Ανθρώπινο μικροβίωμα και νοσήματα Γεωργία Γκιούλα Αναπληρώτρια Καθηγήτρια Ιατρικής Μικροβιολογίας Εργαστήριο Μικροβιολογίας, Ιατρικό Τμήμα, Α.Π.Θ.
Αλληλούχηση γονιδίου 16S rrna Fierer et al.,pnas 105:17994 (2008)
Ο άνθρωπος φιλοξενούμενος στο σύμπαν των μικροβίων Άνθρωπος 90% των κυττάρων στο σώμα μας είναι βακτηριακά! Μικρόβια J Infect Dis 2002, 186:S254-S258
Gnotobiology - Ελλειμματική ανάπτυξη του λεμφικού ιστού του συνδεόμενου με το έντερο GALT - Λιγότερες και μικρότερες πλάκες του Peyer, καθώς και μεσεντέριοι λεμφαδένες - Διαταραχή στην ανάπτυξη και ωρίμανση των απομονωμένων λεμφικών θυλακίων (δυναμική σχέση) - Αλλοιωμένα πρότυπα της δομής των μικρολαχνών των επιθηλιακών κυττάρων του εντέρου - Ελαττωμένος αριθμός CD4+ T κυττάρων και πλασματοκυττάρων που παράγουν IgA ανοσοσφαιρίνες Nature Rev Immunol 2014
Ανθρώπινο μικροβίωμα και νοσήματα
Αναπνευστικό σύστημα
http://pocketdentistry.com/salivary-diagnostics-and-the-oral-microbiome/
16S rrna Deep Sequencing for the Characterization of Healthy Human Pharyngeal Microbiome Georgia Gioula, Angeliki Melidou, Panayotis Siasios, Fani Minti, Nikolaos Malisiovas Microbiology Department, School of Medicine, Faculty of Health Science, Aristotle University of Thessaloniki, Thessaloniki, Greece Abstract Background: Deep sequencing methods have made possible the evaluation of the composition of the upper respiratory tract (URT) microbial ecosystem, enabling more accurate studies for the determination of its relationship to human health and disease. The aim of the present study is to characterize the composition and diversity of microbial communities of the pharynx in pharyngeal swabs samples of healthy individuals. Materials and Methods: Ten pharyngeal specimens were obtained from healthy volunteers, who were eligible to the selection criteria. DNA libraries were constructed using primers that selectively amplify the corresponding V2-V9 hypervariable regions of the bacterial 16S rrna. Sequencing was performed using the Ion Torrent PGM instrument. Results: Twelve phyla were identified in the study samples. The most abundant phyla detected, were Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes, followed by Actinobacteria and Fusobacteria. Moreover, 79 families, 79 genera and 137 species were identified. In total, 17 unique differentially abundant families, 30 unique differentially abundant genera and 24 unique differentially abundant species were detected among healthy subgroups with adjusted p-values < 0.05. According to the genus level, from the 30 unique differentially abundant genera, Moraxella (Proteobacteria) and Gemella (Firmicutes) were present with a statistical significance in non-smokers (padj= 5.06E-10, and 6.64E-03 respectively). Bifidobacterium (Actinobacteria), Alloscardovia (Actinobacteria), Dialister (Firmicutes) and Filifactor (Firmicutes) were detected with a statistically significant difference mostly in smokers (padj=4.29e-04, 5.76E-04, 1.52E-02 and 5.06E-10 respectively). Conclusions: The URT microbiome varies greatly between individuals. Further studies are needed to better understand its dynamics, the intramicrobiota competition and its interactions with the host in health and disease. Keywords: pharyngeal microbiome, 16srRNA, healthy, sequencing (Under submission)
Μικροβίωμα εντέρου
Μικροβίωμα και νόσος Φλεγμονώδη νοσήματα του εντέρου Ho et al. BMC Immunology (2015) 16:21
Μικροβίωμα και νόσος: παχυσαρκία και μεταβολικό σύνδρομο Bacteroides/Firmicutes
Μικροβίωμα και νόσος: καρκίνος Ho et al. BMC Immunology (2015) 16:21
Int. J. Mol. Sci. 2017, 18(6), 1310; doi:10.3390/ijms18061310
Μικροβίωμα και νόσος: καρκίνος
Διδακτορική Διατριβή Εργαστήριο Μικροβιολογίας, Ιατρικό Τμήμα, ΑΠΘ Μελέτη του μικροβιώματος του εντερικού συτήματος του ανθρώπου σε άτομα με λοίμωξη από Clostridium difficile Υποψήφιος Διδάκτωρ: Ελευθέριος Τσινταράκης Τριμελής επιτροπή: Καχριμανίδου Μελανία Γκιούλα Γεωργία Μελίδου Αγγελική
Το στρες μέσω του Συμπαθητικού Αυτόνομου νευρικού συστήματος προκαλεί αλλαγές στην φυσιολογική σύνθεση της εντερικής μικροχλωρίδας, ένώ ένας μηχανισμός δραστικής τροποποίησης του μικροβιώματος του εντέρου είναι μέσω του άξονα Υποθαλάμου-Υπόφυση-Επινεφρίδια Αξιοσημείωτη είναι η δράση ορισμένων μεταβολιτών και κυρίως των λιπαρών οξέων μικρής αλύσου που προέρχονται από το εντερικό μικροβίωμα, οι οποίοι δρώντας ως νευροδιαβιβαστές παίζουν κρίσιμο ρόλο στην εγκεφαλική λειτουργία. Ειδικά στον αιματοεγκεφαλικό φραγμό έχει προσδιοριστεί ένας τεράστιος αριθμός ειδικών υποδοχέων πρόσδεσης των λιπαρών οξέων. Το εντερικό μικροβίωμα μπορεί επίσης να επηρεάσει την εγκεφαλική λειτουργία μέσω της τροποποίησης του ανοσοποιητικού συστήματος. Είναι γνωστό ότι η αυξημένη συγκέντρωση κυκλοφορούντων κυτταροκινών έχει συσχετιστεί άμεσα με πολλές νευροψυχιατρικές διαταραχές https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jafc.5b02404
Διδακτορική Διατριβή Εργαστήριο Μικροβιολογίας, Ιατρικό Τμήμα, ΑΠΘ Μελέτη του μικροβιώματος του εντερικού συτήματος του ανθρώπου σε παιδιά με διάχυτες αναπτυξιακές διαταραχές (αυτισμός) Υποψήφια Διδάκτωρ: Ιουλία Πατσιαούρα Τριμελής επιτροπή: Γεωργία Γκιούλα Ευθυμία Βαριάμη Νικόλαος Μαλισιόβας
Μπορούμε να επέμβουμε? Από την θεωρία στην θεραπεία