ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΠΡΟΔΙΑΓΡΑΦΕΣ ΓΙΑ ΤΟ ΔΙΑΓΩΝΙΣΜΟ ΜΕ ΑΡΙΘ. ΠΡΩΤ. 2235/01-02-2013 Ομάδα 1: Χημικά και βιοχημικά αναλώσιμα Προϋπολογισμός με ΦΠΑ: 17.000,00 Τόπος προορισμού των ειδών: Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων Υπεύθυνος παραλαβής: Αναστασία Πολίτου, Επίκ. Καθηγήτρια, Μέλος της ΚΕΟ του έργου α/α Ονομασία είδους και προδιαγραφές* Μονάδα Ποσότητα μέτρησης 1 Μethanol A.R, Fisher M/4000/21 5l 4 2 Γάντια latex powder-free π/100 10 3 Χαρτί επαγγελματικό 2Χ2,5kgr 3 4 Sodium chloride 1kgr 1 5 SDS-PAGE STDS 10-100MW, Biorad 1610304 Τεμ. 1 6 Acrylamide/bis acrylamide 30%, 37.5:1 της 500ml 1 Biorad, 161-0158 7 Glutathione Sepharose 4 fast flow της Amersham 25ml 1 κωδ. 17-5132-01 8 Ethanol absolute 2,5 Lt 2 9 Trizma ultrapure, Applichem A1086 1 Kg 2 10 Ethanol denatured της Riedel code 24194 2.5l 4 11 UltraPure Agarose, Invitrogen 16500-500 500gr 1 12 DNAse Rnase-free 2000units/mg Sigma code 1 vial/11mg D4513 13 Protease inhibitor coctail tablets, τύπου complete 2 πακέτο/20 EDTA-free Roche code 1873580 14 Set τριων πιπετων (20, 200, 1000μl) Gilson F167300 1 set 1 15 Ni-NTA Agarose Qiagen 30210 25 ml 1 16 Φίλτρα σύριγγας 0,45 μm Corning code 431219 πακέτο/50 1 17 PMSF >99%, Sigma 78830 25g 1 18 Aλουμινόχαρτο 60m Τεμ 4 19 Parafilm 38m x 10cm Τεμ 2 20 Τρυβλία Petri(9cm diameter) 15τμχ/συσκ 67 21 LB medium Luria/Miller (Roth) 2.5kgr 1 22 Acrylamide Roth, Rotiphorese Gel 30 (37.5:1), 1lt 3 Roth 3029.1 23 Gelatin from cold water fish skin BioReagent, solid 100g 1, Sigma G7041 24 Acetic Acid glacial 2,5lt 1 25 Cryovials 1ml, Greiner 123263 Πακ/100 10 26 Cryovials 2ml, Greiner 126263 Πακ/100 10 27 Glycine Applichem A1067 1kg 1 28 EDTA, Sigma ED2P 100g 1 29 EGTA, Sigma E4378 10G 1 30 Triton X-100, Sigma T8787 250ml 1 31 Sucrose, Sigma 16104 1kg 1 32 Kanamycin Sigma K4000 5g 1 33 Millipore Centriprep centrifugal unit with Ultracel-3 Πακ/24 1 membrane 3 kda NMWL, Millipore 4302 34 Millipore Amicon Ultra-4, PLBC Ultracel-3 Membrane, 3 kda, Millipore UFC800324 Πακ/24 1
35 Prestained SDS-PAGE MW marker Thermo 500μl 2 Scientific Pierce 26612 36 TCEP, Molecular Probes T-2556 1g 1 37 50bp DNA Ladder, Takara 3421A 500μl 2 38 Amplitaq Gold DNA Polymerase, Applied 250un 2 Biosystems 4311806 39 Άζωτο 5.0, 21-012 m 3 10 40 Διοξείδιο του άνθρακα 21-006 Kg 80 41 96 well plates, Nunc 167008 Τεμ 160 42 Cryo 1 o C, Freezing Container, Nalgene 5100-0001 Τεμ 1 43 ATP Colorimetric/Fluorometric Assay kit, Biovision 100 assays 1 K354-100 44 Γάντια Latex χωρίς πούδρα Πακ/100 20 45 Ring amide-am-resin, 49001 25g 2 46 Χαρτί επαγγελματικό 2x2,5kg 10 47 DMEM, Sigma D6046 500ml 19 48 Primer 18b, scale 50nmol, HPLC Τεμ 5 49 Primer 57b, scale 50nmol, HPLC Τεμ 1 50 Power soil DNA kit, Mo-Bio 12888-50 50 reactions 1 51 Mouse anti-bovine CD1W2, Serotec MCA 2058G 0,25mg 1 52 Mouse anti-sheep CD8, Serotec MCA 2216 0,25mg 1 53 EZ-Sequencing serv (Prepaid bar-code) Τεμ 30 54 Gonadotropin from pregnant mare serum 50IU 1 lyophilized powder, BioXtra, suitable for mouse embryo cell culture, Sigma G4527 55 Καλυπτρίδες Ø10mm Πακ/100 5 56 Καλυπτρίδες Ø12mm Roth P231.1 Πακ/100 4 57 Cryovials 2ml, Greiner 122263 Πακ/100 2 58 Annexin V-FITC, BD 556420 100 tests 3 59 Amplex Red Glucose, Molecular Probes A22189 Kit 1 60 Ταινία αποστείρωσης ατμούη Kartell Τεμ 2 61 L-α-Phosphatidylcholine 100mg 1 from egg yolk, Type XVI-E, 99% (TLC), lyophilized powder, Sigma P3556 62 Sphingomyelin from chicken egg yolk, 98.0% 50mg 1 (TLC), Fluka 85615 63 Lactase Assay Kit, Biovision K267-100 100 assays 1 64 Apyrase from potato, ATPase 3.0-40.0 units/mg 200un 1 protein, lyophilized powder, Sigma A6132 65 HEPES buffer solution 1 M in H 2 O, Sigma 83264 100ml 1 66 U-test, sterile Τεμ 30 67 Gentamicin solution, 10 mg/ml in deionized 10ml 1 water, liquid, sterile-filtered, BioReagent, suitable for cell culture, Sigma G1272 68 Cryoboxes χάρτινα 81 θέσεων Τεμ 20 69 GT Anti-RB IgG (H+L), Pierce 31460 Τεμ 1 70 (R-S) Fmoc-2-amino-tetradecanoic acid, FA 1g 2 20201 71 Lipoxidase from Glycine max (soybean) Type V, ammonium sulfate suspension, 500,000-1,000,000 units/mg protein, Sigma L6632 1MU 2 *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριμένης εταιρείας, μπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναμο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας
Ομάδα 2: Πλαστικά και είδη Μοριακής Βιολογίας Προϋπολογισμός με ΦΠΑ: 10.000,00 Τόπος προορισμού των ειδών: Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων Υπεύθυνος παραλαβής: Σπυρίδων Γεωργάτος, Καθηγητής, Συντονιστής του έργου α/α Ονομασία είδους και προδιαγραφές* Μονάδα Ποσότητα μέτρησης 1 Κιτ απομόνωσης DNA από αντίδραση PCR ή πήκτωμα αγαρόζης NucleoSpin Gel and PCR Clean-up Kit Macherey-Nagel Cat no. 740609.250 250 αντιδράσεις 3 2 Προπαρασκευασμένο μείγμα για PCR υψηλής πιστότητας (Hi Fidelity) KAPA HIFI HotStart Ready Mix Kit/ KAPA BIOSYSTEMS KK2601 100 αντιδράσεις των 25 μl 3 1 kb DNA Ladder Nippon KK2601 50μg 5 4 T4 DNA Ligase με 10ΧΤ4 Ligase buffer, 25000 units 2 Takara Cat. No. 2011A 5 Συνθετικά ολιγονουκλεοτίδια-εκκινητές, βάση 2605 10nmol scale, καθαρισμένα με HPLC 6 Αντιδράσεις αλληλούχισης DNA με ανάγνωση αντίδραση 200 800 βάσεων τουλάχιστον ανά αντίδραση και λήψη ηλεκτρονικά εντος 3 ημερών των αποτελεσμάτων 7 Ρύγχη με φίλτρο 1,0-200µl, αποστειρωμένα 10 racks x 96 5 συμβατά με τους περισσότερους τύπους πιπετών, Kisker Cat. No. A200S 8 Ρύγχη με φίλτρο 100-1000µl, αποστειρωμένα, 10 racks x 96 5 συμβατά με τους περισσότερους τύπους πιπετών, Kisker Cat. No A1000S 9 Σωληνάρια για PCR, Quali PCR Tubes, Single Πακ/1000τμχ 2 PCR Tubes, 0,2 ml flat cap / colored mix Kisker Cat. No. G001-AF 10 Λευκά ρύγχη όγκου 0,1 10μl, συμβατά με Πακ/1000τμχ 8 τους περισσότερους τύπους πιπεττών Kisker Cat. No. GC.TIPS.B 11 Κίτρινα ρύγχη όγκου, 1-200µl, συμβατά με Πακ/1000τμχ 30 τους περισσότερους τύπους πιπεττών, Kisker Cat. No. VL700G 12 Μπλε ρύγχη όγκου, 100-1000µl, συμβατά με Πακ/1000τμχ 10 τους περισσότερους τύπους πιπεττών, Kisker Cat. No. VL004SHO 13 Μικροσωλήνες φυγοκέντρησης με καπάκι των Πακ/1000τμχ 7 1,5ml Kisker Cat. No. G054-SL 14 Μικροσωλήνες φυγοκέντρησης με καπάκι των Πακ/1000τμχ 6 2,0ml Kisker Cat. No. G055-SL 15 Αποστειρωμένες ορολογικές πιπέττες, 5ml, 50τμχ 6 Kisker GPS-5.0 16 Αποστειρωμένες ορολογικές πιπέττες, 10ml, 50τμχ 4 Kisker GPS-10.0 17 Αποστειρωμένες ορολογικές πιπέττες, 25ml, 10τμχ 7 Kisker GPS-25.0 18 Nucleo Fast 96 PCR plates Macherey-Nagel cat 10 plates 1 5
α/α Ονομασία είδους και προδιαγραφές* Μονάδα Ποσότητα μέτρησης no. 743100.10 19 Μη τοξική χρωστική νουκλεϊκών οξεων GelRed Nucleic Acid Stain, 10,000X0,5 ml, Biotium cat no. 41003 0,5 ml 1 *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριμένης εταιρείας, μπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναμο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας
Ομάδα 3: Είδη Μοριακής Βιολογίας Προϋπολογισμός με ΦΠΑ: 5.000,00 Τόπος προορισμού των ειδών: Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης Υπεύθυνος παραλαβής: Ελένη Νικολακάκη, Επικ. Καθηγήτρια, Μέλος της ΚΕΟ του έργου α/α Ονομασία είδους και προδιαγραφές* Μονάδα Ποσότητα μέτρησης 1 ACCUPRIME TAQ ΕΙΔΙΚΗ HOT-START ΠΟΛΥΜΕΡΑΣΗ ΓΙΑ τεμάχιο 1 MULTIPLEX PCR. ΝΑ ΕΙΝΑΙ ΠΡΟΣΔΕΔΕΜΕΝΗ ΜΕ ΜΟΝΟΚΛΩΝΙΚΑ ΑΝΤΙΣΩΜΑΤΑ ΕΤΣΙ ΩΣΤΕ ΝΑ ΕΠΙΤΥΓΧΑΝΕΤΑΙ ΑΥΤΟΜΑΤΟ HOT-START ΚΑΤΑ ΤΗΝ ΠΡΩΤΗ ΑΠΟΔΙΑΤΑΞΗ ΚΑΙ ΝΑ ΔΙΑΘΕΤΕΙ ΜΗΧΑΝIΣΜΟ (ΠΧ ΒΟΗΘΗΤΙΚΗ ΠΡΩΤΕΙΝΗ) ΠΟΥ ΕΝΙΣΧΥΕΙ ΤΗΝ ΕΙΔΙΚΗ ΠΡΟΣΔΕΣΗ ΤΩΝ ΕΚΚΙΝΗΤΩΝ ΣΤΟ DNA ΣΕ ΚΑΘΕ ΚΥΚΛΟ ΤΗΣ PCR, ΕΤΣΙ ΩΣΤΕ ΠΟΥ ΝΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΠΟΛΛΑΠΛΑΣΙΑΣΕΙ ME EIΔIKOTHTA 20 ΓΟΝΙΔΙΑ ΣΕ ΜΙΑ ΑΝΤΙΔΡΑΣΗ. ΝΑ ΣΥΝΟΔΕΥΕΤΑΙ ΑΠΟ ΚΑΤΑΛΛΗΛΟ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΟ ΔΙΑΛΥΜΑ ΠΟΥ ΠΕΡΙΕΧΕΙ DNTPS ΚΑΙ ΞΕΧΩΡΟ ΔΙΑΛΥΜΑ MG 2 SUPERSCRIPT III ΑΝΑΣΤΡΟΦΗ ΜΕΤΑΓΡΑΦΑΣΗ ΓΕΝΕΤΙΚΑ τεμάχιο 1 ΤΡΟΠΟΠΟΙΗΜΕΝΗ ΜΕ ΜΕΤΑΛΛΑΞΕΙΣ ΓΙΑ ΜΕΙΩΜΕΝΗ ΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΗΤΑ RNAase H. ΝΑ ΕΙΝΑΙ ΘΕΡΜΟΣΤΑΘΕΡΗ, ΜΕ ΔΥΝΑΤΟΤΗΤΑ ΑΝΑΣΤΡΟΦΗΣ ΜΕΤΑΓΡΑΦΗΣ ΣΕ ΥΨΗΛΕΣ ΘΕΡΜΟΚΡΑΣΙΕΣ [ 55οC ] ΝΑ ΕΧΕΙ ΣΥΓΚΕΝΤΡΩΣΗ 200 units/μl 3 TRIZOL LS ΜΟΝΟΦΑΣΙΚΟ ΔΙΑΛΥΜΑ ΦΑΙΝΟΛΗΣ ΚΑΙ τεμάχιο 1 ΙΣΟΘΕΙΑΚΥΑΝΙΚΗΣ ΓΟΥΑΝΙΔΙΝΗΣ (ΤΥΠΟΥ TRIZOL) ΚΑΤΑΛΛΗΛΟ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΠΟΜΟΝΩΣΗ ΟΛΙΚΟΥ RNA ΥΨΗΛΗΣ ΠΟΙΟΤΗΤΑΣ ΑΠΟ ΥΓΡΑ ΔΕΙΓΜΑΤΑ ΑΝΘΡΩΠΙΝΗΣ (ΠΧ ΒΙΟΛΟΓΙΚΑ ΥΓΡΑ), ΖΩΙΚΗΣ, ΦΥΤΙΚΗΣ, ΙΙΚΗΣ, ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΗΣ ΠΡΟΕΛΕΥΣΗΣ. ΝΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΕΙΤΑΙ ΣΕ ΑΝΑΛΟΓΙΑ 3:1 ΩΣ ΠΡΟΣ ΤΟ ΥΓΡΟ ΔΕΙΓΜΑ 4 DNTPS 100mM σετ από datp, dctp, dgtp, and dttp τεμάχιο 1 (2 -deoxynucleoside 5 -triphosphates). Το κάθε φιαλίδιο περιέχει 250μl 25μmol dntp σε νερό (pη 7,5) 5 PLATINUM TAQ HOT START ΠΟΛΥΜΕΡΑΣΗ. τεμάχιο 1 ΔΕΣΜΕΥΜΕΝΗ ΜΕ ΜΙΓΜΑ ΕΙΔΙΚΩΝ ΜΟΝΟΚΛΩΝΙΚΩΝ ΑΝΤΙΣΩΜΑΤΩΝ ΠΟΥ ΑΝΑΣΤΕΛΛΟΥΝ ΤΗ ΔΡΑΣΗ ΤΗΣ. ΤΟ ΕΝΖΥΜΟ ΝΑ ΕΝΕΡΓΟΠΟΙΕΙΤΑΙ ΣΤΗΝ ΑΡΧΙΚΗ ΑΠΟΔΙΑΤΑΞΗ ΤΗΣ PCR (ΑΥΤΟΜΑΤΟ HOT-START) ΚΑΙ ΝΑ ΕΠΙΤΡΕΠΕΙ ΝΑ ΣΤΗΘΕΙ Η ΑΝΤΙΔΡΑΣΗ ΣΕ ΘΕΡΜΟΚΡΑΣΙΑ ΔΩΜΑΤΙΟΥ. ΝΑ ΕΧΕΙ ΣΥΓΚΕΝΤΡΩΣΗ 5u/μl KAI ΝΑ ΣΥΝΟΔΕΥΤΑΙ ΑΠΟ ΚΑΤΑΛΛΗΛΟ 10Χ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΟ ΔΙΑΛΥΜΑ ΚΑΙ ΞΕΧΩΡΟ ΔΙΑΛΥΜΑ Mg. ΣΥΣΚΕΥΑΣΙΑ 500units 6 ΑΓΑΡΟΖΗ ULTRA PURE ΓΙΑ ΔΙΑΧΩΡΙΣΜΟ ΤΜΗΜΑΤΩΝ τεμάχιο 1 DNA 100bp- 30Kb. ΝΑ ΔΙΑΤΙΘΕΤΑΙ ΣΕ ΣΥΣΚΕΥΑΣΙΑ ΤΥΠΟΥ ΠΛΑΣΤΙΚΗΣ ΕΥΚΑΜΠΤΗΣ ΣΑΚΟΥΛΑΣ ΜΕ ΕΙΔΙΚΟ ΣΤΟΜΙΟ ΓΙΑ ΕΥΚΟΛΟΤΕΡΟ ΧΕΙΡΙΣΜΟ. ΣΥΣΚΕΥΑΣΙΑ 500g 7 100 BP LADDER ΜΑΡΤΥΡΑΣ ΜΟΡΙΑΚΟΥ ΜΕΓΕΘΟΥΣ DNA τεμάχιο 1 ΕΥΡΟΥΣ 100-1500bp. ΝΑ ΕΜΦΑΝΙΖΕΙ 15 ΖΩΝΕΣ ΣΤΗΝ ΗΛΕΚΤΡΟΦΟΡΗΣΗ ΠΟΥ ΝΑ ΔΙΑΦΕΡΟΥΝ ΜΕΤΑΞΥ ΤΟΥΣ 100 bp. ΣΥΓΚΕΝΤΡΩΣΗ 1 μg/μl 8 SUPERSCRIPT II ΑΝΤΙΣΤΡΟΦΗ ΜΕΤΑΓΡΑΦΑΣΗ, ΓΕΝΕΤΙΚΑ ΤΡΟΠΟΠΟΙΗΜΕΝΗ ΛΟΓΩ ΜΕΤΑΛΛΑΓΩΝ ΩΣΤΕ ΝΑ ΕΧΕΙ τεμάχιο 1
ΜΕΙΩΜΕΝΗ ΔΡΑΣΤΙΚΟΤΗΤΑ RNΑΣΗΣ Η. ΝΑ ΕΙΝΑΙ ΔΡΑΣΤΙΚΗ ΣΕ ΘΕΡΜΟΚΡΑΣΙΑ 42Ο C. ΝΑ ΕΧΕΙ ΣΥΓΚΕΝΤΡΩΣΗ 200U/Μ ΚΑΙ ΝΑ ΣΥΝΟΔΕΥΕΤΑΙ ΑΠΟ ΚΑΤΑΛΛΗΛΟ 5Χ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΟ ΔΙΑΛΥΜΑ KAI DTT 9 SIII FIRST STRAND SYNTHESIS KIT CDNA SYNTHESIS KIT RT-PCR. που να περιέχει όλα τα απαραίτητα αντιδραστήρια : (oligo (dt)20, random hexamers, Recombinant ribonuclease inhibitor, DTT, 10mM dntp s mix,10x buffer, διαλυμα ΜgCl2, RNAse H, DEPC water, control RNA and primers και αναστροφη μεταγραφάση γενετικα τροποποιημένη ώστε να έχει ελάχιστη ενεργότητα RNAaseH και θερμοκρασία λειτουργίας 55ο. Η ευαισθησία του κιτ να είναι, 1 pg αρχικού RNA. ΣΥΣΚΕΥΑΣΙΑ 50 ΑΝΤΙΔΡΑΣΕΩΝ τεμάχιο 1 *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριμένης εταιρείας, μπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναμο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας Σημείωση: Στα υπολογιζόμενα κόστη κάθε ομάδας περιλαμβάνονται και τα έξοδα μεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισμού των ειδών
Ομάδα 4: Αναλώσιμα μοριακής βιολογίας, γενικής χρήσης και πλαστικά Προϋπολογισμός με ΦΠΑ: 5.000 Τόπος προορισμού των ειδών: Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης Υπεύθυνος παραλαβής: Ελένη Νικολακάκη, Επικ. Καθηγήτρια, Μέλος της ΚΕΟ του έργου α/α Εμπορικό Όνομα Γενικό Όνομα Προδιαγραφές Συσκευασία Ποσότητα 1 Porablot NCP, roll, 0,3x3 m, 0,45 µm Cat. No. 741280 2 BamH I, 10000 units, Cat. No. 1010A Μεμβράνη νιτροκυτταρίνης Περιοριστικό ένζυμο BamH I Μεμβράνη μεταφοράς πρωτεϊνών και νουκλεϊκών οξέων. Να είναι υδρόφιλη, από 100% νιτροκυτταρίνη, σε ρολό διαστάσεων 0,3x3 m, και με μέγεθος πόρων 0,45 µm Περιοριστικό ένζυμο BamH I, 10,000 units. Να συνοδεύεται από 10X reaction buffer K & 10X loading buffer. Ρολό 3m 2 FL/10.000 units 2 3 SacI, 2.000 units Cat. No. 1078A 4 SalI, 3.000 units Cat. No. 1080A 5 XhoI, 5.000 units Cat. No. 1094A 6 NcoI, 500 units, Cat. No. 1160A 7 NdeI, 400 units Cat. No. 1161A 8 NotI, 500 units Cat. No. 1166A 9 T4 DNA Ligase, 12500 units Cat. No. 2011A 10 T7 RNA Polymerase, 5000 units, Cat. No. 2540A 11 Bln I(Avr II), 400 units, Cat. Περιοριστικό ένζυμο SacI, 2.000 units Περιοριστικό ένζυμο SalI, 3.000 units Περιοριστικό ένζυμο XhoI, 5.000 units Περιοριστικό ένζυμο NcoI Περιοριστικό ένζυμο NdeI Περιοριστικό ένζυμο Not I Τροποιητικό ένζυμο T4 DNA Ligase Τροποιητικό ένζυμο T7 RNA Polymerase Περιοριστικό ένζυμο Bln I(Avr II), Περιοριστικό ένζυμο SacI, 2.000 units. Να συνοδεύεται από 10X reaction buffer H & 10X loading buffer. Περιοριστικό ένζυμο SalI, 3.000 units. Να συνοδεύεται από 10X reaction buffer H & 10X loading buffer. Περιοριστικό ένζυμο XhoI, 5.000 units. Να συνοδεύεται από 10X reaction buffer H & 10X loading buffer. Περιοριστικό ένζυμο NcoI, 500 units. Να συνοδεύεται από 10X reaction buffer K +, 10X loading buffer & 0,1% BSA. Περιοριστικό ένζυμο NdeI, 400 units. Να συνοδεύεται από 10X reaction buffer H & 10X loading buffer. Περιοριστικό ένζυμο Not I, 500 units. Να συνοδεύεται από 10X reaction buffer H +, 10X loading buffer, 0,1% BSA & 0.1% Triton X-100. T4 DNA Ligase από E.coli. Να συνοδεύεται από 10X reaction buffer. Σε συσκευασία 12500 units T7 RNA Polymerase Να συνοδεύεται από 10X T7 RNA Polymerase Buffer, 50 mm DTT Περιοριστικό ένζυμο Bln I(Avr II), 400 units. Να συνοδεύεται FL/2.000 units FL/3.000 units FL/5.000 units FL/500 units FL/400 units FL/500 units 2 2 1 1 2 2 12500 Units 2 5000 Units 2 400 Units 2
No. 1022A 12 BstX I, 1000 units, Cat. No. 1027A 13 T4 DNA Polymerase, 100 units, Cat. No. 2040A 14 Xfect, 100 rxns (2 x 50 reactions kit) (Clontech) #631317 Περιοριστικό ένζυμο BstX I Τροποιητικό ένζυμο T4 DNA Polymerase Αντιδραστήριο για DNA transfection. από 10X reaction buffer K & 10X loading buffer. Περιοριστικό ένζυμο BstX I, 1000 units. Να συνοδεύεται από 10X reaction buffer H & 10X loading buffer. T4 DNA Polymerase, 100 units. Να συνοδεύετε από 10X T4 DNA Polymerase Buffer & 0.1% BSA Αντιδραστήριο για DNA transfection. Κατάλληλο για χρήση με τις περισσότερες κυτταρικές σειρές. Να είναι κατά το δυνατόν μη κυτταροτοξικό, Να έχει υψηλή απόδοση. Η διαδικασία να είναι απλή, και να επιτυγχάνεται σε περίπου 2 ώρες. 1000 Units 3 100 Units 3 kit / 100 reactions 2 15 Primer synthesis, 10 nmol scale, HPLC purified Συνθετικά ολιγονουκλεοτίδια Σύνθεση ολιγονουκλεοτιδίων (εκκινητών), σε scale 10nmol, καθαρισμένα με HPLC. Να δοθεί τιμή ανά βάση Ανά βάση 218 16 KAPA HIFI DNA Polymerase kit with dntps, 250units Cat. No 17 Prestained Protein Marker BlueStar, 100 lanes Cat. No. MWP03 Πολυμεράση υψηλής πιστότητας Δείκτης μοριακών βαρών πρωτεϊνών Πολυμεράση υψηλής πιστότητας. Να έχει την μεγαλύτερη δυνατή πιστότητα σε σχέση με την απλή Taq Να είναι κατάλληλη για δύσκολες περιοχές Να είναι κατάλληλη για ενίσχυση μεγάλων τμημάτων (έως 15 Kb) Να είναι κατάλληλη για γρήγορες αντιδράσεις Η συσκευασία να περιλαμβάνει: 5x High Fidelity Buffer with MgCl2 5x High Fidelity GC Buffer with MgCl2 25 mm MgCl2 dntp Mix (10 mm each nucleotide) Δείκτης μοριακών βαρών πρωτεινών έγχρωμος Να καλύπτει την περιοχή 10-180 kda. Να περιλαμβάνει 2 ζώνες αναφοράς διαφορετικών χρωμάτων στα 30 και 75kda Να δίνει καθαρές, έντονες ζώνες. Να είναι έτοιμος προς χρήση για FL/250 units Fl/ 500 μl (for 100 minigels) 2 1
18 Quali - Petri Dishes for Microbiology and Tissue Culture, not devided, machine-sterile Cat. No. G090 19 Pasteur Pipettes, plastic, 3 ml graduiert, 155mm long, 20 drops/ml, 50µl drop volume (pack/ 500pcs) Cat. No. GPP-3G 20 Fraction collection Racks, neon mix (pack/5 racks) Cat. No. R003-A Τριβλία τύπου Petri Πλαστικές Πιπέττες Pasteur 3ml Στατώ (Racks) για σωληνάρια 1,5/2,0ml, 80 θέσεων απευθείας φόρτωση στα gels (να περιλαμβάνει loading dye). Να επαρκεί για 500 minigels Τριβλία Petri 94mm x 16mm, χωρίς διαχωριστικό, χωρίς οπές, αποστειρωμένα. Κατάλληλα για βακτηριολογία. Σε συσκευασία των 20 τμχ. Πλαστικές Πιπέττες Pasteur 3ml, με διαβάθμιση, μήκους ~150mm, 20 σταγόνες/ ml, όγκος σταγόνας 50μl. Να είναι κατασκευασμένες από διαφανές πολυπροπυλένιο. Στατώ (Racks) για σωληνάρια 1,5/2,0ml, 80 θέσεων, σε 5 διαφορετικά νέον χρώματα, να μπορούν να αποστειρωθούν και να φυλαχθούν στους -80 0 C, σε συσκευασία των 5 τεμαχίων. Τα στατώ να έχουν περιοχή επισήμανσης και να διαθέτουν 5 σειρές με 16 θέσεις οι οποίες να είναι αριθμητικά κωδικοποιημένες για εύκολη αναγνώριση 20 τεμ. 24 500 τεμ. 10 5 τεμ. 4 21 BestRacks, 96 places neon mix (pack/5 racks) Cat. No. R009 22 Cryobox with hinged lid for 100 x 1,5/2,0 ml tubes, neon mix (pack/5 racks) Cat No. R031-A Στατώ (Racks) διπλής όψεως Κουτιά αποθήκευσης σωληναρίων 1,5/ 2,0 ml, 100 θέσεων Στατώ (Racks) διπλής όψεως, 96 θέσεων για 1,5/2,0 ml tubes στη μια πλευρά και 96 θέσεων για 0,5ml tubes στην άλλη, αριθμημένα, με καπάκι, να αποστειρώνονται. Σε 5 διαφορετικά νέον χρώματα Να είναι κατασκευασμένα από ανθεκτικό πολυπροπυλένιο Κουτιά αποθήκευσης σωληναρίων 1,5/ 2,0 ml σε πολύ χαμηλές θερμοκρασίες, από πολυπροπυλένιο, 10x10 θέσεων Να είναι ανθεκτικά σε θερμοκρασία έως και -80oC. Να έχουν χωρητικότητα 100 θέσεων (10x10). Οι θέσεις να είναι αριθμημένες. Να έχουν διάφανο ενσωματωμένο κάπακι. Να μπορούν να αποστειρωθούν 5 τεμ. 2 5 τεμ. 2
23 Slide Box for 100 Slides Cat. No. R100 24 Cardbox for storage of samples, 136 x 136 mm square, 50mm height Divider for cardbox, 9 x 9places/13mm( pack/box) Cat. No. SB-50 & SB-R-9 25 Nucleo Fast 96 PCR plates cat no. 743100.10 Κουτί από χαρτόνι φύλαξης κρυοσωληναρίων 0,5, 1,5/2,0 ml, 96-well plates για καθαρισμό προϊόντος PCR σε αυτόκαυστο. Να έχουν διαστάσεις περίπου 14x15,5x5,5cm. Να διατίθενται σε πεντάδα σε διάφορα χρώματα. Κουτί για αποθήκευση 100 slides, διαστάσεων 222x171x33mm. Κουτί από χαρτόνι φύλαξης κρυοσωληναρίων 0,5, 1,5/2,0 ml, διαστάσεων 136 x 136 mm, ύψους 50mm, τεμάχιο & διαχωριστικό για κουτί 9 χ 9 θέσεων 96-well plates για καθαρισμό προϊόντος PCR με την τεχνολογία υπερδιήθησης με εφαρμογή κενού. Να είναι κατάλληλα για όγκους 20-300μl. Να απομακρύνει κλάσματα <150bp To DNA που δίνει να είναι κατάλληλο για sequencing, microarray spotting. Η διαδικασία να ολοκληρώνεται σε λιγότερο από 20 λεπτά. Ο όγκος έκλουσης να είναι από 25-100μl. 1 τεμ. 4 1 τεμ. 5 Kit/ 10 plates 1 26 Syringe filters; Cellulose acetate Ø 25mm; Pore size 0,45µm 27 GelRed Nucleic Acid Stain, 10,000X in water, 0,5 ml 41003 SVF-CA-25045 Μη τοξική χρωστική νουκλεϊκών οξεών με φασματικά χαρακτηριστικά ανάλογα του βρωμιούχου αιθιδίου Φίλτρα σύριγγας για την διήθηση βιολογικών διαλυμάτων μεγέθους πόρων 0,45μm.Η διάμετρος τους να είναι 25mm. Να είναι κατασκευασμένα από οξική κυτταρίνη. Να διατίθενται σε συσκευασία 100 τεμαχίων. Να καθιστά δυνάτη τη χρώση νουκλεϊκών οξεών σε πηκτώματα αγαρόζης και ακρυλαμίδης. Να μην είναι μεταλλαξιογόνα. Να μην είναι τοξική. Να μην απαιτούνται ιδιαίτεροι χειρισμοί για την αποκομιδή του. (Να μην θεωρείται τοξικό απόβλητο). Να διατηρείται σε θερμοκρασία δωματίου. Να διατίθεται ως 10.000Χ σε 100 τεμ. 1 Fl/0.5ml 1
υδατικό διάλυμα. Να μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τη χρώση του πηκτώματος είτε με την ενσωμάτωση του σε αυτό κατά την παρασκευή του πριν την ηλεκτροφόρηση, είτε με τη χρώση του πηκτώματος μέσω της εμβάπτισης σε διάλυμα της χρωστικής μετά την ηλεκτροφόρηση Να έχει τουλάχιστον την ίδια ευαισθησία με το βρωμιούχο αιθίδιο. Να μπορεί να χρησιμοποιηθεί με τον ίδιο εξοπλισμό (υπεριώδη πηγή διέγερσης, σύστημα φωτογράφησης) που χρησιμοποιείται και το βρωμιούχο αιθίδιο. *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριμένης εταιρείας, μπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναμο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας Σημείωση: Στα υπολογιζόμενα κόστη κάθε ομάδας περιλαμβάνονται και τα έξοδα μεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισμού των ειδών
Ομάδα 5: Είδη Μοριακής Βιολογίας Προϋπολογισμός με ΦΠΑ: 3800 Τόπος προορισμού των ειδών: Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας Υπεύθυνος παραλαβής: Ελένη Γεωργάτσου, Αναπλ. Καθηγήτρια, Μέλος της ΚΕΟ του έργου α/α Εμπορικό Όνομα Γενικό Όνομα Προδιαγραφές Συσκευασία Ποσότητα 1 KAPA SYBR Fast Master Mix (2x) Universal kit /1000 αντιδράσεις των 20 μl KK4602 2 1 kb DNA Ladder Cat. No.31021 3 Cryotubes, sterile, polypropylen, Προπαρασκευασμ ένο μείγμα KAPA SYBR Fast Master Mix KK4602 για real time-pcr υψηλής απόδοσης. 1kb δείκτης μοριακών βαρών DNA Μικροσωληνίσκοι κρυοαποθήκευση ς 2ml Προπαρασκευασμένο μείγμα για real time PCR υψηλής απόδοσης. Να έχει συγκέντρωση τουλάχιστον 2X. Να περιλαμβάνει στο ίδιο μείγμα DNA πολυμεράση, SYBR Green I φθορίζουσα χρωστική, MgCl 2 και dntps ώστε για την πραγματοποίηση της αντίδρασης να αρκεί η προσθήκη του DNA-μήτρα (template DNA) και των κατάλληλων εκκινητών (primer). Να είναι κατάλληλο για τον πολλαπλασιασμό DNA τμημάτων πλούσιων σε GC ή ΑΤ. Να είναι κατάλληλο για ανάλυση γονιδιακής έκφρασης και ανίχνευση γονιδίων με χαμηλή έκφραση. Να περιλαμβάνει χρωστική αναφοράς ROX αλλά ξεχωριστά από το προπαρασκευασμένο μείγμα. 1kb δείκτης μοριακών βαρών DNA Να περιέχει 13 ζώνες και να καλύπτει την περιοχή 250 10000bp. Να περιλαμβάνει 2 έντονες ζώνες αναφοράς στα 1 και 3Kb. Να είναι γνωστή η ποσότητα του DNA σε κάθε μπάντα (0.2μg ανά φόρτωση) ώστε να επιτυγχάνεται η ποσοτικοποίηση των δειγμάτων. Να είναι έτοιμος προς χρήση για απευθείας φόρτωση στα gels (να περιλαμβάνει loading dye). Να επαρκεί για 150 minigels Μικροσωληνίσκοι κρυοαποθήκευσης (cryotubes), χωρητικότητας 2 ml, για 1000rxs (2x5 ml) 1 300 μl 2 100 τεμάχια 2
internal thread with silicone washer, freestanding 2,0 ml, (1 bag x 100pcs) Cat. No. CV11-2 αποθήκευση σε θερμοκρασία έως -196 C Να έχουν κυλινδρικό πάτο Να έχουν εσωτερικό πώμα Να φέρουν λευκή επιφάνεια σήμανσης. Να είναι συμβατά με τα περισσότερα συστήματα αποθήκευσης. Να διατίθενται σε επανασφραγιζόμενες σακούλες 4 RPMI 1640 Medium, no Glutamine Gibco Cat no. 31870-025 5 Protino Glutathione Agarose 4B, 10 ml Cat. No. 745 500.10 6 High capacity cdna Reverse Transcription kit, 200 Reactions, no RNAse Inhibitor. Cat.no. 4368814 7 Blotting- Paper MN 218 B, 200x200 mm, MACHEREY- NAGEL Cat no. 742115 8 Porablot NCP, roll, 0,3 x 3m, 0,45 μm, MACHEREY- NAGEL Cat. No 741280 9 NucleoSpin Gel and PCR Clean-up Kit/250 prep Θρεπτικό υλικό για καλλιέργεια κυττάρων θηλαστικών Σφαιρίδια Γλουταθειόνης Αγαρόζης Κιτ αντίστροφης μεταγραφάσης. Χαρτί τύπου Whatman Μεμβράνη Νιτροκυτταρίνης Κιτ απομόνωσης DNA από αντίδραση PCR ή πήκτωμα Περιέχει βιοτίνη και βιταμίνη Β12. Επίσης περιέχει ινοσιτόλη και χολίνη σε πολύ υψηλές συγκεντρώσεις. Δεν περιλαμβάνει πρωτεΐνες, λιπίδια και αυξητικούς παράγοντες. Αναπτύχθηκε για την καλλιέργεια ανθρώπινων λευχαιμικών κυττάρων. Σφαιρίδια Γλουταθειόνης Αγαρόζης για τον καθαρισμό πρωτεϊνών με επίτοπο GST Να περιλαμβάνει : 10 RT Buffer, 1.0 ml, 1 tube 10 RT Random Primers, 1.0 ml, 1 tube 25 dntp Mix (100 mm), 1 tube, 0.2 ml MultiScribe Reverse Transcriptase, 50 U/μL, Λεία επιφάνεια, Πάχος χαρτιού 0,36 mm To υλικό της μεμβράνης να είναι 100% νιτροκυτταρίνη, υδρόφιλο, με μέγεθος πόρου 0,45 μm και ικανότητα δέσμευσης πρωτεΐνης 100 μg/cm2 Καθαρισμός PCR προϊόντος και gel extraction να επιτυγχάνονται με το ίδιο kit χρησιμοποιώντας το ίδιο buffer. 500ml 5 10 ml 1 200 Reactions 1 100 φύλλα 1 1 ρολό (3 m) 1 250 preps 1
Cat no. 740609.250 αγαρόζης Η διαδικασία να επιτυγχάνεται σε λιγότερο από 15 λεπτά. Να παρέχει υψηλή ανάκτηση DNA ακόμα και από πολύ μικρά κομμάτια (>65 bp) Να επιτυγχάνεται πλήρης απομάκρυνση των primers. Να είναι δυνατοί μικροί όγκοι έκλουσης (μικρότεροι από 20 μl) και μέχρι 100 μl. Να χρησιμοποιεί τεχνολογία Silica Membrane με spin columns Να παρέχει DNA έτοιμο προς χρήση, κατάλληλο για κλωνοποίηση, sequencing, PCR, transformation, restriction analysis. Να είναι δυνατή η απομόνωση ssdna και SDS-containing samples Να περιλαμβάνει διάλυμα δέσμευσης του DNA με δείκτη ph για βέλτιστη απόδοση του kit. Να περιλαμβάνει Gel Extraction and PCR Clean Up κολόνες, buffers NTI, NT3, NE 10 NucleoSpin Plasmid kit/250 prep Cat no. 740588.250 Κιτ για γρήγορη απομόνωση πλασμιδιακού DNA από αρχικό όγκο καλλιέργειας έως και 10ml (minipreps). Να χρησιμοποιεί τεχνολογία Silica Membrane με spin columns. Να παρέχει DNA με τυπική απόδοση έως και 40 μg. Ο όγκος έκλυσης να μην είναι μεγαλύτερος των 50μl. Να παρέχει DNA έτοιμο προς χρήση, κατάλληλο για κλωνοποίηση, sequencing, PCR,transformation, restriction analysis. Να περιλαμβάνει Plasmid κολόνες, collection tubes, RNase A,Elution Buffer AE, Wash Buffer A4, Wash Buffer AW, Neutralization Buffer A3, Lysis Buffer A2 Resuspension Buffer A1 250 preps 1 11 NucleoBond Xtra Midi kit/100preps Cat no. 740410.100 Κιτ για γρήγορη απομόνωση πλασμιδιακού DNA από αρχικό όγκο καλλιέργειας έως και 100ml (midipreps). Χρησιμοποιεί τεχνολογία Silica Membrane με spin columns. Παρέχει DNA με τυπική απόδοση έως και 400 μg. Παρέχει DNA έτοιμο προς χρήση, κατάλληλο για κλωνοποίηση, sequencing, PCR,transformation, restriction analysis. Περιλαμβάνει Plasmid κολόνες, collection tubes, RNase A, Elution 100 preps 1
12 Primer synthesis, 10 nmol scale, HPLC purified Συνθετικά ολιγονουκλεοτίδι α Buffer AE, Wash Buffer A4, Wash Buffer AW, Neutralization Buffer A3, Lysis Buffer A2 Resuspension Buffer A1 Σύνθεση ολιγονουκλεοτιδίων (εκκινητών), σε scale 10nmol, καθαρισμένα με HPLC. Να δοθεί τιμή ανά βάση Ανά βάση 250 13 Sequencing Service 14 Syringe filters; Cellulose acetate Ø 25mm; Pore size 0,20µm; sterile Cat No. SVF- CA-25020S Υπηρεσία αλληλούχισης Φίλτρα αποστείρωσης, αποστειρωμένα με μέγεθος πόρων μεμβράνης 0,20µm και διάμετρο 25mm Αντίδραση αλληλούχισης. Αλληλούχιση εως 800 βάσεις. Τα αποτελέσματα να λαμβάνονται ηλεκτρονικά εντός τριών ημερών Να είναι ειδικά για βιολογικά υλικά Ανά κατεύθυνση 12 100pc 1 *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριμένης εταιρείας, μπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναμο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας Σημείωση: Στα υπολογιζόμενα κόστη κάθε ομάδας περιλαμβάνονται και τα έξοδα μεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισμού των ειδών
Ομάδα 6: Είδη Κυτταροκαλλιεργειών Προϋπολογισμός με ΦΠΑ: 1400 Τόπος προορισμού των ειδών: Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας Υπεύθυνος παραλαβής: Ελένη Γεωργάτσου, Αναπλ. Καθηγήτρια, Μέλος της ΚΕΟ του έργου α/α Εμπορικό Όνομα Γενικό Όνομα Προδιαγραφές Συσκευ ασία Ποσότητα 1 Glycogen Cat No. 10814-010 2 Lipofectami ne RNAiMax Cat. No. 13778-075 3 Trypsin 0,05% EDTA,100ml Cat no. 25300054 Life Technologie s Limited 4 DMEM, High Glucose, Pyruvate 500ml Cat no. 41966029 Life Technologie s Limited 5 DMEM, High Glucose, no Glutamine, no Phenol Red 500ml Cat no. 31053028 Life Technologie s Limited Γλυκογόν ο Αντιδρασ τήριο επιμόλυν σης κυττάρων lipofecta mine Διάλυμα 0,05% θρυψίνης EDTA Θρεπτικό υλικό κυττάρων 500ml Θρεπτικό υλικό κυττάρων χωρίς ερυθρό της φαινόλης 500ml Να χρησιμοποείται ως μεταφορέας κατά την κατακρήμνιση των νουκλεϊκών οξέων σε αιθανόλη. Να χρησιμοποιείται σε αντιδράσεις λιγάσης. Να χρησιμοποιείται κατά την απομόνωση RNA από ιστούς. Να παρέχεται σε συγκέντρωση 20 μg/ml σε νερό ελεύθερο από RNA-άσες. Αντιδραστήριο επιμόλυνσης ευκαρυωτικών κυττάρων με μικρά μόρια RNA για αποσιώπηση γονιδίων. Μικρή κυτταροτοξικότητα. Μεγάλο ποσοστό επιμόλυνσης. Υψηλά ποσοστά αποσιώπησης με μικρές συγκεντρώσεις RNAi Διάλυμα θρυψίνης ειδικό για τον διαχωρισμό της μονοστοιβάδας των κυττάρων από το πολυστυρόλιο Να είναι δοκιμασμένη για τυχόν μόλυνση από μυκόπλασμα, PPV και PCV 1/2 Να κατασκευάζεται με κατάλληλες διεργασίες, έτσι ώστε να ελαχιστοποιείται η απώλεια της ενεργότητας των ενζύμων από την μετουσίωση και την αυτοαποδόμηση. Βασικό μέσο για την υποστήριξη της ανάπτυξης πολλών διαφορετικών κυττάρων θηλαστικών. Να είναι κατάλληλο για να καλλιεργηθούν επιτυχώς κυτταρικές σειρές όπως HeLa, 293, Cos-7 και Huh 7. Βασικό μέσο για την υποστήριξη της ανάπτυξης πολλών διαφορετικών κυττάρων θηλαστικών. Να είναι κατάλληλο για να καλλιεργηθούν επιτυχώς κυτταρικές σειρές όπως HeLa, 293, Cos-7 και Huh 7, MCF-7. 100μl 1 0,75 ml 1 100ml 1 500ml 26 500ml 8 6 Penicillin- Διάλυμα Συνδυασμός αντιβιοτικών πενικιλίνης 100ml 5
Streptomyci n Liquid 100ml Cat no. Life Technologie s Limited πενικιλίνη ς στρεπτομ υκίνης 100 ml στρεπτομυκίνης για την αποφυγή βακτηριακής μόλυνσης των κυττάρων. Αποτελεσματική δράση έναντι θετικών και αρνητικών βακτηρίων κατά GRAM *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριμένης εταιρείας, μπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναμο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας Σημείωση: Στα υπολογιζόμενα κόστη κάθε ομάδας περιλαμβάνονται και τα έξοδα μεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισμού των ειδών
Ομάδα 7: Αντιδραστήρια πρωτεϊνικής ανάλυσης Προϋπολογισμός με ΦΠΑ: 4900 Τόπος προορισμού των ειδών: Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας Υπεύθυνος παραλαβής: Ελένη Γεωργάτσου, Αναπλ. Καθηγήτρια, Μέλος της ΚΕΟ του έργου α/α Εμπορικό Όνομα Όνομα είδους Προδιαγραφές Συσκευασία Ποσότητα 1 Vent DNA Polymerase 200 units Cat no. M0254S 2 Protein Ladder (10-250 kda) Cat. No. P7703S 3 FBS tetracycline Free Cat.no. S0615 4 Anti- Rabbit IgG, HRPlinked Antibody, Cat. No. 7074s Πολυμεράση υψηλής πιστότητας Πρωτεϊνικός μάρτυρας μοριακός βαρών (10-250 kda) Βόειος Εμβρυικός Ορός Δευτερεύων αντίσωμα που αναγνωρίζει ΙgG κουνελιού συνδεδεμένο με την υπεροξειδάση αγριοραπανιού (HRP) Θερμόφιλη πολυμεράση υψηλής πιστότητας. Να έχει 5-15 φορές μεγαλύτερη πιστότητα σε σχέση με την απλή Taq Να έχει χρόνο ημιζωής 6.7 ώρες στους 95 ο C Να έχει δράση 3' 5' εξονουκλεάσης Η συσκευασία να περιλαμβάνει: 10x Thermopol Reaction Buffer Pack 100mM MgCl2 Να αναλύεται με ακρίβεια (0.5μg ανά φόρτωση) σε ζώνες από 20 έως 250 kda σε SDS-PAGE. Οι ζώνες των 25 και 80 kda να έχουν μεγαλύτερη ένταση ώστε να χρησιμοποιούνται σαν σημεία αναφοράς. Να είναι έτοιμος προς χρήση για απευθείας φόρτωση στα gels (να περιλαμβάνει loading dye). Να επαρκεί για 100 minigels Να έχει χαμηλά επίπεδα ενδοτοξίνης. Να έχει ελεγχθεί για ιούς. Να έχει ελεγχθεί για μυκόπλασμα. Δευτερεύον αντίσωμα που αναγνωρίζει ανοσοσφαιρίνες κουνελιού κατάλληλο για χημειοφωταύγεια για ανοσοαποτύπωση (Western Blotting) 200 units 1 500μl 2 500 ml 4 1 ml 1 5 p44/42 MAPK (Erk1/2) Antibody, Cat. No. 9102 Αντίσωμα p44/42 Πολυκλωνικό αντίσωμα που αναγνωρίζει την μη φωσφορυλιωμένη μορφή της κινάσης p44/42 MAPK σε κυτταρικές σειρές που προέρχονται από άνθρωπο, ποντίκι, αρουραίο, και πίθηκο. Κατάλληλο για ανοσοαποτύπωση, ανοσοφθορισμό και ανοσοκαθίζηση. 200 μl 1
6 Phosphop44/42 MAPK (Erk1/2) (Thr202/Tyr 204) Antibody, Cat. No. 9101 7 Anti beta- Actin CST-8457 8 Anti-tubulin CST-2148 9 TransPass TM D2 Transfection Reagent 0,6 ml Cat no. M2554 S Αντίσωμα Phosphop44/42 (Thr202/Tyr204) Αντίσωμα έναντι της ανθρώπινης β- ακτίνης Αντίσωμα έναντι της ανθρώπινης τουμπουλίνης. Αντιδραστήριο επιμόλυνσης(transfe ction reagent) 10 Ρύγχη πιπεττών με φίλτρο 10µl σε κουτί 11 Ρύγχη πιπεττών με φίλτρο 20µl σε Πολυκλωνικό αντίσωμα που αναγνωρίζει την φωσφορυλιωμένη μορφή της κινάσης p44/42 MAPK (Thr202/Tyr204) σε κυτταρικές σειρές που προέρχονται από άνθρωπο, ποντίκι, αρουραίο, και πίθηκο. Κατάλληλο για ανοσοαποτύπωση, ανοσοφθορισμό και ανοσοκαθίζηση. Να αναγνωρίζει ειδικά την ανθρώπινη β-ακτίνη στα 45 kda. Να μπορεί να χρησιμοποιηθεί για Western και Ανοσοφθορισμό. Να έχει παραχθεί μετά από ανοσοποίηση κουνελιών με το κατάλληλο συνθετικό πεπτίδιο της β-ακτίνης. Να είναι έτοιμο για χρήση. Να επαρκεί για 10 western blots. Να αναγνωρίζει ειδικά την ανθρώπινη τουμπουλίνη στα 55 kda. Να μπορεί να χρησιμοποιηθεί για Western, Ανοσοϊστοχημεία και Ανοσοφθορισμό. Να έχει παραχθεί μετά από ανοσοποίηση κουνελιών με το κατάλληλο συνθετικό πεπτίδιο της ανθρώπινης α- και β- τουμπουλίνης. Να είναι έτοιμο για χρήση. Να επαρκεί για 10 western blots. Κατιονικό πολυμερές σχεδιασμένο για την επιμόλυνση πλασμιδιακού DNA σε πολλές κυτταρικές σειρές θηλαστικών, συμπεριλαμβανομένων και τις πρωτογενείς κυτταρικές σειρές. Να είναι αποτελεσματικό στη συνεπιμόλυνση πολλών πλασμιδίων. Να είναι αποτελεσματικό στις εξής κυτταρικές σειρές: COS, HEK293, HeLa, HepG2, MCF-7, MDA. Ρύγχη με φίλτρο 10µl συμβατά με τους περισσότερους τύπους πιπεττών. Να είναι ελεύθερα DNaσών, RNaσών και πυρετογόνων. Να είναι αποστειρωμένα με γ- ακτινοβολία. Να μπορούν να αποστειρωθούν στο αυτόκαυστο. Ρύγχη με φίλτρο 20µl συμβατά με τους περισσότερους τύπους 200 μl 1 100 μl 1 100 μl 1 600μl 1 1κουτί x96 τεμάχια 1κουτί x96 τεμάχια 10 10
κουτί 12 Ρύγχη πιπεττών με φίλτρο 200µl σε κουτί πιπεττών. Να είναι ελεύθερα DNaσών, RNaσών και πυρετογόνων. Να είναι αποστειρωμένα με γ- ακτινοβολία. Να μπορούν να αποστειρωθούν στο αυτόκαυστο. Ρύγχη με φίλτρο 200µl συμβατά με τους περισσότερους τύπους πιπεττών. Να είναι ελεύθερα DNaσών, RNaσών και πυρετογόνων. Να είναι αποστειρωμένα με γ- ακτινοβολία. Να μπορούν να αποστειρωθούν στο αυτόκαυστο. 1κουτί x96 τεμάχια 10 13 Μπλε ρύγχη πιπεττών 1000µl 14 Κίτρινα ρύγχη πιπεττών 200µl 15 Διάφανα ρύγχη όγκου 10μl Ρύγχη 1000µl συμβατά με πιπέττες τύπου Gilson. Ρύγχη 200µl συμβατά με πιπέττες τύπου Gilson. Διάφανα ρύγχη όγκου 10μl, συμβατά με πιπέττες τύπου Gilson. 250 τεμάχια 30 500 τεμάχια 30 1000 tips 4 16 PCR tubes 0.2mL με επίπεδο καπάκι, χρωματιστά. 17 Σωληνάκια τύπου eppendorf 1,5ml Σωληνάρια για PCR, όγκου 0,2 ml, με πολύ λεπτά τοιχώματα και με επίπεδο καπάκι. Να είναι απαλλαγμένα από DNase, RNase 1000 Tubes 1 Σωληνάκια τύπου eppendorf 1,5ml 500 τεμάχια 20 18 Τρυβλία Kυτταροκαλλιέργεια ς 19 6-well Tissue Culture Plates 20 12-well Tissue Culture Plates 21 Τρυβλία Petri 22 Κωνικά σωληνάκια 15ml Τρυβλία 100/20mm για κυτταροκαλλιέργειες, αποστειρωμένα 6-well Tissue Culture Plates, αποστειρωμένα με γ-ακτινοβολία, με καπάκι 12-well Tissue Culture Plates, αποστειρωμένα με γ-ακτινοβολία, με καπάκι Τρυβλία Petri, 94mm για μικροβιολογικές καλλιέργειες Κωνικά σωληνάκια πολυπροπυλενίου 15ml, αποστειρωμένα. 15 τεμάχια 60 1 τεμάχιο 200 1 τεμάχιο 200 20 τεμάχια 24 100 τεμάχια 5 23 Κωνικά σωληνάκια 50ml Κωνικά σωληνάκια πολυπροπυλενίου 50ml, αποστειρωμένα. 20 τεμάχια 20
24 Parafilm Μεμβράνη Parafilm 4 x125 Το μήκος τους να είναι περίπου 3,2cm. 25 Ορολογικές πιπέττες 5ml 26 Ορολογικές πιπέττες 10ml Αποστειρωμένες ορολογικές πιπέττες, 5ml Να είναι απαλλαγμένες από DNase, RNase, πυρετογόνους παράγοντες και βαρέα μέταλλα. Αποστειρωμένες ορολογικές πιπέττες, 10ml Να είναι απαλλαγμένες από DNase, RNase, πυρετογόνους παράγοντες και βαρέα μέταλλα. (50τεμ/συσκευασία) 27 Κυψελίδες 3ml Κυψελίδες φωτομέτρου 3ml, μίας χρήσης 28 Κυψελίδες 1,0ml Κυψελίδες φωτομέτρου 1.0 ml, μίας χρήσης 1 τεμάχιο 2 50 τεμάχια 10 50 τεμάχια 10 100 τεμάχια 10 100 τεμάχια 10 *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριμένης εταιρείας, μπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναμο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας Σημείωση: Στα υπολογιζόμενα κόστη κάθε ομάδας περιλαμβάνονται και τα έξοδα μεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισμού των ειδών
Ομάδα 8: Αντιδραστηρια πρωτεϊνικής ανάλυσης Προϋπολογισμός με ΦΠΑ: 3000 Τόπος προορισμού των ειδών: Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων Υπεύθυνος παραλαβής: Σπυρίδων Γεωργάτος, Καθηγητής, Συντονιστής του έργου α/α Ονομασία είδους και προδιαγραφές Μονάδα μέτρησης 1 anti-gfp antibodies, ROCHE 200µg 2 #11814460001 2 T4 DNA ligase, ROCHE #10481220001 100units 2 3 "Complete" protease inhibitor tablets, kit (3x20) 1 ROCHE #05056489001 4 DNAse-free RNAse, ROCHE 10.000units 1 #04716728001 5 Glass-bottom microwell cell culture case with 200pc 1 dishes 35mm, with 14mm coverslip, MATTEK #P35G-0-14-C 6 anti-asymmetric dimethylarginine 200µl 2 antibody (ASYM24), MILLIPORE #07-414 7 mouse anti-rabbit IgG light chain, HRP 0.5ml 1 conjugate, MILLIPORE MAB201P 8 Basic fibroblast growth factor (bfgf), 1mg 1 (R&D Systems # 4114-TC) 9 Fibronectin (solution), SIGMA # F1141-2mg 1 2MG 10 cryogenic vials 2ml, with external 500 1 thread, sterile, PP, NALGENE #5000-1020 11 Centrifuge bottles, 500ml, wide-mouth 4 2 with sealing caps Style 3141, NALGENE #3141-0500 Ποσότητα *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριμένης εταιρείας, μπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναμο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας
Ομάδα 9: Kits και ένζυμα Μοριακής Βιολογίας Προϋπολογισμός με ΦΠΑ: 2200 Τόπος προορισμού των ειδών: Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων Υπεύθυνος παραλαβής: Σπυρίδων Γεωργάτος, Καθηγητής, Συντονιστής του έργου α/α Ονομασία είδους και προδιαγραφές Μονάδα Ποσότητα μέτρησης 1 NucleoBond Xtra Midi kit, 50preps 1 MACHERY-NAGEL #740410.50 2 NucleoSpin RNA II kit, MACHERY-NAGEL 50preps 2 #740955.50 3 PrimeScript RT Reagent Kit, TAKARA # RR037A 200rx 2 4 dntp kit for PCR, 100mM each 4x40µmole 1 5 Restriction enzyme DpnI 1000units 1 6 Restriction enzyme NheI 2500units 1 7 Restriction enzyme NotI 500units 2 8 Oligonucleotides, cust. synthesis (around 25bp 1 20 each) 9 electroporation cuvettes 4mm, sterile 50 2 *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριμένης εταιρείας, μπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναμο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας
Ομάδα 10: Κυτταροκαλλιεργητικά υλικά Προϋπολογισμός με ΦΠΑ: 800 Τόπος προορισμού των ειδών: Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων Υπεύθυνος παραλαβής: Σπυρίδων Γεωργάτος, Καθηγητής, Συντονιστής του έργου α/α Ονομασία είδους και προδιαγραφές Μονάδα Ποσότητα μέτρησης 1 Cell culture medium DMEM (4.5g/l glucose, with L-glutamine) 500ml 40 2 Fetal calf serum for cell culture, EU-approved, Gibco #10270-106 or equivalent 500ml 10 *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριμένης εταιρείας, μπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναμο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας
Ομάδα 11: Χημικά αντιδραστήρια Προϋπολογισμός με ΦΠΑ: 300 Τόπος προορισμού των ειδών: Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων Υπεύθυνος παραλαβής: Σπυρίδων Γεωργάτος, Καθηγητής, Συντονιστής του έργου α/α Ονομασία είδους και Μονάδα μέτρησης Ποσότητα προδιαγραφές 1 denatured ethanol (with 1% MEK) 2.5l 6 2 absolute ethanol 2.5l 3 *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριμένης εταιρείας, μπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναμο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας
Ομάδα 12: Πλαστικά είδη εργαστηρίου γενικής χρήσεως Προϋπολογισμός με ΦΠΑ: 2000 Τόπος προορισμού των ειδών: Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων Υπεύθυνος παραλαβής: Σπυρίδων Γεωργάτος, Καθηγητής, Συντονιστής του έργου α/α Ονομασία είδους και προδιαγραφές Μονάδα Ποσότητα μέτρησης 1 5ml serological pipettes 500 2 2 10ml serological pipettes 500 2 3 100mm cell culture dishes 300 2 4 60mm cell culture dishes 500 2 5 pipette tips 200µl (yellow) 10.000 2 6 pipette tips 1000µl (blue) 5.000 2 7 pipette tips 5000µl, for Gilson P5000 250 2 8 1.5ml reaction tubes, "Eppendorf" type, PP 5.000 2 9 0.2ml PCR tubes (thin-wall, certified RNase 1.000 4 and DNase free, flat cap 10 15ml conical tubes, HD-PP, "Falcon" type, without 500 2 skirted base 11 50ml conical tubes, PP, "Falcon" type, 300 4 with skirted base 12 plastic storage box for 0.2ml PCR tubes, 12x12 places 1 20 *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριμένης εταιρείας, μπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναμο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας ΣΥΝΟΛΙΚΟΣ ΠΡΟΫΠΟΛΟΓΙΣΜΟΣ ΜΕ ΦΠΑ: 55.400,00 Τεχνικές πληροφορίες σχετικά με τον διαγωνισμό δίνονται, κατά τις εργάσιμες ημέρες και ώρες από τον Καθηγητή κ. Γεωργάτο Σπυρίδων, στο τηλέφωνο: 26510-07565