PUBMED 1
Τι προσφέρει το NCBI Πληκτρολογούμε: http://www.ncbi.nlm.nih.gov
Τι προσφέρει το NCBI
Η Entrez είναι ένα εργαλείο για crosssearching βάσεων δεδομένων και περιέχει, μεταξύ άλλων: Επιστημονικά κείμενα Βάσεις Αλληλλουχιών DNA και πρωτεϊνών Δεδομένα
Blast: Basic local alignment search tool Εργαλείο έρευνας ομοιότητας αλληλουχιών, πρωτεινικών και νουκλεοτιδικών Πάνω από 80,000
ΟΜΙΜ: Online Mendelian Inheritance In Man Βάση που περιέχει ανθρώπινα γονίδια και γενετικές δυσλειτουργίες Παρουσιάζει ιδιαίτερο Ιατρικό ενδιαφέρον
Το Books είναι: online κατάλογος βιβλίων ό οποίος επιτρέπει την αναζήτηση σε αυτά με χρήση λέξεων-κλειδιών και την εμφάνιση πλήρους κειμένου..
Ο TaxBrowser είναι: Κατάλογος που περιέχει τις ταξινομικές κατηγοριοποιήσεις όλων των οργανισμών Ταξινομικά στοιχεία που περιλαμβάνουν και γενετικούς κώδικες Γονιδιώματα οργανισμών
Η Structure περιέχει, μεταξύ άλλων: Βάση με τρισδιάστατα (3-D) μοριακά μοντέλα Εργαλεία για την οπτικοποίηση των 3-D μοντέλων (όπως το πρόγραμμα Cn3D) Δεδομένα από την PDB (Protein
Η PubMed: Επιτρέπει το «ψάξιμο» στην Medline Ανανεώνεται καθημερινά Είναι προσβάσιμη μέσα από το διαδίκτυο
Τι είναι η Medline; Μια βάση δεδομένων με επιστημονικά άρθρα, με περισσότερες από 16Μ καταχωρήσεις (που ξεκινούν από την δεκαετία του 60) Περιέχει 4.600 περιοδικά (που εκδίδονται σε περισσότερες από 70
PubMed Περιήγηση στην ιστοσελίδα της PubMed Πώς θέτουμε απλά ερωτήματα Πώς εκτελούμε πιο περίπλοκες αναζητήσεις Πληκτρολογούμε: http:// www.ncbi.nlm.nih.gov
PubMed Αποτελ εί κομμάτι του ευρύτερ ου δικτύου αναζήτη σης της Entrez
Abstract/Free Full Text icons
Αποθήκευση
1 AND 2 1 2 lipocalin AND disease (35 αποτελέσματα) 1 OR 2 1 2 lipocalin OR disease (1,300,000 αποτελέσματα) 1 NOT 2 1 2 lipocalin NOT disease (350 αποτελέσματα)
Stopwords
Limits (όρια) Περιορισμός της αναζήτησης κατά: Ηλικιακή κατηγορία Φύλο Άνθρωπο ή ζώο Γλώσσα δημοσίευσης Τύπο δημοσίευσης Ημερομηνία δημοσίευσης Θεματική Υποκατηγορία (π.χ. καρκίνος ή OLDMEDLINE)
Αναζήτησ η βάση ενός ή περισσότ ερων συγγραφέ ων Αναζήτησ η βάση ενός ή περισσότ ερων
Περιορισ μοί στον τύπο των κειμένων
Χρονικά όρια αναζητο ύμενων
Επιλογή μελετών σε ανθρώπους ή ζώα σε φύλο
Επιλογή μεταξύ των πιο διαδεδομένων γλωσσών. Επιλογή μέσα από συγκεκριμένε ς κατηγοριοπο ιήσεις (AIDS, Βιοηθική, Κλινικά περιδικά κ.λ.π.)
Επιλογή του είδους δημοσίευσης (review, κλινικές έρευνες κ.λ.π.) εύρος Ηλικιακό των ατόμων που συμμετέχουν στις μελέτες
Παράδειγμα αναζήτησης με όρια Να βρεθούν τα πρόσφατα reviews πάνω στον καρκίνο του νεφρού ανθρώπων μέσης ηλικίας.
Να βρεθούν οι πρόσφατες ανασκοπήσεις πάνω στον καρκίνο του νεφρού ανθρώπων μέσης ηλικίας.
Οι 100 πιο πρόσφατες αναζητήσεις αποθηκεύονται. Μπορούν να χρησιμοποιηθ ούν για αναζήτηση
History (Ιστορικό Αναζήτησεων) Στο History περιλαμβάνονται: Αποθηκευμένες οι αναζητήσεις Σε χρονολογική σειρά Δυνατότητα επανασκόπησής τους
OMIM Online Mendelian Inheritance in Man 78
OMIM ΟΜΙΜ: Online Mendelian Inheritance In Man Βάση Δεδομένων που αποτελείται από ανθρώπινα γονίδια και γενετικές δυσλειτουργίες Σχεδόν 16.000 καταχωρήσεις. Σχεδόν 10.000 γονίδια γνωστής αλληλουχίας Περίπου 15.000 αυτοσωμικά
Σε τι τύπου αναζητήσεις Ποια απαντάει; γονίδια συνδέονται με την υπέρταση; Σε ποια χρωμοσώματα βρίσκονται; Ποια γονίδια γνωρίζουμε στο Υ χρωμόσωμα; Τι πληροφορίες υπάρχουν για συγκεκριμένα αλληλόμορφα; Ανάσυρε τα δεδομένα της ΟΜΙΜ για τον CFTR παράγοντα της κυστικής ίνωσης και σύνδεσε με σχετικές πρωτεϊνικές αλληλουχίες από την Entrez.
Καταχωρήσεις στην ΟΜΙΜ: ΜΙΜ numbers Κάθε καταχώρηση είναι εξαψήφια. Το πρώτο ψηφίο σημαίνει: 1xxxxx Αυτοσωμικοί τόποι ή φαινότυποι(εγγραφές πρότερες των 15 Μαΐου, 1994) 2xxxxx Αυτοσωμικοί τόποι ή φαινότυποι (εγγραφές ύστερες των 15 Μαΐου, 1994) 3xxxxx X-linked loci or phenotypes 4xxxxx Y-linked loci or phenotypes 5xxxxx Μιτοχονδριακοί τόποι ή φαινότυποι 6xxxxx Αυτοσωμικοί τόποι ή
Καταχωρήσεις στην ΟΜΙΜ: αλληλόμορφα Αλληλόμορφα: αριθμός ΜΙΜ+.+μοναδικός τετραψήφιος αλληλόμορφου Αλληλόμορφα (μεταλλαγές) του παράγοντα ΙΧ (Β αιμοροφιλία): 306900.0001.....
Καταχωρήσεις στην ΟΜΙΜ: σύμβολα Οι αριθμοί ΜΙΜ έπονται συμβόλων: * γονίδιο γνωστής αλληλουχίας # περιγραφική καταχώρηση, συνήθως φαινότυπος, δεν αντιπροσωπεύει μοναδική θέση + περιγραφή γονιδίου γνωστής αλληλουχίας και φαινοτύπου % περιγραφή γνωστού μεντελιανής κληρονομικότητας φαινοτύπου για τον οποίο η
OMIM 84
Απλή αναζήτηση
Απλή αναζήτηση
Απλή αναζήτηση
Απλή αναζήτηση: AND
Απλή αναζήτηση: OR
Απλή αναζήτηση: NOT
Σύνθετες αναζητήσεις με χρήση όρων BOOLE όρος1[πεδίο] BOOLE όρος2[πεδίο] BOOLE όρος3[πεδίο] Cancer, 17 (χρωμόσωμα), allerg*,
Σύνθετες αναζητήσεις με χρήση όρων BOOLE όρος1[πεδίο] BOOLE όρος2[πεδίο] BOOLE όρος3[πεδίο] Κενό: όλα τα πεδία [AV] ή [VAR]: Allelic variant [CH] ή [CHR]: Χρωμόσωμα π.χ. 11[CHR] [GN] ή [GENE]: όνομα γονιδίου [ID] ή [MIM]: αριθμός ΜΙΜ [TI]: όρος στον τίτλο
Σύνθετες αναζητήσεις με χρήση όρων BOOLE όρος1[πεδίο] BOOLE όρος2[πεδίο] BOOLE όρος3[πεδίο] AND, OR, NOT
Σύνθετες αναζητήσεις με χρήση όρων BOOLE όρος1[πεδίο] BOOLE όρος2[πεδίο] BOOLE όρος3[πεδίο] Παράδειγμα: deafness[ti] AND ( 11[CHR] OR 13[CHR] ) AND nonsyndromic
Προχωρημένη αναζήτηση: Index
Προχωρημένη αναζήτηση: Index
Προχωρημένη αναζήτηση: Limits
Προχωρημένη αναζήτηση: Limits
Προχωρημένη αναζήτηση: Limits
Προχωρημένη αναζήτηση: Limits allergy allergies allergic...
Προχωρημένη αναζήτηση: Limits
OMIM Gene Map Περιέχει τις θέσεις των γονιδίων που περιέχονται στην ΟΜΙΜ Αρχείο που ξεκινάει από το p τελομερές του χρωμοσώματος 1 μέχρι το q τελομερές του χρωμοσώματος 22 + Χ + Υ Η Διαδικτυακή έκδοση του μπορεί να ψαχθεί με σύμβολα γονιδίων ( SOD1 ), χρωμοσωμικές θέσεις ( 5, Xq ) ή με γενετική ανωμαλία