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EVOLUTION, ECOSYSTEME, MICROBIOLOGIE, MODELISATION +,#0/6%)+27 102KH"H$.&!&.!+'"!%!H )!0'!(H$H%M71 L/OK/K/</ 6%/)P("&/!&'/# http://biomserv.univ-lyon1.fr/e2m2 INFORMATIQUE ET INFORMATION POUR LA SOCIETE +,#0/H21. +.R7.+ HJ"H% MN.12H.,- L/O/L<// P '/# IIBBB/'/#I INTERDISCIPLINAIRE SCIENCES ET SANTE +,#0/6,7::7. H,%41,H5 O$!N M<OR7,-O L/O/O//O SSP (/# IIBBB/(/#I!./()* +,#0/6!67.%Q.,' HJ)O(/!0!-!# <&!9!',$!H%< M<.,1R,- L/O/K// 6!/6P '/# IIBBB/'/#II"!'!0.1*!0.1*(! +,#0/)CE9.2 1&,!H'!9+$! 102K0Q.0T1. HJ"+'6H H!!H8 $ MN.12H.,- L/O/L</O/K B$P $!/!&'/# IIBBB/'/#I0 &

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Liste des figures...xvi Liste des tableaux...xix Introduction...2 &+ *(.&*33444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 5 &+ (31*-3!44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 /.!/////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// / %"#////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////O Partie A Espace des caractéristiques, paramètres d échelle adaptatifs et estimation non paramétrique de densité...10 &+ *(.&* 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 77 &+2!**-!30.((344444444444444444444444444444444444444 78 /!///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// / +#////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// </."$""//////////////////////////////////////////////////////////////////////////< L/,!////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// &+2!*-*).((*3!**(!*4444444444 76 /!///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// /."!'!""/////////////////////////////////////////////////////////////////////// </ %"!'!/////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////O L/.!!!"'"//////////////////////////////////////////////////////////////////K / N!"!"///////////////////////////////////////////////////////////////////////// //!"///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// // N///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// /</ %!$////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// -

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&+D "" Chapitre I INTRODUCTION GÉNÉRALE!A!!8 "$!! #" 4"$8&!"8!&5!"!8!8&&"#"!8#$"C$ " " '&/ " "$" "$"8(!8&!&8- $ &!8 &$8 ' &8 /! "$ " "!!!"-"!" &!"8& " "!"!/. "$"8 '"!! & " &8!!"@" (A @8! "( #"! ( " ("! $/% -"8 ".% 4"$*"%5"!&!'^! #".%20 4"$ 2 0$!5 A/. "$!8$#!4$U!5!!"!!!"$&4"$!"!5"!!! "!! ## / " " "$ & - $ #"! "!#(/ #$!"8V"!"$8! #&!8!!$" ## "!!!"/ $"! "! &! (A# " S! "$/,!- " #"!- "'#"!"$/!"! " #$ $" "! $ $ #" (/%!8 -! "!"8 ((&!##!8!!! '4!&5 >!?/!"!"!&$4!!"$ "58 " &@ ( "!-& "$4&_E bck<`58&!$ <

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Chapitre II DÉFINITIONS PRÉLIMINAIRES + 8! # >!? > " #?-!#$$""$/ % &8! $ ##""! "( -! ("! "/ 1-8 "$ 8! 4!"!8 "!5!! 4"!!8"("5/! "8!! (A# "! # "!8""-"$""$/! #"! "(!- '" c'!"! "$/ V "! "( S! c!"u!/,!"""$8!!#""!$! 8 "!(!! "$/*! "$! "( "$8 &!! -" 8!!8 -!8 "!&"! "!(!!!# -!&$/!'! "! &! "/ 7 "" 4>#?5/ %!#""8!!!"((Ae!(A "! 4!&5/! & (A! #"&!/!&!! $ $ $ [ 88 ] $ 4/5 8 e% " " % 4%5!&!!&! % %!"% "!(A /8&!!#

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&+D Chapitre III INTRODUCTION + 8!" &!8 "#"""!/ &(&"-""!8!! #!!!!!"'!/,- "& #! " $! &"!!>0#?!!!!&/!"""#"""'!"8 "!"&8"!#"!$"#/!#$"!-$!!-!!&!" "! "! "!!# '! "!-/ % " '! ""8! -" $"!#""! "!"/!!!"#!'!"!""!!!/!"!!-&8! " "&(/!" & @!!>?/

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-D+ "+A" +F+"" Chapitre VII ESTIMATION DE DENSITÉ PAR NOYAU LOCALEMENT ADAPTATIF,"""!-8""! "! " '! ""! "!"/,8"@"""8"!!A! " #/ &!- e " " " #!8!!- " (! $"#/,!(!((&$"&4! &!& #58 "" -" #$"/ 7! (!!!!/ 1!&!!!! " /. ##8! ((! &! &!! "!/, ((!@!$"!"(&!!"/08 &!8! $ O!, N 4$ 58!!##/,"8!!$"! "( &!8 " #!!"!" &! >&?"8!!!!!" $!!!/%! ## >#!?"! "8"@!$"!&$8"(! &!!"!$"8!!!!&! ((/, ## )$! M/!$"!( "!&(!"-"D <K

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&+2D& Chapitre VIII CONCLUSION +8!&"&!8 "#"""!/!&!!""!!" '!/! &" "" #"" "8 "!"&8"!#"!$"#/! & &! " "!!! "'$/8!&!""# '!"!-!/! & -" $"!#""! "!"/""!-8!&(!!("!!-(!""/!&"!!-&8! "!"/!&" &!!! >! " >?/!-!"d!&!>0#?#/ +!&8!!!!(#!&$ " "! '!8 & "!! " # >0 #?/ L<

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-CD+ "+A" +FF!F> Chapitre X CHOIX DU «MEAN SHIFT» + 8! -!!!!! #$>0#?/!!#!#""!#$>0#?!""!"#$#/!"!$!>0#?!!-"!!$/ & (,""!" " "$8 #!! "$ ""! "$ / $!&! "$&!-$$!!##& $&8!#"8!D,#J"/ +"$8"#$! &!!"8(!#"! 48$"8"D5/ A! #$ 4 8 "$8! $8 D5!! &"(("/%"8">&?8 " #$ &! " # 8! #" " $ & &!/!!&8 "8"#$V!-$4 '!$!8//5!&@#"/ ##! _%.27 cm`! "/. (!!$!/,!"# 4H/5!!&(!!("'!8!( &!!& &! $! 4$ 5/!!&! ""#/ L

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-CD+ "+A" +FF!F> Chapitre XIII CONCLUSION #"" >0 #?!"!! " "! "!"!! $""#/! &#!!! >0 #?/! &" @ "!(!"/!&-"!!&"">(!$? >(!$?!&"/!&"!>0#?!#$"$/!& #!-'#$40540,5!&"@/!& #""! >0 #? #! $ " "#/!&"&!"!#$>0#?8 $ >?8!!!! " +/!!-!- "! " & @!#"" ("!" #8!#""!!! $""$!$/ OL

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-&D+ "+A" +F "#HF Chapitre XV CROISSANCE DE RÉGION + 8! $!!-&!-!/!!!## &!-!! $! &" #""/! "!"$/!"&$"(!! $_:1,b.2cO`/ %! $8 $ $$! $8!$$4)$!5/,$$!!$!(!!"!"$ $! $$/,! $$!! $ /! $$! $ &!/ )30+))) ) 5)5 )" 1 % 5) &" ("! - $ 8 8!!-!"!!/!((" $L/ S>!?$!!&$/%!! K

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&+/2D& " Croissance de région Dans l espace des caractéristiques Avec des paramètres d échelle adaptatifs Avec Remise en question des germes Sans remise en question des germes Croissance d une région Croissance de «n» régions Croissance de «n» régions Croissance d une région Croissance en concurrence Croissance sans concurrence Croissance en concurrence Croissance sans concurrence )3*+G)# 1);) ) ' 1 & #; ')) ;" & 1#) ) %! $"! "$ &!" $8 #!#! "( -! "! "$a &! " #4'5"$"!-/ ",""! & &!8 $" $ " $" # 4! 5 " $/ $" #!#"!!$"/ $"!@ "!"/ 0! 8&!"&$(/#!! K<

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&+/2D-"HF Chapitre XVI PRÉSENTATION DU NOUVEAU FORMALISME + 8!!!&!#""8! " $ & "!"!-" $/ + "8 "! $ $ "!&"#/!!!#""/!!!!&!!/ ' 1! (A! "! /, (A "(/7!"!!D!$ "!"(8"A!!P D!$"(/ 1"(!{ }!!!"/!-(A!!!"(4!&!5!2 8>?"("/,""!&! $ "!! 4 -" >?5 ">?!&!4>"(!5 $ $ [ 8 8 ] $ 4,/5,!!&! % 4%*5"@""("%!!>%!4 %!!2 %!2 5/ "(!&@#! #/ "( "! "( 45/! #8 "(!&@!!"/"(!&!@! #!/ 7 " "# { ; 4 5}! "(" &#;4 5/,$#! KO

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&+/2D++ F FF"+ " Chapitre XVII APPLICATION DU FORMALISME AUX DIFFÉRENTS TYPES DE CROISSANCE DE RÉGION + 8! &! $! #""!$&"/ " N #! " ##!! $ "$&!$/$$"!! @!"-"&$$"4!!"$8$ -$58 &!&!$!&[ αa β ] 4& β > α5/,##3!!"!/ "$$J!#M!! $J!'! ( aα8 β ) 8!(!& [ α8 β ]!!"!/7(4"5 _ ` _ ` _ ` {!! 8M ( ( 8 8) )/ ( aα8 ) } 8 β 4,/L5, "(!! "!& 4!! #8!$2 5 _ ` α + β _ ` _ `!! 8M ( ( )) 88 / M 4,/5 β α %!! "$ 4$ $! 5(" " #! &$N L 8c!&$L-/"!@$!!""#!&$!$""!!)$!O/ M

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&+/2D& Chapitre XVIII CONCLUSION #"""$"(" $!/,#"" & """!"8&8"!$8!8! $"!A$"/!"("" $!- $$" & "!&!- / %! "8! '! " $! " #"" "!!!!"#/ +! &! #!- ' $ 4"!"&5!&!8!8!-"! " "!",20 &!/%!!,20 & "@"! #$ >0 #?8 &!"! $" "!"(!#$00%0/!" & 4! "$ &!- $5,2!!"!!$4!,^^5/,#""!@! "(! "!! &(_,1.2. c`! "! $ #! 4! 5$4_2.0.1cMO`8_,Q9cM`D5/ <

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-(D&,"+F Chapitre XX APPORT DE L ESPACE DES CARACTÉRISTIQUES + "!"!8 (" " " "$! $ #"/!!#!""!"(##"!!"$/$!"' ## "!! " #" " (/ +!8 "! ""/ +8!&!!!#$ $""!"!/ %! #$8!!! " #$ >0 #?8! "#$#"""!!/ & (!8! "! (! & "!/ +"@""8!!!!! $" $/ $"!" 4,2058! $ L!, ^N 4$ MO58 " &!!&"! " "!/

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&+//D++A+ " p 1 s ' p 1 s p 2 $" MSC N p 2 p 3 >4 5 p 3 Répété N fois p c p c Données Données d entrée Méthode MSMP filtrées approche «hybride» ):0+# )!!-++ ',>1 @ 7 2 + +!D @,"! >0 #? )!C!$! " (!->?4>)?5/ >'(?! #$ "!"!!_92..2c`8_+N97c`/ ( +" "$!8$J!$#!8"## #"!""@"/,#"(!#" "$("/,! "$! "!

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-(D&,"+F p 1 s p 2 p 3 p c 8 2 N Données filtrées par MSMP approche «hybride» ', $"! " >4 5 Première segmentation (dimension de l image: 2 ) Nombre d éléments minimum d une région 2 $! $ Méthode de segmentation Multidimensionnelle (CRM) Image segmentée : label de région )?0+!)! ( +"A"!! ",20!-! "!/ A!-!$/<4#/)$!<5!/.$"8 # 00% >'(?,20 4#" " "5/ )$! L " "!! A! #"'(&/ L

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-(D&,"+F Chapitre XXI APPORT DES PARAMÈTRES D ÉCHELLE ADAPTATIFS + 8! &! " #! #$$""$/ %! #$8!!!&"(! >0 #? # 405/ $ (!! ( " # " " "!8 $! '"!/!&!&"!&" "!!8 "! """#/ %!$"8!"!"$ $&4,25&&&/##!! "$ "$." % 4.%5 # "$/! "!- (!! $" "#!#$$""$/ <

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-(D&,"+F Échelle optimale (plug in) λ Moyenne géométrique des - A priori sur le système d acquisition 2 "! ' ( ) 8 m # 8 ' 8 ' 8 Matrices d échelles adaptatives Estimation pilote p 1 s s (" p 2 r 8-8 )$!# # "! 4!S5 >4 5 N r Données d entrée Méthode de filtrage adaptative (MSA A+S) Données filtrées )$!L< "0[/A!8" &"0/ ##' A!"!! 4!!$!"!!5/!"!""4"!5 0!!$4$5/,"""!"!/.!8!!#"' 0!"##$! (!-4 5/%!"8!!!" m & # 4 5 (!" ' m!""!4+/<5 4 λ"'$"!- 5/ m # 4 5 m ' ' 8 m ' I > m I (' /4 5) 4+/<5 8 m λ 4 5 #,"#$!&!!-"$!!(! $"#(A""!_92..2c(`8_92..2c`/ I <

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#A ANNEXE A : SIMULATIONS D IMAGES ULTRASONORES!!&!&8!&!## "$&"!!/$"!!$ )& 6 4 IIBBB///!/CI##IAAI#I8 & ""! IIBBB///!/CI##IAAI#I/"5/ " 8! #V" "$ 4$"!5 $"! 4"! #V"58""!$2)42)!5!/ Paramètres de de la sonde Géométrie du fantôme et caractéristiques acoustiques des milieux 5 Géométrie de l acquisition Lignes RF simulées )6:+G) D! - "8!!( 8 " (##"$!"!/ - "!#&!4#/)$!L5" )!&

#A #!$ # \0QS #!!!! 4$ #15 #! " # 0 \<80QS/ N$!!"! \L"Ia $!! \I# 0 / $!"$$!!/ Q!!" ""/ "("!!! M"/ "("# L"/.""4>M#?5 8""/ )@" #@Q$(! "("#/ )!!!! ##-O""/ ) S#<"""" ""/ )" /!""@"!/ )6?+,