TEMA. Clasificación de proteínas Criterios de clasificación Unión de ligandos en proteínas funcionalmente activas

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1 TEMA Clasificación de proteínas Criterios de clasificación Unión de ligandos en proteínas funcionalmente activas

2 Criterios de clasificación: COMPOSICIÓN HOMOPROTEÍNAS O PROTEÍNAS SIMPLES HETEROPROTEÍNAS O PROTEÍNAS CONJUGADAS HOLOPROTEÍNA = APOPROTEÍNA + GRUPO PROSTÉTICO Heteroproteína completa Fe Ribonucleasa bovina HOMOPROTEÍNA HETEROPROTEÍNA Ferritina

3 CLASE Sistemas nucleoproteícos GRUPO PROSTÉTICO RNA y DNA (en ciertos virus) TIPO DE UNIÓN DEL GRUPO Enlaces iónicos, puentes de hidrógeno, EJEMPLOS Ribosomas, RNasa P, virus del mosaico del tabaco Criterio de clasificación COMPOSICIÓN Lipoproteínas Fosfolípidos, colesterol, lípidos neutros Fuerzas de carácter hidrofóbico Lipoproteínas del plasma Glicoproteínas Azúcares (hexosamina, galactosa, manosa, ácido siálico) (Oglicosídico, N- glicosídico) γ-globulinas, receptores de membrana Mucoproteínas Largos y complejos polisacáridos Paredes bacterianas Fosfoproteínas Fosfato (fosfodiéster con OH de Ser, Thr y Tyr) Caseína Hemoproteínas Ferroprotoporfirina y no Hemoglobina, mioglobina, citocromo C Flavoproteínas Nucleotidos de flavina y no Succinato RIBOSOMA Metaloproteínas Iones metálicos (hierro, cobre, calcio, manganeso, magnesio, zinc ) Enlaces de coordinación Ferritina, citocromo oxidasa, calmodulina, alcohol Cromoproteínas Cromóforos que absorben en el visible Hay ejemplos de todo tipo Hemocianina HETEROPROTEÍNAS

4 CLASE Sistemas nucleoproteícos GRUPO PROSTÉTICO RNA y DNA (en ciertos virus) TIPO DE UNIÓN DEL GRUPO Enlaces iónicos, puentes de hidrógeno, EJEMPLOS Ribosomas, RNasa P, virus del mosaico del tabaco Criterio de clasificación COMPOSICIÓN Lipoproteínas Fosfolípidos, colesterol, lípidos neutros Fuerzas de carácter hidrofóbico Lipoproteínas del plasma Glicoproteínas Azúcares (hexosamina, galactosa, manosa, ácido siálico) (Oglicosídico, N- glicosídico) γ-globulinas, receptores de membrana Mucoproteínas Largos y complejos polisacáridos Paredes bacterianas Fosfoproteínas Fosfato (fosfodiéster con OH de Ser, Thr y Tyr) Caseína Hemoproteínas Ferroprotoporfirina y no Hemoglobina, mioglobina, citocromo C Flavoproteínas Nucleotidos de flavina y no Succinato LIPOPROTEÍNA Metaloproteínas Iones metálicos (hierro, cobre, calcio, manganeso, magnesio, zinc ) Enlaces de coordinación Ferritina, citocromo oxidasa, calmodulina, alcohol Cromoproteínas Cromóforos que absorben en el visible Hay ejemplos de todo tipo Hemocianina HETEROPROTEÍNAS

5 CLASE Sistemas nucleoproteícos GRUPO PROSTÉTICO RNA y DNA (en ciertos virus) TIPO DE UNIÓN DEL GRUPO Enlaces iónicos, puentes de hidrógeno, EJEMPLOS Ribosomas, RNasa P, virus del mosaico del tabaco Criterio de clasificación COMPOSICIÓN Lipoproteínas Fosfolípidos, colesterol, lípidos neutros Fuerzas de carácter hidrofóbico Lipoproteínas del plasma Glicoproteínas Azúcares (hexosamina, galactosa, manosa, ácido siálico) (Oglicosídico, N- glicosídico) γ-globulinas, receptores de membrana Mucoproteínas Largos y complejos polisacáridos Paredes bacterianas Fosfoproteínas Fosfato (fosfodiéster con OH de Ser, Thr y Tyr) Caseína Hemoproteínas Ferroprotoporfirina y no Hemoglobina, mioglobina, citocromo C Flavoproteínas Nucleotidos de flavina y no Succinato GLICOPROTEÍNA Metaloproteínas Iones metálicos (hierro, cobre, calcio, manganeso, magnesio, zinc ) Enlaces de coordinación Ferritina, citocromo oxidasa, calmodulina, alcohol Cromoproteínas Cromóforos que absorben en el visible Hay ejemplos de todo tipo Hemocianina HETEROPROTEÍNAS

6 CLASE Sistemas nucleoproteícos GRUPO PROSTÉTICO RNA y DNA (en ciertos virus) TIPO DE UNIÓN DEL GRUPO Enlaces iónicos, puentes de hidrógeno, EJEMPLOS Ribosomas, RNasa P, virus del mosaico del tabaco Criterio de clasificación COMPOSICIÓN Lipoproteínas Fosfolípidos, colesterol, lípidos neutros Fuerzas de carácter hidrofóbico Lipoproteínas del plasma Glicoproteínas Azúcares (hexosamina, galactosa, manosa, ácido siálico) (Oglicosídico, N- glicosídico) γ-globulinas, receptores de membrana Mucoproteínas Largos y complejos polisacáridos Paredes bacterianas Fosfoproteínas Fosfato (fosfodiéster con OH de Ser, Thr y Tyr) Caseína Hemoproteínas Ferroprotoporfirina y no Hemoglobina, mioglobina, citocromo C Flavoproteínas Metaloproteínas Nucleotidos de flavina Iones metálicos (hierro, cobre, calcio, manganeso, magnesio, zinc ) y no Enlaces de coordinación Succinato Ferritina, citocromo oxidasa, calmodulina, alcohol MUCOPROTEÍNA Cromoproteínas Cromóforos que absorben en el visible Hay ejemplos de todo tipo Hemocianina HETEROPROTEÍNAS

7 CLASE Sistemas nucleoproteícos GRUPO PROSTÉTICO RNA y DNA (en ciertos virus) TIPO DE UNIÓN DEL GRUPO Enlaces iónicos, puentes de hidrógeno, EJEMPLOS Ribosomas, RNasa P, virus del mosaico del tabaco Criterio de clasificación COMPOSICIÓN Lipoproteínas Fosfolípidos, colesterol, lípidos neutros Fuerzas de carácter hidrofóbico Lipoproteínas del plasma Glicoproteínas Azúcares (hexosamina, galactosa, manosa, ácido siálico) (Oglicosídico, N- glicosídico) γ-globulinas, receptores de membrana Mucoproteínas Largos y complejos polisacáridos Paredes bacterianas Fosfoproteínas Fosfato (fosfodiéster con OH de Ser, Thr y Tyr) Caseína Hemoproteínas Ferroprotoporfirina y no Hemoglobina, mioglobina, citocromo C Flavoproteínas Nucleotidos de flavina y no Succinato Metaloproteínas Iones metálicos (hierro, cobre, calcio, manganeso, magnesio, zinc ) Enlaces de coordinación Ferritina, citocromo oxidasa, calmodulina, alcohol FOSFOPROTEÍNA Cromoproteínas Cromóforos que absorben en el visible Hay ejemplos de todo tipo Hemocianina HETEROPROTEÍNAS

8 CLASE Sistemas nucleoproteícos GRUPO PROSTÉTICO RNA y DNA (en ciertos virus) TIPO DE UNIÓN DEL GRUPO Enlaces iónicos, puentes de hidrógeno, EJEMPLOS Ribosomas, RNasa P, virus del mosaico del tabaco Criterio de clasificación COMPOSICIÓN Lipoproteínas Fosfolípidos, colesterol, lípidos neutros Fuerzas de carácter hidrofóbico Lipoproteínas del plasma Glicoproteínas Azúcares (hexosamina, galactosa, manosa, ácido siálico) (Oglicosídico, N- glicosídico) γ-globulinas, receptores de membrana Mucoproteínas Largos y complejos polisacáridos Paredes bacterianas Fosfoproteínas Fosfato (fosfodiéster con OH de Ser, Thr y Tyr) Caseína Hemoproteínas Ferroprotoporfirina y no Hemoglobina, mioglobina, citocromo C Flavoproteínas Nucleotidos de flavina y no Succinato Metaloproteínas Iones metálicos (hierro, cobre, calcio, manganeso, magnesio, zinc ) Enlaces de coordinación Ferritina, citocromo oxidasa, calmodulina, alcohol HEMOPROTEÍNA Cromoproteínas Cromóforos que absorben en el visible Hay ejemplos de todo tipo Hemocianina HETEROPROTEÍNAS

9 CLASE GRUPO PROSTÉTICO TIPO DE UNIÓN DEL GRUPO EJEMPLOS Flavina Sistemas nucleoproteícos RNA y DNA (en ciertos virus) Enlaces iónicos, puentes de hidrógeno, Ribosomas, RNasa P, virus del mosaico del tabaco Lipoproteínas Fosfolípidos, colesterol, lípidos neutros Fuerzas de carácter hidrofóbico Lipoproteínas del plasma Glicoproteínas Azúcares (hexosamina, galactosa, manosa, ácido siálico) (Oglicosídico, N- glicosídico) γ-globulinas, receptores de membrana Mucoproteínas Largos y complejos polisacáridos Paredes bacterianas Fosfoproteínas Fosfato (fosfodiéster con OH de Ser, Thr y Tyr) Caseína Hemoproteínas Flavoproteínas Ferroprotoporfirina Nucleotidos de flavina y no y no Hemoglobina, mioglobina, citocromo C Succinato Metaloproteínas Iones metálicos (hierro, cobre, calcio, manganeso, magnesio, zinc ) Enlaces de coordinación Ferritina, citocromo oxidasa, calmodulina, alcohol Cromoproteínas Cromóforos que absorben en el visible Hay ejemplos de todo tipo Hemocianina Flavoproteína Metaloproteína Zn 2+ Cromoproteína Comóforo

10 Criterios de clasificación: CONFORMACIÓN PROTEÍNAS GLOBULARES PROTEÍNAS FIBROSAS PROTEÍNAS GLOBULARES

11 Criterios de clasificación: CONFORMACIÓN PROTEÍNAS FIBROSAS Triple hélice Colágeno Telopéptidos Estrías Fibrilla

12 Criterios de clasificación: LOCALIZACIÓN PROTEÍNAS SOLUBLES PROTEÍNAS DE MEMBRANA PROTEÍNAS SOLUBLES

13 PROTEÍNAS: Diversidad estructural y funcional Criterios de clasificación: LOCALIZACIÓN PROTEÍNAS DE MEMBRANA

14 Criterios de clasificación: FUNCIONALIDAD PROTEÍNAS PASIVAS Membrana plasmática PROTEÍNAS ACTIVAS Lámina basal Receptores de la superficie celular Fibras de colágeno Triple hélice N-terminal Proteínas estructurales Citoesqueleto Matriz extracelular Fibra de colágeno Molécula de colágeno Unión flexible Propiedades mecánicas: Flexibilidad Rigidez Resistencia Fibra de colágeno Tipo IX FIBROSAS: Colágenos Elastina Queratinas Colágeno en los cartílagos PROTEÍNAS PASIVAS ESTRUCTURALES

15 Criterios de clasificación: FUNCIONALIDAD Complejo de ferritina Micela de caseína PROTEÍNAS PASIVAS ALMACENADORAS

16 Criterios de clasificación: FUNCIONALIDAD PROTEÍNAS ACTIVAS: ENZIMAS E + S E:S E + P Lisozima Quimotripsina

17 Criterios de clasificación: FUNCIONALIDAD PROTEÍNAS ACTIVAS: REGULADORAS Hormona del crecimiento Receptor de membrana

18 Criterios de clasificación: FUNCIONALIDAD PROTEÍNAS ACTIVAS: TRANSPORTADORAS P + nl P:L n Bombas y canales Hemoglobina Lipoproteína

19 Criterios de clasificación: FUNCIONALIDAD PROTEÍNAS ACTIVAS: PROTECTORAS P + L P:L Inmunoglobulina Coágulo sanguíneo (los filamentos son de fibrina)

20 Criterios de clasificación: FUNCIONALIDAD PROTEÍNAS ACTIVAS: CONTRÁCTILES dineína Micrografía electrónica del corte transversal de un flagelo

21 Criterios de clasificación: FUNCIONALIDAD PROTEÍNAS ACTIVAS: TÓXICAS Toxina del antrax Actinoporina de anémona marina

22 Criterios de clasificación: FUNCIONALIDAD PROTEÍNAS ACTIVAS: EXÓTICAS Proteína anticongelante Proteína edulcorante (Monelina)

23 Proteínas activas o funcionales Papel en la dinámica celular FUNCIÓN BIOLÓGICA Reconocimiento y unión de ligandos (L) Características de la Interacción Proteína - Ligando Ligando: molécula pequeña Afinidad y especificidad Sitio de unión Centro de transporte Centro activo Interacción No Y Sustratos, antígenos, gases, lípidos, hormonas Curva de saturación 1.- Formación del complejo Proteína-Ligando P + L P-L (sitio de unión) K = [PL]/ [P] [L] Y = [Sitios ocupados] [Sitios totales] = [L] Fracción de saturación = K[L] (1+K[L]) / 2.- Evolución del complejo Distintas clases de proteínas