9 th Symposium on Oceanography & Fisheries, Proceedings, Volume ΙΙ

Σχετικά έγγραφα
Προκαταρκτικα αποτελεσματα της εκτιμησης της γενετικης ποικιλομορφιας σε πληθυσμους κεφαλοποδων (Sepia officinalis) της Μεσογειου και του Ατλαντικου


πληθυσμών του αρουραίου (Rattus rattus)σε συμπλέγματα νησιών και βραχονησίδων των ελληνικών θαλασσών

Τα Ιχθυαποθέματα της Μεσογείου στα Όρια της Κατάρρευσης

ΦΥΣΙΚΗ ΑΝΘΡΩΠΟΛΟΓΙΑ. Πρωτεύοντα ΙΙΙ Χρήση µοριακών δεδοµένων

ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΥΠΡΟΥ ΣΧΟΛΗ ΓΕΩΤΕΧΝΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ ΚΑΙ ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗΣ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΟΣ. Πτυχιακή εργασία

ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ ΔΙΑ ΒΙΟΥ ΜΑΘΗΣΗΣ ΑΕΙ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΠΙΚΑΙΡΟΠΟΙΗΣΗ ΓΝΩΣΕΩΝ ΑΠΟΦΟΙΤΩΝ ΑΕΙ (ΠΕΓΑ)

ΕΙΔΙΚΑ ΘΕΜΑΤΑ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ

Εμπορικα ειδη-στοχοι και κυρια απορριπτομενα ειδη στην Ελληνικη αλιεια με τρατα. ΕΛ.ΚΕ.Θ.Ε. Κρήτης, Τ.Θ. 2214, 71003, Ηράκλειο 3

Ινστιτούτο Θαλάσσιας Βιολογίας και Γενετικής, Ελληνικό Κέντρο Θαλάσσιων Ερευνών 2

8ο Πανελλήνιο Συμποσιο Ωκεανογραφίας & Αλιείας 949

Θεωρία - Εφαρμογές ΓΕΝΕΤΙΚΗ ΒΕΛΤΙΩΣΗ ΦΥΤΩΝ - ΜΟΡΙΑΚΟΙ ΔΕΙΚΤΕΣ 1

Πληθυσμιακή και Εξελικτική Γενετική

ΚΕΦΑΛΑΙΟ 7 ΥΠΟΔΙΑΙΡΕΣΗ ΠΛΗΘΥΣΜΩΝ

Χαρακτηρισμος του ενδιαιτηματος ωοτοκιας του γαυρου, Engraulis encrasicolus (Linnaeus, 1758), τον Ιουνιο 2003 στο ΒΑ Αιγαιο

Εργαλεία Μοριακής Γενετικής

ΓΕΝΕΤΙΚΗ πληθυσμιακη δομη του μελανουριου, Oblada melanura L., με χρηση μικροδορυφορικου DNA.

Department of Biological Sciences, Texas Tech University, MS 43131, Lubbock,Texas

Χαρακτηρισμος του ενδιαιτηματος ωοτοκιας του γαυρου, Engraulis encrasicolus (Linnaeus, 1758), τον Ιουνιο 2003 στο ΒΑ Αιγαιο

ΓΕΝΕΤΙΚΗ ΒΕΛΤΙΩΣΗ ΦΥΤΩΝ

Μεταπτυχιακή Διατριβή

Μοριακή Ανάλυση Φυτών

Εκτιμηση της βιομαζας του αποθεματος του γαυρου στο Αιγαιο με την ακουστικη μεθοδο (Ιουνιοσ 2003 και Ιουνιοσ 2004)

9 th Symposium on Oceanography & Fisheries, Proceedings, Volume ΙΙ

ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΑ ΘΕΩΡΗΤΙΚΟ ΥΠΟΒΑΘΡΟ. Πρόλογος. Κεφάλαιο 1: Γενετική μηχανική - Βιοτεχνολογία. Κεφάλαιο 2: Δομή και λειτουργία των νουκλεїνικών οξέων

ΕΙΔΙΚΑ ΘΕΜΑΤΑ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ

Πληθυσμιακή και Εξελικτική Γενετική

Βιοτεχνολογία Φυτών. Μοριακοί Δείκτες (Εισαγωγή στη Μοριακή Βιολογία)

9 th Symposium on Oceanography & Fisheries, Proceedings, Volume ΙΙ

ΚΕΦΑΛΑΙΟ 1. Η ΠΡΟΕΛΕΥΣΗ ΚΑΙ Η ΕΠΙΔΡΑΣΗ ΤΗΣ ΕΞΕΛΙΚΤΙΚΗΣ ΣΚΕΨΗΣ

DIURNAL Vertical migration of european ANCHOVY

Η επιδραση του κλιματος στις εκφορτωσεις της φρισσας (Sardinella aurita Valenciennes, 1847)

merluccius) ΣΤΟΝ ΠΑΓΑΣΗΤΙΚΟ ΚΟΛΠΟ

2 Δεκεμβρίου Απολογισμός Δράσεων της υποδομής Greek Argo για το 2015

Σχεση αναμεσα στο μηκος εντερου, τη διατροφη και το τροφικο επιπεδο για μερικα ειδη ψαριων στο Β-ΒΔ Αιγαιο

POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR) ΑΛΥΣΙΔΩΤΗ ΑΝΤΙΔΡΑΣΗ ΤΗΣ ΠΟΛΥΜΕΡΑΣΗΣ

ΣτοιχεΙα βιολογιας και οικολογιας δυο βαθυβιων ψαριων του Ν.Α. ΙονΙου

ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΥΠΡΟΥ ΣΧΟΛΗ ΓΕΩΤΕΧΝΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ ΚΑΙ ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗΣ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΟΣ. Πτυχιακή εργασία

Πληθυσμιακή και Εξελικτική Γενετική

Γιατί είναι σημαντική η Βιοποικιλότητα;

Η ιστορική πατρότητα του όρου «Μεσόγειος θάλασσα» ανήκει στους Λατίνους και μάλιστα περί τα μέσα του 3ου αιώνα που πρώτος ο Σολίνος τη ονομάζει

ΓΕΝΕΤΙΚΑ ΤΡΟΠΟΠΟΙΗΜΕΝΑ ΦΥΤΑ. (Μοριακή Βελτίωση)

σπανίων φυλών των ζώων

Συστηματική και φυλογεωγραφία του συμπλέγματος ειδών Ablepharus kitaibelii στη περιοχή της ανατολικής Μεσογείου

Πληθυσμιακή και Εξελικτική Γενετική

Πληθυσμιακή Γενετική

9 th Symposium on Oceanography & Fisheries, Proceedings, Volume ΙΙ

ΚΕΦΑΛΑΙΟ 8 ΑΝΙΣΟΡΡΟΠΙΑ ΣΥΝΔΕΣΗΣ

Σίνος Γκιώκας Πανεπιστήμιο Πατρών Τμήμα Βιολογίας Πάτρα 2015 ΒΙΟΛΟΓΙΑ ΖΩΩΝ Ι - ΕΙΣΑΓΩΓΗ - ΒΑΣΙΚΕΣ ΑΡΧΕΣ - Σίνος Γκιώκας - Πανεπιστήμιο Πατρών

Δασική Γενετική Εισαγωγή: Βασικές έννοιες

ΣΥγκριση βασικων αλιευτικων στοιχειων απο διαφορες επισημες πηγες πληροφορησης

Περιεχόμενα. 1 Η ιστορία της εξελικτικής βιολογίας: Εξέλιξη και Γενετική 2 Η Προέλευση της Μοριακής Βιολογίας 3 Αποδείξεις για την εξέλιξη 89

TreeTOPS. ένα εισαγωγικό παιχνίδι για τα φυλογενετικά δέντρα. Teacher s Guide. ELLS European Learning Laboratory for the Life Sciences

ΜΕΛΕΤΗ ΤΩΝ ΣΥΝΤΗΡΗΜΕΝΩΝ ΑΛΛΗΛΟΥΧΙΩΝ ΠΟΥ ΔΕΝ ΚΩΔΙΚΟΠΟΙΟΥΝ ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΣΤΑ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΑ ΤΩΝ ΨΑΡΙΩΝ

ΚΕΦΑΛΑΙΟ 2 ΙΣΟΡΡΟΠΙΑ HARDY-WEINBERG

ΣΤΟΙΧΕΙΑ ΠΟΙΚΙΛΟΤΗΤΑΣ ΚΑΙ ΚΑΤΑ ΜΗΚΟΣ ΣΥΝΘΕΣΕΙΣ 4 ΕΙΔΩΝ ΨΑΡΙΩΝ ΑΝΑ ΑΛΙΕΥΤΙΚΟ ΕΡΓΑΛΕΙΟ ΣΤΟΝ ΚΕΡΚΥΡΑΪΚΟ

Βαθμός Ασφαλείας Πάτρα Αριθμ. Πρωτ Τμήμα Ερευνητικών Προγραμμάτων Μονάδα Διενέργειας Διαγωνισμών &Διαχείρισης Συμβάσεων

ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΚΑΙ ΕΦΑΡΜΟΓΗ ΜΙΚΡΟΔΟΡΥΦΟΡΙΚΩΝ ΔΕΙΚΤΩΝ ΣΤΗ ΦΥΛΟΓΕΩΓΡΑΦΙΑ ΤΟΥ ΜΠΑΡΜΠΟΥΝΙΟΥ (Mullus surmuletus)

Πληθυσμιακή και Εξελικτική Γενετική

ΑΔΑ: ΒΙΞ446914Γ-ΧΡΖ. Βαθμός Ασφαλείας. Τμήμα Ερευνητικών Προγραμμάτων Μονάδα Διενέργειας Διαγωνισμών &Διαχείρισης Συμβάσεων. Μεγ.

thessalonicae (anthozoa, Octocorallia, Pennatulacea)

Πανελλήνιο Συµπόσιο Ωκεανογραφίας & Αλιείας

Η ανάλυση του DNA στον έλεγχο της πατρότητας και στην εξιχνίαση του εγκλήματος

Πληθυσμιακή και Εξελικτική Γενετική

ΑΝΑΖΗΤΗΣΗ ΣΥΣΧΕΤΙΣΗΣ ΜΕΤΑΞΥ ΚΛΙΜΑΤΙΚΩΝ ΔΕΙΚΤΩΝ ΜΑΚΡΑΣ ΚΛΙΜΑΚΑΣ ΚΑΙ ΜΕΤΕΩΡΟΛΟΓΙΚΗΣ ΞΗΡΑΣΙΑΣ ΣΤΗΝ ΕΛΛΑΔΑ

Σίνος Γκιώκας. Πανεπιστήμιο Πατρών Τμήμα Βιολογίας. Πάτρα ΒΙΟΛΟΓΙΑ ΖΩΩΝ Ι - Η ΒΙΟΛΟΓΙΚΗ ΕΞΕΛΙΞΗ - Σίνος Γκιώκας - Πανεπιστήμιο Πατρών

ΠΡΟΣΦΑΤΕΣ ΤΑΣΕΙΣ ΣΤΗ ΜΕΛΕΤΗ ΤΗΣ ΠΑΝΙΔΑΣ ΤΗΣ ΕΛΛΑΔΑΣ

Πολυμορφισμοί Ανρώπινου DNA. Νικόλαος Δάβανος, MSc PhD

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

ΖΩΟΤΕΧΝΙΑ Διδάσκουσα: Κουτσούλη Παναγιώτα Τμήμα: Επιστήμης Ζωικής Παραγωγής & Υδατοκαλλιεργειών

Σεμινάριο Βιβλιογραφίας στους προπτυχιακούς φοιτητές

Ορισμός επιδημιολογίας

ΜΙΑ ΜΕΛΕΤΗ ΠΕΡΙΠΤΩΣΗΣ: ΣΤΑΤΙΣΤΙΚΗ ΕΠΕΞΕΡΓΑΣΙΑ ΤΩΝ ΒΑΘΜΟΛΟΓΙΩΝ ΤΩΝ ΜΑΘΗΤΩΝ ΕΝΟΣ ΛΥΚΕΙΟΥ ΑΠΟ ΤΟ 2000 ΩΣ ΤΟ 2013.

9 th Symposium on Oceanography & Fisheries, Proceedings, Volume ΙΙ

Εργαστήριο Δασικής Γενετικής / ΔΠΘ Ορεστιάδα. Ποσοτική Γενετική ΒΕΛΤΙΩΣΗ & ΠΡΟΣΤΑΣΙΑ ΔΑΣΟΓΕΝΕΤΙΚΩΝ ΠΟΡΩΝ. Αριστοτέλης Χ.

Μοριακή ταυτοποίηση επιλεγμένων κλώνων φυτών ρίγανης για την αντιμετώπιση παθογόνων ψαριών και ζωοπλαγκτόν.

Η πορεία της βιοποικιλότητας στο χρόνο

Επισκεφτήκαμε το ινστιτούτο νευρολογίας και γενετικής όπου μας μίλησε ο κύριος Βάσος Νεοκλέους και η κ. Αλέξια Φαίδωνος για τη μηχανή Polymerase

ΑΞΙΟΛΟΓΗΣΗ ΑΦΗΓΗΜΑΤΙΚΩΝ ΙΚΑΝΟΤΗΤΩΝ ΜΕΣΩ ΧΟΡΗΓΗΣΗΣ ΤΟΥ ΕΡΓΑΛΕΙΟΥ ΜΑΙΝ ΣΕ ΤΥΠΙΚΩΣ ΑΝΑΠΤΥΣΣΟΜΕΝΑ ΠΑΙΔΙΑ ΣΤΗΝ ΚΥΠΡΟ

Διάκριση ποικιλιών ελαιολάδου μέσω μεθόδου γονοτύπησης βασιζόμενης σε φθορίζοντα μικροσφαιρίδια

ΒΙΟΛΟΓΙΑ ΚΑΤΕΥΘΥΝΣΗ ΤΕΤΑΡΤΗ 30 ΜΑΙΟΥ 2012 ΕΝ ΕΙΚΤΙΚΕΣ ΑΠΑΝΤΗΣΕΙΣ

Παραδοτέα Π.Ε Ιδρυματικό Υπεύθυνος Καθηγητής κ. Χρυσάφη Χαρτώνα. Επιστημονικός Υπεύθυνος Καθηγητής κ. Ηλίας Αναστασόπουλος

ΑΠΑΝΤΗΣΗ ΤΗΣ ΣΥΝΔΥΑΣΤΙΚΗΣ ΑΣΚΗΣΗΣ

Η Αφρική είναι η τρίτη σε μέγεθος ήπειρος του πλανήτη μας, μετά την Ασία και την Αμερική. Η έκτασή της είναι, χωρίς τα νησιά, 29,2 εκατομμύρια τετρ. χ

Ινστιτούτο Θαλάσσιων Βιολογικών Πόρων, Ελληνικό Κέντρο Θαλάσσιων Ερευνών, 2

ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΥΠΡΟΥ ΣΧΟΛΗ ΓΕΩΤΕΧΝΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ ΚΑΙ ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗΣ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΟΣ. Πτυχιακή εργασία

ΒΙΟΛΟΓΙΑ ΚΑΤΕΥΘΥΝΣΗΣ Γ ΛΥΚΕΙΟΥ ΘΕΜΑ 1 ο Α. Να βάλετε σε κύκλο το γράμμα που αντιστοιχεί στη σωστή απάντηση. (Μονάδες 25)

Hλεκτροφόρηση Μοριακοί Δείκτες στα Φυτά

ΙΝΣΤΙΤΟΥΤΟ ΘΑΛΑΣΣΙΑΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΚΑΙ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ

ΑΠΑΝΤΗΣΕΙΣ. ΘΕΜΑ 1ο 1. β 2. β 3. α 4. α 5. β

Ταξινόµιση οργανισµών

ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΥΠΡΟΥ ΣΧΟΛΗ ΓΕΩΤΕΧΝΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ ΚΑΙ ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗΣ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΟΣ. Πτυχιακή εργασία

Εφαρμογές τεχνολογιών Μοριακής Βιολογίας στην Γενετική

Περιεχόμενο Μαθημάτων

Πληροφοριακά Συστήματα Διοίκησης

ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΥΠΡΟΥ ΣΧΟΛΗ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ ΥΓΕΙΑΣ. Πτυχιακή εργασία Η ΚΑΤΑΘΛΙΨΗ ΣΕ ΕΦΗΒΟΥΣ ΜΕ ΣΑΚΧΑΡΩΔΗ ΔΙΑΒΗΤΗ ΤΥΠΟΥ 1

þÿ ½ ÁÉÀ ºµ½ÄÁ¹º ÀÁ à ³³¹Ã Ä þÿ Á³±½Éù±º  ±»»±³  ¼ ÃÉ þÿà» Á Æ Á¹±º Í ÃÅÃÄ ¼±Ä Â.

ΠΑΝΕΛΛΗΝΙΕΣ ΕΞΕΤΑΣΕΙΣ Γ' ΤΑΞΗΣ ΗΜΕΡΗΣΙΟΥ ΓΕΝΙΚΟΥ ΛΥΚΕΙΟΥ ΤΡΙΤΗ 18 ΙΟΥΝΙΟΥ 2019 ΕΞΕΤΑΖΟΜΕΝΟ ΜΑΘΗΜΑ: ΒΙΟΛΟΓΙΑ ΘΕΤΙΚΩΝ ΣΠΟΥΔΩΝ

Γενετική πληθυσμών. Εισαγωγή στη Δασική Γενετική. Χειμερινό εξάμηνο

ΠΑΝΕΛΛΗΝΙΕΣ ΕΞΕΤΑΣΕΙΣ ΗΜΕΡΗΣΙΟΥ ΓΕΝΙΚΟΥ ΛΥΚΕΙΟΥ ΚΑΙ ΤΕΤΑΡΤΗ 30 ΜΑΪΟΥ 2012 ΒΙΟΛΟΓΙΑ ΘΕΤΙΚΗΣ ΚΑΤΕΥΘΥΝΣΗΣ ΑΠΑΝΤΗΣΕΙΣ

Transcript:

9 th Symposium on Oceanography & Fisheries, 2009 - Proceedings, Volume ΙΙ ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΜΙΚΡΟΔΟΡΥΦΟΡΙΚΩΝ ΓΕΝΕΤΙΚΩΝ ΔΕΙΚΤΩΝ ΣΤΟΝ ΕΥΡΩΠΑΪΚΟ ΓΑΥΡΟ (Engraulis encrasicolus) ΚΑΙ ΜΕΛΕΤΗ ΤΗΣ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ ΔΟΜΗΣ ΤΩΝ ΠΛΗΘΥΣΜΩΝ ΤΟΥ Πακάκη Β., Μαγουλάς Α., Κασαπίδης Π. Ινστιτούτο Θαλάσσιας Βιολογίας και Γενετικής, Ελληνικό Κέντρο Θαλάσσιων Ερευνών, vpakakis@edu.biology.uoc.gr, magoulas@her.hcmr.gr, kasapidi@her.hcmr.gr Περίληψη Ο ευρωπαϊκός γαύρος (Engraulis encrasicolus) αποτελεί σημαντική πλουτοπαραγωγική πηγή για την αλιεία της Μεσογείου και του ΒΑ Ατλαντικού. Η μελέτη της γενετικής δομής των πληθυσμών του μπορεί να συμβάλει καθοριστικά στη διάκριση και ορθή διαχείριση των ιχθυοαποθεμάτων του. Στην παρούσα μελέτη αναπτύχθηκαν 12 μικροδορυφορικοί γενετικοί δείκτες, οι οποίοι χρησιμοποιήθηκαν για τη μελέτη της γενετικής δομής 11 πληθυσμιακών δειγμάτων γαύρου που καλύπτουν το μεγαλύτερο μέρος της γεωγραφική του εξάπλωσης. Η στατιστική ανάλυση έδειξε ότι όλα σχεδόν τα πληθυσμιακά δείγματα του γαύρου, που προέρχονται από διαφορετικές θαλάσσιες λεκάνες, διαφέρουν μεταξύ τους. Τα αποτελέσματα αυτά επιβεβαιώνουν την έντονη γενετική διαφοροποίηση του γαύρου που είχε αποκαλυφθεί κυρίως με βάση το μιτοχονδριακό DNA και προσφέρουν νέα στοιχεία για τη διαλεύκανση της πολύπλοκης εξελικτικής του ιστορίας. Λέξεις κλειδιά: μικροδορυφορικό DNA, ιχθυοαπόθεμα, εμπλουτισμένη γενωμική βιβλιοθήκη. Characterization of microsatellite dna markers in the european anchovy (Engraulis encrasicolus) and study of the its genetic population structure Pakaki V., Magoulas A., Kasapidis P. Institute of Marine Biology and Genetics, Hellenic Centre for Marine Research, vpakakis@edu.biology.uoc.gr, magoulas@her.hcmr.gr, kasapidi@her.hcmr.gr Abstract European anchovy (Engraulis encrasicolus) is an important fishery in the Mediterranean and NE Atlantic. The elucidation of its genetic population structure can greatly assist the delineation and management of its stocks. In the current study 12 microsatellite DNA markers were developed and used to study the genetic structure of 11 samples that cover the larger part of the species distribution. Statistical analyses showed that almost all samples, which represent different oceanic basins, differ from each other. These results confirm the strong genetic structure of anchovy revealed by other genetic markers (mainly by mitochondrial DNA) and offer new clues for the elucidation of the complex evolutionary history of the species. Keywords: microsatellite DNA, fish stock, enriched genomic library. 1. Εισαγωγή Ο ευρωπαϊκός γαύρος (E. encrasicolus) εξαπλώνεται στη Μεσόγειο, τη Μαύρη Θάλασσα και τον Ανατολικό Ατλαντικό από τις ακτές της Σκανδιναβίας μέχρι τις ακτές της Δυτικής Αφρικής και αποτελεί σημαντική πλουτοπαραγωγική πηγή για την ελληνική και την παγκόσμια αλιεία. Είναι μικρό πελαγικό ψάρι, σχηματίζει κοπάδια, είναι μεταναστευτικό και πολλαπλώς ωοτόκο είδος με πελαγικά αυγά και λάρβες (Whitehead, 1984). Οι γενετικές μέθοδοι μπορεί να είναι εξαιρετικά χρήσιμα εργαλεία στην αλιευτική διαχείριση, επιτρέποντας την αναγνώριση γενετικά διαφοροποιημένων πληθυσμών, που αναφέρονται και ως γενετικά αποθέματα (genetic stocks) (Ovenden, 1990), δηλαδή μονάδες που είναι λίγο πολύ αναπαραγωγικά απομονωμένες η μία από την άλλη και θα αντιδράσουν ανεξάρτητα σε περίπτωση -800-

9 ο Πανελλήνιο Συμπόσιο Ωκεανογραφίας & Αλιείας 2009 - Πρακτικά, Τόμος ΙΙ υπερεκμετάλλευσης. Η πρώτη κατηγορία γενετικών δεικτών που χρησιμοποιήθηκαν εκτεταμένα σε τέτοιου είδους μελέτες ήταν τα αλλοένζυμα, που όμως παρουσιάζουν μια σειρά από μειονεκτήματα όπως ο χαμηλός πολυμορφισμός, η αδυναμία διάκρισης διαφορετικών αλληλομόρφων με παρόμοια ηλεκτροφορητική κινητικότητα, καθώς και το ότι απαιτούνται σχετικά μεγάλες ποσότητες φρέσκου ιστού (Ashburner, 1991). Η επινόηση τεχνικών ανάλυσης του DNA όπως η αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (PCR) επέτρεψε τη ανάπτυξη γενετικών δεικτών που αποκαλύπτουν τον πολυμορφισμό στο επίπεδο του γενετικού υλικού. Το ζωικό μιτοχονδριακό DNA είναι ένας δείκτης που χρησιμοποιείται ευρέως σε πληθυσμιακές μελέτες, όμως λόγω της μητρικής του κληρονομικότητας, ουσιαστικά δείχνει την εξελικτική ιστορία των μητρικών γενεαλογικών γραμμών. Ο πλέον χρησιμοποιούμενος γενετικός δείκτης, σήμερα, σε τέτοιου είδους μελέτες, είναι το μικροδορυφορικό DNA, που είναι μικρές, επαναλαμβανόμενες, απλές αλληλουχίες μήκους 2-6 βάσεων, όπως για παράδειγμα (CA/GT) n. Oι μικροδορυφορικοί τόποι αποτελούν πολύ χρήσιμους γενετικούς δείκτες επειδή είναι άφθονοι, ιδιαίτερα πολυμορφικοί, η ανάλυσή τους γίνεται με τη χρήση της τεχνικής PCR και μέσω αυτόματων γενετικών αναλυτών, δεν υπόκεινται συνήθως στη δράση της φυσικής επιλογής (εξελικτικά ουδέτεροι) και μπορούν να ανιχνεύσουν γενετικές διαφορές που έχουν συσσωρευθεί σε μικρή χρονική κλίμακα. Αρκετές γενετικές μελέτες έχουν διεξαχθεί στον ευρωπαϊκό γαύρο έως σήμερα, κυρίως με τη χρήση αλλοενζύμων και μιτοχονδριακού DNA. Με τη χρήση των αλλοένζυμων οι Spanakis et al. (1989) διαπίστωσαν σημαντική γενετική διαφοροποίηση του γαύρου μεταξύ πληθυσμών του Αιγαίου και του Ιονίου ενώ οι Bembo et al. (1996a; b) βρήκαν μεγάλη διαφοροποίηση μεταξύ δειγμάτων του Βισκαϊκού και της Μεσογείου. Οι Magoulas et al. (1996), μελετώντας το μιτοχονδριακό DNA (RFLPs) του γαύρου, διαπίστωσαν την ύπαρξη δύο φυλογενετικών κλάδων, A και Β, που βρίσκονται σε διαφορετικές συχνότητες στους πληθυσμούς διαφορετικών θαλάσσιων λεκανών. Ο κλάδος A είναι ο μόνος που εμφανίζεται στη Μαύρη Θάλασσα, ενώ η συχνότητά του μειώνεται στο 85% στο Β. Αιγαίο και κάτω από 44% στην υπόλοιπη Μεσόγειο και στο Βισκαϊκό Κόλπο. Σε μια επόμενη μελέτη τους, οι Magoulas et al. (2006), βρήκαν ότι στον Ατλαντικό, από τις Αφρικανικές ακτές μέχρι την Πορτογαλία καθώς και στη θάλασσα του Αλποράν, επικρατεί ο κλάδος Α σε ποσοστό >80%. Με βάση αυτά τα αποτελέσματα διέκριναν τέσσερις γενετικά διαφοροποιημένες πληθυσμιακές ομάδες: Μαύρη Θάλασσα, Αιγαίο, Κεντρική Μεσόγειο και Ατλαντικό και υποστήριξαν ότι ο Ατλαντικός και η Μεσόγειος ήταν οι περιοχές προέλευσης των κλάδων Α και Β, αντίστοιχα. Αντιθέτως, ο Grant (2005) υποστηρίζει ότι οι προγονικοί πληθυσμοί και των δύο κλάδων απομονώθηκαν στον Ατλαντικό απ όπου και εποίκησαν τη Μεσόγειο σε διαφορετικές χρονικές περιόδους. Σκοπός της παρούσας εργασίας ήταν η ανάπτυξη μικροδορυφορικών δεικτών στο γαύρο και η χρήση τους για τη μελέτη της γενετικής δομής του είδους στη Μεσόγειο και τον Ατλαντικό. 2. Υλικά και Μέθοδοι Η ανάπτυξη των μικροδορυφορικών δεικτών έγινε με τη χρήση ενός τροποποιημένου πρωτόκολλου κατασκευής εμπλουτισμένης για μικροδορυφορικό DNA, γενωμικής βιβλιοθήκης (Tsigenopoulos et al., 2003). Από αυτή τη γενωμική βιβλιοθήκη έγινε επιλογή των κλώνων που περιείχαν μικροδορυφορική αλληλουχία, εξαγωγή του πλασμιδιακού DNA και αλληλούχησή του. Από τις αλληλουχίες που προέκυψαν επιλέχθηκαν βάσει κριτηρίων οι καλύτερες και ακολούθησε σχεδιασμός εκκινητών, βελτιστοποίησή των συνθηκών της PCR αρχικά σε πήκτωμα αγαρόζης, κατόπιν παραγγελία σημασμένων με φθορίζουσες χρωστικές εκκινητών και τελική βελτιστοποίηση και έλεγχος των μικροδορυφορικών δεικτών για πολυμορφισμό με ηλεκτροφόρηση σε αυτόματο γενετικό αναλυτή ΑΒΙ3700. Οι γενετικοί δείκτες που επιλέχθηκαν τελικά, χρησιμοποιήθηκαν για τη γονοτύπηση 891 ενή- -801-

9 th Symposium on Oceanography & Fisheries, 2009 - Proceedings, Volume ΙΙ λικων άτομων γαύρου (E. encrasicolus) από 11 διαφορετικές περιοχές (Εικ.1). Η στατιστική επεξεργασία των αποτελεσμάτων περιελάμβανε: τον έλεγχο για μηδενικά αλληλόμορφα (null alleles) (πρόγραμμα MicroChecker), τον έλεγχο για ισορροπία κατά Hardy-Weinberg, για ανισορροπία σύνδεσης των γενετικών τόπων και για γενετική διαφοροποίηση μεταξύ των πληθυσμιακών δειγμάτων (πρόγραμμα Genepop), την εκτίμηση των γενετικών αποστάσεων με βάση τις τιμές F ST μεταξύ ζευγών δειγμάτων (πρόγραμμα ARLEQUIN), την κατασκευή δενδρογράμματος με βάση τις τιμές F ST (πρόγραμμα MEGA), την ανάλυση της ιεραρχικής δομής των πληθυσμών - AMOVA (πρόγραμμα SAMOVA) και τον έλεγχο γενετικής απομόνωσης λόγω απόστασης (πρόγραμμα IBDWS). Εικ. 1: Γεωγραφική προέλευση των δειγμάτων γαύρου: BAL: Βαλτική, GBIS: Βισκαϊκός, SPORT: Ν. Πορτογαλία, CA: Κανάρια Νησιά, MAL: Μάλαγα, ALG: Αλγερία, LION: Κόλπος των Λεόντων, ADR: Αδριατική, PAT: Πάτρα, KAV: Καβάλα, BS: Μαύρη Θάλασσα. 3. Αποτελέσματα Από τη γενωμική βιβλιοθήκη αναπτύχθηκαν τελικά 12 πολυμορφικοί μικροδορυφορικοί τόποι που χρησιμοποιήθηκαν σε τέσσερις multiplex αντιδράσεις PCR για τη γενετική ανάλυση των 11 πληθυσμιακών δειγμάτων γαύρου. Η ανάλυση των δειγμάτων έδειξε ότι οι περισσότεροι μικροδορυφορικοί τόποι βρίσκονται σε ισορροπία Hardy-Weinberg στους περισσότερους πληθυσμούς, εκτός από δύο τόπους (Ee5_245 και Ee5_376), που εμφανίζουν μεγάλο έλλειμμα ετεροζυγωτίας σε όλους τους υπό μελέτη πληθυσμούς, πιθανώς λόγω ύπαρξης μηδενικών αλληλομόρφων (Πίν. 1). Ο τόπος Ee2_407 εμφανίζει το μεγαλύτερο αριθμό αλληλομόρφων (Ν Α =60) ενώ ο τόπος Ee2_165b το μικρότερο (Ν Α =12). Ο συντελεστής πληθυσμιακής υποδιαίρεσης F SΤ κυμαίνεται από 0.0012 για τον τόπο Ee2_165b έως 0.0447 για τον τόπο Ee5_376, με μέση τιμή για όλους τους τόπους ίση με 0.0156. Ο έλεγχος για γενετική διαφοροποίηση (Fisher s exact tests) έδειξε ότι όλα σχεδόν τα ζεύγη των πληθυσμών εμφανίζουν στατιστικά σημαντικές διαφορές στην κατανομή των αλληλικών τους συχνοτήτων, εκτός του Κόλπου των Λεόντων με την Πάτρα και το Βισκαϊκό, καθώς και της Μάλαγας με τη Ν. Πορτογαλία. Παρόμοια εικόνα εμφανίζουν και οι τιμές F ST μεταξύ των ζευγών δειγμάτων, όπου επιπλέον εμφανίζονται γενετικά μη διαφοροποιημένοι οι πληθυσμοί Βισκαϊκού Πάτρας, Αδριατικής - Κόλπου των Λεόντων, Αλγερίας Μάλαγας, Αλγερίας - Ν. Πορτογαλίας και Αδριατικής - Μαύρης Θάλασσας. Η μέγιστη τιμή F ST (0.051) εμφανίζεται μεταξύ των πληθυσμών της Βαλτικής και των Κανάριων Νήσων. -802-

9 ο Πανελλήνιο Συμπόσιο Ωκεανογραφίας & Αλιείας 2009 - Πρακτικά, Τόμος ΙΙ Πίνακας 1: Χαρακτηρισμός των 12 πολυμορφικών μικροδορυφορικών τόπων του ευρωπαϊκού γαύρου E. encrasicolus. Συντελεστές εγκαθίδρυσης (F IS ), (F ST ) και (F IT ) ανά γενετικό τόπο, N a : αριθμός αλληλομόρφων και (Hobs) μέση παρατηρούμενη και (Hexp) μέση αναμενόμενη ετεροζυγωτία. Μικροδ. Τόπος F IS F ST F IT N Α Hobs Hexp Ee2_091 0.0665 0.0050 0.0711 24 0.80514 0.86585 Ee2_091b 0.0255 0.0066 0.0319 18 0.78121 0.79950 Ee2_135 0.0291 0.0024 0.0314 15 0.83630 0.85689 Ee2_165b 0.0170 0.0012 0.0182 12 0.58955 0.59660 Ee2_407 0.0323 0.0171 0.0489 60 0.82386 0.85095 Ee2_452 0.0430 0.0098 0.0524 35 0.88219 0.92030 Ee2_477 0.1637 0.0419 0.1987 45 0.74106 0.88582 Ee2_483b 0.1339 0.0066 0.1396 22 0.70197 0.82581 Ee2_507 0.0930 0.0024 0.0951 41 0.86669 0.95296 Ee2_508 0.0908 0.0427 0.1297 18 0.73305 0.80879 Ee5_245 0.4125 0.0018 0.4135 37 0.53773 0.91641 Ee5_376 0.2569 0.0447 0.2901 54 0.65250 0.88058 Στο άρριζο ακτινωτό δενδρόγραμμα που κατασκευάστηκε με βάση τις γενετικές αποστάσεις F ST (Εικ. 2), η Βαλτική εμφανίζεται ως ο πιο απομακρυσμένος γενετικά πληθυσμός. Ο πληθυσμός των Κανάριων Νήσων διαχωρίζεται εμφανώς από τους υπόλοιπους πληθυσμούς αλλά συνδέεται σε σειρά με τους γεωγραφικά κοντινούς του. Οι πληθυσμοί του γαύρου της Μεσογείου (εκτός αυτών της Μάλαγας και της Αλγερίας) και της Μαύρης Θάλασσας ομαδοποιούνται, χωρίς όμως η διάταξή τους στο δένδρο να ανταποκρίνεται στη γεωγραφική τους εγγύτητα. Ο Βισκαϊκός ομαδοποιείται και αυτός μαζί με την προηγούμενη ομάδα και εμφανίζεται δίπλα στην Πάτρα και τον Κόλπο των Λεόντων. Εικ. 2: Άρριζο ακτινωτό δενδρόγραμμα µε τη μέθοδο Σύνδεσης Γειτόνων (Neighbour Joining) χρησιμοποιώντας ως γενετικές αποστάσεις τις τιμές F ST. Τα κυκλικά διαγράμματα δείχνουν τη συχνότητα των δύο κλάδων του μιτοχονδριακού DNA (λευκό: κλάδος Α, μαύρο: κλάδος Β) σε κάθε πληθυσμό (δεδομένα από Magoulas et al., 2006 και αδημοσίευτα). Η συσχέτιση μεταξύ γεωγραφικών και γενετικών αποστάσεων ήταν στατιστικά σημαντική (p=0.001, R 2 =0.405) γεγονός που υποδηλώνει την ύπαρξη απομόνωσης λόγω απόστασης στους πληθυσμούς που εξετάστηκαν. -803-

9 th Symposium on Oceanography & Fisheries, 2009 - Proceedings, Volume ΙΙ 4. Συμπεράσματα - Συζήτηση Η γενετική ανάλυση δειγμάτων γαύρου με τη χρήση μικροδορυφορικών δεικτών επιβεβαίωσε την έντονη γεωγραφική δομή των πληθυσμών του, καθώς τα περισσότερα ζεύγη πληθυσμών που εξετάστηκαν εμφανίζονται γενετικώς διαφοροποιημένα. Πιο διαφοροποιημένοι εμφανίζονται οι πληθυσμοί από τα άκρα της κατανομής του γαύρου, ο πληθυσμός στην είσοδο της Βαλτικής που βρίσκεται στο βόρειο άκρο και ο πληθυσμός των Κανάριων Νήσων που βρίσκεται προς το νότιο δυτικό άκρο. Ο πληθυσμός της Βαλτικής είναι σχετικά πρόσφατος και διαφέρει σημαντικά από τον πλησιέστερό του στο Βισκαϊκό Κόλπο, από τον οποίο θεωρητικά θα μπορούσε να είχε προέλθει μέσω επέκτασης της κατανομής προς τα Βόρεια. Αντιθέτως, ο πληθυσμός των Κανάριων Νήσων εμφανίζει τη μικρότερη διαφοροποίηση με τους γεωγραφικά πλησιέστερους πληθυσμούς της Ν. Πορτογαλίας, Μάλαγας και Αλγερίας, οι οποίοι με τη σειρά τους δεν εμφανίζουν στατιστικά σημαντική διαφοροποίηση γεγονός που σημαίνει ότι υπάρχει αυξημένη γονιδιακή ροή μεταξύ τους. Μέσα στη Μεσόγειο, οι πληθυσμοί εμφανίζουν μικρή γενετική διαφοροποίηση μεταξύ τους, που όμως σε αρκετές περιπτώσεις είναι στατιστικά σημαντική. Η έλλειψη γενετικής διαφοροποίησης μεταξύ Πάτρας και Κόλπου των Λεόντων δείχνει ότι υπάρχει αυξημένη γενετική ροή μεταξύ Ιονίου και βορειοδυτικής Μεσογείου. Η γενετική ομοιότητα μεταξύ Μαύρης Θάλασσας και Αδριατικής μάλλον είναι τυχαία, αφού οι πληθυσμοί αυτοί είναι γεωγραφικά απομακρυσμένοι και σε επίπεδο μιτοχονδριακού DNA εμφανίζουν έντονη διαφοροποίηση. Επιπλέον, επιβεβαιώνεται ότι ο διαχωρισμός μεταξύ πληθυσμών Ατλαντικού και Μεσογείου βρίσκεται ανατολικά των στενών του Γιβραλτάρ, με τη θάλασσα του Αλμποράν να εντάσσεται γενετικά (και βιογεωγραφικά) στον Ατλαντικό. Τα παραπάνω αποτελέσματα φαίνεται γενικά να συμφωνούν με αποτελέσματα προηγούμενων μελετών στο γαύρο βασισμένων στο μιτοχονδριακό DNA (Magoulas et al., 1996;Magoulas et al., 2006)(Εικ. 2). Είναι ενδιαφέρον ότι η γενετική ομοιότητα μεταξύ Βισκαϊκού και Δυτικής Μεσογείου που είχε βρεθεί με βάση το μιτοχονδριακό DNA επιβεβαιώνεται και με το μικροδορυφορικό DNA. Αντιθέτως, η ομοιότητα μεταξύ Μαύρης Θάλασσας, Β. Αιγαίου και των πληθυσμών του Ατλαντικού, που έχουν υψηλή συχνότητα κλάδου Α, δεν παρατηρήθηκε στο επίπεδο του μικροδορυφορικού DNA. Τα δεδομένα αυτά προσφέρουν μια νέα θεώρηση της εξελικτικής ιστορίας των πληθυσμών του γαύρου σε σχέση με τα αποτελέσματα του μιτοχονδραικού DNA. Φανερώνουν ότι οι πληθυσμοί Βισκαϊκού και Δυτικής Μεσογείου έχουν πρόσφατη προέλευση, πιθανώς λόγω επέκτασης προς τον ΒΑ Ατλαντικό πληθυσμών από τη Δ. Μεσογείο, που μπορεί να αποτελούσε παγετωνικό καταφύγιο του κλάδου Β. Στην περίπτωση της Μαύρης Θάλασσας και του Ατλαντικού, φαίνεται ο Ατλαντικός (Αφρικανικές ακτές;) να είναι η περιοχή προέλευσης του κλάδου Α. Από εκεί, άτομα με απλότυπο τύπου Α κινήθηκαν προς τα βόρεια και αντικατέστησαν του πληθυσμούς κλάδου Β των πορτογαλικών ακτών, αποκόπτοντας έτσι το Βισκαϊκό από τη Δ. Μεσόγειο. Στη συνέχεια εισήλθαν στη Δ. Μεσόγειο και διαχύθηκαν προς την Α. Μεσόγειο, αναμίχθηκαν με τους εκεί πληθυσμούς ενώ η Μαύρη Θάλασσα αποικήθηκε τυχαία μόνο από άτομα με απλότυπο Α, που όμως στο πυρηνικό επίπεδο δεν διέφεραν από τα υπόλοιπα άτομα της Μεσογείου. Το παραπάνω σενάριο αντικατοπτρίζει την πολύπλοκη εξελικτική ιστορία του γαύρου, χρειάζεται όμως ανάλυση περισσοτέρων δειγμάτων για την πληρέστερη διαλεύκανσή της. 5. Ευχαριστίες Οι συγγραφείς θα ήθελαν να ευχαριστήσουν τη Βάσω Τερζόγλου και την Κατερίνα Οικονομάκη για τεχνική βοήθεια που προσέφεραν στο εργαστηριακό κομμάτι της μελέτης, καθώς και όλους όσους προσέφεραν δείγματα γαύρου για γενετική ανάλυση. -804-

9 ο Πανελλήνιο Συμπόσιο Ωκεανογραφίας & Αλιείας 2009 - Πρακτικά, Τόμος ΙΙ 6. Βιβλιογραφικές Αναφορές Ashburner, M., 1991. Mapping insect genomes. In: Insect Molecular Science. Crampton JM and Eggleston P edition. Academic Press, London. Bembo, D.G., Carvalho, G.R., Cingolani, N. & Pitcher, T.J., 1996a. Electrophoretic analysis of stock structure in Northern Mediterranean anchovies, Engraulis encrasicolus. ICES Journal of Μarine Science, 53: 115-128. Bembo, D.G., Carvalho, G.R., Cingolani, N., Arneri, E., Giannetti, G. & Pitcher, T.J., 1996b. Allozymic and morphometric evidence for two stocks of the European anchovy Engraulis encrasicolus in Adriatic waters. Marine Biology, 126: 529-538. Grant, S.W., Leslie, R.W. & Bowen, B.W., 2005. Molecular genetic assessment of bipolarity in the anchovy genus Engraulis. Journal of Fish Biology, 67: 1-24. Magoulas, A., Castilho, R., Caetano, S., Marcato, S. & Patarnello, T., 2006. Mitochondrial DNA reveals a mosaic pattern pf phylogeographical structure in Atlantic and Mediterranean populations of anchovy (Engraulis encrasicolus). Molecular Phylogenetics and Evolution, 39: 734-746. Magoulas, A., Tsimenides, N. & Zouros, E., 1996. Mitochondrial DNA Phylogeny and the Reconstruction of the Population History of a Species: The Case of the European Anchovy (Engraulis encrasicolus). Molecular Biology and Evolution, 13 (1): 178-190. Ovenden, J.R., 1990. Mitochondrial DNA and marine stock assessment: a review. Australian Journal of Marine and Freshwater Research, 41: 835-853. Spanakis, E., Tsimenides, N. & Zouros, E., 1989. Genetic differences between populations of sardine, Sardina pilchardus, and anchovy, Engraulis encrasicolus, in the Aegean and Ionian seas. Journal of Fish Biology, 35: 417-437. Tsigenopoulos, C.S., Hellemans, B., Chistiakov, D.A. et al. 2003. Eleven new microsatellites of the sea bass (Dicentrarchus labrax L.). Molecular Ecology Notes, 3: 352-354. Whitehead, P.J.P., Nelson, G. & Wongratana, T., 1988. FAO species catalogue, vol. 7, Clupeoid fishes of the world (suborder Clupeoidae), an annotated and illustrated catalogue of the herrings, sardines, pilchards, sprats, shads, anchovies and wolf-herrings. Part 2. Engraulididae, FAO Fish. Synops, 125: 305-579. -805-