ΕΛΛΗΝΙΚΟ ΙΝΣΤΙΤΟΥΤΟ ΠΑΣΤΕΡ ΔΙΑΓΝΩΣΤΙΚΟ ΤΜΗΜΑ ΕΞΕΤΑΣΕΙΣ ΚΑΙ ΒΙΟΛΟΓΙΚΑ ΔΕΙΓΜΑΤΑ

Transcript

1 ΕΛΛΗΝΙΚΟ ΙΝΣΤΙΤΟΥΤΟ ΠΑΣΤΕΡ ΔΙΑΓΝΩΣΤΙΚΟ ΤΜΗΜΑ ΕΞΕΤΑΣΕΙΣ ΚΑΙ ΒΙΟΛΟΓΙΚΑ ΔΕΙΓΜΑΤΑ

2 ΠΙΝΑΚΑΣ 1. ΕΞΕΤΑΣΕΙΣ ΚΑΙ ΜΕΘΟΔΟΙ Παθογόνο/Συντομογραφία Chikungunya ιός Chikungunya ιός Ebola ιός IL-28B Marburg ιός Merkell cell DNA Parecho-ιοί RNA Polyoma-ιός BK DNA Polyoma-ιός JC DNA Polyoma-ιός KI DNA Polyoma-ιός WU DNA Zika ιός Zika ιός Zika ιός RNA Αδενοϊοί DNA Αδενοϊοί Αδενοϊοί Αμοιβάδος ολικά αντισ Αναπ/κός συγ/κός ιός Αναπ/κός συγ/κός ιός Αναπ/κός συγ/κός ιός RNA Αναπ/κός συγ/κός ιός τυποποίηση Ανεμευλογιά ιός DNA Ανεμευλογιάς ιός Ανεμευλογιάς ιός Βρουκέλλα Βρουκέλλα Wright Γρίπη A ιός H3 RNA Γρίπη A ιός H5 RNA Γρίπη A ιός Γρίπη A ιός Γρίπη A ιός N1 RNA Γρίπη A ιός N2 RNA Γρίπη A ιός RNA Γρίπη Α ιός (πανδημική και εποχική) Γρίπη Α ιός H1 RNA Γρίπη Β ιός RNA Γρίπη Β ιός Γρίπη ιός Β τυποποίηση Δάγκειος ιός Δάγκειος ιός IgΜ Δάγκειος ιός RNA Δυτικού Νείλου ιός Δυτικού Νείλου ιός IgΜ Δυτικού Νείλου ιός RNA Εκο ιοί Εκο ιοί Ελικοβακτηρίδιο αντιβιόγραμμα Ελικοβακτηρίδιο Κ/Α Ελικοβακτηρίδιο πυλωρού DNA Μέθοδος nested RT-PCR multiplex nested RT-PCR Αντίδραση Wright Αναστολή αιμοσυγκολλήσεως Αναστολή αιμοσυγκολλήσεως Αναστολή αιμοσυγκολλήσεως E-test ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΑ PCR Σελίδα 2 από 12

3 Παθογόνο/Συντομογραφία Εντεροϊοί RNA Εντεροϊοί καλλιέργεια Εντεροϊοί τυποποίηση Εντεροϊοί φυλογένεση Επστάϊν-Μπαρρ EA Επστάϊν-Μπαρρ EBNA Επστάϊν-Μπαρρ VCA Επστάϊν-Μπαρρ VCA Επστάϊν-Μπαρρ ιός DNA Ερλίχια canis ολικά αντισ Έρπης 6 Έρπης 6 Έρπης 6 ιός, Τύπων Α+Β DNA Έρπης ιός 1 DNA Έρπης ιός 1 Έρπης ιός 1 και 2 Έρπης ιός 2 DNA Έρπης ιός 2 Έρπης ιός τύπου 7 DNA Έρπης ιός τύπου 8 DNA Ερυθρά ιός Ερυθρά ιός avidity Ερυθρά ιός Ερυθρά ιός RNA Ηπατίτις C ιός γονότυπος Ηπατίτις C ιός ποιοτικό/ποσοτικό Ιλαρά Ιλαρά Ιλαρά ιός RNA Ιλαρά ιός τυποποίηση Κοξάκι ιοί B1-B5 Κοξιέλλα burnetti Κοξιέλλα burnetti Κορόνα ιοί (229E, OC43, NL63, HKU1) RNA Κοροναϊός MERS Κορυνοβακτ διφθερίτιδος ολικά αντισ Κυτταρομεγαλοϊός Κυτταρομεγαλοϊός avidity Κυτταρομεγαλοϊός Κυτταρομεγαλοϊός ιικό φορτίο Λεγεωνέλλα ολικά Λεγεωνέλλα πνευμονίας τύπου 1 DNA Λεϊσμάνια ανθρώπου ολικά Λεϊσμάνια ζώου DNA Λεϊσμάνια ζώου Λεπτόσπιρα interrogans Λεπτόσπιρα interrogans Λιστέρια Λιστέρια Μεταπνευμονοϊός RNA Μπαρτονέλλα henselae Μπαρτονέλλα henselae Μπαρτονέλλα quintana Μέθοδος ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΑ ΟΡΟΕΞΟΥΔΕΤΕΡΩΣΗ Φυλογένεση INNO Lipa Φυλογένεση ΟΡΟΕΞΟΥΔΕΤΕΡΩΣΗ (multipl) RT-PCR Σελίδα 3 από 12

4 Παθογόνο/Συντομογραφία Μπαρτονέλλα quintana Μπόκα ιός DNA Μπορέλλια burgdorferi WB Μπορτετέλλα κοκκύτου Μπορτετέλλα κοκκύτου Μυκόπλασμα hominis DNA Μυκόπλασμα πνευμονίας DNA Μυκόπλασμα πνευμονίας Μυκόπλασμα πνευμονίας Ουρεάπλασμα urealyticum DNA Παραγρίπη ιοί Παραγρίπη ιοί IgΑ Παραγρίππη ιοί 1,2,3 RNA Παρβοϊός Β19 DNA Παρβοϊός Β19 Παρβοϊός Β19 Παρωτίτις ιός Παρωτίτις ιός Παρωτίτιτις ιός RNA Πλασμώδιο ελονοσίας DNA Πλασμώδιο ελονοσίας ολικά Πόλιο-ιοί P1-P3 ολικά Ρικέτσια conori Ρικέττσια conori Ρικέττσια mooseri Ρικέττσια mooseri Ρινοϊοί RNA Τoξόπλασμα Τέτανική τοξίνη ολικά Τοξόπλασμα avidity Τοξόπλασμα DNA Τοξόπλασμα IgA Τοξόπλασμα Τοξόπλασμα ζώου ολικά Τοξόπλασμα καλλιέργεια Υερσίνια IgA Υερσίνια Χλαμύδια pneumoniae Χλαμύδια pneumoniae Χλαμύδια psittaci Χλαμύδια psittaci Χλαμύδια trachomatis DNA Χλαμύδια trachomatis Χλαμύδια trachomatis Χλαμύδια πνευμονίας DNA Μέθοδος WESTERN BLOT multiplex RT- PCR ΟΡΟΕΞΟΥΔΕΤΕΡΩΣΗ nested RT-PCR Ενοφθαλμισμός ποντικών WESTERN BLOT WESTERN BLOT Σελίδα 4 από 12

5 ΠΙΝΑΚΑΣ 2. ΕΞΕΤΑΣΕΙΣ ΚΑΙ ΠΡΟΤΕΙΝΟΜΕΝΑ ΒΙΟΛΟΓΙΚΑ ΔΕΙΓΜΑΤΑ Παθογόνο / Εξέταση Chikungunya ιός Chikungunya ιός Ebola ιός IL-28B Marburg ιός Merkell cell DNA Parecho-ιοί RNA Polyoma-ιός BK DNA Polyoma-ιός JC DNA Polyoma-ιός KI DNA Polyoma-ιός WU DNA Zika ιός Zika ιός Zika ιός RNA Αδενοϊοί DNA Αδενοϊοί Αδενοϊοί Αμοιβάδος ολικά αντισ Αναπ/κός συγ/κός ιός Αναπ/κός συγ/κός ιός Αναπ/κός συγ/κός ιός RNA Αναπ/κός συγ/κός ιός τυποποίηση Ανεμευλογιά ιός DNA Ανεμευλογιάς ιός Ανεμευλογιάς ιός Βρουκέλλα Βρουκέλλα Wright Γρίπη A ιός H3 RNA

6 Παθογόνο / Εξέταση Γρίπη A ιός H5 RNA Γρίπη A ιός Γρίπη A ιός Γρίπη A ιός N1 RNA Γρίπη A ιός N2 RNA Γρίπη A ιός RNA Γρίπη Α ιός (πανδημική και εποχική) Γρίπη Α ιός H1 RNA Γρίπη Β ιός RNA Γρίπη Β ιός Γρίπη ιός Β τυποποίηση Δάγκειος ιός Δάγκειος ιός IgΜ Δάγκειος ιός RNA Δυτικού Νείλου ιός Δυτικού Νείλου ιός IgΜ Δυτικού Νείλου ιός RNA Εκο ιοί Εκο ιοί Ελικοβακτηρίδιο αντιβιόγραμμα Ελικοβακτηρίδιο Κ/Α Ελικοβακτηρίδιο πυλωρού DNA Εντεροϊοί RNA Εντεροϊοί καλλιέργεια Εντεροϊοί τυποποίηση Εντεροϊοί φυλογένεση Επστάϊν-Μπαρρ EA Επστάϊν-Μπαρρ EBNA Επστάϊν-Μπαρρ VCA Επστάϊν-Μπαρρ VCA Σελίδα 6 από 12 Ημ/νία τελευταίας ενημέρωσης :

7 Παθογόνο / Εξέταση Επστάϊν-Μπαρρ ιός DNA Ερλίχια canis ολικά αντισ Έρπης 6 Έρπης 6 Έρπης 6 ιός, Τύπων Α+Β DNA Έρπης ιός 1 DNA Έρπης ιός 1 Έρπης ιός 1 και 2 Έρπης ιός 2 DNA Έρπης ιός 2 Έρπης ιός τύπου 7 DNA Έρπης ιός τύπου 8 DNA Ερυθρά ιός Ερυθρά ιός avidity Ερυθρά ιός Ερυθρά ιός RNA Ηπατίτις C ιός γονότυπος Ηπατίτις C ιός ποιοτικό/ποσοτικό Ιλαρά Ιλαρά Ιλαρά ιός RNA Ιλαρά ιός τυποποίηση Κοξάκι ιοί B1-B5 Κοξιέλλα burnetti Κοξιέλλα burnetti Κορόνα ιοί (229E, OC43, NL63, HKU1) RNA Κοροναϊός MERS Κορυνοβακτ διφθερίτιδος ολικά αντισ Κυτταρομεγαλοϊός Σελίδα 7 από 12 Ημ/νία τελευταίας ενημέρωσης :

8 Παθογόνο / Εξέταση Κυτταρομεγαλοϊός avidity Κυτταρομεγαλοϊός Κυτταρομεγαλοϊός ιικό φορτίο Λεγεωνέλλα ολικά Λεγεωνέλλα πνευμονίας τύπου 1 DNA Λεϊσμάνια ανθρώπου ολικά Λεϊσμάνια DNA Λεϊσμάνια Λεπτόσπιρα interrogans Λεπτόσπιρα interrogans Λιστέρια Λιστέρια Μεταπνευμονοϊός RNA Μπαρτονέλλα henselae Μπαρτονέλλα henselae Μπαρτονέλλα quintana Μπαρτονέλλα quintana Μπόκα ιός DNA Μπορέλλια burgdorferi WB Μπορτετέλλα κοκκύτου Μπορτετέλλα κοκκύτου Μυκόπλασμα hominis DNA Μυκόπλασμα πνευμονίας DNA Μυκόπλασμα πνευμονίας Σελίδα 8 από 12 Ημ/νία τελευταίας ενημέρωσης :

9 Παθογόνο / Εξέταση Μυκόπλασμα πνευμονίας Ουρεάπλασμα urealyticum DNA Παραγρίπη ιοί Παραγρίπη ιοί IgΑ Παραγρίππη ιοί 1,2,3 RNA Παρβοϊός Β19 DNA Παρβοϊός Β19 Παρβοϊός Β19 Παρωτίτις ιός Παρωτίτις ιός Παρωτίτιτις ιός RNA Πλασμώδιο ελονοσίας DNA Πλασμώδιο ελονοσίας ολικά Πόλιο-ιοί P1-P3 ολικά Ρικέτσια conori Ρικέττσια conori Ρικέττσια mooseri Ρικέττσια mooseri Ρινοϊοί RNA Τoξόπλασμα Τέτανική τοξίνη ολικά Τοξόπλασμα avidity Τοξόπλασμα DNA Τοξόπλασμα IgA Τοξόπλασμα Τοξόπλασμα ζώου ολικά Τοξόπλασμα καλλιέργεια Υερσίνια IgA Σελίδα 9 από 12 Ημ/νία τελευταίας ενημέρωσης :

10 Παθογόνο / Εξέταση Υερσίνια Χλαμύδια pneumoniae Χλαμύδια pneumoniae Χλαμύδια psittaci Χλαμύδια psittaci Χλαμύδια trachomatis DNA Χλαμύδια trachomatis Χλαμύδια trachomatis Χλαμύδια πνευμονίας DNA ΟΔΗΓΟΣ ΔΕΙΓΜΑΤΩΝ Α/Α ΔΕΙΓΜΑ Α/Α ΔΕΙΓΜΑ 1 Αίμα (ολικό) 14 Ορθού επίχρισμα 2 Αμνιακό υγρό 15 Ορός 3 Βιοψία βλεννογόνου στομάχου 16 Ούρα 4 Βιοψία ιστού 17 Οφθαλμικό επίχρισμα 5 Βρογχικές εκκρίσεις 18 Οφθαλμικό υγρό 6 Βρογχικό έκπλυμα 19 Περικαρδιακό υγρό 7 Δερματική βλάβη 20 Πτύελα 8 ΕΝΥ 21 Ρινικό έκπλυμα 9 Επίχρισμα βλεννογόνου στόματος 22 Ρινικό επίχρισμα 10 Καλλιέργημα ιού 23 Υαλοειδές υγρό 11 Κολπικό επίχρισμα 24 Φαρυγγικό έκπλυμα 12 Κόπρανα 25 Φαρυγγικό επίχρισμα 13 Μητρικό γάλα Σελίδα 10 από 12 Ημ/νία τελευταίας ενημέρωσης :

11 ΠΙΝΑΚΑΣ 3. ΣΥΝΘΗΚΕΣ ΛΗΨΕΩΣ, ΑΠΟΘΗΚΕΥΣΗΣ ΚΑΙ ΜΕΤΑΦΟΡΑΣ ΒΙΟΛΟΓΙΚΩΝ ΔΕΙΓΜΑΤΩΝ Α/Α ΔΕΙΓΜΑ ΕΝΔΕΙΚΤΙΚΗ ΕΛΑΧΙΣΤΗ ΠΟΣΟΤΗΤΑ ΦΙΑΛΙΔΙΟ ΛΗΨΗΣ 1 Αίμα (ολικό) 2ml Φιαλίδιο BD VacutainerK3E15% 0,054ml 2 Αμνιακό υγρό 2ml 3 Βιοψία βλεννογόνου στομάχου ΠΡΟΕΤΟΙΜΑΣΙΑ ΑΣΘΕΝΟΥΣ Νηστεία 8 ώρες πριν τη λήψη ΠΡΟΫΠΟΘΕΣΕΙΣ ΛΗΨΗΣ ΔΕΙΓΜΑΤΟΣ ΣΥΝΘΗΚΕΣ ΜΕΤΑΦΟΡΑΣ Θερμ/σία δωμ. ΑΠΟΘΗΚΕΥΣΗ ΜΕΧΡΙ ΤΗ ΜΕΤΑΦΟΡΑ Η μεταφορά πρέπει να είναι ΑΜΕΣΗ Εξαρτάται από τον ιατρό 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 10mg Θειογλυκολικό Εξαρτάται από τον ιατρό 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 4 Βιοψία ιστού 10mg Δοχείο με 5ml Φυσιολογικό ορό Εξαρτάται από τον ιατρό 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 5 Βρογχικές εκκρίσεις Δοχείο με 5ml Φυσιολογικό ορό Καμία Όχι αιματηρές 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 6 Βρογχικό έκπλυμα GLY-medium, Ref.Number Καμία Όχι αιματηρό 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 7 Δερματική βλάβη GLY-medium, Ref.Number Καμία 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 8 ΕΝΥ 2ml 9 Επίχρισμα βλεννογόνου στόματος Εξαρτάται από τον ιατρό Όχι αιματηρό 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα GLY-medium, Ref.Number Καμία 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 10 Καλλιέργημα ιού Μη εφαρμόσιμο 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 11 Κολπικό επίχρισμα GLY-medium, Ref.Number Εξαρτάται από τον ιατρό 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 12 Κόπρανα 2gr Κενό δοχείο Εξαρτάται από τον ιατρό 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 13 Μητρικό γάλα 2ml Εξαρτάται από τον ιατρό 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 14 Ορθού επίχρισμα GLY-medium, Ref.Number Καμία 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 15 Ορός 2ml-5ml Νηστεία 8 ώρες πριν τη λήψη Όχι λιπαιμικός ή αιματηρός 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 16 Ούρα 10ml Κενό δοχείο Εξαρτάται από τον ιατρό 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 17 Οφθαλμικό επίχρισμα 18 Οφθαλμικό υγρό 1ml 19 Περικαρδιακό υγρό 2ml 20 Πτύελα 2ml GLY-medium, Ref.Number Καμία 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα Καμία 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα Εξαρτάται από τον ιατρό Όχι αιματηρό 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα Καμία 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα Σελίδα 11 από 12 Ημ/νία τελευταίας ενημέρωσης :

12 Α/Α ΔΕΙΓΜΑ ΕΝΔΕΙΚΤΙΚΗ ΕΛΑΧΙΣΤΗ ΠΟΣΟΤΗΤΑ ΦΙΑΛΙΔΙΟ ΛΗΨΗΣ ΠΡΟΕΤΟΙΜΑΣΙΑ ΑΣΘΕΝΟΥΣ ΠΡΟΫΠΟΘΕΣΕΙΣ ΛΗΨΗΣ ΔΕΙΓΜΑΤΟΣ ΣΥΝΘΗΚΕΣ ΜΕΤΑΦΟΡΑΣ ΑΠΟΘΗΚΕΥΣΗ ΜΕΧΡΙ ΤΗ ΜΕΤΑΦΟΡΑ 21 Ρινικό έκπλυμα Δοχείο με 5ml Φυσιολογικό ορό Καμία 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 22 Ρινικό επίχρισμα GLY-medium, Ref.Number Καμία 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα 23 Υαλοειδές υγρό 0.2ml Σύριγγα λήψεως Εξαρτάται από τον ιατρό 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα Φαρυγγικό έκπλυμα Φαρυγγικό επίχρισμα GLY-medium, Ref.Number Καμία 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα GLY-medium, Ref.Number Καμία 2 C-8 C 2 C-8 C μέχρι δύο 24ωρα Σελίδα 12 από 12 Ημ/νία τελευταίας ενημέρωσης :