ΠΑΝΤΕΛΗΣ ΓΕΩΡΓΙΑΔΗΣ Μηχανικός Τεχνολογίας Ιατρικών Οργάνων Διδάκτορας Πανεπιστημίου Πατρών ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΟ ΣΗΜΕΙΩΜΑ & ΣΥΝΟΠΤΙΚΗ ΑΝΑΛΥΣΗ ΔΗΜΟΣΙΕΥΣΕΩΝ Νοέμβριος 2010
1. ΣΥΝΟΨΗ ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΟΥ ΣΗΜΕΙΩΜΑΤΟΣ Προσωπικά στοιχεία: Ονοματεπώνυμο: Γεωργιάδης Παντελής. Γέννηση: 28 09 1980, Θεσσαλονίκη. Τόπος μόνιμης διαμονής: Αμπελόκηποι Καστοριάς. Ιθαγένεια και υπηκοότητα: Ελληνικές. Οικογενειακή κατάσταση: Άγαμος. Στρατιωτική θητεία: Εκπληρωμένη (2009 2010). Επικοινωνία: 2467501692, 6937285909, PantelisGeorgiadis@Gmail.com Σπουδές: Πτυχίο Μηχανικού Τεχνολογίας Ιατρικών Οργάνων, Τμήμα Τεχνολογίας Ιατρικών Οργάνων του Τεχνολογικού Εκπαιδευτικού Ιδρύματος Αθήνας, 2004 (βαθμός 6,80/10). Πτυχίο μεταπτυχιακών σπουδών στα Συστήματα Επικοινωνιών Δεδομένων (Data Communication Systems), School of Engineering and Design, Brunel University, 2006 (βαθμός 6,64/10) Διδακτορικό Δίπλωμα στην Ιατρική Φυσική, Τμήμα Ιατρικής Τμήμα Φυσικής, Διατμηματικό Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα στην Ιατρική Φυσική, Πανεπιστήμιο Πατρών, 2010 (βαθμός Άριστα). Ερευνητικές δημοσιεύσεις: 15 δημοσιευμένες εργασίες σε διεθνή αναγνωρισμένα επιστημονικά περιοδικά με κριτές. 24 δημοσιευμένες εργασίες σε πρακτικά διεθνών επιστημονικών συνεδρίων με κριτές. 9 δημοσιεύσεις σε βιβλία περιλήψεων διεθνών συνεδρίων, σε πρακτικά ελληνικών συνεδρίων ή σε περιοδικά χωρίς δείκτη απήχησης. Αναφορές παραπομπές: 19 ετεροαναφορές προς δημοσιεύεις σε διεθνή αναγνωρισμένα περιοδικά με κριτές (όλες εκ των οποίων από δημοσιεύσεις σε διεθνή αναγνωρισμένα περιοδικά με κριτές). Τρέχουσα ερευνητική δραστηριότητα: α) Επεξεργασία, ανάλυση και μετάδοση ψηφιακού σήματος και εικόνας β) Αναγνώριση προτύπων Συστήματα υποβοήθησης ιατρικής διάγνωσης μέσω Η/Υ Επαγγελματική εμπειρία: 5 έτη και 3 μήνες, από συμμετοχή σε Ευρωπαϊκά ερευνητικά προγράμματα, προγράμματα του ΤΕΙ Αθήνας καθώς και από αναθέσεις έργου ως προγραμματιστής εφαρμογών ανάλυσης, επεξεργασίας, αποθήκευσης και μετάδοσης ιατρικών δεδομένων. Άλλα στοιχεία: Ξένες γλώσσες: Αγγλικά. Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 2
2. ΠΡΟΣΩΠΙΚΑ ΣΤΟΙΧΕΙΑ Επίθετο: Γεωργιάδης Όνομα: Παντελής Ημερομηνία γέννησης: 28 09 1980 Τόπος γέννησης: Θεσσαλονίκη Διεύθυνση: Αμπελόκηποι Καστοριάς, Τ.Κ. 52057 Οικογενειακή κατάσταση: Άγαμος Τηλέφωνο: (+30) 6937 285909 (κινητό) (+30) 2467 501692 (οικίας) E mail: PantelisGeorgiadis@GMail.com 3. ΣΤΡΑΤΙΩΤΙΚΗ ΘΗΤΕΙΑ Στρατός Ξηράς, από 10 2 2009 έως 10 01 2010, Α.Σ.Μ.: 140/000202/2001. Βαθμός: Στρατιώτης Υγειονομικού. Ειδικότητα: Βοηθός Χειρουργείου. 4. ΒΑΣΙΚΟ ΠΤΥΧΙΟ Πτυχίο Μηχανικού Τεχνολογίας Ιατρικών Οργάνων. Τμήμα Τεχνολογίας Ιατρικών Οργάνων του Τεχνολογικού Εκπαιδευτικού Ιδρύματος Αθήνας. Βαθμός πτυχίου: Καλώς (6,80/10). Ημερομηνία λήψης: 05 10 2004. 5. ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟ ΔΙΠΛΩΜΑ Πτυχίο μεταπτυχιακών σπουδών στα Συστήματα Επικοινωνιών Δεδομένων (Data Communication Systems). School of Engineering and Design, Brunel University, West London, UK. Βαθμός πτυχίου: Λίαν Καλώς (6,64/10). Ημερομηνία λήψης: 05 12 2006. Αριθμός αναγνώρισης Δ.Ο.Α.Τ.Α.Π.: 31 2806. 6. ΔΙΔΑΚΤΟΡΙΚΟ ΔΙΠΛΩΜΑ Διδακτορικό Δίπλωμα στην Ιατρική Φυσική. Τμήμα Ιατρικής Τμήμα Φυσικής, Διατμηματικό Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα στην Ιατρική Φυσική, Πανεπιστήμιο Πατρών. Τίτλος διατριβής: «Υπολογιστικό Σύστημα Αυτόματης Διάγνωσης Όγκων Εγκεφάλου με τη χρήση Στατιστικών Μοντέλων και Μεθόδων Αναγνώρισης Προτύπων (Computer Assisted Diagnosis of Brain Tumors based on Statistical Methods and Pattern Recognition Techniques)» Βαθμός πτυχίου: Άριστα. Ημερομηνία λήψης: 24 06 2010. Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 3
7. ΥΠΟΤΡΟΦΙΕΣ Πανεπιστήμιο Πατρών, Ειδικός Λογαριασμός Κονδυλίων Έρευνας «Πρόγραμμα K. Καραθεοδωρή» (01/01/2006 31/12/2008, Κωδικός Έργου: Β706), Τίτλος: «Υπολογιστικό Σύστημα Αυτόματης Διάγνωσης Όγκων Εγκεφάλου με τη χρήση Στατιστικών Μοντέλων και Μεθόδων Αναγνώρισης Προτύπων». 8. ΞΕΝΕΣ ΓΛΩΣΣΕΣ 8.1. Αγγλική: University of Cambridge First Certificate in English, Certificate Grade B (b), December 1996. 8.2. Αγγλική: Educational Testing Service (ETS) Computer Based Test of English as a Foreign Language (CB TOEFL), Total Score 253/300, September 2004. 9. ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΕΣ ΔΗΜΟΣΙΕΥΣΕΙΣ 9.1 Δημοσιεύσεις σε επίσημα περιοδικά αναγνωρισμένου κύρους με κριτές 9.1.1. A. Gal, A. Segev, C. Tatsiopoulos, K. Sidiropoulos and P. Georgiades, Agent Oriented Data Integration, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 3770, pp. 98 108, 2005. 9.1.2. P. Georgiadis, D. Cavouras, I. Kalatzis, A. Daskalakis, G. Kagadis, K. Sifaki, M. Malamas, G. Nikiforidis and E. Solomou, Non linear Least Squares Features Transformation for Improving the Performance of Probabilistic Neural Networks in Classifying Human Brain Tumors on MRI, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 4707, pp. 239 247, 2007. 9.1.3. A. Daskalakis, D. Cavouras, P. Bougioukos, S. Kostopoulos, P. Georgiadis, I. Kalatzis, G. Kagadis and G. Nikiforidis, Effective Quantification of Gene Expression Levels in Microarray Images Using a Spot Adaptive Compound Clustering Enhancement Segmentation Scheme, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 4707, pp. 555 565, 2007. 9.1.4. P. Bougioukos, D. Cavouras, A. Daskalakis, I. Kalatzis, S. Kostopoulos, P. Georgiadis, G. Nikiforidis and A. Bezerianos, Biomarker Selection System, Employing an Iterative Peak Selection Method, for Identifying Biomarkers Related to Prostate Cancer, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 4673, pp. 197 204, 2007. 9.1.5. P. Georgiadis, D. Cavouras, I. Kalatzis, A. Daskalakis, G. C. Kagadis, K. Sifaki, M. Malamas, G. Nikiforidis and E. Solomou, Improving brain tumor characterization on MRI by probabilistic neural networks and non linear transformation of textural features, Computer Methods and Programs in Biomedicine, Vol. 89 (1), pp. 24 32, 2008. 9.1.6. S. Kostopoulos, D. Cavouras, A. Daskalakis, G. Kagadis, I. Kalatzis, P. Georgiadis, P. Ravazoula and G. Nikiforidis, Cascade Pattern Recognition Structure for Improving Quantitative Assessment of Estrogen Receptor Status in Breast Tissue Carcinomas, Analytical and Quantitative Cytology and Histology, Vol. 30 (4), pp. 218 225, 2008. 9.1.7. P. Georgiadis, D. Cavouras, I. Kalatzis, D. Glotsos, E. Athanasiadis, S. Kostopoulos, K. Sifaki, M. Malamas, G. Nikiforidis and E. Solomou, Enhancing the discrimination accuracy between metastases, gliomas and meningiomas on brain MRI by Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 4
volumetric textural features and ensemble pattern recognition methods, Magnetic Resonance Imaging, Vol. 27 (1), pp. 120 130, 2009. 9.1.8. P. Theocharakis, D. Glotsos, I. Kalatzis, S. Kostopoulos, P. Georgiadis, K. Sifaki, K. Tsakouridou, M. Malamas, G. Delibasis, D. Cavouras and G. Nikiforidis, Pattern recognition system for the discrimination of multiple sclerosis from cerebral microangiopathy lesions based on texture analysis of Magnetic Resonance images, Magnetic Resonance Imaging, Vol. 27 (3), pp. 417 422, 2009. 9.1.9. P. Georgiadis, D. Cavouras, K. Sidiropoulos K. Ninos and C. Nomicos, Remote monitoring of electromagnetic signals and seismic events using smart mobile devices, Computers & Geosciences, Vol. 35 (6), pp. 1296 1303, 2009. 9.1.10. S. Kostopoulos, D. Glotsos, D. Cavouras, A. Daskalakis, I. Kalatzis, P. Georgiadis, P. Bougioukos, P. Ravazoula and G. Nikiforidis, Computer Based Association of the Texture of Expressed Estrogen Receptor Nuclei with Histologic Grade Using Immunohistochemically Stained Breast Carcinomas, Analytical and Quantitative Cytology and Histology, Vol. 31 (4), pp. 187 196, 2009. 9.1.11. E. Athanasiadis, D. Cavouras, D. Glotsos, P. Georgiadis, I. Kalatzis and G. Nikiforidis, Segmentation of complementary DNA microarray images by wavelet based Markov random field model, IEEE Transactions on Information Technology in Biomedicine, Vol. 13 (6), pp. 1068 1074, 2009. 9.1.12. D. Glotsos, P. Georgiadis, S. Kostopoulos, A. Daskalakis, I. Kalatzis, P. Ravazoula and D. Cavouras, A Pilot Study Investigating the Minimum Requirements Necessary for Grading Astrocytomas Remotely, Analytical and Quantitative Cytology and Histology, Vol. 31 (5), pp. 262 268, 2009. 9.1.13. D. Glotsos, I. Kalatzis, P. Theocharakis, P. Georgiadis, A. Daskalakis, K. Ninos, P. Zoumboulis, A. Filippidou and D. Cavouras, A multi classifier system for the characterization of normal, infectious, and cancerous prostate tissues employing transrectal ultrasound images, Computer Methods and Programs in Biomedicine, Vol. 97 (1), pp. 53 61, 2010. 9.1.14. K. Ninos, S. Kostopoulos, D. Glotsos, P. Georgiadis, K. Sidiropoulos, N. Dimitropoulos, I. Kalatzis and D. Cavouras, Development and evaluation of a PDAbased teleradiology terminal in thyroid nodule diagnosis, Journal of Telemedicine and Telecare, Vol. 16 (5), pp. 232 236, 2010. 9.1.15. P. Georgiadis, S. Kostopoulos, D. Cavouras, D. Glotsos, I. Kalatzis, K. Sifaki, M. Malamas, E. Solomou and G. Nikiforidis, Quantitative combination of volumetric MR imaging and MR spectroscopy data for the discrimination of meningiomas from metastatic brain tumors by means of pattern recognition, Magnetic Resonance Imaging (υπό κρίση). 9.2 Δημοσιεύσεις σε πρακτικά συνεδρίων με κριτές 9.2.1. P. Georgiadis, K. Banitsas, H. Georgiou, K. Sidiropoulos, S. Tachakra, N. Dimitropoulos and D. Cavouras, A PDA Based teleradiology system, 1 st International Conference From Scientific Computing to Computational Engineering (1 st IC SCCE), Athens, Greece, September 10 18, 2004. Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 5
9.2.2. N. Piliouras, I. Kalatzis, P. Georgiadis, D. Ninos, G. Koulouras, G. Minadakis, D. Cavouras and C. Nomicos, Electromagnetic seismic signal analysis employing pattern recognition methods, 1 st International Conference From Scientific Computing to Computational Engineering (1 st IC SCCE), Athens, Greece, September 10 18, 2004. 9.2.3. K. Banitsas, P. Georgiadis, S. Tachakra and D. Cavouras, Using handheld devices for real time wireless Teleconsultation, 26 th Annual International Conference, IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (26 th EMBC), San Francisco, California, USA, September 1 5, 2004. 9.2.4. P. Georgiadis, K. Banitsas, H. Georgiou, K. Sidiropoulos, N. Dimitropoulos, S. Tachakra, and D. Cavouras, A Smartphone Based Teleradiology System, 4 th European Symposium on Biomedical Engineering (4 th ES BE 2004), Patras, Greece, June 25 27, 2004. 9.2.5. P. Georgiadis, K. Sidiropoulos, H. Georgiou, C. Makris, D. Glotsos and D. Cavouras, A PDA Based teleprocessing system, 1 st International Conference on Experiments / Process / System Modeling / Simulation / Optimization (1 st IC EpsMsO), Athens, Greece, July 6 9, 2005. 9.2.6. Ch. Hikimtzis, P. Georgiadis, K. Sidiropoulos, D. Glotsos and D. Cavouras, Development of a remotely accomplished edge detection algorithm on breast ultrasound, 1 st International Conference on Experiments / Process / System Modeling / Simulation / Optimization (1 st IC EpsMsO), Athens, Greece, July 6 9, 2005. 9.2.7. E. Polyxronopoulou, A. Daskalakis, P. Georgiadis, K. Sidiropoulos, D. Glotsos, P. Ravazoula, D. Cavouras and G. Nikiforidis, Development of a Telemedicine image processing and transferring system over a Wireless Computer Network, 1 st International Conference on Experiments / Process / System Modeling / Simulation / Optimization (1 st IC EpsMsO), Athens, Greece, July 6 9, 2005. 9.2.8. P. Georgiadis, N. Piliouras, K. Sidiropoulos, G. Koulouras, G. Minadakis, D. Cavouras and C. Nomicos, Smartphone based system for monitoring electromagnetic signals, 2005 WSEAS International Conference on Engineering Education, Athens, Greece, July 8 10, 2005. 9.2.9. I. Kalatzis, N. Piliouras, P. Georgiadis, E. Athanasiadis, Ch. Hikimtzis, E. Trapezanidis, E. Ventouras and D. Cavouras, Signal and image processing application development in the biomedical engineering degree program, 2005 WSEAS International Conference on Engineering Education, Athens, Greece, July 8 10, 2005. 9.2.10. C. Vaptismas, P. Georgiadis, Ch. Hikimtzis, K. Sidiropoulos, N Dimitropoulos and D. Cavouras, Development of a secure wireless system for teleprocessing of medical images, 2 nd International Conference From Scientific Computing to Computational Engineering (2 nd IC SCCE), Athens, Greece, July 5 8, 2006. 9.2.11. Ch. Hikimtzis, P. Georgiadis, A. Daskalakis, K. Sidiropoulos, N Dimitropoulos and D. Cavouras, Development of a web service platform for remotely designing medical image processing applications, 2 nd International Conference From Scientific Computing to Computational Engineering (2 nd IC SCCE), Athens, Greece, July 5 8, 2006. Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 6
9.2.12. P. Georgiadis, K. Sidiropoulos, Ch. Hikimtzis, K. Banitsas, N. Dimitropoulos and D. Cavouras, PDA based teleradiology system with real time voice conferencing capabilities, 2 nd International Conference From Scientific Computing to Computational Engineering (2 nd IC SCCE), Athens, Greece, July 5 8, 2006. 9.2.13. P. Georgiadis, K. Sidiropoulos, D. Cavouras, K. Banitsas and C. Nomicos, PDA based system for monitoring electromagnetic signals, Annual International Conference on Telecommunications & Multimedia (TEMU 2006), Heraklion, Greece, July 5 7, 2006. 9.2.14. K. Sidiropoulos, P. Georgiadis, N. Dimitropoulos and D. Cavouras, Personal Mobile Medical Assistant Employing RFID Technology, 5 th European Symposium on Biomedical Engineering (5 th ES BE 2006), Patras, Greece, July 7 9, 2006. 9.2.15. P. Theocharakis, P. Georgiadis, M. Malamas, K. Sifaki, D. Cavouras and G. Nikiforidis, Segmentation of MR Brain Images by Genetic K Means Algorithm for the Measurement of Brain Volume on the Problem of Brain Atrophy Accompanying Patients With Multiple Sclerosis, 5 th European Symposium on Biomedical Engineering (5 th ES BE 2006), Patras, Greece, July 7 9, 2006. 9.2.16. K. Banitsas, P. Georgiadis, S. Tachakra and D. Cavouras, Mobile consultant: combining total mobility with constant access, 28 th Annual International Conference, IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (28 th EMBC), New York City, New York, USA, August 30 September 3, 2006. 9.2.17. P. Georgiadis, D. Cavouras, I. Kalatzis, A. Daskalakis, P. Theocharakis, S. Kostopoulos, P. Bougioukos, K. Sifaki, M. Malamas, G. Nikiforidis and E. Solomou, Ensemble software classification for characterizing human brain tumours on MRI, 2 nd International Conference on Experiments / Process / System Modeling / Simulation / Optimization (2 nd IC EpsMsO), Athens, Greece, July 4 7, 2007. 9.2.18. A. Daskalakis, D. Cavouras, P. Bougioukos, S. Kostopoulos, P. Georgiadis, I. Kalatzis and G. Nikiforidis, An Efficient CLAHE based, Spot Adaptive, image segmentation technique for improving Microarray Genes Quantification, 2 nd International Conference on Experiments / Process / System Modeling / Simulation / Optimization (2 nd IC EpsMsO), Athens, Greece, July 4 7, 2007. 9.2.19. P. Georgiadis, K. Ninos, D. Cavouras, I. Kalatzis and C. Nomicos, Seismic events precursor electromagnetic signal identification employing pattern recognition techniques, 2 nd International Conference on Experiments / Process / System Modeling / Simulation / Optimization (2 nd IC EpsMsO), Athens, Greece, July 4 7, 2007. 9.2.20. I. Kalatzis, K. Ninos, P. Georgiadis, E. Ventouras and D. Cavouras, Evaluation of a Pattern Recognition System for Event Related Potential Signal Classification under Simulated Noise Conditions, 2 nd International Conference on Experiments / Process / System Modeling / Simulation / Optimization (2 nd IC EpsMsO), Athens, Greece, July 4 7, 2007. 9.2.21. P. Georgiadis, D. Cavouras, A. Daskalakis, K. Sifaki, M. Malamas, G. Nikiforidis and E. Solomou, PDA based system with teleradiology and image analysis capabilities, 29 th Annual International Conference, IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (29 th EMBC), Lyon, France, August 23 26, 2007. 9.2.22. K. Banitsas, P. Georgiadis, S. Tachakra and D. Cavouras, Mobile consultant: evaluation of additional services, 29th Annual International Conference, IEEE Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 7
Engineering in Medicine and Biology Society (29 th EMBC), Lyon, France, August 23 26, 2007. 9.2.23. A. Daskalakis, D. Cavouras, P. Bougioukos, S. Kostopoulos, P. Georgiadis, I. Kalatzis, G. Kagadis and G. Nikiforidis, Genes expression level quantification using a spotbased algorithmic pipeline, 29th Annual International Conference, IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (29 th EMBC), Lyon, France, August 23 26, 2007. 9.2.24. S. Kostopoulos, D. Cavouras, A. Daskalakis, P. Bougioukos, P. Georgiadis, G. C. Kagadis, I. Kalatzis, P. Ravazoula, G. Nikiforidis, Colour Texture Based Image Analysis Method for Assessing the Hormone Receptors Status in Breast Tissue Sections, 29th Annual International Conference, IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (29 th EMBC), Lyon, France, August 23 26, 2007. 9.3 Δημοσιεύσεις σε περιλήψεις διεθνών και ελληνικών συνεδρίων και περιοδικών χωρίς δείκτη απήχησης (impact factor) 9.3.1. Π. Γεωργιάδης, Κ. Σιδηρόπουλος, Χ. Μακρής, Χ. Γεωργίου, Ν. Δημητρόπουλος και Δ. Κάβουρας, Σύστημα τηλεραδιολογίας βασισμένο σε προσωπικούς ψηφιακούς βοηθούς, 14 ο Διαπανεπιστημιακό Συνέδριο Ακτινολογίας, Ηράκλειο, Ελλάδα, Νοέμβριος 11 14, 2004. 9.3.2. Κ. Σιδηρόπουλος, Ν. Πήλιουρας, Ε. Αθανασιάδης, Χ. Γεωργίου, Χ. Μακρής, Π. Γεωργιάδης, Ν. Δημητρόπουλος και Δ. Κάβουρας, Συγκριτική αξιολόγηση ψηφιακών φίλτρων καταστολής θορύβου Speckle υπερηχογραφικών εικόνων, 14 ο Διαπανεπιστημιακό Συνέδριο Ακτινολογίας, Ηράκλειο, Ελλάδα, Νοέμβριος 11 14, 2004. 9.3.3. K. Banitsas, T. Kalyvas and P. Georgiadis, Mobile consultant: diagnosis and consultation on the go, Hospital The Official Journal of the European Association of Hospital Managers, Vol. 1 (4), pp. 12 13, 2007. 9.3.4. D. Cavouras and P. Georgiadis, Application of pattern recognition methods for detecting the existence of EM precursor signals preceding major seismic events, European Geosciences Union General Assembly 2007, Vienna, Austria, April 15 20, 2007. 9.3.5. Π. Γεωργιάδης, Δ. Κάβουρας, Ι. Καλατζής, Α. Δασκαλάκης, Γ. Καγκάδης, Κ. Σιφάκη, Μ. Μάλαμας, Γ. Νικηφορίδης και Α. Σολωμού, Βελτίωση της ικανότητας χαρακτηρισμού όγκων εγκεφάλου με χρήση πιθανοκρατικού νευρωνικού δικτύου και μη γραμμικού μετασχηματισμού ελάχιστων τετραγώνων χαρακτηριστικών υφής σε εικόνες MRI, 17 ο Διαπανεπιστημιακό Συνέδριο Ακτινολογίας, Πάτρα, Ελλάδα, Νοέμβριος 9 11, 2007. 9.3.6. Ε. Αθανασιάδης, Κ. Νίνος, Θ. Μαντούκας, Γ. Καγκάδης, Π. Γεωργιάδης, Ι. Καλατζής, Ν. Δημητρόπουλος και Δ. Κάβουρας, Συγκριτική αξιολόγηση φίλτρων «A Trous» μετασχηματισμού κυματιδίου με φίλτρα ισοστάθμισης ιστογράμματος για την βελτίωση εικόνων μαστογραφίας, 17 ο Διαπανεπιστημιακό Συνέδριο Ακτινολογίας, Πάτρα, Ελλάδα, Νοέμβριος 9 11, 2007. 9.3.7. D. Cavouras, P. Georgiadis, K. Ninos and C. Nomicos, Electromagnetic signals monitoring by smartphones and 3G wireless networks, European Geosciences Union General Assembly 2008, Vienna, Austria, April 13 18, 2008. Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 8
9.3.8. P. Georgiadis, D. Cavouras, I. Kalatzis, D. Glotsos, K. Sifaki, M. Malamas, G. Nikiforidis and E. Solomou, Computer aided discrimination between primary and secondary brain tumors on MRI: From 2D to 3D texture analysis, e Journal of Science & Technology (e JST), Vol. 3 (2), pp. 9 18, 2008. 9.3.9. K. Ninos, P. Georgiadis, D. Cavouras and C. Nomicos, An electromagnetic signals monitoring and analysis wireless platform employing personal digital assistants and pattern analysis techniques, European Geosciences Union General Assembly 2010, Vienna, Austria, May 2 7, 2010. 9.3.10. O. Romanos, P. Georgiadis, D. Kardamakis and E. Solomou, Magnetic Resonance Imaging (MRI) and Image Analysis of Post Radiation Changes in Patients with Bone Metastases, 8th Balkan Congress of Radiology (BCR 2010), Alexandroupoli, Greece, October 29 31, 2010. 10. ΑΝΑΦΟΡΕΣ Το σύνολο των ετεροαναφορών είναι δεκαεννιά (19) προς δημοσιεύεις σε διεθνή αναγνωρισμένα περιοδικά με κριτές (όλες εκ των οποίων από δημοσιεύσεις σε διεθνή αναγνωρισμένα περιοδικά με κριτές) και έχουν ως εξής: Μία (1) ετεροαναφορά στην εργασία υπ αριθμόν 2 επίσημων περιοδικών με κριτές: {P. Georgiadis, D. Cavouras, I. Kalatzis, A. Daskalakis, G. Kagadis, K. Sifaki, M. Malamas, G. Nikiforidis and E. Solomou, Non linear Least Squares Features Transformation for Improving the Performance of Probabilistic Neural Networks in Classifying Human Brain Tumors on MRI, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 4707, pp. 239 247, 2007.} 1. M. Zelawski, Detecting pathologies with homology algorithms in magnetic resonance images of brain, Machine Graphics & Vision International Journal, Vol. 18 (3), pp. 253 266, 2009. Οκτώ (8) ετεροαναφορές στην εργασία υπ αριθμόν 5 επίσημων περιοδικών με κριτές: {P. Georgiadis, D. Cavouras, I. Kalatzis, A. Daskalakis, G. C. Kagadis, K. Sifaki, M. Malamas, G. Nikiforidis and E. Solomou, Improving brain tumor characterization on MRI by probabilistic neural networks and non linear transformation of textural features, Computer Methods and Programs in Biomedicine, Vol. 89 (1), pp. 24 32, 2008.} 1. O. Andronesi, K. Blekas, D. Mintzopoulos, L. Astrakas, P. Black and A. Tzika, Molecular classification of brain tumor biopsies using solid state magic angle spinning proton magnetic resonance spectroscopy and robust classifiers, International Journal of Oncology, Vol. 33 (5), pp. 1017 1025, 2008. 2. Ao S. Data Mining and Applications in Genomics (Lecture Notes in Electrical Engineering). New York: Springer, 2008. 3. C. Chevrefils, F. Cheriet, C. E Aubin and G. Grimard, Texture Analysis for Automatic Segmentation of Intervertebral Disks of Scoliotic Spines From MR Images, IEEE Transactions on Information Technology in Biomedicine, Vol. 13 (4), pp. 608 620, 2009. 4. E. Zacharaki, S. Wang, S. Chawla, D. S. Yoo, R. Wolf, E. R. Melhem and C. Davatzikos, Classification of Brain Tumor Type and Grade Using MRI Texture and Shape in a Machine Learning Scheme, Magnetic Resonance in Medicine, Vol. 62 (6), pp. 1609 1618, 2009. Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 9
5. M. Zelawski, Detecting pathologies with homology algorithms in magnetic resonance images of brain, Machine Graphics & Vision International Journal, Vol. 18 (3), pp. 253 266, 2009. 6. D. Assefa, H. Keller, C. Ménard, N. Laperriere, R. J. Ferrari and I. Yeung, Robust texture features for response monitoring of glioblastoma multiforme on T1 weighted and T2 FLAIR MR images: A preliminary investigation in terms of identification and segmentation, Medical Physics, Vol. 37 (4), pp. 1722 1736, 2010. 7. A. Kassner and R.E. Thornhill, Texture Analysis: A Review of Neurologic MR Imaging Applications, American Journal of Neuroradiology, Vol. 31 (5), pp. 809 816, 2010. 8. V. Chinnadurai, G. D. Chandrashekhar, Improvised Levelset method for segmentation and grading of brain tumors in dynamic contrast susceptibility and apparent diffusion coefficient magnetic resonance images, International Journal of Engineering Science and Technology, Vol. 2 (5), pp. 1461 1472, 2010. Πέντε (5) ετεροαναφορές στην εργασία υπ αριθμόν 7 επίσημων περιοδικών με κριτές: {P. Georgiadis, D. Cavouras, I. Kalatzis, D. Glotsos, E. Athanasiadis, S. Kostopoulos, K. Sifaki, M. Malamas, G. Nikiforidis and E. Solomou, Enhancing the discrimination accuracy between metastases, gliomas and meningiomas on brain MRI by volumetric textural features and ensemble pattern recognition methods, Magnetic Resonance Imaging, Vol. 27 (1), pp. 120 130, 2009.} 1. D. Assefa, H. Keller, C. Ménard, N. Laperriere, R. J. Ferrari and I. Yeung, Robust texture features for response monitoring of glioblastoma multiforme on T1 weighted and T2 FLAIR MR images: A preliminary investigation in terms of identification and segmentation, Medical Physics, Vol. 37 (4), pp. 1722 1736, 2010. 2. A. Kassner and R.E. Thornhill, Texture Analysis: A Review of Neurologic MR Imaging Applications, American Journal of Neuroradiology, Vol. 31 (5), pp. 809 816, 2010. 3. T. Woloszynski, P. Podsiadlo, G. W. Stachowiak and M. Kurzynski, A signature dissimilarity measure for trabecular bone texture in knee radiographs, Medical Physics, Vol. 37 (5), pp. 2030 2042, 2010. 4. L. Harrison, M. Raunio, K. Holli, T. Luukkaala, S. Savio, I. Elovaara, S. Soimakallio, H. Eskola and P. Dastidar, MRI Texture Analysis in Multiple Sclerosis: Toward a Clinical Analysis Protocol, Academic Radiology, Vol. 17 (6), pp. 696 707, 2010. 5. V. Chinnadurai, G. D. Chandrashekhar, Improvised Levelset method for segmentation and grading of brain tumors in dynamic contrast susceptibility and apparent diffusion coefficient magnetic resonance images, International Journal of Engineering Science and Technology, Vol. 2 (5), pp. 1461 1472, 2010. Τέσσερις (4) ετεροαναφορές στην εργασία υπ αριθμόν 8 επίσημων περιοδικών με κριτές: {P. Theocharakis, D. Glotsos, I. Kalatzis, S. Kostopoulos, P. Georgiadis, K. Sifaki, K. Tsakouridou, M. Malamas, G. Delibasis, D. Cavouras and G. Nikiforidis, Pattern recognition system for the discrimination of multiple sclerosis from cerebral microangiopathy lesions based on texture analysis of Magnetic Resonance images, Magnetic Resonance Imaging, Vol. 27 (3), pp. 417 422, 2009.} 1. A. Kassner and R.E. Thornhill, Texture Analysis: A Review of Neurologic MR Imaging Applications, American Journal of Neuroradiology, Vol. 31 (5), pp. 809 816, 2010. 2. L. Harrison, M. Raunio, K. Holli, T. Luukkaala, S. Savio, I. Elovaara, S. Soimakallio, H. Eskola and P. Dastidar, MRI Texture Analysis in Multiple Sclerosis: Toward a Clinical Analysis Protocol, Academic Radiology, Vol. 17 (6), pp. 696 707, 2010. Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 10
3. M. Mayerhoefer, G. Welsch, G. Riegler, T. Mamisch, A. Materka, M. Weber, K. El Rabadi, K. Friedrich, A. Dirisamer and S. Trattnig, Feasibility of texture analysis for the assessment of biochemical changes in meniscal tissue on T1 maps calculated from delayed gadolinium enhanced magnetic resonance imaging of cartilage data: comparison with conventional relaxation time measurements, Investigative Radiology, Vol. 45 (9), pp. 543 547, 2010. 4. M. Mayerhoefer, W. Schima, S. Trattnig, K. Pinker, V. Berger Kulemann and A. Ba Ssalamah, Journal of Magnetic Resonance Imaging, Vol. 32 (2), pp. 352 359, 2010. Μία (1) ετεροαναφορά στην εργασία υπ αριθμόν 13 επίσημων περιοδικών με κριτές: {D. Glotsos, I. Kalatzis, P. Theocharakis, P. Georgiadis, A. Daskalakis, K. Ninos, P. Zoumboulis, A. Filippidou and D. Cavouras, A multi classifier system for the characterization of normal, infectious, and cancerous prostate tissues employing transrectal ultrasound images, Computer Methods and Programs in Biomedicine, Vol. 97 (1), pp. 53 61, 2010.} 1. Ο. Ukimura, Evolution of precise and multimodal MRI and TRUS in detection and management of early prostate cancer, Expert Review of Medical Devices, Vol. 7 (4), pp. 541 554, 2010. 11. ΑΛΛΕΣ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΕΣ ΔΙΑΚΡΙΣΕΙΣ 11.1 Προσκεκλημένος Αξιολογητής 11.1.1 Προσκεκλημένος αξιολογητής από τον αναπληρωτή επιμελητή έκδοσης του διεθνούς επιστημονικού περιοδικού Artificial Intelligence in Medicine (ISSN: 0933 3657) για αξιολόγηση της εργασίας An Empirical Comparison of Classifier Ensembles for Limited, Imperfect Training Data: Application to Computer aided Detection of Prostate Cancer from High Resolution MRI (ref. no. AIIM D 08 00111). Πρόσκληση για αξιολόγηση 01 09 2008, υποβολή έκθεσης αξιολόγησης 29 09 2008. 11.1.2 Προσκεκλημένος αξιολογητής από τον αναπληρωτή επιμελητή έκδοσης του διεθνούς επιστημονικού περιοδικού Computers & Geosciences (ISSN: 0098 3004) για αξιολόγηση της εργασίας iseismometer: A Geoscientific iphone Application (ref. no. CAGEO D 09 00109). Πρόσκληση για αξιολόγηση 20 05 2009, υποβολή έκθεσης αξιολόγησης 19 06 2009. 12. ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΗ ΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΗΤΑ 12.1. Μέλος της Ερευνητικής Ομάδας του υποέργου «Υπολογιστικό Σύστημα Αυτόματης Διάγνωσης Καρκίνου Όζων του Θυρεοειδούς Αδένα» του Τμήματος Τεχνολογίας Ιατρικών Οργάνων του Τ.Ε.Ι. Αθήνας (Επιστημονικός Υπεύθυνος Καθηγητής Δ. Κάβουρας) του προγράμματος «Αρχιμήδης Ενίσχυση Ερευνητικών Ομάδων στα Τ.Ε.Ι. (ΕΕΟΤ)» του Τ.Ε.Ι. Αθήνας, του Επιχειρησιακού Προγράμματος Εκπαίδευσης και Αρχικής Επαγγελματικής Κατάρτισης (ΕΠΕΑΕΚ ΙΙ), Μέτρο 2.2, Πράξη 2.2.3.ζ, Ένταξη ΥΠΕΠΘ 10842/22.6.2004. Διάρκεια: 6 μήνες, από 15 03 2004 έως 15 09 2004. 12.2. Ανάπτυξη λογισμικού για το τμήμα Intelligent Agents της τελικής πλατφόρμας του έργου «Quality of Service and Legitimacy in egovernment (QUALEG)» (IST, Contract Number IST 2002 507767, Sixth Framework Programme). Διάρκεια: 8 μήνες, από 03 01 2005 έως 02 09 2005. Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 11
12.3. Μέλος της Ερευνητικής Ομάδας του υποέργου «Ηλεκτρομαγνητικές Διαταραχές και συσχέτιση με σεισμούς» του Τμήματος Ηλεκτρονικής του Τ.Ε.Ι. Αθήνας (Επιστημονικός Υπεύθυνος Καθηγητής Κ. Νομικός) του προγράμματος «Αρχιμήδης Ενίσχυση Ερευνητικών Ομάδων στα Τ.Ε.Ι. (ΕΕΟΤ)» του Τ.Ε.Ι. Αθήνας, του Επιχειρησιακού Προγράμματος Εκπαίδευσης και Αρχικής Επαγγελματικής Κατάρτισης (ΕΠΕΑΕΚ ΙΙ), Μέτρο 2.2, Πράξη 2.2.3.ζ, Ένταξη ΥΠΕΠΘ 10842/22.6.2004. Διάρκεια: 14 μήνες, από 15 07 2005 έως 31 8 2006. 13. ΕΠΑΓΓΕΛΜΑΤΙΚΗ ΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΗΤΑ 13.1. Μέλος της Ερευνητικής Ομάδας του υποέργου «Υπολογιστικό Σύστημα Αυτόματης Διάγνωσης Καρκίνου Όζων του Θυρεοειδούς Αδένα» του Τμήματος Τεχνολογίας Ιατρικών Οργάνων του Τ.Ε.Ι. Αθήνας (Επιστημονικός Υπεύθυνος Καθηγητής Δ. Κάβουρας) του προγράμματος «Αρχιμήδης Ενίσχυση Ερευνητικών Ομάδων στα Τ.Ε.Ι. (ΕΕΟΤ)» του Τ.Ε.Ι. Αθήνας, του Επιχειρησιακού Προγράμματος Εκπαίδευσης και Αρχικής Επαγγελματικής Κατάρτισης (ΕΠΕΑΕΚ ΙΙ), Μέτρο 2.2, Πράξη 2.2.3.ζ, Ένταξη ΥΠΕΠΘ 10842/22.6.2004. Διάρκεια: 6 μήνες, από 15 03 2004 έως 15 09 2004. 13.2. Ανάπτυξη λογισμικού και ψηφιακού εκπαιδευτικού υλικού στα πλαίσια του υποέργου «Τμήμα Τεχνολογίας Ιατρικών Οργάνων» του έργου "ΑΠΠΣ ΤΕΙ ΑΘΗΝΑΣ" της Πράξης 2.2.2.α «Αναμόρφωση Προπτυχιακών Προγραμμάτων Σπουδών ΑΠΠΣ» του Επιχειρησιακού Προγράμματος Εκπαίδευσης και Αρχικής Επαγγελματικής Κατάρτισης (ΕΠΕΑΕΚ ΙΙ). Διάρκεια: 9 μήνες, από 01 12 2004 έως 31 08 2005. 13.3. Εκπόνηση μελέτης έρευνας για τα διεθνή standards τεκμηρίωσης ψηφιοποιημένου πολιτιστικού υλικού. Διάρκεια: 1 μήνας, από 07 12 2004 έως 29 12 2004. 13.4. Ανάπτυξη λογισμικού για το τμήμα Intelligent Agents της τελικής πλατφόρμας του έργου QUALEG (IST, Contract Number IST 2002 507767, Sixth Framework Programme). Διάρκεια: 8 μήνες, από 03 01 2005 έως 02 09 2005. 13.5. Μέλος της Ερευνητικής Ομάδας του υποέργου «Ηλεκτρομαγνητικές Διαταραχές και συσχέτιση με σεισμούς» του Τμήματος Ηλεκτρονικής του Τ.Ε.Ι. Αθήνας (Επιστημονικός Υπεύθυνος Καθηγητής Κ. Νομικός) του προγράμματος «Αρχιμήδης Ενίσχυση Ερευνητικών Ομάδων στα Τ.Ε.Ι. (ΕΕΟΤ)» του Τ.Ε.Ι. Αθήνας, του Επιχειρησιακού Προγράμματος Εκπαίδευσης και Αρχικής Επαγγελματικής Κατάρτισης (ΕΠΕΑΕΚ ΙΙ), Μέτρο 2.2, Πράξη 2.2.3.ζ, Ένταξη ΥΠΕΠΘ 10842/22.6.2004. Διάρκεια: 14 μήνες, από 15 07 2005 έως 31 8 2006. 13.6. Ανάπτυξη ιατρικού λογισμικού για λογαριασμό της εταιρίας Grafimedia, Σπύρος Κοκκάλης και ΣΙΑ ΕΕ. Διάρκεια: 36 μήνες, από 02 01 2007 έως 31 12 2009. 13.7. Σχεδιασμός και παραγωγή ενημερωτικού υλικού για τη συμμετοχή του ΤΕΙ Αθήνας στο Φεστιβάλ Επιστήμης και Τεχνολογίας στα πλαίσια του υποέργου «Σύγχρονη Πραγματικότητα & Μελλοντικές Προοπτικές της Ιατρικής Τεχνολογίας: Θετικές Επιδράσεις & Δυνατότητες για την Ελληνική Κοινωνία, την Ακαδημαϊκή Κοινότητα και Βιομηχανία (ΜΕDI ΤΕCΗ ΝΕWS)» του Τμήματος Τεχνολογίας Ιατρικών Οργάνων του Τ.Ε.Ι. Αθήνας (Επιστημονικός Υπεύθυνος Επίκουρος Καθηγητής Γ. Λούντος) του προγράμματος «Ανταγωνιστικότητα και Επιχειρηματικότητα 2007 2013 (ΕΠΑΝ ΙΙ)». Διάρκεια: 3 μήνες, από 20 08 2008 έως 10 12 2008. Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 12
13.8. Ανάπτυξη ιατρικού λογισμικού για λογαριασμό της εταιρίας Grafimedia, Σπύρος Κοκκάλης και ΣΙΑ ΕΕ. Από 01 01 2010 έως σήμερα. 14. ΣΥΓΓΡΑΦΙΚΗ ΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΗΤΑ 14.1. «Σύστημα τηλεραδιολογίας βασισμένο σε προσωπικούς ψηφιακούς βοηθούς». Πτυχιακή εργασία, Αθήνα 2004. 14.2. «Mobile medical teleconsultation system». Μεταπτυχιακή εργασία, Αθήνα 2006. 14.3. «Υπολογιστικό Σύστημα Αυτόματης Διάγνωσης Όγκων Εγκεφάλου με τη χρήση Στατιστικών Μοντέλων και Μεθόδων Αναγνώρισης Προτύπων (Computer Assisted Diagnosis of Brain Tumors based on Statistical Methods and Pattern Recognition Techniques)». Διδακτορική διατριβή, Πάτρα 2010. 15. ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΟΙ ΕΠΑΓΓΕΛΜΑΤΙΚΟΙ ΣΥΛΛΟΓΟΙ IEEE Member IEEE Engineering in Medicine and Biology Society IEEE Communications Society Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 13
ΠΑΝΤΕΛΗΣ ΓΕΩΡΓΙΑΔΗΣ Μηχανικός Τεχνολογίας Ιατρικών Οργάνων Διδάκτορας Πανεπιστημίου Πατρών ΣΥΝΟΠΤΙΚΗ ΑΝΑΛΥΣΗ ΔΗΜΟΣΙΕΥΣΕΩΝ Η κύρια ερευνητική μου ασχολία εντοπίζεται στα πεδία της επεξεργασίας, ανάλυσης και μετάδοσης ψηφιακής εικόνας και σήματος καθώς και αναγνώρισης προτύπων για την δημιουργία συστημάτων διαχείρισης γνώσης και αποφάσεων. Συγκεκριμένα, έχω ασχοληθεί ερευνητικά με τους εξής τομείς: 1. Επεξεργασία, ανάλυση και μετάδοση ψηφιακής εικόνας Κατά τη διάρκεια της εκπόνησης της διδακτορικής μου διατριβής ασχολήθηκα με την επεξεργασία και ανάλυση ψηφιακής ιατρικής εικόνας, στο Εργαστήριο Επεξεργασίας Ιατρικού Σήματος και Εικόνας (MEDISP) του τμήματος Τεχνολογίας Ιατρικών Οργάνων του ΤΕΙ Αθήνας (διευθυντής: Καθηγητής Δρ. Διονύσιος Κάβουρας) καθώς και στο Εργαστήριο Επεξεργασίας και Ανάλυσης Ιατρικής Εικόνας (MIPA) του τμήματος Ιατρικής του Πανεπιστημίου Πατρών (διευθυντής: Καθηγητής Δρ. Γεώργιος Νικηφορίδης). Κατά τη διάρκεια της ανωτέρω ερευνητικής μου δραστηριότητας στο πεδίο της ανάλυσης εικόνας, ασχολήθηκα κυρίως με την ανάπτυξη και υλοποίηση, σε γλώσσα προγραμματισμού C/C++, λογισμικών συστημάτων αναγνώρισης προτύπων (pattern recognition), με ενσωματωμένες διαδικασίες εξαγωγής χαρακτηριστικών παραμέτρων από τις ψηφιακές εικόνες, μείωσης του πλήθους των απαιτούμενων χαρακτηριστικών, επιλογής των κατάλληλων χαρακτηριστικών, εκπαίδευσης με κλασσικούς και σύγχρονους ταξινομητές αναγνώρισης προτύπων, και αξιολόγησης των ταξινομητών αυτών. Οι ταξινομητές αναγνώρισης προτύπων που ανεπτύχθησαν είναι οι ελάχιστης απόστασης (minimum distance, MD, με χρήση κυρίως για εκπαιδευτικούς λόγους), ελαχίστων τετραγώνων ελάχιστης απόστασης σε γραμμική και πολυωνυμική μορφή (least squares minimum distance, LSMD linear, quadratic, cubic, ), Bayesian, k πλήθους πλησιέστερων γειτόνων (k nearest neighbors, k NN), τεχνητών νευρωνικών δικτύων (και συγκεκριμένα back propagation multilayer perceptron, MLP), πιθανοκρατικών νευρωνικών δικτύων (probabilistic neural networks, PNNs), καθώς και ταξινομητής βασισμένος στις μηχανές διανυσμάτων στήριξης (support vector machines, SVMs). Οι χαρακτηριστικές παράμετροι, που εξήχθησαν από τις ψηφιακές εικόνες και αποτελούσαν τα διανύσματα εισόδου των ταξινομητών, περιελάμβαναν (α) μορφολογικά χαρακτηριστικά μεγέθους και σχήματος παρυφής και (β) στατιστικά χαρακτηριστικά υφής 1ης τάξεως προερχόμενα από το ιστόγραμμα της εικόνας, και 2ης τάξεως προερχόμενα από τις μήτρες χωρικής εξάρτησης των τόνων του γκρι (gray level spatial dependence / co occurrence matrices) και από τις μήτρες μήκους διαδρομής των τόνων του γκρι (gray level run length matrices). Για τη μείωση του πλήθους των απαιτούμενων χαρακτηριστικών υλοποιήθηκαν οι μέθοδοι της εξαντλητικής διερεύνησης (exhaustive search), καθώς και της επαναξιολόγησης μετά από διαδοχική προσθήκη (sequential step forward selection) ή εξαίρεση (sequential step backward selection) χαρακτηριστικών. Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 14
Η αξιολόγηση των ταξινομητών, αφ ενός για την επιλογή των κατάλληλων χαρακτηριστικών, και αφ ετέρου για εύρεση της ακρίβειας ταξινόμησης και της ικανότητας γενίκευσης του συστήματος, έγινε με υλοποίηση και εφαρμογή μεθόδων τύπου διασταυρούμενης επικύρωσης (cross validation), όπως της διαδοχικής εξαίρεσης ενός προτύπου (leave one out) από το σύνολο των προς εκπαίδευση δεδομένων, της k ομάδων (k fold) και της επαναληπτικής ή μη διαίρεσης του συνόλου των δεδομένων (holdout). Όσον αφορά στο ερευνητικό πεδίο της επεξεργασίας εικόνας, συμμετείχα σε εργασίες όπου ασχολήθηκα με τεχνικές βελτίωσης εικόνας (συμπίεση θορύβου, αύξηση αντίθεσης κλπ), με υλοποίηση κλασσικών ψηφιακών φίλτρων και με χρήση κυματιδίων (wavelets), με μεθόδους αυτόματης ανεύρεσης παρυφών με χρήση κυματιδίων, καθώς και με τεχνικές τμηματοποίησης (segmentation) μέσω ομαδοποίησης (clustering). Τα συστήματα επεξεργασίας εικόνας και αναγνώρισης προτύπων που αναπτύχθηκαν εφαρμόστηκαν σε ιατρικές ψηφιακές εικόνες που προήρχοντο από διάφορα απεικονιστικά συστήματα (υπέρηχοι, ακτινογραφίες, αξονικές τομογραφίες, μαγνητικές τομογραφίες, σπινθηρογραφικές τομογραφίες SPECT), με σκοπούς (α) τη βελτίωση της εικόνας για την αποκόμιση των χρήσιμων πληροφοριών προς τον ιατρό από αυτήν, και (β) την αυτόματη ταξινόμηση με τη βοήθεια υπολογιστή εικόνων διαφόρων κατηγοριών για την υποβοήθηση κλινικής διαφορικής διάγνωσης. Συγκεκριμένα: α) Αναπτύχθηκε σύστημα ταξινόμησης όγκων εγκεφάλου από εικόνες και σήματα φασματοσκοπίας προερχόμενα από μαγνητική τομογραφία (θέμα της διδακτορικής διατριβής μου) που περιελάμβανε συνδυασμό μετασχηματισμού τύπου ελαχίστων τετραγώνων δευτέρου βαθμού για αύξηση του διαχωρισμό των κατηγοριών εκπαίδευσης και ταξινομητή πιθανοκρατικού νευρωνικού δικτύου (PNN) και του ταξινομητή μηχανών διανυσμάτων στήριξης (SVM) που λειτουργούσε σε διανύσματα εισόδου αποτελούμενα από χαρακτηριστικά υφής προερχόμενα από το ιστόγραμμα των εικόνων καθώς και από τις μήτρες χωρικής συνεμφάνισης και μήκους διαδρομής τόνων του γκρι (gray level co occurrence & gray level run length matrices). Η συγκεκριμένη μελέτη οδήγησε σε τέσσερις (4) δημοσιεύσεις σε διεθνή επιστημονικά περιοδικά, σε μία (1) δημοσίευση σε πρακτικά διεθνούς συνεδρίου με κριτές, μία (1) δημοσίευση σε βιβλίο περιλήψεων εθνικού συνεδρίου και μία (1) δημοσίευση σε επιστημονικό περιοδικό χωρίς δείκτη απήχησης: P. Georgiadis, D. Cavouras, I. Kalatzis, A. Daskalakis, G. Kagadis, K. Sifaki, M. Malamas, G. Nikiforidis and E. Solomou, Non linear Least Squares Features Transformation for Improving the Performance of Probabilistic Neural Networks in Classifying Human Brain Tumors on MRI, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 4707, pp. 239 247, 2007. P. Georgiadis, D. Cavouras, I. Kalatzis, A. Daskalakis, G. C. Kagadis, K. Sifaki, M. Malamas, G. Nikiforidis and E. Solomou, Improving brain tumor characterization on MRI by probabilistic neural networks and non linear transformation of textural features, Computer Methods and Programs in Biomedicine, Vol. 89 (1), pp. 24 32, 2008. P. Georgiadis, D. Cavouras, I. Kalatzis, D. Glotsos, E. Athanasiadis, S. Kostopoulos, K. Sifaki, M. Malamas, G. Nikiforidis and E. Solomou, Enhancing the discrimination accuracy between metastases, gliomas and meningiomas on brain MRI by volumetric Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 15
textural features and ensemble pattern recognition methods, Magnetic Resonance Imaging, Vol. 27 (1), pp. 120 130, 2009. P. Georgiadis, S. Kostopoulos, D. Cavouras, D. Glotsos, I. Kalatzis, K. Sifaki, M. Malamas, E. Solomou and G. Nikiforidis, Quantitative combination of volumetric MR imaging and MR spectroscopy data for the discrimination of meningiomas from metastatic brain tumors by means of pattern recognition, Magnetic Resonance Imaging (υπό κρίση). P. Georgiadis, D. Cavouras, I. Kalatzis, A. Daskalakis, P. Theocharakis, S. Kostopoulos, P. Bougioukos, K. Sifaki, M. Malamas, G. Nikiforidis and E. Solomou, Ensemble software classification for characterizing human brain tumours on MRI, 2 nd International Conference on Experiments / Process / System Modeling / Simulation / Optimization (2 nd IC EpsMsO), Athens, Greece, July 4 7, 2007. Π. Γεωργιάδης, Δ. Κάβουρας, Ι. Καλατζής, Α. Δασκαλάκης, Γ. Καγκάδης, Κ. Σιφάκη, Μ. Μάλαμας, Γ. Νικηφορίδης και Α. Σολωμού, Βελτίωση της ικανότητας χαρακτηρισμού όγκων εγκεφάλου με χρήση πιθανοκρατικού νευρωνικού δικτύου και μη γραμμικού μετασχηματισμού ελάχιστων τετραγώνων χαρακτηριστικών υφής σε εικόνες MRI, 17 ο Διαπανεπιστημιακό Συνέδριο Ακτινολογίας, Πάτρα, Ελλάδα, Νοέμβριος 9 11, 2007. P. Georgiadis, D. Cavouras, I. Kalatzis, D. Glotsos, K. Sifaki, M. Malamas, G. Nikiforidis and E. Solomou, Computer aided discrimination between primary and secondary brain tumors on MRI: From 2D to 3D texture analysis, e Journal of Science & Technology (e JST), Vol. 3 (2), pp. 9 18, 2008. β) Αναπτύχθηκαν μέθοδοι επεξεργασίας εικόνας με εφαρμογή στη βιοπληροφορική: Σε πραγματικές και προσομοιωμένες εικόνες μικροσυστοιχιών (microarrays) αναπτύχθηκαν μέθοδοι για τμηματοποίηση των κηλίδων (spots) για την ποσοτικοποίηση γονιδίων που περιελάμβαναν πλεγματοποίηση (gridding), ομαδοποίηση (clustering) για το διαχωρισμό του υποβάθρου, αυτόματη τμηματοποίηση και υπολογισμό της έντασης της κηλίδας. Η μελέτη επί της επεξεργασίας εικόνων μικροσυστοιχιών οδήγησε σε δύο (2) δημοσιεύσεις σε διεθνή επιστημονικά περιοδικά και σε δύο (2) δημοσιεύσεις σε πρακτικά διεθνών συνεδρίων με κριτές: A. Daskalakis, D. Cavouras, P. Bougioukos, S. Kostopoulos, P. Georgiadis, I. Kalatzis, G. Kagadis and G. Nikiforidis, Effective Quantification of Gene Expression Levels in Microarray Images Using a Spot Adaptive Compound Clustering Enhancement Segmentation Scheme, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 4707, pp. 555 565, 2007. E. Athanasiadis, D. Cavouras, D. Glotsos, P. Georgiadis, I. Kalatzis and G. Nikiforidis, Segmentation of complementary DNA microarray images by wavelet based Markov random field model, IEEE Transactions on Information Technology in Biomedicine, Vol. 13 (6), pp. 1068 1074, 2009. A. Daskalakis, D. Cavouras, P. Bougioukos, S. Kostopoulos, P. Georgiadis, I. Kalatzis and G. Nikiforidis, An Efficient CLAHE based, Spot Adaptive, image segmentation technique for improving Microarray Genes Quantification, 2 nd International Conference on Experiments / Process / System Modeling / Simulation / Optimization (2 nd IC EpsMsO), Athens, Greece, July 4 7, 2007. Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 16
A. Daskalakis, D. Cavouras, P. Bougioukos, S. Kostopoulos, P. Georgiadis, I. Kalatzis, G. Kagadis and G. Nikiforidis, Genes expression level quantification using a spot based algorithmic pipeline, 29th Annual International Conference, IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (29 th EMBC), Lyon, France, August 23 26, 2007. γ) Αναπτύχθηκε σύστημα αναγνώρισης προτύπων για την εκτίμηση της ποσοτικοποίησης των υποδοχέων οιστρογόνων με χρήση εικόνων μικροσκοπίας από βιοψίες προερχόμενες από περιπτώσεις καρκίνου του μαστού. Η διαδικασία περιελάμβανε τμηματοποίηση των πυρήνων των κυττάρων, υπολογισμό χαρακτηριστικών υφής μετά από επεξεργασία των εικόνων με φίλτρα Gabor και Laws, και είσοδο των διανυσμάτων που αποτελούντο από τα ανωτέρω χαρακτηριστικά σε ταξινομητές πιθανοκρατικού νευρωνικού δικτύου (PNN) και μηχανών διανυσμάτων στήριξης (SVM). Η συγκεκριμένη μελέτη οδήγησε σε δύο (2) δημοσιεύσεις σε διεθνές επιστημονικό περιοδικό και μία (1) δημοσίευση σε πρακτικά διεθνούς συνεδρίου με κριτές: S. Kostopoulos, D. Cavouras, A. Daskalakis, G. Kagadis, I. Kalatzis, P. Georgiadis, P. Ravazoula and G. Nikiforidis, Cascade Pattern Recognition Structure for Improving Quantitative Assessment of Estrogen Receptor Status in Breast Tissue Carcinomas, Analytical and Quantitative Cytology and Histology, Vol. 30 (4), pp. 218 225, 2008. S. Kostopoulos, D. Glotsos, D. Cavouras, A. Daskalakis, I. Kalatzis, P. Georgiadis, P. Bougioukos, P. Ravazoula and G. Nikiforidis, Computer Based Association of the Texture of Expressed Estrogen Receptor Nuclei with Histologic Grade Using Immunohistochemically Stained Breast Carcinomas, Analytical and Quantitative Cytology and Histology, Vol. 31 (4), pp. 187 196, 2009. S. Kostopoulos, D. Cavouras, A. Daskalakis, P. Bougioukos, P. Georgiadis, G. C. Kagadis, I. Kalatzis, P. Ravazoula, G. Nikiforidis, Colour Texture Based Image Analysis Method for Assessing the Hormone Receptors Status in Breast Tissue Sections, 29th Annual International Conference, IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (29 th EMBC), Lyon, France, August 23 26, 2007. δ) Αναπτύχθηκε σύστημα τμηματοποίησης αλλοιώσεων πολλαπλών σκληρώσεων και διαχωρισμού τους από εγκεφαλικές μικρο αγγειοπάθειες σε εικόνες προερχόμενες από μαγνητική τομογραφία με τη χρήση ταξινομητή πιθανοκρατικού νευρωνικού δικτύου (PNN) και διανυσμάτων εισόδου αποτελούμενα από χαρακτηριστικά υφής προερχόμενα από το ιστόγραμμα των εικόνων καθώς και από τις μήτρες χωρικής συνεμφάνισης και μήκους διαδρομής τόνων του γκρι (gray level co occurrence & graylevel run length matrices). Η συγκεκριμένη εργασία οδήγησε σε μία (1) δημοσίευση σε διεθνές επιστημονικό περιοδικό και σε μία (1) δημοσίευση σε πρακτικά διεθνούς συνεδρίου με κριτές: P. Theocharakis, D. Glotsos, I. Kalatzis, S. Kostopoulos, P. Georgiadis, K. Sifaki, K. Tsakouridou, M. Malamas, G. Delibasis, D. Cavouras and G. Nikiforidis, Pattern recognition system for the discrimination of multiple sclerosis from cerebral microangiopathy lesions based on texture analysis of Magnetic Resonance images, Magnetic Resonance Imaging, Vol. 27 (3), pp. 417 422, 2009. P. Theocharakis, P. Georgiadis, M. Malamas, K. Sifaki, D. Cavouras and G. Nikiforidis, Segmentation of MR Brain Images by Genetic K Means Algorithm for the Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 17
Measurement of Brain Volume on the Problem of Brain Atrophy Accompanying Patients With Multiple Sclerosis, 5 th European Symposium on Biomedical Engineering (5 th ES BE 2006), Patras, Greece, July 7 9, 2006. ε) Αναπτύχθηκε σύστημα διαχωρισμού ιστών μη παθολογικών, μολυσματικών και καρκινικών του ανθρώπινου προστάτη σε εικόνες προερχόμενες από υπερηχογραφία με τη χρήση των ταξινομητών Bayesian, του ταξινομητή πιθανοκρατικού νευρωνικού δικτύου (PNN) και του ταξινομητή μηχανών διανυσμάτων στήριξης (SVM). Τα αποτελέσματα της ταξινόμησης ανά ταξινομητή συγκεντρώθηκαν σε ένα πλειοψηφικό (majority vote) σύστημα λήψης απόφασης. Τα διανύσματα εισόδου αποτελούταν από χαρακτηριστικά υφής προερχόμενα από το ιστόγραμμα των εικόνων καθώς και από τις μήτρες χωρικής συνεμφάνισης και μήκους διαδρομής τόνων του γκρι (gray level co occurrence & gray level run length matrices). Η συγκεκριμένη εργασία οδήγησε σε μία (1) δημοσίευση σε διεθνές επιστημονικό περιοδικό: D. Glotsos, I. Kalatzis, P. Theocharakis, P. Georgiadis, A. Daskalakis, K. Ninos, P. Zoumboulis, A. Filippidou and D. Cavouras, A multi classifier system for the characterization of normal, infectious, and cancerous prostate tissues employing transrectal ultrasound images, Computer Methods and Programs in Biomedicine, Vol. 97 (1), pp. 53 61, 2010. ζ) Αναπτύχθηκε και αξιολογήθηκε πλατφόρμα εφαρμογών για το περιβάλλον των προσωπικών ψηφιακών βοηθών (Personal Digital Assisstants PDAs) η οποία αναλαμβάνει να παραλάβει, να απεικονίσει και να επεξεργαστεί στατικές ιατρικές εικόνες υψηλής ποιότητας, προσφέροντας υπηρεσίες ασύρματης φορητής τηλεραδιολογίας. Ο κάθε προσωπικός ψηφιακός βοηθός, που εκτελεί την εφαρμογή, έχει την ικανότητα να παραλάβει εικόνες, να τις φορτώσει και να τις αποθηκεύσει (DICOM, BMP, JPG, GIF, PCX, PNG και TIFF), να τις επεξεργαστεί (τεχνικές παραθύρου, τροποποίησης ιστογράμματος και χωρικού φιλτραρίσματος), να τις διαχειριστεί γεωμετρικά (περιστροφή, μεγέθυνση, κατοπτρισμός και αναστροφή) και τέλος να πραγματοποιήσει σε αυτές μετρήσεις αποστάσεως και επιφανείας. Τέλος υπάρχει και η δυνατότητα μεταφοράς βίντεο και ήχου σε πραγματικό χρόνο μέσω του πρωτοκόλλου H.323 καθιστώντας το σύστημα ένα χρήσιμο εργαλείο τηλεϊατρικής. Η συγκεκριμένη εργασία οδήγησε σε μία (1) δημοσίευση σε διεθνές επιστημονικό περιοδικό, σε δέκα (10) δημοσιεύσεις σε πρακτικά διεθνών συνεδρίων με κριτές, μία (1) δημοσίευση σε βιβλίο περιλήψεων εθνικού συνεδρίου και μία (1) δημοσίευση σε επιστημονικό περιοδικό χωρίς δείκτη απήχησης: K. Ninos, S. Kostopoulos, D. Glotsos, P. Georgiadis, K. Sidiropoulos, N. Dimitropoulos, I. Kalatzis and D. Cavouras, Development and evaluation of a PDA based teleradiology terminal in thyroid nodule diagnosis, Journal of Telemedicine and Telecare, Vol. 16 (5), pp. 232 236, 2010. P. Georgiadis, K. Banitsas, H. Georgiou, K. Sidiropoulos, S. Tachakra, N. Dimitropoulos and D. Cavouras, A PDA Based teleradiology system, 1 st International Conference From Scientific Computing to Computational Engineering (1 st IC SCCE), Athens, Greece, September 10 18, 2004. K. Banitsas, P. Georgiadis, S. Tachakra and D. Cavouras, Using handheld devices for real time wireless Teleconsultation, 26 th Annual International Conference, IEEE Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 18
Engineering in Medicine and Biology Society (26 th EMBC), San Francisco, California, USA, September 1 5, 2004. P. Georgiadis, K. Banitsas, H. Georgiou, K. Sidiropoulos, N. Dimitropoulos, S. Tachakra, and D. Cavouras, A Smartphone Based Teleradiology System, 4 th European Symposium on Biomedical Engineering (4 th ES BE 2004), Patras, Greece, June 25 27, 2004. P. Georgiadis, K. Sidiropoulos, H. Georgiou, C. Makris, D. Glotsos and D. Cavouras, A PDA Based teleprocessing system, 1 st International Conference on Experiments / Process / System Modeling / Simulation / Optimization (1 st IC EpsMsO), Athens, Greece, July 6 9, 2005. E. Polyxronopoulou, A. Daskalakis, P. Georgiadis, K. Sidiropoulos, D. Glotsos, P. Ravazoula, D. Cavouras and G. Nikiforidis, Development of a Telemedicine image processing and transferring system over a Wireless Computer Network, 1 st International Conference on Experiments / Process / System Modeling / Simulation / Optimization (1 st IC EpsMsO), Athens, Greece, July 6 9, 2005. P. Georgiadis, K. Sidiropoulos, Ch. Hikimtzis, K. Banitsas, N. Dimitropoulos and D. Cavouras, PDA based teleradiology system with real time voice conferencing capabilities, 2 nd International Conference From Scientific Computing to Computational Engineering (2 nd IC SCCE), Athens, Greece, July 5 8, 2006. K. Sidiropoulos, P. Georgiadis, N. Dimitropoulos and D. Cavouras, Personal Mobile Medical Assistant Employing RFID Technology, 5 th European Symposium on Biomedical Engineering (5 th ES BE 2006), Patras, Greece, July 7 9, 2006. K. Banitsas, P. Georgiadis, S. Tachakra and D. Cavouras, Mobile consultant: combining total mobility with constant access, 28 th Annual International Conference, IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (28 th EMBC), New York City, New York, USA, August 30 September 3, 2006. P. Georgiadis, D. Cavouras, A. Daskalakis, K. Sifaki, M. Malamas, G. Nikiforidis and E. Solomou, PDA based system with teleradiology and image analysis capabilities, 29 th Annual International Conference, IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (29 th EMBC), Lyon, France, August 23 26, 2007. K. Banitsas, P. Georgiadis, S. Tachakra and D. Cavouras, Mobile consultant: evaluation of additional services, 29th Annual International Conference, IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (29 th EMBC), Lyon, France, August 23 26, 2007. Π. Γεωργιάδης, Κ. Σιδηρόπουλος, Χ. Μακρής, Χ. Γεωργίου, Ν. Δημητρόπουλος και Δ. Κάβουρας, Σύστημα τηλεραδιολογίας βασισμένο σε προσωπικούς ψηφιακούς βοηθούς, 14 ο Διαπανεπιστημιακό Συνέδριο Ακτινολογίας, Ηράκλειο, Ελλάδα, Νοέμβριος 11 14, 2004. K. Banitsas, T. Kalyvas and P. Georgiadis, Mobile consultant: diagnosis and consultation on the go, Hospital The Official Journal of the European Association of Hospital Managers, Vol. 1 (4), pp. 12 13, 2007. 2. Επεξεργασία, ανάλυση και μετάδοση ψηφιακού σήματος Παράλληλα με τα συστήματα ανάλυσης και αναγνώρισης προτύπων σε ψηφιακές εικόνες αναπτύχθηκαν και αντίστοιχα συστήματα για (μονοδιάστατα) ψηφιακά σήματα. Παντελής Γεωργιάδης, Νοέμβριος 2010 19