" + .2 7 03 2 2 0 0) 0 " 6 .2 0 02 2 # * ( 1 # * " # " $ % & ' # ( ) * ) + ), -. / # 0



Σχετικά έγγραφα
$% & '# % ( " ) # % # " *! ) # # # #!

23456µ7839: $;<7=>7!"# $"%!&!'!"# (µ'µ)!"* +,-.!/",0123 4&5)3%.63.)% (-53","17)* 89","1%:!63!&* ;",#!-53%.'* <5",'*!"# ;)3-9%:!&µ7"# ;)!

#$"$%&'("$")*+,-&$$&.&$&!&!" /)*#)"-"#%&#!&#!*)0&&$$*01

!"#ά%&'( 15 )*ή,&, -.'/ό1'&, /( -.ί."3( 4',ώ6 1&' (' 786&%%&9,&/'1έ; <=(/',ί";

(ό*+",-"./0ό*"+: 1+ 20ό3%"4/- Heckscher-Ohlin

! " #$" % & ' &()&#%'*$' +!' " #$

!"# $%&'()*% +,-.%&,/ 0) $.)&-.,* 1%(23-%/,*

!"#"$%&'& ()& 02.1/ 2014

ĀĀĀĀĀ ĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀĀȀ ЀԀ

Cc Cj e+f '' ' 3j Cc Cc 2 2 " +" ' ) F C C C C C C C C Cc 3- C- m & " "# " ) F 3 Cc 30 C, 2 " +" ' ) F j 3. C- l &+' " C C C C C C C C C C C j/ C- C.

#&' ()* #+#, 2 )' #$+34 4 )!' 35+,6 5! *,#+#26 37)*! #2#+#42 %8')* #44+#%$,)88) 9 #,6+-55 $)8) -53+2#5 #6) :&' 2#3+23- ##) :* #-) ''

SUPPORTING INFORMATION

Το άτομο του Υδρογόνου

!"ά$%&' 11 () *+,)$%ί).)" /" *0"01ώ3%"4 1'4!"%56/ύ4 *80/+".ή4 :/$"1".ή4

Είσοδος και Έξοδος. (Input and Output) Διαφάνειες από τους Robert Sedgewick και Kevin Wayne. Τι θα δούµε σήµερα

ΕΒ ΟΜΑ ΙΑΙΟ ΩΡΟΛΟΓΙΟ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ Α ΕΞΑΜΗΝΟΥ

Parts Manual. Trio Mobile Surgery Platform. Model 1033

The effect of curcumin on the stability of Aβ. dimers

1417 Ν. 23(ΙΙ)/99. E.E. Παρ. Ι(Π) Αρ. 3322,

ΜΟΝΑΔΑ ΜΕΣΡΗΗ ΠΟΟ ΣΗΣΑ ΤΝΟΛΟ ΑΝΕΤ ΦΠΑ ΣΚΜΗ ΜΟΝΑΔΟ ΑΝΕΤ ΦΠΑ ΕΚΔΟ 1. DVD R ΑΠΛΑ ΕΓΓΡΑΦΗ CPV : CD R ΑΠΛΑ ΕΓΓΡΑΦΗ CPV :

Παραγωγή ήχου από ψάρια που υέρουν νηκτική κύστη: Παραμετρική ανάλυση του μοντέλου

ΑΙΩΝΑ. ΜΑΘΗΜΑ ΛΑΟΓΡΑΦΙΑ ΚΑΘΗΓΗΤΗΣ κ.μαρινα ΒΡΕΛΛΗ-ΖΑΧΟΥ ΟΝΟΜΑΤΕΠΩΝΥΜΟ ΚΑΛΑΤΗ ΕΜΜΑΝΟΥΕΛΑ ΑΡΙΘΜΟΣ ΜΗΤΡΩΟΥ 6084 ΕΞΑΜΗΝΟ Γ (3006 ~ 00Fj

ΓΕΝΙΚΗ ΣΥΝΕΛΕΥΣΗ Ε.Φ.Ο.Τ. ΣΑΒΒΑΤΟ , ΜΟΥΣΕΙΟ ΜΑΡΑΘΩΝΙΟΥ ΔΡΟΜΟΥ ΣΤΟΝ ΜΑΡΑΘΩΝΑ - ΣΩΜΑΤΕΙΑ ΜΕ ΔΙΚΑΙΩΜΑ ΨΗΦΟΥ(ΑΛΦΑΒΗΤΙΚΑ)

Η ΒΙΒΛΙΟΘΗΚΗ ΤΟΥ ΑΡΧΟΝΤΙΚΟΥ ΤΟΣΙΤΣΑ ΚΑΙ Ο ΕΥΑΓΓΕΛΟΣ ΑΒΕΡΩΦ-ΤΟΣΙΤΣΑΣ ΩΣ ΒΙΒΛΙΟΣΥΛΛΕΚΤΗΣ

Supporting Information

Διευθύνοντα Μέλη του mathematica.gr

ΕΛΛΗΝΙΚΗ ΗΜΟΚΡΑΤΙΑ ΗΜΟΣ ΑΜΥΝΤΑΙΟΥ ΟΙΚΟΝΟΜΙΚΗ ΕΠΙΤΡΟΠΗ ΑΡΙΘΜΟΣ ΑΠΟΦΑΣΗΣ 275/2015

4.3 ΟΓΚΟΣ ΠΡΙΣΜΑΤΟΣ ΚΥΛΙΝ ΡΟΥ

ΒΕΛΤΙΩΤΙΚΕΣ ΠΑΡΕΜΒΑΣΕΙΣ ΣΥΝΤΗΡΗΣΗΣ ΟΔΟΣΤΡΩΜΑΤΩΝ

Supporting Information

SEN TRONIC AG A AB 93 :, C,! D 0 7 % : 3 A 5 93 :

È

ΡΗΞΗ ΤΩΡΑ ΜΕ ΤΗΝ ΕΕ ΤΟΥ ΠΟΛΕΜΟΥ. Φρίκη στο Παρίσι Γυρίστε στις σελίδες 2, 3, 8. 9, 10. των Μνημονίων και του ρατσισμού Η ΠΑΝΕΡΓΑΤΙΚΗ ΑΝΟΙΞΕ ΤΟ ΔΡΟΜΟ

ΚEΦΑΛΑΙΟ 1. Πίνακες. Από τα παραπάνω γίνεται αντιληπτό ότι κάθε γραµµή και στήλη ενός πίνακα A ορίζει µονοσήµαντα τη θέση κάθε στοιχείου A

ΕΞΕΤΑΣΕΙΣ ΣΤΗ ΓΕΝΙΚΗ ΧΗΜΕΙΑ

ΚΕΦΑΛΑΙΟ 2. Περιγραφή της Κίνησης. 2.1 Κίνηση στο Επίπεδο

!"# $%& '"& " (!")* #+,--

VBA Microsoft Excel. J. Comput. Chem. Jpn., Vol. 5, No. 1, pp (2006)

KEΦΑΛΑΙΟ 3 ΟΞΕΑ - ΒΑΣΕΙΣ ΚΑΙ ΙΟΝΤΙΚΗ ΙΣΟΡΡΟΠΙΑ

Mandelamide-Zinc Catalyzed Alkyne Addition to Heteroaromatic Aldehydes

ΣΤΡΙΨΗ ΜΕΘΟΔΟΙ ΠΡΟΣΔΟΣΗΣ ΤΗΣ ΣΤΡΙΨΗΣ ΠΤΥΧΙΑΚΗ ΕΡΓ ΑΣΙΑ. για την απόκτηση Πτυχίου ΚΛΩΣΤΟΥΦΑΝΤΟΥΡΓΙΑΣ. με την συνεργασία του Επίκουρου καθηγητή

ΟΑΕΔ ΣΥΝΟΠΤΙΚΗ ΕΚΘΕΣΗ ΕΓΓΕΓΡΑΜΜΕΝΟΙ ΣΤΟ ΜΗΤΡΩΟ ΤΟΥ ΟΑΕΔ



Exercises 10. Find a fundamental matrix of the given system of equations. Also find the fundamental matrix Φ(t) satisfying Φ(0) = I. 1.

SIEMENS Squirrel Cage Induction Standard Three-phase Motors

Spherical Coordinates

Mean bond enthalpy Standard enthalpy of formation Bond N H N N N N H O O O

ΔΗΛΩΣΗ περιουσιακής κατάστασης έτους 2013

ΘΕΡΜΟΚΗΠΙΑΚΕΣ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΕΣ ΕΚΤΟΣ ΕΔΑΦΟΥΣ ΘΡΕΠΤΙΚΑ ΔΙΑΛΥΜΑΤΑ

Π Ι Ν Α Κ Α Σ ΔΟΚΙΜΩΝ ΠΥΡΟΣΒΕΣΤΩΝ ΓΕΝΙΚΩΝ ΚΑΘΗΚΟΝΤΩΝ ΠΟΥ ΠΛΗΡΟΥΝ ΤΑ ΠΡΟΣΟΝΤΑ ΚΑΙ ΤΙΣ ΠΡΟΥΠΟΘΕΣΕΙΣ ΓΙΑ ΠΡΟΣΛΗΨΗ Κατηγορία Α7 -Πληροφορικής Α.Τ.Ε.

Η γεωργία στην ΕΕ απαντώντας στην πρόκληση των κλιματικών αλλαγών

E62-TAB AC Series Features

ΠΡΑΚΤΙΚΟ της 4ης Συνεδρίασης του ιοικητικού Συµβουλίου της Ελληνικής Εταιρείας Βιοχηµείας και Φυσιολογίας της Άσκησης

ΤΙΜΟΛΟΓΙΟ ΠΑΡΑΔΟΣΗΣ ΚΑΤΑΛΟΙΠΩΝ Ο.Λ.ΠΑ. Α.Ε.

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΑ ΜΑΘΗΜΑΤΑ Α ΓΥΜΝΑΣΙΟΥ

Consolidated Drained

Comparative Review Apps towards an in-between performance app

δ 6.19 δ 7.26 HET 007 ΦΟΥΡΑΝΙΟ FURAN ΦΥΣΙΚΕΣ ΚΑΙ ΦΑΣΜΑΤΟΣΚΟΠΙΚΕΣ ΙΔΙΟΤΗΤΕΣ PHYSICAL AND SPECTROSCOPIC PROPOERTIES

Ιςτορία τθσ Νεοελλθνικισ. Τ Γεωργαντά, ΑΔ Ιςτορία τθσ Νεοελλθνικισ

Υπ' αριθμ. Σ.Ο.Χ. : 2/2014. αρ. πρωτ:2168. ημερομηνία ΒΑΘΜΟΛΟΓΙΑ. ΒΑΘΜΟΣ ΒΑΣΙΚΟΥ ΤΙΤΛΟΥ ΕΜΠΕΙΡΙΑ (σε μήνες) ΜΟΝΑΔΕΣ (7) ΜΟΝΑΔΕΣ (3)

!! # ! # % &! !! # % & % % ( ( )

chlorostibine Iou-Sheng Ke and François P. Gabbai Department of Chemistry, Texas A&M University, College Station, TX

College of Life Science, Dalian Nationalities University, Dalian , PR China.

Εισαγωγή στον Προγραμματισμό

# & ( ) # % +,. / 0 1 &2 ( ) 3 % # # %4 % #! % # % # # #5 # # % ) #, # # % # #) #

4 ος Σταθμός του Cyprus Bowling Tour 2013 ΕΓΚΡΙΣΗ TOURNAMENT INFORMATION Ε.Σ.ΜΠΟ.ΛΕΥΚΩΣΙΑΣ & ΚΕΡΥΝΕΙΑΣ TOURNAMENT DELIMITATIONS

Heterobimetallic Pd-Sn Catalysis: Michael Addition. Reaction with C-, N-, O-, S- Nucleophiles and In-situ. Diagnostics

Παρόντες Πρόεδροι Εκπρόσωποι Τ. Κοινοτήτων : Αντιπρόεδρος Δημ. Κοινότητας Βαθέος Νικ. Φραγκογιάννης.

Α. Η ΜΕΛΙΣΣΟΚΟΜΙΑ ΣΤΗΝ ΕΛΛΑΔΑ

ΠΡΟΛΟΓΟΣ. Κλείνει με τις λύσεις όλων των θεμάτων του Μαίου

An experimental and theoretical study of the gas phase kinetics of atomic chlorine reactions with CH 3 NH 2, (CH 3 ) 2 NH, and (CH 3 ) 3 N

Πξόβιεκα Κξππηνγξαθίαο

E.K., Παρ. I, Αρ. 2427,

SOLUTIONS & ANSWERS FOR KERALA ENGINEERING ENTRANCE EXAMINATION-2018 PAPER II VERSION B1

# % & ( & #) # & & ) ) & # & & +, &,. / 0 # 1 # / # / #2 / 3 # &

46 ΒΑΛΑΜΒΑΝΟΥ ΜΑΡΙΑ ΝΙΚΟΛΑΟΣ ΑΙ ΟχιΝαι Β , , Οχι Β Ναι 1.473,80 1

ΘΕΩΡΗΤΙΚΗ ΚΑΙ ΠΕΙΡΑΜΑΤΙΚΗ ΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΤΗΣ ΙΕΡΓΑΣΙΑΣ ΣΚΛΗΡΥΝΣΗΣ ΙΑ ΛΕΙΑΝΣΕΩΣ

Μαθητές που εισήχθησαν στην Τριτοβάθμια Εκπαίδευση με τις Πανελλαδικές Εξετάσεις Όνομα Πατέρα. Μητέρας

Ανάπτυξη Εφαρµογών σε Προγραµµατιστικό Περιβάλλον. Κεφάλαιο 7. Κουτσοδόντης Ανέστης Σελίδα 1

ΕΦΗΜΕΡΙΣ ΤΗΣ ΚΥΒΕΡΝΗΣΕΩΣ

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΑΣΚΗΣΗ 1 ΑΠΕΙΚΟΝΙΣΤΙΚΗ ΜΙΚΡΟΣΚΟΠΙΑ

ΠΙΝΑΚΑΣ ΑΠΟΡΡΙΠΤΕΩΝ ΚΑΤΗΓΟΡΙΑΣ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΑΚΗΣ ΕΚΠΑΙΔΕΥΣΗΣ ΕΝΙΑΙΟΣ

!"#$!"#$%!"#$ Application Note. Pharmaceutical. Udo Huber. ChemStore C/S! ChemStation Plus!"#$ LC LC/MSD CE GC A/D!"#$%&'()*+,!"#$%!"#$!

ΟΔΗΓΙΕΣ ΧΕΙΡΙΣΜΟΥ. ΑΝΑΛΥΤΗΣ ΚΑΥΣΑΕΡΙΩΝ Κane45

Εκδόσεις Μ. Γκιούρδας Ζωοδόχου Πηγής 74, , Αθήνα Τηλ Fax

1. Arrhenius. Ion equilibrium. ก - (Acid- Base) 2. Bronsted-Lowry *** ก - (conjugate acid-base pairs) HCl (aq) H + (aq) + Cl - (aq)

Εἶναι ἄραγε νεκρός ὁ Εὐκλείδης ;

Η Περιφερειακή ιευθυντρία Εκπαίδευσης Θεσσαλίας

ΚΕΦΑΛΑΙΟ 1ο ΔΙΑΝΥΣΜΑΤΑ

k A = [k, k]( )[a 1, a 2 ] = [ka 1,ka 2 ] 4For the division of two intervals of confidence in R +

5/16/2015. Δρ. Σωτήρης Δέμης. Σημειώσεις Εργαστηριακής Άσκησης Κριτήρια Αστοχίας Διάτμηση Τοιχοποιίας. Πολιτικός Μηχανικός (Πανεπιστημιακός Υπότροφος)

Σχάρες, Σούβλες. Είδη Ελαίου. Πτηνοτροφικά. Είδη Φανοποιείας. Δημ. ΣΑΜΙΩΤΗΣ. Σχάρες, Σούβλες, Είδη Ελαίου, Γαλακτοκομικά,

ΑΠΟΛΥΤΗΡΙΕΣ ΕΞΕΤΑΣΕΙΣ Γ ΤΑΞΗΣ ΗΜΕΡΗΣΙΟΥ ΕΝΙΑΙΟΥ ΛΥΚΕΙΟΥ ΣΑΒΒΑΤΟ 7 ΙΟΥΝΙΟΥ 2003 ΕΞΕΤΑΖΟΜΕΝΟ ΜΑΘΗΜΑ: ΧΗΜΕΙΑ ΘΕΤΙΚΗΣ ΚΑΤΕΥΘΥΝΣΗΣ ΣΥΝΟΛΟ ΣΕΛΙ ΩΝ: ΕΞΙ (6)

ΠΡΟΣΩΡΙΝΟΣ ΠΙΝΑΚΑΣ ΑΙΤΗΣΕΩΝ ΩΦΕΛΟΥΜΕΝΩΝ ΓΥΝΑΙΚΩΝ ΜΕ ΕΛΛΙΠΗ ΦΑΚΕΛΟ ΔΙΚΑΙΟΛΟΓΗΤΙΚΩΝ (ΚΑΤΑ ΑΥΞΟΥΣΑ ΣΕΙΡΑ ΚΩΔΙΚΟΥ ΑΝΑ ΔΗΜΟ)

ΓΡΑΠΤΗ ΕΞΕΤΑΣΗ ΣΤΗ ΦΥΣΙΚΗ ΚΑΤΕΥΘΥΝΣΗΣ Γ ΛΥΚΕΙΟΥ

Αποθήκες εδοµένων και Εξόρυξη Γνώσης (Data Warehousing & Data Mining)

Περιεχόμενα. Γλωσσάριo Ενότητα 1: Το νέο περιβάλλον Κεφάλαιο 1: Τι είναι το Internet...29

Ο13. Μεγεθυντικός φακός. 1. Σκοπός. 2. Θεωρία. θ 1

ΠΕΡΙΦΕΡΕΙΑ ΥΤΙΚΗΣ ΜΑΚΕ ΟΝΙΑΣ

Transcript:

! " $% & %'( ),-. 1 3 4 0 5 /,,! 4 # *+ 0 $% 6 & 0 %' "

" + 6 0 6 ( 1 # * # * " # " $ % & ' # ( ) * ) + ), -. / # 0 ". 0 0. 7 03 0 0) 0 " 6 ) + # 5 1

8 ( G RL R L RL + + + G R slv G L slv G RL slv + G RL slv 3 $ ) ( " * * $ 4 35 6 /7 ) 8 ) + ) * 9 + : 8 8 49 0: 64 3 ; & ( 6 8/;: * 8 /; 8 /;7 ) 86/;: 8/< " * = * ) 1 7 = " (> 7 ", * " * 5 == * = 7 ) ( = /? " * 8 /6/;7 ) 86/ /;: 8/: /< " ) * $ = " * 7 " 5 ) * * * *?! " * 8 /6/;: 8/< " =) * + = " 7 + * 57 1 * 8 * 8 = + * * /? ( 6/7 ) 86/;: 8/< * * " * 5 ) + * /? " # $ %$ % & &! " ) * 8 /;: 8/< == ) 8 @ 7 " * * 1 1 (, 7 1 ) $ * * ( @ A " /?! 1 ( $ * * ( @ A " 5 + ε - - + ε - ε - ε - + G R slv G L slv πρ φ = ε [ ε φ] φ = πρ + - - + - + G RL int G RL int + - + - - +. ( <=3 & > 9= 4' ($ (

1 0 & 3? 0 60 & 5?@ A.> BA > 5 7 * * - = 0 1 * " " - + = 0 $ + =" - = 0 + * -) + * ;) " * ; * 1 ; " * 0 7 = " * - # " + * ; B * * * " B * " 0 * ) == 1 " " * 5 + ) ) * # * ) * * ) * 1 + ) # " * ) # * * / 1 *

C $ : 7 D * " $ 7 $ C * " C $ : 7 D truncated ctahedrn # 7 " " # *. 9 0 9 9 $999' 04 0 9 0 0 $9'400 ".999 0 3 3 & 9 water shells r caps

CnQuest " * 1 * =" =, E " # * * ) * 8, * ) =" + 8 " 5 CDED4--- " F" G ) * " # * " " * ) G * ) G " (# * ) Cambridge Crystallgraphic Data Centre http://www.ccdc.cam.ac.uk/ Cambridge Crystallgraphic Data Centre #DOXSIS 3387048 16 9 0 0 0 4 4 8 0 0 301300000010000000000086 137050 HEADER 99740 84360 CSD ENTRY 90 DOXSIS 90 90444000 0 0 0 0 0 0 0168 19P111 440 R=0.0180 COMPND NICOTINE MONOHYDROGEN IODIDE 11 011 CRYST 011 011 13.705 6101 9.974 6110 0011 8.436 011 6110 90.00 6011 90.00 6101 90.00 011 6 P111 C 68H ATOM 3I 140N 1 I1 68 NICO 1 1.583 1.561 0.355 1.00 0.00 I1 ATOM 11550 15650 N1 NICO 410 N1 1 39070 5.355-53910 -5.377 11530 10.5 C1 1.00 41910-410 0.00 1190 C ATOM 390-3350 3 C1 106130 NICO C3 1 33370 5.744-39370 -4.111 9460 10.057 C4 1.00 30500-5630 0.00 9660 C5 ATOM 33450-59370 4 C 11070 NICO C6 1 4610 5.375-19100 -3.343 105490 8.953 C7 1.00 34670 0.00-8430 103700 C8 ATOM 39850 3750 5 C3 96340 NICO C9 1 49810 4.573-150 -3.97 90740 7.98 N 1.00 49050-16310 0.00 9160 C10 ATOM 58640-3330 6 C4 91710 NICO H1 1 45630 4.180-37430 -5.49 17800 8.151 H 1.00 3010-34830 0.00 84940 H3 ATOM 7050-56910 7 C5 88930 NICO H4 1 31160 4.584-69540 -5.9 111430 9.30 H5 1.00 46660-17710 0.00 114730 H6 ATOM 9460-1150 8 C6 9790 NICO H7 1 3110 5.840-6480 -1.905 114010 8.899 H8 1.00 36550 0.00 6990 88960 H9 ATOM 41090 10990 9 C7 105490 NICO H10 1 51390 4.75 1190-0.841 8000 8.748 H11 1.00 54700 0.00 1150 9780 H1 ATOM 45690-18690 10 C8 8150 NICO H13 1 61800 5.461-070 0.374 1000 8.17 H14 1.00 57540 0.00-3340 940 H15 ATOM 61740-1060 11 C9 83660 NICO 1 6.86-0.15 7.655 1.00 0.00 0 3 ATOM 4 5 6 7 1 4 8 N 910 NICO 81 3 5 1 6 7 8 9 6.7 9101011111131313111-1.67 7.699 1.00 0.00... CONECT 1 0 CONECT 3 7 CONECT 3 4 14... MASTER 0 0 0 0 0 0 0 0 8 0 8 0 END

H N O. 9 O O " ) OH HO H N H H NH 8 3 O NH * ) D " = + * ) # * * O O N O O *(+ + NH HN O O O O 1 5 Knwledge f intermlecular interactins Knwledge-based applicatin prgrams Data mining tls fr ligand-receptr cmplexes and IsStar Scatterplts IsStar - knwledge base f infrmatin abut intermlecular interactins SuperStar - prgram fr predicting binding pints in an enzyme active site SuperStar predictins based slely n IsStar data

IsStar Density Surfaces Química Cuántica Se pueden cmbinar ls rbitales atómics para dar rbitales mleculares Orbitales mleculares del agua Orbitales del xígen 5 00 6 06 "0 Orbitales del hidrógen F 7, H> "B & H* 6 9 3 07 $9' 9 3 07 $9' 0 I1 $ 1 D4 1 J4 1 K' L 9 6 9 $L 9' $B.' 81 M" 6 0 8& 1 3,!M 8?;1 " 6 0 8&4?4; 1 8J?;1 " 8?;1 3 J" 6 05 78& http://www.msg.ameslab.gv/gamess/gamess.html @ 5 5 *

Gaussian http://www.gaussian.cm/ Spartan http://www.wavefun.cm/ 5 + @ 5 $9 D6 ' * $ J ' Cn variables: h 1 l1 h l l1 a1 l1 0.96 a1 104.0 Cn valres: h 1 0.96 h l 0.96 104.0 c c 1 l1 h l 1 a1 h l 1 a1 3 10.0 h l 1 a1 3-10.0 h 1 l a1 3 180.0 h 1 l a1 6 10.0 h 1 l a1 6-10.0 l1 1.54 l 1.09 a1 110.0 F 7 7 ( $ 7 5 6 7 / 9 A6 $6 0< 1 " 0 03 6 3 " ' A6 A6 E' A$6 0 3 " 7 3 " ' > A $6 0 3 =.,!EE' G 5,$6 0 3 5 3 >,!M' $ ' 1 J$6 0< 3,!' 6 A1 5 9 5 $9 D6 ' PM3 EF PRECISE HO (water) MOPAC input as a Z-matrix O H 0.96000 1 1 H 0.96000 1 104.00000 1 1 AM1 EF PRECISE HO (water) MOPAC input in Cartesian crdinates O 0.0000 0 0.0000 0 0.0000 0 H 0.9600 1 0.0000 0 0.0000 0 H -0.3 1 0.9315 1 0.0000 0

766 6 35 4 31 1 -*. +!. 3, @ * ( " http://www.cmbi.kun.nl/~schaft/mlden/mlden.html " Calculate new gemetry -+ Read input Calculate gemetry Assign basis set Calculate integrals Initial guess %( Self-cnsistent Field Calculate atmic frces -+ Ppulatin analysis ( % ( Calculate new gemetry -+ Read input Calculate gemetry Assign parameters Self-cnsistent Field iteratins Calculate atmic frces -+ Ppulatin analysis! " # $% $%& '$' ()!* + *,'! -#.* #.* /01,'1 34564! 7(879!+, + ' $,! '+ '+ *:)3*!,,!'*'!'+ )* )(' % & $ #"!, (/ 0 1 4 SMILES Simplified Mlecular Input Line Entry Specificatin Rules 1. Atms are represented by atmic symbls: B, C, N, O, F, P, S, Cl, Br, and I.. Duble bnds are `=', triple bnds are `#'. 3. Branching is indicated by parentheses. 4. Ring clsures are indicated by pairs f matching digits. Examples Depictin SSMILES Name Remark http://www.chemie.uni-erlangen.de/sftware/crina/free_struct.html C methane hydrgens fill nrmal valence CCO ethanl a single bnd is assumed t jin adjacent atms CC(=O)O acetic acid parentheses are used t indicate branching C1CCCCC1 cyclhexane bnds can als be represented by pairs f matching digits

BABEL A prgram designed t intercnvert a number f file frmats currently used in mlecular mdelling Input type cdes: alc -- Alchemy file macmd -- Macrmdel file prep -- AMBER PREP file micr -- Micr Wrld file bs -- Ball and Stick file mmin -- MM Input file bgf -- MSI BGF file mmut -- MM Output file car -- Bisym.CAR file mm3 -- MM3 file bg -- Bgie file mmads -- MMADS file caccrt -- Caca Cartesian file mdl -- MDL MOLfile file cadpac -- Cambridge CADPAC file mlen -- MOLIN file charmm -- CHARMm file mpcrt -- Mpac Cartesian file c3d1 -- Chem3D Cartesian 1 file mpint -- Mpac Internal file c3d -- Chem3D Cartesian file mput -- Mpac Output file cssr -- CSD CSSR file pcmd -- PC Mdel file fdat -- CSD FDAT file pdb -- PDB file gstat -- CSD GSTAT file psin -- PS-GVB Input file dck -- Dck Database file psut -- PS-GVB Output file dpdb -- Dck PDB file msf -- Quanta MSF file feat -- Feature file schakal -- Schakal file fract -- Free Frm Fractinal file shelx -- ShelX file gamut -- GAMESS Output file smiles -- SMILES file gzmat -- Gaussian Z-Matrix file spar -- Spartan file gauut -- Gaussian 9 Output file semi -- Spartan Semi-Empirical file g94 -- Gaussian 94 Output file spmm -- Spartan Ml. Mechanics file gr96a -- GROMOS96 (A) file ml -- Sybyl Ml file gr96n -- GROMOS96 (nm) file ml -- Sybyl Ml file hin -- Hyperchem HIN file wiz -- Cnjure file sdf -- MDL Isis SDF file unixyz -- UniChem XYZ file m3d -- M3D file xyz -- XYZ file macml -- Mac Mlecule file xed -- XED file BABEL A prgram designed t intercnvert a number f file frmats currently used in mlecular mdelling Output type cdes: > ", 6 73 0 0 > 8; diag -- DIAGNOTICS file i -- IDATM file t -- Alchemy file macml -- Mac Mlecule file bs -- Ball and Stick file k -- Macrmdel file bmin -- Batchmin Cmmand file micr -- Micr Wrld file caccrt -- Caca Cartesian file mi -- MM Input file cacint -- Caca Internal file m -- MM Ouput file cache -- CAChe MlStruct file mm3 -- MM3 file c3d1 -- Chem3D Cartesian 1 file mmads -- MMADS file c3d -- Chem3D Cartesian file mdl -- MDL Mlfile file d -- ChemDraw Cnn. Table file ac -- Mpac Cartesian file cn -- Cnjure file ai -- Mpac Internal file cntmp -- Cnjure Template file pc -- PC Mdel file cssr -- CSD CSSR file p -- PDB file feat -- Feature file reprt -- Reprt file fhz -- Fenske-Hall ZMatrix file spar -- Spartan file gamin -- Gamess Input file ml -- Sybyl Ml file gcart -- Gaussian Cartesian file ml -- Sybyl Ml file g -- Gaussian Z-matrix file maccs -- MDL Maccs file file gtmp -- Gaussian Z-matrix tmplt file xed -- XED file hin -- Hyperchem HIN file unixyz -- UniChem XYZ file icn -- Icn 8 file x -- XYZ file ftp://ccl.sc.edu/pub/chemistry/sftware/unix/babel/

) * α 7 α/β http://relibase.ccdc.cam.ac.uk/ http://relibase.ebi.ac.uk/ http://relibase.rutgers.edu/ Binding Site Superpsitin Prtein-ligand database system Based n riginal sftware develped by Manfred Hendlich and clleagues at Merck and Marburg University Enables searching f PDB and f in-huse prprietary databases Relibase: http://relibase.ccdc.cam.ac.uk/

Sme Relibase+ Optins Text searching Sequence searching D substructure and similarity searching 3D substructure searching Lgical cmbinatin f hit lists Searching fr intermlecular interactins Aut-superpsitin f similar binding sites Scripting facility based n Pythn Analysis f 3D searches Ligand Explrer http://lpdb.scripps.edu variables VIP*! "# $% & "'"!!!

5 &? N? " & & & Q RR O? PO P O? " P @ R > ". + @ $&S ' -T,-,T D- DT J- RDJ-J. 6 * Q D7 T7,J7 D!7 M7,T7 5 +4 & 5 9 0 " 7 ' + 4K!TJ"K!ME$,!!T' *F1 * *.5? 5.5 85 * J.: 9.: * BA.> *?@ 5 ;.* 5.9*5 9> A?*9:?5 *9> 5 9! % ) * + % %! + ( $. / 0 1 inhibitr F"5 ; 9;.5??A@ 5 1 > ;?@ 5 "*9*1.A 9A 1?*F J.: 9.: * BA.> **9*1.A! " # $ % & ' ( 1 *9.A9A1 ; > A A?A@ ; A*? @ HIV-1 Prtease Enzyme-Inhibitr Cmplex

CASTp. 0? < 5 + " 1 $ # " " 7 -. / 0 - G N 9 R 9 +, G?0 : &, + @ ' +, - J ", -!K $,!!'U http://www.mldiscvery.cm/ 4 A7 6 6 <. / 0 1? $ 9 http://cast.engr.uic.edu/cast/ 7 = * + " *? 1.0.-$. 0 $. 1 : 6 K!" T E $,! T ', K-", KE $,!!J 'U, K ", T M $,!!J ' http://www.mldiscvery.cm/

1 8,;= # # @ 6 ("TKT T-&S 9 6("DT&S : + ) # # @ 6 ("DM --&S 9 6(",-&S 8 0 *B",5 # +, + # @ 6 ("-J T-&S 9 6("T-&S : +, +, + # @ 6 (",DJ- T-&S 9 6("E-&S Marc, E.; Martín-Santamaría, S.; Cuevas, C.; Gag, F. Jurnal f Medicinal Chemistry 47(18): 4439-445 (004) W.> *A9Q @ 1 A8?* X 4 ) *.*S?@ 5 *1 **.5.A $ > V' <: F.5 1 A.A AB.> *?@ 5 5.*B5 *AB*B** 9* $ & ' *5?: 5.A AB9A 1?* *.5.; $ ' ;< *!'"& )!3!3+ G J 4J $W X' G G = ) 0 4 0

6 ;.* 5.9*5 9> $34-.56.7 '( 5 0 $ ' 5 :.A 5.**5 9> ( @ *A *.9 *.> A( $ 4 4 ' BA9*B*? *.> A( ) " " 9 7 =" * B "0 ( 6 = 03 Q 3 "0( J 7 6 8.05.- 0-. 03 * ( 0 0 & 3 0 9 67/ 0 $ 06( 0 0 4 4 4 ' 7 " 7 " # G 90 0 6 G 0 " G? & 6 6 G 9 " 0 0& 7 " 7 = " * G 96 G G G > & G 9 9" 1 8"0 G @ $%&'()$( *)&+&&()+)*&%& $&),*)+$,-!./

Q 3 "0 *7 & 1 B Y $,!!!' M!E?"1 7,M1 JK? ( B $A9Q' 8?**1 ",$ 3 '. 5$D---' 8?**1 "D$3 ' JT,?"1 7 D- B70 ( @ &5 $D--,',4JEM?"1 7,E $A9QK-' $B7F' $5 &DK' 9 $ 9A9Q' @ $5 &J-4@ A?4@ 5 8?*' 4 * G 6 G G G Z 6.& Q)[ : 9B Z Z " http://www.cmpharm.ucsf.edu/kuntz/dck.html Z 6 3 70 Z 6 : 640 0 999 Z : Z B70 " http://www.ccdc.cam.ac.uk/ C C Z 0 0. Z http://www.trips.cm Z B70 Z 8A* Z http://www.peneye.cm Z 400 43 Z G 6 Z?0 " http://www.scripps.edu/pub/lsn-web/dc/autdck/ G Z : @ 5 Z 5 " http://www.accelrys.cm/cerius/cligandfit.html 1 A@ 5 6 %5 @ 5 "? % Q ) 4< 8 4<A4? 4.*B :(.5&.54DM!"D$,!D' %: 9? 8 Q 3." %?<41 4@?0 4<7 4Q ) 4 & 6 :( / 7 4EDD"ED!$,!' %5 & 3 @ "8* *6 % *9 48Q 4Q ) :. 8 7 4T-T"TDK$,!!,'

$ 7 7 : > W X. 5 1 1 > @ * 6 9> * @ "?@ 5 9AA 5.* 6 7 A9Q A ) G 6 : 6 G : ) G 9 $ 0' G B 70 G B 0 ( Z " 0 $;05 <3.0/' Z " 6 =$63 ' $;05/9 ' Z 63 $005/9 ' Z $005..0'

) * G 9W X 0 4 W X G : W X G @ 0 $W 6X' $W X' 63 G. W 6 X Hw GAs Wrk 5 3 0 0 $7... '4 \ \ $-0-40.0' 6+6+6+6+ = 7+, (+* 4+$ * >+, *?+**!!! ( ) * ) * G B 43 40 4 (. F. ;. ] F ; ] τ, τ D 3 3 6J 6 $.'4J 6 $' $τ' 00 G 4 3 0)3 64 C1 C C3 C4 C5 C6 C7 T X -3..8-8.7 -. 5.8 0.3 4.4 T Y -1.6 1.3.9 -.9 4.1 -.7-0.3 T Z 4.5-4.6 3.1-3.6 4.9 5.6-0. R X 130 97 143 7 19 14 1 R Y 16 31 61 80 5 81 46 R Z 8 149 1 141 6 7 τ 1 131 16 83 31 341 155 6 τ 114 144 9 16 18 75 98

* * " * * " G : W X G B 43 3 3 3 0 G & @ 5 0 0 3 ( G. 4@ 5 3 6 4 4 3 0 + J Z * $0 4 ' Z 0 0 Z > 0 Z * * * =" * = " " # * G 4 3 0)3 64 G 4 3 0)3 64 T X T Y T Z R X R Y R Z τ 1 τ Scre T X T Y T Z R X R Y R Z τ 1 τ Scre C1-3. -1.6 4.5 130 16 8 131 114 0.4 C1-3. -1.6 4.5 130 16 8 131 114 0.4 C.8 1.3-4.6 97 31 149 16 144 0.95 C.8 1.3-4.6 97 31 149 16 144 0.65 C3-8.7.9 3.1 143 61 1 83 9 0.87 C3-8.7.9 3.1 143 61 1 83 9 0.77 C4 -. -.9-3.6 7 80 141 31 16 0.04 C4 -. -.9-3.6 7 80 141 31 16 0.04 C5 5.8 4.1 4.9 19 5 6 341 18 0.3 C5 5.8 4.1 4.9 19 5 6 341 18 0.3 C6 0.3 -.7 5.6 14 81 7 155 75 0.78 C6 0.3 -.7 5.6 14 81 7 155 75 0.78 C7 4.4-0.3-0. 1 46 6 98 0.61 C7 4.4-0.3-0. 1 46 6 98 0.61

Crssver Mutatin C.8 1.3-4.6 97 31 149 16 144 0.65 C.8 0.3-4.6 107 1 149 16 134 0.65 C3-8.7.9 3.1 143 61 1 83 9 0.77 C8-8.7 1.3-4.6 97 61 1 83 144 C9.8 0.3-4.6 107 1 149 16 134 Scre new chrmsmes Delete pr chrmsmes C1 C C3 C4 C5 C6 C7 C8 C9 T X -3..8-8.7 -. 5.8 0.3 4.4-8.7.8 T Y -1.6 1.3.9 -.9 4.1 -.7-0.3 1.3 0.3 T Z 4.5-4.6 3.1-3.6 4.9 5.6-0. -4.6-4.6 R X 130 97 143 7 19 14 1 97 107 R Y 16 31 61 80 5 81 46 61 1 R Z 8 149 1 141 6 7 1 149 τ 1 131 16 83 31 341 155 6 83 16 τ 114 144 9 16 18 75 98 144 134 Scre 0.4 0.65 0.77 0.04 0.3 0.78 0.61 0.83 0.56 C1 C C3 C4 C5 C6 C7 C8 C9 T X -3..8-8.7 -. 5.8 0.3 4.4-8.7.8 T Y -1.6 1.3.9 -.9 4.1 -.7-0.3 1.3 0.3 T Z 4.5-4.6 3.1-3.6 4.9 5.6-0. -4.6-4.6 R X 130 97 143 7 19 14 1 97 107 R Y 16 31 61 80 5 81 46 61 1 R Z 8 149 1 141 6 7 1 149 τ 1 131 16 83 31 341 155 6 83 16 τ 114 144 9 16 18 75 98 144 134 Scre 0.4 0.65 0.77 0.04 0.3 0.78 0.61 0.83 0.56

7 " " @ 1., - + 0 G 4 *, ) " * 1 : & & B* & 0 3 0 $ 5 40' & G 7 B* & & E,T 1 "-- ) 91 : G " ( * * B* 1 $1 '?7 @. 3 B* &6 3 ) G " * =" * B* 9 41?1 4 @ 3 ]5 1 $1 8 63 0A* 3 ' G 1 4 * * = * B*6 & 3 G ) = * - ) D 0 =B* 4 = + B*3 )3 0 B Neural Netwrks G 5 0 0 3 & G.& W X 4 W X G 0 & 3 G : WX 7 H ) $ Σ G = G. 6 6+ 3 3 G 9& 0 40 3

" ( + 4 * 9 4 " * = " 4 * G & Y 1 FA G. 6 W X3 G : 318.86.0 3 0& G. 6! 45! 9.1 G 0 G 90W 6X G W8&0 7XZ 0 640 0 G @ S 0 G 04 "( 03 & & V = & S 0 6 0 V 43 V W X 3 V =0 0 6 V 9 0 J & $ &4B7F4@ '3 E $ &4 B7F4@ 41 49 4B 4 ',---" 0 3 4 & $.Q' "0 0 $*' 5 0!!-,-& 3 3 6 7 ( $' & $ & 3 '4 $' $ 0 0 '4 $'W X 4 4 $6' 6 4 $6' )&01, 3 *))!" 4454

& O 6 $ 4^ ' F" P $ & ',*)+ +-&+) ++-:+) +:,)+-&, +(&)&$:(,,6,(, 5+-$$,&) 585+-&&, +--+$+),&,9&,' $+)+) 7&&)(&+),6 *),6 $),6 3)*&+ 3,-; 13 4 4! 44!!5 5 5!! 5! 45!!!!! 4! 4! 5 4!!! 5! * 4, * 0 ) ( 0 0 34 4 ) 3 4 3 3 & > ( 0 &4 0 6 0 A $.Q' (0,& )*$+,-. /*0) & $ ' J & 9 & 3 0 $.Q ' & 6 6 F".Q 3 0 & S 0 )&01, 3 *))!"4454

A9Q _ R 0 3 & 3 A9Q 7 K" 7" 7 B7F &(,-4EEK B7F(,-4K B7F F" @ (,- 4!DE @ A? @ A? '! R0 (J A9Q _ R 0 3 & 3 6, C B7F &(,-4!-E B7F(! 4EM 9 6& @ (,- 4!DM $ ' J & @ A? '! & S 0.Q0

* 0 6 3 B7F <&)/&,< &!!!!!.004.06>9 B7F1?1 3 B7F"1?1 0 9! *93# 1! * + 9 A 6 &3 3 0 6 $W "X'. /%)= =< ><:?.?,&!#!!!,E 7 0 D S $5 8*' $1 B' 3,! 0!'",!,!) & 6 0 ') @,, 1' '! 6 91 # )Y 5 A) :( / 7 I I4JEM"JET$D--,'

* K K E G &. " I + * @+ 5 90 http://www.chem.x.ac.uk/ccdd/ccdd.html?!!5 S,-DL 6?!!5 Superxide dismutase RAS prteins Cyclxygenase (COX-) Fibrblast Grwth Factr Receptr Vascular Endthelial Grwth Factr Insulin Tyrsine Kinase c-abl Tyrsine Kinase CDK- J 8* J 8J 1 : 8 ) * J 87 ) ) 6/ # * = * * =" * " 4 / ' ( $ ( -. & &. 0'.. 5''K ('L L RAF Prtein-Tyrsine- Phsphatase 1B Farnesyltransferase VEGFr1 http://www.fightaidsathme.rg )/1!!, G + (() 3.J 0. 0 3 0 3 0 G 3 + 3 4 % (( A 6 4 0 4 " 0 " ) 4 0&0 7 $ 3 0..A G((3 4 %. 3 0 $. 43.40 % = % 3. 3 0 6 03 4 6 0 9 6 G(% 3 +. 0.6 0 6

H? 5.9 7.-7.0480. 84.05<// 460 Z 3 3 http://ncbr.chemi.muni.cz/tritn/ http://ncbr.chemi.muni.cz/tritn/ 1 *@ :.5 41 AB5 A L : *.A =*?9A * *" (federic.gag@uah.es