ΣΟΦΙΑ ΚΑΛΛΙΑ - ΡΑΥΤΟΠΟΥΛΟΥ ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΟ ΣΗΜΕΙΩΜΑ Προσωπικά Στοιχεία Όνομα : Καλλία-Ραυτοπούλου Σοφία Πατρώνυμο : Ευάγγελος Τόπος Γέννησης : Παραλία Πατρών Αχαΐας Διεύθυνση μον. κατοικίας : 25 ης Μαρτίου 101, 26333 Παραλία Πατρών, τηλ.: 2610522481 Διεύθυνση Εργασίας : Εργαστήριο Βιολογικής Χημείας, Τμήμα Ιατρικής, Παν/μιο Πατρών, 26504 Ρίο, Πάτρα τηλ.: 2610-997934, FAX 2610-969167 email: sofkalra@med.upatras.gr Οικογ. Κατάσταση : Έγγαμη, 2 παιδιά Ξένες γλώσσες : Αγγλικά: άριστα, Γαλλικά: άριστα Σπουδές 1979 : Πτυχίο Βιοχημείας (Maitrise de Biochimie ) Πανεπιστήμιο Παρισίων VI (Pierre et Marie Curie, Paris VI), 1982-1984 : Χημικό Τμήμα Πανεπιστημίου Πατρών. Με απόφαση του Διαπανεπιστημιακού Κέντρου Αναγνωρίσεως Τίτλων Σπουδών Αλλοδαπής (ΔΙΚΑΤΣΑ 6497/81) φοίτηση στο Χημικό Τμήμα και κατόπιν επιτυχούς συμπληρωματικής εξετάσεως σε επτά μαθήματα απόκτηση αντίστοιχου τίτλου κλάδου Χημείας Ελληνικού Α.Ε.Ι. (ΔΙΚΑΤΣΑ 6487/30-11-84). 1992 : Διδάκτωρ Ιατρικού Τμήματος Πανεπιστημίου Πατρών με βαθμό ΑΡΙΣΤΑ. Σταδιοδρομία 1979-1980 : Γαλλικό Ινστιτούτο Πατρών, διδασκαλία της γαλλικής γλώσσας ως αναπληρωματικό μέλος του διδακτικού προσωπικού. 1980 : Διορισμός σε θέση Επιστημονικού Συνεργάτη στο εργαστήριο Βιολογικής Χημείας του Ιατρικού Τμήματος του Πανεπιστημίου Πατρών 1992 : Mονιμοποίηση στη θέση αυτή. 1994 : Ένταξη στη βαθμίδα του Λέκτορα, θέση στην οποία υπηρετώ μέχρι σήμερα. Διδακτικό έργο Προπτυχιακά Μαθήματα Από το ακαδημαϊκό έτος 1990-1991 μέχρι το 1996, συμμετοχή στις εργαστηριακές ασκήσεις Βιοχημείας οι οποίες γίνονταν για τους φοιτητές του προγράμματος της Ιατρικής Φυσικής Biomedical Engineering and Medical Physics Course) στα πλαίσια του ERASMUS (επιστημονικός υπεύθυνος καθηγητής κ. Β. Πρώιμος). Από το 1994 έως σήμερα συμμετοχή στη διδασκαλία των μαθημάτων Βιοχημείας Ι, ΙΙ και ΙΙΙ και των αντίστοιχων εργαστηριακών ασκήσεων του Ιατρικού
Τμήματος καθώς επίσης και του Φαρμακευτικού Τμήματος (Βιοχημεία, Κλινική Χημεία και αντίστοιχες εργαστηριακές ασκήσεις) καθ όλο το διάστημα που γινόταν συνδιδασκαλία. Παράλληλα εκτός των υπολοίπων καθηκόντων μου ασχολήθηκα και με την συγγραφή κλινικών εργαστηριακών ασκήσεων Μεταπτυχιακά Μαθήματα Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών στις Βασικές Ιατρικές Επιστήμες. Από το 1999 έως σήμερα, συμμετοχή στη διδασκαλία μαθημάτων και εργαστηριακών ασκήσεων στα πλαίσια της κατεύθυνσης «Παθοβιοχημεία». Συμμετοχή στο μάθημα «Σεμινάρια φοιτητών». Ερευνητικό Αντικείμενο Μελέτη των μηχανισμών δράσης διαφόρων αντιβιοτικών (π.χ. λινκομυκίνη, κλινδαμυκίνη, σπαρσομυκίνη και ανάλογά της ) στην πρωτεϊνική σύνθεση μικροοργανισμών. Διερεύνηση του ρόλου μονοσθενών και δισθενών κατιόντων κατά την πρωτεϊνοσύνθεση. Μελέτη της επίδρασης διαφόρων προσδεμάτων (π.χ. μακρολίδια-κετολίδια) στην δραστικότητα της RNase P καθώς και της χρησιμοποίησης του ριβοενζύμου αυτού στην εξειδικευμένη αποσιώπηση της γονιδιακής έκφρασης Μέλος συμβουλευτικών και εξεταστικών επιτροπών 1/ Συμμετoχή ως μέλος της τριμελούς συμβουλευτικής επιτροπής για την εκπόνηση της διδακτορικής διατριβής της μεταπτυχιακής φοιτήτριας του Ιατρικού Τμήματος Ευαγγελίας Παπαδήμου με τίτλο Μελέτη της δράσης συνθετικών ρετινοειδών στην ενζυμική δραστικότητα της ριβονουκλεάσης Ρ. 2/ Συμμετοχή ως μέλος της τριμελούς συμβουλευτικής επιτροπής για την εκπόνηση της διπλωματικής εργασίας της φοιτήτριας του Βιολογικού Τμήματος Ειρήνης Κουμπούρη με τίτλο Μελέτη της αναστολής του σχηματισμού του πεπτιδικού δεσμού σε ριβοσώματα από E.coli από ανάλογα του αντιβιοτικού Σπαρσομυκίνη. 3/ Συμμετοχή ως μέλος της επταμελούς εξεταστικής επιτροπής για την διδακτορική διατριβή της φοιτήτριας του Ιατρικού Τμήματος Δέσποινας Παυλίδου με τίτλο H ριβονουκλεάση Ρ της φυσιολογικής και παθολογικής επιδερμίδας. 4/ Συμμετoχή ως μέλος της τριμελούς συμβουλευτικής επιτροπής για την εκπόνηση της διπλωματικής εργασίας της μεταπτυχιακής φοιτήτριας του Ιατρικού Τμήματος Μαριάνθης Τσιτλαϊδου με τίτλο Μελέτες επί της δραστικότητας της ριβονουκλεάσης Ρ (RNase P) από το αιθανολοπαραγωγό βακτήριο Zymomonas mobilis 5/ Συμμετοχή ως μέλος της επταμελούς εξεταστικής επιτροπής για την διδακτορική διατριβή της φοιτήτριας του Ιατρικού Τμήματος Ελευθερίας Βρυζάκη με τίτλο «Η ριβονουκλεάση Ρ (RNase P) των ανθρωπίνων λεμφοκυττάρων 6/ Συμμετoχή ως μέλος της τριμελούς συμβουλευτικής επιτροπής για την εκπόνηση της διπλωματικής εργασίας της μεταπτυχιακής φοιτήτριας του Ιατρικού Τμήματος Μαρίας Μπίκου με τίτλο Λειτουργικές μελέτες επί των υπομονάδων του ριβονουκλεοπρωτεϊνικού συμπλόκου της ριβονουκλεάσης Ρ από το μυξομύκητα Dictyostelium discoideum 7/ Συμμετοχή ως μέλος της επταμελούς εξεταστικής επιτροπής για την διδακτορική διατριβή της φοιτήτριας του Ιατρικού Τμήματος Χρυσαυγής Τουμπέκη με τίτλο
Μελέτες επί της τροποποίησης της ενζυμικής δραστικότητας του ριβοενζύμου ριβονουκλεάση Ρ Νοσοκομειακό έργο Από τον Φεβρουάριο του 1981 μέχρι τον Απρίλιο του 1983 (πλήρης απασχόληση) και από τον Απρίλιο του 1983 μέχρι τον Μάρτιο του 1984 (μερική απασχόληση), παράλληλα με τις άλλες ακαδημαϊκές δραστηριότητες, απασχόληση στο Πανεπιστημιακό Βιοχημικό Εργαστήριο του νοσοκομείου Αγιος Ανδρέας, υπεύθυνη για τη διεξαγωγή κλινικών βιοχημικών αναλύσεων. Συμμετοχή σε ερευνητικά προγράμματα 1/ Παν/μιο Πατρών, Επιτροπή Ερευνών, πρόγραμμα Κ. Καραθεοδωρή 2009 (Επιστημονικός υπεύθυνος ) 2/ ΠΕΝΕΔ 1995/αριθμός έργου 1575. Στο πρόγραμμα αυτό που έχει ολοκληρωθεί, συμμετείχα ως επιστημονικό μέλος. Επιστημονικός υπεύθυνος του προγράμματος που είχε τίτλο : Διερεύνηση του ρόλου ορισμένων ριβοσωματικών πρωτεϊνών και του ριβοσωματικού RNA επί της ακρίβειας της μετάφρασης in vitro στο ευκαρυωτικό κύτταρο ήταν ο καθηγητής κ. Δ. Συνετός. 3/ ΠΕΝΕΔ 1989/αριθμός έργου 89ΕΔ458. Στο πρόγραμμα αυτό που έχει ολοκληρωθεί, συμμετείχα ως επιστημονικό μέλος. Επιστημονικός υπεύθυνος του προγράμματος που είχε τίτλο: Πεπτιδυλοτρανσφεράση και αντιβιοτικά που την αναστέλλουν ήταν ο καθηγητής κ. Χ.Δ. Κουτσογεωργόπουλος. Μέλος επιστημονικών εταιριών Τακτικό μέλος της Ελληνικής Εταιρείας Βιοχημείας και Μοριακής Βιολογίας (HSBMB) Διεθνή Σχολεία-Workshops 1981 : ΝΑΤΟ/ΕΜΒΟ/FEBS International Summer School, Spetses: Control and Processing in the biosynthesis of macromolecules. 1986 : ΕΜΒΟ Workshop. Patras, Greece: Regulation of Protein Synthesis in Eucaryotes. Διοικητικό έργο 1989-1994 Εκπρόσωπος των Επιστημονικών Συνεργατών στην συνέλευση του Τομέα Βασικών Ιατρικών Επιστημών Ι (ΒΙΕ Ι). 1991-1994 Εκπρόσωπος των Επιστημονικών Συνεργατών στη Γενική Συνέλευση του Ιατρικού Τμήματος. 1994 έως σήμερα Συμμετοχή στην συνέλευση του Τομέα ως μέλος ΔΕΠ. 1997-1999, 2009/2010 Εκπρόσωπος των λεκτόρων του Τομέα ΒΙΕ Ι στη Γενική Συνέλευση του Τμήματος Ιατρικής. 2001 έως σήμερα Εκπρόσωπος του εργαστηρίου Βιολ. Χημείας στην Επιτροπή Εκπαιδευτικών Εργαστηρίων του Τμήματος Ιατρικής. 2013 Μέλος Επιτροπής που συγκροτήθηκε από το Τμήμα Ιατρικής, για την ολοκλήρωση εγγραφής των επιτυχόντων μέσω της διαδικασίας μεταφοράς θέσης εισαγωγής ακαδημαϊκού έτους 2011-2012. Δημοσιεύσεις-Ανακοινώσεις (με χρονολογική σειρά) 1. S. Kallia-Raftopoulos and C. Coutsogeorgopoulos (1986)
Uridine triphosphate replaces GTP in producing puromycin reactive complexes. Hellen. Biochem. Biophys. Soc. Newsletter, vol. 24, pp. 31-33. 2. S. Kallia-Raftopoulos, G. Dinos, D. L. Kalpaxis and C. Coutsogeorgopoulos (1989) On the mechanism of action of the antibiotic lincomycin in protein synthesis. Hellen. Biochem. Biophys. Soc. Newsletter, vol. 29, pp. 45-48. 3. S. Kallia-Raftopoulos, D.L. Kalpaxis and C. Coutsogeorgopoulos (1990) Isomerization of a ribosomal complex induced by the antibiotic lincomycin. Hellen. Biochem. Biophys. Soc. Newsletter, vol. 31, pp. 21-24. 4. Σ. Καλλία-Ραυτοπούλου (1992) Βραδέως εκδηλουμένη αναστολή σχηματισμού πεπτιδικών δεσμών. Εφαρμογή στην περίπτωση της λινκομυκίνης. Διδακτορική Διατριβή εγκριθείσα υπό του Ιατρικού Τμήματος του Πανεπιστημίου Πατρών. 5. (*) S. Kallia-Paftopoulos, D.L. Kalpaxis and C. Coutsogeorgopoulos (1992) Slow-Onset inhibition of ribosomal peptidyltransferase by lincomycin. Arch. Biochem. Biophys. Vol. 298, pp. 332-339. 6. (*) S. Kallia-Raftopoulos, D.L. Kalpaxis and C. Coutsogeorgopoulos (1994) New aspects of the kinetics of inhibition by lincomycin of peptide bond formation. Mol. Pharmacol., 46:1009-1014. 7. S. Kallia-Raftopoulos, D. Synetos, H.C.J. Ottenheijm and C. Coutsogeorgopoulos (1994) Determination of the potency of sparsomycin analogs as inhibitors of ribosomal peptidyltransferase. Hellen. Biochem. Biophys. Soc. Newsletter, vol. 37, pp. 11-13. 8. (*) S. Kallia-Raftopoulos, D. Synetos, H.C.J. Ottenheijm L.A.G.M. Van den Broek, and C. Coutsogeorgopoulos (1996) Sparsomycin and its analogs: a new approach for evaluating their potency as inhibitors of peptide bond formation. Molec. Pharmacol., 49:1085-1091. 9. S. Kallia-Raftopoulos, D.L. Kalpaxis and C. Coutsogeorgopoulos (1997) Kinetic evidence for slow sequential, conformational changes in E.coli ribosomes, induced by lincomycin. 11 th Balcan Biophysical and Biochemical Days, May 15-17, Thessaloniki, Greece, abstract 84. 10. (*) S. Kallia-Raftopoulos and D.L. Kalpaxis (1999) Slow sequential, conformational changes in Escherichia coli ribosomes induced by lincomycin: Kinetic Evidence" Mol. Pharmacol. 56:1042-1046. 11. C. Toumpeki, V. Stamatopoulou, M. Bikou, C. Kontopoulou, F. Kakatsidis, S. Kallia-Raftopoulos and D. Drainas (2010) Modulation of RNase P activity by small molecule effectors Joint Workshop "Biotechnology, Drug Discovery & Novel Therapeutic Approaches", Camerino, October 28-30. 12. C. Toumpeki, V. Stamatopoulou, S. Kallia-Raftopoulos, A. Mouzaki, D. Drainas. (2011) Construction of an M1GS ribozyme targeting efficiently the human protooncogene ets-2 product in vitro and in vivo. 62o Ετήσιο Συνέδριο Ε.Ε.Β.Μ.Β., Αθήνα 9-11 Δεκεμβρίου. 13. C.Toumpeki, V. Stamatopoulou, S. Kallia-Raftopoulos, D. Anastasakis, A. Mouzaki and D. Drainas.(2012) Rapid gene silencing by spiramycin activated ribonuclease P ribozyme 24 th trna Conference, Olmue, Chile, December 2-6. 14. C.Toumpeki, V.Stamatopoulou, M.Bikou, K.Grafanaki, S.Kallia-Raftopoulou, D.Papaioannou, C.Stathopoulos and D.Drainas. (2013) Targeting ribonuclease
P in Antibiotics-targets,mechanisms and resistance, Gualerzi, C. et al, eds, Wiley Publishers (in press). Επεξηγήσεις Με αστερίσκο (*) σημειώνονται οι πλήρεις δημοσιεύσεις.