مقایسه سطح پالسمایی RNA طویل غيرکدکننده BDNF-AS در بيماران مبتال به آلزایمر با افراد سالم

Transcript

1 و 8 و 5 و 7 مقاله تحقیقی مجله دانشگاه علوم پزشکی بابل دوره بیستم شمارة 4 فروردین 3179 صفحه مقایسه سطح پالسمایی RNA طویل غيرکدکننده BDNF-AS در بيماران مبتال به آلزایمر با افراد سالم رقیه عزیزي آقاعلی )MSc( 3 محمد خلج کندري )PhD( 3* نرگس زینال زاده )PhD( 3 محمد علی حسین پور فیضی )PhD( 3 2 مهدي فرهودي )MD( 2 مهناز طالبی )MD( 3 -گروه زیست شناسی دانشکده علوم طبیعی دانشگاه تبریز تبریز ایران 2 -مرکز تحقیقات علوم اعصاب دانشکده علوم پزشکی تبریز تبریز ایران دریافت: 76/8/8 اصالح: 76/33/31 پذیرش: 79/32/5 خالصه سابقه و هدف: تشخیص بیماري آلزایمر معموال زمانی صورت میگیرد که آسیب هاي جدي به مغز وارد شده و درمانهاي رایج در ممانعت از آن ناکارآمد هستند. یکی از RNAهاي دخیل در بیماري آلزایمر RNA غیرکدکننده بلند بنام )BDNF-AS(BDNF antisense میباشد. این مطالعه با هدف بررسی حضور و مقایسه سطح BDNF-AS در پالسماي بیماران آلزایمري و افراد سالم و ارزیابی پتانسیل آن به عنوان نشانگر پالسمایی براي بیماري آلزایمر صورت گرفت. مواد و روشها: در این مطالعه مورد-شاهدي 11 فرد مبتال به آلزایمر دیرهنگام و 11 فرد سالم بدون بیماري عصبی که از نظر سن با بیماران منطبق بودند براساس معیارهاي تشخیص بالینی بیماري آلزایمر توسط پزشک متخصص انتخاب و نمونه خون وریدي آنها دریافت شد. پالسماي نمونههاي خونی جداسازي و RNA تام پالسما استخراج شد. پس از سنتز cdna حضور BDNF-AS در پالسما توسط PCR بررسی شد. در نهایت مقدار نسبی رونوشتهاي BDNF-AS در نمونههاي پالسماي بیماران آلزایمري و سالم با استفاده از Real time PCR مورد بررسی و مقایسه قرار گرفت. یافته ها: نتایج حاصل نشان داد کهRNA غیرکدکننده بلند BDNF-AS در پالسماي افراد بیمار و کنترل وجود دارد و مقایسه دادههاي به دست آمده از PCR نشان داد که سطوح BDNF-AS در پالسماي گروه بیماران )1/319±1/123( افزایش معنیداري نسبت به افراد سالم ) 1/117±1/116 (دارد. نتیجه گیري: Real time نتایج حاصل از این بررسی اولیه نشان میدهد که شاید بتوان از مقدارRNA غیرکدکننده بلند BDNF-AS در پالسما به عنوان نشانگر خونی/پالسمایی براي تشخیص بیماري آلزایمر استفاده کرد. واژه هاي کلیدي: بیماري آلزایمر BDNF-AS نشانگر زیستی. مقدمه بیماري آلزایمر یکی از بیماريهاي تحلیل عصبی شایع میباشد و اغلب موارد زوال عقل را در افراد پیر سراسر دنیا تشکیل میدهد) 3 (. با این وجود تعداد آلزایمر باشد) 4 (. عامل دیگر در ایجاد بیماري آلزایمر پروتئین تاو میباشد. در مغز بیماران آلزایمري پروتئین تاو به صورت غیر طبیعی هایپرفسفریله است و با یک 1 اندکی از افراد در سنین میانسالی به این بیماري مبتال میشوند که درنتیجه این استوکیومتري حداقل برابر بیشتر از تاو طبیعی یک مشخصه بافتشناسی بیماري به شکلهاي زودهنگام و دیرهنگام طبقهبندي میشود )2(. آلزایمر دیرهنگام در سنین باالتر از 65 سال بروز میکند و تحقیقات مختلف نشان می دهد که تعامالت پیچیده بین عوامل ژنتیک اپیژنتیک و محیط عامل بروز آن میباشد) 1 (. با این وجود نقش اصلی در ایجاد بیماري آلزایمر را پروتئین آمیلوئید بتا )Aβ( بازي میکند که از شکافت پروتئولیتیکی پروتئین پیشساز آمیلوئید بتا بیماري است )6(. شواهد رو به رشدي نشان میدهند که کاهش سطوح عامل نوروتروفیک مشتق شده از مغز ( factor Brain derived neurotrophic )=BDNF میتواند مرتبط با پاتوژنز بیماري آلزایمر باشد (.)9 BDNF یکی از مهمترین عوامل دخیل در نوروژنز و پالستیستی سیناپس ها می باشد و کاهش آن در مغز بویژه هیپوکمپ به آسیب حافظه و یادگیري می انجامد فرآیندي که وقوع آن در آلزایمر اثبات شده است )8(. بررسی سطح سرمی BDNF در =APP( )Amyloid Precursor Protein حاصل میشود).)4 عدم تعادل بین تولید و پاکسازي و در نتیجه تجمع پپتیدهاي Aβ منجر به افزایش میزان Aβ میشود که این پدیده میتواند یک عامل شروعکننده براي بیماري بیماران آلزایمر پیشرفته و خفیف نشان داده است که سطح سرمی آن در بیماري آلزایمر نسبت به افراد سالم دچار کاهش می شود ( 8(. این مطالعات نشان می این مقاله حاصل بخشی از نتایج پایان نامه رقیه عزیزي آقاعلی دانشجوي کارشناسی ارشد رشته ژنتیک دانشگاه تبریز و طرح تحقیقاتی به شماره 2939 مصوب ستاد توسعه علوم و فناویهاي شناختی می باشد. مسئول مقاله: دکتر محمد خلج کندري * khalaj@tabrizu.ac.ir آدرس: تبریز بلوار 27 بهمن دانشگاه تبریز دانشکده علوم طبیعی گروه علوم جانوري. تلفن:

2 25 J Babol Univ Med Sci; 20(4); Apr 2018 Comparison between the Plasma Levels of Long Noncoding ; R. Azizi-Aghaali, et al دهند که اختالل در تنظیم رونویسی و ترجمه BDNF می تواند با کاهش بیان آن به روند تحلیل قواي شناختی در پیشرفت بیماري آلزایمر کمک کند. لذا تالشهاي زیادي براي درک نحوه تنظیم رونویسی و ترجمهBDNF صورت گرفته است. در طی چند سال گذشته گزارش شده است که رونوشتهاي آنتی- سنس طبیعی =NATs( )Natural antisense transcripts به طور بالقوه در اکثر اختالالت انسان شامل بیماري آلزایمر بیماري پارکینسون سندرم x شکننده و غیره درگیر میباشند) 31 (. NATها عموما از رشته مقابل سنس بسیاري از ژنهاي کدکننده پروتئین منشا میگیرند و اغلب در بخشی با mrna پروموتر و مناطق تنظیمی هم- پوشانی دارند) 33 (. مطالعات نشان داده است که BDNF با یک رونوشت آنتی- سنس بنام BDNF-AS که از رشته مقابل آن بیان میشود تنظیم میشود. BDNF-AS یک RNA بلند غیرکدکننده )lncrna( میباشد و جزو رونوشتهاي آنتیسنس طبیعی محسوب میشود. این ژن به طول حدود kb 373 روي کروموزوم 33 قرار دارد و شامل حداقل 31 اگزون میباشد که توسط یک پروموتر رونویسی میشوند) 32 (. اگزون 5 ژن BDNF-AS حدود 225 نوکلئوتید با همه واریانتهاي ژن BDNF همپوشانی کامل دارد. بنابراین می- تواند با BDNF mrna دوبلکس RNA-RNA تشکیل داده در تنظیم پایداري و ترجمه BDNF اثرگذار باشد )33( و بدین ترتیب میتواند در روند پیشرفت آلزایمر دخالت داشته باشد. هر دو رونوشت BDNF و BDNF-AS در بسیاري از بافتها همبیان هستند که نشان از ارتباط تنظیمی بین آنها می باشد) 32 (. در حال حاضر تشخیص بیماري آلزایمر زمانی صورت میگیرد که آسیبهاي شدید و غیر قابل برگشتی در مغز اتفاق افتاده است و این وضعیت درمان و حتی ممانعت از پیشرفت بیماري را غیرممکن میسازد )31(. مطالعات نشان داده است که شروع آسیبهاي منجر به آلزایمر به سالها قبل بر میگردد زمانی که تغییرات پروفایل بیانی ژنها در مغز اتفاق میافتد. تشخیص زودهنگام این تغییرات ممکن است اقدامات الزم براي جلوگیري از پیشرفت بیماري و توسعه درمانهاي موثر مفید باشد) 34 (. اما بافت مغز براي تشخیص زودهنگام تغییرات بیان ژنها در دسترس نمیباشد. از طرفی مایع مغزي-نخاعی ( fluid Cerebrospinal )=CSF منبع خوبی براي تحقیق و تشخیص در مورد بیماريهاي تحلیل عصبی از جمله آلزایمر میباشد اما کاربرد بالینی آن به دلیل تهاجمی بودن روش به ویژه در افراد سالمند محدود میباشد. گذشته از آن نیاز به افراد بسیار ماهر آن را براي استفادههاي معمول نامناسب میسازد. بنابراین شناسایی بیومارکرهاي جدید مقرون به صرفه و غیرتهاجمی که امکان شناسایی زودهنگام آلزایمر را فراهم کند ضروري به نظر می رسد. پالسما یک مایع بدنی پیچیده حاوي پروتئینها پپتیدها لیپیدها و متابولیتها میباشد که فعالیتهاي مختلف فیزیولوژیکی و پاتولوژیکی اندامهاي مختلف بدن از جمله سیستم عصبی مرکزي =CNS( )Central Nervous System را منعکس میکند و میتواند منبع مناسبی از نشانگرهاي زیستی بیماریهاي مختلف از جمله بیماريهاي تحلیل عصبی مثل آلزایمر باشد) 34 (. لذا این مطالعه با هدف بررسی حضور و مقایسه سطح BDNF-AS در پالسماي بیماران آلزایمري و افراد سالم و ارزیابی پتانسیل آن به عنوان نشانگر پالسمایی براي بیماري آلزایمر صورت گرفت. مواد و روشها این مطالعه مورد شاهدي پس از تصویب در کمیته اخالق دانشگاه علوم پزشکی تبریز با کد TBZMED.REC بر روي 11 نفر از مراجعه کننده به کلینیک اعصاب بیمارستان امام رضا )ع( تبریز انجام شد. تشخیص بیماري توسط متخصص بیماريهاي مغز و اعصاب بر اساس معیارهاي انستیتو ملی انجمن آلزایمر و پیري )NIA-AA( انجام شد و افراد کنترل نیز به تعداد 11 نفر از بین افرادي که هیچگونه بیماري اعصاب نداشتند و از لحاظ سنی با بیماران هماهنگ بودند با معاینه پزشک متخصص انتخاب شدند. افراد تحت مطالعه در صورت نداشتن رضایت عدم مطابقت عالیم با معیارهاي تشخیص آلزایمر دمانس هاي قابل برگشت شامل هیپوتیروییدي کمبود ویتامینهايB12,E,B1 الکلیسم مصرف داروهاي سایکوتیک افسردگی شدید نارسایی کبدي نارسایی کلیوي ضایعات فضاگیر مغزي سابقه هماتوم ساب دورال سابقه تروماي مغزي سابقه عفونت و آنسفالیت مغزي lewy و دمانس هاي غیرآلزایمر مانند دمانس لوب فرونتال و دمانس NPH body از مطالعه خارج شدند. از افراد شرکت کننده و یا قیم آنها رضایت آگاهانه اخذ شد و خونگیري از افراد صورت گرفت. پس از خونگیري پالسماي نمونهها جداسازي و به فریزر 81 - درجه سانتیگراد منتقل گردید. به منظور استخراج RNA ابتدا پالسماي مورد نظر از فریزر 81- درجه سانتیگراد خارج و سپس با استفاده از محلول تریزول شرکت Ambion استخراج RNA طبق پروتکل شرکت سازنده از نمونههاي پالسما انجام شد. پس از استخراج RNA غلظت و کیفیت RNA با استفاده از دستگاه نانودراپ بررسی شد. قبل از سنتز cdna براي حذف آلودگی احتمالی DNA تیمار با آنزیم Scientific) DNase I (Thermo صورت گرفت. پس از تیمار با استفاده از کیت PrimeScript TM RT reagent Kit ساخت شرکت Takara از روي RNAي به دست آمده از هر نمونه cdna سنتز شد. براي نشان دادن حضور یا عدم حضور BDNF-AS در پالسما از واکنش PCR استفاده شد. واکنشهاي PCR در حجم نهایی 25 میکرولیت با شرایط واسرشت- سازي اولیه در دماي 74 درجه سانتیگراد به مدت 1 دقیقه 15 چرخه شامل واسرشتسازي در دماي 74 درجه سانتیگراد به مدت 11 ثانیه اتصال پرایمر در دماي 61 درجه سانتیگراد به مدت 11 ثانیه گسترش در دماي 92 درجه سانتیگراد به مدت 35 ثانیه و گسترش نهایی در دماي 92 درجه سانتیگراد به مدت 5 دقیقه انجام گرفت. تکثیر با پرایمرهاي BDNF-AS 5- رفت TGTAGAGATGAGCCCAAGGA برگشت و TGGTTAGATGAATTTGTGCTGT -3 و پرایمرهاي ژن RNU6 رفت -5-3 CTCGCTTCGGCAGCACAT و برگشت 3-5- GGAACGCTTCACGAATTTGC به عنوان کنترل داخلی که توسط نرمافزار Gene Runner طراحی شدند انجام شد. پرایمرها توسط شرکت Metabion آلمان سنتز شدند. براي انجام واکنش PCR 5 میکرولیتر Master mix2x 1/1 میکرولیتر از هر پرایمر رفت و برگشت با غلظت 3 31pmol میکرولیتر cdna و 1/4 میکرولیتر آب دوبار تقطیر به هر ویال واکنش افزوده گردید. حجم نهایی واکنش 31 میکرولیتر می- باشد. واکنش در دستگاه PeQlab اجرا شد. در این آزمایشات حضور یا عدم حضور رونوشت هاي BDNF-AS در نمونه هاي پالسما متغیر مورد اندازه-

3 مجله دانشگاه علوم پزشکی بابل دوره بیستم/ شماره 4/ فروردین 3179 مقایسه سطح پالسمایی RNA طویل غیرکدکننده... رقیه عزیزي آقاعلی و همکاران 26 گیري و معیار سنجش آن مشاهده باند الکتروفورز حاصل از تکثیر در واکنش AS در پالسماي گروه بیمار و گروه سالم با هم متفاوت بوده و در بیماران باالتر Real Q میکرولیتر 5 real-time PCR بود. براي انجام واکنش PCR Plus Master 2x ساخت شرکت Ampliqon 1/2 میکرولیتر از هر پرایمر رفت و برگشت با غلظت 4 31pmol میکرولیتر cdna و 1/8 میکرولیتر آب دوبار تقطیر به هر ویال واکنش افزوده شد. حجم نهایی واکنش 31 میکرولیتر میباشد. واکنش در دستگاه step one plus شرکت ABI اجرا شد. براي هر نمونه دو تکرار در نظر گرفته شد و Ct میانگین براي هر نمونه محاسبه شد. از ژن 2 -Δct به عنوان کنترل داخلی استفاده شد. در نهایت از فرمول RNU6 براي برآورد سطح پالسمایی BDNF-AS در نمونه ها استفاده شد. از آزمون آماري Independent t-test با سطح معنی داري 1/15>p براي مقایسه سطوح پالسمایی در دو گروه استفاده شد. یافته ها بررسی حضور BDNF-AS در پالسما: انجام PCR با استفاده از پرایمرهاي اختصاصی BDNF-AS بر روي نمونههاي پالسما و الکتروفورز محصوالت PCR بر روي ژل آگارز حاکی از ایجاد باند اختصاصی 321 جفتبازي بود. این آزمایش بر روي 31 نمونه آلزایمري و 5 نمونه سالم انجام شد که در همه آنها تکثیر و باند اختصاصی 321 جفت بازي مشاهده شد. نتایج حاصل از تکثیر و الکتروفورز سه نمونه در شکل 3 نشان داده شده است. با توجه به مثبت بودن نتیجه در ادامه تحقیق کمیت رونوشت هاي BDNF-AS در نمونه هاي پالسما توسط real-time PCR مطالعه شد. است و این تفاوت به لحاظ آماري معنیدار میباشد ) p<1/113 ()نمودار 2(. بررسی تغییرات مقدارBDNF-AS بین زنان و مردان: میانگین مقدار سطح پالسمایی BDNF-AS در مردان برابر با 1/185±1/123 و در زنان برابر با 1/161±1/135 بود )نمودار 1(. اگرچه میانگین سطح پالسمایی BDNF-AS در مردان باالتر از زنان می باشد اما مقایسه این اعداد نشان داد که با بازه اطمینان %75 تفاوت مشاهده شده در بین زنان و مردان از لحاظ آماري معنیدار نیست. بنابراین سطح پالسمایی BDNF-AS ارتباطی با جنسیت افراد ندارد. بررسی ارتباط مقادیر BDNF-AS پالسمایی با سن: جهت بررسی ارتباط مقادیر BDNF-AS پالسمایی با سن نمونه هاي مورد آزمایش به دو گروه باالتر از 95 سال و پایین تر از 95 سال تقسیم شدند. میانگین مقادیر نسبی پالسمایی در نمونه هاي باالتر از 95 سال برابر با 1/185±1/12 و در گروه پایین- تر از 95 سال برابر با 1/157±1/132 بود. میانگین سطح پالسمایی رونوشتهاي BDNF-AS در گروه افراد باالتر از 95 سال بیشتر از گروه افراد پایین تر از 95 سال بود. اما این تفاوت معنی دار نمی باشد )نمودار 4(. نمودار 2. سطوح پالسمایی BDNF-AS در گروه بیمار و گروه کنترل )***( نشاندهنده سطح معنیداري در 1/113>p میباشد. شکل 3. ژل الکتروفورز نشان دهنده محصوالت PCR مربوط به تکثیر BDNF-AS در نمونههاي مختلف است. باندها به ترتیب Marker )اندازه ( نمونه هاي 2 3 و 1 نما( NTC )کنترل منفی بدون الگو( Plasma1,2,3 پالسمایی( و Tissue )کنترل مثبت PCR با استفاده از نمونه بافتی کنترل(. نمودار 1. مقایسه سطوح پالسمایی BDNF-AS بین دو جنس زن و مرد )1/15<p( بررسی مقدار BDNF-AS در پالسماي افراد سالم و بیمار: براي مشخص کردن مقدار BDNF-AS در نمونه هاي پالسماي گروه سالم و گروه آلزایمر از روش real-time PCR کمی استفاده شد. براي نرمالسازي از مقدار رونوشتهاي ژن RNU6 به عنوان کنترل داخلی که داراي بیان تقریبا ثابت در بافتهاي مختلف است استفاده شد. نتایج حاصل نشان داد که میانگین مقادیر نسبی پالسمایی در نمونه هاي آلزایمر برابر با 1/319±1/123 و در گروه افراد سالم برابر با 1/117±1/116 میباشد. مقایسه این اعداد نشان داد که مقدار BDNF- نمودار 4. مقایسه سطوح پالسمایی BDNF-AS بین دو گروه سنی بزرگتر از 95 سال و کوچکتر از 95 سال )1/15<p(

4 29 J Babol Univ Med Sci; 20(4); Apr 2018 Comparison between the Plasma Levels of Long Noncoding ; R. Azizi-Aghaali, et al بحث و نتیجه گیري مطالعه حاضر نشان داد که BDNF-AS در پالسماي افراد سالم و مبتال به آلزایمر وجود دارد و میتوان آن را با استفاده از روش PCR آشکارسازي کرد. همچنین مقایسه مقادیر پالسمایی رونوشتهاي BDNF-AS در گروه بیماران و افراد سالم نشان داد که سطح این RNAي بلند غیرکدکننده در پالسماي افراد مبتال به آلزایمر نسبت به افراد سالم دچار افزایش می شود. در مطالعات گذشته دخالت BDNF در عملکرد حافظه )36-37( و تغییر بیان آن در بیماري آلزایمر )21-22( گزارش و تایید شده است. همچنین تاثیر BDNF-AS بر BDNF و نقش آن در عملکرد BDNF اثبات شده است) 33 (. اما تا به حال گزارشی در مورد سطح پالسمایی BDNF-AS چه در افراد سالم و چه در بیماریهاي مختلف ارائه نشده است. با این وجود گزارشاتی در مورد سطح سرمی پروتئین BDNF و نه BDNF-AS در بیماران آلزایمر در دسترس می باشد. Borba و همکاران در تحقیق خود گزارش کردند که سطح سرمی پروتئین BDNF در بیماران آلزایمر کاهش می یابد )8(. گزارشات در مورد سطح سرمی پروتین BDNF متناقض میباشد با این وجود متاآنالیزي که در سال 2136 انجام گرفت حاکی از کاهش سطح سرمی آن در بیماران آلزایمري است )35(. با توجه به نقش مهاري BDNF-AS بر روي بیان ژن BDNF )33( میتوان گفت که نتایج حاصل از مطالعه ما که نشاندهنده سطح باالي BDNF-AS در پالسماي بیماران آلزایمري است با نتایج مطالعاتی که حاکی از سطح پایین BDNF در سرم بیماران مبتال به آلزایمر است همخوانی دارد. چراکه نشان داده شده است که مهار یا حذف BDNF-AS هم در شرایط in vitro و هم در in vivo میتواند سطوح BDNF را افزایش دهد )33( و طبیعتا افزایش BDNF-AS به کاهش BDNF میانجامد. باتوجه به باال بودن متوسط طول عمر زنان نسبت به مردان شیوع بیماري آلزایمر در بین خانمها بیشتر از آقایان میباشد.)31( BDNF-AS در مطالعه حاضر مقایسه مقادیر پالسمایی در آقایان و خانمها نشان داد که باالبودن سطح پالسمایی BDNF-AS در بیماران آلزایمري با جنسیت مرتبط نیست. این یافته نشان میدهد که سطح پالسمایی BDNF-AS مستقل از جنسیت بوده و تغییر در سطح آن ناشی از بیماري آلزایمر میباشد و لذا می تواند نشانگر مطلوبی براي بیماري آلزایمر باشد. گذشته از این بیماري آلزایمر دیرهنگام یک بیماري وابسته به سن است و با افزایش سن احتمال ابتالء به آلزایمر افزایش مییابد) 31 (. نتیجه حاصل از بررسی ارتباط سطح پالسمایی BDNF-AS با سن نشان داد که سطح پالسمایی BDNF-AS با سن ارتباط معنیداري ندارد و لذا تغییر مشاهده شده در مقادیر پالسمایی BDNF-AS بین افراد مبتال به آلزایمر و گروه سالم ناشی از سن نبوده و با بیماري آلزایمر مرتبط است. در مجموع یافتههاي مطالعه حاضر نشان داد که BDNF-AS در خون و پالسماي افراد مبتال به بیماري آلزایمر و افراد سالم وجود دارد و با PCR قابل تشخیص است. همچنین سطح پالسماییBDNF-AS در افراد مبتال به آلزایمر نسبت به افراد سالم به طرز معنیداري باالتر است و این باالبودن با جنسیت و سن افراد ارتباط ندارد. لذا BDNF-AS میتواند به عنوان نشانگر خونی/پالسمایی بیماري آلزایمر در نظر گرفته شود. تقدیر و تشکر بدینوسیله از ستاد توسعه علوم و فناوریهاي شناختی معاونت علمی ریاست جمهوري و همچنین از معاونت می گردد. تحقیقات و فناوري دانشگاه تبریز تشکر و قدردانی

5 مجله دانشگاه علوم پزشکی بابل دوره بیستم/ شماره 4/ فروردین 3179 مقایسه سطح پالسمایی RNA طویل غیرکدکننده... رقیه عزیزي آقاعلی و همکاران 28 Comparison between the Plasma Levels of Long Noncoding RNA BDNF- AS in Patients with Alzheimer's disease and Healthy Subjects R. Azizi-Aghaali (MSc) 1, M. Khalaj-Kondori (PhD) 1, N. Zeinalzadeh (PhD) 1, M. A. Hoseinpour Feizi (PhD) 1, M. Farhoudi (MD) 2, M. Talebi (MD) 2 1.Department of Biology, Faculty of Natural Sciences, Tabriz University, Tabriz, I.R.Iran 2. Neuroscience Research Center, Faculty of Medical Sciences Tabriz, Tabriz, I.R.Iran ABSTRACT J Babol Univ Med Sci; 20(4); Apr 2018; PP: 24-9 Received: Oct 30 th 2017, Revised: Jan 30 th 2018, Accepted: Feb 24 th BACKGROUND AND OBJECTIVE: Diagnosis of Alzheimer's disease usually occurs when serious damages have occurred in the brain and common treatments are ineffective in preventing it. One of the RNAs involved in Alzheimer's disease is a long noncoding RNA, called BDNF antisense (BDNF-AS). The aim of this study is to determine the presence and compare the BDNF-AS levels in plasma of Alzheimer's patients and healthy subjects, and to evaluate its potential as a plasma marker for Alzheimer's disease. METHODS: In this case-control study, 30 patients with late-stage Alzheimer's disease and 30 healthy subjects without neurological disease who matched the patients in terms of age were selected by a specialist according to the criteria for clinical diagnosis of Alzheimer's disease and their intravenous blood samples were collected. The plasma of the blood samples was isolated and total plasma RNA was extracted. After cdna synthesis, the presence of BDNF-AS in plasma was examined by PCR. Finally, the relative level of BDNF-AS transcripts in plasma samples of patients with Alzheimer's disease and healthy subjects was evaluated using Real Time PCR. FINDINGS: The results of this study showed that long noncoding RNA BDNF-AS was present in the plasma of patients and controls. Comparison of Real Time PCR data showed that BDNF-AS levels in the plasma of patients (0.107±0.021) showed significant increase compared to healthy subjects (0.039 ± 0.006). CONCLUSION: The results of this preliminary study indicate that the levels of long noncoding RNA BDNF-AS in plasma can be used as a blood/plasma marker for the diagnosis of Alzheimer's disease. KEY WORD: Alzheimer's disease, BDNF-AS, Biomarker. Please cite this article as follows: Aziz-Aghaali R, Khalaj-Kondori M, Zeinalzadeh N, Hoseinpour Feizi MA, Farhoudi M, Talebi M. Comparison between the Plasma Levels of Long Noncoding RNA BDNF-AS in Patients with Alzheimer's disease and Healthy Subjects. J Babol Univ Med Sci. 2018;20(4):24-9. Corresponding author: M. Khalaj-Kondori (PhD) Adress: Department of Animal Sciences, Faculty of Natural Sciences,Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz University, Tabriz, I.R.Iran. Tel: khalaj@tabrizu.ac.ir

6 27 J Babol Univ Med Sci; 20(4); Apr 2018 Comparison between the Plasma Levels of Long Noncoding ; R. Azizi-Aghaali, et al References 1. Korolev IO. Alzheimer s Disease: A clinical and basic science review. Med Student Res J. 2014;4: Rosenthal SL, Kamboh MI. Late-onset Alzheimer s disease genes and the potentially implicated pathways. Curr Genet Med Rep. 2014;2(2): Huang Y, Mucke L. Alzheimer mechanisms and therapeutic strategies. Cell. 2012;148(6): Masters CL, Cappai R, Barnham KJ, Villemagne VL. Molecular mechanisms for Alzheimer's disease: implications for neuroimaging and therapeutics. J Neuroch. 2006;97(6): Adlard PA, Tran BA, Finkelstein DI, Desmond PM, Johnston LA, Bush A, et al. A review of β-amyloid neuroimaging in Alzheimer's disease. Frontiers in neuroscience. 2014;8. 6.Mandelkow E-M, Mandelkow E. Tau in Alzheimer's disease. Trend Cell Biol. 1998;8(11): Fumagalli F, Racagni G, Riva M. The expanding role of BDNF: a therapeutic target for Alzheimer's disease?. Pharmacog J. 2006;6(1):8. 8.Borba EM, Duarte JA, Bristot G, Scotton E, Camozzato AL, Chaves MLF. Brain-Derived neurotrophic factor serumlevels and hippocampal volume in mildcognitive impairment and dementia due toalzheimer disease.demen Geriat Cog Dis Extra. 2016;6: Ventriglia M, Zanardini R, Bonomini C, Zanetti O, Volpe D, Pasqualetti P, et al. Serum brain-derived neurotrophic factor levels in different neurological diseases. Bio Med Res Int. 2013; Salta E, De Strooper B. Noncoding RNAs in neurodegeneration. Nat Rev Neurosci. 2017;18(10): Modarresi F, Faghihi MA, Lopez-Toledano MA, et al. Inhibition of natural antisense transcripts in vivo results in gene-specific transcriptionalupregulation. Nat Biotechnol. 2012;30(5): Pruunsild P, Kazantseva A, Aid T, Palm K, Timmusk T. Dissecting the human BDNF locus: bidirectional transcription, complex splicing, and multiple promoters. Genomics. 2007;90(3): Alzheimer's Association Alzheimer's disease facts and figures. Alzheimers Dement. 2016; 12: Available From: Song F,Poljak A, Smythe GA, Sachdev P. Plasma biomarkers for mild cognitive impairment and Alzheimer's disease. Brain Res Rev. 2009;61(2): Ng kst, ho cs, tam w, kua eh, ho rc-m. Serum brain-derived neurotrophic factors (bdnf) levels in patients with alzheimer's disease (ad), individuals with mild cognitive impairment (mci), and healthy controls: a systematic review, meta-analysis, and meta-regression. J Alzheimer's Associ. 2016;12(7):P Khalaj-Kondori M, Sadeghi F, Hosseinpourfeizi MA, Shaikhzadeh-Hesari F, Nakhlband A, Rahmati-Yamchi M. Boswellia serrata gum resin aqueous extract upregulates BDNF but not CREB expression in adult male rat hippocampus. Turk J Med Sci 2016;46(5): Moussaieff A, Gross M, Nesher E, Tikhonov T, Yadid G, Pinhasov A. Incensole acetate reduces depressive-like behavior and modulates hippocampal BDNF and CRF expression of submissive animals. J Psychopharmacol. 2012;26: Bekinschtein P, Cammarota M, Medina JH. BDNF and memory processing. Neuropharmacol. 2014;76: Cunha C, Brambilla R, Thomas KL. A simple role for BDNF in learning and memory?. FrontMol Neurosci. 2010;3: J Jiao SS, Shen LL, Zhu C, Bu XL, Liu YH, Liu CH, et al. Brain-derived neurotrophic factor protects against taurelated neurodegeneration of Alzheimer's disease. Transl Psychiatry. 2016;6(10): Song JH, Yu JT, Tan L. Brain-Derived neurotrophic factor in alzheimer's disease: risk, mechanisms, and therapy. Mol Neurobiol. 2015;52(3): HeikkiTanila. The role of BDNF in Alzheimer's disease. Neurobiol Dis. 2017;97: