ΒΙΟMIC Κέντρο Βιοανάλυσης και Τεχνολογιών Omics

Transcript

1 ΒΙΟMIC Κέντρο Βιοανάλυσης και Τεχνολογιών Omics Συντονιστής: Γ. Θεοδωρίδης, καθ. Τμ. Χημείας

2 BIOMIC

3 ΒΙΟΜΙC: Ανθρώπινο δυναμικό 1 ΓΕΩΡΓΙΟΣ ΘΕΟΔΩΡΙΔΗΣ (Καθ. Χημ) Βιοαναλυτική Χημεία, Μεταβολομική, LC- MS, Χρωματογραφία, Φασματοσκοπικές Τεχνικές 2 ΓΕΩΡΓΙΟΣ ΚΑΡΑΚΙΟΥΛΑΚΗΣ (Καθ. Ιατρ) Βιοδιαθεσιμότητα, Φαρμακολογία 3 ΔΗΜΗΤΡΙΟΣ ΚΟΥΒΕΛΑΣ (Καθ. Ιατρ) Κλινικές Μελέτες φάσης Ι και ΙΙ, Βιοϊσοδυναμία 4 ΓΕΩΡΓΙΟΣ ΑΡΣΕΝΟΣ (Καθ. Κτηνιατρ) Ζωική παραγωγή 5 ΝΙΚΟΛΑΟΣ ΡΑΙΚΟΣ (Αν.Καθ. Ιατρ.) Κλινική, Αναλυτική και Ιατροδικαστική Τοξικολογία, GC- MS, LC- MS 6 ΒΑΣΙΛΗΣ ΜΟΥΓΙΟΣ (Καθ. ΤΕΦΑΑ) Βιοχημεία της Ασκησης 7 ΑΛΕΞΑΝΔΡΟΣ ΤΡΙΑΝΤΑΦΥΛΛΙΔΗΣ (Αν.Καθ. Βιολ) Γενετική πληθυσμών ζώων, Γονιδιωματική, Ιχνηλασιμότητα 8 ΕΛΕΝΗ ΓΚΙΚΑ (Λέκτορας Ιατρ.) Βιοαναλυτική, Μεταβολομική, Εύρεση Βιοδεικτών, LC- MS, NMR, GC- MS 9 ΙΩΑΝΝΗΣ ΒΛΑΧΑΒΑΣ (Καθ. Πληρ.) Μηχανική Μάθηση και Ανακάλυψη γνώσης από Βάσεις Δεδομένων (Data Mining 10 ΕΜΜΑΝΟΥΗΛ ΡΟΗΛΙΔΗΣ (Καθ. Ιατρ) Λοιμωξιολογία, Ανοσολογία Λοιμώξεων, Βιομεμβράνες 11 ΚΟΣΜΑΣ ΣΑΡΑΦΙΔΗΣ (Αν. Καθ. Ιατρ.) Νεογνολογία, Παιδιατρική 12 ΣΥΜΕΩΝ ΜΕΤΑΛΛΙΔΗΣ (Επικ. Καθ. Ιατρ.) Λοιμωξιολογία, Θεραπευτική, Γενική παθολογία 13 ΝΙΚΟΣ ΝΕΝΑΔΗΣ (Επικ. Καθ. Χημ.) Οξείδωση λιπών και ελαίων, φαινολικά αντιοξειδωτικά, ενόργανη ανάλυση 14 ΑΝΑΣΤΑΣΙΑ ΚΑΡΙΩΤΗ (Επικ. Καθ. Φαρμ.) Χημεία Φυσικών Βιοδραστικών Προϊόντων, απομόνωση και ταυτοποίηση. Ελεγχος ποιότητας φυτοθεραπευτικών/συμπληρωμάτων διατροφής. 15 ΣΤΑΥΡΟΣ ΚΑΛΟΓΙΑΝΝΗΣ (Επικ. Καθ. ΑΤΕΙ Διατροφής) Μελη ΔΕΠ Βιοχημεία Τροφίμων και Διατροφής 16 ΔΗΜΗΤΡΑ ΛΑΜΠΡΟΠΟΥΛΟΥ (Επικ. Καθ. Χημ) Ελεγχος ρύπανσης περιβαλλοντος

4 ΒΙΟΜΙC: Ανθρώπινο δυναμικό Ερευνητές 1 Δρ. Λεμονιά Βαλιάνου Χημικός, Δρ. Αναλυτική Χημεία Βιοαναλυτική, LC- MS, GC- MS 2 Δημήτριος Παλαχάνης Χημικός, MSc Bioinforma~cs Βιοπληροφορική 3 Ολγα Δέδα Βιο- Χημικός, MSc Βιοαναλυτική Χημεία Βιοαναλυτική, LC- MS, GC- MS, NMR 4 Χριστίνα Βιργιλίου Χημικός, MSc Αναλυτική Τοξικολογία Βιοαναλυτική, LC- MS, GC- MS 5 Χρυσοβαλάντου Χατζηιωάννου Χημικός, MSc Βιοαναλυτική Χημεία Βιοαναλυτική, LC- MS, GC- MS, NMR 6 Ολγα Μπέγου Χημικός, MSc Βιοαναλυτική Χημεία Βιοαναλυτική, LC- MS 7 Νικολέττα Καραίσκου Βιολόγος, ΕΔΙΠ Γενετική Πληθυσμών 8 Αικατερίνη Σιώπη Διατροφή και διαιτολογία Επιστήμες άσκησης, διατροφή και διαιτολογία 9 Καβακιώτης Ιωάννης Πληροφορικός MSc Πληροφοριακά Συστήματα MSc Εφαρμοσμένη Γενετική και Βιοτεχνολογία, Ανάλυση δεδομένων 10 Ελένη Παπακωνσταντίνου Φαρμακολόγος Βιοϊσοδυναμία, Βιοδιαθεσιμότητα, Φαρμακοκινητική

5 Δομή Σύστημα Ι: HPLC (Aliance Waters) - API350 MS (Applied Biosystems) Σύστημα ΙΙ: UPLC (Acquity Waters) - TOF- HR- MS (Ul~ma Waters) Σύστημα ΙΙΙ: UPLC ( Accela)- TSQ Quantum MS (Thermo) Σύστημα ΙV: GC FID (Agilent)

6 Δράσεις Εφαρμοσμένη έρευνα Παροχή υπηρεσιών Οι δράσεις μπορούν να εξυπηρετήσουν τις ανάγκες φαρμακευτικών εταιριών, εταιριών του αγροδιατροφικού τομέα (παραγωγή, έλεγχος ποιότητας), εταιριών βιοχημικών ή άλλων αναλύσεων καθώς και παροχή υπηρεσιών σε μεμονωμένους παραγωγούς Εφαρμογή τεχνολογιών omics σε θέματα υγείας, διατροφής και τροφίμων Βιοδείκτες ασθενειών (διάγνωση- πρόγνωση), > 40 μελέτες (τοξικότητα, ρευματοειδής αρθρίτιδα, σήψη, IVF, ανάπτυξη εμβρύων, παχυσαρκία, μεταβολικό σύνδρομο κ.α.) Χαρακτηρισμός προϊόντων/τροφίμων υψηλής διατροφικής αξίας, έλεγχος γεωγραφικής προέλευσης και αυθεντικότητας (μέλι, κρασί, φρούτα κ.α.), Προϊόντα βιοτεχνολογικής βελτίωσης (γενετικό/μεταβολικό προφίλ). Ανάπτυξη και παροχή υπηρεσιών στο πεδίο κλινικών μελετών φάσης Ι και ΙΙ, βιοϊσοδυναμίας - βιοδιαθεσιμότητας φαρμακευτικών ουσιών που προορίζονται για άνθρωπο και ζώα και προσδιορισμό καταλοίπων από χορήγηση φαρμακευτικών ουσιών σε ζώα. Ελεγχος ποιότητας ιατρικών και κτηνιατρικών φαρμακευτικών σκευασμάτων (φυτοθεραπευτικά σκευάσματα- συμπληρώματα διατροφής κ.α.) Βιο- φαρμακευτική ανάλυση και έλεγχος θεραπευτικών επιπέδων φαρμάκων Παροχή υπηρεσιών στο πεδίο περιβαλλοντικού ελέγχου Ανάπτυξη και παροχή Υπηρεσιών σε ανάλυση Δεδομένων

7 Γενετικές Υπηρεσίες Ιχνηλασιμότητας σε ζώα και στα παράγωγά τους Σχολή: ΘΕΤΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ Τμήμα: ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ Τομέας: ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ, ΑΝΑΠΤΥΞΗΣ ΚΑΙ ΜΟΡΙΑΚΗΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ Διευθυντής: Αναπληρωτής Καθηγητής Τριανταφυλλίδης Αλέξανδρος E- mail: Eφαρμογή της γενετικής και του DNA στην ταυτοποίηση ζώων και τροφίμων. Χρησιμοποιούνται κυρίως ουδέτεροι μοριακοί δείκτες (μιτοχονδριακό DNA και μικροδορυφορικό DNA), ενώ ήδη συμπεριλαμβάνονται και τεχνολογίες αλληλούχησης νέας γενιάς (NGS) και βιοπληροφορικής ανάλυσης γονιδιωματικών δεδομένων.

8 Γενετικές Υπηρεσίες Ιχνηλασιμότητας σε ζώα και στα παράγωγά τους Ποιοτική και ποσοτική ανάλυση προϊόντων κρέατος Ταυτοποίηση ειδών όπως μοσχάρι, κατσίκα, κοτόπουλο, πρόβατο, χοίρος, άλογο σε τρόφιμα ιχθυηρών Ταυτοποίηση νοθείας σε επίπεδο είδους σε ιχθυηρά τρόφιμα εκτρεφόμενων ζώων Ταυτοποίηση ενδημικότητας σε επίπεδο γεωγραφικής προέλευσης. Ταυτοποίηση ελληνικών παραγωγικών φυλών (μαύρος χοίρος, φυλές αιγοπροβάτων) γεννητόρων και παραγώγων Ταυτοποίηση γονέων και απογόνων σε παραγωγικά ζώα προέλευσης Ταυτοποίηση άγριων και καλλιεργούμενων ατόμων τσιπούρας και λαυρακιού στα ελληνικά ύδατα θηραμάτων Αγριόχοιρος, λαγός, ελάφι, ορεινή/νησιωτική/πεδινή πέρδικα, φασιανός Μελλοντικά Βιοπαρακολούθηση περιβάλλοντος με υπηρεσίες Next Genera~on Sequencing ΠΕΛΑΤΕΣ: ΕΦΕΤ, Κρατικές Υπηρεσίες, Κτηνοτρόφοι, Γαλακτοβιομηχανία, Δασολόγοι, Κυνηγοί, Ιχθυοκαλλιεργητές, Ιδιώτες ΧοίροςΆλογο Πρόβατο Κοτόπουλο Κατσίκα Μοσχάρι

9 Στόχοι - Προοπτικές Συνένωση δυνάμεων, ειδικοτήτων, εμπειρίας, υλικών για τη δημιουργία ενός σύγχρονου κέντρου βιοανάλυσης και τεχνολογιών - omics. Το κεντρικό αυτό εργαστήριο λείπει από το ΑΠΘ Ερευνα αιχμής και παροχή υπηρεσιών σε δι- επιστημονικά πεδία. Ανάπτυξη νέων μεθόδων και υπηρεσιών. Διαπίστευση μεθόδων. Υποβολή ερευνητικών προτάσεων, προσέλκυση χρηματοδότησης, εκπαίδευση νέων ερευνητών