ΔΗΜΗΤΡΙΟΣ Κ. ΤΣΑΚΟΓΙΑΝΝΗΣ, MSc, PhD ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΟ ΣΗΜΕΙΩΜΑ

Transcript

1 ΔΗΜΗΤΡΙΟΣ Κ. ΤΣΑΚΟΓΙΑΝΝΗΣ, MSc, PhD ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΟ ΣΗΜΕΙΩΜΑ

2 ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΑ ΣΥΝΟΠΤΙΚΑ ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΑ ΣΤΟΙΧΕΙΑ... 1 ΕΚΠΑΙΔΕΥΣΗ... 1 ΑΚΑΔΗΜΑΪΚΗ ΕΜΠΕΙΡΙΑ... 2 ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΕΣ ΔΕΞΙΟΤΗΤΕΣ... 2 ΨΗΦΙΑΚΕΣ ΔΕΞΙΟΤΗΤΕΣ... 2 ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΕΣ ΔΙΑΚΡΙΣΕΙΣ... 3 ΓΛΩΣΣΕΣ... 3 ΣΥΜΜΕΤΟΧΕΣ ΣΕ ΣΥΝΕΔΡΙΑ... 4 ΔΗΜΟΣΙΕΥΣΕΙΣ... 5

3 ΣΥΝΟΠΤΙΚΑ ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΑ ΣΤΟΙΧΕΙΑ Όνομα: ΔΗΜΗΤΡΙΟΣ Επίθετο: ΤΣΑΚΟΓΙΑΝΝΗΣ Πατρώνυμο: ΚΩΝΣΤΑΝΤΙΝΟΣ Ημερομηνία Γέννησης: 3/12/1985 Εθνικότητα: Ελληνική Οικογενειακή Κατάσταση: Άγαμος Διεύθυνση: Αρτέμωνος, 26-28, 11636, Αθήνα Τηλέφωνο: Στρατιωτική Θητεία Εκπληρωμένη, Σεπτέμβριος Ιούνιος 2015, Στρατός Ξηράς, Υγειονομικό Σώμα ΕΚΠΑΙΔΕΥΣΗ 05/ /2014: Διδακτορικό Δίπλωμα στη Μοριακή Ιολογία Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας, Τμήμα Βιοχημείας και Βιοτεχνολογίας, Λάρισα (Ελλάδα) Τίτλος Διδακτορικής Διατριβής: Προσδιορισμός της μορφής του γονιδιώματος των στελεχών HPV-16, συσχέτιση με τη κλινική εικόνα του ασθενή και προσδιορισμός της θέσης ενσωμάτωσης του ιού στο κυτταρικό γονιδίωμα Βαθμός: 10/10 ''Άριστα'' 09/ /2010: Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης με τίτλο ''Εφαρμογές Μοριακής Βιολογίας - Μοριακή Γενετική, Διαγνωστικοί Δείκτες'' Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας, Τμήμα Βιοχημείας και Βιοτεχνολογίας, Λάρισα (Ελλάδα), Βαθμός : 8.94/10 ''Άριστα'' 09/ /2008: Πτυχίο Βιοχημείας και Βιοτεχνολογίας Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας, Τμήμα Βιοχημείας και Βιοτεχνολογίας, Λάρισα (Ελλάδα), Βαθμός : 6.85/10 ''Λίαν Καλώς'' 1

4 ΑΚΑΔΗΜΑΪΚΗ ΕΜΠΕΙΡΙΑ 09/ /2013: Επικουρική Διδασκαλία Εργαστηριακών Ασκήσεων Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας, Τμήμα Βιοχημείας και Βιοτεχνολογίας, Λάρισα (Ελλάδα) Συμμετοχή στην οργάνωση και εκτέλεση των εργαστηριακών ασκήσεων κατά το χειμερινό εξάμηνο των δευτεροετών φοιτητών στο μάθημα ''Μικροβιολογία και Ιολογία'' 21/02/ /07/2011: Εργαστηριακός Συνεργάτης Τεχνολογικό Εκπαιδευτικό Ίδρυμα, Τμήμα Ιατρικών Εργαστηρίων, Λάρισα (Ελλάδα) Οργάνωση και εκτέλεση των εργαστηριακών ασκήσεων κατά το εαρινό εξάμηνο των πρωτοετών φοιτητών στο μάθημα ''Βιοχημεία Ι'' 14/10/ /02/2011: Εργαστηριακός Συνεργάτης Τεχνολογικό Εκπαιδευτικό Ίδρυμα, Τμήμα Ιατρικών Εργαστηρίων, Λάρισα (Ελλάδα) Οργάνωση και εκτέλεση των εργαστηριακών ασκήσεων κατά το χειμερινό εξάμηνο των πρωτοετών φοιτητών στο μάθημα ''Στοιχεία Βιολογίας - Γενετικής'' 06/ /2005: Εκπαιδευόμενος στην εφαρμογή μοριακών τεχνικών και στον χειρισμό διαγονιδιακών ζώων Ελληνικό Ινστιτούτο Παστέρ, Εργαστήριο Μοριακής Γενετικής και Μονάδα Διαγονιδιακής Τεχνολογίας, Αθήνα (Ελλάδα) ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΕΣ ΔΕΞΙΟΤΗΤΕΣ Μικροβιολογία: Καλλιέργεια Βακτηρίων (υγρές και στερεές), απομόνωση και μετασχηματισμός. Μοριακή Βιολογία: Σχεδιασμών εκκινητών, RNA/DNA εκχύλιση, αντίστροφη μεταγραφή, PCR, Nested PCR, Multiplex PCR, Nested Multiplex PCR, ποσοτική PCR πραγματικού -χρόνου (Real-Time PCR), Duplex Real-Time PCR, RS-PCR (Restriction- Site PCR), απομόνωση DNA από πήκτωμα αγαρόζης, πέψη, μοριακή κλωνοποίηση. Βιοστατιστική Ανάλυση ΨΗΦΙΑΚΕΣ ΔΕΞΙΟΤΗΤΕΣ Πολύ καλή γνώση και χρήση Windows, Internet και Microsoft office. Πολύ καλή γνώση και χρήση προγραμμάτων Βιοπληροφορικής: Primer 3, Mega, SeaVew, Chromas, Gene Runner, BLAST, ClustalW, TreeView, RasMol, SimPlot, RDP3, BEAST package (BEAuti, TreeAnnotator, FigTree, TRACER), Datamonkey server (SLAC, FEL, SBP, GARD), Selecton Server, FindModel. 2

5 ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΕΣ ΔΙΑΚΡΙΣΕΙΣ Α' Βραβείο Βασικής Έρευνας για την ελεύθερη ανακοίνωση με τίτλο ''Μελέτη της μορφής του γονιδιώματος των στελεχών HPV-16 σε κλινικά δείγματα. Μoριακή ανάλυση των ογκογονιδίων Ε6, Ε7 και της ρυθμιστικής περιοχής LCR'' στο 35 ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο, 5-9 Μαΐου Αθήνα. Υποτροφία από το Ίδρυμα Ωνάση για την παρακολούθηση των διαλέξεων με θέμα Βασική και Εφαρμοσμένη Ιολογία'', Ηράκλειο, Κρήτη, Ελλάδα (Ιούλιος 11-15, 2011). ΓΛΩΣΣΕΣ Αγγλικά (Αυτοαξιολόγηση) Κατανόηση Ομιλία Γραφή Προφορική Γραπτή Επικοινωνία Προφορική έκφραση C2 C2 C2 C2 C2 Απρίλιος, 2016 Test of English as a Foreign Language ibt ) Total score: 90/120 Μάρτιος, 2016 Test of English for International Communication (TOEIC) Total Score: 840/990 Δεκέμβριος, 2005 University of Michigan Certificate of Competency in English - University of Michigan 3

6 ΣΥΜΜΕΤΟΧΕΣ ΣΕ ΣΥΝΕΔΡΙΑ 1. Τσακογιάννης Δ, Μπλέτσα Μ, Κυριακοπούλου Ζ, Δημητρίου Τ, Μαρκουλάτος Π. Ανίχνευση αναδιαταγμένων αλληλουχιών του HPV16 DNA σε προ - καρκινικές και καρκινικές τραχηλικές αλλοιώσεις. Ελεύθερη ανακοίνωση. 10 ο Πανελλήνιο Συνέδριο Ιολογίας, Φεβρουαρίου Αθήνα. 2. Δημητρίου Τ, Κυριακοπούλου Ζ, Τσακογιάννης Δ, Μοσχονάς Γ, Μαρκουλάτος Π. Ανάπτυξη μιας Multiplex RT- PCR μεθόδου για την ταυτοποίηση σπάνιων τύπων ανασυνδυασμού στις γενωμικές περιοχές εμβολιοσυνδεόμενων πολιοϊών. Ελεύθερη ανακοίνωση. 10 ο Πανελλήνιο Συνέδριο Ιολογίας, Φεβρουαρίου Αθήνα. 3. Μπλέτσα Μ, Κυριακοπούλου Ζ, Τσακογιάννης Δ, Δημητρίου Τ, Αμούτζιας Γ, Μαρκουλάτος Π. Μοριακή επιδημιολογία και εξελικτική ανάλυση του echo 3 οροτύπου των εντεροϊών. Αναρτημένη ανακοίνωση. 10 ο Πανελλήνιο Συνέδριο Ιολογίας, Φεβρουαρίου Αθήνα. 4. Τσακογιάννης Δ, Δαρμής Φ, Γκορτσίλας Π, Ρούτερ Ε.Γ.Α, Κυριακοπούλου Z, Πλιάκα Β, Μαρκουλάτος Π. Μοριακή ανάλυση του γονιδίου Ε1 στελεχών HPV16 σε ασθενείς με τραχηλική δυσπλασία στην Ελλάδα. Ελεύθερη ανακοίνωση. 37 ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο, Μαΐου Αθήνα. 5. Γκορτσίλας Π, Τσακογιάννης Δ, Δαρμής Φ, Ρούτερ Ε.Γ.Α, Κυριακοπούλου Z, Πλιάκα Β, Μαρκουλάτος Π. Χαρτογράφηση των θέσεων ρήξης του γονιδίου Ε2 του Human Papillomavirus HPV-16. Ελεύθερη ανακοίνωση. 37 ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο, Μαΐου Αθήνα. 6. Τσακογιάννης Δ, Θεοχαροπούλου Α, Δαρμής Φ, Νέπκα Χ, Κυριακοπούλου Ζ, Πλιάκα Β, Μαρκουλάτος Π. Μοριακοί δείκτες εντοπισμούενσωματωμένων κλινικών στελεχών ΗPV- 16 στο κυτταρικό γονιδίωμα σε προκαρκινικές τραχηλικές αλλοιώσεις. Ελεύθερη ανακοίνωση. 36 ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο, 4-8 Μαΐου Αθήνα. 7. Πλιάκα Β, Δεδεψίδης Ε, Τσακογιάννης Δ, Ρούτερ Ε.Γ.Α, Λεβιδιώτου Στεφάνου Σ, Μαρκουλάτος Π. Μια νέα multiplex RT-PCR μέθοδος για την ταυτοποίηση των συνήθων τύπων ανασυνδυασμού στις 2C και 3D γενωμικές περιοχές εμβολιο παραγόμενων πολιοϊών. Ελεύθερη ανακοίνωση. 36 ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο, 4-8 Μαΐου Αθήνα. 8. Πλιάκα Β, Κυριακοπούλου Ζ, Τσακογιάννης Δ, Ρούτερ Ε.Γ.Α, Λεβιδιώτου Στεφάνου Σ, Μαρκουλάτος Π. Προσδιορισμός του επιπέδου ανοσίας ατόμων ηλικίας 1-40 ετών έναντι ανασυνδυασμένων εμβολιο-παραγώμενων πολιοϊών. Ελεύθερη ανακοίνωση. 6 ο Πανελλήνιο Συνέδριο Ιατρικής Βιοπαθολογίας, Απριλίου Αθήνα. 9. Κυριακοπούλου Ζ, Δεδεψίδης Ε, Πλιάκα Β, Τσακογιάννης Δ, Μαρκουλάτος Π. Μοριακή και επιδημιολογική μελέτη εντεροϊών που απομονώθηκαν από περιβαλλοντικά δείγματα στη Λάρισα το Ελεύθερη ανακοίνωση. 6 ο Πανελλήνιο Συνέδριο Ιατρικής Βιοπαθολογίας, Απριλίου Αθήνα. 10. Τσακογιάννης Δ, Κοντοστάθη Γ, Γκορτσίλας Π, Νέπκα Χ, Μαρκουλάτος Π. Μελέτη της μορφής του γονιδιώματος των στελεχών HPV-16 σε κλινικά δείγματα. Μoριακή ανάλυση των ογκογονιδίων Ε6, Ε7 και της ρυθμιστικής περιοχής LCR. Ελεύθερη ανακοίνωση. 35 ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο, 5-9 Μαΐου Αθήνα. 11. Τσακογιάννης Δ, Γκορτσίλας Π, Ευδοκίμου Μ, Πραττή Α, Πανοτοπούλου E, Μαρκουλάτος Π. Ταυτοποίηση HPV στελεχών υψηλής επικινδυνότητας, προσδιορισμός της μορφής του γονιδιώματος των στελεχών HPV-16 και μελέτη της ρυθμιστικής περιοχής LCR. Ελεύθερη ανακοίνωση. 9 ο Πανελλήνιο Συνέδριο Ιολογίας, Νοεμβρίου Αθήνα. 4

7 ΔΗΜΟΣΙΕΥΣΕΙΣ 1. Tsakogiannis D *, Gartzonika C, Levidiotou-Stefanou S, Markoulatos P (2017) Molecular approaches for HPV genotyping and HPV DNA physical status. Expert Rev Mol Med 19:e1.* Corresponding author 2. Moschonas GD, Tsakogiannis D *, Lamprou KA, Mastora E, Dimitriou T.G, Kyriakopoulou Z, Kottaridi C, Karakitsos P, Markoulatos P (2017) Association of codon 72 polymorphism of p53 with the severity of cervical dysplasia, E6-T350G and HPV16 variant lineages in HPV16 infected women. (submitted) * Corresponding author 3. Kyriakopoulou Z, Amoutzias GD, Dimitriou TG, Tsakogiannis D, Mossialos D, Markoulatos P (2017) Intra- and inter- serotypic recombinations in 5 UTR-VP4 region of Echovirus 30 strains. (submitted) 4. Tsakogiannis D, Bletsa M, Kyriakopoulou Z, Dimitriou T.G, Kotsovassilis C, Panotopoulou E, Markoulatos P (2016) Identification of rearranged sequences of HPV16 DNA in precancerous and cervical cancer cases. Mol Cell Probes 30: Dimitriou TG, Kyriakopoulou Z, Tsakogiannis D, Fikatas A, Gartzonika C, Levidiotou- Stefanou S, Markoulatos P (2016) Development of a multiplex RT-PCR assay for the identification of recombination types at different genomic regions of vaccine-derived polioviruses. Virus Genes 52: Tsakogiannis D, Gortsilas P, Kyriakopoulou Z, Ruether I.G.A, Dimitriou T.G, Orfanoudakis G, Markoulatos P (2015) Sites of disruption within E1 and E2 genes of HPV16 and association with cervical dysplasia. J Med Virol 87: Tsakogiannis D, Diamantidou V, Toska E, Kyriakopoulou Z, Dimitriou TG, Ruether IG, Gortsilas P, Markoulatos P (2015) Multiplex PCR assay for the rapid identification of human papillomavirus genotypes 16, 18, 45, 35, 66, 33, 51, 58, and 31 in clinical samples. Arch Virol 160: Tsakogiannis D, Papacharalampous M, Toska E, Kyriakopoulou Z, Dimitriou TG, Ruether IG, Komiotis D, Markoulatos P (2015) Duplex Real-time PCR assay and SYBR green I melting curve analysis for molecular identification of HPV genotypes 16, 18, 31, 35, 51 and 66. Mol Cell Probes 29: Kyriakopoulou Z, Bletsa M, Tsakogiannis D, Dimitriou TG, Amoutzias GD, Gartzonika C, Levidiotou-Stefanou S, Markoulatos P (2015) Molecular epidemiology and evolutionary dynamics of Echovirus 3 serotype. Infect Genet Evol 32: Tsakogiannis D, Kyriakopoulou Z, Ruether IG, Amoutzias GD, Dimitriou TG, Diamantidou V, Kotsovassilis C, Markoulatos P (2014) Determination of human papillomavirus 16 physical status through E1/E6 and E2/E6 ratio analysis. J Med Microbiol 63: Tsakogiannis D, Kyriakopoulou Z, Darmis F, Ruether IG, Dimitriou TG, Orfanoudakis G, Panotopoulou E, Markoulatos P (2014) Prevalence of HPV16 E1-1374^63nt variants in Greek women. J Med Virol 86: Tsakogiannis D, Darmis F, Gortsilas P, Ruether IG, Kyriakopoulou Z, Dimitriou TG, Amoutzias G, Markoulatos P (2014) Nucleotide polymorphisms of the human papillomavirus 16 E1 gene. Arch Virol 159: Ruether IG, Dimitriou TG, Tsakogiannis D, Kyriakopoulou Z, Amoutzias GD, Gartzonika C, Levidiotou Stefanou S, Markoulatos P (2014) Characterization of novel intergenogroup and intergenotype recombinant noroviruses from central Greece. Mol Cell Probes 28: Ruether IG, Tsakogiannis D, Kyriakopoulou Z, Dimitriou TG, Papamichail C, Gartzonika C, Leveidiotou-Stefanou S, Markoulatos P (2014) Circulation of intergenotype recombinant noroviruses GII.9/GII.6 from 2006 to 2011 in central Greece. Virus Genes 48:

8 15. Dimitriou TG, Pliaka V, Kyriakopoulou Z, Ruether IG, Tsakogiannis D, Fountoucidou P, Gartzonika C, Levidiotou-Stefanou S, Markoulatos P (2013) PCR assays for the identification of rare recombination types from VP1 to 3D genomic region of vaccine derived poliovirus strains. Mol Cell Probes 28: Tsakogiannis D, Papadopoulou A, Kontostathi G, Ruether IG, Kyriakopoulou Z, Dimitriou TG, Orfanoudakis G, Markoulatos P (2013) Molecular and evolutionary analysis of HPV16 E6 and E7 genes in Greek women. J Med Microbiol 62: Tsakogiannis D, Kyriakopoulou Z, Amoutzias G, Ruether IG, Dimitriou TG, Panotopoulou E, Markoulatos P (2013) Identification of novel E6-E7 sequence variants of human papillomavirus 16. Arch Virol 158: Tsakogiannis D, Ruether IG, Kyriakopoulou Z, Pliaka V, Skordas V, Gartzonika C, Levidiotou-Stefanou S, Markoulatos P (2012) Molecular and phylogenetic analysis of the HPV 16 E4 gene in cervical lesions from women in Greece. Arch Virol 157: Tsakogiannis D, Ruether I, Kyriakopoulou Z, Pliaka V, Theoharopoulou A, Skordas V, Panotopoulou E, Nepka C, Markoulatos P (2012) Sequence variation analysis of the E2 gene of human papilloma virus type 16 in cervical lesions from women in Greece. Arch Virol 157: Ruether IG, Tsakogiannis D, Pliaka V, Kyriakopoulou Z, Krikelis A, Gartzonika C, Leveidiotou-Stefanou S, Markoulatos P (2012) Molecular characterization of a new intergenotype Norovirus GII recombinant. Virus Genes 44: Kyriakopoulou Z, Tsolis K, Pliaka V, Tsakogiannis D, Ruether IG, Gartzonika C, Levidiotou-Stefanou S, Markoulatos P (2012) Combined 5' UTR RFLP analysis and VP1 sequencing for epidemic investigation of enteroviruses. Arch Virol 158: Kyriakopoulou Z, Dedepsidis E, Pliaka V, Tsakogiannis D, Ruether IGA, Krikelis A, Markoulatos P (2011) Complete nucleotide sequence analysis of VP1 genomic region of Echoviruses 6 isolated from sewages in Greece revealed 98% similarity with Echoviruses 6 that were characterized from an aseptic meningitis outbreak one year later. Clin Microbiol Infect 17: Kyriakopoulou Z, Pliaka V, Tsakogiannis D, Ruether IG, Komiotis D, Gartzonika C, Levidiotou-Stefanou S, Markoulatos P (2011) Genome analysis of two type 6 echovirus (E6) strains recovered from sewage specimens in Greece in Virus Genes 44: Pliaka V, Filliponi ME, Kyriakopoulou Z, Ruether IGA, Tsakogiannis D, Gartzonika C, Levidiotou-Stefanou S, Markoulatos P (2011) Retrospective molecular and phenotypic analysis of Poliovirus vaccine strains isolated in Greece. Clin Microbiol Infect 10: Pliaka V, Achilleos C, Kyriakopoulou Z, Tsakogiannis D, Ruether IG, Gartzonica C, Levidiotou-Stefanou S, Markoulatos P (2011) Determination of antigenic properties of vaccine derived poliovirus strains. Vaccine 29: Pliaka V, Dedepsidis E, Kyriakopoulou Z, Mpirli K, Tsakogiannis D, Pratti A, Levidiotou- Stefanou S, Markoulatos P (2010) A new RT-PCR assay for the identification of the predominant recombination types in 2C and 3D genomic regions of vaccine derived poliovirus strains. Mol Cell Probes 24: Pliaka V, Dedepsidis E, Kyriakopoulou Z, Papadi G, Tsakogiannis D, Pratti A, Levidiotou- Stefanou S, Markoulatos P (2010) Growth kinetic analysis of bi-recombinant Poliovirus vaccine strains. Virus genes 40: Kyriakopoulou Z, Dedepsidis E, Pliaka V, Tsakogiannis D, Pratti A, Levidiotou-Stefanou S, Markoulatos P (2010) Full-genome sequence analysis of a multirecombinant echovirus 3 strain isolated from sewage in Greece. J Clin Microbiol 48: Pliaka V, Kyriakopoulou Z, Tsakogiannis D, Ruether IGA, C. Gartzonika, S. Levidiotou- Stefanou, A. Krikelis, Markoulatos P (2010) Correlation of and recombination with growth kinetics of Poliovirus vaccine strains. Eur J Clin Microbiol Infect Disease 29: