(Glycoside Hydrolase, GH) (1) α-n (NagBb) (Hyp) β-l- (HypBA2) β-l- (HypBA1) HypBA2. SeMet-SAD. (2) Bifidobacterium bifidum, B. longum, B. B.

Σχετικά έγγραφα
High mobility group 1 HMG1

Streptococcus pneumoniae. in silico. PfbA. M. Yamaguchi et al. Microbes Infect., 8: A. Martner et al. Infect. Immun., 77: , 2009

Mouse Gene 2.0 ST Array Shn3. Runx2 Shn3. Runx2 Shn3 Runx2. adult. (Schnurri, Shn)3/Hivep3. Runx2 Shn/Hivep. ST2 BMP-2 Shn3

1. Seimiya, M., Wada, A., Kawamura, K., Sakamoto, A., Ohkubo, Y., Okada,S., Hatano, M., Tokuhisa, T., Watanabe, T., Saisho, H., Tagawa, M.

MnZn. MnZn Ferrites with Low Loss and High Flux Density for Power Supply Transformer. Abstract:

2.6-kb kb site. Elf5 PCR

"#$%&#%$'(!)*!+$',+-.$+/!,%&/')0$)#'.,(!1.#2!#$.02)(02+#'!3(456!$'-'+/!+!

rp, ribosomal protein 60S rp mrna rpl30 rps14 RT-PCR mrna nonsense-mediated mrna decay smg-2 smg-2 mrna rp rpl-1 rpl-1

Cellular Physiology and Biochemistry

Electrolyzed-Reduced Water as Artificial Hot Spring Water

α 1 2- Cloning and Expression of alpha 1 2-fucosyltransferase in E. coli BIOTECHNOLOGY BULLETIN

1.1 1., Litopenaeus vannamei N- -β-d- NAGase. Asp Glu. K I 9.50 mmol/l mmol/l. Litopenaeus vannamei

Γεωπονικό Πανεπιςτήμιο Αθηνών Τμήμα Αξιοποίηςησ Φυςικών Πόρων και Γεωργικήσ Μηχανικήσ

Electronic Supplementary Information (ESI)

Μελέτη της έκφρασης του ογκοκατασταλτικού γονιδίου Cyld στον καρκίνο του μαστού

Identification of Fish Species using DNA Method

Studies on purification and characteristics of glycosyltransferase from an engineering strain

Η ΔΙΔΑΣΚΑΛΙΑ ΤΩΝ ΜΟΡΦΟΛΟΓΙΚΩΝ ΔΙΑΔΙΚΑΣΙΩΝ ΤΗΣ ΠΑΡΑΓΩΓΗΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΣΥΝΘΕΣΗΣ ΥΠΟ ΤΟ ΠΡΙΣΜΑ ΤΩΝ ΑΠΣ: ΜΙΑ ΚΡΙΤΙΚΗ ΘΕΩΡΗΣΗ

PKA. gastric inhibitory polypeptide(gip) glucagonlike peptide-1(glp-1) 2 GIP. Ca 2+ PKA PKA PKA AKAPs(A-kinase anchoring proteins) PKA PKA GLP-1 GLP-1

Development of a Seismic Data Analysis System for a Short-term Training for Researchers from Developing Countries

Ειδικό πρόγραμμα ελέγχου για τον ιό του Δυτικού Νείλου και την ελονοσία, ενίσχυση της επιτήρησης στην ελληνική επικράτεια (MIS )

ΑΡΙΣΤΟΤΕΛΕΙΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΘΕΣΣΑΛΟΝΙΚΗΣ ΙΑΤΡΙΚΗ ΣΧΟΛΗ. ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΩΝ ΣΠΟΥ ΩΝ «Ιατρική Ερευνητική Μεθοδολογία» ΙΠΛΩΜΑΤΙΚΗ ΕΡΓΑΣΙΑ

encouraged to use the Version of Record that, when published, will replace this version. The most /BCJ

ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΥΠΡΟΥ ΣΧΟΛΗ ΓΕΩΠΟΝΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ ΚΑΙ ΕΠΙΣΤΗΜΗΣ ΤΡΟΦΙΜΩΝ. Πτυχιακή εργασία

ΑΚΑ ΗΜΙΑ ΕΜΠΟΡΙΚΟΥ ΝΑΥΤΙΚΟΥ ΜΑΚΕ ΟΝΙΑΣ ΣΧΟΛΗ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ ΠΤΥΧΙΑΚΗ ΕΡΓΑΣΙΑ

Diversity-oriented Enzymatic Modular Assembly of ABO Histo-blood Group Antigens

Shiraia sp. Slf14 III

The Bioactivity of Glycocluster and Glycodendrimer

Τ.Ε.Ι. ΔΥΤΙΚΗΣ ΜΑΚΕΔΟΝΙΑΣ ΠΑΡΑΡΤΗΜΑ ΚΑΣΤΟΡΙΑΣ ΤΜΗΜΑ ΔΗΜΟΣΙΩΝ ΣΧΕΣΕΩΝ & ΕΠΙΚΟΙΝΩΝΙΑΣ

Χαρτογράφηση θορύβου

Multifunctinality and Crystal Dynamics of Highly Stable Porous Metal-Organic Framework [Zn 4 O(NTB) 2 ]

w o = R 1 p. (1) R = p =. = 1

Emulsifying Properties of Egg Yolk as a Function of Diacylglycerol Oil

Υδατάνθρακες. Χρήστος Κρούπης, MSc, PhD. Επίκουρος Καθηγητής Κλινικής Βιοχημείας Ιατρική Σχολή Πανεπιστημίου Αθηνών Αττικόν Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο

, DYY-8B, ; : Centrifuge 11 R. min

AΡΙΣΤΟΤΕΛΕΙΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΘΕΣΣΑΛΟΝΙΚΗΣ ΠΟΛΥΤΕΧΝΙΚΗ ΣΧΟΛΗ ΤΜΗΜΑ ΠΟΛΙΤΙΚΩΝ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ

encouraged to use the Version of Record that, when published, will replace this version. The most /BCJ BIOCHEMICAL JOURNAL

Πανεπιστήμιο Δυτικής Μακεδονίας. Τμήμα Μηχανικών Πληροφορικής & Τηλεπικοινωνιών. Ηλεκτρονική Υγεία

INSPIRED: The National RIs on Integrated Structural Biology, Drug Screening Efforts & Drug target functional characterization

Isolation, purification and partial characterization of the 2N2acetyl2D2 glucosaminidase from the pupae of Helicoverpa armigera

Enantioselective Organocatalytic Michael Addition of Isorhodanines. to α, β-unsaturated Aldehydes

Higher spin gauge theories and their CFT duals

coronary heart disease CHD 40% [1] atherosclero- sis AS 52.27±5.3 2~6. / polycyclic aromatic hydrocarbons PAHs

HIV HIV HIV HIV AIDS 3 :.1 /-,**1 +332

:B : (2011)

SUPPLEMENTARY INFORMATION

«ΘΕΜΑΤΑ ΑΣΤΙΚΟΥ ΣΧΕΔΙΑΣΜΟΥ» ΔΙΔΑΣΚΟΥΣΕΣ: ΒΑΪΟΥ Ντ., ΜΑΝΤΟΥΒΑΛΟΥ Μ., ΜΑΥΡΙΔΟΥ Μ. «Gentrification Friendly» γειτονιές στο κέντρο της Αθήνας(;)

[11].,, , 316 6, ,., 15.5%, 9.8%, 2006., IDF,, ,500, 2,830.,, ,200.,,, β, [12]. 90% 2,,,,, [13-15].,, [13,

Development of the Nursing Program for Rehabilitation of Woman Diagnosed with Breast Cancer

Inhibition of mushroom tyrosinase by flavonoid from Sorbus tianschanica Ruper in Xinjiang

The effect of curcumin on the stability of Aβ. dimers

Synthesis Characterization and Application of Phosphorus-Containing Derivatives of Chitosan

Acknowledgements... 3 Contents... I Figures... VII Tables... IX Abbreviations... X

Yahoo 2. SNS Social Networking Service [3,5,12] Copyright c by ORSJ. Unauthorized reproduction of this article is prohibited.

Μεταπτυχιακή διατριβή. Ανδρέας Παπαευσταθίου

ΑΡΙΣΤΟΤΕΛΕΙΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΘΕΣΣΑΛΟΝΙΚΗΣ

Supporting information. An unusual bifunctional Tb-MOF for highly sensing of Ba 2+ ions and remarkable selectivities of CO 2 /N 2 and CO 2 /CH 4

GREECE BULGARIA 6 th JOINT MONITORING

ΕΘΝΙΚΟ ΜΕΤΣΟΒΙΟ ΠΟΛΥΤΕΧΝΕΙΟ ΣΧΟΛΗ ΠΟΛΙΤΙΚΩΝ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ. «Θεσμικό Πλαίσιο Φωτοβολταïκών Συστημάτων- Βέλτιστη Απόδοση Μέσω Τρόπων Στήριξης»

An Advanced Manipulation for Space Redundant Macro-Micro Manipulator System

ACTA SCIENTIAE CIRCUMSTANTIAE. 16S rrna PNAN5 ( Rhodococcus sp. strain PNAN5). 20. ( Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences,

EM Baum-Welch. Step by Step the Baum-Welch Algorithm and its Application 2. HMM Baum-Welch. Baum-Welch. Baum-Welch Baum-Welch.

Engineering Tunable Single and Dual Optical. Emission from Ru(II)-Polypyridyl Complexes. Through Excited State Design

College of Life Science, Dalian Nationalities University, Dalian , PR China.

Επίδραση της Συμβολαιακής Γεωργίας στην Χρηματοοικονομική Διοίκηση των Επιχειρήσεων Τροφίμων. Ιωάννης Γκανάς

Εκπαίδευση και Πολιτισμός: έρευνα προκαταρκτικής αξιολόγησης μίας εικονικής έκθεσης

þÿ ¹µ ½  ±À±³É³ À±¹ ¹Î½ º±Ä þÿ ͼ²±Ã Ä Â ³ Â Ä Å

Δθαξκνζκέλα καζεκαηηθά δίθηπα: ε πεξίπησζε ηνπ ζπζηεκηθνύ θηλδύλνπ ζε κηθξνεπίπεδν.

ΣΥΓΧΡΟΝΕΣ ΤΑΣΕΙΣ ΣΤΗΝ ΕΚΤΙΜΗΣΗ ΚΑΙ ΧΑΡΤΟΓΡΑΦΗΣΗ ΤΩΝ ΚΙΝΔΥΝΩΝ

Electronic Supplementary Information

ΑΚΑΔΗΜΙΑ ΕΜΠΟΡΙΚΟΥ ΝΑΥΤΙΚΟΥ Α.Ε.Ν. ΜΑΚΕΔΟΝΙΑΣ ΠΤΥΧΙΑΚΗ ΕΡΓΑΣΙΑ ΕΠΙΒΛΕΠΩΝ ΚΑΘΗΓΗΤΗΣ : ΑΘΑΝΑΣΙΟΣ ΜΑΤΟΥΛΑΣ ΘΕΜΑ. Ανάλυση κυριότερων ειδών κλίματος

I ΙΑΙΤΕΡΟΤΗΤΕΣ ΤΗΣ ΙΑΠΙΣΤΕΥΣΗΣ ΤΩΝ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΚΩΝ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΩΝ ΝΕΡΟΥ ΚΑΤΑ ISO ΠΗΓΕΣ ΑΝΟΜΟΙΟΓΕΝΕΙΑΣ ΚΑΙ ΛΑΘΩΝ

Original Article. Corynebacterium. (

IMES DISCUSSION PAPER SERIES

Durbin-Levinson recursive method

Schedulability Analysis Algorithm for Timing Constraint Workflow Models

Wiki. Wiki. Analysis of user activity of closed Wiki used by small groups

Nguyen Hien Trang* **

ΑΡΙΣΤΟΤΕΛΕΙΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΘΕΣΣΑΛΟΝΙΚΗΣ ΤΜΗΜΑ ΟΔΟΝΤΙΑΤΡΙΚΗΣ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΟΔΟΝΤΙΚΗΣ ΚΑΙ ΑΝΩΤΕΡΑΣ ΠΡΟΣΘΕΤΙΚΗΣ

Development of Methods for the Specific Enrichment of Glycopeptides for the LC/MS Analysis

Πτυχιακή Εργασία Η ΠΟΙΟΤΗΤΑ ΖΩΗΣ ΤΩΝ ΑΣΘΕΝΩΝ ΜΕ ΣΤΗΘΑΓΧΗ

Chalkou I. C. [PROJECT] Ανάθεση εργασιών.

Τα ηπατικά επίπεδα του FOXP3 mrna στη χρόνια ηπατίτιδα Β εξαρτώνται από την έκφραση των οδών Fas/FasL και PD-1/PD-L1

ΠΡΟΟΠΤΙΚΕΣ ΓΙΑ ΒΙΩΣΙΜΗ Ή ΑΕΙΦΟΡΟ ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΣΤΟΝ ΔΗΜΟ ΠΙΕΡΙΩΝ

Correction of chromatic aberration for human eyes with diffractive-refractive hybrid elements

+, - functional food, nutraceutical , Food for Specified Health Uses (FoSHU) in future Makoto SHIMIZU, ,*+*

ΕΘΝΙΚΟ ΜΕΤΣΟΒΙΟ ΠΟΛΥΤΕΧΝΕΙΟ

Extract Isolation Purification and Identification of Polysaccharides from Exocarp of Unripe Fruits of Juglans mandshurica

Προβλήματα πρόσληψης της ορολογίας και θεωρίας στη μέση εκπαίδευση Καλλιόπη Πολυμέρου ΠΕΡΙΛΗΨΗ

Infant formula with galacto-oligosaccharides (OM55N) stimulates the growth of indigenous bifidobacteria in healthy term infants

CIFOR Japan CIFOR ,**0 -,**0 1 CIFOR

Ψηφιακό Μουσείο Ελληνικής Προφορικής Ιστορίας: πώς ένας βιωματικός θησαυρός γίνεται ερευνητικό και εκπαιδευτικό εργαλείο στα χέρια μαθητών

Photo-Induced Self-Assembly of Pt(II)-Linked Rings and Cages via the Photolabilization of a Pt(II) Pyridine Bond

Buried Markov Model Pairwise

«ΤΟ ΠΑΙΧΝΙΔΙ ΣΤΟ ΝΗΠΙΑΓΩΓΕΙΟ: ΈΡΕΥΝΑ

,35 , 96 %, China Academic Journal Electronic Publishing House. All rights reserved. CHINA BIOTECHNOLOGY ( )

The Simply Typed Lambda Calculus

Supporting Information

ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΠΑΤΡΩΝ ΤΜΗΜΑ ΗΛΕΚΤΡΟΛΟΓΩΝ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ ΚΑΙ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΩΝ ΤΟΜΕΑΣ ΣΥΣΤΗΜΑΤΩΝ ΗΛΕΚΤΡΙΚΗΣ ΕΝΕΡΓΕΙΑΣ

Development of a Tiltmeter with a XY Magnetic Detector (Part +)

Transcript:

(Glycoside Hydrolase, GH) (1) B α- (AgaBb) α-n (NagBb) (Hyp) β-β-l- (HypBA2) β-l- (HypBA1) B (2) Bifidobacterium bifidum, B. longum, B. breve B. bifidum B. bifidum (3)β-L- β-l- EC 3.2.1.187 EC 3.2.1.185 B. longum - - HypBA1 (BLLJ_1826 38%) B. longum - (1) AgaBb HypBA2 SeMet-SAD HypBA1 NREL Gregg T. Beckham QM/MM (2) B. bifidum JCM 1254 PCR pet21 BL21 TLC HPLC CBM (3) -Araf 2 L-Ara PYF B. longum JCM1217 mrna cdna BLLJ_0211 BLLJ_0212 -Araf 2 BLLJ_0208 PCR -Araf 2

cdna - HypBA1 (BLLJ_1826) (1)HypBA1 pnp- -L-Araf HypBA1 HypBA1 GH127 β-l- 2.2Å 2.0Å HypBA1 β- Zn 2+ Cys Glu E322 / Zn 2+ C417 E322 Zn 2+ C417 QM/MM C417 GH127 HypBA1 HypBA1 AgaBb 1289aa native 2.0Å NagBb native 2.8Å SeMet native S-SAD HypBA2 2.8Å native SeMet (2) Gal 1-3GalNAc 1-Ser/Thr -α-n- EngBF nagbb NagBb GalNAc 1-Ser/Thr GH129 pnp- -GalNAc GalNAc 1-Ser ABO B GH110 - AgaBb B B O AgaBb CBM51 B -N- GH89 -N- AgnB C CBM32 Sd a [GalNAc 1-4(NeuAc 2-3)Gal 1-4 GlcNAc-R] GH33 - GH123 -N- SiaBb3 Sd a Sd a GM2 N- (3) - -Araf 2 BLLJ_0208 29.5 BLLJ_0211 17.0 BLLJ_0212 51.6 L-Ara

-Araf 2 BLLJ_0208 BLLJ_0213 mrna - -Araf 2 HypBA1 BLLJ_1826 BLLJ_1826 30 His-tag 3540pH 5.0 HypBA1 -Araf 2 BLLJ_1826 HypBA1 BLLJ_1826 BLLJ_0211 -Araf 2 17.5 B.longum 2 -L- -Araf 2 L-Ara - M. Kiyohara, T. Nakatomi, S. Kurihara, S. Fushinobu, H. Suzuki, T. Tanaka, S.-I. Shoda, M. Kitaoka, T. Katayama, K. Yamamoto, and H. Ashida. An α-n-acetylgalactosaminidase from infant-associated bifidobacteria belonging to a novel glycoside hydrolase family 129 is implicated in an alternative mucin degradation pathway. J. Biol. Chem. 287, 693-700 (2012) doi: 10.1074/jbc.M111.277384 H. Sakurama, S. Fushinobu, M. Hidaka, E. Yoshida, Y. Honda, H. Ashida, M. Kitaoka, H. Kumagai, K. Yamamoto, and T. Katayama. 1,3-1,4-α-L-Fucosynthase that specifically introduces Lewis a/x antigens into type-1/2 chains. J. Biol. Chem. 287, 16709-16719 (2012) doi: 10.1074/jbc.M111.333781 Fujita K, Kitahara K, and Suganuma T. Functional analysis of degradative enzymes for hydroxyproline-linked β-l-arabinofuranosides in Bifidobacterium longum. Trends Glycosci. Glycotechnol. 24, 215-224 (2012). doi: 10.4052/tigg.24.215 S. Kaeothip, A. Ishiwata, T. Ito, S. Fushinobu, K. Fujita K, and Y. Ito. Preparation of p-nitrophenyl β-l-arabinofuranoside as a substrate of β-l-arabinofuranosidase. Carbohydr. Res. 382, 95-100 (2013) doi: 10.1016/j.carres.2013.10.005 T. Ito, T. Katayama, M. Hattie, H. Sakurama, J. Wada, R. Suzuki, H. Ashida, T. Wakagi, K. Yamamoto, K. A. Stubbs, and S. Fushinobu. Crystal structures of a glycoside hydrolase family 20 lacto-n-biosidase from Bifidobacterium bifidum. J. Biol. Chem. 288, 11795-11806 (2013) doi: 10.1074/jbc.M112.420109 Wakinaka T, Kiyohara M, Kurihara S, Hirata A, Chaiwangsri T, Ohnuma T, Fukamizo T, Katayama T, Ashida H, Yamamoto K. Bifidobacterial -galactosidase with unique carbohydrate-binding module specifically acts on blood group B antigen. Glycobiology 23 232-240 (2013) doi: 10.1093/glycob/cws142 Sakurama H, Kiyohara M, Wada J, Honda Y, Yamaguchi M, Fukiya S, Yokota A, Ashida H, Kumagai H, Kitaoka M, Yamamoto K, Katayama T. Lacto-N-biosidase encoded by a novel gene of Bifidobacterium longum subspecies longum shows unique substrate specificity and requires a designated chaperone for its active expression. J. Biol. Chem. 288 25194-25206 (2013) doi: 10.1074/jbc.M113.484733 T. Ito, K. Saikawa, S. Kim, K. Fujita, A. Ishiwata, S. Kaeothip, T. Arakawa, T. Wakagi, G. T. Beckham, Y. Ito, and S. Fushinobu. Crystal structure of glycoside hydrolase family 127 β-l-arabinofuranosidase from Bifidobacterium longum. Biochem. Biophys. Res. Commun. 447, 32-37 (2014) doi: 10.1016/j.bbrc.2014.03.096 Fujita K, Sakaguchi, T., Sakamoto, A., Shimokawa, M., and Kitahara, K. Bifidobacterium longum subsp. longum exo-β-1,3-galactanase, an enzyme for the degradation of type II arabinogalactan. Appl. Environ. Microbiol. 80, 4577-4584 (2014) doi: 10.1128/AEM.00802-14 Shimada Y, Watanabe Y, Wakinaka T, Funeno Y, Kubota M, Chaiwangsri T, Kurihara S, Yamamoto K, Katayama T, Ashida H. -N-Acetylglucosaminidase from Bifidobacterium bifidum specifically hydrolyzes -linked N-acetylglucosamine at nonreducing terminus of O-glycan on gastric mucin. Appl. Microbiol. Biotech. 99 3941-3948 (2015) doi: 10.1007/s00253-014-6201-x Shimokawa M, Kitahara K, and Fujita K. Characterization of a β-l-arabinopyranosidase from Bifidobacterium longum subsp. longum. J. Appl. Glycosci. 62, 1-6 (2015). doi: 10.5458/jag.jag.JAG-2014_006 S. Fushinobu, T. Ito, K. Saikawa, K. Fujita, S. Kaeothip, A. Ishiwata, and Y. Ito. The crystal structure of GH127 β-l-arabinofuranosidase. 10th Carbohydrate Engineering Meeting, 2013 4 21-24

T. Ito, T. Katayama, M. Hattie, J. Wada, R. Suzuki, H. Ashida, T. Wakagi, K. Yamamoto, K. A. Stubbs, and S. Fushinobu. Crystal structure of lacto-n-biosidase from Bifidobacterium bifidum. 10th Carbohydrate Engineering Meeting, 2013 4 21-24 Seonah Kim Sophon Kaeothip Gregg T. Beckham GH127 -L- 2014 3 29 2014 3 29 GH127 -L- 2014 7 11-12 GH127 -L- 2014 8 11 -N- 15 2014 5 24 H. Ashida, Y. Shimada, Y. Funeno, M. Kubota, T. Chaiwangsri, T. Katoh, T. Koyanagi, H. Tamaki, K. Yamamoto and T. Katayama. Screening and analysis of useful glycosidases for production of bifidogenic factors. The 1st Joint Seminar. New Core to Core Program. A. Advanced Research Networks on "Establishment of an International Research Core for New Bio-Research Fields with Microbes from Tropical Areas", 2014 8 10-11, 14 2014 8 30 39 2014 11 15 Sda 2015 3 29 HRGP Bifidobacterium longum -L- 2015 3 29 (1) FUSHINOBU, Shinya (2) ASHIDA, Hisashi (FUJITA, Kiyotaka) :