Γιατί να σπουδάσω Βιολογία Καζ. Μ. Μνπζηάθα Αλαπι. Καζ. Α. Σξηαληαθπιιίδεο Σκήκα Βηνινγίαο ΑΠΘ 18/2/2019, Οη ζπνπδέο ζην ΑΠΘ
Σν DNA παληνύ Αιιά
Ση ζεο λα γίλεηο?.γηαηξόο???
H Βιολογία ΗΜΕΡΑ
Μικποβιολογία http://www.bio.auth.gr Ανοζοβιολογία 1 o 2 o Φιλοζοθία & ύγσπονερ Σάζειρ ηηρ Βιολογίαρ Φυσικοχημεία Βιοσημεία Μοπιακή Βιολογία ΓΗΑΡΘΡΩΖ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΣΟ ΜΑΘΖΜΑΣΩΝ ΣΜΖΜΑΣΟ ΒΗΟΛΟΓΗΑ ΑΠΘ Διδικά Θέμαηα Γενεηικήρ Γενεηική Ανθπώπος Γενεηική Μησανική Διδικά Θέμαηα Βιολογίαρ Κςηηάπος Διδικά Θέμαηα Μοπιακήρ Βιολογίαρ 5 o Βιοπληποθοπική 3 o Βιολογία Κςηηάπος Γενεηική 6 o Βιοηεσνολογικέρ Δθαπμογέρ Μικποοπγανιζμών Βιοηεσνολογία Εώων & Φςηών Διδικά Θέμαηα Μικποβιολογίαρ 4 o Δξέλιξη &ηοισεία Γενεηικήρ Πληθςζμών Βιολογία Ανάπηςξηρ Μησανιζμοί Γιαθοποποίηζηρ Οικονομία-Γίκαιο ζηη Βιολογία Βιολογική Ανθπωπολογία Οικοηοξικολογία 7 o Τδαηοκαλλιέπγειερ Χημεία Τροφίμων Ενζυμολογία 8 o
ΔΡΔΤΝΑ Ρύθμιζη Γονιδίων Δππηηο Ηών Ανηιμικποβιακή δπάζη θςζικών οςζιών Πποβιοηικοί Μικποοπγανιζμοί Πειπαμαηικά Μονηέλα Αςηοανοζίαρ (απθπίηιδα-κοιλιοκάκη) Μησανιζμοί Παθογένειαρ (κςηηαπική & γονιδιακή θεπαπεία) Μοπιακοί Μησανιζμοί Ογκογένεζηρ Ρύθμιζη ηος NFkB (ςγιή και παθολογική) Βιοπαπακολούθηζη/ Βιοδείκηερ&Βιομάπηςπερ ηην Τγεία και ηο πεπιβάλλον Οικοηοξικολογία Γενεηική Ανάλςζη ελληνικού Πληθςζμού Πολςμοπθικοί Γείκηερ Γονίδια-Νοζήμαηα (ακσ. Γιαβ./ςπέπηαζη) Γενεηική ποικιλόηηηα & Γιασείπιζη πληθςζμών Γενεηικόρ έλεγσορ & Δίδη ππορ απελεςθέπωζη Δξελικηική Ηζηοπία ειδών ζηην Δλλάδα Γενεηική Σαςηοποίηζη
ΕΡΓΑΙΑ Ω ΓΕΝΕΣΙΣΗ Ωο εξεπλεηέο ζηα εξεπλεηηθά ηδξύκαηα ηεο ρώξαο - Ωο εξγαζηεξηαθνί επηζηήκνλεο ηνπ θιάδνπ ΠΕ ζηα εξγαζηήξηα (παξνρήο ππεξεζηώλ ή εξεπλεηηθά) ησλ δεκόζησλ λνζνθνκείσλ (ΝΠΓΓ ε ΝΠΙΓ) όπσο ην βηνρεκηθό, αλνζνβηνινγηθό, αηκνδνζίαο, αηκαηνινγίαο, κηθξνβηνινγίαο, θπηηαξνινγηθό, παζνινγναλαηνκηθό, κνλάδεο κνξηαθήο βηνινγίαο, γελεηηθνύ ειέγρνπ, εμσζσκαηηθήο γνληκνπνίεζεο θ.ά. ύκθσλα κε ηνλ λ.2889/2001 ν βηνιόγνο έρεη ηελ δπλαηόηεηα εμέιημεο έσο θαη ηνλ βαζκό ηνπ δηεπζπληή. ΠΡΟΒΛΗΜΑ!!! ε κε απηνλνκία ησλ βηνιόγσλ ζηελ Διιάδα ζε ζρέζε κε ηνπο γηαηξνύο νη κηζζνί ηνπο είλαη πην θνληά ζε ηερληθό πξνζσπηθό παξά ζησλ γηαηξώλ Γεκνζηεύηεθε ην ΦΔΚ 20/9/2018 Αξ. Φύιινπ 4138, ζην νπνίν πεξηιακβάλεηαη ε εηδηθόηεηα Εξγαζηεξηαθήο Γελεηηθήο γηα Βηνιόγνπο, κεηά απν 5εηή εθπαίδεπζε
Μια νέα Δποσή Ζ ολοκλήπωζη ηος ππώηος ανθπώπινος γονιδιώμαηορ ζημαηοδοηεί ηο ξεκίνημα μιαρ νέαρ εποσήρ Νέα μησανήμαηα Νέερ μέθοδοι ανάλςζηρ Νέερ πποοπηικέρ ζηη διάγνωζη και ζηη θεπαπεία
Σα δεδνκέλα απμάλνληαη. Ion Torrent-Life tech-abi Oxford Nanopore - Min Ion https://www.nanoporetech.com/products-services/minion-mki
Ζ Αύξηζη ηων δεδομένων 1976/79: Ππώηο ιικό γονιδίωμα MS2/fX174 1995: Ππώηο πποκαπςωηικό γονιδίωμα H. influenzae 1996: Ππώηο γονιδίωμα μονοκύηηαπος εςκαπςώηη - Εύμη 1997: Ππώηο γονιδίωμα πολςκύηηαπος εςκαπςώηη - C. elegans 2001: Σο ανθπώπινο γονιδίωμα ~3Gb 2019: >13.000 ολοκληπωμένα πποκαπςωηικά γονιδιώμαηα (+ 165.000 ζε εξέλιξη), + 7700 εςκαπςωηικά γονιδιώμαηα (μόνο 54 πλήπωρ ολοκληπωμένα, 1000 ζε επίπεδο σπωμοζώμαηορ) (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/browse/)
the cost of DNA data production is less than the cost of storing it
ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ ε εθαξκνγή ππνινγηζηηθώλ αλαιύζεσλ ζηα δεδνκέλα ηεο γνληδησκαηηθεο κε εθαξκνγέο ζηελ αλάιπζε αιιεινπρηώλ ζηελ εύξεζε ηνπ ηξόπνπ ιεηηνπξγίαο γνληδίσλ ζηελ αλάιπζε ηεο γνληδηαθήο έθθξαζεο ζηε ζύγθξηζε γνληδησκάησλ ζηελ πξόβιεςε ηεο δνκήο ησλ πξσηετλώλ ζηελ εύξεζε θαξκάθσλ
Νέεο εηαηξείεο γελεηηθώλ ειέγρσλ.
1 Nov 2012 1 Oct 2015 Καηά κέζν όξν θάζε άλζξωπνο, θέξεη 100-200 επηβιαβείο κεηαιιάμεηο θαη έωο 20 ζρεηηδόκελεο κε θιεξνλνκηθέο αζζέλεηεο ή LOF. Αιιά πιεξνθνξίεο θαη γηα ηελ ηζηνξία καο
5/7/2013 : Αλληλούσηζη ηος γονιδιώμαηορ 100.000 Βπεηανών μέσπι ηο 2017 Τπνπξγείν πγείαο NHS Welcome Trust - Illumina http://www.genomicsengland.co.uk/ Παξόκνηα πξνγξάκκαηα έρνπλ μεθηλήζεη ζηνλ Καλαδά, ηελ Απζηξαιία, ηελ Ιαπσλία, ηε Ν. Κνξέα, ηε ηγθαπνύξε, ηελ Σατιάλδε, ην Κνπβέηη, ην Καηάξ, ην Ιζξαήι, ην Βέιγην, ην Λνπμεκβνύξγν θαη ηελ Δζζνλία. ΗΠΑ θαη Κίλα έρνπλ ζηόρν 1 δηζεθαηνκκύξηα άηνκα
Γιάγνωζη Καπκίνος Υπήζη μησανημάηων μικποζςζηοισιών Παπακολούθηζη αζθενών Ανηίδπαζη ζε σημειοθεπαπεία Οι αζθενείρ έσοςν διαθοπεηικό πποθίλ ΞΔΥΑΣΔ ΣΙ ΒΙΟΥΗΜΙΚΔ ΔΞΔΣΑΔΙ!!!!
ΔΙΝΑΙ ΟΛΑ ΣΟΟ ΔΤΚΟΛΑ???? ή αιιηώο λα ην θάλω ην γελεηηθό ηεζη?
ΓΔΝΔΣΙΚΟ ΤΜΒΟΤΛΟ βνεζώληαο άηνκα θαη ηηο νηθνγέλεηεο ηνπο λα θαηαλνήζνπλ πώο ε γελεηηθή επεξεάδεη ηελ πγεία θαη ηε δσή ηνπο Αλάιπζε ηζηνξηθνύ νηθνγελεηώλ πδήηεζε πεξί αζζελεηώλ πκβνπιέο γηα γελεηηθά ηεζη πκβνιή ζηελ ιήςε απνθάζεσλ νηθνγελεηώλ Δλεκέξσζε ηεο ηαηξηθήο θνηλόηεηαο http://www.nature.com/nature/journal/v526/n75 71/full/nj7571-151a.html
Νέεο Γπλαηόηεηεο Σξνπνπνίεζεο ηνπ γελεηηθνύ πιηθνύ Nature (2011) 479, 223-227
http://www.bio.auth.gr/spoydes Βιολογία (Περιβάλλον) Αντικείμενα Μαθημάτων Μορφολογία/Ανατομία, Φυσιολογία, Συστηματική, Οικολογία Φυτών, Ζώων, Μικροοργανισμών Βιοποικιλότητα, Ανάλυση οικολογικών συστημάτων, Αρχές αειφορίας και διαχείρισης, Βιογεωγραφία Χερσαίο/Λιμνοποτάμιο/Θαλάσσιο Περιβάλλον και οργανισμοί Επιλογής Μαθήματα, Διπλωματική, Πρακτική
Βιοποικιλότητα Φυτών από την αυλή μας (χαμηλά υψόμετρα)
Centaurea paxorum (Vulnerable) Βιοποικιλότητα Φυτών ενδημικά είδη Scutellaria rupestris subsp. cephalonica (Endangered)
Προστασία της Βιοποιλότητας Caretta caretta Θαλάσσιο Πάρκο Ζακύνθου
Προστασία της Βιοποιλότητας σε πλανητική κλίμακα Caretta caretta
Προστασία της Βιοποιλότητας σε πλανητική κλίμακα Caretta caretta
Ερυθρές παλίρροιες Όρμος Θεσσαλονίκης Προστασία και αποκατάσταση του θαλάσσιου περιβάλλοντος
Φαινόμενο «βρώμικης θάλασσας» Ιούνιος 2017
H μικροσκοπική ανάλυση νερού
Πρωτόζωο σχηματισμού ερυθράς παλίρροιας Noctiluca scintillans
http://www.whoi.edu/science/b/redtide/pfiesteria/molecular/molecular_workshop_report.pdf
H βιοπληροφορική στην εξερεύνηση της βιοποικιλότητας >OTU001 ATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATA GTACCTTACTACACGGATAACCGTA GTAATTCTAGAGCTAATACGTGCTAA AAGCCCCGACTTTGAAGGGGTGTAT TTATTAGATA >OTU002 ATTACCATGGCTATGCATTCTGTCAA TAAACCTATCGTGAGCTAATCAGTTA TAGTTTATTTGATAGTACCTTACTAC ACGGATAACCGTAGTAATTCTTGGC ATACGGTCGCAATGACACG? Haematococcus sp ζηο κηίριο Βιολογίας Χαμηλή ή καθόλοσ ομολογία με αποθηκεσμένη αλληλοστία ζε βάζη δεδομένων
Computational ecosystems biology in Tara Oceans: translating data into knowledge Taxonomic and genetic diversity analysed to date by the Tara Oceans project
Αποκατάσταση Λίμνη Καστοριάς Σεπτέμβριος 2014 μια λίμνη..λαδομπογιά
21st century This map represents global temperature anomalies averaged from 2008 through 2012. Σνπιάρηζηνλ 97 % ησλ επηζηεκόλσλ ζπκθσλνύλ όηη νη αλζξσπνγελείο εθπνκπέο CO 2 είλαη ε αηηία ηνπ global warming (Cook et al. 2013). ΗΜΕΡΑ
RNA : DNA ratio Με την αύξηση της θερμοκρασίας σε διαφορετική αλατότητα θαλασσινού νερού εμφανής η αύξηση δραστηριότητας αποικοδομητών και παρασίτων Stefanidou et al. 2018 Hf- Hi Hf+ Ai Af Af+ Af- Hf
Φπζηθή-Βηνινγηθή Επεμεξγαζία Απνβιήηωλ The process involves the use of algae photosynthesis in "high rate ponds" rather than the electro-mechanical aeration devices used in more expensive, conventional wastewater treatment systems. The algae produce oxygen that allows aerobic bacteria to break down remaining contaminants in the water. http://www.oswaldgreentech.com/
Μικροβιόκοσμος στην ατμόσφαιρα της Θεσσαλονίκης Αλαγλώξηζε θαη παξαθνινύζεζε
Παραγωγή γυρεοκόκκων Σεξάζηηα κεγέζε ~ 4x10 3 15x10 4 γπξεόθνθθνη αλά άλζνο ~ 35x10 4 3,5x10 6 γπξεόθνθθνη αλά ηαμηαλζία ~ 65x10 7 4,5x10 12 αλά άηνκν
Συλλέκτες σωματιδίων προετοιμασία παρασκευασμάτων Συσκευή Burkard Συνεχής λειτουργία (7 ημέρες επί 24 ώρες)
Τα αφθονότερα: φυτά Cupressaceae, Pinaceae, Quercus, Platanus, Olea [>55%, >75%]
Κυκλοφορία γυρεοκόκκων Cupressaceae Fabaceae Salix Ulmaceae Asteroideae Corylus Alnus Populus Fraxinus Rosaceae Juglans Cannabaceae Ericaceae Urticaceae Platanus Carpinus Fagus Pinaceae Olea Plantago Poaceae Thalictrum Quercus Rumex Chenopodiaceae Artemisia Ambrosia Φεβ Μαρ Απρ Μαϊ Ιουν Ιουλ Αυγ Σεπ Οκτ
Δελτίο Ατμοσφαιρικής Κυκλοφορίας Σωματιδίων Βιολογικής Προέλευσης
Αύξηση συγκέντρωσης γύρης στην ατμόσφαιρα της Θεσσαλονίκης 10 Alnus 10 Carpinus 10 Chenopodiaceae 5 ln(y) = 0.09x - 173.72 R 2 = 0.37 5 ln(y) = 0.17x - 337.75 R 2 = 0.53 5 ln(y) = 0.05x - 96.27 R 2 = 0.33 10 AVERAGE 0 0 0 10 Cupressaceae 10 Oleaceae 10 Pinaceae 5 ln(y) = 0.06x - 116.82 R 2 = 0.50 0 1985 1990 1995 2000 2005 5 0 10 5 ln(y) = 0.07x - 122.96 Plantago R 2 = 0.25 ln(y) = 0.16x - 313.76 R 2 = 0.74 5 5 ln(y) = 0.07x - 142.88 R 2 = 0.34 ln(y) = 0.09x - 179.74 R 2 = 0.66 0 0 10 Platanus 10 Poaceae 5 5 ln(y) = 0.16x - 308.03 ln(y) = 0.08x - 158.16 R 2 = 0.54 R 2 = 0.54 0 0 0 10 0 Quercus εκαληηθή αύμεζε γηα 14 από 16 taxa 5 (κε ζπκκεηνρή >0,5%) Damialis A et al. 2007. Long-term trends in atmospheric pollen levels in the city of Thessaloniki, Greece. Atmospheric environment 41: 7011-7021. ln(y) = 0.07x - 130.24 R 2 = 0.35 1985 1995 2005 10 5 0 Rumex ln(y) = 0.09x - 185.14 R 2 = 0.57 1985 1995 2005 10 5 0 Urticaceae ln(y) = 0.08x - 154.65 R 2 = 0.23 1985 1995 2005
Δίκτυο συνεργασιών ενός μέλους ΔΕΠ
Εργασία - Σομέας περιβάλλοντος Περιβαλλοντικές μελέτες, μελέτες περιβαλλοντικών επιπτώσεων έργων και δραστηριοτήτων, μελέτες προστασίας και διαχείρισης, αποκατάστασης περιβάλλοντος Κλάδος ΠΕ Περιβάλλοντος για τον δημόσιο τομέα Ευρωπαϊκές/εθνικές Οδηγίες για τα ύδατα, θαλάσσια στρατηγική, κολυμβητικά ύδατα κ.α. Προστατευόμενες περιοχές δικτύου Φύση 2000 τρατηγική της ΕΕ για την Βιοποικιλότητα
τρατηγική της ΕΕ για την Βιοποικιλότητα το 2020 The EU biodiversity objectives and the labour market: benefits and identification of skill gaps in the current workforce DG Environment 26 November 2012 Implications of EU Biodiversity Strategy for jobs and skills 174000 FTE jobs in the EU in total (52000+122000 νέες) http://ec.europa.eu/environment/pubs /pdf/biodiversity/biodiversity%20and %20Jobs_final%20report.pdf
Καλό ταξίδι στη Βιολογία Καλή επιτυχία!