Ινστιτούτο Θαλάσσιας Βιολογίας και Γενετικής, Ελληνικό Κέντρο Θαλάσσιων Ερευνών 2

Σχετικά έγγραφα
Νέες καταγραφές παρουσίας του κρισίµως κινδυνεύοντος Valencia letourneuxi (Sauvage 1880) και ζητήµατα διατήρησης

Προκαταρκτικα αποτελεσματα της εκτιμησης της γενετικης ποικιλομορφιας σε πληθυσμους κεφαλοποδων (Sepia officinalis) της Μεσογειου και του Ατλαντικου


CURRENT POPULATION STATUS OF VALENCIA LETOURNEUXI

ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΥΠΡΟΥ ΣΧΟΛΗ ΓΕΩΤΕΧΝΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ ΚΑΙ ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗΣ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΟΣ. Πτυχιακή εργασία

Τα ψάρια των εσωτερικών υδάτων της Ελλάδας

Hellenic Centre for Marine Research, P.O. Box 712, 19013, Anavyssos, Greece 2. Ελληνικό Κέντρο Θαλασσίων Ερευνών, Τ.Θ. 712, 19013, Ανάβυσσος, Ελλάδα 2

9 th Symposium on Oceanography & Fisheries, Proceedings, Volume ΙΙ

Πληθυσμιακή και Εξελικτική Γενετική

ΕΙΔΙΚΑ ΘΕΜΑΤΑ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ

ΦΥΣΙΚΗ ΑΝΘΡΩΠΟΛΟΓΙΑ. Πρωτεύοντα ΙΙΙ Χρήση µοριακών δεδοµένων

ΠΡΟΣΦΑΤΕΣ ΤΑΣΕΙΣ ΣΤΗ ΜΕΛΕΤΗ ΤΗΣ ΠΑΝΙΔΑΣ ΤΗΣ ΕΛΛΑΔΑΣ

Πληθυσμιακή Γενετική

Αξιολογηση της ιχθυολογικης βιβλιογραφιας για τους ποταμούς και λίμνες της Ελλαδας σε σχεση με την εφαρμογή της Οδηγίας για το νερο (2000/60/ΕΚ)

AΡΙΣΤΟΤΕΛΕΙΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΘΕΣΣΑΛΟΝΙΚΗΣ ΠΟΛΥΤΕΧΝΙΚΗ ΣΧΟΛΗ ΤΜΗΜΑ ΠΟΛΙΤΙΚΩΝ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ

σπανίων φυλών των ζώων

Study of urban housing development projects: The general planning of Alexandria City

9 th Symposium on Oceanography & Fisheries, Proceedings, Volume ΙΙ

Department of Biological Sciences, Texas Tech University, MS 43131, Lubbock,Texas

πληθυσμών του αρουραίου (Rattus rattus)σε συμπλέγματα νησιών και βραχονησίδων των ελληνικών θαλασσών

Γιατί είναι σημαντική η Βιοποικιλότητα;

Αξιολογηση της ιχθυολογικης βιβλιογραφιας για τους ποταμούς και λίμνες της Ελλαδας σε σχεση με την εφαρμογή της Οδηγίας για το νερο (2000/60/ΕΚ)

ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΚΑΙ ΕΦΑΡΜΟΓΗ ΜΙΚΡΟΔΟΡΥΦΟΡΙΚΩΝ ΔΕΙΚΤΩΝ ΣΤΗ ΦΥΛΟΓΕΩΓΡΑΦΙΑ ΤΟΥ ΜΠΑΡΜΠΟΥΝΙΟΥ (Mullus surmuletus)

ΚΑΤΑΝΟΜΗ ΚΑΙ ΑΦΘΟΝΙA ΕΙΔΩΝ ΨΑΡΙΩΝ ΣΤΟΝ ΠΟΤΑΜΟ ΣΤΡΥΜΟΝΑ FISH SPECIES DISTRIBUTION AND ABUNDANCE IN THE RIVER STRYMON

Πληθυσμιακή και Εξελικτική Γενετική

ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ ΔΙΑ ΒΙΟΥ ΜΑΘΗΣΗΣ ΑΕΙ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΠΙΚΑΙΡΟΠΟΙΗΣΗ ΓΝΩΣΕΩΝ ΑΠΟΦΟΙΤΩΝ ΑΕΙ (ΠΕΓΑ)

ΣΤΟΙΧΕΙΑ ΠΟΙΚΙΛΟΤΗΤΑΣ ΚΑΙ ΚΑΤΑ ΜΗΚΟΣ ΣΥΝΘΕΣΕΙΣ 4 ΕΙΔΩΝ ΨΑΡΙΩΝ ΑΝΑ ΑΛΙΕΥΤΙΚΟ ΕΡΓΑΛΕΙΟ ΣΤΟΝ ΚΕΡΚΥΡΑΪΚΟ

Πληθυσμιακή και Εξελικτική Γενετική

ΑΦΗΣΤΕ ΛΙΓΟ ΝΕΡΟ ΣΤΟ ΠΟΤΑΜΙ. ΤΑ ΨΑΡΙΑ ΤΩΝ ΕΛΛΗΝΙΚΩΝ ΓΛΥΚΩΝ ΝΕΡΩΝ ΣΤΗΝ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΗ ΕΚΠΑΙ ΕΥΣΗ

Identification of Fish Species using DNA Method

Μοριακή Ανάλυση Φυτών

Εργαλεία Μοριακής Γενετικής

Πανελλήνιο Συµπόσιο Ωκεανογραφίας & Αλιείας

POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR) ΑΛΥΣΙΔΩΤΗ ΑΝΤΙΔΡΑΣΗ ΤΗΣ ΠΟΛΥΜΕΡΑΣΗΣ

Elucidation of fine-scale genetic structure of sandfish (Holothuria scabra) populations in Papua New Guinea and northern Australia

A life-table metamodel to support management of data deficient species, exemplified in sturgeons and shads. Electronic Supplementary Material

Πληθυσμιακή και Εξελικτική Γενετική

ΒΙΟΠΟΙΚΙΛΟΤΗΤΑ ΚΑΙ ΒΙΟΓΕΩΓΡΑΦΙΚΑ ΠΡΟΤΥΠΑ ΤΩΝ ΙΧΘΥΩΝ ΤΩΝ ΕΣΩΤΕΡΙΚΩΝ ΥΔΑΤΩΝ ΤΗΣ ΒΑΛΚΑΝΙΚΗΣ ΧΕΡΣΟΝΗΣΟΥ ΟΙΚΟΝΟΜΟΥ ΑΝΘΗ

8ο Πανελλήνιο Συμποσιο Ωκεανογραφίας & Αλιείας 949

ΚΕΦΑΛΑΙΟ 1. Η ΠΡΟΕΛΕΥΣΗ ΚΑΙ Η ΕΠΙΔΡΑΣΗ ΤΗΣ ΕΞΕΛΙΚΤΙΚΗΣ ΣΚΕΨΗΣ

Η ανάλυση του DNA στον έλεγχο της πατρότητας και στην εξιχνίαση του εγκλήματος

Γενετική της ιατήρησης επαπειλούμενων ειδών

ΖΩΟΤΕΧΝΙΑ Διδάσκουσα: Κουτσούλη Παναγιώτα Τμήμα: Επιστήμης Ζωικής Παραγωγής & Υδατοκαλλιεργειών

Η πορεία της βιοποικιλότητας στο χρόνο

Βιοτεχνολογία Φυτών. Μοριακοί Δείκτες (Εισαγωγή στη Μοριακή Βιολογία)

Βιβλιομετρική ανάλυση των εργασιών της κλιματικής αλλαγής με ειδική εφαρμογή στην Ελλάδα και τη Θεσσαλία Θεόδωρος Καλύβας, Ευθύμιος Ζέρβας

Πληθυσμιακή και Εξελικτική Γενετική

Μεταπτυχιακή Διατριβή

Περιεχόμενα. 1 Η ιστορία της εξελικτικής βιολογίας: Εξέλιξη και Γενετική 2 Η Προέλευση της Μοριακής Βιολογίας 3 Αποδείξεις για την εξέλιξη 89

TreeTOPS. ένα εισαγωγικό παιχνίδι για τα φυλογενετικά δέντρα. Teacher s Guide. ELLS European Learning Laboratory for the Life Sciences

ALIEN SPECIES: NEW TRENDS OF SCIENTIFIC JOURNALS FOR THE RECORD OF A GLOBAL PHENOMENON

thessalonicae (anthozoa, Octocorallia, Pennatulacea)

Σεμινάριο Βιβλιογραφίας στους προπτυχιακούς φοιτητές

ΓΕΝΕΤΙΚΗ πληθυσμιακη δομη του μελανουριου, Oblada melanura L., με χρηση μικροδορυφορικου DNA.

Πληθυσμιακή και Εξελικτική Γενετική

EUB057 - Εκβολή ποταμού Μανικιάτη

Παρουσιαση και αξιολογηση της διαθεσιμης - για τα ψαρια των εσωτερικων υδατων της Βαλκανικης και της Τουρκιας - πληροφοριας, μεσω της FishBase

ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΥΠΡΟΥ ΣΧΟΛΗ ΓΕΩΤΕΧΝΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ ΚΑΙ ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗΣ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΟΣ. Πτυχιακή εργασία

Διάκριση ποικιλιών ελαιολάδου μέσω μεθόδου γονοτύπησης βασιζόμενης σε φθορίζοντα μικροσφαιρίδια

Προσδιορισμός Ικανοποιητικών Τιμών Αναφοράς και Στόχων Διατήρησης

Πολυμορφισμοί Ανρώπινου DNA. Νικόλαος Δάβανος, MSc PhD

Σημαντικές διακρίσεις του Τμήματος Βιολογίας του ΕΚΠΑ στην παγκόσμια κατάταξη «US News - Best Global University Rankings 2019»

Κ ι λ µα µ τι τ κές έ Α λλ λ α λ γές Επι π πτ π ώ τ σει ε ς στη τ β ιοπο π ικιλό λ τη τ τα τ κ αι τ η τ ν ν ά γρια ζ ωή

Αρχές αειφορίας και διαχείρισης Βιολογία της Διατήρησης

Medicago marina 2012

Πληθυσμιακή Γενετική

Νέες πληροφορίες σχετικά με την εμφάνιση, κατανομή και αφθονία νεο-εισαχθέντων ειδών ψαριών στις ακτές της Κρήτης

Γενετική πληθυσμών. Εισαγωγή στη Δασική Γενετική. Χειμερινό εξάμηνο

Έρευνα για το κυνήγι του λαγού στο νομό Έβρου

ΚΛΙΜΑΤΟΛΟΓΙΑ CLIMATOLOGY

Κατανομες μεταλλων στα ιζηματα του υφαλοκρηπιδικου συστηματος της βορειοδυτικης Μαυρης Θαλασσας. 2

ΜΕΛΕΤΗ ΤΩΝ ΣΥΝΤΗΡΗΜΕΝΩΝ ΑΛΛΗΛΟΥΧΙΩΝ ΠΟΥ ΔΕΝ ΚΩΔΙΚΟΠΟΙΟΥΝ ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΣΤΑ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΑ ΤΩΝ ΨΑΡΙΩΝ

ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΠΕΙΡΑΙΩΣ ΤΜΗΜΑ ΟΙΚΟΝΟΜΙΚΗΣ ΕΠΙΣΤΗΜΗΣ ΑΜΕΣΕΣ ΞΕΝΕΣ ΕΠΕΝΔΥΣΕΙΣ ΣΕ ΕΥΡΩΠΑΙΚΕΣ ΧΩΡΕΣ

Τελική Αναφορά της Κατάστασης Διατήρησης της Μεσογειακής Φώκιας Monachus monachus στη Νήσο Γυάρο Περίληψη

merluccius) ΣΤΟΝ ΠΑΓΑΣΗΤΙΚΟ ΚΟΛΠΟ

ΕΘΝΙΚΗ ΣΧΟΛΗ ΔΗΜΟΣΙΑΣ ΔΙΟΙΚΗΣΗΣ ΤΜΗΜΑ ΤΟΠΙΚΗΣ ΑΥΤΟΔΙΟΙΚΗΣΗΣ & ΠΕΡΙΦΕΡΕΙΑΚΗΣ ΑΝΑΠΤΥΞΗΣ. Θέμα: «Ο Προσανατολισμός του Περιφερειακού Σκέλους του Γ ΚΠΣ»

ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΟΤΗΤΑΣ ΑΤΟΜΩΝ ΜΕ ΒΑΡΙΑ ΝΟΗΤΙΚΗ ΥΣΤΕΡΗΣΗ ΚΑΙ ΠΡΟΒΛΗΜΑΤΑ ΣΥΜΠΕΡΙΦΟΡΑΣ ΠΟΥ ΜΕΝΟΥΝ ΣΕ ΟΙΚΟΤΡΟΦΕΙΟ ΣΤΗΝ ΚΟΙΝΟΤΗΤΑ.

Φορέας Διαχείρισης Περιοχής Οικοανάπτυξης Κάρλας. Μαυροβουνίου Κεφαλόβρυσου Βελεστίνου. ΣΤΕΦΑΝΟΒΙΚΕΙΟ, Δεκέμβριος 2013

ΕΛΛΗΝΙΚΗ ΕΤΑΙΡΕΙΑ ΠΕΡΙΦΕΡΕΙΑΚΗΣ ΕΠΙΣΤΗΜΗΣ ERSA

ΚΕΦΑΛΑΙΟ 4 ΜΕΤΑΛΛΑΞΗ-ΜΕΤΑΝΑΣΤΕΥΣΗ

ΠΕΡΙΓΡΑΜΜΑ ΕΙΣΗΓΗΣΕΩΝ Διάλεξη 1 Τίτλος Στόχος και Περιεχόμενα Λέξεις-Κλειδιά

ΑΛΥΣΙΔΩΤΗ ΑΝΤΙΔΡΑΣΗ ΠΟΛΥΜΕΡΑΣΗΣ POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR)

Κεφάλαιο 4 Σύγχρονη Εξελικτική θεωρία

Πληθυσμιακή και Ποσοτική Γενετική. Εξέλιξη

Αναφορά σχετικά με την αναγκαιότητα και τη δυνατότητα επανεισαγωγής στη φύση συγκεκριμένων φυτικών ειδών

ΕΙΔΙΚΑ ΘΕΜΑΤΑ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ

ΣτοιχεΙα βιολογιας και οικολογιας δυο βαθυβιων ψαριων του Ν.Α. ΙονΙου

2 Δεκεμβρίου Απολογισμός Δράσεων της υποδομής Greek Argo για το 2015

ΠΡΟΣΤΑΣΙΑ ΑΤΜΟΣΦΑΙΡΙΚΗΣ ΔΙΑΒΡΩΣΗΣ ΑΛΟΥΜΙΝΙΟΥ/ΑΝΟΔΙΩΣΗ Al

ΚΕΦΑΛΑΙΟ 7 ΥΠΟΔΙΑΙΡΕΣΗ ΠΛΗΘΥΣΜΩΝ

Εισηγητής Αναπλ. Καθ. Πουλακάκης Νίκος Γενετική Διαχείριση

ΣΥΓΚΡΙΤΙΚΗ ΜΕΛΕΤΗ ΤΗΣ ΕΠΙ ΟΣΗΣ ΤΩΝ ΦΟΙΤΗΤΩΝ ΥΟ ΑΚΑ ΗΜΑΪΚΩΝ ΤΜΗΜΑΤΩΝ ΕΝΟΣ ΑΕΙ ΩΣ ΠΡΟΣ ΤΟ ΣΥΣΤΗΜΑ ΕΙΣΑΓΩΓΗΣ ΤΟΥΣ ΣΤΗ ΤΡΙΤΟΒΑΘΜΙΑ ΕΚΠΑΙ ΕΥΣΗ

Δομή του πληθυσμού του σπάνιου και απειλούμενου φυτού Eriolobus trilobatus στο Ν. Έβρου

8ο Πανελλήνιο Συμποσιο Ωκεανογραφίας & Αλιείας 637

Development of a Seismic Data Analysis System for a Short-term Training for Researchers from Developing Countries

ΓΕΝΕΤΙΚΗ ΠΛΗΘΥΣΜΩΝ. Προβλέποντας την κληρονομικότητα σε έναν πληθυσμό

Μοριακή Ταυτοποίηση της Ρίγανης Κόζιακα

Κατάλογος Προγραµµάτων που έχει εκπονήσει η MOm µε τη Συγχρηµατοδότηση Θεσµικών Πόρων

ΠΑΝΕΛΛΗΝΙΕΣ ΕΞΕΤΑΣΕΙΣ Γ' ΤΑΞΗΣ ΗΜΕΡΗΣΙΟΥ ΓΕΝΙΚΟΥ ΛΥΚΕΙΟΥ ΤΡΙΤΗ 18 ΙΟΥΝΙΟΥ 2019 ΕΞΕΤΑΖΟΜΕΝΟ ΜΑΘΗΜΑ: ΒΙΟΛΟΓΙΑ ΘΕΤΙΚΩΝ ΣΠΟΥΔΩΝ

Συστηματική και φυλογεωγραφία του συμπλέγματος ειδών Ablepharus kitaibelii στη περιοχή της ανατολικής Μεσογείου

Transcript:

9 ο Πανελλήνιο Συμπόσιο Ωκεανογραφίας & Αλιείας 2009 - Πρακτικά, Τόμος ΙΙ ΜελΕτη της γενετικης ποικιλοτητας στο ειδος Valencia letourneuxi (ΙχθΥες, VALENCIIDAE) Βογιατζή Ε. 1, 2, Μαγιόπουλος Ι. 1, 3, Καλογιάννη Ε. 4, Γιακουμή Σ. 4, Μαγουλάς Α. 1, Τσιγγενόπουλος Κ. 1 1 Ινστιτούτο Θαλάσσιας Βιολογίας και Γενετικής, Ελληνικό Κέντρο Θαλάσσιων Ερευνών 2 Τμήμα Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής, Δημοκρίτειο Πανεπιστήμιο Θράκης 3 Τμήμα Βιολογίας, Πανεπιστήμιο Κρήτης 4 Ινστιτούτο Εσωτερικών Υδάτων, Ελληνικό Κέντρο Θαλασσίων Ερευνών Περίληψη Το Valencia letourneuxi Sauvage, 1880, είναι ένα μικρόσωμο ψάρι του γλυκού νερού, ενδημικό στη Δυτική Ελλάδα, την Πελοπόννησο και τη Νότια Αλβανία. Το είδος χαρακτηρίζεται από μικρά πληθυσμιακά μεγέθη και αποτελεί ένα από τα πλέον απειλούμενα είδη στην Ευρώπη. Η μελέτη της γενετικής του ποικιλότητας είναι απαραίτητη προκειμένου να βρεθούν οι πιο άμεσα απειλούμενες μονάδες και να καθοριστούν οι πιο κατάλληλες στρατηγικές προστασίας και διατήρησης. Ακολουθώντας ένα πρωτόκολλο εμπλουτισμού, απομονώθηκαν αλληλουχίες με μικροδορυφορικές επαναλήψεις (γενωμική βιβλιοθήκη) και σχεδιάστηκαν ζεύγη εκκινητών για αυτές. Από τα 20 αρχικά ζεύγη, 11είχαν τα καλύτερα αποτελέσματα κι ακολούθησε γονοτύπιση των δειγμάτων που είχαν συλλεχθεί από επτά διαφορετικές περιοχές του ελλαδικού χώρου. Από τις αναλύσεις προκύπτουν ενδείξεις μειωμένης γενετικής ποικιλότητας, γεγονός που ίσως οφείλεται σε φαινόμενα στενωπού (bottleneck). Επιπλέον, παρατηρείται μια γεωγραφική συσχέτιση μεταξύ των πληθυσμών, με πιθανή εξήγηση το φαινόμενο της γονιδιακής ροής στο παρελθόν, το οποίο με τη σειρά του σχετίζεται με τη γεωλογική ιστορία της περιοχής. Λέξεις κλειδιά: Valencia letourneuxi, μικροδορυφορικό DNA, γενετική δομή. GEnetic population structure in Valencia letourneuxi (pisces, VALENCIIDAE) Vogiatzi E. 1,2, Magiopoulos I. 1, 3, Kalogianni E. 4, Giakoumi S. 4, Magoulas A. 1, Tsigenopoulos C. 1 1 Institute of Marine Biology and Genetics, Hellenic Centre for Marine Research 2 Department of Molecular Biology and Genetics, Democritus University of Thrace 3 Biology Department, University of Crete 4 Institute of Inland Waters, Hellenic Centre for Marine Research Abstract The Greek Valencia toothcarp Valencia letourneuxi is a small-bodied freshwater fish species, endemic in Western Greece, the Peloponnese and Southern Albania. The species is characterised by low population densities and is one of the most endangered of Europe. The study of its genetic variation is a prerequisite for designating the evolutionarily significant units and for developing an effective conservation strategy. Using an enrichment protocol, a set of microsatellite-containing sequences was isolated and pairs of primers were designed. From the 20 initial pairs, 11 of them gave the best results and the next step consisted of genotyping the samples collected from seven different water bodies of Greece. The analysis showed evidence of reduced genetic variation, a fact that might be due to a bottleneck event. Moreover, a geographical correlation among populations is evident, with possible explanation the past gene flow and the geological history of the region. Keywords: Valencia letourneuxi, microsatellite DNA, genetic structure. 1. Εισαγωγή Το Valencia letourneuxi (Sauvage, 1880), είναι ένα μικρόσωμο ψάρι του γλυκού νερού (Εικ. 1), με μικρή διάρκεια ζωής (δύο με τρία χρόνια) και ταχεία ωρίμανση, που παρουσιάζει κρυπτικό χρωματισμό και σεξουαλικό διμορφισμό (Barbieri et al., 2000, 2002; Kottelat & Freyhoff, 2007). -1161-

9 th Symposium on Oceanography & Fisheries, 2009 - Proceedings, Volume ΙΙ Εικ. 1: Άτομο του είδους V. letourneuxi (δείγμα από τις πηγές Βλυχού στη Βόνιτσα). Από ταξινομικής άποψης, το είδος ανήκει στην οικογένεια Valenciidae, η οποία περιλαμβάνει μόνο το γένος Valencia με δύο είδη: το V. hispanica (Valenciennes, 1846), ενδημικό της Ανατολικής Ιβηρικής χερσονήσου και το V. letourneuxi, αντικείμενο της παρούσης εργασίας, ενδημικό της Δυτικής Ελλάδας, της Πελοποννήσου και της Νότιας Αλβανίας (Economidis, 1991; Barbieri et al., 2000; Daoulas, 2003). Η κατακερματισμένη γεωγραφική κατανομή του είδους, οι ιδιαίτερες οικολογικές του απαιτήσεις και η χαμηλή του αφθονία, το καθιστούν είδος προς εξαφάνιση. Φέρεται να έχει ήδη εξαφανιστεί από τα τέσσερα υδάτινα συστήματα που είχε παλαιότερα εντοπιστεί στα νησιά Κέρκυρα και Λευκάδα, ενώ οι πληθυσμοί του στο νοτιότερο άκρο της γεωγραφικής του εξάπλωσης έχουν μεωθεί δραματικά (Bianco et al., 1996; Kalogianni et al., 2006). Μεταξύ των παραγόντων που θεωρούνται υπεύθυνοι για την πληθυσμιακή του μείωση συγκαταλέγονται η λειτουργία των φραγμάτων, η άντληση νερού για άρδευση και ύδρευση και η κατασκευή έργων υποδομής που επιφέρουν υποβάθμιση των ενδιαιτημάτων του. Αποτέλεσμα όλων αυτών ήταν να συμπεριληφθεί το είδος ως είδος προτεραιότητας για προστασία στην Κοινοτική Οδηγία για την Προστασία των Οικοτόπων (92/43/ EEC), και προσφάτως ως κρισίμως κινδυνεύον στον κατάλογο του IUCN (2005). Η προστασία της γενετικής ποικιλότητας είναι θέμα πρώτης προτεραιότητας για την προστασία και διατήρηση των οργανισμών καθώς αυτή είναι το αρχικό ακατέργαστο υλικό για την εξέλιξη και τις αλλαγές μεταξύ των πληθυσμών. Παράλληλα ο Παγκόσμιος Οργανισμός για τη Διατήρηση (World Conservation Union, IUCN) έχει αναγνωρίσει τη γενετική ποικιλότητα σαν ένα από τα τρία επίπεδα ποικιλότητας που απαιτούν διατήρηση (McNeely et al., 1990). Επομένως για ένα είδος όπως το V. letourneuxi η μελέτη της γενετικής του ποικιλότητας είναι απαραίτητη προκειμένου να καθοριστεί το επίπεδο του κινδύνου, να βρεθούν οι πιο άμεσα απειλούμενες μονάδες και ακολούθως να καθοριστούν οι καταλληλότερες στρατηγικές προστασίας. Ειδικά μάλιστα ένα είδος με μικρούς και απομονωμένους πληθυσμούς, όπως το V. letourneuxi, είναι περισσότερο εκτεθειμένο στην τυχαία γενετική παρέκκλιση και την ομομιξία τα οποία οδηγούν στην επιπλέον μείωση της ποικιλότητας (Avise, 1994). Οι μικροδορυφορικές περιοχές δεν είναι γενικά χρήσιμες για την μελέτη εξελικτικών γεγονότων στο βαθύ παρελθόν, λόγω του ταχύτατου ρυθμού μετάλλαξης και της εύκολης αλλαγής του μεγέθους τους. Όμως είναι πολύ καλοί δείκτες για τα σχετικά πρόσφατα εξελικτικά γεγονότα ακριβώς λόγω αυτού του ταχύτατου ρυθμού μετάλλαξης που τους επιτρέπει να καταγράφουν γρήγορα τις αλλαγές αυτές. Μάλιστα λόγω αυτού του ρυθμού μπορεί να εντοπισθεί και διαφορά μεταξύ των ατόμων σε σχέση με τον υπόλοιπο πληθυσμό. Στην παρούσα εργασία μελετούμε τη γενετική ποικιλότητα του υπό εξαφάνιση είδους V. letourneuxi με τη χρήση μικροδορυφορικών περιοχών. Δείγματα έχουν συλλεχθεί από επτά περιοχές της Ελλάδας που είναι γνωστή η ύπαρξή του. Παράλληλα θα χρησιμοποιηθούν για σύγκριση και 3 άτομα από το συγγενικό είδος Aphanius fasciatus (Cyprinodontidae, Valenciennes, 1821) -1162-

9 ο Πανελλήνιο Συμπόσιο Ωκεανογραφίας & Αλιείας 2009 - Πρακτικά, Τόμος ΙΙ 2. Υλικά και Μέθοδοι Συνολικά μελετήθηκαν δείγματα από 119 ψάρια του είδους V. letourneuxi και από τρία ψάρια του συγγενικού είδους A. fasciatus. Όλα τα άτομα του V. letourneuxi προέρχονται από τον ελληνικό χώρο και συγκεκριμένα από επτά υδάτινα συστήματα. Στoν Πίνακα 1 παρατίθενται τα συστήματα από τα οποία έγινε συλλογή δειγμάτων και ο αριθμός των ατόμων ανά δείγμα. Πίνακας 1: Τοποθεσίες συλλογής δειγμάτων και μέγεθος δείγματος. Περιοχή Αριθμός ατόμων Πηγές Χιλιαδούς (Μόρνος, Φωκίδα) 26 Αχέροντας (Ήπειρος) 25 Σκάλα Λούρου (Ήπειρος) 22 Πηγές Βλυχού (Βόνιτσα, Αιτ/νία) 20 Άραχθος (Ήπειρος) 12 Πηνειός (Πελοπόννησος) 8 Κέρκυρα 6 Τα δείγματα συλλέχθηκαν από προσωπικό του Ινστιτούτου Εσωτερικών Υδάτων του ΕΛ.ΚΕ.Θ.Ε., εκτός από τα δείγματα του Πηνειού και της Κέρκυρας που στάλθηκαν από το Ζωολογικό Κήπο του Λονδίνου (ο αρχικός πληθυσμός Κέρκυρας αποτελέστηκε από 14 άτομα που συλλέχθηκαν το 1994 και το 1995, ενώ ο αρχικός πληθυσμός Πηνειού αποτελέστηκε από 15 άτομα που συλλέχθηκαν το 1994 και άλλα οκτώ που συλλέχθηκαν το 2000). Τα δείγματα του A. fasciatus προέρχονταν από την Κέρκυρα (δύο άτομα από την Αλυκή Λευκίμμης) και από το σύστημα του Ευήνου (ένα άτομο από την Κάτω Βασιλική). Για την εξαγωγή DNA χρησιμοποιήθηκαν τμήματα του ουραίου πτερυγίου και του μυϊκού ιστού των ψαριών. Η εξαγωγή έγινε ακολουθώντας το πρωτόκολλο των Miller et al. (1988). Ακολουθώντας ένα πρωτόκολλο εμπλουτισμού (enrichment protocol) είχε κατασκευαστεί και υπήρχε διαθέσιμη στο ΙΘΑΒΙΓ μια γενωμική βιβλιοθήκη για το είδος (Tsigenopoulos et al., 2003). Ακολούθησε έλεγχος σε πήκτωμα αγαρόζης - οι primers με τα καλύτερα αποτελέσματα παραγγέλθηκαν ως σημασμένοι και πραγματοποιήθηκε βελτιστοποίηση των συνθηκών PCR, με τελικό στόχο τη γονοτύπιση όλων των ατόμων του είδους με ηλεκτροφόρηση σε αυτόματο αναλυτή αλληλουχιών (ABI sequencer 3700). 3. Αποτελέσματα Τα 11 ζεύγη εκκινητών (primers) που είχαμε στη διάθεσή μας ομαδοποιήθηκαν με βάση το μέγεθος των τμημάτων DNA που πολλαπλασιάζουν και την απόσταση μεταξύ τους (προκειμένου να απέχουν τουλάχιστον 30 40 βάσεις) και τη σήμανσή τους με φθορίζουσα χρωστική διαφορετικής απορρόφησης. Ακολούθησε η διαδικασία εύρεσης των κατάλληλων συνθηκών για την αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης για κάθε αντίδραση ξεχωριστά. Συγκεκριμένα οι ποσότητες από κάθε αντιδραστήριο που χρησιμοποιήθηκαν (όπως και σε κάθε αντίδραση PCR στην συγκεκριμένη εργασία) ήταν: ~20 ng/μl DNA, 1Χ Taq Buffer, 1,5 ή 2,5 mm MgCl 2, 2,7μΜ dntps, 4 μμ του κάθε εκκινητή και 0,2U Taq polymerase. Στις αναλύσεις που ακολούθησαν, τα αποτελέσματα αναλύθηκαν με διάφορα λογισμικά προγράμματα, όπως το GENETIX 4.05 (Belkhir 2000) και FSTAT 2.9.3 (Goudet 1995). Οι περισσότεροι εμφάνισαν μικρό αριθμό αλληλομόρφων στους διαφορετικούς πληθυσμούς. Όσον αφορά στα αλληλόμορφα, ο αριθμός τους ποικίλει από 3 έως 11 ανά τόπο, όπως φαίνεται και στον Πίνακα 2. (Ο πληθυσμός της Βόνιτσας ήταν αυτός που χρησιμοποιήθηκε αρχικά για τη δημιουργία της Γενωμικής Βιβλιοθήκης). -1163-

9 th Symposium on Oceanography & Fisheries, 2009 - Proceedings, Volume ΙΙ Πίνακας 2: Ο αριθμός των αλληλομόρφων για κάθε τόπο σε κάθε πληθυσμό. Πληθυσμοί Τόποι Αχέροντας Μόρνος Λούρος Βόνιτσα Άραχθος Κέρκυρα Πηνειός Aphanius Total VL057 1 2 1 1 2 1 1 2 6 VL059 3 2 3 3 2 1 2-9 VL060 2 8 3 1 1 1 2 1 11 VL061 2 2 1 1 3 1 1 3 7 VL068 2 2 2 2 2 2 2 3 6 VL070 3 2 4 2 3 2 1 1 7 VL072 3 2 2 2 2 2 4 3 6 VL085 2 1 1 1 2 1 1-3 VL103 7 3 4 3 4 3 4 3 11 VL117 3-2 3 2 - - - 6 VL205 1 2 1 2 1 1 1 1 3 Πίνακας 3 : Εκτιμώμενη και παρατηρούμενη ετεροζυγωτία για κάθε πληθυσμό (ο τόπος VL068 εξαιρείται), το ποσοστό των τόπων που είναι πολυμορφικοί (όταν η συχνότητα του πιο συχνού αλληλομόρφου είναι ως 0,99) και Ν ο μέσος αριθμός των αλληλομόρφων ανά τόπο σε κάθε πληθυσμό. Πληθυσμοί H αναμενόμενη H παρατηρούμενη P(0.99) Ν Αχέροντας 0,1816 0,1704 0,80 2,7 Μόρνος 0,2737 0,3488 0,89 2,67 Λούρος 0,1365 0,1377 0,60 2,20 Βόνιτσα 0,1582 0,1500 0,60 1,90 Άραχθος 0,2652 0,2755 0,80 2,2 Κέρκυρα 0,1528 0,2296 0,33 1,44 Πηνειός 0,1761 0,2249 0,44 1,89 Aphanius 0,3036 0,3571 0,57 2,00 Εκ πρώτης όψεως, είναι φανερό ότι σε όλους τους πληθυσμούς οι ετεροζυγώτες είναι σαφώς περισσότεροι απ ότι αναμενόταν θεωρητικά. Αυτό θα μπορούσε να σημαίνει ότι οι πληθυσμοί του V. letourneuxi δεν βρίσκονται σε ισορροπία Hardy Weinberg. Από τις παραπάνω τιμές μπορούν να εξαχθούν συμπεράσματα για τη γενετική διαφοροποίηση μεταξύ των πληθυσμών υπολογίζοντας τις τιμές των F statistics, οι οποίες δείχνουν το βαθμό ομομιξίας μεταξύ ατόμων σε σχέση με τον υπόλοιπο πληθυσμό καθώς και το πλεόνασμα (εάν είναι αρνητική η τιμή) ή το έλλειμμα ετεροζυγωτίας (εάν η τιμή της Fis είναι θετική). Για τους περισσότερους τόπους και πληθυσμούς, το Fis παίρνει αρνητικές τιμές κάτι που υποδηλώνει ότι υπάρχει πλεόνασμα ετεροζυγωτών. Πάντως η στατιστική μελέτη έδειξε ότι όλες οι τιμές δεν είναι στατιστικά σημαντικές, εκτός από την τιμή του τόπου VL115 στον πληθυσμό του Μόρνου. Με τη χρήση του προγράμματος Genetix 4.05 υπολογίστηκαν οι γενετικές αποστάσεις μεταξύ των πληθυσμών κατά Cavalli-Sforza & Edwards (1967). Ενδεικτικά αναφέρουμε ότι εμφανίζονται έντονες διαφοροποιήσεις στις γενετικές αποστάσεις μεταξύ των πληθυσμών του είδους V. letourneuxi. Εισάγοντας τις παραπάνω αποστάσεις στο πρόγραμμα PHYLIP προκύπτει το φυλογενετικό δέντρο της Εικόνας 2. -1164-

9 ο Πανελλήνιο Συμπόσιο Ωκεανογραφίας & Αλιείας 2009 - Πρακτικά, Τόμος ΙΙ Εικ. 2: Φυλογενετικό δέντρο Neighbor-Joining βασισμένο σε γενετικές αποστάσεις Cavalli-Sforza & Edwards (1967). 4. Συζήτηση Όπως ήδη αναφέρθηκε, η προστασία της γενετικής ποικιλότητας είναι θέμα πρώτης προτεραιότητας για την προστασία και διατήρηση των οργανισμών. Το βασικό συμπέρασμα που προκύπτει μελετώντας τις συχνότητες των αλληλομόρφων για τους πληθυσμούς του V. letourneuxi είναι ότι παρουσιάζουν πολύ μικρή γενετική ποικιλότητα, τουλάχιστον για τους τόπους που μελετήθηκαν. Αυτό μπορεί να είναι μια ένδειξη πραγματικής μειωμένης ποικιλότητας. Γνωρίζοντας ότι το συγκεκριμένο είδος είναι κρισίμως κινδυνεύον και οι πληθυσμοί του είναι περιορισμένοι (Barbieri et al., 2000; Das 1985; Kalogianni et al., 2006) αναμένουμε την περιορισμένη γενετική ποικιλότητα που διαπιστώσαμε εδώ. Ένα ακόμα στοιχείο που διαφαίνεται από την παρούσα εργασία είναι ότι οι πληθυσμοί δε βρίσκονται σε ισορροπία Hardy Weinberg για όλους τους γενετικούς τόπους και μάλιστα με πλεόνασμα των ετεροζυγωτών. Αυτό σε συνδυασμό με την περιορισμένη γενετική ποικιλότητα θα μπορούσε να σημαίνει ότι οι πληθυσμοί πέρασαν από μια σχετικά πρόσφατη πληθυσμιακή στενωπό (population bottleneck). Επιπροσθέτως, αν ο πληθυσμός μετά τη στενωπό είναι αρκετά μικρός, η τυχαία γενετική παρέκκλιση (genetic drift) θα προκαλέσει την εξαφάνιση των σπάνιων αλληλομόρφων και άρα θα μειώσει περαιτέρω τη γενετική ποικιλότητα. Μάλιστα σύμφωνα με τους Luikart & Cornuet (1998) το πλεόνασμα των ετεροζυγωτών ίσως να είναι ένας καλός δείκτης για την ύπαρξη του φαινομένου της στενωπού σε έναν πληθυσμό. Μελετώντας τις γενετικές αποστάσεις μεταξύ των πληθυσμών παρατηρείται τέλος μια γεωγραφική συσχέτιση. Το FCA διάγραμμα και το φυλογενετικό δέντρο δείχνουν τρεις κύριες «ομάδες» πληθυσμών. Η ύπαρξη των ομάδων αυτών ίσως να αντανακλά την πιο πρόσφατη γονιδιακή ροή που είχαν οι πληθυσμοί μιας ομάδας σε σχέση με τους πληθυσμούς άλλων ομάδων. Ένα ακόμα συμπέρασμα είναι επίσης η δυνατότητα χρήσης μοριακών δεικτών και γενετικών τόπων σε συγγενικά είδη, όπως το A. fasciatus, με αντίστοιχη απόκριση. 5. Βιβλιογραφικές Αναφορές Avise, J.C., 1994. Molecullar Markers, Natural History and Evolution. Chapman & Hall, London. Barbieri, R., Daoulas, Ch., Psarras, Th., Stoumboudi, M.Th. & Economou, A.N., 2000. The biology and ecology of V. letourneuxi Sauvage 1880 (Valenciidae) prospects for conservation. Mediterranean Marine Science, 1(2): 75 90. Barbieri, R., Stoumboudi, M.Th. & Economou, A.N., 2002. Threatened fishes of the world: Valencia letourneuxi Sauvage, 1880 (Valenciidae). Environmental Biology of Fishes, 65: 46. -1165-

9 th Symposium on Oceanography & Fisheries, 2009 - Proceedings, Volume ΙΙ Belkhir, K. Borsa, P., Chikhi, L., Raufaste, N. & Bonhomme, F., 1996-2004. GENETIX 4.05, logiciel sous Windows TM pour la génétique des populations. Laboratoire Génome, Populations, Interactions, CNRS UMR 5000, Université de Montpellier II, Montpellier (France). Bianco, P.G., Ahnelt, H. & Economidis, P.S., 1996. The freshwater fishes from Eastern and Large Mediterranean Islands with Comments on their safety status. Acta Universitatis Carolinae Biologica, 40: 45-60. Cavalli-Sforza, L.L. & Edwards, A.W.F., 1967. Phylogenetic analysis: models and estimation procedures. Evolution: 550-570. Daoulas, C., 2003. New records of Economidichthys pygmaeus (Holly, 1929) (Gobiidae) and Valencia letourneuxi (Sauvage, 1880) (Valenciidae) in Western Greece. Proceedings of the 11th Panhellenic Ichthyological Congress, Preveza, pp 109-112. Das, J., 1985. On the biology and ecology of Valencia letourneuxi (Sauvage, 1880) (Teleostei, Cyprinodontiformes) in the Aheron-Kokitos-River-Drainage in northwestern Greece. Bonner Zoologische Beitraege. 36: 163 176. Economidis, P.S., 1991. Check list of fresh water fishes of Greece (recent status of threats and protection). Bulletin of the Hellenic Society for the protection of nature, Spec Publ, pp. 48. Goudet, J., 1995. Fstat version 1.2: a computer program to calculate Fstatistics. Journal of Heredity, 86:485-486. Kalogianni, E., Giakoumi, S., Zogaris, S., Barbieri, R., Stoumboudi, M.Th., Zimmerman, B. & Economou, A.N., 2006. Population Decline of the Endangered Fish Species Valencia letourneuxi In Western Greece Strategies for Conservation. 1st European Congress of Conservation Biology, Book of Abstracts, p. 520. Kottelat, M. & Freyhof, J., 2007. Handbook of European freshwater fishes. Kottelat, Cornol, Switzerland & Freyhof, Berlin, Germany (Eds), Kottelat Publ., 646 pp. Luikart, G., & Cornuet, J.M., 1998. Empirical evaluation of a test for identifying recently bottlenecked populations from allele frequency data. Conservation Biology, 13: 523-530. Mcneely, J. A., Miller, K. R., Reid, W.V., Mittermeier, R. A. & Werner, T. B., 1990. Conserving the World s Biological Diversity. IUCN, World Resources Institute, Conservation International, WWF-US and the World Bank, Washington, DC. Miller, S.A., Dykes, D.D. & Polesky, H.F., 1988. A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic Acids Research, 16:1215. Tsigenopoulos, C.S., Hellemans, B., Chistiakov, D.A., Libertini, A., Kotoulas, G. & Volckaert, F., 2003. Eleven new microsatellites of the sea bass (Dicentrarchus labrax L.). Molecular Ecology Notes, 3: 352 354. -1166-