Βασιλική Κουμάντου Βιογραφικό Σημείωμα. Στοιχεία Επικοινωνίας Εργαστήριο Γενετικής Τηλέφωνο:

Σχετικά έγγραφα
ΤΕΙ Θεσσαλίας - Επαγγελμάτων Υγείας - Πρόνοιας (ΣΕΥΠ) Τμήμα Ιατρικών Eργαστηρίων

ΤΕΙ Θεσσαλίας - Επαγγελμάτων Υγείας - Πρόνοιας (ΣΕΥΠ) Τμήμα Ιατρικών Eργαστηρίων

Βιογραφικό Σημείωμα Ημερομ. Ενημέρωσης

NATIONAL AND KAPODISTRIAN UNIVERSITY OF ATHENS SCHOOL OF SCIENCE FACULTY OF INFORMATICS AND TELECOMMUNICATIONS

ΧΡΙΣΤΙΝΑ Ι. ΜΕΣΣΗΝΗ ΛΕΚΤΟΡΑΣ ΜΑΙΕΥΤΙΚΗΣ ΚΑΙ ΓΥΝΑΙΚΟΛΟΓΙΑΣ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΘΕΣΣΑΛΙΑΣ.

ΤΕΙ Θεσσαλίας - Επαγγελμάτων Υγείας - Πρόνοιας (ΣΕΥΠ) Τμήμα Ιατρικών Eργαστηρίων

ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ Α ΕΞΑΜΗΝΟΥ ΤΜΗΜΑΤΟΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ

ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ Α ΕΞΑΜΗΝΟΥ ΤΜΗΜΑΤΟΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ

ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ Α ΕΞΑΜΗΝΟΥ ΤΜΗΜΑΤΟΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ

Βιοπληροφορική. Μαργαρίτα Θεοδωροπούλου. Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας, Λαμία 2016

ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ Α ΕΞΑΜΗΝΟΥ ΤΜΗΜΑΤΟΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ

ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ Α ΕΞΑΜΗΝΟΥ ΤΜΗΜΑΤΟΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ

ΕΙΣΗΓΗΤΙΚΗ ΕΚΘΕΣΗ «Βιοχημεία»

ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ Α ΕΞΑΜΗΝΟΥ ΤΜΗΜΑΤΟΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ

Inferring regulatory subnetworks through the analysis of genome-wide expression profiles

ΕΥΑΓΓΕΛΙΑ ΣΑΜΟΛΗ 1. Εκπαίδευση, μετεκπαίδευση, τίτλοι σπουδών: Ξένες Γλώσσες: Μετεκπαιδευτική κατάρτιση: 2. Διδακτικό έργο Πανεπιστημιακά Μαθήματα

ΜΟΡΙΑΚΗ & ΚΥΤΤΑΡΙΚΗ ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΑ (ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΑ Ι)

ΠΡΟΚΗΡΥΞΗ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΟΣ

ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ Α ΕΞΑΜΗΝΟΥ ΤΜΗΜΑΤΟΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ

Ανάπτυξη Υπολογιστικών Εργαλείων για την Προσομο ίωση Μοριακής Δυναμικής Πρωτεϊνών σε Υδατικό Διάλυμα

ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΟ ΣΗΜΕΙΩΜΑ. Οικογενειακή κατάσταση: Έγγαμος με την Αναστασία Παπαδοπούλου (Δικηγόρος)

ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ Α ΕΞΑΜΗΝΟΥ ΤΜΗΜΑΤΟΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ

ΤΕΙ Θεσσαλίας - Επαγγελμάτων Υγείας - Πρόνοιας (ΣΕΥΠ) Τμήμα Ιατρικών Εργαστηρίων

239 Χημικών Μηχανικών Πάτρας

Τμήμα Πληροφορικής με Εφαρμογές στη Βιοϊατρική

Εργαστήριο Ιατρικής Φυσικής

ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΥΠΡΟΥ ΤΜΗΜΑ ΒΙΟΛΟΓΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ

Βιογραφικά Νέας Πρυτανικής Αρχής Πανεπιστημίου Κρήτης

ΚΑΡΙΟΦΥΛΛΑΣ ΧΑΡΑΛΑΜΠΟΣ του ΓΕΩΡΓΙΟΥ

Σας καλωσορίζουμε στην Ημερίδα της Ομάδας Νέων Ελλήνων Ογκολόγων (ΟΝΕΟ) με θέμα «Βιοπληροφορική και Ογκολογία: από την Έρευνα στην Κλινική Πράξη».

Βιοπληροφορική. Ενότητα 1: Εισαγωγή στη Βιοπληροφορική, 2 ΔΩ. Τμήμα: Βιοτεχνολογίας Όνομα καθηγητή: Τ. Θηραίου

ΕΙΣΑΓΩΓΗ ΣΤΗ ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ

Τ Α Π Ρ Ο Σ Ω Π Α Τ Η Σ Ε Π Ι Σ Τ Η Μ Η Σ Τ Ο Υ Μ Ε Λ Λ Ο Ν Τ Ο Σ

ΑΝΑΓΝΩΣΤΟΠΟΥΛΟΥ ΒΑΣΙΛΕΙΑ ΧΗΜΙΚΟΣ

Προσδιορισμός Σημαντικών Χαρακτηριστικών της Αυθόρμητης Δραστηριότητας Απομονωμένου Εγκεφαλικού Φλοιού in vitro

Σημαντικές διακρίσεις του Τμήματος Βιολογίας του ΕΚΠΑ στην παγκόσμια κατάταξη «US News - Best Global University Rankings 2019»

ΑΓΓΕΛΙΚΗ ΛΥΜΠΕΡΟΠΟΥΛΟΥ , ,

Π Ρ Ο Σ Κ Λ Η Σ Η Ε Κ Δ Η Λ Ω Σ Η Σ Ε Ν Δ Ι Α Φ Ε Ρ Ο Ν Τ Ο Σ Ε Ξ Ω Τ Ε Ρ Ι Κ Ο Υ Σ Υ Ν Ε Ρ Γ Α Τ Η

Το τμήμα Ιατρικών Εργαστηρίων. Π. Καρκαλούσος Επίκουρος καθηγητής κλινικής χημείας

ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΥΠΡΟΥ ΤΜΗΜΑ ΒΙΟΛΟΓΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ

Βιοπληροφορική. Ενότητα 2: Βάσεις Δεδομένων (1/3), 1 ΔΩ. Τμήμα: Βιοτεχνολογίας Όνομα καθηγητή: Τ. Θηραίου

ΣΧΟΛΗ ΕΠΑΓΓΕΛΜΑΤΩΝ ΥΓΕΙΑΣ ΚΑΙ ΠΡΟΝΟΙΑΣ ΤΜΗΜΑ ΙΑΤΡΙΚΩΝ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΩΝ

Ο μαγικός κόσμος της έρευνας στη Βιολογία και Βιοϊατρική

Βιοπληροφορική Ι. Παντελής Μπάγκος. Παν/µιο Στερεάς Ελλάδας

ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΟ ΣΗΜΕΙΩΜΑ ΕΛΕΝΗ ΚΥΡΙΑΚΟΥ (Δρ.)

ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΩΝ ΣΠΟΥΔΩΝ «ΕΦΑΡΜΟΓΕΣ ΣΤΗ ΒΙΟΛΟΓΙΑ»

Διάρκεια Τρία (3) ακαδημαϊκά εξάμηνα


Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών. ( ) Βαθμός: «Άριστα» (9,25/10)

ΑΝΟΙΚΤΑ ΑΚΑΔΗΜΑΪΚΑ ΜΑΘΗΜΑΤΑ ΑΡΙΣΤΟΤΕΛΕΙΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΘΕΣΣΑΛΟΝΙΚΗΣ. Βιοπληροφορική. Ενότητα 6 η : Φυλογενετική ανάλυση 3. Ηλίας Καππάς Τμήμα Βιολογίας

ΒΙΟ003 - Εισαγωγή στη Βιοπληροφορική 1 η Εργαστηριακή Άσκηση. Διαδικτυακές βιβλιογραφικές πηγές (Μοριακής) Βιολογίας και Βιοπληροφορικής

ΕΦΗΜΕΡΙ Α ΤΗΣ ΚΥΒΕΡΝΗΣΕΩΣ

NATIONAL AND KAPODISTRIAN UNIVERSITY OF ATHENS SCHOOL OF SCIENCE DEPARTMENT OF INFORMATICS AND TELECOMMUNICATIONS

ΕΘΝΙΚΟ ΚΑΙ ΚΑΠΟΔΙΣΤΡΙΑΚΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΑΘΗΝΩΝ ΕΙΔΙΚΟΣ ΛΟΓΑΡΙΑΣΜΟΣ ΚΟΝΔΥΛΙΩΝ ΕΡΕΥΝΑΣ

Splice site recognition between different organisms

Τα περιοδικά Science και Nature από το 2009 είναι πλέον διαθέσιμα και ηλεκτρονικά μέσω της ιστοσελίδας της βιβλιοθήκης.

ΠΡΟΣΚΛΗΣΗ ΕΚΔΗΛΩΣΗΣ ΕΝΔΙΑΦΕΡΟΝΤΟΣ

Κατάλογος μαθημάτων (η σελίδα είναι υπό διαμόρφωση)

ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΠΕΛΟΠΟΝΝΗΣΟΥ Σχολή Επιστημών Ανθρώπινης Κίνησης και Ποιότητας Ζωής Τμήμα Νοσηλευτικής

ΕΤΟΣ ΓΕΝΝΗΣΗΣ: 11/6/1966, ΑΤΑΛΑΝΤΗ ΦΘΙΩΤΙΔΟΣ. ΠΑΡΟΥΣΑ ΘΕΣΗ: Τακτικός Καθηγητής στο ΤΜΗΜΑ ΗΛΕΚΤΡΟΝΙΚΗΣ ΤΕΙ ΛΑΜΙΑΣ

ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΟ ΣΗΜΕΙΩΜΑ. Προσωπικές πληροφορίες

ΩΡΟΛΟΓΙΟ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ ΤΜΗΜΑΤΟΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΑΚΑΔΗΜΑΙΚΟ ΕΤΟΣ Κυριότερες αλλαγές που πραγματοποιήθηκαν στο νέο ωρολόγιο πρόγραμμα σπουδών 1)

Ηλεκτρονική και Επεξεργασία της Πληροφορίας ΗΕΠ. Οργάνωση και λειτουργία του Προγράμματος Εκπαιδευτικές Δραστηριότητες

Για τις θέσεις με κωδικούς FUNglucan /1 και /2 ανταποκρίθηκαν στην πρόσκληση οι παρακάτω:

Πανεπιστήμια με Κλάδους Διατροφολογίας Διαιτολογίας

ΟΜΑΔΑ Λ. Αναστασίου Κωνσταντίνος Δεληγιάννη Ισαβέλλα Ζωγοπούλου Άννα Κουκάκης Γιώργος Σταθάκη Αρετιάννα

ΤΕΙ Θεσσαλίας - Επαγγελμάτων Υγείας - Πρόνοιας (ΣΕΥΠ) Τμήμα Ιατρικών Eργαστηρίων

Σπανού Άννα Βιογραφικό Σημείωμα

Α' ΕΤΟΣ ΜΑΘΗΜΑΤΑ ΣΤΟ ΑΜΦΙΘΕΑΤΡΟ ΔΗΜΗΤΡΑΣ, ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑ ΔΡΑΓΑΝΑ

ΕΛΛΗΝΙΚΗ ΔΗΜΟΚΡΑΤΙΑ ΥΠΟΥΡΓΕΙΟ ΠΑΙΔΕΙΑΣ ΚΑΙ ΘΡΗΣΚΕΥΜΑΤΩΝ, ΠΟΛΙΤΙΣΜΟΥ ΚΑΙ ΑΘΛΗΤΙΣΜΟΥ ΓΕΝΙΚΗ ΓΡΑΜΜΑΤΕΙΑ ΕΡΕΥΝΑΣ & ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ

Επάγγελμα: Βιολόγος, Γενετιστής

ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΥΠΡΟΥ ΤΜΗΜΑ ΒΙΟΛΟΓΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ

ΤΕΙ Θεσσαλίας - Επαγγελμάτων Υγείας - Πρόνοιας (ΣΕΥΠ) Τμήμα Ιατρικών Eργαστηρίων

Η συγκρότηση του Εκλεκτορικού Σώματος ορίστηκε από τη Γενική Συνέλευση Ειδικής Σύνθεσης του Τμήματος Βιολογίας στις

Αναζήτηση επιστημονικών δημοσιεύσεων μέσω διαδικτύου

Περιεχόμενα Παρουσίασης

Ε.ΚΕ.Β.Ε. ΑΛΕΞΑΝΔΡΟΣ ΦΛΕΜΙΓΚ ΑΛ. ΦΛΕΜΙΓΚ 34, Τ.Κ ΒΑΡΗ ΑΤΤΙΚΗΣ ΤΗΛ.:

ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΩΝ ΣΠΟΥΔΩΝ. «Εφαρμοσμένη Διαιτολογία Διατροφή»

Προπτυχιακό Πρόγραμμα Σπουδών στο Τμήμα Φαρμακευτικής Α.Π.Θ.

πρόγραμμα στο ΤΕΙ Αθήνας

Ερευνητικό Έργο: ΧΡΟΝΟΒΙΟΛΟΓΙΑ Προσωπικό

Εξόρυξη Γνώσης από Βιολογικά εδομένα

Κατανομή χρηματοδότησης ανά περιφέρεια. Συμμετοχές ελληνικών φορέων στα έργα. Χώρες με περισσότερες Συνεργασίες ΕΛΛΑΔΑ.

Π Ρ Ο Σ Κ Λ Η Σ Η Ε Κ Δ Η Λ Ω Σ Η Σ Ε Ν Δ Ι Α Φ Ε Ρ Ο Ν Τ Ο Σ Ε Ξ Ω Τ Ε Ρ Ι Κ Ο Υ Σ Υ Ν Ε Ρ Γ Α Τ Η

Introduction to Bioinformatics

Βιοπληροφορική. Ενότητα 17: Δομή Πρωτεϊνών, 1 ΔΩ. Τμήμα: Βιοτεχνολογίας Όνομα καθηγητή: Τ. Θηραίου

ΧΑΡΑΛΑΜΠΟΣ Α. ΓΩΓΟΣ ΚΑΘΗΓΗΤΗΣ ΠΑΘΟΛΟΓΙΑΣ IΑΤΡΙΚΟΥ ΤΜΗΜΑΤΟΣ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟΥ ΠΑΤΡΩΝ ΠΡΟΕΔΡΟΣ ΙΑΤΡΙΚΟΥ ΤΜΗΜΑΤΟΣ. Πάτρα 2012

ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ ΕΙΔΙΚΕΥΣΗΣ: ΒΙΟΛΟΓΙΑ ΣΤΟΜΑΤΟΣ. Οδηγός Προγράμματος

BIOΓΡΑΦΙΚΟ ΣΗΜΕΙΩΜΑ ΟΛΥΜΠΙΑΣ ΚΛΗΜΗ-ΚΑΜΙΝΑΡΗ ΣΤΑΔΙΟΔΡΟΜΙΑ. Επίκουρης Καθηγήτριας Τμήμα Δημόσιας Διοίκησης Τομέας Οικονομίας

Πανεπιστήμιο Δυτικής Μακεδονίας. Τμήμα Μηχανικών Πληροφορικής & Τηλεπικοινωνιών. Βιοπληροφορική. Ενότητα 1: Εισαγωγή στη Βιοπληροφορική

ΠΙΝΑΚΑΣ IV.1. Προγράμματα Προπτυχιακών και Μεταπτυχιακών Σπουδών των Τμημάτων του Iδρύματος

Η ΑΞΙΟΛΟΓΗΣΗ ΤΩΝ ΤΜΗΜΑΤΩΝ ΤΗΣ ΣΧΟΛΗΣ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΩΝ ΕΦΑΡΜΟΓΩΝ ΤΟΥ ΤΕΙ ΑΘΗΝΑΣ. ΣΥΜΠΕΡΑΣΜΑΤΑ ΚΑΙ ΜΕΛΛΟΝΤΙΚΟΙ ΣΤΟΧΟΙ

ΣΥΣΤΗΜΑ ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗΣ ΔΕΔΟΜΕΝΩΝ ΠΟΙΟΤΗΤΑΣ - ΑΝΑΦΟΡΑ ΙΔΡΥΜΑΤΟΣ. ΤΜΗΜΑ - Ιατρικής. Δημοκρίτειο Πανεπιστήμιο Θράκης

Characterization of the molecular networks that control pathogenic T-cell driven responses in Multiple Sclerosis using RNA-seq analysis software

ΜΑΡΙΝΑ Ε. ΜΠΙΣΑΚΗ. Τκήκα Δθαξκνζκέλωλ Μαζεκαηηθώλ Παλεπηζηήκην Κξήηεο Τ.Θ , Ηξάθιεην, Κξήηε

FAX

ΕΚΠΑΙΔΕΥΣΗ- ΕΡΓΑΣΙΑΚΕΣ ΘΕΣΕΙΣ

ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΥΠΡΟΥ ΤΜΗΜΑ ΒΙΟΛΟΓΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ

Α' ΕΤΟΣ ΜΑΘΗΜΑΤΑ ΣΤΟ ΑΜΦΙΘΕΑΤΡΟ ΔΗΜΗΤΡΑΣ, ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑ ΔΡΑΓΑΝΑ

ΠΕΡΙΓΡΑΜΜΑ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ

Transcript:

ΒασιλικήΚουμάντου ΒιογραφικόΣημείωμα ΣτοιχείαΕπικοινωνίας ΕργαστήριοΓενετικής Τηλέφωνο:2105294645 email:koumandou@aua.gr ΤίτλοιΣπουδών 1997:ΠτυχίοΤμήματοςΒιολογίας,ΤεχνολογικόΙνστιτούτοτηςΜασαχουσέτης(ΜΙΤ),Η.Π.Α. ΒαθμόςΠτυχίου:9.60/10 2000:ΜεταπτυχιακόΔίπλωμαΕιδίκευσηςστηΒιολογικήΩκεανογραφία,Πανεπιστήμιοτης Ουάσινγκτον, Η.Π.Α. Βαθμός Πτυχίου: 9.25/10 Θέμα μεταπτυχιακής εργασίας: «Προσδιορισμόςμοριακώνδεικτώντουκυτταρικούκύκλουσταδιάτοµα». 2006: Διδακτορική Διατριβή στη Βιοχημεία, Πανεπιστήμιο του Cambridge, Αγγλία. Θέμα: «ΜοριακήγενετικήτουχλωροπλάστηστοδινομαστιγοφόροAmphidiniumoperculatum». Διακρίσεις Μερική υποτροφία από το MIT κατά τη διάρκεια της φοίτησης (1993 1997). Υποτροφία επίδοσης«burchard»(1996). ΥποτροφίαγιατηνεκπόνησημεταπτυχιακώνσπουδώναπότοτμήμαΩκεανογραφίαςτου ΠανεπιστημίουτηςΟυάσινγκτον(1998 2000). ΥποτροφίαγιατηνεκπόνησηδιδακτορικήςδιατριβήςστοΠανεπιστήμιοτουCambridgeαπό τοbiotechnologyandbiologicalsciencesresearchcouncil(bbsrc),τοcambridgeeuropean Trust,καιτοκολλέγιοCorpusChristi(2001 2005). Υποτροφία της Federation of the European Biochemical Societies(FEBS) για παρουσίαση στοφόρουμνέωνεπιστημόνωνκαιστοσυνέδριοfebs IUBMBστηνΑθήνα(2008). Υποτροφία του European Molecular Biology Organization (ΕΜΒΟ) για επίσκεψη στο ΠανεπιστήμιοτηςAlbertaστονΚαναδά(2009). Υποτροφία Marie Curie για την υλοποίηση μεταδιδακτορικής έρευνας στο Ίδρυμα ΙατροβιολογικώνΕρευνώντηςΑκαδημίαςΑθηνών(2013 2015). Επαγγελματικήδραστηριότητα 1996:ΒοηθόςΕρευνήτρια,ΚρατικόΙνστιτούτοΘαλασσίωνΕρευνών,Βαρκελώνη,Ισπανία. 1997:ΒοηθόςΕρευνήτρια,ΚρατικόΚέντροΕρευνώντηςΚαρλσρούης,Γερμανία. 1998:ΣταζστηνΕυρωπαϊκήΕπιτροπή,Βρυξέλλες,Βέλγιο. 2001: Βοηθός Ερευνήτρια, Ινστιτούτο Μοριακής Βιολογίας και Βιοτεχνολγίας, Ίδρυμα ΤεχνολογίαςκαιΈρευνας(ΙΤΕ),ΗράκλειοΚρήτης. 2005 2010: Μεταδιδακτορική Ερευνήτρια, Τμήμα Παθολογίας, Πανεπιστήμιο του Cambridge,Αγγλία.ΧρηματοδοτούμενηαπότοWellcomeTrust. 2010 2011: Ερευνητικός Συνεργάτης, Εργαστήριο Βιοπληροφορικής και Ιατρικής Πληροφορικής, Ίδρυμα Ιατροβιολογικών Ερευνών της Ακαδημίας Αθηνών. Ευρωπαϊκό ΕρευνητικόπρόγραμμαDICODEhttp://cordis.europa.eu/project/rcn/95901_en.html 2011 2013:ΕρευνητικόςΣυνεργάτης,ΤμήμαΒιοχημείαςκαιΜοριακήςΒιολογίας,Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών. Ευρωπαϊκό Ερευνητικό πρόγραμμα INSPIRE http://cordis.europa.eu/project/rcn/100288_en.htmlhttp://inspire.uoa.gr/ 2013 2015: Ερευνητικός Συνεργάτης, Ίδρυμα Ιατροβιολογικών Ερευνών της Ακαδημίας Αθηνών. Ευρωπαϊκό Ερευνητικό πρόγραμμα EBioDiP: «The emergence of bioenergetic diversityinprokaryotes»http://cordis.europa.eu/projects/rcn/106370_en.html 2014 σήμερα:λέκτορας,τμήμαβιοτεχνολογίας,γεωπονικόπανεπιστήμιοαθηνών 1

ΕρευνητικάΕνδιαφέροντα Λειτουργικήγονιδιωματικήκαιεξελικτικήβιολογίασυστημάτων Συγκριτικήγονιδιωματικήκαιφυλογενετικήανάλυσηβιοενεργητικώνμονοπατιών Μοριακήεξέλιξητηςενδοκυτταρικήςκυκλοφορίαςστονκοινόπρόγονοτωνευκαρυωτών Μοριακήεξέλιξητουμηχανισμούδιακυτταρικήςχημικήςεπικοινωνίας(quorum sensing)σε παθογόναβακτήρια ΕργαστηριακέςΔεξιότητες&ΓνώσειςΒιοπληροφορικής: Kυτταρικέςκαλλιέργειες:τρυπανόσωμα,σακχαρομύκητας,βακτήρια,πλαγκτόν. TεχνικέςανασυνδυασμένουDNA,PCR,qRT PCR,RNAi,Southern,Northern. Μεταγραφικήανάλυσημέσωμικροσυστοιχιών. Έκφρασηκαιαπομόνωσηπρωτεϊνών,ανάλυσηWestern,ανοσοκατακρήμνιση. Μικροσκοπίαφωτεινούπεδίουκαιανοσοφθορισμού. Ανάλυσηαλληλουχιών(BLAST,HMMer,Clustal,Muscle)καισυγκριτικήγονιδιωματική. Φυλογενετικήανάλυση(MrBayes,PHYML,RAXML,FigTree). Ανάλυσημικροσυστοιχιών(GenePix,Bluefuse,Genespring,Limma). Ανάλυσηδεδομένωναλληλούχισηςνέαςγενιάς(fastq,bwa,samtools,GATK,IGV). AdobePhotoshopκαιIllustrator. Γλώσσες Αγγλικά,άριστα:Proficiency,Lower,TOEFL,εμπειρίαστοεξωτερικότατελευταία15χρόνια. Ισπανικά,πολύκαλά:ΔίπλωμαΙσπανικώνΣπουδώντουΠανεπιστημίουτηςΒαρκελώνης. Γερμανικά,πολύκαλά:Mittelstuffe,Grundstuffe. Διδακτικήεμπειρία Α.ΠροπτυχιακόΠρόγραμμαΣπουδών «ΜοριακήΒιολογία»(3 ο έτος),βοηθόςεργαστηρίουμιτ,η.π.α.(1997) «Βιολογική Ωκεανογραφία» (4 ο έτος), βοηθός καθηγητή, Σχολή Ωκεανογραφίας, ΠανεπιστήμιοτηςΟυάσινγκτον,Η.Π.Α.(2000) «Κυτταρική Βιολογία» (1 ο έτος), βοηθός εργαστηρίου, Σχολή Βιολογικών Επιστημών, ΠανεπιστήμιοτουCambridge,Αγγλία(2002 2004) «ΜοριακήΒιολογίακαιΒιοχημεία»(2 ο έτος),supervisor,τμήμαβιοχημείας,πανεπιστήμιο τουcambridge,αγγλία(2007 2010) Συν επίβλεψηπτυχιακήςεργασίαςφοιτήτριαςστοεργαστήριοτουκαθηγητήfield,τμήμα Παθολογίας,ΠανεπιστήμιοτουCambridge,Αγγλία(2009) «Γενετική» (υποχρεωτικό μάθημα κορμού, 3 ο Εξάμηνο), συμμετοχή στη διδασκαλία της θεωρίαςκαιτουεργαστηρίου,γεωπονικόπανεπιστήμιοαθηνών(2014 2016) «Βιοπληροφορική» (υποχρεωτικό μάθημα, 5 ο Εξάμηνο), συμμετοχή στη διδασκαλία του εργαστηρίου,τμήμαβιοτεχνολογίας,γεωπονικόπανεπιστήμιοαθηνών(2014 2016) «Εξέλιξη»(υποχρεωτικόμάθημαειδικότητας,4 ο Εξάμηνο),συμμετοχήστηδιδασκαλίατου εργαστηρίου,τμήμαβιοτεχνολογίας,γεωπονικόπανεπιστήμιοαθηνών(2015 2016) «Γενετική Οργανισμών Μοντέλων» (μάθημα επιλογής, 8 ο Εξάμηνο), συμμετοχή στη διδασκαλία της θεωρίας και του εργαστηρίου, Τμήμα Βιοτεχνολογίας, Γεωπονικό ΠανεπιστήμιοΑθηνών(2015) ΜέλοςτριμελούςεπιτροπήςεξέτασηςτηςπτυχιακήςμελέτηςτηςφοιτήτριαςτουΤμήματος Βιοτεχνολογίας του Γεωπονικού Πανεπιστημίου Αθηνών, Σωτηρίας Μηλιά, με θέμα: «Υπολογιστικήμελέτησχεδιασμούεντομοαπωθητικώνενώσεων»(Οκτώβριος2015) Β.ΜεταπτυχιακόΠρόγραμμαΣπουδών 2

Συν επίβλεψημεταπτυχιακώνεργασιώνδύοφοιτητώνστοεργαστήριοτηςκυρίαςκοσσίδα, ΊδρυμαΙατροβιολογικώνΕρευνώντηςΑκαδημίαςΑθηνών.(2011) Προσκεκλημένη ομιλήτρια σε μεταπτυχιακό τετραήμερο εκπαιδευτικό σεμινάριο Πρωτεωμικής και Βιοπληροφορικής, Εθνικό Πανεπιστήμιο Ανώτατης Εκπαίδευσης του Hanoi,Βιετνάμ.(Ιούνιος2011) Συμμετοχή στη διδασκαλία του μαθήματος «Εισαγωγή στη Βιολογία Συστημάτων», FEBS practical & lecture course, Ίδρυμα Ιατροβιολογικών Ερευνών της Ακαδημίας Αθηνών. (Σεπτέμβριος2011) Συμμετοχή στη διδασκαλία των μεταπτυχιακών μαθημάτων «Εισαγωγή στην Ερευνητική Μεθοδολογία» και «Θέματα Γονιδιωματικής Επιστήμης και Ανάλυση Γονιδιωμάτων», στα πλαίσια του Προγράμματος Μεταπτυχιακών Σπουδών «Μοριακή Ιατρική» της Ιατρικής ΣχολήςτουΠανεπιστημίουΑθηνών.(2011 2015) Συμμετοχή στη διδασκαλία του μεταπτυχιακού μαθήματος «Βιοπληροφορική και Βιοστατιστική», στα πλαίσια του Προγράμματος Μεταπτυχιακών Σπουδών «Κλινική Βιοχημεία, Μοριακή Διαγνωστική» του Τμήματος Βιολογίας του Πανεπιστημίου Αθηνών. (2011 σήμερα) Συμμετοχήστηδιδασκαλίαειδικώνσεμιναρίωνγενετικήςκαιλειτουργικήςγονιδιωματικής, στα πλαίσια του Προγράμματος Μεταπτυχιακών Σπουδών «Βιολογία Συστημάτων» του ΤμήματοςΒιοτεχνολογίαςτουΓεωπονικούΠανεπιστημίουΑθηνών.(2015 σήμερα) Μέλος τριμελούς επιτροπής εξέτασης της μεταπτυχιακής διατριβής της φοιτήτριας του ΠΜΣ «Βιολογία Συστημάτων», Ειρήνης Γιαλιτάκη, με θέμα: «Ανίχνευση πολυμορφισμών στο γονίδιο DNAJC11 σε ασθενείς με αμυοτροφική πλευρική σκλήρυνση» (Δεκέμβριος 2015) ΕπιστημονικέςΔραστηριότητες Μέλοςτηςοργανωτικηςεπιτροπήςτου66 ου ΠανελλήνιουΣυνεδρίουτηςΕΕΒΜΒ(2015). Τακτικό μέλος της Ελληνικής Εταιρείας Βιοχημείας και Μοριακής Βιολογίας (ΕΕΒΜΒ), της ΕλληνικήςΕταιρείαςΥπολογιστικήςΒιολογίαςκαιΒιοπληροφορικής(ΕΕΥΒΒ),τηςΕλληνικής Επιστημονικής Εταιρείας Μικροβιόκοσμος, και της Βιοχημικής Εταιρείας της Βρετανίας (BiochemicalSociety). Κριτήςσεδιεθνήεπιστημονικάπεριοδικά:Planta,CurrentBioinformatics,Genomics,Marine Genomics,BMCBioinformatics. MέλοςτουEditorialBoard:JournalofMolecularBiochemistry. Δημοσιεύματα ScopusAuthorID:6506372290,h index:11 1) Howe CJ, Barbrook AC, Koumandou VL, Nisbet RE, Symington HA, Wightman TF (2003) Evolution of the chloroplast genome. Philosophical Transactions of the Royal Society of London,SeriesB.358:99 107 (ImpactFactor:7.06,citations:49) 2) NisbetRE,KoumandouLV,BarbrookAC,HoweCJ(2004) Novelplastidgeneminicirclesin thedinoflagellatea.operculatum.gene331:141 147 (IF:2.14,citations:22) 3) KoumandouVL,NisbetRE,BarbrookAC,HoweCJ(2004)Dinoflagellatechloroplasts:where haveallthegenesgone?review.trendsingenetics20:261 267 (IF:9.92,citations:45) 4) KoumandouVL,HoweCJ(2007)Thecopynumberofchloroplastgeneminicircleschanges dramatically with growth phase in the dinoflagellate Amphidinium operculatum. Protist 158(1):89 103 (IF:3.05,citations:21) 5) Koumandou VL, Dacks JB, Coulson RMR, Field MC (2007) Control systems for membrane fusionintheancestraleukaryote;evolutionoftetheringcomplexesandsmproteins.bmc EvolutionaryBiology7:29 (IF:3.37,citations:105) 3

6) FieldMC,NatesanSKA,Gabernet CastelloC,KoumandouVL(2007)Intracellulartrafficking inthetrypanosomatids.review.traffic8(6):629 39 (IF:4.35,citations:26) 7) Berdalet E, Peters F, Koumandou VL, Roldán C, Guadayol O, Estrada M (2007) Speciesspecific physiological response of dinoflagellates to small scale turbulence. Journal of Phycology43:965 977 (IF:2.84,citations:28) 8) Koumandou VL, Natesan SKA, Sergeenko T, Field MC (2008) The trypanosome transcriptome is remodelled during differentiation but displays limited responsiveness withinlifestages.bmcgenomics9:298 (IF:3.99,citations:63) 9) KoumandouVL,HermanE,KluteM,Nunez MiguelR,DacksJB,FieldMC(2011)Evolutionary reconstructionoftheretromercomplexanditsfunctionintrypanosomabrucei.journalof CellScience124:1496 1509 (IF:5.43,citations:45) 10) Dimitriadis D, Koumandou VL, Trimpalis P, Kossida S (2011) Protein functional links in Trypanosomabrucei,identifiedbygenefusionanalysis.BMCEvolutionaryBiology11:193 (IF:3.37,citations:5) 11) TsagrasoulisD,Danos V,KissaM,TrimpalisP,KoumandouVL,KaragouniAD, TsakalidisA, KossidaS(2012)SAFEsoftwareandFEDdatabasetouncoverprotein proteininteractions usinggenefusion.evolutionarybioinformatics8:47 60 (IF:1.45,citations:3) 12) Koumandou VL, Boehm C, Horder K, Field MC (2013) Evidence for recycling of invariant surfacetransmembranedomainproteinsinafricantrypanosomes.eukaryoticcell12:330 342 (IF:3.18,citations:10) 13) VlachakisD,KoumandouVL,KossidaS(2013)Aholisticevolutionaryandstructuralstudyof flaviviridaeprovidesinsightsintothefunctionandinhibitionofhcvhelicase.peerj1:e74 (IF:2.11,citations:6) 14) Koumandou VL, Scorilas A (2013) Evolution of the plasma and tissue kallikreins and their alternativesplicingisoforms.plosone8(7):e68074 (IF:3.23,citations:9) 15) TrimpalisP,KoumandouVL,PliakouE,AnagnouNP,KossidaS(2013)Genefusionanalysisin thebattleagainsttheafricanendemicsleepingsickness.plosone8(7):e68854 (IF:3.23,citations:1) 16) Koumandou VL, Wickstead B, Ginger M, van der Giezen M, Dacks JB, Field MC (2013) Molecular paleontology and complexity in the last eukaryotic common ancestor. Critical ReviewsInBiochemistry&MolecularBiology48(4):373 396 (IF:7.71,citations:35) 17) Papageorgiou L, Vlachakis D, Koumandou VL, Papangelopoulos N, Kossida S (2013) Computer aideddrugdesignandbiologicalevaluationofnovelanti GreekGoatEncephalitis agents.internationaljournalofsystemsbiologyandbiomedicaltechnologies2(4):1 16 18) PorcelBM,DenoeudF,OpperdoesF,NoelB,MadouiMA,HammartonTC,FieldMC,DaSilva C,CoulouxA,PoulainJ,KatinkaM,JabbariK,AuryJM,CampbellDA,CintronR,DickensNJ, DocampoR,SturmNR,KoumandouVL,FabreS,FlegontovP,LukešJ,MichaeliS,Mottram JC,SzöőrB,ZilbersteinD,BringaudF,WinckerP,Dollet1M(2014)Thestreamlinedgenome ofphytomonasspp.relativetohumanpathogenickinetoplastidsrevealsaparasitetailored forplants.plosgenetics10(2):e1004007 (IF:7.53,citations:19) 19) Karamichali I, Koumandou VL, Karagouni AD, Kossida S (2014) Frequent gene fissions associatedwithhumanpathogenicbacteria.genomics103(1):65 75 (IF:2.28) 20) KoumandouVL,KossidaS(2014)EvolutionoftheF0F1ATPsynthasecomplexinlightofthe patchy distribution of different bioenergetic pathways across prokaryotes. PLoS ComputationalBiology10(9):e1003821 (IF:4.62,citations:2) 21) Papageorgiou L, Loukatou S, Koumandou VL, Makalowski W, Megalooikonomou V, Vlachakis D, Kossida S (2014) Structural models for the design of novel antiviral agents againstgreekgoatencephalitis.peerj2:e664 (IF:2.11) 4

22) Koumandou VL, Kossida S (2015) Evolution of b type cytochromes in prokaryotes. PeerJ PrePrints3:e1950https://doi.org/10.7287/peerj.preprints.1564v1 ΚεφάλαιασεΒιβλία Κουμάντου Β (2008) «Ανάλυση ομοιότητας αλληλουχιών». Στο βιβλίο «Βιοπληροφορική: δυνατότητες και προοπτικές». Έκδοση του Ινστιτούτου Ιατροβιολογικών Ερευνών της ΑκαδημίαςΑθηνών.Επιμελήτριαέκδοσης:ΣοφίαΚοσσίδα.σελ.71 85. KoumandouVL,FieldMC(2011)Theemergenceofcellularcomplexityatthedawnofthe eukaryotes:reconstructingtheendomembranesystemwithinsilicoandfunctionalanalyses. In "Evolutionary Biology Concepts, Biodiversity, Macroevolution and Genome Evolution" pg.153 167.PublishedbySpringer Verlag.Editor:PierrePontarotti Συμμετοχήκαιανακοινώσειςσεσυνέδρια Συνεργάτης παρουσίασης: «Identification of genes expressed specifically during sexual reproduction in a marine centric diatom» στο European Phycological Congress. 21 25/9/1999,MontecatiniTerme,Ιταλία. Ομιλία: «Expression patterns of three putative sexual specific genes in the centric diatom Thalassiosira weissflogii» στο Annual Meeting of the Phycological Society of America, 15 19/7/2000,SanDiego,Καλιφόρνια,Η.Π.Α.JournalofPhycology(2000)36(Supplement3):38. Συνεργάτης παρουσίασης: «Evolution of the chloroplast genome» στο Royal Society DiscussionmeetingonOrganelleFunctionalGenomics.26 27/6/2002,Λονδίνο,Αγγλία. Παρουσίαση πόστερ: «Aberrant minicircles in the dinoflagellate chloroplast genome» στο InternationalCongressofPlantMolecularBiology.23 28/6/2003,Βαρκελώνη,Ισπανία Παρουσίασηπόστερ:«Anomalousplastidgeneorganisationindinoflagellates»στοGordon ResearchConferenceonMarineMicrobes.6 1/6/2004,Roscoff,Γαλλία. ΣυμμετοχήστοRoyalSocietydiscussionmeeting«Majorstepsinevolution:evidence,timing andglobalimpact».26 27/9/2005,Λονδίνο,Αγγλία. Ομιλία: «Developmental regulation of the endocytic system in the parasite Trypanosoma brucei» στο Cold Spring Harbor Laboratory/Wellcome Trust conference on «Genomic Perspectives to Host Pathogen Interactions». 7 10/9/2006, Wellcome Trust Genome Campus,Hinxton,Αγγλία. Παρουσίαση πόστερ: «Genome wide analysis of developmental regulation of trafficking systems in Trypanosoma brucei» στο Kinetoplastid Molecular Cell Biology Conference, 23 26/4/2007,MarineBiologicalLaboratory,Woodshole,Μασαχουσέτη,Η.Π.Α. Συμμετοχή στο Royal Society discussion meeting «Photosynthetic and atmospheric evolution».12 13/11/2007,Λονδίνο,Αγγλία. ΣυμμετοχήστοGordonResearchConferenceontheOriginofLife.20 25/1/2008,Ventura, Καλιφόρνια,Η.Π.Α. Ομιλία: «Life cycle dependent remodelling and limited environmental responsiveness in trypansome membrane transport» στο 8th FEBS IUBMB Young Scientists Forum «Cell Harmony»,26 28/6/2008Λουτράκι,καιπαρουσίασηπόστερστο33οFEBSCongess&11ο IUBMB Conference «Biochemistry of Cell Regulation», 2/6 3/7/2008 Αθήνα. FEBS Journal (2008)275(Supplement1):452. Ομιλία: «Evolutionary relationships of bioenergetic pathways» στο ISSOL International Conference on the Origin of Life, 24 29/9/2008, Φλωρεντία, Ιταλία. Origins of Life and EvolutionofBiospheres(2009)39(3 4):211 212. 5

Ομιλία: «Evolutionary reconstruction of the retromer complex and its function in Trypanosoma brucei» στο συνέδριο της Βρετανικής Εταιρείας Παρασιτολογίας, 30/3 1/4/2010,Cardiff,Ουαλία. Ομιλία: «Evolutionary reconstruction of the retromer complex and its function in Trypanosoma brucei» στο 14ο Συνέδριο Εξελικτικής Βιολογίας, 21 24/9/2010, Μασσαλία, Γαλλία. Παρουσίαση πόστερ: «Evolution of bioenergetic pathways through the study of ATP synthase» στο 62 ο συνέδριο της Ελληνικής Εταιρείας Βιοχημείας και Μοριακής Βιολογίας (ΕΕΒΜΒ),9 11/12/2011,Αθήνα. Συμμετοχή στο 4ο COST Statseq Workshop «Statistical Challenges of the 1000 genome sequencesinplants»,18 19/4/2012,Βερόνα,Ιταλία. Συμμετοχή στο COST Training School on Next Generation Sequencing data analysis, 28 31/5/2012καιστοCOSTWorkshop«NextgenerationSequencing:What'sNext?»1/6/2012, Uppsala,Σουηδία. Συμμετοχή στο workshop on «Next Generation Sequencing technologies and Informatics tools for studying Marine Biodiversity and Adaptation», Marbigen project (FP7 REGPOT 2010 1),1 3/10/2012ΕλληνικόΚέντροΘαλασσίωνΕρευνών,ΗράκλειοΚρήτης. Ομιλία: «Evolutionary and functional relationships between plasmaand tissuekallikreins» στο7 ο συνέδριο της Ελληνικής Εταιρείας Υπολογιστικής Βιολογίας και Βιοπληροφορικής (ΕΕΥΒΒ),4 6/10/2012,ΊδρυμαΤεχνολογίαςκαιΈρευνας(ΙΤΕ),ΗράκλειοΚρήτης. Παρουσίαση πόστερ: «Evolution of bioenergetic pathways through the study of ATP synthase»στοembo/febslecturecourseon«host MicrobeInteractions»30/8 7/9/2013, Σπέτσες. Ομιλία:«AholisticevolutionaryandstructuralstudyofFlaviviridaeprovidesinsightsintothe function and inhibition of Hepatitis C virus helicase» στο 64 ο συνέδριο της Ελληνικής ΕταιρείαςΒιοχημείαςκαιΜοριακήςΒιολογίας(ΕΕΒΜΒ),6 8/12/2013,Αθήνα. Παρουσίασηπόστερ:«EvolutionoftheF0F1ATPsynthasecomplexinbacteriawhichutilize differentbioenergeticpathways»στοemboconference«microbiologyafterthegenomics Revolution:Genomes2014»24 27/6/2014,ΙνστιτούτοΠαστέρ,Παρίσι,Γαλλία. Ομιλία:«EvolutionoftheF0F1ATPsynthasecomplexinlightofthepatchydistributionof different bioenergetic pathways across prokaryotes» στο 9 ο συνέδριο της Ελληνικής ΕταιρείαςΥπολογιστικήςΒιολογίαςκαιΒιοπληροφορικής(ΕΕΥΒΒ),10 12/10/2014,Αθήνα. Παρουσίασηπόστερ:«EvolutionoftheF0F1ATPsynthaseinlightofthepatchydistribution of different bioenergetic pathways across prokaryotes» στο 65 ο συνέδριο της Ελληνικής ΕταιρείαςΒιοχημείαςκαιΜοριακήςΒιολογίας(ΕΕΒΜΒ),28 30/11/2014,Θεσσαλονίκη. Συμμετοχήστο6οΣυνέδριοτηςΕλληνικήςΕταιρείαςΜΙΡΚΟΒΙΟΚΟΣΜΟΣ,Αθήνα. Παρουσίαση πόστερ: «Evolution of b type cytochromes in prokaryotes» στο 40ο FEBS Congress"TheBiochemicalBasisofLife"4 9/7/2015,Βερολίνο,Γερμανία. Ομιλία:«Evolutionofb typecytochromesinprokaryotes»&«bioenergeticdiversityofthe human gut microbiome» στο 10 ο συνέδριο της Ελληνικής Εταιρείας Υπολογιστικής ΒιολογίαςκαιΒιοπληροφορικής(ΕΕΥΒΒ),9 11/10/2015,Αθήνα. Ομιλία: «Bioenergetic diversity of the human gut microbiome» στο 66 ο συνέδριο της ΕλληνικήςΕταιρείαςΒιοχημείαςκαιΜοριακήςΒιολογίας(ΕΕΒΜΒ),11 13/12/2015,Αθήνα. Δραστηριότητεςστοντομέα«Επιστήμη&Κοινωνία»: Συμμετοχή στο φόρουμ «Η Φωνή του Μέλλοντος» νέων επιστημόνων και βουλευτών, ΒασιλικήΕταιρείαΧημείαςτηςΒρετανίας,Λονδίνο,Aγγλία(2002) 6

Συμμετοχή στη διδασκαλία τεχνικών μοριακή βιολογίας σε τριήμερο σεμινάριο για δασκάλους,embo,χαϊδελβέργη,γερμανία(2004) Συμμετοχήσεσεμινάριαεπικοινωνίαςτηςεπιστήμης,ΠανεπιστήμιοτουCambridge,Αγγλία (2003),καιΙνστιτούτοΒιολογίας,Λονδίνο,Αγγλία(2007) Εκλαϊκευμένο επιστημονικό άρθρο «Τα νερά της Μεσογείου», περιοδικό BlueSci του Πανεπιστημίου του Cambridge (2005, Τεύχος 3, σελίδα 19) http://issuu.com/bluesci/docs/bluesci issue3 ΕθελόντριαστοΦεστιβάλΕπιστημώντουCambridge,Αγγλία(2004 2009) Ομιλία::«Τοανθρώπινογονιδίωμα:τιμαςέχειδιδάξειμέχρισήμερακαιτιυπόσχεταιγια την ιατρική του μέλλοντος» στον κύκλο ομιλιών νέων ερευνητών, Διαδραστική Έκθεση ΕπιστήμηςκαιΤεχνολογίας,ΊδρυμαΕυγενίδου,Αθήνα.(2012)http://vimeo.com/43956568 ΣυνέντευξηστηνεκπομπήWhat'sUpDocτουRadioReboot«Ταβακτήριαωςεργοστάσια παραγωγήςενέργειας»(2013)https://www.mixcloud.com/whatsupdoc_webradioshow/ ΜέλοςτηςΟργανωτικήςΕπιτροπήςτουAthensScienceFestival,Τεχνόπολις,Αθήνα(2014) http://www.athens science festival.gr/ Διοργανώτρια της σειράς επιστημονικών ομιλιών για το κοινό «Cafe Scientifique Athens» (2013 σήμερα)http://tinyurl.com/cafesci gr 7