Iranian Journal of Medical Microbiology

Transcript

1 riginal Article Iranian Journal of Medical Microbiology Iran J Med Microbiol: Volume 0, Number 6 (January February) Journal homepage: Farname Inc. serogrouping of Escherichia coli strains isolated from patients with Urinary tract infection by using PCR method Vahid Goudarzi, Mohsen Mirzaee 2, Reza Ranjbar 3 Downloaded from ijmm.ir at 7: on Thursday ctober th 208. Department of Cell and Molecular Biology, Boroujerd Branch, Islamic Azad University, Boroujerd, Iran 2. Department of Medical Laboratory Sciences, Boroujerd Branch, Islamic Azad University, Boroujerd, Iran 3. Molecular Biology Research Center, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran Article Information Article history: Received: 206/0/30 Accepted: 206/04/7 Available online: 206/0/7 Article Subject: Medical Bacteriology IJMM 207; 0(6): 008 Corresponding author at: Dr. Mohsen Mirzaee Department of Medical Laboratory Sciences, Boroujerd Branch, Islamic Azad University, Boroujerd, Iran Tel: Mohsen439@yahoo.com Abstract Background and Aim: Urinary tract infection (UTI) is one of the most common infections, and Escherichia coli is so far the most common causative agent of this disease. The antigen, consisting of many repeats of an oligosaccharide unit, is part of the lipopolysaccharide (LPS) in the outer membrane of Gramnegative bacteria. The variability of the antigen provides the major basis for serological schemes of Gramnegative bacteria. The aim of this study was to investigate the prevalence of serogroups among E. coli isolated from patients with UTI. Materials and Methods: During three months, 20 patients with urinary tract infection, referred to three hospitals of Tehran, Sanandaj and Boroujerd. E. coli isolates were identified using standard methods then serogrouping was performed by using PCR method. Results: A total of 50 E. coli strains were isolated from the urine samples. The most common types of antigens were (3.33%), 6 (8%), 8 (5.33%) and 2 (4%). There was no positive isolate for 22 and 83 genes. Conclusions: The present study revealed that serogroup was isolated with maximum frequency followed by 6, 8 and 2, respectively. In UPEC, the serogroups can be related to the virulence factor profile of each strain. Further studies from other parts of Iran and on other serogroup are recommended. KeyWords: Escherichia coli, Urinary tract infection, Antigen Copyright 207 Iranian Journal of Medical Microbiology. All rights reserved. How to cite this article: Goudarzi V, Mirzaee M, Ranjbar R. serogrouping of Escherichia coli strains isolated from patients with Urinary tract infection by using PCR method. Iran J Med Microbiol. 207; 0 (6): 008 Īrān. Majallahi mīkrub/shināsīi pizishkīi مجله میکرب شناسی پزشکی ایران

2 Farname Inc. مجله میکربشناسی پزشکی ایران سال شماره 2 بهمن اسفند 3 Journal homepage: مقاله پژهشی تعیین سرگرپهای در سیههای جداشده از بیماران مبتالبه عفنت دستگاه ادراری با استفاده از رش PCR Downloaded from ijmm.ir at 7: on Thursday ctober th 208 حید گدرزی محسن میرزایی 2 رضا رنجبر گره زیست شناسی دانشکده علم پایه احد برجرد دانشگاه آزاد اسالمی گره علم آزمایشگاهی احد برجرد دانشگاه آزاد اسالمی برجرد ایران مرکز تحقیقات بیلژی ملکلی دانشگاه علم پزشکی بقیه ا...)عج( تهران ایران اطالعات مقاله تاریخچه مقاله دریافت: 34// پذیرش: 3//2 انتشار مضع: باکتریشناسی پزشکی آنالین: 3/0/22 IJMM 395; 0(6): 008 نیسنده مسئل: دکتر محسن میرزایی گره علم آزمایشگاهی دانشگاه آزاد اسالمی احد برجرد برجرد ایران تلفن: چکیده زمینه اهداف: برجرد ایران عفنت ادراری (UTI) یکی از شایعترین عفنتها بده اشرشیاکلی رایجترین دلیل برز عفنت ادراری میباشد. آنتیژن متشکل از احدهای الیگساکاریدی تکراری است که یکی از اجزاء لیپپلی ساکارید )LPS( در غشاء خارجی باکتریهای گرم منفی میباشد. تغییرات آنتیژن مبنای اصلی مطالعات سرلژیک در باکتریهای گرم منفی میباشد. هدف از این مطالعه بررسی شیع اناع سرگرپهای در جداشده از بیماران مبتالبه عفنت ادراری بد. ماد رش کار: در طل سه تهران سنندج برجرد مردبررسی قرار گرفتند. هیت شدند. سپس تعیین سرگرپ ه یا یافتهها: باکتری ماه 02 بیمار مبتال به عفنت ادراری مراجعهکننده به سه بیمارستان شهرهای از تعداد کل بیماران مرد مطالعه قرار گرفته 52 اناع آنتیژن )%3/33( )%8( 88 شناسایی نگردید. به جدایه های با استفاده از رشهای استاندارد تعیین این جدایه ها با استفاده از رش PCR انجام گرفت. جدایه از نمنه ادرار جدا شد. شایعترین گزارش شد هیچ جدایه مثبتی برای ژنهای )%4( 8 )%5/33( نتیجهگیری: مطالعه حاضر نشان داد که سرگرپ با حداکثر تکرار به دنبال آن سرگرپ های 8 ترتیب از فراانی بیشتری برخردار بدند. در ملد عفنت ادراری )UPEC( سرگرپهای میتانند با الگی عامل یرالنس در هر سیه در ارتباط باشند. عاله بر این مطالعات بیشتر در پست الکترنیک: Mohsen439@yahoo.com خصص فراانی اناع سرگرپ ها در سایر نقاط ایران از دیگر سرگرپ تصیه میشد. کلمات کلیدی عفنت دستگاه ادراری آنتیژن کپیرایت : حق چاپ نشر استفاده علمی از این مقاله برای مجله میکربشناسی پزشکی ایران محفظ است. 2 مقدمه عفنت مجاری ادراری )Urinary Tract Infection :UTI( نعی پاسخ التهابی این مجرا نسبت به تهاجم عامل عفنی ازجمله باکتریها میباشد. میکرارگانیسمهای مختلف قادر هستند از راه مجاری ادراری ارد مثانه شده با طی مسیری به سمت کلیهها حرکت کنند. چنانچه قسمتهای تحتانی مجاری ادراری مانند مثانه درگیر شند بیمار از سزش درد به هنگام ادرار رنج میبرد. اگر قسمتهای فقانی مجاری ادراری مانند کلیهها درگیر شد عفنت را التهاب کلیه )پیلنفریت( مینامند بیمار از عالئمی چن درد پهل تهع استفراغ تب لرز شدید )(. میبرد رنج عفنت دستگاه ادراری یکی از مهمترین عفنتهای انسان محسب میشد ازنظر فراانی بعد از عفنت تنفسی قرار دارد یکی از شایعترین عفنتها در بین بیماران بستری در بیمارستان مراجعهکننده به آزمایشگاهها میباشد. عامل این عفنت در اغلب این مارد میباشد. که در تمام گرههای سنی در هر د جنس دیده میشد اما احتمال ابتال به عفنت ادراری در میان خانمهای جان بیشتر است )2(. در بین سیههای بیماریزا سیههای یرپاتژن )Uropathogenic E.coli شایعترین :UPEC(

3 مجله میکرب شناسی پزشکی ایران سال شماره 6 بهمن اسفند 33 Downloaded from ijmm.ir at 7: on Thursday ctober th 208 سیههای ایجادکننده عفنت ادراری هستند )3(. ها شامل هر د کلنی از سیههای بیماریزا کمنسال هستند که بهطر معملی تسط باکتریها مانند آنتیژن سرگرپهای سطحی این آنتیژنهای )لیپپلی ساکارید( آنتیژن H )فالژله( در برخی مارد آنتیژن K )کپسل( شناسایی میشند. که از بین آنتیژن سماتیک اهمیت بیشتری نسبت به سایرین دارد. آنتیژن قسمتی از لیپپلی ساکارید مجد در غشای خارجی باکتریهای گرم منفی است که از احدهای الیگساکارید تکرارشنده ساختهشده است. این آنتی ژن بهطر میانگین 3 تا 6 احد قندی ساختهشده که ری سطح سلل نقش یک آنتیژن اصلی را ایفا کرده عامل اصلی برای تحریک سیستم ایمنی میزبان میباشد باعث ایجاد آنتیژن )4(. تغییرات آنتیژن یک در باکتری بااسطه تفات در اجزاء قندی ارتباطات ساختمان احدهای تکراری قندی میشد. برای الین بار بر آنتیژن از مختلفی اناع اساس Kauffmann تسط طبقهبندی شد. در حال حاضر بیش 8 گره در های مختلف شش سرگرپ نشدهاند تعیین طبقهبندیشده جد دارد ) (.)( در کالستر ژنی آنتیژن ژنهای مردنیاز برای سنتز آنتیژن بهجز که ری کرمزم باکتری اقعشدهاند. این ژنها بین یک ناحیه حفاظتشده 33 جفت بازی در باالدست ژن دهیدرژناژ در آنتیژن gnd پاییندست کد کننده آنزیم 6 فسفگلکنات قرار دارند. ژنهایی که در سنتز بهطر نرمال نقش دارند شامل سه گره میباشند ژن سنتز کننده گره قند نکلئتید ژن سنتز کننده 2 گلیکزیل ترانسفراز 3 ژن پردازش کننده احد که شامل ژن )( فلیپاز ژن پلیمراز میباشد )wzy( 2(. با 0( به تجه تفات در ترکیب آنتیژن ژنهایی که آنزیمهای مردنیاز برای سنتز آنتیژن را کد میکنند میان سرگرپ های مختلف در متفات هستند. از بین بیش از 8 شناساییشده است سرگرپ های سرگرپ که از باکتری ارتباط با سیههای یرپاتژنیک ترجیحا در 83 هستند )0(. همانطر که گفته شد همه ژنهای مخصص سنتز آنتیژن بهطر نرمال ری کرمزم در درن یک دسته ژنی بین galf gnd عاله میباشد. ژنهای اختصاصیت بر تنع wzy ژنتیکی بهطر نرمال برای آنتیژن داشته میتانند هدف در رشهای تایپینگ ملکلی از قبیل PCR بهعنان برای شناسایی سرگرپ های مختلف استفاده شند )(. ماد رشها اسفند در یک مطالعه تصیفی مقطعی طی مدت لغایت خرداد )33 ماه )از نمنه ادرار از افراد مبتالبه عالئم عفنت ادراری به رش midstream )قسمت میانی جریان ادرار( از بیمارستانهای امام خمینی )ره( برجرد بعثت سنندج بقیها... )عج( تهران جمعآری گردید. ابتدا نمنهها بر ری محیطهای مک کانکی آگار )سپس با استفاده از EMB TSI MR/VP SIM ساخت شرکت مرک آلمان( تعداد جمعآری شد. کشت داده شدند آزمایشهای رایج بیشیمیایی مانند اره سیمن سیترات )تمامی محیطهای فق ایزله استخراج DNA بررسی فراانی ژنهای سرگرپ استخراج DNA باکتری با رش جشاندن انجام گرفت بهطر خالصه یک کلنی خالص از کشت تازه باکتری در میکرتیپ حای محیط مایع به مدت LB 2 میکرتیپ در در ساعت در دمای 33 2 به مدت )مرک آلمان( تلقیح گردید درجه سلسیس انکبه شد. دقیقه سانتریفیژ شد. مایع ریی در ریخته شد میکرلیتر آب مقطر استریل به آن اضافه شد بهخبی مخلط گردید. میکرتیپ به مدت دقیقه در دمای 3 درجه سلسیس قرار داده شد سپس در در 2 به مدت DNA اکنش دقیقه سانتریفیژ شد. مایع ریی حای است که در میکرتیپ دیگر ریخته شد. تا زمان انجام در فریزر PCR بهمنظر تشخیص حضر 2 استفاده گردید. در جدل )پیشگام درجه سلسیس نگهداری شدند. ژنهای PCR رش از سرگرپ ایران( آرده شده است. هریک از تالی پرایمرهای استفادهشده سیههای دریافت شده در آزمایشگاه با استفاده از پرایمرهای اختصاصی ژن 6SrRNA باکتری تأیید شدند. اجزاء اکنش حجم اکنش برنامه حرارتی در جدل 2 آمده است. 3

4 گدرزی همکاران تعیین سرگرپه ای در سیه های جدل : فهرست پرایمرهای مرداستفاده برای شناسایی ژنهای سرگرپ در یرپاتژنیک جداشده از بیماران مبتالبه عفنت ادراری Downloaded from ijmm.ir at 7: on Thursday ctober th 208 Serogroup Target gene Primer sequences (5' 3') Size of product (bp) orf469 E. coli 6S rrna F: GTGAGCAAAAGTGAAATAAGGAACG R: CGCTGATACGAATACCATCCTAC F: CCAGAGGCATAATCAGAAATAACAG R: GCAGAGTTAGTCAACAAAAGGTCAG F: GGTTTCAATCTCACAGCAACTCAG R: GTTAGAGGGATAATAGCCAAGCGG F: CTGCTGATGTCGCTATTATTGCTG R: TGAAAAAAAGGGAAACAGAAGAGCC F: TTCATTGTCGCCACTACTTTCCG R: GAAACAGCCCATGACATTACTACG F: GTACACCAGGCAAACCTCGAAAG R: TTCTGTAAGCTAATGAATAGGCACC F: AGAGTTTGATCMTGGCTCAG R: CCGTCAATTCATTTGAGTTT جدل 2: حجم فرایند دمایی تعداد سیکل اکنشهای زنجیرهای پلیمراز ژنهای هدف برنامه PCR Cycle 95 0 C..5 min 30 Cycle 95 0 C s 55 0 C...60 s 72 0 C.. 60 s Cycle 72 0 C 5 min الکترفرز محصل PCR برای بررسی محصالت حجم اکنش 25µL Taq 2x Master Mix x: TrisHcl ph 8.5, (NH4) 2S 4, 3Mm Mgcl 2, 0.2% Tween Mm dntps 0.2 units/µl Ampliqon Taq DNA polymerase (Pishgam) μm of each primers F & R (Pishgam) 3 μl DNA template PCR %/ رنگآمیزی DNA استفاده از دستگاه مردبررسی قرار گرفتند. تجزیه تحلیل آماری از الکترفرز در ژل آگارز بارنگ سایبر گرین انجام شد. ژلها با Viber( آلمان( Gel Documentation SPSS دادههای حاصل از این مطالعه با استفاده از نرمافزار آماری Chicago.( )SPSS Inc Version 6.0. آزمنهای آماری مربع کای فیشر معنیداری ری یافتهها P 0.05 قرار داده شد. تجزیهتحلیل گردید. مرز از اسفند 333 لغایت خرداد 33 از دیست ده نمنه مردبررسی شناسایی گردید )تصیر ایزله (. نتایج نشان میدهد ملد عفنت ادراری از میان 33 ایزله مرد )%26( مربط به جنس مذکر مرد )%3( مربط به جنس مؤنث بد. بیشترین شیع ملد عفنت ادراری در خانمها در گره سنی سال تا 3 )%3/33( در آقایان در گره سنی باالتر از 6 سال )%8/66( دیده شد. فراانی باکتری یرپاتژنیک جداشده از بیماران مبتالبه عفنتهای ادراری برحسب بخش بستری به این صرت بد: %6 نمنهها از بخش داخلی %26/66 از ارژانس %/66 از بخش %2/66 ICU سرپایی %/33 از بخش از بخش قلب %2/66 CCU بخشها. فراانی ژنهای سرگرپ بیماران %2 از بخش ارلژی سایر در باکتری جداسازی شده از بیماران مبتالبه عفنتهای ادراری در جدل 3 بهدستآمده در میان جدایهها شیع آمده است. ژنهای بر طبق 8 نتایج 6 2 به ترتیب شامل 8 /33 3/33 درصد به دست آمد ژنهای در سیههای ما شناسایی نشد )تصیر 2(.

5 مجله میکرب شناسی پزشکی ایران سال شماره 6 بهمن اسفند 33 جدل 3: فراانی ژنهای سرگرپ در باکتری یرپاتژنیک جداسازی شده از بیماران مبتالبه عفنت ادراری برحسب بیمارستان جنسیت ژنهای سرگرپ تعداد )%( بیمارستان جنس Downloaded from ijmm.ir at 7: on Thursday ctober th 208 )( )/( 2 )/( 3 )/( 2 )3/32( 2 )3/3( )2/22( )( 6 )8/8( 8 )/8( 8 )/( )3/3( )3/32( 2 )8/8( 2 )/( 2 )8( 2 )3/3( )3/( )/36( )8/88( )/33( 8 تصیر باکتری بقیها... )عج( تهران بعثت سنندج امام خمینی )ره( برجرد کل )2( 2 )3/63( 6 )/8( 8 )/( 2 )2/2( )/36( 6 )3/3( )/3( )3/33( 6 )3/33( 2 مذکر )( مؤنث )( کل )( مذکر )8( مؤنث )33( کل )( مذکر )( مؤنث )3( کل )( )( PCR اکنش : یرپاتژنیک برای ردیابی ژن 6S rrna باکتری در نمنههای ادرار بیماران مبتالبه عفنتهای ادراری. M: مارکر جفت بازی :NC کنترل منفی :PC کنترل مثبت شماره 3 نمنههای مثبت تصیر :2 محصل PCR با اندازههای بحث عفنت مجاری ادراری شامل عفنتهای کلیهها مثانه است که ازنظر شیع دمین نع عفنت باکتریایی پس از عفنت مجاری تنفسی مارد میباشد ) 4(. عامل بیش از 8 درصد UTI باگذشت UTI سیههای در تمام ردههای سنی است )0 2(. درمان نامناسب زمان میتاند مهمترین نارسایی باعث عامل ایجادکننده یرپاتژنیک کلیی عفنت شد )0(. است. ادراری )UPEC( خصصیات یرالنس خاصی از قبیل تانایی کسب آهن اتصال سرگرپهای : K: H اختصاصی تانایی ساخت سیتتکسین های خاصی را از خد نشان میدهند. همه این یژگیها در کلنیزاسین تهاجم باکتری نقش دارند. سیههای بهطرمعمل با رش سرتایپینگ برای آنتیژن )فالژل( )کپسل( H )لیپپلی ساکارید( در برخی مارد آنتیژن شناسایی میشند )(. سرگرپهای K UPEC با برخی از عامل مؤثر در بیماریزایی این سیههای باکتری در ارتباط میباشند. در مطالعات گذشته گزارشهایی مبنی بر ارتباط بین سرگرپ های سیههای با 83 مشاهده گردیده است )2(. در مطالعه حاضر 6 سرگرپ جدایههای گرفت. از UPEC در ملد عفنت ادراری مردبررسی قرار جدایه مردبررسی 6 جدایه )3/66 درصد( اجد یکی از سرگرپهای مردبررسی بده 63/3 322 جفت بازی حاصل از پرایمرهای مرداستفاده برای ژنهای :M.83 مارکر

6 گدرزی همکاران تعیین سرگرپه ای در سیه های Downloaded from ijmm.ir at 7: on Thursday ctober th 208 درصد سیهها فاقد این سرگرپها بدند. از این میان سرگرپ با فراانی %3/33 بیشترین فراانی را در بین ژنهای مردبررسی به خد اختصاص داد. برای الین بار کافمن سیههای را بر اساس اناع مختلف آنتیژن طبقهبندی نمد )(. تاکنن بیش از 8 نع آنتیژن مرد شناسایی قرارگرفته است )2(. تنها سرگرپهای تعداد محددی از در مانند غیره با در ارتباط UTI بده است شیع آنها در مکانهای مختلف در طل زمان تغییر میکند )2(. در ایران مطالعات زیادی در خصص سرگرپ بندی جدایههای ملد عفنت ادراری بر اساس آنتیژن انجامگرفته است. دریکی از مطالعاتی که تسط همکارانش در سال Emamghoraishi 2 انجام گرفت 36 جدایه ملد عفنت ادراری جداشده از کدکان مبتالبه پیلنفریت سیستیت ازنظر سرگرپهای آنها در مطالعه خد به این سرگرپهای مردبررسی قراردادند )22(. نتیجه رسیدند که بین برخی از ژنهای دخیل در بیماریزایی ارتباط جد دارد. در این مطالعه مشابه مطالعه ما سرگرپ شایعترین سرگرپ در جدایه های ملد پیلنفریت سیستیت گزارششده است. در مطالعه حاضر سرگرپهای به ترتیب از فراانی برابر 8 /33 3/33 درصد برخردار بدند سرگرپه یا 22 شناسایی نشد. در مطالعه 83 Li PCR در جدایه های مردمطالعه ما همکاران که با استفاده از رش چهارده سرگرپ مردبررسی قراردادند 4 2 ( ( سرگرپ های, 2, 8 75 از فراانی باالتری برخردار بدند )3(. در بسیاری از مطالعات انجامشده درگذشته سرگرپ سرگرپ در گردیده است. رایجترین 6 سیههای ملد عفنت ادراری گزارش 6 ما مطالعه از فراانی بیشتری 8 برخردار بدند علت این تفات در نتایج بهدستآمده در مطالعه حاضر میتاند به این دلیل باشد که 6 یک سرگرپ شایع در سیههایی از است که از کدکان با عفنت ادراری جداشدهاند حالآنکه مرد ارزیابی قرارگرفتهاند. Dormanesh نمنههیا مردمطالعه همکارانش در سال 23 ما در همه سنین سیه 2 از نمنههای ادرار افراد مبتال به پیلنفریت التهاب مثانه را بررسی کردند ردیابی شده در کدکان مبتالبه پیلنفریت نشان دادند که سرگرپهای اصلی سرگرپهای اصلی ردیابی شده در کدکان مبتالبه التهاب مثانه بدند شیع سرگرپهای 22 6 را به ترتیب %23 %/2 %/6 گزارش کردند )23(. همچنین در مطالعهای که تسط Issazadeh 2 انجام شد سرگرپ همکاران در سال از فراانی بیشتری برخردار بد )24(. همانطر که مشاهده میشد در این مطالعه نیز مشابه مطالعه ما سرگرپ فراانی بیشتری در بین سرگرپهای مردبررسی داشت. از سی دیگر همانطر که گفته شد در مطالعه حاضر د سرگرپه یا در جدایه های مردمطالعه ما شناسایی نشد. در مطالعه هیچیک از Momtaz Dormanesh 23 در سال کمترین فراانی را داشته در مطالعه در سال نیز سرگرپهای Dormanesh 23 سرگرپ 83 در هیچیک از همکارانش سیههای مردبررسی شناسایی نشد که بامطالعه ما همخانی دارد )23 (. با تجه به نتایج بهدستآمده در خصص سرگرپهای میتان گفت احتماال این د سرگرپ در بین جدایه های برخردار هستند. ملد عفنت ادراری در ایران از شیع پائینی بر اساس نتایج بهدستآمده در تحقیق حاضر سرگرپ فراانی بیشتری در بین جدایه های بیماران سرگرپ مبتالبه از جداشده از عفنت ادراری برخردار بد. شیع باالی در جدایه های ملد عفنت ادراری میتاند نتیجه ارتباط بین سرگرپها با تانایی ایجاد بیماری حضر عامل یرالنس باکتری باشد. یافتن درک ارتباط بین عامل مؤثر در بیماریزایی با سرگرپهای مختلف در آینده نهچندان در میتاند زمینهساز جایگزینی درمانهای اکلژیک محر را با درمانهای به نسبت تهاجمیتر نظیر استفاده از آنتیبیتیکها فراهم مینماید. از سی دیگر بررسی این ارتباطها میتاند فراهمکننده بینش سیعتر محققین در خصص رند بیماریزایی باکتریها از قبیل در مرحله بعد پیشگیری از آن خاهد بد. از سی دیگر استفاده از رش استراتژی سرلژی کارآمد سنتی برای مناسب PCR سرگرپهای ملد عفنت ادراری اجتناب این تسعه بنابراین باشد. از رش میتاند یک معایب میتاند سیههای رش برای 6

7 مجله میکرب شناسی پزشکی ایران سال شماره 6 بهمن اسفند 33 تشخیص بالینی مطالعات این بیماری کنترل اپیدمیلژی تعارض منافع بسیار مفید باشد. بین نیسندگان هیچگنه تعارض منافعی جد ندارد. Downloaded from ijmm.ir at 7: on Thursday ctober th 208 References. Schaechter M, Engleberg NC, Dirita VJ, Dermody TS. Schaechter's mechanisms of microbial disease. Pathophysiology of infection disease. 2 nd ed. Lippincott Williams & Wilkins; 202. p HamidFarahani R, Tajik A, Noorifard M, Keshavarz A. Antibiotic resistance pattern of E.coli isolated from urine culture in 660 Army clinical laboratory center in Tehran J Army Univ Med Sci 202; 0 (): [in Persian] 3. Wilson BA, Salyers AA, Whitt DD, Winkler ME. Bacterial pathogenesis: a molecular approach. 2 nd ed. ASM Press; 20. p Sarkar S, Ulett GC, Totsika M, Phan MD, Schembri MA. Role of Capsule and Antigen in the Virulence of Uropathogenic Escherichia coli. PloS one 204; 9(4): e Kalynych S, Yao D, Magee J, Cygler M. Structural characterization of closely related antigen lipopolysaccharide (LPS) chain length regulators. J Biol Chem 202; 287(9): Wang Q, Perepelov AV, Beutin L, Senchenkova SN, Xu Y, Shashkov AS and et al. Structural and genetic characterization of the Escherichia coli 80 antigen and identification of a UDPGlcNAc 6 dehydrogenase. Glycobiology 202; 22(0): Debroy C, Roberts E, Valadez AM, Dudley EG, Cutter CN. Detection of Shiga toxin producing Escherichia coli 26, 45, 03,, 3, 2, 45, and 57 serogroups by multiplex polymerase chain reaction of the gene of the antigen gene cluster. Foodborne Pathog Dis 20; 8(5): Liu Y, Yan X, Debroy C, Fratamico PM, Needleman DS, Li RW, Wang W, Losada L, Brinkac L, Radune D, Toro M. Escherichia coli antigen gene clusters of serogroups 62, 68, 3, 40, 42, and 63: DNA sequences and similarity between 62 and 68, and PCRbased serogrouping. Biosensors 205; 5():568. تقدیر تشکر نیسندگان این مقاله الزم میدانند بدینسیله از دانشگاه آزاد اسالمی احد برجرد تأمین جهت صمیمانه در انجام این پرژه قدردانی نمایند. امکانات همکاری 9. DebRoy C, Roberts E, Fratamico PM. Detection of antigens in Escherichia coli. Anim Health Res Rev 20; 2 (2): Momtaz H, Karimian A, Madani M, Safarpoor Dehkordi F, Ranjbar R, Sarshar M, Souod N. Uropathogenic Escherichia coli in Iran: Serogroup distributions, virulence factors and antimicrobial resistance properties. Ann Clin Microbiol Antimicrob 203; 2 (8): e Yun KW, Kim DS, Kim W, Lim IS. Molecular typing of uropathogenic Escherichia coli isolated from Korean children with urinary tract infection. Korean J Pediatr 205; 58(): MolinaLópez J, Apariciozores G, RibasAparicio RM, GavilanesParra S, ChávezBerrocal ME, HernándezCastro R, ManjarrezHernández HÁ. Drug resistance, serotypes, and phylogenetic groups among uropathogenic Escherichia coli including 25ST3 in Mexico City. J Infect Dev Ctries 20; 5(2): Li D, Liu B, Chen M, Guo D, Guo X, Liu F, Feng L, Wang L. A multiplex PCR method to detect 4 Escherichia coli serogroups associated with urinary tract infections. J Microbiol Methods 200; 82():77 4. Kulkarni R, Dhakal BK, Slechta ES, Kurtz Z, Mulvey MA, Thanassi DG. Roles of putative type II secretion and type IV pilus systems in the virulence of uropathogenic Escherichia coli. PLoS ne 2009; 4(3): e Nielubowicz GR and Harry M. Host pathogen interactions in urinary tract infection. Nat Rev Urol 200; 7 (8): Karimian A, Momtaz H, Madani M. Detection of uropathogenic Escherichia coli virulence factors in patients with urinary tract infections in Iran. Afr J Microbiol Res 202; 6(39):

8 گدرزی همکاران تعیین سرگرپه ای در سیه های Downloaded from ijmm.ir at 7: on Thursday ctober th Kudinha T, Kong F, Johnson JR, Andrew SD, Anderson P, Gilbert GL. Multiplex PCRbased reverse line blot assay for simultaneous detection of 22 virulence genes in uropathogenic Escherichia coli. Appl Environ Microbiol 202; 78(4): Asadi S, Kargar M, Solhjoo K, Najafi A, and GhorbaniDalini S. The association of virulence determinants of uropathogenic Escherichia coli with antibiotic resistance. Jundishapur J Microbiol 204; 7 (7): e9936. [in Persian] 9. Rashki A and Hussein AA. serotyping of Escherichia coli Strains isolated from Patients with Urinary Tract Infection in Southeast of Iran. Int J Enteric Pathog 204; 2(4): e Wang Q, Perepelov AV, Beutin L, Senchenkova SN, Xu Y, Shashkov AS, et al. Structural and genetic characterization of the Escherichia coli 80 antigen and identification of a UDPGlcNAc 6 dehydrogenase.glycobiolog 202; 22(0): Shweta S, Nirmaljit K, Shalini M, Preeti M, Wasim A and Charoo H. Serotyping and Antimicrobial Susceptibility Pattern of Escherichia coli Isolates from Urinary Tract Infections in Pediatric Population in a Tertiary Care Hospital. J Pathog 206; e Emamghoraishi F, Farshad S, Kalani M. Relationship between serotype and virulent genes in Escherichia coli causing urinary tract infections. Iran J Kidney Dis 20; 5(4):2347. [in Persian] 23. Dormanesh B, Safarpoor F, Hosseini S, Momtaz H, Mirnejad R, Hoseini MJ, Yahaghi E. Virulence factors and serogroups profiles of uropathogenic Escherichia coli isolated from Iranian pediatric patients. Iran Red Crescent Med J 204; 6 (2). e4627. [in Persian] 24. Issazadeh K, Naghibi SN, KhoshkholghPahlaviani MM. Drug Resistance and Serotyping of Uropathogenic Escherichia coli among Patients with Urinary Tract Infection in Rasht, Iran. Zahedan J Res Med Sci 205; 7 (6): 5. [in Persian] 8