ΕΠΙΤΡΟΠΗ ΕΡΕΥΝΩΝ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟΥ ΙΩΑΝΝΙΝΩΝ ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΠΡΟ ΙΑΓΡΑΦΕΣ ΓΙΑ ΤΟ ΙΑΓΩΝΙΣΜΟ ΜΕ ΑΡΙΘ. ΠΡΩΤ /

Transcript

1 ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΠΡΟ ΙΑΓΡΑΦΕΣ ΓΙΑ ΤΟ ΙΑΓΩΝΙΣΜΟ ΜΕ ΑΡΙΘ. ΠΡΩΤ. 523/ Οµάδα : Χηµικά και αναλώσιµα γενικής χρήσης Προϋπολογισµός µε ΦΠΑ: 0.400,00 Τόπος προορισµού των ειδών: Πανεπιστήµιο Ιωαννίνων Υπεύθυνος παραλαβής: Ευστάθιος Φριλίγγος, Καθηγητής, Συντονιστής του έργου αα Ονοµασία είδους και προδιαγραφές* TWEEN 20 viscous liquid, Sigma P379 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών 5-Bromo-2 -deoxyuridine 99% (HPLC), Sigma B5002 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών EDTA dipotassium salt dihydrate, Sigma ED2P ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Albumin from bovine serum lyophilized powder, 96% (agarose gel electrophoresis), Sigma A4503 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Agarose low EEO (Agarose Standard), Applichem A24 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Tris base, for molecular biology, Fisher ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Developer Kodak GBX, Sigma P7042 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Fixer GBX Kodak, Sigma P767 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Toluene AR, Fisher ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Phenazine methosulfate 90% (UV), Sigma P9625 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Gel Loading Solution Type I, Sigma G7654 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών 2,5-Diphenyloxazole 99%, suitable for scintillation, Aldrich D20404 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών BCA Protein Assay Reagent A, Pierce ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών ιοξείδιο άνθρακα Ethanol absolute with MEK, Applichem A4930 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Xylenol Orange disodium salt for spectrophotometric determination of metal ions, Sigma ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Glutathione Sepharose 4FF, Amersham ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Gelatin from cold water fish skin BioReagent, solid, Sigma Μονάδα Ποσότητα µέτρησης 00ml 3 g 2 00g 2 50g 3 500g 2 kg 3 g 3 g 3 2,5lt 0 g 5ml 2 00g 2 500ml 3 kg 30 5lt 7 g 2 25ml 00g 2

2 αα Ονοµασία είδους και προδιαγραφές* G704 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Diethyl ether AR Acetone AR Formamide 99.5% (GC), BioReagent, for molecular biology, Sigma F9037 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών 2-Deoxy-D-glucose 98% (GC), crystalline, Sigma D8375 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Thiazolyl Blue Tetrazolium Bromide powder, BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, 97.5% (HPLC), Sigma M5655 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Diethyl pyrocarbonate 97% (NMR), Sigma D5758 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Tris Hydrochoride Molecular Biology Grade, Applichem A3452 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Acetic Acid glacial Tips 0µl, , για πιπέττα Orange ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Syringe filters 0,2µm, Whatman ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Syringe filters 0,45µm, Whatman ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Γάντια Latex Πιπέττες Pasteur 230mm, Isolab ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Cryovials ml, Greiner ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Cryovials 2ml, Greiner ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Cryovials 2ml, Greiner ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Σωληνάρια Universal, 30ml, Greiner 2070 ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Χαρτί επαγγελµατικό Γάντια νιτριλίου Χ-RAY Fuji Film, 3x8cm άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Gene Amp thin-walled Reaction tubes, Applied Biosystems M ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Dishes 90mm Parafilm 38m x 0cm Αναπλήρωση στήλης απιονισµού Zalion Μονάδα µέτρησης Ποσότητα 5lt 2 2,5lt 5 00ml g g 2 5ml kg 2,5lt Πακ/ Πακ/50 6 Πακ/50 6 Πακ/00 40 Πακ/ Πακ/00 5 Πακ/00 0 Πακ/00 0 Πακ/ x2,5kg 0 Πακ/00 20 Πακ/00 8 Πακ/ Πακ/480 5 Τεµ 5 Τεµ

3 αα Ονοµασία είδους και προδιαγραφές* Μονάδα Ποσότητα µέτρησης 43 Scintillation vials 20ml Πακ/ Ηθµοί GF/C, 47mm, Whatman ή άλλου οίκου, πάντα Πακ 2 όµως ίδιων προδιαγραφών 45 Protran BA85, 0.45µm, Whatman 04096, 30x30cm, ή Τεµ 2 άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών 46 Σωληνάρια κωνικά 0ml, αποστειρωµένα, Aptaca 009, ή Πακ/250 5 άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών 47 Cryoboxes 0x0 θέσεων Τεµ Φιαλίδια µε σταγονόµετρο 00g Πακ/ Φιαλίδια µε σταγονόµετρο 200g Πακ/ Weighing paper B-2, 4x4, Whatman ή άλλου οίκου, Πακ/500 πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών 5 Σύριγγα 50µl, Hamilton 705N, ή άλλου οίκου, πάντα Τεµ όµως ίδιων προδιαγραφών *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριµένης εταιρείας, µπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναµο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας Σηµείωση: Στα υπολογιζόµενα κόστη κάθε οµάδας περιλαµβάνονται και τα έξοδα µεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισµού των ειδών

4 Οµάδα 2: Ραδιενεργά υποστρώµατα Προϋπολογισµός µε ΦΠΑ: 5.464,00 Τόπος προορισµού των ειδών: Πανεπιστήµιο Ιωαννίνων Υπεύθυνος παραλαβής: Ευστάθιος Φριλίγγος, Καθηγητής, Συντονιστής του έργου αα Ονοµασία είδους* Προδιαγραφές* Ποσότητα [ 3 Η]Xanthine Xanthine, [8-3 H], HPLC purified, purity 97%, Sterile water solution, mci/ml, 3-0 Cimmol, M.W. 52. Σε συσκευασία mci 2 [ 3 H]Hypoxanthine Hypoxanthine, [2,8-3 H], HPLC purified, purity 97%, Sterile water solution, mci/ml, 0-30 Ci/mmol, M.W. 36. Σε συσκευασία mci 3 [ 3 H]Uracil Uracil, [5,6-3 H], HPLC purified, purity 97%, Sterile water solution, mci/ml, Ci/mmol, M.W. 2. Σε συσκευασία 250 µci 4 [ 3 H]Cytosine Cytosine, [5-3 H], HPLC purified, purity 97% Ethanol:water (2:98) solution, mci/ml, 0-20 Ci/mmol, M.W.. Σε συσκευασία 250 µci 5 [ 3 H]Adenine Adenine, [2,8-3 H], HPLC purified, purity 97% Ethanol:water (2:98) solution, mci/ml, Ci/mmol, M.W. 35. Σε συσκευασία 250 µci 6 [ 3 H]Guanine Guanine, [8-3 H], HPLC purified, purity 97% Ethanol:water (2:98) solution, 00 µci/ml, 5-5 Ci/mmol, M.W. 5. Σε συσκευασία 250 µci 7 [ 4 C] Uric acid Uric acid, [8-4 C], HPLC purified, purity 95% pure Solid, mci/mmol, M.W. 68. Σε συσκευασία 250 µci *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριµένης εταιρείας, µπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναµο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας Σηµείωση: Στα υπολογιζόµενα κόστη κάθε οµάδας περιλαµβάνονται και τα έξοδα µεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισµού των ειδών

5 Οµάδα 3: Είδη Μοριακής Βιολογίας Προϋπολογισµός µε ΦΠΑ: 3.270,00 Τόπος προορισµού των ειδών: Πανεπιστήµιο Ιωαννίνων Υπεύθυνος παραλαβής: Ευστάθιος Φριλίγγος, Καθηγητής, Συντονιστής του έργου αα Ονοµασία είδους* Προδιαγραφές* Ποσότητα High Fidelity High Fidelity polymerase, 00 units. polymerase, κατάλληλη και για µεγάλα τµήµατα DNA, 00 units Να έχει την µεγαλύτερη δυνατή πιστότητα σε σχέση µε την απλή Taq Να είναι κατάλληλη για δύσκολες περιοχές Να είναι κατάλληλη για ενίσχυση µεγάλων τµηµάτων (έως 5 Kb) Να είναι κατάλληλη για γρήγορες αντιδράσεις Η συσκευασία να περιλαµβάνει 5x High Fidelity Buffer with MgCl 2 5x High Fidelity GC Buffer with MgCl 2 25 mm MgCl 2 dntp Mix (0 mm each nucleotide) 2 Restriction Enzyme Σε συσκευασία των units. ApaI (8-20 units / µl) 3 Restriction Enzyme Σε συσκευασία των units BamHI (8-20 units / µl) 4 Restriction Enzyme Σε συσκευασία των units EcoRV (8-20 units / µl) 5 Alk. Phosphatase Σε συσκευασία των.000 units (calf intestine) (0-30 units / µl) 6 T4 DNA Ligase Σε συσκευασία των units (350 units / µl) (2.8 Weiss units/µl) 7 00bp δείκτης µοριακών βαρών DNA 8 Μη τοξική χρωστική νουκλεϊκών οξέων µε φασµατικά χαρακτηριστικά ανάλογα του βρωµιούχου αιθιδίου 00bp δείκτης µοριακών βαρών DNA Να περιέχει 2 µπάντες και να καλύπτει την περιοχή bp. Να περιλαµβάνει 2 µπάντες αναφοράς στα 500bp & 500bp. Να είναι έτοιµος προς χρήση για απευθείας φόρτωση στα gels (να περιλαµβάνει loading dye). Να είναι αρκετό για 00 minigels Να καθιστά δυνατή τη χρώση νουκλεϊκών οξεών σε πηκτώµατα αγαρόζης και ακρυλαµίδης. Να µην είναι µεταλλαξιγόνο. Να µην είναι κυτταροτοξικό. Να µην απαιτούνται ιδιαίτεροι χειρισµοί για την αποκοµιδή του. Να µην θεωρείται τοξικό απόβλητο (hazardous waste). Να είναι σταθερό σε θερµοκρασία δωµατίου. Να προσφέρεται σε συγκέντρωση Χ (ή µεγαλύτερη) σε υδατικό διάλυµα. Να µπορεί να χρησιµοποιηθεί για τη χρώση του πηκτώµατος είτε µε την ενσωµάτωση του σε αυτό κατά την παρασκευή του πριν την ηλεκτροφόρηση (precast gel stain) είτε µε τη χρώση του πηκτώµατος µέσω της εµβάπτισης σε διάλυµα της χρωστικής για µετά την ηλεκτροφόρηση precast είτε για (post gel staining). Να έχει τουλάχιστον την ίδια ευαισθησία µε το βρωµιούχο αιθίδιο.

6 9 Κιτ αποµόνωσης DNA από αντίδραση PCR ή πήκτωµα αγαρόζης/250 αντιδράσεις 0 Κιτ για γρήγορη αποµόνωση πλασµιδιακού DNA από αρχικό όγκο καλλιέργειας έως και 0ml (minipreps). Κιτ για αποµόνωση πλασµιδιακού DNA από αρχικό όγκο καλλιέργειας έως και 200ml (maxi preps). Να µπορεί να χρησιµοποιηθεί µε τον ίδιο εξοπλισµό (υπεριώδη πηγή διέγερσης, σύστηµα φωτογράφησης) που χρησιµοποιείται και το βρωµιούχο αιθίδιο. Καθαρισµός PCR προϊόντος και gel extraction να επιτυγχάνονται µε το ίδιο kit χρησιµοποιώντας το ίδιο buffer. Η διαδικασία να επιτυγχάνεται σε λιγότερο από 5 λεπτά. Να παρέχει υψηλή ανάκτηση DNA ακόµα και από πολύ µικρά κοµµάτια (>65 bp) Να επιτυγχάνεται πλήρης αποµάκρυνση των primers. Να είναι δυνατοί µικροί όγκοι έκλουσης (µικρότεροι από 20 µl) και µέχρι 00 µl. Να χρησιµοποιεί τεχνολογία Silica Membrane µε spin columns Να παρέχει DNA έτοιµο προς χρήση, κατάλληλο για κλωνοποίηση, sequencing, PCR, transformation, restriction analysis. Να είναι δυνατή η αποµόνωση ssdna και SDScontaining samples Να περιλαµβάνει διάλυµα δέσµευσης του DNA µε δείκτη ph για βέλτιστη απόδοση του kit. Να περιλαµβάνει Gel Extraction and PCR Clean Up κολόνες, buffers NTI, NT3, NE Για 250 αποµονώσεις Να χρησιµοποιεί τεχνολογία Silica Membrane µε spin columns. Να παρέχει DNA µε τυπική απόδοση έως και 40 µg. Ο όγκος έκλυσης να µην είναι µεγαλύτερος των 50µl. Να παρέχει DNA έτοιµο προς χρήση, κατάλληλο για κλωνοποίηση, sequencing, PCR,transformation, restriction analysis. Να περιλαµβάνει Plasmid κολόνες, collection tubes, RNase A,Elution Buffer AE, Wash Buffer A4, Wash Buffer AW, Neutralization Buffer A3, Lysis Buffer A2 Resuspension Buffer A Για 250 αποµονώσεις Η διαδικασία να επιτυγχάνεται µε χρωµατογραφία ιονανταλλαγής Η στήλη να είναι σχεδιασµένη έτσι ώστε η διαδικασία να µην διαρκεί περισσότερο από 30 min. Να περιλαµβάνεται φίλτρο ώστε το lysate να µπορεί να φορτωθεί απευθείας στην στήλη. Να επιτυγχάνεται µεγάλη ταχύτητα ροής. Τυπική απόδοση DNA: 000 µg Να παρέχει υψηλής καθαρότητας πλασµιδιακό DNA κατάλληλο και για transfection Να περιλαµβάνει στήλες µε ένθετο φίλτρο, buffers RES, LYS, NEU EQU, WASH, ELU, RNase A Για 0 αποµονώσεις *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριµένης εταιρείας, µπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναµο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας 3 kits 2 kits 2 kits Σηµείωση: Στα υπολογιζόµενα κόστη κάθε οµάδας περιλαµβάνονται και τα έξοδα µεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισµού των ειδών

7 Οµάδα 4: Πλαστικά και αντιδραστήρια γενικής χρήσης Προϋπολογισµός µε ΦΠΑ: 2.673,00 Τόπος προορισµού των ειδών: Ε.Κ.Ε.Φ.Ε. ηµόκριτος Υπεύθυνος παραλαβής: Βασιλική Σοφιανοπούλου, Ερευνήτρια Α, Μέλος της ΚΕΟ του έργου αα Ονοµασία είδους* Σωλήνες φυγοκέντρησης τύπου Eppendorf.5ml Περιγραφή και προδιαγραφές* Σωληνάρια µικροφυγοκέντρου µε ενσωµατωµένο καπάκι,5ml, DNase-free, RNase-free, human DNA-free, Nonpyrogenic, συσκευασία 500 τεµ/σακκούλα Συσκευασία 500 τεµ./ συσκ-σία Συνολική ποσότητα / αριθµός συσκευασιών 6 2 Σωλήνες φυγοκέντρησης τύπου Eppendorf 2ml PCR Tubes (0,2ml) ultrathin walls Tips για αυτοµατες πιπέτες τύπου Gilson µl Tips για αυτοµατες πιπέτες τύπου Gilson µl Τρυβλία Petri (9cm diameter) 7 Autoclavable tip boxes for blue tips (00-000µL) 8 Autoclavable tip boxes for yellow tips (20-200µL) 9 Autoclavable tip boxes for white tips (0,-0µL) 0 Cryoboxes (plastic) Σωληνάρια µικροφυγοκέντρου µε ενσωµατωµένο καπάκι 2,2ML, Free of detectable DNase, RNase, human DNA, Non-Pyrogenic, συσκευασία 500 τεµ/σακκούλα Σωληνάρια PCR, από πολυπροπυλένιο, διαφανή, 0,2 ML, µε επίπεδο καπάκι, διάφορα χρώµατα, συσκευασία 000 τεµ./σακκούλα, Dnase free, RNAse free, human DNA free, non pyrogenic Ρύγχη πλαστικά, κίτρινα, για πιπέτα GILSON, 0-200µl, 500 τεµ./ συσκ-σία Ρύγχη πλαστικά, µπλε, για πιπέτα GILSON, µl, 250 τεµ./ συσκ-σία Τρυβλία πετρί, µε εγκοπές, διαστάσεων 94,0/5 MM, 20 τεµ/συσκ, machine sterilized Rack for blue tips Rack for yellow tips Rack with Micro Pipette tips, clear, 0µl Ideally suited for Gilson P2, P0 (length: 28.8mm) Volume 0.5-0µl Graduated, Natural colour Πλαστικά κουτιά πολυπροπυλενίου ύψους 50mm, διαστάσεων 50 x 30 x 30 mm, 8 θέσεων, διάφορα χρώµατα, µε διαφανές καπάκι και αρίθµηση θέσεων πάνω στο 500 τεµ./ συσκ-σία.000 τεµ./ συσκ-σία 500 τεµ./ συσκ-σία 250 τεµ./ συσκ-σία τεµ./ συσκ-σία 00 τεµ. 4 τεµ. 4 3 τεµ. 3 τεµ./ συσκσία 0

8 αα Ονοµασία είδους* Περιγραφή και προδιαγραφές* Συσκευασία Συνολική ποσότητα / αριθµός συσκευασιών καπάκι Serological Pipettes, sterile, Πιπέτες πλαστικές, αποστειρωµένες 0 ML, µε συνθετικό υδρόφοβο φίλτρο από ινώδες 50 τεµ./ συσκ-σία 2 0 ml υλικό (όχι βαµβάκι), βαθµονοµηµένες (/0), συσκευασµένες ανά µία, Dnase free, RNAse free, human DNA free, non pyrogenic, non cytotoxic, συσκευασία 50 τεµ. 2 Yeast extract Yeast extract της BioChemica ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών 500g 3 Casein Panc. Peptone Peptone from casein (pancreatic digest) 500g 4 NaCl Sodium chloride p. A. 5kg 5 6 KH 2 PO 4 Potassium dihydrogen phosphate p. A. CuCl 2 2H 2 O Copper(II) chloride dihydrate pure kg 500g 7 Trisodium citrate 2H 2 O Sodium citrate dihydrate Molecular biology grade kg 8 Glycine min %, της BioChemica, ή Glycine άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών 9 D-Sorbitol D(-)-Sorbitol pure Ph. Eur., NF 20 D(+)Glucose D(+)-Glucose anhydrous pure Ph. Eur. kg kg 5 kg 2 D(-)Fructose D(-)-Fructose BioChemica ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών 500g 22 D(+)Sucrose D(+)-Sucrose BioChemica ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών 23 Uracil Uracil BioChemica, Assay (HPLC) min. 99 % ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών 24 Uridine Uridine BioChemica Assay (HPLC) min. 99 % ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών 25 Acrylamide Acrylamide 2K Standard grade, extrapure 26 Phenol equilibrated Phenol equilibrated 5 kg 00g 25g 500g 500 ml

9 αα Ονοµασία είδους* 27 Triton-X00 28 BSA blotting grade Περιγραφή και προδιαγραφές* Triton X-00 BioChemica ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Albumin Fraction V (ph 7.0) from bovine serum Min. 98% Συσκευασία Συνολική ποσότητα / αριθµός συσκευασιών L 500g 29 Myriocin Myriocin BioChemica from Mycelia sterilia Assay (TLC) approx. 97 % ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών 30 Polyethylenglycol (biochemical grade) Polyethylene glycol 6000 BioChemica ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών 5 mg kg *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριµένης εταιρείας, µπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναµο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας Σηµείωση: Στα υπολογιζόµενα κόστη κάθε οµάδας περιλαµβάνονται και τα έξοδα µεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισµού των ειδών

10 Οµάδα 5: Ραδιενεργά υποστρώµατα Προϋπολογισµός µε ΦΠΑ: 662,00 Τόπος προορισµού των ειδών: Ε.Κ.Ε.Φ.Ε. ηµόκριτος Υπεύθυνος παραλαβής: Βασιλική Σοφιανοπούλου, Ερευνήτρια Α, Μέλος της ΚΕΟ του έργου αα Ονοµασία είδους* Προδιαγραφές* Ποσότητα [ 3 H]Proline L-Proline, [2,3,4,5-3 H], HPLC purified, purity 97% Ethanol:water (2:98) solution, 5 mci/ml, Ci/mmol Σε συσκευασία mci 2 [α- 32 P]dATP Deoxyadenocine 5 -[α- 32 P] triphosphate, triethylammonium salt, Σε έγχρωµο διάλυµα µε σταθεροποιητικό, 3000 Ci / mmol, 0 mci / ml Σε συσκευασία 500 µci *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριµένης εταιρείας, µπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναµο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας Σηµείωση: Στα υπολογιζόµενα κόστη κάθε οµάδας περιλαµβάνονται και τα έξοδα µεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισµού των ειδών

11 Οµάδα 6: Είδη Μοριακής Βιολογίας Προϋπολογισµός µε ΦΠΑ: 0.665,00 Τόπος προορισµού των ειδών: Ε.Κ.Ε.Φ.Ε. ηµόκριτος Υπεύθυνος παραλαβής: Βασιλική Σοφιανοπούλου, Ερευνήτρια Α, Μέλος της ΚΕΟ του έργου αα Ονοµασία είδους* Προδιαγραφές* Ποσότητα Εκκινητές PCR και Σύνθεση σε scale 0nmol, καθαρισµένα µε 5000 b sequencing (oligos), HPLC purified HPLC. (συνολικός αριθµός βάσεων, 5000) 2 Ανάγνωση αλληλουχιών DNA Ανάγνωση αλληλουχιών DNA (αριθµός αντιδράσεων-αναγνώσεων) 200 αντιδράσεις 3 High Fidelity polymerase, κατάλληλη και για µεγάλα τµήµατα DNA, 00 units High Fidelity polymerase, 00 units Να έχει την µεγαλύτερη δυνατή πιστότητα σε σχέση µε την απλή Taq Να είναι κατάλληλη για δύσκολες περιοχές Να είναι κατάλληλη για ενίσχυση µεγάλων τµηµάτων (έως 5 Kb) Να είναι κατάλληλη για γρήγορες αντιδράσεις Η συσκευασία να περιλαµβάνει 5x High Fidelity Buffer with MgCl 2 5x High Fidelity GC Buffer with MgCl 2 25 mm MgCl 2 dntp Mix (0 mm each nucleotide) 3 συσκ. 4 Ανασυνδυασµένη Taq DNA Πολυµεράση 5 Restriction Enzyme BamHI 6 Restriction Enzyme BglII 7 Restriction Enzyme ClaI 8 Restriction Enzyme DpnI 9 Restriction Enzyme EcoRI 0 Restriction Enzyme HindIII Restriction Enzyme KpnI 2 Restriction Enzyme NcoI 3 Restriction Enzyme NotI 4 Restriction Enzyme PstI Taq DNA Πολυµεράση, ανασυνδυασµένη, από θερµόφιλο βακτηριακό στέλεχος, Thermus aquaticus strain. Να έχει συγκέντρωση 5 units/µl. Να συνοδεύεται από 0Χ Reaction buffer C χωρίς Mg 2+ και 0Χ Reaction buffer D χωρίς Mg 2+ και Mg 2+ 25mM Σε συσκευασία των 500 units Σε συσκευασία των units (8-20 units / µl) Σε συσκευασία των units (4-2 units / µl) Σε συσκευασία των.000 units (4-2 units / µl) Σε συσκευασία των.000 units (0 units / µl) Σε συσκευασία των units (8-20 units / µl) Σε συσκευασία των units (8-20 units / µl) Σε συσκευασία των units (4-2 units / µl) Σε συσκευασία των 500 units (4-2 units / µl) Σε συσκευασία των 500 units (4-2 units / µl) Σε συσκευασία των units (8-20 units / µl) 2 συσκ. 2 συσκ. 2 συσκ 2 συσκ 2 συσκ 2 συσκ

12 5 Restriction Enzyme SacI 6 Restriction Enzyme SacII 7 Restriction Enzyme SalI 8 Restriction Enzyme SmaI 9 Restriction Enzyme SpeI 20 Restriction Enzyme StuI 2 Restriction Enzyme XbaI 22 Restriction Enzyme XhoI Σε συσκευασία των units (4-2 units / µl) Σε συσκευασία των.000 units (8-20 units / µl) Σε συσκευασία των units (8-20 units / µl) Σε συσκευασία των units (4-2 units / µl) Σε συσκευασία των 300 units (4-2 units / µl) Σε συσκευασία των 500 units (4-2 units / µl) Σε συσκευασία των units (8-20 units / µl) Σε συσκευασία των units (4-2 units / µl) 23 Alk. Phosphatase (calf intestine) Σε συσκευασία των.000 units (0-30 units / µl) 24 T4 DNA Ligase Σε συσκευασία των units (350 units / µl) (2.8 Weiss units/µl) 25 00bp δείκτης 00bp δείκτης µοριακών βαρών DNA µοριακών βαρών Να περιέχει 2 µπάντες και να καλύπτει την DNA περιοχή bp. Να περιλαµβάνει 2 µπάντες αναφοράς στα 500bp & 500bp. Να είναι έτοιµος προς χρήση για απευθείας φόρτωση στα gels (να περιλαµβάνει loading dye). Να είναι αρκετό για 00 minigels 26 kb δείκτης µοριακών βαρών DNA kb δείκτης µοριακών βαρών DNA Να περιέχει 3 µπάντες και να καλύπτει την περιοχή bp. Να περιλαµβάνει 2 µπάντες αναφοράς στα Kb & 3Kb. Να είναι γνωστή η ποσότητα του DNA σε κάθε µπάντα (0.5µg ανά φόρτωση) ώστε να επιτυγχάνεται ποσοτικοποίηση DNA των δειγµάτων. Να είναι έτοιµος προς χρήση για απευθείας φόρτωση στα gels (να περιλαµβάνει loading dye). Να είναι αρκετό για 500 minigels (250µg/ 2500µl) 2 συσκ 27 dntps set 00mM, 4x40 µmol 28 Ρετρονεκτίνη Αντιδραστήριο ρετρονεκτίνης (ανασυνδυασµένο κλάσµα αθρώπινης φιµπρονεκτίνης) για υψηλής απόδοσης γονιδιωµατική µεταφορά σε κύτταρα στόχους. Να είναι καταλληλο για αιµοποιητικά κύτταρα και άλλες κυτταρικές σειρές. Να µπορεί να χρησιµοποιηθεί σε ανθρώπινα βλαστοκύτταρα. Να µην απαιτεί πολυβρένιο για την επιµόλυνση τον κυττάρων µε τον ιό. Να παρέχεται σε συσκευασία 0,5mg

13 29 Κιτ αποµόνωσης DNA από αντίδραση PCR ή πήκτωµα αγαρόζης 30 Κιτ αποµόνωσης DNA από αντίδραση PCR ή πήκτωµα αγαρόζης/250 αντιδράσεις 3 Κιτ για γρήγορη αποµόνωση πλασµιδιακού DNA από αρχικό όγκο καλλιέργειας έως και 0ml (minipreps). Καθαρισµός PCR προϊόντος και gel extraction να επιτυγχάνονται µε το ίδιο kit χρησιµοποιώντας το ίδιο buffer. Η διαδικασία να επιτυγχάνεται σε λιγότερο από 5 λεπτά. Να παρέχει υψηλή ανάκτηση DNA ακόµα και από πολύ µικρά κοµµάτια (>65 bp) Να επιτυγχάνεται πλήρης αποµάκρυνση των primers. Να είναι δυνατοί µικροί όγκοι έκλουσης (µικρότεροι από 20 µl) και µέχρι 00 µl. Να χρησιµοποιεί τεχνολογία Silica Membrane µε spin columns Να παρέχει DNA έτοιµο προς χρήση, κατάλληλο για κλωνοποίηση, sequencing, PCR, transformation, restriction analysis. Να είναι δυνατή η αποµόνωση ssdna και SDScontaining samples Να περιλαµβάνει διάλυµα δέσµευσης του DNA µε δείκτη ph για βέλτιστη απόδοση του kit. Να περιλαµβάνει Gel Extraction and PCR Clean Up κολόνες, buffers NTI, NT3, NE Για 50 αποµονώσεις Καθαρισµός PCR προϊόντος και gel extraction να επιτυγχάνονται µε το ίδιο kit χρησιµοποιώντας το ίδιο buffer. Η διαδικασία να επιτυγχάνεται σε λιγότερο από 5 λεπτά. Να παρέχει υψηλή ανάκτηση DNA ακόµα και από πολύ µικρά κοµµάτια (>65 bp) Να επιτυγχάνεται πλήρης αποµάκρυνση των primers. Να είναι δυνατοί µικροί όγκοι έκλουσης (µικρότεροι από 20 µl) και µέχρι 00 µl. Να χρησιµοποιεί τεχνολογία Silica Membrane µε spin columns Να παρέχει DNA έτοιµο προς χρήση, κατάλληλο για κλωνοποίηση, sequencing, PCR, transformation, restriction analysis. Να είναι δυνατή η αποµόνωση ssdna και SDScontaining samples Να περιλαµβάνει διάλυµα δέσµευσης του DNA µε δείκτη ph για βέλτιστη απόδοση του kit. Να περιλαµβάνει Gel Extraction and PCR Clean Up κολόνες, buffers NTI, NT3, NE Για 250 αποµονώσεις Να χρησιµοποιεί τεχνολογία Silica Membrane µε spin columns. Να παρέχει DNA µε τυπική απόδοση έως και 40 µg. Ο όγκος έκλυσης να µην είναι µεγαλύτερος των 50µl. Να παρέχει DNA έτοιµο προς χρήση, κατάλληλο για κλωνοποίηση, sequencing, PCR,transformation, restriction analysis. Να περιλαµβάνει Plasmid κολόνες, collection tubes, RNase A,Elution Buffer AE, Wash Buffer A4, Wash Buffer AW, Neutralization Buffer A3, Lysis Buffer A2 Resuspension Buffer kit kit kit

14 A Για 50 αποµονώσεις *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριµένης εταιρείας, µπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναµο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας Σηµείωση: Στα υπολογιζόµενα κόστη κάθε οµάδας περιλαµβάνονται και τα έξοδα µεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισµού των ειδών

15 Οµάδα 7: Είδη Ανοσολογίας, Καθαρισµού και Ανάλυσης Πρωτεϊνών Προϋπολογισµός µε ΦΠΑ: 80,00 Τόπος προορισµού των ειδών: Ε.Κ.Ε.Φ.Ε. ηµόκριτος Υπεύθυνος παραλαβής: Βασιλική Σοφιανοπούλου, Ερευνήτρια Α, Μέλος της ΚΕΟ του έργου αα Ονοµασία είδους* Προδιαγραφές* Ποσότητα Blotting Paper Να έχει πάχος 0,36mm, migration (Klemm): mm/0min Να έχει διαστάσεις 30x 60cm Σε πακέτα των 00 φύλλων 2 είκτης µοριακών βαρών πρωτεϊνών έγχρωµος Να έχει έγχρωµες ζώνες µε τρία διαφορετικά χρώµατα και να καλύπτει περιοχή 0-80 kda. Να περιλαµβάνει 2 ζώνες αναφοράς διαφορετικών χρωµάτων στα 30 και 75kda Να δίνει καθαρές, έντονες ζώνες. Να είναι έτοιµος προς χρήση για απευθείας φόρτωση στα gels (να περιλαµβάνει loading dye). Σε ποσότητα 500 µl (να επαρκεί για 00 minigels) 3 Aureobasidin A Aureobasidium pullulans R06 Σε συσκευασία του mg 4 Phytosphingosine Σε λυοφιλιωµένη µορφή, Σε συσκευασία του ml *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριµένης εταιρείας, µπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναµο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας Σηµείωση: Στα υπολογιζόµενα κόστη κάθε οµάδας περιλαµβάνονται και τα έξοδα µεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισµού των ειδών 2

16 Οµάδα 8: Πλαστικά και αντιδραστήρια γενικής χρήσης Προϋπολογισµός µε ΦΠΑ:.247,00 Τόπος προορισµού των ειδών: Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήµιο Αθηνών Υπεύθυνος παραλαβής: Γεώργιος ιαλλινάς, Αναπληρωτής Καθηγητής, Μέλος της ΚΕΟ του έργου αα Ονοµασία είδους* Σωλήνες φυγοκέντρησης τύπου Eppendorf.5ml 2 Σωλήνες φυγοκέντρησης τύπου Eppendorf 2ml PCR Tubes (0,2ml) ultrathin walls Tips για αυτοµατες πιπέτες τύπου Gilson µl Tips για αυτοµατες πιπέτες τύπου Gilson µl Tips για αυτοµατες πιπέτες τύπου Gilson 0,-0µl Conical test tubes (5 ml) Conical test tubes (50 ml) Περιγραφή και προδιαγραφές* Σωληνάρια µικροφυγοκέντρου µε ενσωµατωµένο καπάκι,5ml, DNasefree, RNase-free, human DNA-free, Non-pyrogenic, συσκευασία 500 τεµ/σακκούλα Σωληνάρια µικροφυγοκέντρου µε ενσωµατωµένο καπάκι 2,2ML, Free of detectable DNase, RNase, human DNA, Non-Pyrogenic, συσκευασία 500 τεµ/σακκούλα Σωληνάρια PCR, από πολυπροπυλένιο, διαφανή, 0,2 ML, µε επίπεδο καπάκι, διάφορα χρώµατα, συσκευασία 000 τεµ./σακκούλα, Dnase free, RNAse free, human DNA free, non pyrogenic Ρύγχη πλαστικά, κίτρινα, για πιπέτα GILSON, 0-200µl, 500 τεµ./ συσκ-σία Ρύγχη πλαστικά, µπλε, για πιπέτα GILSON, µl, 250 τεµ./ συσκσία Ρύγχη πλαστικά, άσπρα, διαβαθµισµένα για πιπέτα GILSON P-2,P-0, 0,5-0µl, autoclavable, 000 τεµ./ συσκ-σία Σωληνάρια πολυπροπυλενίου 5 ML, διαστάσεων 7,0/20 MM, τύπου falcon, µε βιδωτό πώµα, αποστειρωµένα, Dnase/RNAse/human DNA free, non pyrogenic, non cytotoxic, συσκ. 00 τεµ/σακούλα Σωληνάρια πολυπροπυλενίου 50 ML, διαστάσεων 30,0/5 MM, τύπου falcon, µε βιδωτό πώµα, αποστειρωµένα, Dnase free, RNAse free, human DNA free, non pyrogenic, non cytotoxic, συσκ. 20 τεµαχίων/σακούλα Συνολική Συσκευασία ποσότητα / αριθµός συσκευασιών 500 τεµ./ συσκ-σία τεµ./ συσκ-σία τεµ./ συσκ-σία 500 τεµ./ συσκ-σία τεµ./ συσκ-σία τεµ./ συσκ-σία 2 00 τεµ./ συσκ-σία 5 20 τεµ./ συσκ-σία 25

17 αα 9 0 Ονοµασία είδους* MgSO 4 7H 2 O Rubidium chloride Trisodium citrate 2H 2 O 2 Phenol equilibrated 3 Dodecyl-β,Dmaltoside (DDM) Περιγραφή και προδιαγραφές* Magnesium sulfate heptahydrate p. A. Rubidium chloride, της BioChemica ή άλλου οίκου, πάντα όµως ίδιων προδιαγραφών Συσκευασία Συνολική ποσότητα / αριθµός συσκευασιών kg 0 g Sodium citrate dihydrate Molecular biology grade kg Phenol equilibrated n-dodecyl-β-d-maltoside, Crystallography grade, Assay (HPLC) min % 500 ml g *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριµένης εταιρείας, µπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναµο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας Σηµείωση: Στα υπολογιζόµενα κόστη κάθε οµάδας περιλαµβάνονται και τα έξοδα µεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισµού των ειδών

18 Οµάδα 9: Ραδιενεργά υποστρώµατα Προϋπολογισµός µε ΦΠΑ: 2.454,00 Τόπος προορισµού των ειδών: Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήµιο Αθηνών Υπεύθυνος παραλαβής: Γεώργιος ιαλλινάς, Αναπληρωτής Καθηγητής, Μέλος της ΚΕΟ του έργου αα Ονοµασία είδους* Προδιαγραφές* [ 3 Η]Xanthine Xanthine, [8-3 H], HPLC purified, purity 97%, Sterile water solution, mci/ml, 3-0 Cimmol, M.W. 52. Σε συσκευασία mci 2 [ 3 H]Hypoxanthine Hypoxanthine, [2,8-3 H], HPLC purified, purity 97%, Sterile water solution, mci/ml, 0-30 Ci/mmol, M.W. 36. Σε συσκευασία mci Ποσότητα *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριµένης εταιρείας, µπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναµο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας Σηµείωση: Στα υπολογιζόµενα κόστη κάθε οµάδας περιλαµβάνονται και τα έξοδα µεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισµού των ειδών

19 Οµάδα 0: Είδη Μοριακής Βιολογίας Προϋπολογισµός µε ΦΠΑ:.680,00 Τόπος προορισµού των ειδών: Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήµιο Αθηνών Υπεύθυνος παραλαβής: Γεώργιος ιαλλινάς, Αναπληρωτής Καθηγητής, Μέλος της ΚΕΟ του έργου αα Ονοµασία είδους* Προδιαγραφές* Ποσότητα Εκκινητές PCR (oligos), Σύνθεση σε scale 0nmol, desalted. (συνολικός 000b desalted αριθµός βάσεων, 500) 2 Ανασυνδυασµένη Taq DNA Πολυµεράση Taq DNA Πολυµεράση, ανασυνδυασµένη, από θερµόφιλο βακτηριακό στέλεχος, Thermus aquaticus strain. Να έχει συγκέντρωση 5 units/µl. 2 συσκ. Να συνοδεύεται από 0Χ Reaction buffer C χωρίς Mg 2+ και 0Χ Reaction buffer D χωρίς Mg 2+ και Mg 2+ 25mM 3 Μεµονωµένες κολώνες για αποµόνωση πλασµιδιακού DNA από αρχικό όγκο καλλιέργειας έως και 0ml (minipreps). Σε συσκευασία των 500 units Spin columns µε τεχνολογία Silica Membrane Σε συσκευασία των 50 τεµαχίων 4 Restriction Enzyme DpnI Σε συσκευασία των.000 units (0 units / µl) 5 Restriction Enzyme EcoRI Σε συσκευασία των units (8-20 units / µl) 6 Restriction Enzyme Σε συσκευασία των units HindIII (8-20 units / µl) 7 Restriction Enzyme NcoI Σε συσκευασία των 500 units (4-2 units / µl) 8 Restriction Enzyme NdeI Σε συσκευασία των 400 units (4-2 units / µl) 9 Restriction Enzyme NotI Σε συσκευασία των 500 units (4-2 units / µl) 0 Restriction Enzyme SacII Σε συσκευασία των.000 units (8-20 units / µl) Restriction Enzyme SalI Σε συσκευασία των units (8-20 units / µl) 2 Restriction Enzyme SpeI Σε συσκευασία των 300 units (4-2 units / µl) 3 Restriction Enzyme XbaI Σε συσκευασία των units (8-20 units / µl) 4 Restriction Enzyme XhoI Σε συσκευασία των units (4-2 units / µl) 5 Alk. Phosphatase (calf Σε συσκευασία των.000 units intestine) (0-30 units / µl) 6 T4 DNA Ligase Σε συσκευασία των units (350 units / µl) (2.8 Weiss units/µl)

20 7 kb δείκτης µοριακών βαρών DNA kb δείκτης µοριακών βαρών DNA Να περιέχει 3 µπάντες και να καλύπτει την περιοχή bp. Να περιλαµβάνει 2 µπάντες αναφοράς στα Kb & 3Kb. Να είναι γνωστή η ποσότητα του DNA σε κάθε µπάντα (0.5µg ανά φόρτωση) ώστε να επιτυγχάνεται ποσοτικοποίηση DNA των δειγµάτων. Να είναι έτοιµος προς χρήση για απευθείας φόρτωση στα gels (να περιλαµβάνει loading dye). Να είναι αρκετό για 500 minigels (250µg/ 2500µl) 8 dntps set 00mM, 4x40 µmol *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριµένης εταιρείας, µπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναµο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας Σηµείωση: Στα υπολογιζόµενα κόστη κάθε οµάδας περιλαµβάνονται και τα έξοδα µεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισµού των ειδών

21 Οµάδα : Είδη Ανοσολογίας, Καθαρισµού και Ανάλυσης Πρωτεϊνών Προϋπολογισµός µε ΦΠΑ: 990,00 Τόπος προορισµού των ειδών: Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήµιο Αθηνών Υπεύθυνος παραλαβής: Γεώργιος ιαλλινάς, Αναπληρωτής Καθηγητής, Μέλος της ΚΕΟ του έργου αα Ονοµασία είδους* Προδιαγραφές* Ποσότητα ιάλυµα ιάλυµα χηµειοφωταύγειας µε HRP (LumiSensor χηµειοφωταύγειας µε HRP Chemiluminescent HRP Substrate ), κατάλληλο για Western Blot. Να είναι αρκετό για 5000 cm 2 µεµβράνης. Να έχει υψηλή ευαισθησία, υψηλή ένταση, µεγάλη διάρκεια και να δίνει χαµηλό background. Να περιέχει 2 αντιδραστήρια Reagent A και Reagent B για ανίχνευση HRP σήµατος. Σε συσκευασία των 2 x 50ml. 2 Blotting Paper Να έχει πάχος 0,36mm, migration (Klemm): mm/0min Να έχει διαστάσεις 30x 60cm Σε πακέτα των 00 φύλλων 3 είκτης µοριακών βαρών πρωτεϊνών έγχρωµος Να έχει έγχρωµες ζώνες µε τρία διαφορετικά χρώµατα και να καλύπτει περιοχή 0-80 kda. Να περιλαµβάνει 2 ζώνες αναφοράς διαφορετικών χρωµάτων στα 30 και 75kda Να δίνει καθαρές, έντονες ζώνες. Να είναι έτοιµος προς χρήση για απευθείας φόρτωση στα gels (να περιλαµβάνει loading dye). Σε ποσότητα 500 µl (να επαρκεί για 00 minigels) 4 SynaptoRed C2 Σε συσκευασία των 5 mg *οπουδήποτε στον παραπάνω πίνακα αναφέρεται είδος συγκεκριµένης εταιρείας, µπορεί να προσφερθεί και να γίνει αποδεκτό ισοδύναµο προϊόν οποιασδήποτε άλλης εταιρείας Σηµείωση: Στα υπολογιζόµενα κόστη κάθε οµάδας περιλαµβάνονται και τα έξοδα µεταφοράς στον εκάστοτε τόπο προορισµού των ειδών