ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΟ KΩΣΤΑ TΡΙΑΝΤΑΦΥΛΛΟΠΟΥΛΟΥ

ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΟ KΩΣΤΑ TΡΙΑΝΤΑΦΥΛΛΟΠΟΥΛΟΥ ΠΡΟΣΩΠΙΚΕΣ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΕΣ Ιδιότητα: Λέκτορας στην Γονιδιακή Τεχνολογία. Διεύθυνση: Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών, 75 Iερά Οδός Τηλέφωνο: 2105294447 Φαξ 2105294442 e-mail: ktrianta@aua.gr ΣΠΟΥΔΕΣ ΚΑΙ ΣΤΑΔΙΟΔΡΟΜΙΑ Ο ΚΤ έλαβε το πτυχίο του το 1985, με βαθμό Λίαν Καλώς απο το Γεωπονικό Πανεπιστήμιο της Αθήνας, με την υψηλότερη βαθμολογία του έτους. Το ίδιο έτος, έλαβε υποτροφία για μεταπτυχιακές σπουδές στο Ινστιτούτο Μοριακής Βιολογίας & Βιοτεχνολογίας του Πανεπιστήμιο της Κρήτης (1985-1986). Το επόμενο έτος, έλαβε επίσης, υποτροφία με τον υψηλότερο βαθμό από το Εθνικό Κέντρο Έρευνας Φυσικών Επιστημών «Δημόκριτος», για να πραγματοποιήσει έρευνα σε επίπεδο διδακτορικού PhD (Φεβρουαρίος 1987). Υπέβαλε και έλαβε το διδακτορικό του από το τμήμα Κυτταρικής και Μοριακής βιολογίας του πανεπιστημίου Πατρών (το 1994), με άριστα (10/10) από την 7/μελή εξεταστική επιτροπή. Τίτλος PhD: Φάσμα δράσης της μεταγραφής του Cab γονιδίου κατά την στθεροποίησή του στο θυλακοειδές. Απο το 1994, ήταν Ερευνητικός Συνεργάτης στο Imperial College London, το University College London και Kings College London, στο Ηνωμένο Βασίλειο. Έχει κάνει διαλέξεις και ήταν εργαστηριακός βοηθός από την αρχή της σταδιοδρομίας του, διδάσκοντας γενετική, μοριακή γενετική και τα πρακτικά στην βιοχημεία κατά τη διάρκεια των μεταπτυχιακών του, στην Ιατρική Σχολή του Πανεπιστημίου Κρήτης (1985-86). Λέκτορας διδασκαλίας στην γονιδιακή θεραπεία και επί ειδικών θεμάτων (topics) μοριακής γενετικής στους φοιτητές ιατρικής, της ιατρικής Σχολής του Kings College London. Επίσης στη σχολή των βιοϊατρικών επιστημών, στο ίδιο κολλέγιο, υπήρξε υπεύθυνος για την εργαστηριακή πρακτική κατάρτιση των φοιτητών σε βασικές τεχνικές μοριακής βιολογίας. 1

Το 2007 του απονεμήθηκε υποτροφία ως έμπειρου επιστήμονα απο το ευρωπαϊκό πρόγραμμα Marie Curie στα πλαίσια του 7 ου δια-ευρωπαϊκού ερευνητικού προγράμματος (FP6), μεταξύ αυτών, της Ουγγαρίας, Μ. Βρεττανίας και Σουηδίας, όπου παρουσίασε και την ερευνητική του εργασία. Το 2008 έλαβε το εναλλακτικό ακαδημαϊκό βραβείο προγράμματος πρωτοβουλία Ανακάλυψης (alternative Academic Discovery Initiative project Award) από την Βιοτεχνολογική Εταιρεία GlaxoSmithKline (GSK) σε συνεργασία με το Imperial College London, για την παροχή άριστης έρευνας και διαχείρισης ερευνητικού προγράμματος.. Υπεύθυνος ερευνητικής ομάδας έρευνας του οξειδωτικού stress σε συνδυασμό με την φλεγμονή και την δημιουργία ζωϊκών μοντέλων ασθενειών για την μοριακή και λειτουργική τους ανάλυση (molecular dissection of disease & animal modeling). Συνεργάτης της GSK ώς προ-κλινικός μελετητής/εκτιμητής υποψηφίων φαρμάκων. Έχει συμμετάσχει σε πολλές επιστημονικές συνεδριάσεις και συμπόσια, διασκέψεις με τις σχετικές παρουσιάσεις και έχει οργανώσει πολλές επιστημονικές λέσχες (journal clubs). Έχει συμμετάσχει σε διάφορες κριτικές επιτροπές και επιτροπές συνέντευξης και έχει επιθεωρήσει (reviewer) επιστημονικά άρθρα σε διεθνή επιστημονικά περιοδικά όπως Clinical & Experimental Rheumatology και πρόσφατα μεταξύ αυτών στην Γονιδιωματική (Genomics) και Βιοτεχνολογία, του Small Ruminant Research, Elsevier. Θέση Λέκτορα με τίτλο ειδίκευσης, την γονιδιακή τεχνολογία, στο τμήμα Ζωικής Επιστήμης και Υδατοκαλλιεργειών του Γεωπονικού Πανεπιστημίου της Αθήνας από τον Νοέμβριο του 2009. ΜΕΘΟΔΟΙ ΚΑΙ ΓΕΝΙΚΑ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΕΝΔΙΑΦΕΡΟΝΤΑ Γενικά Μοριακή και κυτταρική βιολογία, βιοχημεία/βιοτεχνολογία. Xαρακτηρισμός, έκφραση και ρύθμιση γονιδίων, κλωνοποίηση, πρωτεϊνική έκφραση με έμφαση στη γενετική αλλά και το ανοσοβιολογία των θηλαστικών. Μοριακοί μηχανισμοί στη φυσιολογική ή μη κατάσταση. Γονιδιακά συστήματα που αφορούν μονογονιδιακά και πολυπαραγοντικά γνωρίσματα. Κληρονομικές ιδιότητες μη ελεγχόμενες απο το DNA. Eπιγενετικοί μηχανισμοί. Ειδικά Συγκριτική γονιδιωματική στα εκτρεφόμενα ζώα σε σύγκριση με το ανθρώπινο ανάλογο. Μεταγραφικό γένωμα της κωδικοποιούμενων και μη- κωδικοποιούμενων RNAs, στα διάφορα (εκτρεφόμενα) ζώα. Εφαρμογές επόμενης γενιάς αλληλούχισης σε συγκριτική γονιδιωματική. Επιγονιδίωμα και μελέτες χρωματίνης στα κύτταρα των αγροτικών ζώων. 2

Η βιολογία του και ο χαρακτηρισμός των γονιδίων που (θα) εμπλέκονται στην λιπογένεση στα μυρηκαστικά (κλωνοποίηση γονιδίων της λιπογένεσης του Ovis aries) και άλλα είδη, όπως επίσης και η ρύθμισή τους γενικότερα. Διερεύνηση των μεταγραφικών και πρωτεϊνικών μηχανισμών που ενορχηστρώνουν την λιπογένεση / λιπογένεση μεταξύ των ειδών. Διαφοροποίηση του γενετικού (πολυμορφισμοί) και πρωτεϊνικού προφίλ (proteomic profile) των αγροτικών ζώων και εν γένει των θηλαστικών σε σχέσει με το δυναμικό των φυσιολογικών ιδιαίτεροτήτων των παραγωγικών χαρακτηριστικών των, τους διάφορους μηχανισμούς ελέγχου των γονιδίων που εμπλέκονται/αναζητούνται, σε συνδυασμό με τα επιγενετικά χαρακτηριστικά που τα συνοδεύουν. Μελέτη και χαρακτηρισμός γονιδιακών προϊόντων που προκαλούνται -ή ελέγχονται απο το στρες- (βιοδείκτες), σε συνδυασμό με τους ανοσολογικούς (και μή), μηχανισμούς ανθετικότητας, σε συνάρτηση της γενετικής παραλλακτικότητας των ζώων. Μηχανισμοί εσωτερικής ανοσίας (Innate immunity). Οι επιδράσεις των παρασιτικών νόσων και της φλεγμονής ή κάθε είδους στρες, στο παραγωγικό δυναμικό και την ευμάρεια των αγροτικών ζώων, σε συνάρτηση του γενετικού τους προφίλ. Βιοτεχνολογικές εφαρμογές στην αγροτική και ζωϊκή παραγωγή. Πειραματικές προσεγγίσεις σε translational research (εφαρμογές) στην ζωϊκή επιστήμη, συμπεριλαμβανομένων των υδατοκαλλιεργειών για την βελτίωση της ζωϊκής παραγωγής, αλλά και της υγιεινής τους. Ερευνα για την επακριβή εφαρμογή των βέλτιστων συνθηκών παραγωγής ζωϊκής προέλευσης, με την βοήθεια της βιο-και νανοτεχνολογίας. ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ (2011-2015) Ευρωπαϊκό (δικτυωμένων χωρών) ερευνητικό πρόγραμμα στην γονιδιωματική βιολογία του ευρωπαϊκού κουνελιού. Πηγή Χρηματοδότησης: Ευρωπαϊκός οργανισμός για την επιστήμη (European Science Foundation). (2008-2009) Συνεργάτης ερευνητής στο Imperial College London, συν-χρηματοδοτούμενος από Glaxo Smith Kline (GSK), σχετικά με το Ρόλο της MAP-Κινάση της φωσφατάσης-1 3

(mkp-1) στην ανταπόκριση στα κορτικοστεροεϊδή, κατά το οξειδωτικό στρές και την αλλεργική φλεγμονή. (2007-2009) Συνεργάτης ερευνητής χρηματοδοτούμενος από Glaxo Smith Kline (GSK), Stevenage, UK, για την μελέτη νέων αναστολέων στις αυτοάνοσες ανοσολογικές ασθένειες, σε συνεργασία με το Imperial College London. (2004-2005) Ερευνητής στο Kings College London χρηματοδοτούμενο απο Wellcome Trust, για την επιγενετική ρύθμιση των γονιδίων ιντερλευκίνης -4 και -13 του ανθρώπου κατά την κυτταρική διαφοροποίηση. Επίσης, συνεργάτης ερευνητής, μέλος της ερευνητικής επιτροπής και συμμετέχων του ερευνητικού προγράμματος χρηματοδοτούμενο απο τον οργανισμό Aσθμα UK για την μελέτη της έκφρασης και ρύθμισης των γονιδίων που ελέγχουν τους υποδοχείς των λευκοτριενίων του ανθρώπου (LTC4) και το ρόλος τους στους ευαίσθητους και μη, ασθματικούς ασθενείς, στην χορήγηση ασπιρίνης. (1999-2003). Συνεργάτης ερευνητής στο Kings College London υπό την χορηγεία του βρετανικού χρηματοδοτικού οργανισμού για την καταπολέμηση της μυϊκής δυστροφίας (MDCUK) σχετικό με τη λειτουργική ανάλυση του ανθρώπινου γονιδιακού τόπου της δεσμίνης (Desmin) στα διαγονιδιακά ποντίκια, και τον χαρακτηρισμό νέων DNA ρυθμιστικών στοιχείων. (1994-1997) Συνεργάτης ερευνητής στο Imperial College London, Ινστιτούτο Ρευματολογίας Kennedy, στο προγράμμα γονιδιακής θεραπείας για την σκλήρυνση κατα πλάκας και της ρευματοειδούς αρθρίτιδας, χρηματοδοτούμενα απο την Εταιρεία Σκλήρυνσης κατά Πλάκας του Ηνωμένου Βασιλείου και Βόρειας Ιρλανδίας και την Εταιρεία Έρευνας για την Aρθρίτιδα, με την χρήση γενετικά τροποποιημένων ρετροιϊκών ή πλασμιδιακών φορέων και γονιδίων των ανασταλτικών κυτοκινών ή αναστολέων των κυτοκινών. ΥΠΟΤΡΟΦΙΕΣ ΚΑΙ ΒΡΑΒΕΙΑ (2008-9). Βραβείο Εναλλακτικής Πρωτοβουλίας Ακαδημαϊκής Ανακάλυψης χορηγούμενο από την Glaxo Smith Kline, σε συνεργασία με το Imperial College του Λονδίνου, για την διαχείριση και τα παραδοτέα του ερευνητικού έργου. (2007-8). Yποτροφία βραβείο Μαρίας Κιουρί για πεπειραμένους Επιστήμονες RTN από την Ευρωπαϊκή Κοινότητα (Framework Project-FP7) γιά να συμμετάσχω σε Ευρωπαϊκό δικτυακό ερευνητικό πρόγραμμα (network) στον τομέα της γονιδιωματικής έρευνας για την 4

ρευματοειδή αρθρίτιδα σε συνεργασία του Semmelweis University, Τμήμα Γενετικής, Βιολογίας Κυττάρου &-Ανοσοβιολογίας, Βουδαπέστη, Ουγγαρίας του Ηνωμένου Βασιλείου και της Σουηδίας. (1987-1992). Πρώτος επιτυχών εθνικής υποτροφίας του έτους 1987 κατόπιν πανελλήνιου γραπτού διαγωνισμού και συνέντευξης, χορηγειθήσα για έρευνα σε επίπεδο διδακτορικού από το Ινστιτούτο Βιολογίας, Εθνικό Κέντρο Έρευνας Φυσικών Επιστημών "Δημόκριτος", Αγία Παρασκευή, Αττική, Ελλάδα. Η Διδακτορική διατριβή απονεμήθηκε από το Πανεπιστήμιο Πατρών. Τίτλος διδακτορικής διατριβής: Φάσμα δράσης της μεταγραφής του Cab γονιδίου κατά την σταθεροποίησή του στο θυλακοειδές. (1985-6). Υποτροφία χορηγειθήσα κατόπιν πανελλήνιου γραπτού διαγωνισμού και συνέντευξης για μεταπτυχιακές σπουδές στο Ινστιτούτο Μοριακής Βιολογίας & Βιοτεχνολογίας του Πανεπιστημίου Κρήτης. ΔΙΔΑΣΚΑΛΙΕΣ ΚΑΙ ΑΛΛΕΣ ΣΧΕΤΙΚΕΣ ΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΗΤΕΣ Διδάσκων και οργανωτής του μαθήματος βιοτεχνολογία ζωϊκής παραγωγής, σε συνδυασμό με την εισαγωγή στην γονιδιακή τεχνολογία, συνοδευομένων μετά των εργαστηριακών ασκήσεων και εφαρμογών στην ζωϊκή παραγωγή του 4 ου έτους, του κλάδου Ζωϊκής παραγωγής, του εργαστηρίου Γενικής και Ειδικής Ζωοτεχνίας, στο Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών. ΜΕΛΟΣ ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΩΝ ΕΤΑΙΡΕΙΩΝ Μέλος Βρετανικής Εταιρείας Ανοσολογίας, Μέλος Επιστημονικής Λέσχης του Λονδίνου για την Μελέτη της Χρωματίνης, Μέλος Βρετανικής Εταιρείας Βιοχημείας, Ένωση Ελλήνων Βιολόγων, Γεωτεχνικό Επιμελητήριο Ελλάδος (ΓΕΩΤΕΕ.) ΟΛΙΚΟΣ ΑΡΙΘΜΟΣ ΕΤΕΡΟΑΝΑΦΟΡΩΝ 379 (αθροισμα συνολικών αναφορών ) 5

ΔΕΙΚΤΗΣ (HIRSCH) H-INDEX: 8 ΕΠΙΛΕΓΜΕΝΕΣ ΔΗΜΟΣΙΕΥΣΕΙΣ 1) P. E. Simitzis, E. Kalogeraki, M. Goliomytis, M. A. Charismiadou, K. Triantaphyllopoulos, A. Ayoutanti, K. Niforou, A. L. Hager-Theodorides and S. G. Deligiorgis (2012). Impact of Stocking Density on Broilers Growth Performance, Meat Characteristics, Behavioural Components, Physiological and Oxidative Stress Indicators. British Poultry Science. Br Poult Sci. 53(6):721-30. 2) Paul A Kirkham, Gaetano Caramori, Paolo Casolari, Alberto A Papi, Matt Edwards, Betty Shamji, Kostas Triantaphyllopoulos, Farhana Hussain, Mariona Pinart, Younis Khan, Laurie Stevens, Peter J Barnes, Kian F Chung and Ian M Adcock. (2011). Oxidative stressinduced autoantibodies to carbonyl-modified self-protein correlate with severity of COPD. Am J Respir Crit Care Med. 184:796-802. 3) Kostas Triantaphyllopoulos, Farhana Hussain, Mariona Pinart, Min Zhang, Feng Li, Ian Adcock, Paul Kirkham, Jie Zhu and Kian Fan Chung (2011). A model of chronic inflammation and pulmonary emphysema after multiple ozone exposures in mice Am. J. Physiol. Lung Cell Mol Physiol. Feb 25. [Epub ahead of print]. 4) Li F, Zhang M, Hussain F, Triantaphyllopoulos K, Clark AR, Bhavsar PK, Zhou X, Chung KF (2011) Inhibition of p38-mapk-dependent bronchial contraction after ozone by corticosteroids. Eur Respir J. Aug 6. [Epub ahead of print]. 5) Triantaphyllopoulos K, Madden L, Rioja I, Essex D, Buckton J, Malhotra R, Ray K, Binks M, Paleolog EM. (2010). In vitro target validation and in vivo efficacy of p38 MAP kinase inhibition in established chronic collagen-induced arthritis model: a pre-clinical study. Clin Exp Rheumatol. 28:176-85. 6) Samantha Santangelo, David J. Cousins, Kostas Triantaphyllopoulos and Dontcho Z. Staynov (2009). Chromatin structure and DNA methylation of the IL-4 gene in human T(H)2 cells. Chromosome Res., 17:485-96 6

7) Jennifer LY Tam, Kostas Triantaphyllopoulos, Helen Todd, Selina Raguz, Ton de Wit, Jennifer E. Morgan, Terence A. Partridge, Eleni Makrinou, Frank Grosveld and Michael Antoniou (2006). The human desmin locus: gene organisation and LCR-mediated transcriptional control. Genomics 87, 733-746. 8) Chernajovsky, Y., Dreja, H., Triantaphyllopoulos, K. and Gould, D.J. (2003) Interferon b gene therapy for the treatment of arthritis. In Methods in Molecular Biology (vol 215): Cytokines and Colony Stimulating Factors methods and protocols. Eds. D. Korholz and W. Kiess, Humana Press, Totowa, NJ. pp. 171-180. 9) J. L. Croxford, K. Triantaphyllopoulos, R. Neve, M. Feldmann, Y. Chernajovsky and D. Baker (2000). Gene therapy for Chronic Relapsing Experimental Allergic Encephalomyelitis using Cells Expressing a Novel Soluble p75 Dimeric TNF receptor. J.Immunol. 164, 2776-2781. 10) K. A. Triantaphyllopoulos, H. Tailor, R. Williams and Y. Chernajovsky (1999). Amelioration of collagen-induced arthritis and suppression of IFN, IL-12 and TNF production by IFN β gene therapy Arthritis & Rheum. 42, 90-99. 11) J. L. Croxford, K. Triantaphyllopoulos, O. L. Podhajcer, M. Feldmann, D. Baker and Y. Chernajovsky (1998). Cytokine gene therapy in experimental allergic encephalomyelitis by injection of plasmid DNA-cationic liposome complex into the central nervous system J.Immunol. 160, 5181-5187. 12) K. A. Triantaphyllopoulos, L.J. Croxford, D. Baker and Y. Chernajovsky (1998) Cloning and expression of murine IFN β and a TNF antagonist for gene therapy of chronic relapsing experimental allergic encephalomyelitis. Gene Therapy 5, 253-263. 13) Y. Chernajovsky, A. Annenkov, C. Herman. K. Triantaphyllopoulos, D. Gould, H. Dreja, R. Mageed, O.L. Podhajcer and D. Baker. (1997) Gene Therapy for Rheumatoid Arthritis: Theoretical considerations. Drugs & Aging 12, 29-41. 14) Y. Chernajovsky, G. Adams, K. Triantaphyllopoulos, M. F. Ledda and O.L. Podhajcer. (1997). Pathogenic lymphoid cells engineered to express TGF b1 ameliorate disease in a collagen-induced arthritis model. Gene Therapy 4, 553-559. 7

15) K. A. Triantaphyllopoulos, R. Neve, G. Adams, D. Baker, L.J. Croxford, M. Feldmann and Y. Chernajovsky. (1996) Expression of cytokines and cytokine inhibitors in retroviral vectors for use in gene therapy of chronic relapsing experimental allergic encephalomyelitis. Mult. Sclerosis 2, 23-24. 16) K. Triantaphyllopoulos and J.H. Argyroudi-Akoyunoglou (1993) Action spectrum of lightharvesting transcript accumulation and coordinated translation, Eur. J. Biochem. 211, 127-134. ΑΡΘΡΑ ΣΕ ΒΙΒΛΙΑ K. Triantaphyllopoulos and Joan H. Argyroudi-Akoyunoglou. Action spectrum of LHC-II precursor apoprotein transcription and coordinated translation (1992), In: Regulation of Chloroplast Biogenesis, J.H. Argyroudi-Akoyunoglou, eds., NATO ASI series, Plenum Press, New York, pp 85-90. Joan H. Argyroudi-Akoyunoglou, Thalia Bei-Paraskevopoulou, K. Triantaphyllopoulos and Rania Anastassiou (1992). Regulation of photosynthetic unit assembly: regulation of light-harvesting apoprotein transcription, translation and stabilization in thylakoids, ), In: Regulation of Chloroplast Biogenesis, J.H. Argyroudi-Akoyunoglou, eds., NATO ASI series, Plenum Press, New York, pp 313-321. ΕΠΙΛΕΓΜΕΝΕΣ ΠΑΡΟΥΣΙΑΣΕΙΣ 1) Theodosiou Joan-Angeliki, Triantaphyllopoulos Kostas, Massouras Theophilos, Xylouri Eytyxia (2012). Physico-chemical, microbiological characteristics and antimicrobial properties of milk ass. 12th Pan-Hellenic Veterinary Congress, The Athens Hilton, 5-8 April 2012 2) Kandris A., K. Kostakis, D. Papachristou, P. Koutsouli, K. Triantaphyllopoulos, Theophilos Massouras, I. Bizelis (2011). Investigation of gene polymorphism coding for beta-lactoglobulin in sheep breeds of Greece. 26th Conference Hellenic Zootechnical Society, Chalchida 12-14 October 2011. Animal Science, Special Publication No. 37 pp. 93. 3) Jennifer Tam, Kostas Triantaphyllopoulos, Helen Wildish, Ton de Wit, Tim Ong, Selina Raguz, Jenny Morgan, Eleni Makrinou, Terry Partridge, Frank Grosveld and Antoniou, M. (2002). Characterisation of the Muscle-Specific Locus Control Region Associated with the Human Desmin 8

Gene Domain. In EMBO Workshop on The Molecular Genetics of Myogenesis and Muscle Disease, Churchill College, Cambridge, England, September 29 - October3, 2002 4) M. Antoniou, H. Wildish, K. Triandaphyllopoulos, Ton de Wit, Tim Ong, Selina Raguz, Jenny Morgan, Terry Partridge and Frank Grosveld. The Muscle-Specific Locus Control Region of the Human Desmin Gene. In Molecular Biology of Muscle Development and Disease, p.18 Asilomar Conference Center, Pacific Grove, California, May 21-26, 2000. 5) J. L. Croxford, K. Triantaphyllopoulos, R. Neve, M. Feldmann Y. Chernajovsky and D. Baker. Ex vivo retroviral gene therapy for EAE. In British Society of Immu-nology 6th Annual Congress of Immunology, Harrogate, U.K. 1-4 December 1998. 6) K. A. Triantaphyllopoulos, R. Neve, G. Adams, D. Baker, L.J. Croxford, M. Feldmann and Y. Chernajovsky. Expression of cytokines and cytokine inhibitors in retroviral vectors for use in gene therapy of chronic relapsing experimental allergic encephalomyelitis, In Self-Non Self Discrimination: Molecular Basis of Autoagression, European Research Conferences abstract book p.35, Lenggries, Munich, 11-15 October 1996. 7) K. A. Triantaphyllopoulos, R. Neve, G. Adams, D. Baker, L.J. Croxford, M. Feldmann and Y. Chernajovsky. (1996) Expression of cytokines and cytokine inhibitors in retroviral vectors for use in gene therapy of chronic relapsing experimental allergic encephalomyelitis, In MS society 1996 Research Grant Holders Meeting, abstract booklet, Poster Session, London 11-12 February 1996. 9

EΜΠΕΙΡΙΑ ΚΑΙ ΑΝΑΘΕΣΕΙΣ ΤΕΧΝΙΚΩΝ In vivo and in vitro research in the lung. Function and analysis in the airway inflammation and oxidative stress. See in vitro techniques as last post, plus animal physiology studies in the lung and animal surgery. All known Microsoft statistical (Prism) and molecular biology programs (Vector NTi, DNA star etc., Graphical & Statistical programs on MAC and PCs- GraphPad Prism) Clinical biochemistry testing of animal fluids, handling etc. DNA, RNA and mrna isolation, PCR, RT-PCR, real-time quantitative PCR, Tissue culture primary & established cell lines, tranfections with lipofectamine systems. Immunological assays. Western blotting, Protein assay. Gel electrophoresis. Biochemical assays. ELISA detection systems for various biomarkers, cell biological assays. Histology, hematoxylin/eosin staining in animal paws. Histopathological assessment. Light and phase contrast microscopy. Multi-tasking PC platform used with Microsoft office, DNA molecular biology programs and bioinformatic tools were used. Corbett Robotics system software and quantitative PCR software, ELISA assay. Cloning and subcloning techniques, restriction digestion, transformation, TOPO vectors expression systems in E. coli, Tetracycline inducible systems-suicide gene expression (Flp- In, InVitrogen), Mutation analysis, site-directed mutagenesis. Microbiological techniques, DNA (plasmid and genomic) purification, RT-PCR. ABI sequencing systems, ABI 3130x capillary genetic analyser, gene expression studies. Tissue Culture Techniques, immunofluorescence, Protein Analysis (Western blots). Electrophoresis (SDS/PAGE, agarose). Biochemical protein determination methods, Fluorography. Light and 3-beam confocal microscopy. Bioinformatics - gene and protein databank usage. Manipulation of plasmid vectors. shrna cloning. Microbiological techniques, DNA (plasmid and genomic) purification, DNA micrococcal nuclease treatment. RNA isolation, PCR, RT-PCR, real-time PCR ABI9600HT system. Tissue Culture, FACS. Bisulphite DNA modification & sequencing method, DNA methylation studies, Electrophoresis (native, SDS/PAGE, agarose). Chromatin structure studies. DNase I hypersensitivity mapping, S1 nuclease protection assay, transgenic analysis in the mouse. Southern & Northern blots. Chromatin structure studies, Animal work experience (mouse transgenic line). Electrophoresis (native, SDS/PAGE, agarose), Radioactive material usage, handling and experimentation. Retroviral vectors and gene delivery systems. Manipulation of plasmid and retroviral vectors. Retrovirus packaging cell lines, primary and established cell line, transfection 10

studies, WEHI cells cytotoxicity assay, cell proliferation assay, antiviral activity bioassay (EMC virus), and other functional cell assays. Knowledge of cell surface antigens detection and cytokine, Serology, FACS analysis, immunohistochemistry. Electrophoresis (native, SDS/PAGE, agarose), Protein Analysis (Western blots). Biochemical protein determination methods. Fluorography, Light microscopy. Animal work experience (murine disease models, CIA). Preparation, testing and application of in vitro translation cell-free system, in wheat-germ. DNA (plasmid and genomic) purification. Immunoprecipitation, Electrophoresis (native, SDS/PAGE, agarose, 2-D), Protein Analysis (Western blots). Antibody production and purification in rabbits. Biochemisrty, protein determination methods. Fluorography, Autoradiography. Knowledge of Light and Electron microscopy (TEM). Radioactive material usage, handling and experimentation. Basic molecular modeling. 11