ΔΟΜΕΣ ΠΡΩΤΕΪΝΩΝ. Fibrous - extended shape, insoluble (e.g. keratin, collagen, elastin) Globular

Σχετικά έγγραφα
Δομή και λειτουργία πρωτεϊνών. Το κύριο δομικό συστατικό των κυττάρων. Το κύριο λειτουργικό μόριο

οµή και Αναδίπλωση πρωτεϊνών

ΔΟΜΗ ΚΑΙ ΔΡΑΣΗ ΠΡΩΤΕΙΝΩΝ

Δομικές κατηγορίες πρωτεϊνών

Aναδίπλωση και επεξεργασία των πρωτεϊνών

Ηλίας Ηλιόπουλος Εργαστήριο Γενετικής, Τμήμα Βιοτεχνολογίας, Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών

Βιοπληροφορική. Ενότητα 17: Δομή Πρωτεϊνών, 1 ΔΩ. Τμήμα: Βιοτεχνολογίας Όνομα καθηγητή: Τ. Θηραίου

Kυτταρική Bιολογία ΔΟΜΗ ΚΑΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΕΣ ΤΩΝ ΠΡΩΤΕΪΝΩΝ ΔIAΛEΞΗ 3 (7/3/2012) Δρ. Xρήστος Παναγιωτίδης, Τμήμα Φαρμακευτικής Α.Π.Θ.

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΟ ΚΕΝΤΡΟ ΦΥΣΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ Ν. ΜΑΓΝΗΣΙΑΣ ( Ε.Κ.Φ.Ε ) ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ

Κατα το θερµικό Σοκ µαζί µε τις αλλαγές πού επισυµβαινουν στην µεταγραφή παρατηρείται και µια επιλεκτική µετάφραση των µηνυµάτων εκείνων που

ΓΩΝΙΕΣ φ, ψ ΚΑΙ ΕΠΙΤΡΕΠΤΕΣ ΔΙΑΜΟΡΦΩΣΕΙΣ ΤΗΣ ΠΟΛΥΠΕΠΤΙΔΙΚΗΣ ΑΛΥΣΙΔΑΣ

Επίδραση και άλλων παραγόντων στην Αλλοστερική συμπεριφορά της Αιμοσφαιρίνης

ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ. Φατούρος Ιωάννης Αναπληρωτής Καθηγητής

αποτελούν το 96% κ.β Ποικιλία λειτουργιών

τα βιβλία των επιτυχιών

Το ένζυμο Καρβοξυπεπτιδάση Α έχει τα εξής χαρακτηριστικά

Ρύθμιση της μετάφρασης. Η μετάφραση του mrna της φερριτίνης ρυθμίζεται από τη διαθεσιμότητα σιδήρου

ΑΥΤΟΣΥΓΚΡΟΤΗΣΗ ΥΠΕΡΜΟΡΙΑΚΩΝ ΔΟΜΩΝ ΚΑΨΙΔΙΑ ΙΩΝ ΚΑΙ ΦΑΓΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΕΣ ΜΑΣΤΗΓΙΝΕΣ ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΚΗ ΚΑΙ ΜΗ-ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΚΗ ΣΥΣΣΩΜΑΤΩΣΗ

Πρωτεινική αναδίπλωση

Φυσική Στερεών στις Πρωτεΐνες

ΚΕΦΑΛΑΙΟ 9 ο ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΕΣ ΚΑΤΑΛΥΣΗΣ

ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ: Δομή και λειτουργία. (Διδακτική προσέγγιση με πειράματα και αναλογίες)

Kυτταρική$Bιολογία$ ΔIAΛEΞΗ(6! (21!&!23/3/2012)! ΣΥΝΘΕΣΗ,(ΑΝΑΔΙΠΛΩΣΗ,( ΤΡΟΠΟΠΟΙΗΣΕΙΣ(&(ΑΠΟΙΚΟΔΟΜΗΣΗ( ΤΩΝ(ΠΡΩΤΕΪΝΩΝ(

ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΑ ΦΥΤΩΝ ΕΙΣΑΓΩΓΗ. Θερινό εξάμηνο ΔΠΘ - Τμήμα Δασολογίας & Διαχείρισης Περιβάλλοντος & Φυσικών Πόρων

Δομή πρωτεϊνών: Τριτοταγής διαμόρφωση της δομής

Δελτίο Τύπου Τροποποιημένα βακτήρια για την ανακάλυψη νέων φαρμάκων

AMINEMAX και ΤΡΟΠΟΣ ΠΑΡΑΣΚΕΥΗΣ

ΚΕΦΑΛΑΙΟ 10. Στρατηγικές ρύθμισης

«ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ: ΧΗΜΙΚΗ ΔΟΜΗ ΚΑΙ ΒΙΟΛΟΓΙΚΟΣ ΡΟΛΟΣ»

Τριαδικό σύστημα του Salthe (1985) επίπεδα σημειωτικών διεργασιών.

Μετα-μεταφραστικές τροποποιήσεις. των πρωτεϊνών

και χρειάζεται μέσα στο ρύθμιση εναρμόνιση των διαφόρων ενζυμικών δραστηριοτήτων. ενζύμων κύτταρο τρόπους

Απομόνωση Καζεΐνης ΆΣΚΗΣΗ 6 Η ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΧΗΜΕΙΑΣ & ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ ΤΡΟΦΙΜΩΝ

Κυτταρική Βιολογία. Ενότητα 02 : Χημική σύσταση κυττάρων- Δομή και λειτουργίες πρωτεϊνών. Παναγιωτίδης Χρήστος Τμήμα Φαρμακευτικής ΑΠΘ

Το δίπλωµα των πρωτεϊνών Μοριακοί ακόλουθοι Ανωµαλίες στο δίπλωµα Ασθένειες

Βιοϋλικά. Ενότητα 5: Πρωτεΐνες, Κύτταρα, Ιστοί Αλληλεπίδραση με Βιοϋλικά. Ελευθέριος Αμανατίδης Πολυτεχνική Σχολή Τμήμα Χημικών Μηχανικών

Δομικές επικράτειες Τάξης α/β (α/β επικράτειες)

Kυτταρική Bιολογία ΣΥΝΘΕΣΗ, ΑΝΑΔΙΠΛΩΣΗ, ΤΡΟΠΟΠΟΙΗΣΕΙΣ & ΑΠΟΙΚΟΔΟΜΗΣΗ ΤΩΝ ΠΡΩΤΕΪΝΩΝ ΔIAΛEΞΕΙΣ 8, 9 & 10 (15, 17 & 20/3/2017)

Θέµατα ιάλεξης ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ - ΕΝΖΥΜΑ ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ. ιαχωρισµός Αµινοξέων

BIOXHMEIA, TOMOΣ I ΠANEΠIΣTHMIAKEΣ EKΔOΣEIΣ KPHTHΣ

Η κυτταρική µετατόπιση των πρωτεϊνών

πρωτεΐνες πολυμερείς ουσίες δομούν λειτουργούν λευκώματα 1.Απλές πρωτεΐνες 2.Σύνθετες πρωτεΐνες πρωτεΐδια μη πρωτεϊνικό μεταλλοπρωτεΐνες

ΚΕΦΑΛΑΙΟ 1. Οργάνωση της ζωής βιολογικά συστήματα

Αρχιτεκτονική της τρισδιάστατης δομής πρωτεϊνών

2 Ο ΜΑΘΗΜΑ ΣΥΣΤΗΜΑ ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑΤΟΣ ΠΑΠΑΓΙΑΝΝΗΣ ΔΗΜΗΤΡΗΣ ΤΜΗΜΑ ΙΑΤΡΙΚΩΝ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΩΝ ΤΕΙ ΘΕΣΣΑΛΙΑΣ

οµή και λειτουργία των µεγάλων βιολογικών µορίων

ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ Ι. ΚΕΦΑΛΑΙΟ 2 ο Βιοχημική εξέλιξη

Μεταγωγή σήματος και βιολογικές μεμβράνες

BIOXHMEIA, TOMOΣ I ΠANEΠIΣTHMIAKEΣ EKΔOΣEIΣ KPHTHΣ

ΙΑΤΡΙΚΗ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟΥ ΑΘΗΝΩΝ (ΕΚΠΑ) ΚΑΤΑΤΑΚΤΗΡΙΕΣ ΕΞΕΤΑΣΕΙΣ ΑΚ.ΕΤΟΥΣ ΕΞΕΤΑΖΟΜΕΝΟ ΜΑΘΗΜΑ: ΧΗΜΕΙΑ

1 Απο την πρωτεΐνη στο πρωτεινωµα στις µοριακες µηχανες. Τασος Οικονόµου

Ειδικές μέθοδοι ανάλυσης κυτταρικών διεργασιών Επίδραση εξωγενών παραγόντων στη λειτουργία κυτταρικών μεμβράνων

Δομές (Διαμορφώσεις) Πρωτεινικών μορίων

Ηλίας Ηλιόπουλος Εργαστήριο Γενετικής, Τμήμα Βιοτεχνολογίας, Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών

Οι πρωτεΐνες μπορεί να είναι σφαιρικές (συμπαγείς) ή ινώδεις

Δευτεροταγής Δομή Πρωτεϊνών

ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΘΕΣΣΑΛΙΑΣ

Βιολογικές Μεμβράνες και Μεταγωγή Σήματος

Άσκηση 7. Προσομοίωση 3D Δομών Βιομορίων μέσω. Ομολογίας & Threading

Kυτταρική Bιολογία ΒΙΟΛΟΓΙΚΕΣ ΜΕΜΒΡΑΝΕΣ, ΜΕΤΑΦΟΡΑ ΜΕ ΚΥΣΤΙΔΙΑ, ΛΥΣΟΣΩΜΑΤΙΑ & ΑΥΤΟΦΑΓΙΑ ΔIAΛEΞΕΙΣ 6 & 7 (8 & 13/3/2017)

Ασκήσεις 5& 6. Διαμόρφωση Βιομορίων μέσω Φασματοσκοπίας NMR. Σύγκριση & Ανάλυση Δομών Βιομορίων

Βιολογικές Μεμβράνες και Μεταγωγή Σήματος

Κεφάλαιο 3 ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ

Φωτοσύνθεση. κυτταρική αναπνοή άμυλο. άλλες οργανικές ουσίες

ΑΠΑΝΤΗΣΕΙΣ ΤΩΝ ΕΡΩΤΗΣΕΩΝ.-ΑΣΚΗΣΕΩΝ ΚΑΙ ΠΡΟΒΛΗΜΑΤΩΝ ΤΟΥ ΒΙΒΛΙΟΥ ΤΟΥ ΜΑΘΗΤΗ

ΧΗΜΙΚΗ ΣΥΣΤΑΣΗ ΤΟΥ ΚΥΤΤΑΡΟΥ. Τα χημικά μόρια που οικοδομούν τους οργανισμούς

ΒΙΟΛΟΓΙΑ. Παραδόσεις του μαθήματος γενικής παιδείας (Β λυκείου) Επιμέλεια: ΑΡΓΥΡΗΣ ΙΩΑΝΝΗΣ Βιολόγος M.Sc. Καθηγητής 3 ου λυκ.

Κυτταρική Βιολογία. Ενότητα 12 : Απόπτωση ή Προγραμματισμένος κυτταρικός θάνατος. Παναγιωτίδης Χρήστος Τμήμα Φαρμακευτικής ΑΠΘ

3.1 Ενέργεια και οργανισμοί..σελίδα Ένζυμα βιολογικοί καταλύτες...σελίδα Φωτοσύνθεση..σελίδα Κυτταρική αναπνοή.

ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΙΩΑΝΝΙΝΩΝ ΣΧΟΛΗ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ ΥΓΕΙΑΣ ΙΑΤΡΙΚΟ ΤΜΗΜΑ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ ΒΑΣΙΚΕΣ ΙΑΤΡΙΚΕΣ ΕΠΙΣΤΗΜΕΣ

Περίληψη Βιολογίας Κεφάλαιο 3

ΜΟΝΟΠΑΤΙΑ ΕΝΔΟΚΥΤΤΑΡΙΚΗΣ ΜΕΤΑΓΩΓΗΣ ΣΗΜΑΤΟΣ

Κωνσταντίνος Π. (Β 2 ) ΚΕΦΑΛΑΙΟ 3: ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ

ΑΡΧΗ 2ΗΣ ΣΕΛΙ ΑΣ. 1.4 Να μεταφέρετε στο τετράδιό σας τις παρακάτω χημικές εξισώσεις, σωστά συμπληρωμένες:

Κεφάλαιο 20 Η ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης στους ευκαρυωτικούς οργανισμούς

Αντιδράσεις της α-αμινομάδος

ΛΙΠΙΔΙΑ ΒΙΟΛΟΓΙΚΕΣ ΜΕΜΒΡΑΝΕΣ. 29/10/2015 Δ.Δ. Λεωνίδας

Αρχές Βιοτεχνολογίας Τροφίμων

Ενεργειακή ανάλυση βιομορίων

Βιοχημεία Τροφίμων Ι. Ενότητα 2 η Κρέας και ψάρι II. Όνομα καθηγητή: Έφη Τσακαλίδου. Τμήμα: Επιστήμης Τροφίμων & Διατροφής του Ανθρώπου

Μικρά αμινοξέα. Βιοχημεία Ι Β-3

Θέµατα Βιολογίας Γενική Παιδεία Γ Λυκείου 2000

Βιοχημεία Τροφίμων Ι. Ενότητα 2 η Κρέας και ψάρι II (μέρος α) Όνομα καθηγητή: Έφη Τσακαλίδου. Τμήμα: Επιστήμης Τροφίμων & Διατροφής του Ανθρώπου

Θέµατα Βιολογίας Γενική Παιδεία Γ Λυκείου 2000

ΒΙΟΛΟΓΙΑ Β ΛΥΚΕΙΟΥ ΓΕΝΙΚΗΣ ΠΑΙΔΕΙΑΣ ΠΕΡΙΛΗΨΗ ΚΕΦΑΛΑΙΟΥ 3

Κυτταρική Βιολογία. Ενότητα 06 : Σύνθεση, αναδίπλωση, τροποποιήσεις και αποικοδόμηση πρωτεϊνών. Παναγιωτίδης Χρήστος Τμήμα Φαρμακευτικής ΑΠΘ

Αλληλεπιδράσεις μεταξύ βιομορίων

Ηλίας Ηλιόπουλος Εργαστήριο Γενετικής, Τμήμα Βιοτεχνολογίας, Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών

ΦΥΛΛΟ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΣΤΗ ΒΙΟΛΟΓΙΑ Γ ΛΥΚΕΙΟΥ

Παθητική και ενεργητική μεταφορά μέσω μεμβρανών

ΣΥΜΠΥΚΝΩΣΗ: αφαίρεση ενός μορίου νερού - σύνθεση ενός διμερούς ΥΔΡΟΛΥΣΗ : προσθήκη ενός μορίου νερού - διάσπαση του διμερούς στα συστατικά του

Τα χημικά στοιχεία που είναι επικρατέστερα στους οργανισμούς είναι: i..

Κεφάλαια 8 ο Ένζυμα και κατάλυση

ΘΕΜΑ 1ο Α. Στις ερωτήσεις 1-5, να γράψετε στο τετράδιό σας τον αριθμό της ερώτησης και δίπλα το γράμμα που αντιστοιχεί στη σωστή απάντηση.

Β. ΚΑΜΙΝΕΛΛΗΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑ. Είναι η επιστήμη που μελετά τους ζωντανούς οργανισμούς. (Αποτελούνται από ένα ή περισσότερα κύτταρα).

ΑΝΤΙΓΡΑΦΗ DNA. «Το ειδικό ζευγάρωμα των βάσεων που θεωρήσαμε δεδομένο υποδηλώνει άμεσα έναν πιθανό μηχανισμό αντιγραφής του γενετικού υλικού»

Ε νότητα 1 ΧΗΜΙΚΗ ΣΥΣΤΑΣΗ ΤΟΥ ΚΥΤΤΑΡΟΥ. Ενδεικτική διδακτική προσέγγιση ΓΕΝΙΚΟΙ ΣΤΟΧΟΙ

Οι πρωτεΐνες συμμετέχουν σε όλες τις κυτταρικές λειτουργίες

To πρωτέωμα είναι η λειτουργική απεικόνιση του γονιδιώματος. Βιοχημεία Ι Γ-1

Εργασία για το μάθημα της Βιολογίας Περίληψη πάνω στο κεφάλαιο 3 του σχολικού βιβλίου

Transcript:

ΔΟΜΕΣ ΠΡΩΤΕΪΝΩΝ Fibrous - extended shape, insoluble (e.g. keratin, collagen, elastin) Globular - compact shape, water soluble (e.g. myoglobin, trypsin) Membranous - often multidomain one lipid soluble (e.g. photoreaction centre, ATP synthase)

Σφαιρικές πρωτεΐνες Παραδείγματα περιλαμβάνουν: ένζυμα, αντισώματα, μεταφορείς Από 5 έως 500 kda (50-5.000 αμινοξέα) Πτύχωση ενεργή κατάσταση Χαλαρή: χαμηλής ενέργειας

Σφαιρικές πρωτεΐνες Τι σημαίνουν οι δομές ; Πεπτιδικές αλυσίδες πληρούν τους εγγενείς περιορισμούς στη δική τους δομή Η πεπτιδική αλυσίδα πρέπει να αναδιπλώνεται έτσι ώστε να "θάψει" τις υδρόφοβες πλευρικές αλυσίδες, ελαχιστοποιώντας την επαφή τους με το νερό. Φορτισμένα και πολικά κατάλοιπα βρίσκονται συνήθως στην επιφάνεια που έρχεται σε επαφή με το νερό - αλλά μπορεί να εσωτερικευθεί αν ικανοποιούνται οι προυποθέσεις η δημιουργίας δεσμών Η και η ισορροπία φορτίου

ΜΟΡΙΑΚΟΙ «ΚΗΔΕΜΟΝΕΣ» Γιατί οι χρειάζονται «κηδεμόνες», εάν η πληροφορία για την αναδίπλωση είναι συνυφασμένες με την ακολουθία; Να προστατεύσουν τα «εν τω γεννάσθαι» πρωτεϊνικά μόρια από αποικοδόμηση και καταβύθιση και για να αποτρέψουν λανθασμένη αναδίπλωση πρωτεϊνών έτσι να έχουν άλλη μια ευκαιρία πτυχωθούν σωστά ATP

Ασθένειες που σχετίζοντα άμεσα με την Prion diseases (Proteinaceous infectious particle) e.g. MAD cow (bovine spongiform ecephalopathy [BSE]), KURU, Creutzfeld-Jacob change of protein conformation Fibril or amyloid formation Alzheimers Parkinsons πτύχωση των πρωτεϊνών

Τι θα συμβεί αν πρωτεΐνες δεν πτυχωθούν σωστά;

http://swissmodel.expasy.org/course/text/chapter4.htm

Μη-λειτουργικές Ακατάλληλες αλληλεπιδράσεις Μη παραγωγικές αλληλεπιδράσεις Συσσωμάτωση Στόχευση για πρωτεόλυση Διαρροή κυτταρικών πόρων (δέσμευση της ύλης και της ενέργειας)

Οι πρωτεϊνικές αλληλεπιδράσεις μπορεί να είναι άκρως ειδικές Chaperones και chaperonins πρέπει να δεσμεύουν μια πολλές διαφορετικές πρωτεΐνες Ποιος είναι ο μηχανισμός της αναγνώρισης ότι η πρωτεΐνη δεν είναι σωστά πτυχωμένη;

Hsp70 και Hsp90 Τα σημαντικότερα chaperones που βρίσκονται στα θηλαστικά είναι οι πρωτεΐνες Hsp70 και 90 Το Hsp70 συμμετέχει στην πτύχωση των πρόσφατα συντεθειμένων πρωτεϊνών, και στην προστασία των πρωτεϊνών κατά τη διάρκεια της κυτταρικής λειτουργίας και της πρωτεϊνικής κίνησης Hsp90 : η λειτουργία της είναι περιορισμένη, αλλά διαδραματίζει έναν ρόλο στην κυτταρική ανταπόκριση σε αντίξοες συνθήκες

Και οι δύο αυτοί οι τύποι chaperones συνδέονται με τα μη πτυχωμένα πρωτεϊνικά υποστρώματα μέσω των υδρόφοβων περιοχών Ελέγχουν τη διαμόρφωση των πρωτεϊνών που εμπλέκονται περιλαμβάνονται στη μεταγωγή σήματος, τον πολλαπλασιασμό κυττάρων, και την απόπτωση Συνεργάζονται με τους μηχανισμούς αποικοδόμησης στο κύτταρο Hsp70 και Hsp90 απαιτούν co-chaperones προκειμένου να λειτουργήσουν

Carboxyl terminus of Hsp70 Interacting Protein-CHIP CHIP είναι co- chaperone που αλληλεπιδρά με hsp70, και επιταχύνει την εξαρτώμενη από ουβικιτίνη, αποικοδόμηση των υποστρωμάτων των chaperones

Molecular chaperones: Γενικές έννοιες Απαιτούμενα για να θεωρηθεί μία πρωτεΐνη chaperone: (1) Να αλληλεπιδρά με και να σταθεροποιεί μη φυσικές μορφές της πρωτεΐνης (ων); - (2) δεν αποτελεί μέρος της τελικής διάταξης της πρωτεΐνης (-ών) στόχων Λειτουργίες ενός μοριακού συνοδού: "Κλασική" - Βοηθούν αναδίπλωση και συναρμολόγηση...πιο πρόσφατα - Δομική Διαμόρφωση της πρωτεΐνης στόχου (υποστρώματος) - μεταφορά ΠΥ - Διάσπαση των πρωτεϊνικών συσσωματωμάτων - Αποπτύχωση των ΠΥ

Hsp70 in de novo protein biogenesis

Λειτουργικός κύκλος Βακτηριακής DnaK

Η λειτουργία της prefoldin Ο μηχανισμός της prefoldin είναι σαφώς διαφορετικός από αυτόν της Hsp70, αλλά η γενική λειτουργία μπορεί να είναι παρόμοια: και οι δύο δεσμεύουν νέα πολυπεπτίδια prefoldin: μπορεί να σταθεροποιήσει μια μη πτυχωμένη πρωτεΐνη για την επακόλουθη πτύχωση δίπλωμα από Hsp 70 -Υπάρχει archaeal prefoldin η παρουσία prefoldin μπορεί να επιλύσει το παράδοξο ότι πολλά archaea δεν έχουν Hsp70

Chaperones: Variations on a theme

Chaperonin complex GroES/GroEL Journal of Biochemistry 2005 137(5):543-549

GroEL (Hsp60)

GroEL/GroES complex