ΠΑΡΔΥΟΜΔΝΔ ΤΠΗΡΔΙΔ Π.Δ.Γ.Τ. ΚΡΗΣΗ ΣΟΜΔΑ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ Νερά, Σρόθηκα, Περηβαιιοληηθά δείγκαηα Δίδνο Γείγκαηνο Δμεηαδόκελε παξάκεηξνο Μέζνδνο Πξόηππν Γηαπηζηεπκέλε 1. Νεξά αλζξώπηλεο θαηαλάισζεο, θπζηθά κεηαιιηθά λεξά, θνιπκβεηηθώλ δεμακελώλ, επηθαλεηαθά, λεξά αλαςπρήο 1. Καηακέηρεζε θαιιηεργήζηκφλ κηθροοργαληζκώλ-μέηρεζε αποηθηώλ κε εκβοιηαζκό ζε ζρεπηηθό agar ζηοσς 22 2 ο C θαη ζηοσς 36 2 ο C Δλζφκάηφζες ΔΛΟΣ ΔΝ ISO 6222:2000 2. Αλίτλεσζε θαη θαηακέηρεζε Pseudomonas aeruginosa Γηήζεζες από κεκβράλες (MF) ΔΛΟΣ ΔΝ ISO 16266:2009 2. Νεξά αλζξώπηλεο θαηαλάισζεο, θπζηθά κεηαιιηθά λεξά, επηθαλεηαθά λεξά, ζαιαζζηλά λεξά, λεξά θνιπκβεηηθώλ δεμακελώλ θαη λεξά αλαςπρήο 1. Αλίτλεσζε θαη θαηακέηρεζε θοιοβαθηερηοεηδώλ θαη E. coli 2. Αλίτλεσζε θαη θαηακέηρεζε εληεροθόθθφλ εληερηθής προέιεσζες Γηήζεζες από κεκβράλες (MF) Γηήζεζες από κεκβράλες (MF) ΔΛΟΣ ΔΝ ISO 9308.01: 2001 ΔΛΟΣ ΔΝ ISO 7899.02: 2001 3. Νεξά αλζξώπηλεο θαηαλάισζεο θαη επηθαλεηαθά πνπ πξννξίδνληαη γηα αλζξώπηλε θαηαλάισζε Αλίτλεσζε θαη θαηακέηρεζε Clostridium perfringens ζσκπερηιακβαλοκέλφλ ηφλ ζπορίφλ Γηήζεζες από κεκβράλες (MF) Παράρηεκα ΙΙΙ ηες ΚΤΑ Τ2/2600/2001 όπφς ηροποποηήζεθε θαη ηζτύεη 4. Νεξά αλζξώπηλεο θαηαλάισζεο, λεξά θνιπκβεηηθώλ δεμακελώλ, λεξά αλαςπρήο θαη άιια είδε λεξνύ Αλίτλεσζε θαη θαηακέηρεζε ηφλ Legionella spp. Γηήζεζες από κεκβράλες (MF) ISO 11731:1998 5. Σξόθηκα 1. Αλίτλεσζε Salmonella spp. Προεκπιοσηηζκού ΔΛΟΣ ΔΝ 6579: 2003 ELISA/vidas 2. Αλίτλεσζε ηες Listeria monocytogenes Προεκπιοσηηζκού ΔΛΟΣ ΔΝ ISO 11290.01: 1997/Amd1:2004 ELISA/vidas
Δίδνο δείγκαηνο Δμεηαδόκελε παξάκεηξνο Μέζνδνο Πξόηππν Γηαπηζηεπκέλε 3. Απαρίζκεζε ηες Listeria monocytogenes Προεκπιοσηηζκού ΔΛΟΣ ΔΝ ISO 11290.02: 1999/Amd1:2004 4. Καηακέηρεζε B- glucuronidase, E coli κε τρφκογόλα κέζα Καηακέηρεζε αποκόλφζε ζε εηδηθά ζρεπηηθά σποζηρώκαηα ΔΛΟΣ ΔΝ ISO 16649-2: 2001 5. Καηακέηρεζε ηαθσιοθόθθφλ ζεηηθώλ ζηελ θοαγθοσιάζε (τρσζίδφλ ζηαθσιόθοθθος θ άιια είδε) Δπίζηρφζες ΔΛΟΣ ΔΝ ISO 6888.01: 1999/ Αmd1:2004 6. Αλίτλεσζε Campylobacter spp Προεκπιοσηηζκοί θαη θαιιηέργεηα ζε εηδηθά ζρεπηηθά ζηερεά σποζηρώκαηα ISO 17995:2005 7. Καηακέηρεζε Οιηθώλ Κοιοβαθηερηοεηδώλ Καηακέηρεζε αποκόλφζε ζε εηδηθά ζρεπηηθά σποζηρώκαηα ISO 4832:2006 8. Καηακέηρεζε ζεηαλαγφγηθώλ θιφζηερηδίφλ Καηακέηρεζε αποκόλφζε ζε εηδηθά ζρεπηηθά σποζηρώκαηα ISO 7937:2004 9. Enterobacter sakazakii αποκόλφζε θαηακέηρεζε Καηακέηρεζε αποκόλφζε ζε εηδηθά ζρεπηηθά σποζηρώκαηα ISO/TS/22964 IDF RM 210.2006 6. Λύκαηα 1. Αλίτλεσζε θαη θαηακέηρεζε E.coli Γηήζεζες από κεκβράλες (MF) ΔΛΟΣ EN ISO 9308-1:2001 2. Αλίτλεσζε θαη θαηακέηρεζε εληεροθόθθφλ Γηήζεζες από κεκβράλες (MF) ΔΛΟΣ EN ISO 7899-2:2001 7. Πεξηβαιινληηθά θαη θιηληθά δείγκαηα Σασηοποίεζε κηθροοργαληζκώλ Φαζκαηοκεηρία κάδας, Real Time PCR Δζφηερηθή κέζοδος Δργαζηερίοσ βαζηζκέλε ζηολ Καηαζθεσαζηή Biotyper Microflex LT
ΣΟΜΔΑ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ Αλζρώπηλα δείγκαηα Παζνγόλν Δίδνο δείγκαηνο Δίδνο εμέηαζεο Μέζνδνο Γηαπηζηεπκέλε 1. Αλαπιάζκαηα Anaplasma phagocytophilum αλοζοθζορηζκός IFA (IgM,IgG) Anaplasma phagocytophilum αίκα, κσειός οζηώλ Άκεζε αλίτλεσζε παζογόλοσ Άκεζος αλοζοθζορηζκός DFA Anaplasma phagocytophilum αίκα, κσειός οζηώλ Καιιηέργεηα Anaplasma phagocytophilum αίκα, κσειός οζηώλ Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR, Real-Time PCR Anaplasma spp αίκα, κσειός οζηώλ Σσποποίεζε PCR, Real-Time PCR Anaplasma spp αίκα, κσειός οζηώλ Καιιηέργεηα Anaplasma spp αίκα, κσειός οζηώλ Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR, Real-Time PCR Anaplasma spp αίκα, κσειός οζηώλ Σσποποίεζε PCR-RFLP, sequencing 2. Aspergillus Aspergillus Βροτγηθό έπισκα, θαρσγγηθό επίτρηζκα Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR, Real-Time PCR 3. Μπακπέζηεο Babesia spp αίκα Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Babesia spp αίκα Σσποποίεζε PCR, sequencing 4. Βάθηινο ηνπ άλζξαθα Bacillus anthracis πηύεια, βηουίας Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR 5. Μπαξηνλέιιεο Bartonella alsatica αίκα, ιεκθαδέλας, ηζηός, δερκαηηθό Καιιηέργεηα Καιιηέργεηα ζε ηρσβιία
Bartonella alsatica Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR, Real-Time PCR Bartonella alsatica Σσποποίεζε Bartonella alsatica Παραγφγή αληηγόλοσ Bartonella elizabethae Bartonella elizabethae Bartonella elizabethae Καιιηέργεηα Γολοησπηθή αλίτλεσζε Σσποποίεζε Bartonella elizabethae Παραγφγή αληηγόλοσ Bartonella henselae Άκεζε αλίτλεσζε παζογόλοσ Bartonella henselae Παραγφγή αληηγόλοσ Bartonella henselae PCR-RFLP, sequencing θαζαρηζκός από ειεύζερο κέζο θαη Καιιηέργεηα ζε ηρσβιία PCR, Real-Time PCR PCR-RFLP, sequencing θαζαρηζκός από ειεύζερο κέζο θαη Άκεζος αλοζοθζορηζκός DFA θαζαρηζκός από ειεύζερο κέζο θαη αλοζοθζορηζκός IFA (IgM,IgG) Bartonella henselae western blot Bartonella henselae Καιιηέργεηα Καιιηέργεηα ζε ηρσβιία Bartonella henselae Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR, Real-Time PCR Bartonella henselae Σσποποίεζε PCR-RFLP, sequencing Bartonella quintana Άκεζε αλίτλεσζε παζογόλοσ Άκεζος αλοζοθζορηζκός DFA Bartonella quintana αλοζοθζορηζκός IFA (IgM,IgG) Bartonella quintana western blot
Bartonella quintana αίκα, ιεκθαδέλας, ηζηός, δερκαηηθό Καιιηέργεηα Καιιηέργεηα ζε ηρσβιία Bartonella quintana Bartonella quintana αίκα, ιεκθαδέλας, ηζηός, δερκαηηθό αίκα, ιεκθαδέλας, ηζηός, δερκαηηθό Γολοησπηθή αλίτλεσζε Σσποποίεζε Bartonella quintana Παραγφγή αληηγόλοσ 6. Μπνξέιιηεο PCR, Real-Time PCR PCR-RFLP, sequencing θαζαρηζκός από ειεύζερο κέζο θαη Borrelia burgdorferi Borrelia burgdorferi ELISA western blot Borrelia sp αίκα, δερκαηηθό Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Borrelia sp αίκα, δερκαηηθό Σσποποίεζε PCR, sequencing 7. Βξνπθέιιεο Brucella abortus αίκα, δείγκα ηζηού Καιιηέργεηα Καιιηέργεηα ζε ηρσβιία Brucella abortus αίκα, δείγκα ηζηού Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Brucella abortus αίκα, δείγκα ηζηού Σσποποίεζε PCR, sequencing Brucella abortus Παραγφγή αληηγόλοσ Brucella abortus θαζαρηζκός από ειεύζερο κέζο θαη MIC ζε ηρσβιίο Brucella melitensis αίκα, δείγκα ηζηού Καιιηέργεηα Καιιηέργεηα ζε ηρσβιία Brucella melitensis αίκα, δείγκα ηζηού Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR
Brucella melitensis αίκα, δείγκα ηζηού Σσποποίεζε PCR, sequencing Rose-Bengal SAT SAT-DTT SAT-Coombs ELISA (IgM,IgG, IgA) ζύλδεζε ζσκπιερώκαηος (CF) ΑΝΑΣΡΟΦΗ ΑΝΟΟΗΛΔΚΣΡΟΦΟΡΗΗ (CIEP) ΑΝΟΟΓΙΑΥΤΗ Δ ΑΓΑΡ (ID) Αθηηλφηή αλοζοδηάτσζε (RID) Brucella suis αίκα, δείγκα ηζηού Καιιηέργεηα Καιιηέργεηα ζε ηρσβιία Brucella suis αίκα, δείγκα ηζηού Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Brucella suis αίκα, δείγκα ηζηού Σσποποίεζε PCR, sequencing 8. Κακππινβαθηεξίδηα Campylobacter spp Κόπραλα Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Campylobacter spp Κόπραλα Σσποποίεζε 9. Candida
Candida θοιπηθό επίτρηζκα, ηρατειηθό Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR, Real-Time PCR 10. Υιακύδηα Chlamydia pneumoniae Chlamydia pneumoniae βρογτηθό έθπισκα Γολοησπηθή αλίτλεσζε (IgM,IgG) PCR Chlamydia trachomatis Chlamydophilla psittaci οσρεζρηθό έθθρηκα, θοιπηθό επίτρηζκα, ηρατειηθό βρογτηθό έθπισκα Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR 11. Coxiella burnetii Coxiella burnetii Coxiella burnetii αίκα, πηύεια, πιεσρηηηθό σγρό, ράκκαηα, θαρσγγηθό/βρογτηθό έθπισκα, ηζηός αίκα, πηύεια, πιεσρηηηθό σγρό, ράκκαηα, θαρσγγηθό/βρογτηθό έθπισκα, ηζηός Άκεζε αλίτλεσζε παζογόλοσ Καιιηέργεηα Άκεζος αλοζοθζορηζκός DFA shell-vial method/θσηηαροθαιιηέρ γεηα Coxiella burnetii αίκα, πηύεια, πιεσρηηηθό σγρό, ράκκαηα, θαρσγγηθό/βρογτηθό έθπισκα, ηζηός Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR, Real-Time PCR, nested PCR Coxiella burnetii αίκα, πηύεια, πιεσρηηηθό σγρό, ράκκαηα, θαρσγγηθό/βρογτηθό έθπισκα, ηζηός Σσποποίεζε PCR-RFLP, sequencing Coxiella burnetii Παραγφγή αληηγόλοσ /Re nographin gradient Coxiella burnetii MIC ζε Coxiella burnetii θάζε I Άκεζος αλοζοθζορηζκός DFA Coxiella burnetii θάζε II/Ι (IgM,IgG, IgA) 12. Κξππηόθνθθνο Cryprococcus Έλσ Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR, Real-Time PCR
13. Δληεξόθνθθνη Enterococcus spp Κόπραλα Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Enterococcus spp Κόπραλα Σσποποίεζε Enterococcus spp MIC ζε ηρσβιίο 14. Escherichia coli Escherichia coli Κόπραλα Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Escherichia coli Κόπραλα Σσποποίεζε 15. Φξαλζηζέιιεο Fransicella spp αίκα, δερκαηηθό Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Fransicella spp αίκα, δερκαηηθό Σσποποίεζε PCR, sequencing 16. Λεγησλέιιεο Legionella sp Legionella sp βρογτηθό έθπισκα, λερά περηβάιιοληος βρογτηθό έθπισκα, λερά περηβάιιοληος Καιιηέργεηα Καιιηέργεηα ζε ηρσβιία Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR, Real-Time PCR Legionella sp βρογτηθό έθπισκα, λερά περηβάιιοληος Σσποποίεζε Legionella pneumophila (IgM,IgG) Legionella pneumophila Οροησποποίεζε Σασηοποίεζε ορόησποσ Legionella pneumophila βρογτηθό έθπισκα, λερά περηβάιιοληος Άκεζε αλίτλεσζε παζογόλοσ Άκεζος αλοζοθζορηζκός DFA
Legionella pneumophila Παραγφγή αληηγόλοσ θαζαρηζκός από ειεύζερο κέζο θαη Legionella pneumophila MIC ζε ηρσβιίο Legionella pneumophila Legionella pneumophila βρογτηθό έθπισκα, λερά περηβάιιοληος βρογτηθό έθπισκα, λερά περηβάιιοληος Καιιηέργεηα Καιιηέργεηα ζε ηρσβιία Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR, Real-Time PCR Legionella pneumophila βρογτηθό έθπισκα, λερά περηβάιιοληος Σσποποίεζε Legionella spp MIC ζε ηρσβιίο 17. Λετζκάληεο Leishmania spp (IgM,IgG) Leishmania spp western blot Leishmania spp αίκα, κσειός οζηώλ Καιιηέργεηα Leishmania spp αίκα, κσειός οζηώλ Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR, Real-Time PCR Leishmania spp αίκα, κσειός οζηώλ Σσποποίεζε PCR, Real-Time PCR Leishmania spp MIC ζε Leishmania spp Παραγφγή αληηγόλοσ θαζαρηζκός από ειεύζερο κέζο θαη 18. Λεπηόζπεηξεο Leptospira spp (IgM,IgG)
Leptospira spp Haemaglutination Leptospira spp αίκα, ούρα Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR, nested PCR Leptospira spp αίκα, ούρα Σσποποίεζε PCR, nested PCR 19. Ληζηέξηεο Listeria monocytogenes Κόπραλα Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Listeria monocytogenes Κόπραλα Σσποποίεζε PCR, PFGE, ρηβοησπία, sequencing 20. Μπθνβαθηεξίδην Mycobacterium tuberculosis βρογτηθό έθπισκα Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR 21. Μπθνπιάζκαηα Mycoplasma hominis οσρεζρηθό έθθρηκα, ζπέρκα Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Mycoplasma pneumoniae Mycoplasma sp βρογτηθό έθπισκα πηύεια, θαρσγγηθό/ηρατειηθό/θοιπηθό/ βρογτηθό/οσρεζρηθό επίτρηζκα Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR 22. Ρηθέηζηεο Rickettsia conorii (IgM,IgG, IgA) Rickettsia conorii western blot Rickettsia conorii αίκα, δερκαηηθό, Άκεζε αλίτλεσζε παζογόλοσ Άκεζος αλοζοθζορηζκός DFA
Rickettsia conorii Rickettsia conorii αίκα, δερκαηηθό, αίκα, δερκαηηθό, Καιιηέργεηα shell-vial method/θσηηαροθαιιηέρ γεηα Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR, Real-Time PCR Rickettsia conorii αίκα, δερκαηηθό, Σσποποίεζε PCR-RFLP, sequencing Rickettsia conorii Παραγφγή αληηγόλοσ /Re nographin gradient Rickettsia conorii MIC ζε Rickettsia typhi (IgM,IgG, IgA) Rickettsia typhi western blot Rickettsia typhi αίκα, δερκαηηθό, Άκεζε αλίτλεσζε παζογόλοσ Άκεζος αλοζοθζορηζκός DFA Rickettsia typhi αίκα, δερκαηηθό, Καιιηέργεηα shell-vial method/θσηηαροθαιιηέρ γεηα Rickettsia typhi αίκα, δερκαηηθό, Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR, Real-Time PCR Rickettsia typhi αίκα, δερκαηηθό, Σσποποίεζε PCR-RFLP, sequencing Rickettsia typhi Παραγφγή αληηγόλοσ /Re nographin gradient Rickettsia typhi MIC ζε
23. αικνλέιιεο Salmonella spp Οροησποποίεζε Σασηοποίεζε ορόησποσ Salmonella spp Κόπραλα Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Salmonella spp Κόπραλα Σσποποίεζε 24. STDs sexual transmitted pathogens οσρεζρηθό έθθρηκα, θοιπηθό επίτρηζκα, ηρατειηθό Γολοησπηθή αλίτλεσζε ποιιαπιό PCR 25. ηαθπιόθνθθνη Staphylococcus spp Αίκα, πύολ Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Staphylococcus spp Αίκα, πύολ Σσποποίεζε Staphylococcus spp MIC ζε ηρσβιίο 26. ηξεπηόθνθθνη Streptococcus spp Αίκα, πύολ Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Streptococcus spp Αίκα, πύολ Σσποποίεζε
27. Tropheryma whipplei Tropheryma whipplei αίκα, δφδεθαδαθη σγρό, εληερηθό σγρό, ΔΝΤ Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR Tropheryma whipplei αίκα, δφδεθαδαθη σγρό, εληερηθό σγρό, ΔΝΤ Σσποποίεζε PCR, sequencing 28. Οπξεάπιαζκα Ureaplasma urealyticum οσρεζρηθό έθθρηκα, θοιπηθό επίτρηζκα, ηρατειηθό Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR 29. Yersinia Yersinia Κόπραλα Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR 30. Ινί Ιοί βρογτηθό έθπισκα, Γολοησπηθή αλίτλεσζε Real-Time PCR Ιός Γσηηθού Νείιοσ ELISA 31. Σνμόπιαζκα Toxoplasma spp (IgM,IgG) Toxoplasma spp western blot Toxoplasma spp αίκα Καιιηέργεηα
Toxoplasma spp αίκα Γολοησπηθή αλίτλεσζε PCR, Real-Time PCR Toxoplasma spp αίκα Σσποποίεζε PCR, Real-Time PCR * Eφαρμογή Πρότσπης Μεθόδοσ