Προκαταρτική ταυτοποίηση Συμβατικές μέθοδοι. Μαρία Φουστούκου



Σχετικά έγγραφα
Αλγόριθμοι για την ταυτοποίηση των αερόβιων Gram-θετικών κόκκων

Αλγόριθμοι για την ταυτοποίηση των αερόβιων Gram-θετικών κόκκων

ΙΑΤΡΙΚΗ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΙΙ

Ταυτοποίηση Gram-αρνητικών αναεροβίων βακτηρίων

Ταυτοποίηση Gram-αρνητικών αναεροβίων βακτηρίων

BD Mac Conkey II Agar / Columbia CNA Agar with 5% Sheep Blood (Biplate)

ΔΗΜΟΚΡΙΤΕΙΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΘΡΑΚΗΣ ΤΜΗΜΑ ΙΑΤΡΙΚΗΣ

Περιγραφή και βασικός χειρισµός του οπτικού µικροσκοπίου.

ΙΑΤΡΙΚΗ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΙΙ

Καλλιέργεια και τυποποίηση των μικροβίων. Ιωάννης Γ. Ρούτσιας, MD, PhD Επίκουρος καθηγητής Ανοσολογίας/Μικροβιολογίας

Καλλιεργητικά υλικά και επιλογή τους στο Κλινικό Εργαστήριο. Τρόπος εμβολιασμού κλινικών δειγμάτων Ανάγνωση καλλιεργειών

BD CLED Agar (Bevis)

BD CHROMagar Orientation Medium

Ταυτοποίηση βακτηρίων: συμβατικές και αυτοματοποιημένες μέθοδοι.

ΛΟΙΜΩΞΕΙΣ ΣΤΟ ΔΙΑΒΗΤΙΚΟ ΠΟΔΙ Επιδημιολογία των παθογόνων στελεχών στην Ελλάδα

Καλλιεργητικά υλικά και επιλογή τους στο Κλινικό Εργαστήριο. Η ανάπτυξη της βακτηριακής καλλιέργειας.

BD MacConkey II Agar / Columbia CNA Agar Improved II with 5% Sheep Blood (Biplate)

Αλγόριθμοι ταυτοποίησης αεροβίων Gram (-) βακτηρίων

BD Triple Sugar Iron Agar (TSI Agar)

BD CHROMagar Orientation Medium / Columbia CNA Agar (Biplate)

Είδος μικροοργανισμού και αληθής βακτηριαιμία

ISO/TS :2012 Kαταμέτρηση Salmonella spp μέθοδος mini MPN

Ταυτοποίηση βακτηρίων: συμβατικές και αυτοματοποιημένες μέθοδοι. Αναστασία Πάγκαλη Βιοπαθολόγος Κλινικός Μικροβιολόγος

ΙΑΤΡΙΚΗ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΙΙ

ΜΕΘΟΔΟΙ ΑΝΙΧΝΕΥΣΗΣ ΚΑΙ ΑΡΙΘΜΗΣΗΣ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΩΝ ΠΟΥ ΒΡΙΣΚΟΝΤΑΙ ΣΕ ΧΑΜΗΛΟ ΠΛΗΘΥΣΜΟ ΣΤΑ ΤΡΟΦΙΜΑ

ΑΝΑΘΕΩΡΗΣΗ ΤΗΣ EN ISO 6579

2 Ταινίες μέτρησης σακχάρου στο αίμα σε σακχαρόμετρο (ΣΕ ΚΟΥΤΙΑ) ΤΑΙΝΙΕΣ

Ταυτοποίηση βακτηρίων: συμβατικές και αυτοματοποιημένες μέθοδοι

ΚΕΦΑΛΑΙΟ 8. Μεταβολισμός των Βακτηρίων

ΛΗΨΗ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΩΝ ΚΑΙ ΑΞΙΟΛΟΓΗΣΗ ΤΩΝ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΩΝ

ΟΝΟΜΑΤΟΛΟΓΙΑ ΚΑΙ ΤΑΞΙΝΟΜΗΣΗ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ

ΟΙ ΠΡΩΤΕΣ ΕΜΠΕΙΡΙΕΣ ΤΟΥ ΤΜΗΜΑΤΟΣ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΩΝ ΤΟΥ ΝΟΣΟΚΟΜΕΙΟΥ ΛΑΜΙΑΣ

Mικροβιολογία του νερού Χαρακτηριστικά βακτηρίων. Μ. ΑΡΒΑΝΙΤΙΔΟΥ-ΒΑΓΙΩΝΑ Καθηγήτρια Ιατρικής Σχολής, ΑΠΘ

ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΤΡΟΦΙΜΩΝ

Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών. Χρώση Gram. Δοκιμή καταλάσης. Δοκιμή οξειδάσης

Φ. ΚΟΛΟΝΙΤΣΙΟΥ Αν. Καθηγήτρια, Τμήμα Ιατρικής Πανεπιστήμιο Πατρών

συγκέντρωσης αντιμυκητιακών για τον έλεγχο αντοχής των μυκήτων σε αντιμυκητιακά και

Αλγόριθμοι ταυτοποίησης αεροβίων Gram (-) βακτηρίων

Τα παθογόνα μικρόβια στο ιαβητικό πόδι σε ασθενείς που παρακολουθούνται στο ιατρείο ιαβητικού ποδιού και θεραπεύονται εκτός νοσοκομείου.

Φ5 1/ 9 Κωδικός ΥΠΕ ΑΝΑΡΤΗΤΕΟ ΣΤΟ ΔΙΑΔΙΚΤΥΟ ΓΕΝΙΚΟ ΝΟΣΟΚΟΜΕΙΟ ΛΑΜΙΑΣ

BD BBL TM CHROMagar TM CPE

Written by Δρ Δημήτριος Ν. Γκέλης, Ιατρός, Οδοντίατρος, Ωτορινολαρυγγολόγος, -

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

Aνίχνευση του στρεπτοκόκκου ομάδας Β σε έγκυες γυναίκες: Καλλιέργεια, ή PCR;

Τίτλος Μαθήματος: Γενική Μικροβιολογία. Ενότητα: ΚΑΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ. Διδάσκων: Καθηγητής Ιωάννης Σαββαΐδης. Τμήμα: Χημείας

BD CLED Agar / MacConkey II Agar (Biplate)

ΠΡΟΣ: Το Ψυχιατρικό Νοσοκομείο Αττικής έχοντας υπόψη:

BD Modified CNA Agar BD Modified CNA Agar with Crystal Violet

Επιμέλεια : Dr Ιωάννης Δετοράκης

ΠΕΡΙΛΗΨΗ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΩΝ ΤΟΥ ΠΡΟΪΟΝΤΟΣ PRICEFIL. Κάθε επικαλυμμένο με λεπτό υμένιο δισκίο περιέχει Cefprozil 500mg/Tab.

Εντεροβακτηριοειδή. Salmonella-Shigella

BD DCLS Agar, Modified / Hektoen Enteric Agar (Biplate)

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

3. ΑΝΤΙΔΡΑΣΤΗΡΙΑ Το VRESelect αρ. καταλόγου περιέχει 20 πλάκες ανά συσκευασία.

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Εντεροβακτηριοειδή. Salmonella-Shigella

Εργαστηριακές Δοκιμασίες που πραγματοποιούνται στο Π.Ε.Δ.Υ Κρήτης.

Εργαστηριακή Άσκηση 1 ΠΑΡΑΣΚΕΥΗ ΚΑΙ ΑΠΟΣΤΕΙΡΩΣΗ ΘΡΕΠΤΙΚΩΝ ΜΕΣΩΝ

ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ Ι) ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΗ. της. Συνέπεια βακτηρίων αύξησή τους Η. της. αναπαραγωγής είναι η πληθυσμιακή. απλή. διαίρεση διχοτόμηση.

ΚΕΦΑΛΑΙΟ IV ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ ΚΕΦΑΛΑΙΟ IV 1 V ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ

ΙΑΤΡΙΚΗ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΙΙ

Προσδιορισμός Μικροβιακής Αντοχής Μέθοδοs Διάχυσης με Δίσκους ( Disk Diffusion Method)

ΕΓΚΕΦΑΛΙΚΑ ΑΠΟΣΤΗΜΑΤΑ. Μαρία Ορφανίδου Επιμελήτρια Β Μικροβιολογικό Εργαστήριο Γ.Ν.Α. «Γ. Γεννηματάς»

ΣΥΣΤΗΜΑΤΑ ΑΝΑΕΡΟΒΙΑΣ ΕΠΩΑΣΗΣ ΚΑΙ ΘΡΕΠΤΙΚΑ ΥΛΙΚΑ. Ορφανίδου Μαρία Επιμελήτρια Β Βιοπαθολόγος Γ.Ν.Α. «Γ. Γεννηματάς»

ΠΕΡΙΛΗΨΗ TΩΝ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΩΝ ΤΟΥ ΠΡΟΙΟΝΤΟΣ. Ενα g ρινικής αλοιφής περιέχει 21,5mg Mupirocin calcium που αντιστοιχεί σε 20mg (2% w/w) Mupirocin.

3Η ΔΙΑΒΟΥΛΕΥΣΗ ΧΩΡΙΣ ΣΥΝΟΔΟ ΕΞΟΠΛΙΣΜΟ (ΚΑΛΑΜΑΤΑ) Posted by ΓΡΑΦΕΙΟ ΠΡΟΜΗΘΕΙΩΝ - 18 Apr :20

ονάκια: gram (-), ζυµωτικά βακτηρίδια ΌΧΙ ΌΛΑ ΠΑΘΟΓΌΝΑ ΓΙΑ ΤΟΝ ΑΝΘΡΩΠΟ Vibrio cholerae

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

BD BBL GO Slide. Ο ΗΓΙΕΣ ΧΡΗΣΗΣ ΕΤΟΙΜΑ ΠΡΟΣ ΧΡΗΣΗ ΥΛΙΚΑ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΑΣ ΣΕ ΕΜΒΑΠΤΙΖΟΜΕΝΕΣ ΑΝΤΙΚΕΙΜΕΝΟΦΟΡΟΥΣ ΠΛΑΚΕΣ DA Αναθ.

ΠΕΡΙΛΗΨΗ ΤΩΝ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΩΝ ΤΟΥ ΠΡΟΪΟΝΤΟΣ

Βασικές αρχές Ιατρικής Μικροβιολογίας

16PROC

Δ. Μείωση του αριθμού των μικροοργανισμών 4. Να αντιστοιχίσετε τα συστατικά της στήλης Ι με το ρόλο τους στη στήλη ΙΙ

Gram-αρνητικά αναερόβια Bacteroides Prevotella - Fusobacterium

Φροντιστηριακό μάθημα Αναερόβια μικρόβια και αναερόβιες λοιμώξεις

ΕΛΛΗΝΙΚΗ ΔΗΜΟΚΡΑΤΙΑ Ιωάννινα: 30/06 /2017

ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΑ ΔΙΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΩΝ ΔΟΚΙΜΩΝ ΑΝΙΧΝΕΥΣΗΣ ΣΑΛΜΟΝΕΛΛΩΝ ANNEX D ISO 6579:2002 PT 0088 SALMONELLA IN POULTRY VLA / VETQAS

ΕΛΛΗΝΙΚΗ ΔΗΜΟΚΡΑΤΙΑ Ιωάννινα: 19/01 /2018

ΚΟΛΟΒΑΚΤΗΡΙΟΕΙΔΗ ΕΝΤΕΡΙΚΗΣ ΠΡΟΕΛΕΥΣΗΣ ΚΟΛΟΒΑΚΤΗΡΙΟΕΙΔΗ ESCHERICHIA COLI

Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών. Εργαστήριο: Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

Αλγόριθμοι ταυτοποίησης αεροβίων Gram (-) βακτηρίων

Γ.Ν.Α «Ο ΕΥΑΓΓΕΛΙΣΜΟΣ- ΟΦΘΑΛΜΙΑΤΡΕΙΟ ΑΘΗΝΩΝ ΠΟΛΥΚΛΙΝΙΚΗ» ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΚΟΥ ΤΜΗΜΑΤΟΣ - ΒΙΟΙΑΤΡΙΚΗΣ ΥΠΗΡΕΣΙΑΣ. ΘΕΟΔΩΡΟ ΝΙΑΡΧΑΚΟ (Διευθυντή Πωλήσεων)

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

ΕΛΛΗΝΙΚΗ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΚΗ ΕΤΑΙΡΕΙΑ ΒΑΚΤΗΡΙΑΙΜΙΑ ΕΝΔΟΚΑΡΔΙΤΙΔΑ

BD Chocolate Agar with IsoVitaleX and Bacitracin BD Brain Heart Infusion Agar with 5% Horse Blood and Bacitracin

Προαγωγή Υγείας Πρόληψη Νόσου Ιατρική κοινότητας

Διακήρυξη 93/ Οι ενδιαφερόμενοι να υποβάλουν τις προσφορές τους στο Γραφείο Προμηθειών του 401 ΓΣΝΑ.

Το Εργαστήριο μπορεί να συστήσει τον τρόπο λήψης, καθώς και τα κατάλληλα υλικά λήψης και μεταφοράς των δειγμάτων.

ΣΗΜΕΙΩΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΣΜΕΝΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑΣ. Μαντώ Κυριακού

BD BBL UROTUBE 2s BBL UROTUBE BBL UROTUBE M BBL UROTUBE E BBL UROTUBE E. coli BBL UROTUBE SXT

Προκαρυωτικά κύτταρα: Βακτήρια, Μύκητες Ευκαριωτικά κύτταρα: Μύκητες, Παράσιτα (ιοί) Παθογόνοι μικροοργανισμοί: Μύκητες, βακτήρια, παράσιτα, ιοί

Εισαγωγή στις Λοιμώξεις. Γ. Λ. Δαΐκος Α Παθολογική Κλινική

ΙΑΤΡΙΚΗ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΙΙ

Δομή του Προκαρυωτικού κυττάρου: (κεφάλαιο 4 από το βιβλίο «Εισαγωγή στην Μικροβιολογία)

Εσωτερικός και Εξωτερικός Ποιοτικός έλεγχος αντιβιογράμματος. Μάμαλη Βασιλική Επιμ. Β ΕΣΥ «Τζάνειο» Νοσ. Πειραιά

Γενικές αρχές απομόνωσης και ταυτοποίησης αναερόβιων μικροβίων

Αρχές αντιμετώπισης των τραυμάτων από δήγμα. Μπασδάνη Λένα

Ουρολοιμώξεις. Μήνα Ψυχογυιού Επικ.Καθ. Παθολογίας Λοιμώξεων Α Παθολογική Κλινική

DIAGNOSTIK NORD. STR-A-K-20 Test of Group A Streptococcal Antigen

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΑΣΚΗΣΗ 3 Η ΜΚΡΟΒΙΟΛΟΠΚΟΣ ΕΛΕΓΧΟΣ ΝΕΡΟΥ

Transcript:

Προκαταρτική ταυτοποίηση Συμβατικές μέθοδοι Μαρία Φουστούκου

Ταξινόμηση, ονοματολογία, ταυτοποίηση μικροβίων Ταξινόμηση είναι η κατάταξη των μικροβίων σε Οικογένειες και Γένη Ονοματολογία είναι μέσο επικοινωνίας. Τα μικρόβια έχουν δύο ονόματα: το 1 ο δηλώνει το γένος, το 2 ο το είδος π.χ.staphylococcus aureus Ταυτοποίηση είναι η χρήση των κριτηρίων ταξινόμησης για να ξεχωρίσουμε κάποιους μικροοργανισμούς από κάποιους άλλους.

Ταυτοποίηση Καθαρή καλλιέργεια Μορφολογία αποικίας και Gram χρώση προκαταρτική ταυτοποίηση Βιοχημικές, αντιγονικές ιδιότητες, χαρακτηριστικά ανάπτυξης 2 ονόματα κλινικούς σκοπούς Μοlecular and genetic characteristic G+C, DNA homology, thermal stability επιδημιολογικούς και δικαστικούς σκοπούς

Gram(+) μικρόβια Gram(+) κόκκοι καταλάση + καταλάση - Gram(+) βακτηρίδια

Καταλάση (+) Gram (+) κόκκοι Γένη : Staphylococcus Micrococcus Stomatoccus Rothia Planococcus

Καταλάση (+) Gram (+) κόκκοι Αποικίες κίτρινες, ή λευκές κοκκιώδεις στερεά κολλημένες στο άγαρ. Δεν τις ελέγχουμε. Διαφορετικά: Slide Co + Latex Staph + Slide Co- έλεγχος ευαισθησίας σε δίσκο Bacit 10 mm Latex Staph- Poly B<10 mm Poly B 10 mm Rothia mucilaginosa Micrococcus group H.D.Isenberg, Clinical Microbiology Procedures Handbook 2 nd ed., 2004

Bacitacin 0.04-U δίσκος ταυτοποίησης Δοκιμή ευαισθησίας στη Bacitracin χρησιμοποιείται προκαταρτική ταυτοποίηση του Streptococcus pyogenes διαχωρισμό των Staphylococci από Rothia mucilaginosus (Stomatococcus m.) και Micrococcus Διαχωρισμό των Pen=E Micrococcus και Rothia από τους Pen=A κοαγκουλάση αρνητικούς σταφυλοκόκκους

Bacitracin 0.04 U (συνέχεια) Ελεγχος σε ΒΑ (αιματούχο) ή ΜΗάγαρ Ζώνη αναστολής 6mm Ζώνη αναστολής 10mm Ζώνη αναστολής 7-10mm Streptococcus pyogenes =E Streptococcus agalactiae =A Αντοχή Coagulase negative staphylococci = A Rothia, Micrococcus= E QC S.Pyogenes 12 S.aureus: 6 Ευαισθησία Επανάληψη

Σταφυλόκοκκοι Κοαγκουλάση θετικοί Staphylococcus aureus, S. intermedius Κοαγκουλάση αρνητικοί Staphylococcus epidermidis, S. warneri, S. haemolyticus, S. saprophyticus, S.hyicus Κατά την ταυτοποίηση των Σταφυλοκόκκων εκτός από τη μορφολογία των αποικιών και τη μικροσκοπική εικόνα (Gram) λαμβάνονται υπ όψη το ιστορικό του ασθενή και η προέλευση του δείγματος

Καταλάση (+), Gram (+) κόκκοι εξετάσεις,αντιδραστήρια Καταλάση: 3% Η 2 Ο 2 Κοαγκουλάση ελεύθερη: ελέγχεται σε σωληνάριο (μέθοδος αναφοράς) Κοαγκουλάση συνδεδεμένη: συγκόλληση σε πλάκα Ορνιθίνης αποκαρβοξυλίωση Πυρρολιδονυλ-β-ναφθυλαμίνη (ΠΥΡ) Δίσκοι ταυτοποίησης: polymyxin Β (300U), novobiocin (5 g), bacitracin (0.04U), vancomycin

Καταλάση (+), Gram (+) κόκκοι Σταφυλόκοκκοι-Κοαγκουλάση Κοαγκουλάση ελεύθερη: ελέγχεται σε σωληνάριο με πλάσμα κουνελιού Κοαγκουλάση συνδεδεμένη ή παράγων θρόμβου ή clumbing factor (C.F.) ελέγχεται σε πλάκα: Συγκόλληση σε πλάκα: α) πλάσμα κουνελιού β) εμπορικά κιτ latex Staph (C.F. + Πρωτεϊνη Α + αντιγόνα ελύτρου)

Σχόλια για κοαγκουλάση Κοαγκουλάση σε πλάκα Δεν ελέγχουμε αποικίες που αναπτύχθηκαν σε εκλεκτικά θρεπτικά υλικά (π.χ Chapman, MacConkey ) γιατί τα στελέχη αυτοσυγκολλόνται και το αποτέλεσμα είναι ψευδώς θετικό ή ψευδώς αρνητικό. Διαβάζουμε τα ένθετα των εμπορικών kits (latex Staph) γιαταψευδώςθετικάήψευδώςαρνητικά αποτελέσματα. Q.C: 1) S.aureus, 2) S. epidermidis

Καταλάση (+), Gram (+) κόκκοι Σταφυλόκοκκοι Κοαγκουλάση (+) ή latex Staph. (+) επιπολής λοιμώξεις εκτός τις μη αιμολυτικές αποικίες των ούρων Διεισδυτικές ή και μη αιμολυτικές αποικίες στα ούρα κοαγκουλάση σε σωληνάριο (+) Poly Β<10mm Poly B 10mm S.aureus S. intermedius H.D.Isenberg sec.ed.

Καταλάση (+) gram (+) κόκκoι κοαγκουλάση(-) Σοβαρές διεισδυτικές λοιμώξεις Κοαγκουλάση (-) ή latex Staph (-) Κοαγκουλάση σε σωληνάριο (-) Bacit = A (προαιρετικό) Bacit 10mm PYR(-) ή PYR(+) &/ή ornithine ( ) ή Poly B 10mm CoNS PYR (+) &/ή ornithine (+) ή Poly B < 10mm S. lugdunensis Micrococcus Rothia H.D.Isenberg, Clinical Microbiology Procedures Handbook 2 nd ed., 2004

Καταλάση (+) gram (+) κόκκoι κοαγκουλάση(-) Επιπολής λοιμώξεις Κοαγκουλάση σε πλάκα (-) ή latex Staph (-) Κοαγκουλάση σε σωληνάριο (-) Επιπολής λοιμώξεις ούρα: έλεγχος NOVO σε MH CoNS sos έλεγχος NOVO μόνο για ταυτοποίηση Co(-) στα ούρα. ΝΟVΟ σεαιματούχοaντοχή 12 mm >16mm CoNS 16mm S. saprophyticus H.D.Isenberg, Clinical Microbiology Procedures Handbook 2 nd ed., 2004

Καταλάση (-) Gram (+) κόκκοι Γένη: Streptococcus Enterococcus Aerococcus, Gemella, Lactococcus, Leuconostoc, Pediococcus - σπάνια παθογόνα για τον άνθρωπο

Καταλάση (-) Gram (+) κόκκοι Streptococcus Γένος: Streptococcus S. pyogenes ( group A ) S. agalactiae ( group B [ GBS] ) S. dysgalactiae (group C& G) S. pneumoniae S. anginosus group, S. mitis group, S. salivarius group, S. mutans group, S. bovis group = Viridans streptococcal groups

Στρεπτόκοκκοι Tαξινόμηση και ιδιότητες (I) Ταξινόμηση σύμφωνα με την αιμόλυση στο αιματούχο άγαρ: αλφα-ατελής, βήτα-πλήρης, γάμμα-χωρίς αιμόλυση σύμφωνα με τις ορολογικές κατά Lancefield ομάδες A-H,K-V, όμως δεν έχουν όλοι οι στρεπτόκοκκοι το ειδικό αντιγόνο της ομάδας στο κυτταρικό τους τοίχωμα

Στρεπτόκοκκοι Tαξινόμηση και ιδιότητες (II) Α S.pyogenes bacitracin β-αιμόλυση B S.agalactiae CAMP β-αιμόλυση C S.aginosus D S.bovis β, α α, γ - S.pneumoniae optochin + α - S.salivarius optochin - α

Streptococcus pneumoniae Gram + κόκκος, λογχοειδής, σε ζεύγη (διπλόκοκκος) ή κοντές αλυσίδες

Πνευμονιόκοκκος ή πρασινίζων Στρεπτόκοκκος? Αποικίες του πνευμονιοκόκκου σε αιματούχο και σοκολατόχρωμο είναι μικρές, γκριζωπές, βλεννώδεις και περιβάλλονται από πράσινη ζώνη αλφααιμόλυσης. Η ανάπτυξή του ευνοείται από την παρουσία CO 2 5-10 %

Πνευμονιόκοκκος ή πρασινίζων Στρεπτόκοκκος? Ταυτοποίηση Streptococcus pneumoniae Οι αποικίες των πνευμονιοκόκκων και των α- αιμολυτικών πρασινιζόντων στρεπτοκόκκων όταν είναι νεαρές μοιάζουν. Mετά 24-48 ώρες το κέντρο της αποικίας των πνευμονιοκόκκων κατεβαίνει, σχηματίζοντα «πιατάκια», ενώ των πρασινιζόντων όχι (παραμένουν επηρμένες) Οπτοχίνη: S. pneumoniae=ε, viridans strep.=a ιαλυτότητα στη χολή: S.pneumoniae=Ε, viridans.strep =Α

Πνευμονιόκοκκος: ο μοναδικός στρεπτόκοκκος ευαίσθητος στην οπτοχίνη

Δίσκος Οπτοχίνης διαμέτρου 6mm και περιεκτικότητας 5 mg Καλλιεργούμε την αποικία σε αιματούχο τοποθετούμε δίσκο Οπτοχίνης Επώαση τρυβλίων: σε CO 2 5% / 35 o C/ 18-24 ώρες Αξιολόγηση αποτελεσμάτων Ζώνη αναστολής 14 mm: πνευμονιόκοκκος Καμία ζώνη αναστολής: πρασινίζοντες στρεπτόκοκκοι Ζώνη-αναστολής 9-13 mm: έλεγχος διαλυτότητας στη χολή.

10% bile salts

Διαύγαση S. pneumoniae Θολερότητα ΌΧΙ S. pneumoniae Αλγόριθμος ταυτοποίησης S. pneumoniae σε δείγματα από στείρες περιοχές (αίμα, ΕΝΥ) Εμβολιασμός σε αιματούχο και/ή σοκολατόχρωμο Αποικίες μικρές,γκριζωπές, υδαρείς, περιβαλόμενες από πράσινηζώνηα-αιμόλυσης Χρώση Gram Gram (+) διπλόκοκκοι ή Gram (+) κόκκοι σε αλυσίδες Δοκιμή ευαισθησίας στην οπτοχίνη (δίσκος 6mm,5μg) α-αιμολ.στελ. Opt 14 mm α-αιμολ.στελ. Opt 9-13mm S. pneumoniae Δοκιμασία διαλυτότητας στη χολή α-αιμολ.στελ. Opt 8mm Viridans strep Οpt = A S.pn.= αρν

Gram (-) Μικρόβια Τα Gram-αρνητικά μικρόβια είναι μία ετερογενής ομάδα που περιλαμβάνει πολλές οικογένειες, γένη και είδη πολλά από τα οποία προκαλούν σοβαρές λοιμώξεις και ενδοτοξικό σοκ. Η ταχεία και ακριβής ταυτοποίηση των Gram (-) βακτηριδίων και Gram ( ) διπλοκόκκων παρέχει έγκαιρη και σωστή έναρξη της αντιμικροβιακής αγωγής. Gram ( ) cocci Gram ( ) rods

Ταυτοποίηση Gram-αρνητικών μικροβίων Αντιδραστήρια I 1. Καταλάση 3 και 30% 2. Ινδόλη (spot, Kovac s, Ehrlich s) 3. Οξειδάση 4. Polymymixin B (300U) ή colistin 10mg & penicillin 10U 5. MH agar 6. Butyrate test (spot test Remel )

Ταυτοποίηση Gram-αρνητικών μικροβίων Αντιδραστήρια (ιι) 7. Aminolevulininic acid (ALA) 8. Pyrrolidonyl-b- naphthylamide (PYR) 9. Triple sugar iron agar (TSI) ή Kligler s iron agar (KIA) 10. Ταχεία μέθοδος ουρίας 11. Υλικό κινητικότητας 12. Kit ταυτοποίησης Neisseria 13. Kit(s) enteric και αζυμωτικών και άλλων απαιτητικών βακτηριδίων 14. Δίσκοι 0/129 μg (δ.δ.aeromonas,vibrio,plesiomonas)

Καλλιέργεια Gram-αρνητικών μικροβίων Κοινά θρεπτικά υλικά: Αιματούχο (ΒΑ) Σοκολατόχρωμο (CHOC) Εκλεκτικά διαφορο-διαχωριστικά υλικά: MacConkey SS EMB

1. Καλλιέργεια δείγματος από στείρες περιοχές (αίμα, ΕΝΥ, αρθρικό κ.λ.π) 1 η περίπτωση Αιματούχο: ανάπτυξη Σοκολατόχρωμο: ανάπτυξη MacConkey: καμία ανάπτυξη 2 η περίπτωση Ανάπτυξη μόνο στο σοκολατόχρωμο 3 η περίπτωση Ανάπτυξη και στα τρία υλικά

1 η και 2 η περίπτωση Αιματούχο (ΒΑ) +, Σοκ.+, MacConkey Μορφολογία της αποικίας Gram-χρώση Gram αρνητικός κόκκος, ή Gram αρνητικό βακτηρίδιο Οξειδάση από το Αιμ. ήτοσοκ.* Καταλάση test * Για να αποφύγουμε την λάθος ταυτοποίηση η εξέταση δεν παραλείπεται. Εξαιρούνταιοιφανεράερπύζουσες και οι δορυφορικές αποικίες.

Ταυτοποίηση Gram-αρνητικών μικροβίων περιπτώσεις 1,2 Αξιολόγηση ανάπτυξης σε ΜacConkey (Ι) MaC ( ) Gram απο αιματούχο ή σοκολατόχρωμο Βακτηρίδιο ή κοκκοβακτηρίδιο MaC (+) Οξειδάση διπλόκοκκοι Ανάπτυξη-/+ σε αιματ.αεροβίως +5% CO2 Neisseria Moraxella catarrhalis ΒΑ - ΒΑ + Haemophilus Brucella Pasteurella Κάποια αζυμωτικά H.D.Isenberg, Clinical Microbiology Procedures Handbook 2 nd ed., 2004

Gram-αρνητικοί διπλόκοκκοι Οξειδάση θετικοί Αιματούχο αποικίες «μετακινούμενες» Butyrate test + Moraxella catarrhalis Αποικίες κίτρινες: σαπροφυτικές ναϊσσέρειες Kits: rapid ID NH Neisseria Screen + Αποικίες: οχι Μ. catarrhalis οχι κίτρινες ο χ καταλάση ι ο - χ Gram(-) κοκκοβακτηρίδια Neisseria meningitidis N. lactamica, N. gonorrhoeae Σαπροφυτικές ναϊσσέρειες Οροομάδες Α,Β,C, Y, W-135

Σχόλια για τους Gram(-) διπλόκοκκους Όλοι οι αερόβιοι Gram ( ) διπλόκοκκοι είναι οξειδάση θετικοί. Σε περίπτωση αμφιβολίας: κόκκος ή κοκκοβακτηρίδιο? sos Κάνουμε ανακαλλιέργεια σε άγαρ με δίσκο πενικιλλίνης 10U Κάνουμε Gram χρώση γύρω από τον δίσκο. Neisseria & Moraxella catarrhalis παραμένουν κόκκοι ενώ Μoraxella spp & Αcinetobacter είναι βακτηρίδια με νηματοειδείς μορφές.

3 η περίπτωση Αιμ (+), Σοκ (+), MacConkey (+) Οξειδάση Ινδόλη * α) ινδόλη spot: για αρνητικά βακτηρίδια που αναπτύσσονται σε Β.Α β) ινδόλη με Kovacs: για μικρόβια που αναπτύσσονται φτωχά σε MAC γ) ινδόλη σε σωληνάριο με Ehrlich s για κίτρινες αποικίες * για να αποφύγουμε την λάθος ταυτοποίηση δεν παραλείπουμε την εξέταση

Ταυτοποίηση Gram-Αρνητικών Μικροβίων ΙΙ 3 η περίπτωση [Αιμ(+),Σοκ (+), ΜaC (+)] Ανάπτυξη και σε MacConkey (+) Οξειδάση αρνητική Enterobacteriaceae Μερικά αζυμωτικά βακτηρίδια θετική Aeromonas Plesiomonas Μερικά Vibrios θετική ινδόλη αρνητική Χρωστική? Ελεγx. TSI /KIA

Ταξινόμηση Εντεροβακτηριακών (Ι) Γένη : Salmonella, Shigella, Escherichia, Yersinia, Klebsiella, Enterobacter, Citrobacter, Serratia, Hafnia, Proteus, Providensia, Plesiomonas (P. shigelloides)

Ταυτοποίηση Εντεροβακτηριακών (Ι) κοινά χαρακτηριστικά 1. όλα είναι δυνητικά αναερόβια 2. όλα ζυμώνουν την γλυκόζη * 3. όλα είναι οξειδάση αρνητικά ** 4. ανάγουν τα νιτρικά σε νιτρώδη Μedical Microbiology & Immunology 6 th ed., 2000 **εκτός Plesiomonas shigelloides 99% & Serratia fecaria 8% * P. shigeloides. 80% Manual of Clinical Microbiology 9 th ed., 2007

Ταυτοποίηση Εντεροβακτηριακών (Ι) κοινά χαρακτηριστικά Αυτές οι 4(?)αντιδράσεις διαχωρίζουν τα Εντεροβακτηριακά από τα αζυμωτικά, το σημαντικότερο των οποίων είναι η P. aeruginosa. Η P. aeruginosa δεν ζυμώνει την γλυκόζη, δεν ανάγει τα νιτρικά, είναι οξειδάση-θετική, και σε αντίθεση με τα εντεροβακτηριακά είναι αυστηρά αερόβια.

Θρεπτικά υλικά MacConkey, EMB Εκλεκτικά, διαφορο-διαχωριστικά υλικά Η διαφορο-διαχωριστική τους ικανότητα στηρίζεται στη ζύμωση της λακτόζης ηοποία είναι το σημαντικότερο μεταβολικό κριτήριο που χρησιμοποιείται στην ταυτοποίηση των εντεροβακτηριακών. Η εκλεκτική τους δράση στηρίζεται στην αναστολή ανάπτυξης των Gram(+) μικροβίων από τα χολικά άλατα και τις χρωστικές που περιέχουν.

Ταυτοποίηση Εντεροβακτηριακών (ΙΙ) ΜacConkey agar: ζύμωση λακτόζης Ζύμωση Ναι αποικίες κόκκινες / ροζ Όχι αποικίες άχρωμες Βραδέως ζυμούντα Γένη Escherichia ( lactose +), / Klebsiella, Enterobacter Shiggella, Salmonella, Escherichia (lactose -), Yersinia, Proteus, Providencia, Morganella Serratia, Citrobacter Medical microbiology & Immunology 6th ed., 2000

Μορφολογία αποικίας των πλέον κοινών εντεροβακτηριακών σε MacConcey & αιματούχο Γένος, είδος MacConkey Αιματούχο. Salmonella, Shigella άχρωμες, επίπεδες λείες 2-3mm E.coli lactose (+) κόκκινες, ιζήματα χολής λείες 2-3mm E. coli lactose (-) άχρωμες λείες 2-3mm Yersinia enterocolitica άχρωμες <1mm λείες<1mm Klebsiella pneumoniae ρόζ, βλεννώδεις, 3-4μμ βλεννώδεις 3-4mm Enterobacter ρόζ βλεν. όχι όσο Klebs. λείες 3-4mm P. vulgaris, P. mirabilis άχρωμες, επίπεδες 2-3μμ ερπυσμός Άλλοι Proteus, Providencia, Morganella άχρωμες, επίπεδες, δεν ερπύζουν, 2-3μμ επίπεδες, δεν ερπύζουν, 2-3mm Manual of Clinical Microbiology 9th ed., 2007

Triple Sugar Iron Agar (TSI) Kligler Iron Agar (KIA) TSI (τριπλοσακχαρούχο σιδηρούχο άγαρ): περιέχει τα σάκχαρα glucose, lactose, sucrose, και ferrous sulfate (δ.phenol red, δ.h2s) KIA: περιέχει δύο σάκχαρα glucose, lactose και ferrous sulfate (δ.phenol red, δ.h 2 S) ΑΞΙΟΛΟΓΗΣΗ Ζύμωση γλυκόζης: κίτρινη στήλη, ± αερίου Ζύμωση λακτόζης: κίτρινη λοξή επιφάνεια Παραγωγή H 2 S : μαύρισμα στήλης QC: E.coli, S.flexneri, Salmonella H 2 S(+)

TSI

TSI, Kligler Αντιδράσεις στη Λοξή επιφάνεια Όξινη (κίτρινο) Αλκαλική (κόκκινο) Αλκαλική (κοκκινο) Αλκαλική (κοκκινο) Στήλη Αέριο Η 2 S Όξινη (κιτρινο) Όξινη (κιτρινο) Όξινη (κιτρινο) Όξινη (κιτρινο) Γένη + - Escherichia, Enterobacter, Klebsiella - - Singella, Serratia + + Salmonella, Proteus - +/- Salmonella typhi αλκαλική αλκαλική - - Pseudomonas Medical microbiology & Immunology 6th ed., 2000

Προκαταρτική ταυτοποίηση (1,2) Σαλμονέλλας τύφου: δείγματα από στείρες περιοχές & κόπρανα Δ. στείρες.περιοχές 3 η περίπτωση κόπρανα BA: γκρι,γυαλιστερές διαφανείς ή όχι>1μμ MaC:άχρωμες 2-3μμ BA Xpώση Gram gram- βακτηρίδιο 1. Βιοχ.ταυτοπ. κ/α ΤSI / ΚIA S.S: αχρωμες1-2μμ MaC: άχρωμες, γυαλ., 2-3μμ Κινητικ.+ Ουρία - Ινδόλη - 2.Ορολογική ταυτοπ. Αντιοοροί Vi & D Anti-Vi + S. typhi Anti-D + Υποπτο για S.typhi CDC,WHO, USAID

Ταυτοποίηση Salmonella,Shigella Πρακτικές οδηγίες Ι Σε κάθε θετική Αιμοκαλλιέργεια γίνεται αντιβιόγραμμα και δεν περιμένουμε την βιοχημική ή ορολογική ταυτοποίηση. Από μία αποικία γίνεται ο εμβολιασμός ΚIA/ΤSΙ, και η ανακαλλιέργεια σε μη εκλεκτικό υλικό. Με ίσιο κρίκο αγγίζουμε ελαφρά μόνο το κέντρο της αποικίας. Δεν παίρνουμε όλη την αποικία, δεν την σύρουμε επάνω στην επιφάνεια του άγαρ γιατί υπάρχει κίνδυνος επιμόλυνσης CDC,WHO,USAID 2003

Πρακτικές οδηγίες ΙΙ Εάν η αποικία δεν είναι «καθαρή», ανακαλλιεργείται και μετά εμβολιάζεται το ΚIA/ΤSI. Δοκιμή κινητικότητας : η επιφάνεια του άγαρ πρέπει να είναι στεγνή. Η υγρή επιφάνεια μπορεί να δώσει ψευδώς θετικό αποτέλεσμα. Ηδοκιμήμπορείναγίνειαπότις αποικίες του ΚIA/ΤSΙ. Από μία καθαρή αποικία μπορούμε να εμβολιάσουμε συγχρόνως το άγαρ κινητικότητας και το ΚIA/TSΙ. Πρώτα την κινητικότητα μετά την στήλη και τέλος τη λοξή επιφάνεια του ΚIA/ΤSΙ. CDC,WHO,USAID 2003

Πρακτικές οδηγίες ΙΙΙ Μετά τον εμβολιασμό του άγαρ κινητικότητας δεν παίρνουμε δεύτερη αποικία για να εμβολιάσουμε το ΚIA / ΤSI. Μπορεί να είναι άλλο μικρόβιο. Οι ορολογικές δοκιμασίες πρέπει να γίνονται με αποικίες από την επιφάνεια KIA, TSI, heart-infusion agar (HIA) ή άλλων μη εκλεκτικών υλικών. Οι ορολογικές δοκιμασίες δεν πρέπει να γίνονται από αποικίες που αναπτύχθηκαν σε εκλεκτικά θρεπτικά υλικά MaC, SS,DCA,XLD,EMB. Τα εκλεκτικά υλικά μπορεί να δώσουν ψευδώς αρνητικές ορολογικές δοκιμές. CDC,WHO,USAID 2003

Οξειδάση Κάνουμε οξειδάση από το Αιματ., το Σοκολ.,ΜΗ. Δεν κάνουμε οξειδάση από MacConkey, EMB. Αξιολόγηση Οξειδάση θετική: Ναϊσσέρειες, Ψευδομονάδες, Καμπυλοβακτηρίδια, Αερομονάδες, Παστερέλλες, Μοραξέλλες Οξειδάση αρνητική: Εντεροβακτηριακά (όλα?)

PΥR (L-Pyrrolidonyl-b-Naphthylamide) πυρρολινοδάση Streptococcus pyogenes + Enterococcus + E.coli Staphylococcus lugdunensis + Citrobacteur freundii + Salmonella (H 2 S+) -

Αναερόβια GNB- Bacteroides Fusobacterium Prevotella Porphyromonas Selenomonas GNC - Veillonella