Περιβαλλοντική και Διατροφική Μικροβιολογία

Transcript

1 Περιβαλλοντική και Διατροφική Μικροβιολογία Εισαγωγή στην βιολογική απορρύπανση Βιολογική απορρύπανση ανοργάνων ρύπων Δημήτριος Καρπούζας

2 1. Βιολογική Αποκατάσταση (Bioremediation) α. Βιολογική απορρύπανση ανόργανων ρύπων β. Βιολογική απορρύπανση οργανικών ρύπων 2. Επεξεργασία στερεών και υγρών αγροτικών αποβλήτων Κομποστοποίηση, Βιοκλίνες - Βιοφίλτρα

3 Βιολογική Αποκατάσταση ή Βιολογική Εξυγίανση ή Βιολογική Απορρύπανση

4 Βιολογική Απορρύπανση: Ηχρήσητης μεταβολικής ικανότητας μικροοργανισμών με στόχο την απορρύπανση και αποκατάσταση ρυπασμένων εδαφών, υδροφόρων και λοιπών οικοσυστημάτων

5 Πως προέκυψε η Βιολογική Απορρύπανση? Ανησυχία για την δημόσια υγεία Προστασία και αειφορία του περιβάλλοντος Κόστος απορρύπανσης Καλύπτει μόνο 10-15% της παγκόσμιας αγοράς απορρύπανσης κυρίως λόγω 1) έλλειψης τεχνολογικών υποδομών για αποτελεσματική εφαρμογή και 2) περιορισμένης γνώσης της μικροβιακής οικολογίας σε συστήματα βιολογικής απορρύπανσης

6 Πλεονεκτήματα vs Μειονεκτήματα Βιολογικής Απορρύπανσης

7 Πλεονεκτήματα Βιολογικής Απορρύπανσης Χαμηλό κόστος εφαρμογής σε σχέση με συμβατικές μεθόδους Περιβαλλοντικά φιλική μέθοδος Οδηγεί σε πλήρη απομάκρυνση των ρύπων Ευεργετικές συνέπειες στην σύσταση, δομή και γονιμότητα του εδάφους Τεχνολογία Κόστος (λίρες/m 3 ) Βιολογική απορρύπανση Xημική Καύση Προσρόφηση Απομάκρυνση/Μεταφορά 30-75

8 Μειονεκτήματα Βιολογικής Απορρύπανσης Για αποτελεσματική απορρύπανση απαιτείται η βελτιστοποίηση των θρεπτικών και περιβαλλοντικών συνθηκών που συνήθως απαιτεί σημαντική εργασία, χρόνο και κόστος Οι μικροοργανισμοί ίσως να προτιμούν να χρησιμοποιούν άλλα πιο άμεσα διαθέσιμα υποστρώματα με αποτέλεσμα να μεταβολίζουν τους ρύπους με αργό ρυθμό. Συνεπώς, οι μικροοργανισμοί θα πρέπει να χρησιμοποιούν τους ρύπους για την αύξηση και ανάπτυξη τους αποκομίζοντας ενέργεια από την διάσπαση τους

9 Μειονεκτήματα Βιολογικής Απορρύπανσης Το φυσικό ρυπασμένο περιβάλλον ίσως να περιέχει σημαντικό αριθμό άλλων τοξικών ρύπων ή μίγματα ρύπων που δεν μπορούν να αποδομηθούν βιολογικά αλλά πιθανόν να είναι και τοξικοί για την μικροβιακή κοινότητα του εδάφους Θέματα ασφάλειας, υγείας και περιβαλλοντικά προβλήματα που δημιουργούν προβλήματα στην εφαρμογή των βιολογικών μεθόδων

10 Στρατηγικές βιολογικής απορρύπανσης Βιολογική ενεργοποίηση (Biostimulation) Βιολογική προσθήκη (Βioaugmentation) Προσθήκη καταβολικών ενζύμων (Cell-free extracts) Φυτική Απορρύπανση (Phytoremediation)

11 Βιολογική ενεργοποίηση (Biostimulation) H ενεργοποίηση της ενδογενούς μικροβιακής κοινότητας τους εδάφους ώστε να μεγιστοποιηθεί η αποδομητική της ικανότητα Η εφαρμογή περιλαμβάνει προσθήκη θρεπτικών συστατικών, βελτίωση του αερισμού και διατήρηση της θερμοκρασίας και υγρασίας σε βέλτιστα επίπεδα ώστε να δημιουργηθούν ιδανικές συνθήκες στο μικροπεριβάλλον για την αύξηση και ανάπτυξη των ενδογενών μικροοργανισμών

12 Χρήσεις Βιολογικής Ενεργοποίησης Η συνηθέστερη στρατηγική βιολογικής απορρύπανσης Στηρίζεται στην παρουσία, σε ρυπασμένες περιοχές, μικροοργανισμών που έχουν την ικανότητα να αποδομούν τους ρύπους και να τους χρησιμοποιούν για αύξηση και ανάπτυξη τους Προτιμάται για την απορρύπανση περιοχών που έχουν εκτεθεί σε πολλαπλές χρήσεις και συνεπώς περιέχουν μίγμα διαφόρων ρύπων Σε τέτοιες περιοχές οι ρύποι βρίσκονται συνήθως σε συγκεντρώσεις από μέτριες ως υψηλές και δεν υπάρχει πίεση χρόνου για αποκατάσταση των ρυπασμένων υλικών

13 Βιολογική Προσθήκη (Bioaugmentation) Εμβολιασμός ρυπασμένων υποστρωμάτων με ικανό πληθυσμό μικροοργανισμών που παρουσιάζουν αυξημένη καταβολική ικανότητα με στόχο την επιτάχυνση της αποδόμησης των ρύπων Η προσθήκη καταβολικών μικροοργανισμών χρησιμοποιείται είτε ως επικουρική μέθοδος ώστε να βοηθήσει την αποδομητική δραστηριότητα της ενδογενούς μικροβιακής κοινότητας είτε ως αυτοδύναμη μέθοδος με την προσθήκη σημαντικού πληθυσμού μικροοργανισμών που θα πρέπει να ανταγωνισθούν με την ενδογενή μικροβιακή κοινότητα για χώρο και υποστρώματα

14 Χρήσεις Βιολογικής Προσθήκης Η συγκέντρωση των ρύπων είναι πολύ υψηλή ή πολύ χαμηλή Απαιτείται άμεση απορρύπανση της περιοχής Οι ρύποι είναι ιδιαίτερα τοξικοί Οι ρύποι είναι γενικά υπολειμματικά μόρια ανθεκτικά στην διάσπαση αλλά βιοδιαθέσιμα Διαπιστωμένη απουσία ενδογενών μικροοργανισμών που μπορούν να επιφέρουν διάσπαση των ρύπων

15 Προέλευση εξωγενών μικροοργανισμών Ενδογενείς μικροοργανισμοί οι οποίοι έχουν απομονωθεί απότορυπασμένοέδαφος Εξωγενείς μικροοργανισμοί ή κοινότητες μικροοργανισμών (consortia) που έχουν απομονωθεί από άλλο έδαφος ή περιβάλλον Ενδογενείς ή εξωγενείς μικροοργανισμοί που έχουν γενετικώς τροποποιηθεί για την διάσπαση των ρύπων

16 Ιδανικοί Μικροοργανισμοί για χρήση στην βιολογική απορρύπανση Υψηλή αποδομητική ικανότητα Μικρή υπολειμματικότητα στο έδαφος Αυξημένη κινητικότητα Ανθεκτικοί σε αντίξοες περιβαλλοντικές συνθήκες Χαμηλό κόστος μαζικής παραγωγής και εφαρμογής τους Ευρύ φάσμα αποδομητικής ικανότητας

17 Προβλήματα Βιολογικής Προσθήκης Γενικά ο εμβολιασμός ρυπασμένων περιβαλλοντικών υποστρωμάτων με αποδομητικούς μικροοργανισμούς δεν έχει στεφτεί πάντα με επιτυχία κυρίως λόγω της ταχύτατης μείωσης του πληθυσμού του εμβολίου λόγω κυρίως ανταγωνισμού για χώρο και θρεπτικά στοιχεία με την προσαρμοσμένη ολιγοτροφική ενδογενή μικροβιακή κοινότητα

18 Προσθήκη Καταβολικών Ενζύμων Τα προβλήματα εφαρμογής που παρουσιάζουν οι βιολογικές μέθοδοι απορρύπανσης όπου προστίθενται αυτούσιοι μικροοργανισμοί μπορούν να λυθούν με την εφαρμογή ενζύμων (cell-free extracts) Ενζυμικά καταβολικά συστήματα εξειδικευμένα στην αποδόμηση οργανικών ρύπων έχουν απομονωθεί από πλήθος μικροοργανισμών και η πειραματική εφαρμογή τους για την απορρύπανση εδαφών έχει παρουσιάσει ικανοποιητικά αποτελέσματα Βασικό πρόβλημα η έλλειψη μεθόδων και τεχνολογιών εφαρμογής ώστε να μεγιστοποιηθεί η επαφή των ενζύμων με το υπόστρωμα-ρύπο στο περιβάλλον

19 Ποιους ρύπους θέλουμε να απομακρύνουμε; Ανόργανους Ρύπους Οργανικούς Ρύπους

20 Βιολογική απορρύπανση ανόργανων ρύπων

21 Ανόργανοι Περιβαλλοντικοί Ρύποι Μέταλλα Ανιόντα Ραδιενεργά μέταλλα

22 Το βασικότερο πρόβλημα που έχει να αντιμετωπίσει η βιολογική απορρύπανση είναι η ανθεκτικότητα των μετάλλων στην μικροβιακή διάσπαση με συνέπεια οι μικροοργανισμοί να έχουν αναπτύξει άλλους μηχανισμούς για την απομάκρυνση τους

23 Βιολογική Απομάκρυνση Ανιόντων NO 3 και PO 4 Η απομάκρυνση ΝΟ 3 περιλαμβάνει κυρίως την διεργασία της απονιτροποίησης Η απομάκρυνση των PO 4 περιλαμβάνει διεργασίες συσσώρευσης φωσφορικών ιόντων σε μικροβιακά κύτταρα με την μορφή πολυφωσφορικών πολυμερών

24 Απονιτροποίηση H διεργασία κατά την οποία NO 3- ανάγονται υπό αναεροβικές συνθήκες προς ΝΟ, Ν 2 Ο, Ν 2 και ελευθερώνονται στην ατμόσφαιρα 2ΝΟ 3-2ΝΟ 2-2ΝΟ Ν 2 Ο Ν 2

25 Απονιτροποίηση Βιολογική απομάκρυνση ΝΟ 3 Η απονιτροποίηση πραγματοποιείται από ετερότροφα βακτήρια που παράγουν ΑΤΡ κατά την μεταφορά e - μέσω της κυτοχρωμικής αλυσίδας από ένα δότη e - σε ΝΟ - 3 Thiobacillus sp. Pseudomonas sp. Paracoccus denitrificans Thiosphaera pantotropha

26 Εφαρμογές Βιολογική απομάκρυνση ΝΟ 3 Παραδοσιακά, η απονιτροποίηση βρίσκει εφαρμογή στην επεξεργασία υγρών αποβλήτων που περιέχουν υψηλές συγκεντρώσεις ΝΟ 3 Εφαρμογή ανοξικών ζωνών ή δεξαμενών στην βιολογική επεξεργασία αποβλήτων και προσθήκη οργανικών υποστρωμάτων ως δότες ηλεκτρονίων (μεθανόλη, οξικό οξύ) οδηγούν στην απομάκρυνσης ΝΟ 3 απόταυγράαπόβλητα

27 Βιολογική Απομάκρυνση Φωσφόρου Διαδικασία που χρησιμοποιείται στην απομάκρυνση φωσφορικών από υγρά απόβλητα και περιλαμβάνει την πρόσληψη και συσσώρευση από εξειδικευμένα βακτήρια φωσφορικών με την μορφή πολυφωσφορικών κόκκων στο εσωτερικό του κυττάρου ή εξωκυτταρικών πολυμερών

28 Βιολογική Απομάκρυνση Φωσφόρου Tα βακτήριαυπό αεροβικές συνθήκες και παρουσία πηγών C συσσωρεύουν φωσφορικά υπό την μορφή πολυφωσφορικών (ως και 10 4 μονομερή) Υπό αναεροβικές συνθήκες τα βακτήρια υδρολύουν τα πολυφωσφορικά για την παραγωγή ΑΤΡ (ενέργειας) με παράλληλη ελευθέρωση των φωσφορικών

29 Βιολογική Απομάκρυνση Μετάλλων Βιοπροσρόφηση (Biosorption)και βιοσυσσώρευση (Bioaccumulation) Αναγωγή (Reduction) Μεθυλίωση (Methylation) Κατακρήμνιση (Precipitation)

30

31 Βιοπροσρόφηση και Βιοσυσσώρευση μετάλλων Αναφέρεται στην παθητική (βιοπροσρόφηση) ήενεργητική (βιοσυσσώρευση) προσρόφηση ή απορρόφηση μετάλλων από τους μικροοργανισμούς Κύρια Χαρακτηριστικά Μπορεί να χρησιμοποιηθεί νεκρή (AlgaSORB ) ήζωντανή μικροβιακή μάζα Τεράστιες διαφορές στην ικανότητα απορρόφησης μετάλλων από τους διάφορους μικροοργανισμούς (εξειδίκευση?)

32

33 Βιοπροσρόφηση και Βιοσυσσώρευση μετάλλων Μηχανισμοί 1. Δημιουργία οργανικών συμπλόκων μεταξύ εξωκυτταρικών πολυμερών που παράγουν οι μικροοργανισμοί και μετάλλων 2. Δέσμευση των κατιόντων μετάλλων στα αρνητικά φορτισμένα συστατικά των κυτταρικών μεμβρανών όπως τειχικό οξύ (θετικά κατά Gram βακτήρια) και στα στρώματα S (θετικά κατά Gram βακτήρια και Αρχαία)

34 Βιοπροσρόφηση και Βιοσυσσώρευση μετάλλων Εφαρμογές Βασική απαίτηση για εμπορική εκμετάλλευση η χρήση φθηνής βιομάζας για την προσρόφηση των μετάλλων Μικροβιακή μάζα που παράγεται σε ζυμώσεις Μικροβιακή μάζα από φύκη Μικροβιακή μάζα από συστήματα επεξεργασίας αποβλήτων

35 Αναγωγή Ι Μικροοργανισμοί έχουν την ικανότητα να ανάγουν μέταλλα και συνήθως αυτό οδηγεί σε μορφές με χαμηλότερη διαλυτότητα και άρα περιορισμένη διαθεσιμότητα των μετάλλων για το περιβάλλον

36 Αναγωγή ΙΙ Οι μικροοργανισμοί αυτοί συνήθως υπό αναεροβικές συνθήκες και παρουσία κάποιου οργανικού μορίου ως δότη ηλεκτρονίων και πηγή C, χρησιμοποιεί τα μέταλλα (η οξειδωμένες τους μορφές) ως τερματικούς δέκτες ηλεκτρονίων για την παραγωγή ενέργειας (ΑΤΡ)

37 Πόσο καλοί τερματικοί δέκτες ηλεκτρονίων είναι τα μέταλλα?

38 Αναγωγή ΙΙΙ Τέτοιοι μικροοργανισμοί είναι: Θειο-αναγωγικά βακτήρια (Desulfovibrio) Μέταλλο-αναγωγικά βακτήρια (Geobacter) Απονιτροποιητικά βακτήρια Μεθανιογόνα βακτήρια

39 Κατακρήμνιση Ι Η ικανότητα διαφόρων μικροοργανισμών να μετατρέπουν διαλυτοποιημένες μορφές μετάλλων σε αδιάλυτες μορφές όπως σουλφίδια (MS) ή σύμπλοκαμεφωσφορικέςομάδες

40 Κατακρήμνιση ΙΙ 1. Υπό αναεροβικές συνθήκες και παρουσία οργανικών υποστρωμάτων τα θείο-αναγωγικά βακτήρια μετατρέπουν διαλυτά μέταλλα ή διαλυτές μορφές μετάλλων προς αδιάλυτα σουλφίδια (MS) 2. Βακτήρια του γένους Citrobacter sp. ή ο μύκητας Pisolithus tinctorius έχει βρεθεί ότι κατέχουν φωσφατάσες που ελευθερώνουν στο περιβάλλον φωσφορικά ιόντα που δημιουργούν αδιάλυτα σύμπλοκα με μέταλλα όπως Cu, Zn

41 Κατακρήμνιση ΙΙI 3. Ορισμένα βακτήρια έχουν την ικανότητα να παράγουν σιδηροφόρες ουσίες οι οποίες δημιουργούν σύμπλοκα με διάφορα μέταλλα Πλουτώνιο (Pu) και με την μορφή αυτή παραλαμβάνονται και συσσωρεύονται

42 Κατακρήμνιση - Εφαρμογές Χρήση τεχνητών υδροβιοτόπων στους οποίους διοχετεύονται υγρά απόβλητα που περιέχουν υψηλές συγκεντρώσεις διαλυτών μετάλλων (αναεροβικό ίζημα + οργανικά υποστρώματα) Βιοαντιδραστήρες που εμβολιάζονται με θειο-αναγωγικά βακτήρια για την αποτοξικοποίηση αποβλήτων πλούσιων σε Cd, Zn, Ni

43 Μεθυλίωση Η μεθυλίωση διαφόρων μετάλλων μπορεί να οδηγήσει σε πιο τοξικά παράγωγα (Ηg) ή σε πτητικά παράγωγα με χαμηλή τοξικότητα που ελευθερώνονται στον αέρα (Se)

44 Σελήνιο - Αναγωγή ΗμετατροπήSeO -2 4, SeO -2 3 σε στοιχειακό Se 0, που είναι δυσδιάλυτο έχει παρατηρηθεί σε διάφορα βακτήρια Βακτήρια χρησιμοποιούν το SeO -2 4 ως τερματικό δέκτη ηλεκτρονίων, αντίθετα η παραπέρα αναγωγή του SeO -2 3 από μικροοργανισμούς είναι μάλλον διεργασία αποτοξικοποίησης και όχι διεργασία παραγωγής ενέργειας

45 Σελήνιο - Αναγωγή Εφαρμογή: ΗαπομάκρυνσηSeO -2 4 από στραγγιστικά νερά με υψηλές συγκεντρώσεις Se. To νερό διοχετεύτηκε σε αναεροβικό βιοαντιδραστήρα που περιείχε πληθυσμό του βακτηρίου Thauera selenatis. Η επεξεργασία αυτή οδήγησε σε μετατροπή του 98% της ποσότητας του SeO -2 4 στο μη τοξικό Se 0

46 Σελήνιο - Μεθυλίωση Μικροβιακή μεθυλίωση Se προς πτητικά και λιγότερα τοξικά προϊόντα όπως διμέθυλο σελίνιο (CH 3 SeCH 3 ) έχει παρατηρηθεί σε αρκετά βακτήρια, φύκη και μύκητες Tο διμεθυλοσελίνιο σχηματίζει στο αέρα οξειδωμένα παράγωγα που δεσμεύονται σε σωματίδια και μεταφέρονται σε μεγάλες αποστάσεις Το διμεθυλοσελίνιο είναι 700 φορές λιγότερο τοξικό από το SeO -2 4 και μετά από εισπνοή στον ανθρώπινο οργανισμό δεν εμφανίζει τοξικότητα σε συγκεντρώσεις ως 8000 ppm

47 Σελήνιο - Μεθυλίωση Η μέθοδος αυτή έχει χρησιμοποιηθεί με επιτυχία για την απομάκρυνση υψηλών συγκεντρώσεων Se από ρυπασμένα εδάφη, ιζήματα λιμνών ή άλλων υδροφόρων συστημάτων Περιορισμός στην εφαρμογή της μεθόδου Οι μικροοργανισμοί μπορούν να μεθυλιώσουν μόνο υδατοδιαλυτές μορφές του Se

48 Σελήνιο - Βιοσυσσώρευση Το βακτήριο Desulfovibrio desulfuricans έχει την ικανότητα να ανάγει SeO 3-2 σε στοιχειακό Se 0 που αποθηκεύεται υπό μορφή κόκκων στο κυτόπλασμα

49 Υδράργυρος Διάφορα βακτήρια έχουν την ικανότητα να μεταβολίζουν Ηg +2 προς Ηg 0 το οποίο λόγω πτητικότητας ελευθερώνεται στην ατμόσφαιρα με αποτέλεσμα την μείωση της τοξικότητας του Ηg στο περιβάλλον ΗμεθυλίωσητουΗg οδηγεί σε αύξηση της τοξικότητας

50 Υδράργυρος Ο γενετικός μηχανισμός ανθεκτικότητας των βακτηρίων στον υδράργυρο είναι πλέον γνωστό και ελέγχεται από 6 γονίδια που βρίσκονται σε ένα οπερόνιο (mer γονίδια)

51 Αρσενικό Μικροβιακή μεθυλίωση Αs προς πτητικά και λιγότερα τοξικά προϊόντα όπως τριμέθυλο-αρσενικό έχει παρατηρηθεί σε αρκετά βακτήρια, φύκη και μύκητες Αναγωγή προς αδιάλυτα σουλφίδια του αρσενικού (As 2 S 3 ) από θείο-αναγωγικά βακτήρια (Desulfotomaculum auripigmentum)

52 Χρώμιο Διάφορα βακτήρια έχουν την ικανότητα να ανάγουν το Cr +6 σε Cr +3 που παρουσιάζει χαμηλότερη τοξικότητα και είναι δυσδιάλυτο Αναεροβικά και αναεροβικά βακτήρια που παρουσιάζουν ανεκτικότητα σε υψηλές συγκεντρώσεις Cr μπορούν να απομακρύνουν >99% της αρχικής ποσότητας Cr

53 Βιολογική Απορρύπανση Ραδιονουκλεϊδίων Μικροοργανισμοί με αυξημένη ανεκτικότητα σε ραδιενέργεια έχουν απομονωθεί από εγκαταστάσεις παραγωγής πυρηνικής ενέργειας, ιζήματα ρυπασμένα με υψηλές συγκεντρώσεις ραδιενεργών ρύπων Bacillus sp., Staphylococcus sp., Arthrobacter sp., Rhodococcus sp. Deinococcus radiodurans

54 Βιολογική Απορρύπανση Ραδιονουκλεϊδίων Υψηλές ποσότητες ραδιενέργειας δεν είναι απαραίτητα τοξικές σε όλους τους μικροοργανισμούς Μικροοργανισμοί που απομονώθηκαν από περιοχές ρυπασμένες με ραδιενεργούς ρύπους αποτελούν τα χρησιμότερα εργαλεία για την βιολογική αποκατάσταση τέτοιων ρυπασμένων οικοσυστημάτων

55 Βιολογική Απορρύπανση Ραδιενεργών Αποβλήτων Τα δύο βασικά ραδιονουκλείδια που αποτελούν ποσοτικά σημαντικούς περιβαλλοντικούς ρύπους είναι τα Ουράνιο (U) και Τεχνίτιο (Te) που αποτελεί προϊόν της επεξεργασίας του U

56 Βιολογική Απορρύπανση Oυρανίου 1. Αναγωγή διαλυτού U +6 προς αδιάλυτο U Αδρανοποίηση U με τη μορφή συμπλόκων με φωσφορικά που παράγονται από διάφορους μικροοργανισμούς 3. Βιολογική προσρόφηση στις κυτταρικές μεμβράνες μικροοργανισμών

57 Αναγωγή διαλυτού U +6 προς αδιάλυτο U +4 Πραγματοποιείται από θείο-αναγωγικά βακτήρια του γένους Geobacter sp., και Anaeromixobacter sp. Αντιδράσεις παρόμοιες με αυτές που περιγράφηκαν για την αναγωγή μετάλλων από μικροοργανισμούς και οδηγούν στην μετατροπή διαλυτών μορφών (U +6 ) σε αδιάλυτες μορφές (U +4 )

58 Εφαρμογή Βιολογική απορρύπανση υπόγειων νερών σε περιοχές εξόρυξης U με την βιολογική ενεργοποίηση μέταλλο αναγωγικών βακτηρίων Περιοχές εξόρυξης ουρανίου στις ΗΠΑ (Κολοράντο, Νέο Μεξικό) παρουσιάζουν έντονα προβλήματα ρύπανσης των υπογείων υδροφόρων συστημάτων με ουράνιο (U +6 ) και ξεκίνησε μια προσπάθεια βιολογικής απορρύπανσης - βιοενεργοποίησης

59 Τα μέταλλο-αναγωγικά βακτήρια όταν τους παρέχεται οξικό οξύ, ως πηγή ηλεκτρονίων, μπορούν να χρησιμοποιήσουν τα ηλεκτρόνια αυτά για να ανάγουν Fe +3 και UV +6 προς Fe +2 και UV +4 που αποτελεί δυσδιάλυτη μορφή