artus CT/ QS-RGQ Kit Χαρακτηριστικά απόδοσης artus CT/ QS-RGQ Kit, Έκδοση 1, 4569365 Διαχείριση έκδοσης Το παρόν έγγραφο είναι τα Χαρακτηριστικά απόδοσης του κιτ artus CT/ QS-RGQ, Έκδοση 1, R2. Ελέγξτε την διαθεσιμότητα νέων ηλεκτρονικών αναθεωρήσεων επισήμανσης στη διεύθυνση www.qiagen.com/products/artusctngqsrgqkitce.aspx προτού εκτελέσετε τον έλεγχο. Η τρέχουσα κατάσταση αναθεώρησης υποδεικνύεται από την ημερομηνία έκδοσης (μορφή: μήνας/έτος). Όριο ανίχνευσης επιχρίσματα Το όριο ανίχνευσης (LOD) όσον αφορά στον καθαρισμό αξιολογήθηκε για το κιτ artus CT/ QS-RGQ με χρήση CT/-θετικών κλινικών δειγμάτων σε συνδυασμό με την εκχύλιση στο όργανο QIAsymphony SP. Για επιχρίσματα στο μέσο μεταφοράς enat (Copan, Ιταλία), το όριο ανίχνευσης όσον αφορά στον καθαρισμό του κιτ artus CT/ QS-RGQ προσδιορίστηκε με χρήση μιας σειράς αραιώσεων κυττάρων C. trachomatis (CT) και N. gonorrhoeae () (DSMZ) από 14,5 έως ονομαστική τιμή 0,0145 EB/ml (CT) και 35,3 έως ονομαστική τιμή 0,0112 cfu/ml () με εμβολιασμό σε μέσο enat. Αυτά τα δείγματα υποβλήθηκαν σε εκχύλιση DNA με χρήση του κιτ QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi σε συνδυασμό με το πρωτόκολλο Complex400_DSP (όγκος εκχύλισης: 400 µl, όγκος έκλουσης: 60 µl). Καθεμιά από τις 9 (10 για ) αραιώσεις αναλύθηκε με το κιτ artus CT/ QS-RGQ σε 4 διαφορετικές ημέρες, σε 4 εκτελέσεις με 9 αντίγραφα έκαστη. Τα αποτελέσματα καθορίστηκαν μέσω ανάλυσης probit. Μια γραφική αναπαράσταση της ανάλυσης probit παρουσιάζεται στις Εικόνες 1 και 2. Το όριο ανίχνευσης όσον αφορά στον καθαρισμό του κιτ artus CT/ QS-RGQ σε συνδυασμό με το Rotor-Gene Q είναι 5 EB/ml (p = 0,05) για C. trachomatis και 3 cfu/ml (p = 0,05) για N. gonorrhoeae. Αυτό συνεπάγεται ότι υπάρχει 95% πιθανότητα ανίχνευσης 5 EB/ml και 3 cfu/ml, αντίστοιχα. Μάρτιος 2014 Sample & Assay Technologies
Εικόνα 1. Ανάλυση probit: επιχρίσματα, C. trachomatis. Όριο ανίχνευσης όσον αφορά στον καθαρισμό (enat, με χρήση του κιτ QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi) του κιτ artus CT/ QS-RGQ στο Rotor-Gene Q. Εικόνα 2. Ανάλυση probit: επιχρίσματα, N. gonorrhoeae. Όριο ανίχνευσης όσον αφορά στον καθαρισμό (enat, με χρήση του κιτ QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi) του κιτ artus CT/ QS-RGQ στο Rotor-Gene Q. Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 2 από 22
Ειδικότητα επιχρίσματα Η ειδικότητα του κιτ artus CT/ QS-RGQ διασφαλίζεται κατά κύριο λόγο από την επιλογή των εκκινητών και των ανιχνευτών, καθώς και από την τήρηση αυστηρών συνθηκών για την αντίδραση. Οι εκκινητές και οι ανιχνευτές ελέγχθηκαν ως προς πιθανές ομολογίες με όλες τις δημοσιευμένες ακολουθίες σε δημόσιες βάσεις δεδομένων ακολουθιών μέσω ανάλυσης σύγκρισης ακολουθιών. Η ανιχνευσιμότητα όλων των σχετικών γονότυπων διασφαλίστηκε με ευθυγράμμιση βάσης δεδομένων και μία εκτέλεση PCR σε όργανα Rotor-Gene με τα ακόλουθα στελέχη/οροποικιλίες (Πίνακας 1). Πίνακας 1. Εξέταση της ειδικότητας για σχετικά στελέχη CT Εσωτερικός Αριθμός μάρτυρας ATCC * Όνομα Green) Orange) Yellow) VR-1477 Chlamydia trachomatis + + VR-346 Chlamydia trachomatis τράχωμα τύπος F + + VR-348B Chlamydia trachomatis τράχωμα τύπος E + + VR-886 Chlamydia trachomatis + + VR-902B Chlamydia trachomatis + + VR-1500 Chlamydia trachomatis + + VR-901B Chlamydia trachomatis LGV + + VR-577 Chlamydia trachomatis LGV II + + VR-903 Chlamydia trachomatis LGV III + + VR-571B VR-573 VR-347 Chlamydia trachomatis ορότυπος τραχώματος a Chlamydia trachomatis ορότυπος τραχώματος b Chlamydia trachomatis ορότυπος τραχώματος ba + + + + + + * American Type Culture Collection. Ο πίνακας συνεχίζεται στην επόμενη σελίδα Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 3 από 22
Πίνακας 1. Συνέχεια CT Εσωτερικός Αριθμός μάρτυρας ATCC* Όνομα Green) Orange) Yellow) VR-878 VR-879 VR-880 VR-887 VR-885 Chlamydia trachomatis ορότυπος τραχώματος g Chlamydia trachomatis ορότυπος τραχώματος h Chlamydia trachomatis ορότυπος τραχώματος i Chlamydia trachomatis ορότυπος τραχώματος k Chlamydia trachomatis ορότυπος τραχώματος d + + + + + + + + + + 53420 Neisseria gonorrhoeae + + 53421 Neisseria gonorrhoeae + + 53422 Neisseria gonorrhoeae + + 53423 Neisseria gonorrhoeae + + 53424 Neisseria gonorrhoeae + + 53425 Neisseria gonorrhoeae + + 700717 Neisseria gonorrhoeae + + 700718 Neisseria gonorrhoeae + + 700719 Neisseria gonorrhoeae + + 700825 Neisseria gonorrhoeae + + BAA-1833 Neisseria gonorrhoeae + + BAA-1838 Neisseria gonorrhoeae + + * American Type Culture Collection. Ο πίνακας συνεχίζεται στην επόμενη σελίδα Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 4 από 22
Πίνακας 1. Συνέχεια CT Εσωτερικός Αριθμός μάρτυρας ATCC* Όνομα Green) Orange) Yellow) BAA-1839 Neisseria gonorrhoeae + + BAA-1840 Neisseria gonorrhoeae + + BAA-1841 Neisseria gonorrhoeae + + BAA-1842 Neisseria gonorrhoeae + + BAA-1843 Neisseria gonorrhoeae + + BAA-1844 Neisseria gonorrhoeae + + BAA-1845 Neisseria gonorrhoeae + + BAA-1847 Neisseria gonorrhoeae + + 9793 Neisseria gonorrhoeae + + 9826 Neisseria gonorrhoeae + + 9827 Neisseria gonorrhoeae + + 9828 Neisseria gonorrhoeae + + 9830 Neisseria gonorrhoeae + + 10150 Neisseria gonorrhoeae + + 10874 Neisseria gonorrhoeae + + 11688 Neisseria gonorrhoeae + + 11689 Neisseria gonorrhoeae + + 19088 Neisseria gonorrhoeae + + 19424 Neisseria gonorrhoeae + + 19999 Neisseria gonorrhoeae + + * American Type Culture Collection. Ο πίνακας συνεχίζεται στην επόμενη σελίδα Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 5 από 22
Πίνακας 1. Συνέχεια CT Εσωτερικός Αριθμός μάρτυρας ATCC* Όνομα Green) Orange) Yellow) 21823 Neisseria gonorrhoeae + + 23050 Neisseria gonorrhoeae + + 31356 Neisseria gonorrhoeae + + 31397 Neisseria gonorrhoeae + + 31398 Neisseria gonorrhoeae + + 31399 Neisseria gonorrhoeae + + 31400 Neisseria gonorrhoeae + + 31401 Neisseria gonorrhoeae + + 31402 Neisseria gonorrhoeae + + 31403 Neisseria gonorrhoeae + + 31404 Neisseria gonorrhoeae + + 31405 Neisseria gonorrhoeae + + 31406 Neisseria gonorrhoeae + + 31407 Neisseria gonorrhoeae + + 31426 Neisseria gonorrhoeae + + 43069 Neisseria gonorrhoeae + + 49226 Neisseria gonorrhoeae + + 49498 Neisseria gonorrhoeae + + 49981 Neisseria gonorrhoeae + + 51109 Neisseria gonorrhoeae + + * American Type Culture Collection. Εκτός αυτού, η ειδικότητα επαληθεύτηκε με 30 διαφορετικά CT/-αρνητικά κλινικά δείγματα επιχρίσματος. Κανένα από αυτά τα δείγματα δεν παρήγαγε σήμα με τους ειδικούς για CT/ εκκινητές και ανιχνευτές, που περιλαμβάνονται στο CT/ RG Master. Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 6 από 22
Ελέγχθηκε μία πιθανή διασταυρούμενη αντιδραστικότητα του κιτ artus CT/ QS-RGQ με χρήση της ομάδας μαρτύρων που παρατίθεται στον Πίνακα 2. Κανένα από τα παθογόνα που ελέγχθηκαν δεν ήταν αντιδραστικό. Πίνακας 2. Έλεγχος της ειδικότητας του κιτ με δυνητικώς διασταυρούμενα αντιδρώντα παθογόνα CT Εσωτερικός Αριθμός μάρτυρας ATCC* Όνομα Green) Orange) Yellow) 14987 Acinetobacter calcoaceticus + 17925 Acinetobacter lwoffii + 10048 Actinomyces israelii + 7965 Aeromonas hydrophila + 8750 Alcaligenes faecalis + 6051 Bacillus subtilis + 753 Candida albicans + 2001 Candida glabrata + 750 Candida tropicalis + VR-1310 Chlamydia pneumoniae + 8090 Citrobacter freundii + 2344 Cryptococcus neoformans + VR-538 Κυτταρομεγαλοϊός + 13047 Enterobacter cloacae + 19433 Enterococcus faecalis + 19434 Enterococcus faecium + 11775 Escherichia coli + * American Type Culture Collection. Ο πίνακας συνεχίζεται στην επόμενη σελίδα Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 7 από 22
Πίνακας 2. Συνέχεια CT Εσωτερικός Αριθμός μάρτυρας ATCC* Όνομα Green) Orange) Yellow) 14018 Gardnerella vaginalis + 10379 Gemella haemolysans + 33940 Haemophilis ducreyi + 9006 Haemophilus influenzae + VR-260 Ιός του απλού έρπητα 1 + VR-540 Ιός του απλού έρπητα 2 + 45113 HPV τύπος 16 + 45152 HPV τύπος 18 + 23330 Kingella kingae + 4356 Lactobacillus acidophilus + 14869 Lactobacillus brevis + 25258 Lactobacillus jensenii + 10973 Moraxella osloensis + 25830 Morganella morganii + 23114 Mycoplasma hominis + 14685 Neisseria cinerea + 25295 29315 49377 Neisseria elongata υποείδος elongata Neisseria elongata υποείδος glycolytica Neisseria elongata υποείδος nitroreducens + + + * American Type Culture Collection. Ο πίνακας συνεχίζεται στην επόμενη σελίδα Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 8 από 22
Πίνακας 2. Συνέχεια CT Εσωτερικός Αριθμός μάρτυρας ATCC* Όνομα Green) Orange) Yellow) 14221 Neisseria flava + 13120 Neisseria flavescens + 23970 Neisseria lactamica + 23971 Neisseria lactamica + 23972 Neisseria lactamica + 49142 Neisseria lactamica + 13077 Neisseria meningitidis + 13102 Neisseria meningitidis + 13113 Neisseria meningitidis + 35558 Neisseria meningitidis + 35560 Neisseria meningitidis + 35561 Neisseria meningitidis + 35562 Neisseria meningitidis + 43744 Neisseria meningitidis + 43828 Neisseria meningitidis + 53415 Neisseria meningitidis + 17937 Neisseria meningitidis παραλλαγή L-φάσης + 10555 Neisseria perflava + 43768 Neisseria polysaccharea + 9913 Neisseria sicca + * American Type Culture Collection. Ο πίνακας συνεχίζεται στην επόμενη σελίδα Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 9 από 22
Πίνακας 2. Συνέχεια CT Εσωτερικός Αριθμός μάρτυρας ATCC* Όνομα Green) Orange) Yellow) 29193 Neisseria sicca + 29256 Neisseria sicca + 29259 Neisseria sicca + 49275 Neisseria subflava + 27337 Peptostreptococcus anaerobius + 6919 Propionibacterium acnes + 29906 Proteus mirabilis + 29914 Providencia stuartii + 10145 Pseudomonas aeruginosa + 14028 Salmonella typhimurium + 6538 Staphylococcus aureus + 12228 Staphylococcus epidermidis + 13813 Streptococcus agalactiae + 49456 Streptococcus mitis + 25175 Streptococcus mutans + 49619 Streptococcus pneumoniae + 23345 Streptomyces griseus + 30001 Trichomonas vaginalis + 27618 Ureaplasma urealyticum + 17802 Vibrio parahaemolyticus + 9610 Yersinia enterocolitica + * American Type Culture Collection. Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 10 από 22
Ανθεκτικότητα επιχρίσματα Η επικύρωση της ανθεκτικότητας επιτρέπει τον καθορισμό του συνολικού ποσοστού αποτυχίας του κιτ artus CT/ QS-RGQ. Για την επικύρωση της ανθεκτικότητας, εμβολιάσθηκαν 30 CT/αρνητικά δείγματα επιχρίσματος με 15 EB/ml υλικού C. trachomatis και 8 cfu/ml υλικού N. gonorrhoeae (περίπου τριπλάσια συγκέντρωση από το όριο ανίχνευσης). Ύστερα από εκχύλιση DNA με χρήση του κιτ QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi σε συνδυασμό με το πρωτόκολλο Complex400_DSP (όγκος εκχύλισης: 400 ml, όγκος έκλουσης: 60 µl), τα δείγματα αυτά αναλύθηκαν με το κιτ artus CT/ QS-RGQ. Επιπλέον, η ανθεκτικότητα του εσωτερικού μάρτυρα αξιολογήθηκε με καθαρισμό και ανάλυση των 30 εμβολιασμένων δειγμάτων επιχρίσματος. Δεν παρατηρήθηκαν αναστολές. Για το λόγο αυτό, η ανθεκτικότητα του κιτ artus CT/ QS RGQ είναι 99%. Όριο ανίχνευσης ούρα, 400 µl Για τα ούρα, το όριο ανίχνευσης (LOD) όσον αφορά στον καθαρισμό αξιολογήθηκε για το κιτ artus CT/ QS-RGQ με χρήση μιας σειράς αραιώσεων κυττάρων CT και (DSMZ) από 45,8 έως ονομαστική τιμή 0,0458 EB/ml (CT) και 11,2 έως ονομαστική τιμή 0,0112 cfu/ml με εμβολιασμό σε δείγματα ούρων που περιέχουν enat ως παράγοντα σταθεροποίησης (1 μέρος enat προς 2 μέρη ούρων προσομοιώνοντας ένα δείγμα ούρων σε ένα σωληνάριο enat που περιέχει 2 ml enat, Copan, αρ. καταλ. 606C). Αυτά τα δείγματα υποβλήθηκαν σε εκχύλιση DNA με χρήση του κιτ QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi σε συνδυασμό με το πρωτόκολλο Complex400_DSP (όγκος εκχύλισης: 400 µl, όγκος έκλουσης: 60 µl). Καθεμιά από τις 9 αραιώσεις αναλύθηκε με το κιτ artus CT/ QS-RGQ σε 4 διαφορετικές ημέρες, σε 4 εκτελέσεις για CT και 6 εκτελέσεις για με 9 αντίγραφα έκαστη. Τα αποτελέσματα καθορίστηκαν μέσω ανάλυσης probit. Μια γραφική αναπαράσταση της ανάλυσης probit παρουσιάζεται στις Εικόνες 3 και 4. Το όριο ανίχνευσης όσον αφορά στον καθαρισμό του κιτ artus CT/ QS-RGQ σε συνδυασμό με το Rotor-Gene Q είναι 7,65 EB/ml (p = 0,05) για C. trachomatis και 6,89 cfu/ml (p = 0,05) για N. gonorrhoeae. Αυτό συνεπάγεται ότι υπάρχει 95% πιθανότητα ανίχνευσης 7,65 EB/ml και 6,89 cfu/ml, αντίστοιχα. Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 11 από 22
Εικόνα 3. Ανάλυση probit: ούρα, C. trachomatis. Όριο ανίχνευσης όσον αφορά στον καθαρισμό (ούρα με enat, με χρήση του κιτ QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi) του κιτ artus CT/ QS-RGQ στο Rotor-Gene Q. Εικόνα 4. Ανάλυση probit: ούρα, N. gonorrhoeae. Όριο ανίχνευσης όσον αφορά στον καθαρισμό (ούρα με enat, με χρήση του κιτ QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi) του κιτ artus CT/ QS-RGQ στο Rotor-Gene Q. Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 12 από 22
Ειδικότητα ούρα, 400 µl Η ειδικότητα του κιτ artus CT/ QS-RGQ διασφαλίζεται κατά κύριο λόγο από την επιλογή των εκκινητών και των ανιχνευτών, καθώς και από την τήρηση αυστηρών συνθηκών για την αντίδραση. Οι εκκινητές και οι ανιχνευτές ελέγχθηκαν ως προς πιθανές ομολογίες με όλες τις δημοσιευμένες ακολουθίες σε δημόσιες βάσεις δεδομένων ακολουθιών μέσω ανάλυσης σύγκρισης ακολουθιών. Η ανιχνευσιμότητα όλων των σχετικών γονότυπων διασφαλίστηκε με ευθυγράμμιση βάσης δεδομένων και μία εκτέλεση PCR σε όργανα Rotor-Gene με τα στελέχη/οροποικιλίες που παρατίθενται στον Πίνακα 1 (που αρχίζει στη σελίδα 3). Εκτός αυτού, η ειδικότητα επαληθεύτηκε με περισσότερα από 100 CT/-αρνητικά δείγματα ούρων. Κανένα από αυτά τα δείγματα δεν παρήγαγε σήμα με τους ειδικούς για CT/ εκκινητές και ανιχνευτές, που περιλαμβάνονται στο CT/ RG Master. Ελέγχθηκε μία πιθανή διασταυρούμενη αντιδραστικότητα του κιτ artus CT/ QS-RGQ με χρήση της ομάδας μαρτύρων που παρατίθεται στον Πίνακα 2 (που αρχίζει στη σελίδα 7). Κανένα από τα παθογόνα που ελέγχθηκαν δεν ήταν αντιδραστικό. Ανθεκτικότητα ούρα, 400 µl Η επικύρωση της ανθεκτικότητας επιτρέπει τον καθορισμό του συνολικού ποσοστού αποτυχίας του κιτ artus CT/ QS-RGQ. Για την επικύρωση της ανθεκτικότητας, εμβολιάσθηκαν 100 CT/-αρνητικά δείγματα ούρων με 23 EB/ml υλικού C. trachomatis και 20 cfu/ml υλικού N. gonorrhoeae (περίπου τριπλάσια συγκέντρωση από το όριο ανίχνευσης). Ύστερα από εκχύλιση DNA με χρήση του κιτ QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi σε συνδυασμό με το πρωτόκολλο Complex400_DSP (όγκος εκχύλισης: 400 µl, όγκος έκλουσης: 60 µl), τα δείγματα αυτά αναλύθηκαν με το κιτ artus CT/ QS-RGQ. Επιπλέον, η ανθεκτικότητα του εσωτερικού μάρτυρα αξιολογήθηκε με καθαρισμό και ανάλυση των 100 εμβολιασμένων δειγμάτων ούρων. Δεν παρατηρήθηκαν αναστολές. Για το λόγο αυτό, η ανθεκτικότητα του κιτ artus CT/ QS-RGQ είναι 99%. Ακρίβεια Τα δεδομένα ακρίβειας του κιτ artus CT/ QS-RGQ επιτρέπουν τη δυνατότητα καθορισμού της ολικής διακύμανσης του προσδιορισμού. Η ολική διασπορά αποτελείται από τη μεταβλητότητα εντός του προσδιορισμού (μεταβλητότητα πολλαπλών αποτελεσμάτων δειγμάτων της ίδιας συγκέντρωσης, στα πλαίσια ενός πειράματος), τη μεταβλητότητα μεταξύ διαφορετικών προσδιορισμών (μεταβλητότητα πολλαπλών αποτελεσμάτων του προσδιορισμού που παρήχθησαν σε διαφορετικά όργανα του ίδιου τύπου από διαφορετικούς χειριστές εντός του ίδιου εργαστηρίου) και τη μεταβλητότητα μεταξύ των παρτίδων (μεταβλητότητα πολλαπλών αποτελεσμάτων του προσδιορισμού με χρήση περισσότερων παρτίδων). Τα ληφθέντα δεδομένα χρησιμοποιήθηκαν για τον καθορισμό της τυπικής απόκλισης (ΤΑ), της διασποράς και του συντελεστή διακύμανσης (ΣΔ) για το ειδικό παθογόνο και την PCR εσωτερικού μάρτυρα. Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 13 από 22
Τα αναλυτικά δεδομένα ακρίβειας του κιτ artus CT/ QS-RGQ Kit συλλέχθηκαν με χρήση των δειγμάτων και συγκεντρώσεων που παρουσιάζονται στους Πίνακες 3 και 4. Η δοκιμασία εκτελέστηκε με 9 αντίγραφα. Τα δεδομένα ακρίβειας υπολογίστηκαν με βάση τις τιμές C T των καμπυλών ενίσχυσης (C T: κύκλος κατωφλίου, βλ. Πίνακα 5). Με βάση αυτά τα αποτελέσματα, η γενική στατιστική διασπορά οποιουδήποτε δείγματος με την αναφερθείσα συγκέντρωση παρουσιάζεται στους Πίνακες 5 7. Αυτές οι τιμές βασίζονται στο σύνολο όλων των μεμονωμένων τιμών της καθορισμένης μεταβλητότητας. Πίνακας 3. Δείγματα και συγκεντρώσεις C. trachomatis που χρησιμοποιούνται για τα πειράματα ακρίβειας Μήτρα Ούρα και enat enat Συγκέντρωση 0,316 EB/ml 0,100 EB/ml Πίνακας 4. Δείγματα και συγκεντρώσεις N. gonorrhoeae που χρησιμοποιούνται για τα πειράματα ακρίβειας Μήτρα Ούρα και enat enat Συγκέντρωση 10 cfu/ml 10 cfu/ml Πίνακας 5. Ολική διασπορά και στατιστική διασπορά C. trachomatisκαι για τους δύο τύπους δείγματος Μήτρα Συγκέντρωση (EB/ml) Διασπορά ΣΔ (%) Ούρα και enat 0,316 0,42 1,90 enat 0,1 0,79 2,51 Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 14 από 22
Πίνακας 6. Ολική διασπορά και στατιστική διασπορά N. gonorrhoeae και για τους δύο τύπους δείγματος Μήτρα Συγκέντρωση (cfu/ml) Διασπορά ΣΔ (%) Ούρα και enat 10 0,96 3,06 enat 10 0,40 2,00 Πίνακας 7. Ολική διασπορά και στατιστική διασπορά εσωτερικού μάρτυρα και για τους δύο τύπους δείγματος Μήτρα Διασπορά ΣΔ (%) Ούρα και enat 0,16 1,37 enat 0,13 1,26 Πίνακας 8. Δεδομένα ακρίβειας για C. trachomatis, ούρα και enat, με βάση τις τιμές C T 0,316 EB/ml ούρα και enat Τιμή C T ΤΑ ΣΔ (%) Μεταβλητότητα εντός του προσδιορισμού: Σήμα CT Μεταβλητότητα εντός του προσδιορισμού: εσωτερικός μάρτυρας 33,69 0,47 1,39 28,32 0,15 0,51 Μεταβλητότητα μεταξύ προσδιορισμών: Σήμα CT 33,92 0,59 1,74 Μεταβλητότητα μεταξύ προσδιορισμών: εσωτερικός μάρτυρας 28,67 0,31 1,07 Μεταβλητότητα μεταξύ παρτίδων: Σήμα CT 34,31 0,66 1,91 Μεταβλητότητα μεταξύ παρτίδων: εσωτερικός μάρτυρας 28,72 0,29 1,01 Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 15 από 22
Πίνακας 9. Δεδομένα ακρίβειας για C. trachomatis, enat, με βάση τις τιμές C T 0,1 EB/ml enat Τιμή C T ΤΑ ΣΔ (%) Μεταβλητότητα εντός του προσδιορισμού: Σήμα CT Μεταβλητότητα εντός του προσδιορισμού: εσωτερικός μάρτυρας 34,90 0,55 1,58 28,81 0,08 0,29 Μεταβλητότητα μεταξύ προσδιορισμών: Σήμα CT 35,14 0,56 1,61 Μεταβλητότητα μεταξύ προσδιορισμών: εσωτερικός μάρτυρας 28,73 0,21 0,73 Μεταβλητότητα μεταξύ παρτίδων: Σήμα CT 35,87 1,01 2,81 Μεταβλητότητα μεταξύ παρτίδων: εσωτερικός μάρτυρας 28,83 0,23 0,79 Πίνακας 10. Δεδομένα ακρίβειας για N. gonorrhoeae, ούρα και enat, με βάση τις τιμές C T 10 cfu/ml ούρα και enat Τιμή C T ΤΑ ΣΔ (%) Μεταβλητότητα εντός του προσδιορισμού: Σήμα Μεταβλητότητα εντός του προσδιορισμού: εσωτερικός μάρτυρας Μεταβλητότητα μεταξύ προσδιορισμών: Σήμα Μεταβλητότητα μεταξύ προσδιορισμών: εσωτερικός μάρτυρας 31,92 0,76 2,38 29,40 0,47 1,61 32,14 0,65 2,03 29,24 0,38 1,30 Μεταβλητότητα μεταξύ παρτίδων: Σήμα 31,84 1,21 3,80 Μεταβλητότητα μεταξύ παρτίδων: εσωτερικός μάρτυρας 28,68 0,28 0,99 Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 16 από 22
Πίνακας 11. Δεδομένα ακρίβειας για N. gonorrhoeae, enat, με βάση τις τιμές C T 10 cfu/ml enat Τιμή C T ΤΑ ΣΔ (%) Μεταβλητότητα εντός του προσδιορισμού: Σήμα Μεταβλητότητα εντός του προσδιορισμού: εσωτερικός μάρτυρας Μεταβλητότητα μεταξύ προσδιορισμών: Σήμα Μεταβλητότητα μεταξύ προσδιορισμών: εσωτερικός μάρτυρας 31,84 0,23 0,72 29,53 0,10 0,33 32,11 0,37 1,16 29,48 0,20 0,67 Μεταβλητότητα μεταξύ παρτίδων: Σήμα 35,87 1,01 2,81 Μεταβλητότητα μεταξύ παρτίδων: εσωτερικός μάρτυρας 28,79 0,22 0,76 Αναπαραγωγιμότητα Ένα μέρος της μελέτης επικύρωσης που διενεργήθηκε με το κιτ artus CT/ QS-RGQ ήταν ένα πείραμα όπου ελέγχθηκε ένας τυποποιημένος πίνακας επάρκειας (παρεχόμενος από την QCMD) με καθορισμένο CT και. Τα αποτελέσματα αυτών των ελέγχων είναι συγκρίσιμα σε υψηλό βαθμό σε όλες τις διαφορετικές θέσεις και ο ΣΔ σε όλα τα κέντρα ήταν <10% σε όλες τις περιπτώσεις. Μεταφορά Η απουσία μεταφοράς (διασταυρούμενης μόλυνσης) μεταξύ δειγμάτων για τη συνολική ροή εργασίας αποδείχθηκε με την ενδεδειγμένη ανίχνευση όλων των γνωστών θετικών και αρνητικών δειγμάτων σε εναλλάξ θέσεις. Προσομοιωμένα δείγματα επιχρίσματος και ούρων εμβολιάστηκαν με πλασμίδια θετικού μάρτυρα σε συγκεντρώσεις 1 x 10 7 αντίγραφα/ml (CT) και 1 x 10 6 αντίγραφα/ml (). Αυτά τα δείγματα υποβλήθηκαν σε επεξεργασία με την πλήρη ροή εργασίας artus CT/. Όλα τα δείγματα ανιχνεύθηκαν σωστά. Αναχαιτιστικές ουσίες Κατά τη διάρκεια της επαλήθευσης, ένα σύνολο δειγμάτων εμβολιασμένων με δυνητικά αναχαιτιστικές ουσίες ελέγχθηκε με το κιτ artus CT/ QS-RGQ. Τα δείγματα και οι επωνυμίες παρατίθενται στον Πίνακα 12. Όλες οι ουσίες ελέγχθηκαν σε δείγματα που περιείχαν κύτταρα CT Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 17 από 22
και στις συγκεντρώσεις 10x LOD. Καμία από τις ουσίες δεν κατέδειξε ανασταλτική επίδραση στα σήματα του εσωτερικού μάρτυρα και στα σήματα των παθογόνων μικροοργανισμών. Πίνακας 12. Ουσίες που ελέγχθηκαν για πιθανή αναστολή Ουσία Τύπος δείγματος Υψηλότερη συγκέντρωση που ελέγχθηκε Acidovir (Rathioparm 50mg/g) Επίχρισμα 0,25% CLOTRIMAZOLE 2% κολπική κρέμα Επίχρισμα 0,25% Monistat - αγωγή 1 δόσης Επίχρισμα 0,25% Gyno-Daktar Kombi (υπόθετο 100 mg) Επίχρισμα 0,25% Antifungol Hexal 3 κολπική κρέμα Επίχρισμα 0,25% Terazol 7 κολπική κρέμα (0,4%) Επίχρισμα 0,25% Yeast gard Επίχρισμα 0,25% Metrogel -Vaginal 0.75% (Galderna) Επίχρισμα 0,25% Betaisodona Lsg. (Mundipharma) Επίχρισμα 0,25% K-Y Jelly (προσωπικό λιπαντικό) Επίχρισμα 0,25% Vagisan FeuchtCreme Combi (υπόθετο) Επίχρισμα 0,25% Vagisan FeuchtCreme Combi (κρέμα) Επίχρισμα 0,25% Ο πίνακας συνεχίζεται στην επόμενη σελίδα Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 18 από 22
Πίνακας 12. Συνέχεια Ουσία Τύπος δείγματος Υψηλότερη συγκέντρωση που ελέγχθηκε Κολπικό λιπαντικό Vagisil Επίχρισμα 0,25% Patentec ωοειδές υπόθετο (Merz) Επίχρισμα 0,25% Norforms αποσμητικά υπόθετα Επίχρισμα 0,25% Hydrocortison Hexal 1% Επίχρισμα 0,25% Βλέννη Επίχρισμα δ/εφαρμ.* Αίμα Επίχρισμα 5% Λευκά αιμοσφαίρια Επίχρισμα 1 x 10 6 κύτταρα/ml Βλέννη Ούρα δ/εφαρμ.* Αίμα Ούρα 5% Λευκά αιμοσφαίρια Ούρα 1 x 10 6 κύτταρα/ml Χολερυθρίνη Ούρα 10 mg/ml Γλυκόζη Ούρα 10 mg/ml Ούρα ph 4 Ούρα δ/εφαρμ.* Ούρα ph 9 Ούρα δ/εφαρμ.* Πρωτεΐνη (λευκωματίνη) από ανθρώπινο ορό Ούρα 5% Σκόνη ταλκ Ούρα 0,15% Υδροχλωρική φαιναζοπυριδίνη Ούρα 3 mg/ml * δ/εφαρμ.: δεν εφαρμόζεται. Αξιολόγηση διαγνωστικής απόδοσης Τα χαρακτηριστικά διαγνωστικής απόδοσης καθορίστηκαν σε μια μελέτη με αναδρομικά συλλεγμένα δείγματα, η οποία πραγματοποιήθηκε στο Tilburg, Ολλανδία. Κατά τη διάρκεια αυτής της μελέτης επικύρωσης, ελέγχθηκαν 612 διαφορετικά δείγματα, τα οποία περιείχαν όλες τις Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 19 από 22
θέσεις δειγματοληψίας και υλικά προς επικύρωση (ούρα [ανδρικά/γυναικεία], ουρηθρικά επιχρίσματα [ανδρικά], τραχηλικά και κολπικά επιχρίσματα). Με τα κλινικά δείγματα που ελέγχθηκαν, το κιτ artus CT/ QS-RGQ κατέδειξε συνολική κλινική ειδικότητα 99,8% και ευαισθησία 98,1% για CT, και 99,8% ειδικότητα και 100% ευαισθησία για, σε σύγκριση με τον προσδιορισμό Abbott CT/ (Πίνακας 13 και Πίνακας 14). Λεπτομερής επισκόπηση της ευαισθησίας και ειδικότητας για τους συγκεκριμένους τύπους δειγμάτων παρουσιάζεται στον Πίνακα 15 και στον Πίνακα 16. Πίνακας 13. Θετικά και αρνητικά δείγματα με κάθε προσδιορισμό (C. trachomatis) Προσδιορισμός Abbott CT/ + Σύνολο artus CT/ QS-RGQ Kit + 103 1 104 2 506 508 Σύνολο 105 507 612 Πίνακας 14. Θετικά και αρνητικά δείγματα με κάθε προσδιορισμό (N. gonorrhoeae) Προσδιορισμός Abbott CT/ + Σύνολο artus CT/ QS-RGQ Kit + 26 1 27 0 585 585 Σύνολο 26 586 612 Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 20 από 22
Πίνακας 15. Κλινική ευαισθησία και ειδικότητα για γυναικεία και ανδρικά δείγματα (C. trachomatis) Δείγμα n TP* FP* TN* FN* Ευαισθησία (%) Ειδικότητα (%) Ούρα 51 9 0 42 0 100,00 100,00 Γυναίκες Άνδρες Τραχηλικό 186 9 0 177 0 100,00 100,00 Κολπικό 49 4 0 45 0 100,00 100,00 Ούρα 309 78 1 231 2 97,50 99,57 Ουρηθρικό 17 5 0 12 0 100,00 100,00 * TP: πραγματικά θετικά δείγματα, FP: ψευδή θετικά δείγματα, TN: πραγματικά αρνητικά δείγματα, FN: ψευδή αρνητικά δείγματα. Πίνακας 16. Κλινική ευαισθησία και ειδικότητα για γυναικεία και ανδρικά δείγματα (N. gonorrhoeae) Δείγμα n TP* FP* TN* FN* Ευαισθησία (%) Ειδικότητα (%) Ούρα 51 3 0 48 0 100,00 100,00 Γυναίκες Άνδρες Τραχηλικό 186 3 1 183 0 100,00 99,46 Κολπικό 49 4 0 45 0 100,00 100,00 Ούρα 309 18 0 291 0 100,00 100,00 Ουρηθρικό 17 2 0 15 0 100,00 100,00 * TP: πραγματικά θετικά δείγματα FP: ψευδή θετικά δείγματα, TN: πραγματικά αρνητικά δείγματα, FN: ψευδή αρνητικά δείγματα. Χαρακτηριστικά απόδοσης: artus CT/ QS-RGQ Kit σελίδα 21 από 22
Για τις τρέχουσες πληροφορίες άδειας και αποποιήσεις σχετικά με συγκεκριμένα προϊόντα, ανατρέξτε στο σχετικό εγχειρίδιο ή οδηγίες χρήσης του κιτ QIAGEN. Τα εγχειρίδια και οι οδηγίες χρήσης των κιτ QIAGEN είναι διαθέσιμα στη διεύθυνση www.qiagen.com. Μπορείτε επίσης να τα ζητήσετε από το Τμήμα τεχνικής εξυπηρέτησης της QIAGEN ή τον τοπικό σας αντιπρόσωπο. Εμπορικά σήματα: QIAGEN, QIAsymphony, artus, Rotor-Gene (QIAGEN Group) Abbott (Abbott Laboratories) ATCC (American Type Culture Collection) Copan, enat (Copan Italia Spa) K-Y, Monistat (Johnson & Johnson) Merz (Merz Pharma GmbH & Co. KGaA), Metrogel (Galderma S.A.) Norforms (C.B. Fleet Investment Corporation) Vagisan (Dr. August Wolff; GmbH & Co. KG Arzneimittel) Vagisil (Combe Incorporated) Yeast Gard (TCF National Bank). HB-1517-D01-002 2013 2014 QIAGEN, με την επιφύλαξη κάθε δικαιώματος. www.qiagen.com France 01-60-920-930 The Netherlands 0800 0229592 Australia 1-800-243-800 Austria 0800/281010 Belgium 0800-79612 Canada 800-572-9613 China 021-51345678 Denmark 80-885945 Finland 0800-914416 Germany 02103-29-12000 Hong Kong 800 933 965 Ireland 1800 555 049 Italy 800 787980 Japan 03-5547-0811 Korea (South) 1544 7145 Luxembourg 8002 2076 Norway 800-18859 Singapore 65-67775366 Spain 91-630-7050 Sweden 020-790282 Switzerland 055-254-22-11 UK 0808-234-3974 USA 800-426-8157 Sample & Assay Technologies