Ερωτησεις στη Βιοφυσική & Νανοτεχνολογία. Χειμερινό Εξάμηνο 2012

Transcript

1 Ερωτησεις στη Βιοφυσική & Νανοτεχνολογία. Χειμερινό Εξάμηνο ) Ποιο φυσικό φαινόμενο βοηθάει στην αυτοσυναρμολόγηση μοριακών συστημάτων? α) Η τοποθέτηση μοριων με χρήση μικροσκοπίου σάρωσης δείγματος β) Η επιλεκτική προσκόλληση μορίων μεταξύ τους γ) Η καταλυτική δράση των ενζύμων δ) Η σκέδαση ακτινων Χ 2) Ποιο είναι το χαρακτηριστικό των κρυστάλλων και όχι των άμορφων στερεών υλικών που επιτρέπει τα πειράματα κρυσταλλογραφίας? α) Τα ηλεκτρόνια των ατόμων του άμορφου υλικού δεν σκεδάζουν ακτίνες Χ β) Ο κρύσταλλος βρίσκεται σε κατάσταση εσωτερικής κρυσταλλικής τάξης γ) Στα άμορφα υλικά τα μόρια καταστρέφονται δ) Οι κρύσταλλοι έχουν συγκεκριμένο σχήμα. 3) 1 Angstrom είναι περίπου όσο: α) 10 νανόμετρα β) το μέγεθος ενός κυττάρου γ) η διάμετρος ατόμoυ υδρογόνου δ) 10-6 m 4) Ένας ορθορομβικός κρύσταλλος έχει κυψελίδα με a=10 Å, b=100 Å, c=100 Å, α=β=γ=90º. Υπάρχουν 2 μόρια πρωτεΐνης μοριακού βάρους Dalton, ανα κυψελίδα. Η πυκνότητα του κρυστάλλου ειναι α) 32 Kg/m 3 β) 1,6 g/cm 3 γ) 16 g/cm 3 δ) 0,32 Kg/cm 3 5) Πρωτεΐνη συγκέντρωσης 10 mg/ml βρισκεται σε διαλυμα NaCl και παύει να ειναι διαλυτη οταν η συγκέντρωση του NaCl υπερβεί το 1,2 M. Ποια απο τις παρακάτω τελικές συνθήκες κρυσταλλωσης στην σταγόνα (μετα απο διάχυση ατμών) πιθανον ειναι η κατάλληλη;(5 μοναδες) α) 20 mg/ml πρωτεΐνη, 1,3 M NaCl β) 20 mg/ml πρωτεΐνη, 1,2 M NaCl γ) 10 mg/ml πρωτεΐνη, 1,0 M NaCl δ) 10 mg/ml πρωτεΐνη, 2,0 M NaCl 6) Στο τετραγωνικο κρυσταλλικο συστημα: α) a=b=c, α=β=γ=90 β) a=b, α=β=γ=90 γ) a=b, α=β=90, γ ǂ 90 δ) a ǂ b ǂ c, α=β=γ=90 7) Σε ποια από τις παρακάτω εικόνες βλέπουμε την σωστή μοναδιαία κυψελίδα;

2 8) Το συμβολο 2 1 περιγραφει την εξης συμμετρία: α) στροφή 180 β) στροφη 90 και μετάθεση κατά 2 a γ) στροφη 180 και μεταθεση κατά 1/2 a δ) στροφη 90 και μεταθεση κατά a 9) Η γωνία ανάκλασης θ από τα επίπεδα 100 ενός ορθορομβικού κρυστάλλου είναι 10. Αν λ= 2 Å, ποια είναι η διάσταση της πλευράς α της μοναδιαίας κυψελίδας? α) 1,1Å β) 2,2 Å γ) 5,9 Å δ) 11,2 Å 10) Τι σχέση έχει η εικόνα περίθλασης κρυστάλλου με το πλέγμα στον αντίστροφο χώρο;: α) Οι κηλίδες αντιστοιχούν στα άτομα της μοναδαίας κυψελίδας β) Οι κηλίδες αντιστοιχούν στα άτομα των μορίων στην ασύμμετρη ομάδα γ) Οι κηλίδες αντιστοιχούν στα σημεία του πλέγματος αντίστροφου χώρου που βρίσκονται πάνω στη σφαίρα Ewald δ) Οι κηλίδες αντιστοιχούν στις φάσεις των ανακλάσεων 11) Τα δεδομένα περίθλασης ακτίνων Χ από κρύσταλλο αποτελούνται από: α) Τρεις παραμέτρους θέσης (x,y,z) για κάθε άτομο και μια για τη θερμική του ταλάντωση β) Τρεις παραμέτρους θέσης (h,k,l) για κάθε ανάκλαση και μια για την ένταση της γ) το πλέγμα Bravais και η ομάδα συμμετρίας χώρου δ) οι ισοτροπικοί παράγοντες θερμοκρασιακής αβεβαιότητας κάθε ατόμου 12) Η σφαίρα του Ewald μας χρησιμεύει στο: α) Να επιλύσουμε το πρόβλημα των φάσεων. β) Να προβλέψουμε ποια επίπεδα Bragg έχουν το σωστό προσανατολισμό ώστε να δώσουν ανακλάσεις. γ) Να υπολογίσουμε τους παράγοντες δομής. δ) Να βρούμε την ομάδα συμμετρίας χώρου και την ασύμμετρη κυψελίδα.

3 13) Τι είναι σωστό από τα παρακάτω αναφορικά με τις πληροφορίες που παίρνουμε από τη εικόνα περίθλασης κρυστάλλου;: α) Απο τις θέσεις των κηλίδων βρίσκουμε τις διαστάσεις της μοναδιαίας κυψελίδας β) Από τις εντάσεις των κηλίδων βρίσκουμε τις διαστάσεις της μοναδιαίας κυψελίδας γ) Απο τον αριθμο των κηλίδων βρισκουμε απο ποσα ατομα αποτελειται το μοριο δ) Απο τις διαστάσεις των κηλίδων βρίσκουμε την ομάδα συμμετρίας χώρου 14) Τι σχέση έχει η εικόνα περίθλασης κρυστάλλου με το πλέγμα στον αντίστροφο χώρο; α) Οι κηλίδες αντιστοιχούν στα άτομα της μοναδαίας κυψελίδας β) Οι κηλίδες αντιστοιχούν στα άτομα των μορίων στην ασύμμετρη ομάδα γ) Οι κηλίδες αντιστοιχούν στα σημεία του πλέγματος αντίστροφου χώρου που βρίσκονται πάνω στη σφαίρα Ewald δ) Οι κηλίδες αντιστοιχούν στις φάσεις των ανακλάσεων 15) Η ύπαρξη συστηματικών αποσβέσεων στη περίθλαση δηλώνει... α) την υπαρξη κεντρου συμμετριας β) την υπαρξη αξονα στροφης γ)την υπαρξη αξονα ελικωσεως δ) την υπαρξη επιπεδου κατοπτρισμου 16) Η διακριτική ικανότητα δεδομένων περίθλασης ειναι καλυτερη οσο μεγαλωνει... α) το ευρος γωνιών περιθλασης β) το μηκος κυματος των ακτινων Χ γ) οι αποστασεις των επιπεδων στον κρυσταλλο δ) η αποσταση του ανιχνευτη απο τον κρυσταλλο 17) Το μοριακό πρότυπο που περιγράφει μια κρυσταλλική δομή αποτελείται από: α) Μια παράμετρο για την φάση και μια για την ένταση κάθε ανάκλασης β) Τρεις παραμέτρους θέσης (x,y,z) για κάθε άτομο και μια για τη θερμική του ταλάντωση γ) το πλέγμα Bravais και η ομάδα συμμετρίας χώρου δ) οι ισοτροπικοί παράγοντες θερμοκρασιακής αβεβαιότητας κάθε ατόμου 18) Ποια είναι η τιμη του μέτρου και της φάσης του παραγόντα δομής F = 5exp(iπ/2); Ποια ειναι η αντιστοιχη ενταση ανακλασης; Μετρο Φαση Ενταση α) β) γ) δ) 5exp(iπ/2) ) Ο χάρτης ηλεκτρονιακής πυκνότητας χρησιμεύει: (5 μονάδες) α) Για να βρούμε τις διαστάσεις της μοναδιαιας κυψελίδας β) Για να υπολογίσουμε την ένταση των ανακλώμενων ακτίνων γ) Για βρούμε τις θέσεις των ατόμων στην μοναδιαία κυψελίδα δ) Για να λύσουμε το πρόβλημα των φάσεων 20) Για τον υπολογισμό του χάρτη ηλεκτρονιακής πυκνότητας χρειαζόμαστε:

4 α) Εντάσεις ανακλάσεων β) Φάσεις ανακλάσεων και ισοτροπικούς παράγοντες θερμοκρασιακής αβεβαιότητας γ) Εντάσεις και φάσεις ανακλάσεων δ) Ισοτροπικούς παράγοντες θερμοκρασιακής αβεβαιότητας και γνώση της ομάδας συμμετρίας χώρου 21) Πως απο τον χάρτη ηλεκτρονιακής πυκνότητας βρίσκουμε την δομή του μορίου: α) Ο χάρτης μας βοηθάει να βρούμε τις διαστάσεις a,b,c της μοναδιαίας κυψελίδας, δηλαδή την θέση των ατόμων β) Η θέσεις των ανακλώμενων ακτίνων στον χάρτη ηλεκτρονιακής πυκνότητας αντιστοιχούν στην θέση των ατόμων γ) Τοποθετούμε τα άτομα στο εσωτερικό των ισοβαρων επιφανειών δ) Λύνουμε το πρόβλημα των φάσεων απο το οποίο προκύπτει η δομή 22) Τι είναι το πρόβλημα των φάσεων ; α) ο προσδιορισμός της ομάδας συμμετρίας χώρου με χρήση των φάσεων. β) η ανάλυση του χάρτη Patterson που υπολογίζεται απο τις φάσεις. γ) η αποκάλυψη των χαμένων φάσεων των παραγόντων δομής δ) ο προσδιορισμός των γωνιών θ των ανακλάσεων 23) Έχουμε συλλέξει κρυσταλλογραφικά δεδομένα για ένα ένζυμο του οποίου η πολυπεπτιδικη αλληλουχία είναι παρόμοια με εκείνη ενζύμου γνωστής δομής. Για την πλήρη επίλυση της δομής του ενζύμου, το πρόβλημα των φάσεων μπορει να λυθει ευκολότερα με την μεθοδο της : α) πολλαπλης ισομορφης αντικαταστασης β) μοριακης αντικαταστασης γ) ανωμαλης διασπορας δ) ανωμαλης διασπορας πολλαπλου μηκους κυματος 24) Η αξιοπιστία μιας μοριακής δομής είναι καλύτερη οσο...: α)...μικρότεροι είναι οι παράγοντες δομής F hkl β)...μεγαλύτερος ειναι ο R-factor γ)...μεγαλύτερος ειναι ο παράγοντας θερμοκρασιακής αβεβαιότητας δ)..μικρότερος ειναι ο R-free 25) Ο παράγοντας R-factor είναι ίσος με Σ Fo-Fc / Σ Fo (όπου Fo είναι οι πειραματικά μετρημένοι και Fc είναι οι υπολογισμένοι με βάση το μοριακό πρότυπο παράγοντες δομής). Έχουμε καλύτερη αξιοπιστία για ένα μοριακό πρότυπο όταν: Α. Ο R-factor είναι μεγάλος αριθμός και τείνει στο άπειρο Β. Ο R-factor είναι μικρός αριθμός κοντά στο 0 (π.χ. 0.1) Γ. Ο R-factor είναι μικρός αριθμός κοντά στο 1 (π.χ. 0.99) Δ. Δεν έχει σχέση η αξιοπιστία μοριακού προτύπου με τον R-factor. 26) Για ποιο λόγο χρησιμοποιούμε ακτίνες Χ και όχι ορατό φως για πειράματα κρυσταλλογραφίας? α) Γιατί το λ των ακτίνων Χ είναι της τάξης μήκους χημικών δεσμών β) Γιατί το φως θα καταστρέψει τον κρύσταλλο γ) Γιατί το λ του φωτός είναι της τάξης μήκους χημικών δεσμών δ) Γιατί οι κρύσταλλοι απορροφούν το φως

5 27) Στην δυναμική σκέδαση φωτός εξάγουμε πληροφοριες απο α) την γωνια σκεδασης φωτος απο το δειγμα β)τις διακυμανσεις σκεδασης φωτος απο το δειγμα γ) το μηκος κυματος του σκεδαζομενου φωτος δ) το δεικτη διαθλασης του δειγματος 28) Η σκεδαση ακτινων Χ μικρης γωνιας εφαρμοζεται α) σε κρυσταλλους β) σε μεμονωμένα μορια γ) σε διαλυματα μοριων δ) σε βαρεα μεταλλα 29)Η διακριτικη ικανοτητα που επιτυγχανεται με την σκεδαση ακτινων Χ μικρης γωνιας ειναι της ταξης του α) Ȧ β) nm γ) μm δ) mm 30) Ποια τεχνικη βοηθησε στο να βρεθει η δομη του νουκλεοσωματος; α) δυναμική σκέδαση φωτός β) σκεδαση ακτινων Χ μικρης γωνιας γ) σκεδαση νετρονιων μικρης γωνιας δ) NMR 31) Η εξισωση van't Hoff μας επιτρεπει να υπολογισουμε θερμοδυναμικες σταθερες μετρωντας α) τη θερμοτητα που απορροφαται απο το συστημα β) την ελευθερη ενεργεια σε διαφορετικες θερμοκρασιες γ) τις ενθαλπιες σε διαφορετικες θερμοκρασιες δ) τις σταθερες ισορροπιας Κ σε διαφορετικες θερμοκρασιες 32)Η θερμιδομετρια διαφορικης σαρωσης βασιζεται α) στην μετρηση της θερμοτητας που απορροφαται η απελευθερώνεται απο το συστημα οταν μεταβαλλεται η θερμοκρασια β) στην μετρηση σταθερων ισορροπιας Κ σε διαφορετικες θερμοκρασιες γ) στην μετρηση της θερμοτητας που απορροφάται η απελευθερώνεται απο το συστημα οταν γινεται αναμιξη 2 συστατικων δ) στην μετρηση της ενθαλπιας που μεταβαλλεται στο συστημα 33) Στην θερμιδομετρια διαφορικης σαρωσης μιας πρωτεινης παρατηρουμε μια κορυφη στον ρυθμο απορρόφησης θερμοτητας σε μια συγκεκριμενη θερμοκρασια, επειδη α) η πρωτεινη ξεδιπλωνει στην θερμοκρασια τηξης β) η πρωτεινη διασπαται σε πεπτιδια στην θερμοκρασια αυτη γ) η πρωτεινη προσδενεται στην θερμοκρασια αυτη δ) η πρωτεινη εξατμιζεται στην θερμοκρασια τηξης 34)Η θερμιδομετρια ισοθερμικης τιτλοδοτησης βασιζεται α) στην μετρηση της θερμοτητας που απορροφάται η απελευθερώνεται απο το συστημα οταν μεταβαλλεται η θερμοκρασια β) στην μετρηση σταθερων ισορροπιας Κ σε διαφορετικες θερμοκρασιες

6 γ) στην μετρηση της θερμοτητας που απορροφαται η απελευθερώνεται απο το συστημα οταν γινεται αναμιξη 2 συστατικων δ) στην μετρηση της ενθαλπιας που μεταβαλλεται στο συστημα 35) Σε ένα φάσμα NMR, η θέση μιας κορυφής εκφραζει (5 μονάδες): α) την θερμικη κινηση πυρηνων ατομων που σχετίζονται με την κορυφή ; β) τη συχνοτητα εκπομπης η απορροφησης ακτινοβολιας απο τους πυρηνες ατομων γ) την αλληλεπιδραση συγκεκριμενων ατομων μέσα σε ένα μακρομόριο; δ) τη ενεργεια φωτονιων απο αποδιεγερσεις ηλεκτρονιων ατομων 36) Σε ένα φάσμα NMR, η θέση μιας κορυφής μάς δίνει πληροφορίες για: α) την ταυτότητα των πυρήνων υδρογόνου που σχετίζονται με την συγκεκριμένη κορυφή ; β) τον αριθμό των ισοδύναμων πυρήνων υδρογόνου που σχετίζονται με την συγκεκριμένη κορυφή ; γ) την σχετική θέση των πυρήνων υδρογόνου μέσα σε ένα μακρομόριο; δ) τον συνολικό αριθμό των ατόμων υδρογόνου μέσα στο μόριο 37) Σε ένα φάσμα NMR, το υψος μιας κορυφής μάς δίνει πληροφορίες για: α) την ταυτότητα των πυρήνων υδρογόνου που σχετίζονται με την συγκεκριμένη κορυφή ; β) τον αριθμό των ισοδύναμων πυρήνων υδρογόνου που σχετίζονται με την συγκεκριμένη κορυφή ; γ) την σχετική θέση των πυρήνων υδρογόνου μέσα σε ένα μακρομόριο; δ) τον συνολικό αριθμό των ατόμων υδρογόνου μέσα στο μόριο 38) Τα πλεονεκτηματα του NMR στον προσδιορισμο της δομης μακρομοριων ειναι (10 μονάδες): α) παρέχει πληροφορίες για την δυναμική κίνηση του μοριου β) το μόριο προς μελετη ειναι σε διάλυμα αρα δεν απαιτειται κρυσταλλωση γ) ειναι πιο γρήγορη και οικονομική τεχνικη δ) απαιτούνται μικρότερες ποσότητες μακρομοριου 39)Το μειονέκτημα του NMR στον προσδιορισμο της δομης μακρομοριων ειναι α) το δείγμα καταστρέφεται ευκολα και χρειάζεται ταχεία συλλογή δεδομένων β) ειναι απαραίτητη η προσθήκη βαρέων μετάλλων γ) το ισχυρό μαγνητικό πεδίο προκαλεί αλλαγές στη δομή του μορίου. δ) είναι εφικτός ο προσδιορισμός δομής μόνο σχετικά μικρών μακρομοριων 40)Σε ένα φάσμα NMR, ποιo χαρακτηριστικό των κορυφών μάς δίνει πληροφορίες για (10 μονάδες): α) την ταυτότητα των πυρήνων υδρογόνου που σχετίζονται με την συγκεκριμένη κορυφή ; Α. εμβαδό της κορυφής Β. θέση της κορυφής στο φάσμα (χημική μετατόπιση) Γ. πλάτος και υφή της κορυφής β) τον αριθμό των ισοδύναμων πυρήνων υδρογόνου που σχετίζονται με την συγκεκριμένη κορυφή ; Α. εμβαδό της κορυφής Β. θέση της κορυφής (χημική μετατόπιση) Γ. πλάτος και υφή της κορυφής

7 γ) την σχετική θέση των πυρήνων υδρογόνου μέσα σε ένα μακρομόριο; Α. εμβαδό της κορυφής Β. θέση της κορυφής (χημική μετατόπιση) Γ. πλάτος και υφή της κορυφής 41) Οι πιο ισχυροι δεσμοι ειναι οι: α) ομοιοπολικοι β) ιοντος-ιοντος γ) διασπορας δ) υδρογονου 42) Οι δεσμοι που ειναι υπεύθυνοι για τον σχηματισμο εξαγωνικου πλεγματος απο τα μορια νερου ειναι: α) ομοιοπολικοι β) ιοντος-ιοντος γ)διασπορας δ) υδρογονου 43) Οι δεσμοι που ειναι ασθενεις και υπαρχουν αναμεσα σε ολα τα ειδη ατομων ειναι οι: α) ομοιοπολικοι β) ιοντος-ιοντος γ)διασπορας δ) υδρογονου 44) Η εξισώση υπολογίσμου του χάρτη της ηλεκτρονικής πυκνότητας ειναι η ρ(x,y,z)=σ F hkl cos2π(hx+ky+lz-φ hkl ) Τα F hkl προκυπτουν απο α) τις τετραγωνικες ριζες των εντασεων ανακλασεων περίθλασης β) απο υπολογισμό των φασεων ανακλασεων περίθλασης γ) απο τους δεικτες Miller hkl d) απο τους χαρτες Patterson 45) Η εξισώση υπολογίσμου του χάρτη της ηλεκτρονικής πυκνότητας ειναι η ρ(x,y,z)=σ F hkl cos2π(hx+ky+lz-φ hkl ) Κατα τον υπολογισμο ενος χαρτη, τα hkl στην εξισωση προκυπτουν απο α) απο δεικτες hkl της μοναδιαίας κυψελιδας β) τους δεικτες hkl των ανακλασεων περίθλασης απο τα δεδομενα πειραματος. γ) απο τους δεικτες hkl των φασεων d) απο υπολογισμό ολων των επιπεδων hkl 46) Η εξισώση υπολογίσμου των παραγοντων δομης γνωστης κρυσταλλικης δομης ειναι η Κατα τον υπολογισμο των παραγοντων δομης, τα xyz στην εξισωση προκυπτουν απο α) απο τις διαστασεις abc της μοναδιαίας κυψελιδας β) τους xyz των ανακλασεων περίθλασης απο τα δεδομενα πειραματος. γ) απο τις συντεταγμενες xyz των ατομων της γνωστης δομης d) απο υπολογισμό ολων των επιπεδων xyz

8 47) Η εξισώση υπολογίσμου των παραγοντων δομης γνωστης κρυσταλλικης δομης ειναι η Για τον υπολογισμο, οι ατομικοι παραγοντες δομης f i θα προκυψουν απο α) πινακες β) τις μετρησεις μας γ) φασεις δ) χαρτη ηλεκτρονιακης πυκνοτητας 48) Η παρακάτω εικόνα δείχνει το πακετάρισμα μορίων σφαιρικού σχήματος σε ένα κρύσταλλο. Ο κρύσταλλος παράγεται στην 3 η διάσταση με μετατόπιση της εικονιζόμενης διάταξης κάθετα στο επίπεδο της σελίδας. Ποσα μόρια υπάρχουν σε κάθε κυψελίδα; α) 1 β) 2 γ) 4 δ) 6 49) Η παρακάτω εικόνα δείχνει το πακετάρισμα μορίων χοντρικα σφαιρικού σχήματος διαμετρου 10 Α σε ένα κρύσταλλο. Ο κρύσταλλος παράγεται στην 3 η διάσταση με μετατόπιση της εικονιζόμενης διάταξης κάθετα στο επίπεδο της σελίδας. Ποιες είναι οι διαστάσεις της κυψελίδας και το είδος του κρυσταλλικού συστήματος; α) a=10, b=10, c=10 Å ΕΞΑΓΩΝΙΚΟ β) a=5, b=5, c=5 Å ΕΞΑΓΩΝΙΚΟ γ) a=10, b=10, c=10 Å ΤΡΙΚΛΙΝΙΚΟ δ) a=5, b=5, c=5 Å ΤΡΙΚΛΙΝΙΚΟ 50) Με το περιθλασίμετρο του εργαστηρίου παρατηρούμε ότι η ανάκλαση 001 από ένα κρύσταλλο σχηματίζει γωνία 15 σε σχέση με την προσπίπτουσα δέσμη ακτίνων

9 Χ μήκους κύματος 1,5 Å. Πως θα αλλάξει η γωνία αυτή αν χρησιμοποιήσουμε μια πηγή με ακτίνες Χ μήκους κύματος 1,0 Å ; α) θα μειωθει β) θα αυξηθει γ) δεν θα αλλαξει δ) χρειαζονται και αλλοι παραμετροι για να ξερουμε. 51) Ένας τετραγωνικός κρύσταλλος (α=b= 20 Å, c=40 Å), έχει ένα ατομο Mg στη θέση 1/4 0 1/4 της μοναδιαίας κυψελίδας. Ποιες ειναι οι συντεταγμένες του Mg σε Å; a) 5, 0, 20 a) 5, 5, 10 a) 5, 0, 10 a) 5, 0, 5 52) Ένας κρυσταλλος, ομάδας συμμετρίας χώρου P2 1 ( όπου ο άξονας 2 1 είναι παράλληλος του b), έχει ένα ατομο Mg στη θέση 1/4 0 1/4 της μοναδιαίας κυψελίδας. Ποιες απο τις παρακατω κλασματικες συντεταγμένες ενός συμμετρικου Mg ειναι η σωστες; a) 1/4, 3/4, 1/4 a) -1/4, 0, -1/4a) -1/4, 3/4, -1/4 a) -1/4, 1/2, -1/4 53) Ποιος τυπος συνδεει την ενταση ανακλασεων με τους παραγοντες δομης; α) Ι= F hkl 2 β) F hkl = I 2 γ) Ι= F hkl δ) Ι= φ hkl 2 54) Ένας κυβικός κρύσταλλος σε σχήμα κύβου διαστάσεων 0,1 mm σε κάθε ακμή, έχει κυψελίδα με a=100 Å. Υπάρχουν 2 μόρια πρωτεΐνης ανα κυψελίδα. Από πόσα μόρια πρωτεΐνης αποτελείται ο κρύσταλλος; α) 2x10 15 β) 0,5x10 12 γ) 2x10 12 δ) 0,5x10 14 ε) 0,5x ) Θέλουμε να βρούμε πως ένα φυτοφάρμακο αλληλεπιδρά στερεοχημικά με ένα ένζυμο του καλαμποκιού με κρυσταλλογραφια. Αν γνωρίζουμε την δομή του ενζύμου (το οποίο είναι πολύ μεγαλύτερο από το μόριο φυτοφαρμάκου) πως είναι ευκολότερο να επιλύσουμε το πρόβλημα των φάσεων? α) Με ισόμορφη αντικατάσταση β)με μοριακή αντικατάσταση γ) Με τη συναρτηση Patterson δ) Με ανώμαλη διασπορα πολλαπλού λ 56) Θέλουμε να βρούμε την κρυσταλλικη δομη μιας μεταλλοπρωτεινης με κρυσταλλογραφια σε πηγη synchrotron. Πως είναι ευκολότερο να επιλύσουμε το πρόβλημα των φάσεων? α) Με ισόμορφη αντικατάσταση β)με μοριακή αντικατάσταση γ) Με τη συναρτηση Patterson δ) Με ανώμαλη διασπορα πολλαπλού λ 57) Ο παράγοντας R-factor =Σ ( Fo-Fc) / Σ Fo εκφράζει: α) Τον βαθμό συμφωνίας των υπολογισμένων (από το μοριακό πρότυπο) με τους πειραματικά μετρημένους παράγοντες δομής β) Τον ισοτροπικό παράγοντα θερμοκρασιακής αβεβαιότητας

10 γ) Τον λόγο του πλάτους της σκεδαζόμενης δέσμης από όλα τα ηλεκτρόνια της κυψελίδας προς το πλάτος του κύματος από ένα απλό ηλεκτρόνιο. δ) Την συνάρτηση μεταθεσης 58) Η γωνία ανάκλασης θ από τα επίπεδα 010 ενός ορθορομβικού κρυστάλλου είναι 10. Αν λ= 2 Å, ποια είναι η διάσταση της πλευράς b της μοναδιαίας κυψελίδας? α) 3,76 Å β) 5,88 Å γ) 7,92 Å δ) 15,36 Å 59) Ο νομος του Friedel λεει οτι α) Ι -h-k-l = Ι hkl β) F hkl = I 2 γ) Ι hk-l = Ι hkl δ) Ι= φ hkl 2 60) Στην κρυσταλλογραφια, ο παράγοντας θερμοκρασιας Β εκφράζει: α) Την ελευθερη ενεργεια συνδεσης του ατομου β) Το μετρο της θερμικης κινησης ενος ατομου γ) Τον λόγο του πλάτους της σκεδαζόμενης δέσμης από όλα τα ηλεκτρόνια της κυψελίδας προς το πλάτος του κύματος από ένα απλό ηλεκτρόνιο. δ) Την θερμοσταθεροτητα του μοριου 61) Θέλουμε να βρούμε τη δομη ενος φυτοφάρμακου που ειναι ενα μικρο οργανικο μοριο. Πως είναι ευκολότερο να επιλύσουμε το πρόβλημα των φάσεων? α) Με ισόμορφη αντικατάσταση β)με μοριακή αντικατάσταση γ) Με αμεσες μεθοδους δ) Με ανώμαλη διασπορα πολλαπλου λ 62) Το συμβολο 2 1 υποδηλώνει α) αξονα στροφης 180 β) αξονα ελικωσεως 180 γ) κεντρο συμμετριας 180 δ) αξονα ελικωσεως 90 63) Το συμβολο 4 1 υποδηλώνει α) αξονα στροφης 180 β) αξονα ελικωσεως 180 γ) κεντρο συμμετριας 180 δ) αξονα ελικωσεως 90 64) Πρέπει να περιστρέφουμε τον κρύσταλλο κατά την συλλογή κρυσταλλογραφικών δεδομένων επειδή: Α. Για να προσδιορίσουμε την σφαίρα Ewald Β. Για να αυξήσουμε την διακριτική ικανότητα του πειράματος Γ. Για να λύσουμε το πρόβλημα των φάσεων Δ. Γιατί χωρίς περιστροφή, η συνθήκη Bragg ικανοποιείται μόνο για λίγες ανακλάσεις

11 65) Ο παράγοντας R-factor =Σ ( Fo-Fc) / Σ Fo (όπου Fo είναι οι πειραματικά μετρημένοι και Fc είναι οι υπολογισμένοι με βάση το μοριακό πρότυπο παράγοντες δομής) βρέθηκε να έχει την τιμή 0.25 για το μοριακό πρότυπο Α, 0.20 για το μοριακό πρότυπο Β και 0.20 για το μοριακό πρότυπο Γ. O R-free βρέθηκε να έχει την τιμή 0.27 για το μοριακό πρότυπο Α, 0.30 για το μοριακό πρότυπο Β και 0.25 για το μοριακό πρότυπο Γ. Σε ποιά από τις 3 περιπτώσεις πιθανώς έχουμε καλύτερη αξιοπιστία στο μοριακό πρότυπο; α) Α β) Β γ) Γ δ) Δεν μπορουμε να ξερουμε 66) Η διακριτικη ικανοτητα που επιτυγχανεται με την κρυσταλλογραφία ακτινων Χ για μακρομορια ειναι της ταξης του α) Ȧ β) nm γ) μm δ) mm 67) Η ύπαρξη συστηματικών αποσβέσεων για h=0, 3, 6, 9,... στη περίθλαση δηλώνει... α) την υπαρξη αξονα στροφης 3-ταξεως καθετου προς τον a β) την υπαρξη αξονα στροφης 3-ταξεως παραλληλου προς τον a γ)την υπαρξη αξονα ελικωσεως 3-ταξεως παραλληλου προς τον a δ) την υπαρξη αξονα ελικωσεως 3-ταξεως καθετου προς τον a 68) Η εικονα που καταγραφεται απο σκεδαση ακτινων Χ μικρης γωνιας απο διαλυμα ουσιας απεικονιζει α) ομοκεντρους δακτυλιους β) ανακλασεις γ) φασματικες γραμμες δ) διακυμανσεις σκεδασης 69) Η σκεδαση ακτινων Χ μικρης γωνιας ειναι τεχνική προσδιορισμού δομής που ενδείκνυται για ποιο απο τα ακόλουθα μοριακά συστήματα; α) Ιός β) Πρωτεΐνη γ) Μικρή πρωτεΐνη που δεν κρυσταλλώνει δ) Στερεό CsC 70) Ποιος τυπος συνδεει την μεταβολη της ελευθερης ενεργειας μιας αντιδρασης απο την τις μεταβολες της ενθαλπιας και την εντροπιας; α) ΔG=ΔΗ-ΤΔ S β) ΔS=klnW γ) ΔG=-RTlnK δ) ΔΕ=Q-W 71) Ποιος τυπος συνδεει την μεταβολη της ελευθερης ενεργειας μιας αντιδρασης με την σταθερα χημικης ισσοροπιας; α) ΔG=ΔΗ-ΤΔ S β) ΔS=klnW γ) ΔG= -RTlnK δ) ΔΕ=Q-W 72) Η πιο καταλληλη τεχνικη για τον προσδιορισμο της ελευθερης ενεργειας αλληλεπιδρασης μοριων ειναι η α) θερμιδομετρια διαφορικης σαρωσης β) πειραμα διαπιδυσης γ) θερμιδομετρια ισοθερμικης τιτλοδοτησης δ) δυναμικη σκεδαση φωτος

12 73) Η πιο καταλληλη τεχνικη για τον προσδιορισμο της θερμοκρασιας τηξης μιας πρωτεινης ειναι η α) θερμιδομετρια διαφορικης σαρωσης β) πειραμα διαπιδυσης γ) θερμιδομετρια ισοθερμικης τιτλοδοτησης δ) δυναμικη σκεδαση φωτος 74) Η διακριτικη ικανοτητα που επιτυγχανεται με τo NMR για μακρομορια ειναι της ταξης του α) Ȧ β) nm γ) μm δ) mm 75) Με τo NMR ειναι εφικτη η επιλυση δομης για μορια μεγεθους α) <20 κda β) <70 κda γ) <150 κda δ)<300 κda 76) Η χημική μετατόπιση δ στο NMR εκφραζει α) την χημικη επιδραση του μαγνητικου πεδιου στο δειγμα β) την αλλαγη της συχνοτητας συντονισμου πρωτονιου του δειγματος σε σχεση με την συχνοτητα αναφορας γ) την διαφορα εντασης του μαγνητικου πεδιου σε σχεση με το πεδιο αναφορας δ) την αλλαγη της συχνοτητας συντονισμου πρωτονιου του δειγματος εξαιτιας της αλληλεπίδρασης spin-spin με γειτονικους πυρηνες 77) Το πυρηνικο φαινομενο Overhauser (ΝΟΕ) εχει να κανει με: α) την αλλαγη της εντασης σηματος NMR ενος πυρηνα εξαιτιας της εξωτερικης διεγερσης με ακτινοβοληση ενος γειτονικου πυρηνα β) την αλλαγη της συχνοτητας σηματος NMR ενος πυρηνα εξαιτιας της εξωτερικης διεγερσης με ακτινοβοληση ενος γειτονικου πυρηνα γ) την αλλαγη της συχνοτητας σηματος NMR ενος πυρηνα εξαιτιας της αλληλεπιδρασης με το spin ενος γειτονικου πυρηνα d) την αλλαγη της εντασης σηματος NMR ενος πυρηνα εξαιτιας της αλληλεπιδρασης με το spin ενος γειτονικου πυρηνα 78) Οταν το μαγνητικο πεδιο αυξανει, η συχνοτητα συντονισμου ενος πυρηνα α) αυξανει β) μειωνεται γ) δεν αλλαζει 79) Οι διασταυρουμενες κορυφες σε φασματα 2D NMR εκτος της διαγωνιου αντιστοιχουν σε α) αλληλεπίδραση των πυρηνων με τον εαυτο τους β) δυο διαφορετικους πυρηνες που βρισκονται σε αλληλεπιδραση γ) συντονισμους των πυρηνων με τα μορια διαλυματος δ) κανενα απο τα παραπανω 80) Σε ενα φασμα NMR απο οργανο συχνοτητας ακτινοβολιας 1000 ΜΗz παρατηρειται μια κορυφη σε συχνοτητα khz. Η συχνοτητα που εμφανιζει η προτυπη ουσια την ιδια κορυφη ειναι khz. Η χημικη μετατοπιση της κορυφης ειναι α) 2 β) 3 γ) 0,002 δ) 0,003 khz ε) 2000 khz