο διαφορετικά lysis buffer για την βέλτιστη χρήση ανάλογα με το δείγμα, φίλτρα και RNase A. Κατάλληλο για όλες τις συνήθεις εφαρμογές. Για 50 απομονώσεις Κιτ για απομόνωση DNA από τρόφιμα ποσότητας 5 έως 00mg. Παρέχεται υψηλής καθαρότητας συγκέντρωση DNA 0. 0μg Να χρησιμοποιεί τεχνολογία Silica Membrane με spin columns Να παρέχει DNA έτοιμο προς χρήση, κατάλληλο για κλωνοποίηση, sequencing, PCR, transformation, restriction analysis. Για 50 απομονώσεις. Κιτ για γρήγορη απομόνωση πλασμιδιακού DNA από αρχικό όγκο καλλιέργειας έως και 0ml (minipreps). Να χρησιμοποιεί κιτ κιτ κιτ κιτ κιτ κιτ 5
τεχνολογία Silica Membrane με spin columns. Να παρέχει DNA με τυπική απόδοση έως και 40 μg. Ο όγκος έκλυσης να μην είναι μεγαλύτερος των 50μl. Να παρέχει DNA έτοιμο προς χρήση, κατάλληλο για κλωνοποίηση, sequencing, PCR,transformation, restriction analysis. Να περιλαμβάνει Plasmid κολόνες, collection tubes, όλα τα απαραίτητα buffers και RNase A. Nα διατίθεται σε συσκευασία των 50 απομονώσεων. Ομάδα Γ: Θρεπτικά Υλικά Συνολικός Προϋπολογισμός: Χίλια οκτακόσια ευρώ (.800,00 ) μη συμπεριλαμβανομένου Φ.Π.Α. ή δύο χιλιάδες διακόσια τριάντα δύο ευρώ (.,00 ) συμπεριλαμβανομένου Φ.Π.Α. Α/Α Yeast Nitrogen Base w/o AA, Carbohydrate & w/as (YNB) 500 gr Yeast Nitrogen Base w/o AA, Carbohydrate & w/o AS (YNB) 500 gr 5-Fluoroorotic acid 0 gr 5 Yeast Extract, microbiology grade Kg 6 D-Glucose (Dextrose) Kg Ομάδα Δ: Αναλώσιμα αλληλούχισης και ολιγονουκλεοτίδια Συνολικός Προϋπολογισμός: Τρεις χιλιάδες τετρακόσια ευρώ (.400,00 ) μη συμπεριλαμβανομένου Φ.Π.Α. ή τέσσερις χιλιάδες διακόσια δεκαέξι ευρώ (4.6,00 ) συμπεριλαμβανομένου Φ.Π.Α. Α/Α Κιτ κλωνοποίησης βασισμένο στην τεχνολογία TOPO-TA που να περιέχει Mach-T chemically competent cells με το pcrii-topo πλασμίδιο, για 0 αντιδράσεις Εξατομικευμένες ολιγονουκλεοτιδικές αλληλουχίες (Custom Primers) που να α) Δύνανται να φτάσουν σε μέγεθος τις 00 βάσεις (00b length), β) η μέση ποσότητα παρεχόμενου προϊόντος να ανέρχεται στα 5 OD Units, γ) να είναι καθαρότητας Desalted και αποδεδειγμένα να δύνανται να χρησιμοποιηθούν για εφαρμογές PCR, δ) να προσφέρεται η δυνατότητα μικτών βάσεων στην παραγγελλόμενη κιτ 5 κιτ βάση.500 βάσεις 6
αλληλουχία, ε) η παραγγελία να γίνεται άμεσα και η παράδοση σε διάστημα 6 εργάσιμων ημερών Αλληλούχιση DNA με τη μέθοδο Sanger για πλασμίδια και PCR προϊόντα, ο χρόνος ανάλυσης να μην υπερβαίνει τις 5 εργάσιμες ημέρες αντίδραση 6 αντιδρ. 5 Αλληλούχιση DNA με τη μέθοδο Sanger για πλασμίδια και PCR προϊόντα σε πλάκες 96 δειγμάτων, ο χρόνος ανάλυσης να μην υπερβαίνει τις 5 εργάσιμες ημέρες αντίδραση πλάκας αντιδρ. πλάκας Ομάδα Ε: Αναλώσιμα γυαλικά Συνολικός Προϋπολογισμός: Χίλια διακόσια ευρώ (.00,00 ) μη συμπεριλαμβανομένου Φ.Π.Α. ή χίλια τετρακόσια ογδόντα οκτώ ευρώ (.488,00 ) συμπεριλαμβανομένου Φ.Π.Α. Α/Α Σκουρόχρωμα βιδωτά φιαλίδια, ml, 000/pk Χ000 τεμ. 000 τεμ. Καπάκια 9mm, βιδωτά PTFE/Silicone, 000/pk Χ000 τεμ. 5000 τεμ. 0,ml Micro Insert x6mm clear glass, 000/pk Χ000 τεμ. 000 τεμ. 4 Rough pump fluid, Inland 45,.06 qt τεμ. τεμ. 7