ΠΑΡΕΥΟΜΕΝΕ ΤΠΗΡΕΙΕ Κ.Ε.Δ.Τ. ΣΟΜΔΑ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ 1. ΣΜΗΜΑ ΝΔΡΩΝ Είδνο Δείγκαηνο Εμεηαδόκελε παξάκεηξνο Μέζνδνο Πξόηππν Καηάζηαζε 1. Νεξά αλζξώπηλεο θαηαλάισζεο, θπζηθά κεηαιιηθά λεξά, επηθαλεηαθά λεξά, λεξά θνιπκβεηηθώλ δεμακελώλ θαη λεξά αλαςπρήο 1. Καηακέηξεζε θαιιηεξγήζηκωλ κηθξννξγαληζκώλ-μέηξεζε απνηθηώλ κε εκβνιηαζκό ζε ζξεπηηθό πιηθό agar ζηνπο 22 2 ν C θαη ζηνπο 36 2 ν C 2.Αλίρλεπζε θαη θαηακέηξεζε Pseudomonas aeruginosa Δλζωκάηωζεο Γηήζεζεο από κεκβξάλεο (MF) 6222:2000 16266:2009 2. Νεξά αλζξώπηλεο θαηαλάισζεο, θπζηθά κεηαιιηθά λεξά θαη επηθαλεηαθά λεξά πνπ πξννξίδνληαη γηα αλζξώπηλε θαηαλάισζε 1. Αλίρλεπζε θαη θαηακέηξεζε Clostridium perfringens ζπκπεξηιακβαλνκέλωλ ηωλ ζπνξίωλ Γηήζεζεο από κεκβξάλεο (MF) 2. Αλίρλεπζε Salmonella spp. Πξν-εκπινπηηζκνύ θαη δηήζεζεο από κεκβξάλεο (MF) Παξάξηεκα ΙΙΙ ηεο ΚΤΑ Τ2/2600/2001 όπωο ηξνπνπνηήζεθε θαη ηζρύεη ISO 19250:2010 3. Νεξά αλζξώπηλεο θαηαλάισζεο, θπζηθά κεηαιιηθά λεξά, επηθαλεηαθά λεξά, ζαιάζζηα λεξά, λεξά θνιπκβεηηθώλ δεμακελώλ θαη λεξά αλαςπρήο 1.Αλίρλεπζε θαη θαηακέηξεζε θνινβαθηεξηνεηδώλ θαη E. coli 2.Αλίρλεπζε θαη θαηακέηξεζε εληεξνθόθθωλ εληεξηθήο πξνέιεπζεο Γηήζεζεο από κεκβξάλεο (MF) Γηήζεζεο από κεκβξάλεο (MF) 9308.01: 2001 7899.02: 2001 4. Νεξά αλζξώπηλεο θαηαλάισζεο 1. Αλίρλεπζε E.coli O157:H7 Πξν-εκπινπηηζκνύ θαη δηήζεζεο από κεκβξάλεο (MF) APHA 9260F 2. Αλίρλεπζε θαη θαηακέηξεζε Campylobacter spp Πξν-εκπινπηηζκνύ θαη δηήζεζεο από κεκβξάλεο (MF) ISO 17995:2005
Είδνο Δείγκαηνο Εμεηαδόκελε παξάκεηξνο Μέζνδνο Πξόηππν Καηάζηαζε 3. Αλίρλεπζε Vibrio spp. Πξν-εκπινπηηζκνύ APHA 9260H 1. Αλίρλεπζε θαη θαηακέηξεζε E.coli Γηήζεζεο από κεκβξάλεο (MF) ΔΛΟΣ EN ISO 9308-1:2001 5. Λύκαηα 2. Αλίρλεπζε θαη θαηακέηξεζε εληεξνθόθθωλ εληεξηθήο πξνέιεπζεο Γηήζεζεο από κεκβξάλεο (MF) ΔΛΟΣ EN ISO 7899-2:2001 6. Νεξό γηα αηκνδηάιπζε θαη ζρεηηθέο ζεξαπείεο 1. Καηακέηξεζε θαιιηεξγήζηκωλ κηθξννξγαληζκώλ Δλζωκάηωζεο ISO 13959:2009 7. Τγξό αηκνδηάιπζεο γηα αηκνδηάιπζε θαη ζρεηηθέο ζεξαπείεο 2. Καηακέηξεζε θαιιηεξγήζηκωλ κηθξννξγαληζκώλ Δλζωκάηωζεο θαη Γηήζεζεο από κεκβξάλεο (MF) ISO 11663:2009
1. ΣΜΗΜΑ ΣΡΟΦΙΜΩΝ ΚΑΙ ΔΜΦΙΑΛΩΜΔΝΩΝ ΝΔΡΩΝ Είδνο Δείγκαηνο Εμεηαδόκελε παξάκεηξνο Μέζνδνο Πξόηππν Καηάζηαζε 1. Σξόθηκα 1. Αλίρλεπζε Salmonella spp. Πξνεκπινπηηζκνύ ΔΛΟΣ ΔΝ 6579: 2003 2. Αλίρλεπζε ηεο Listeria monocytogenes Πξνεκπινπηηζκνύ 11290.01: 1997/Amd1:2004 3. Απαξίζκεζε ηεο Listeria monocytogenes Πξνεκπινπηηζκνύ θ Δπίζηξωζεο 11290.02: 1999/Amd 1:2004 4. Αλίρλεπζε E. coli Ο157:Η7 Πξνεκπινπηηζκνύ 16654:2001 5. Καηακέηξεζε ηαθπινθόθθωλ ζεηηθώλ ζηελ θναγθνπιάζε (τρσζίζων ζηαθσλοκόκκος και άλλα είδη) Δπίζηξωζεο 6888.01: 1999/ Αmd1:2004 6. Καηακέηξεζε B. cereus Δπίζηξωζεο ISO 7932:2004 7. Οξηδόληηα κέζνδνο γηα ηελ απαξίζκεζε ηωλ κηθξννξγαληζκώλ Σερληθή κέηξεζεο απνηθηώλ ζηνπο 30 O C 8. Αλίρλεπζε θαη θαηακέηξεζε εληεξνβαθηεξηαθώλ Δλζωκάηωζεο ISO 4833:2003 Δλζωκάηωζεο ISO 21528-2:2004 9. Αλίρλεπζε Vibrio spp. (V. cholera θαη V. parahaemolyticus) Πξν-εκπινπηηζκνύ ISO 21872-1:2007 10. Kαηακέηξεζε (Cl. perfringens) Δλζωκάηωζεο ISO 7937:2004 11. Καηακέηξεζε δπκώλ θαη κπθήηωλ α) ζε ηξόθηκα Δπίζηξωζεο ISO 21527-1:2008 β) ζε γαιαθηνθνκηθά πξνϊόληα Δλζωκάηωζεο ISO 6611:2004 12. Καηακέηξεζε νμπγαιαθηηθώλ βαθηεξίωλ Δλζωκάηωζεο ISO 15214:1998
Είδνο Δείγκαηνο Εμεηαδόκελε παξάκεηξνο Μέζνδνο Πξόηππν Καηάζηαζε 13. Αλίρλεπζε θαη θαηακέηξεζε Campylobacter spp Πξν-εκπινπηηζκνύ ISO 10272-1:2006 14. Αλίρλεπζε Enterobacter sakazakii ζε γαιαθηνθνκηθά πξνϊόληα Πξν-εκπινπηηζκνύ ISO 22964:2006 15. Ε. coli O104 Δλζωκάηωζεο 16. ηαθπινθνθθηθέο εληεξνηνμίλεο Αλνζν-ελδπκηθή (Vidas) 17. Καηακέηξεζε ηωλ β- γιπθνπξνληδάζε ζεηηθώλ Escherichia coli Δλζωκάηωζεο ISO 16649-2:2001
2. ΣΜΗΜΑ ΣΡΟΦΙΜΟΓΔΝΩΝ ΛΟΙΜΩΞΔΩΝ (ΚΔΝΣΡΟ ΑΝΑΦΟΡΑ ΑΛΜΟΝΔΛΛΩΝ ΚΑΙ ΙΓΚΔΛΛΩΝ) Μηθξννξγαληζκόο Εμέηαζε Μέζνδνο Πξόηππν Καηάζηαζε 1. Κιηληθά & πεξηβαιινληηθά ζηειέρε αικνλειιώλ 1. Οξνηππία ζηειερώλ ζαικνλέιιαο Οξνζπγθόιιεζε επί πιαθόο White Kauffmann Le Minor Scheme_2007, 9 ε έθδνζε 2. Έιεγρνο Μηθξνβηαθήο Αληνρήο ηεο Salmonella spp.ζε: Ampicillin, Cefotaxime, Amoxicillin+clavoulanic acid, Ceftazidime, Chloramphenicol, Tetracycline, Trimethoprim, Nalidixic, Amikacin, Ciprofloxacin, Streptomycin, Kanamycin, Netilmicin, Tobramycin Μέζνδνο Γηάρπζεο κε Γίζθνπο CLSI:Μ2- Α11, Vol. 32, No. 1 CLSI:M100- S23, Vol.33, No.1 2. Shigella Οξνηππία ζηειερώλ ζηγθέιιαο Οξνζπγθόιιεζε επί πιαθόο Αληηγνληθό ρήκα Σππνπνίεζεο 3. E. coli Αλίρλεπζε Οξνηύπνπ O:157 Σαρεία Οξνζπγθόιιεζε επί πιαθόο & νξνζπγθόιιεζε ζε ζωιήλα Αληηγνληθό ρήκα Σππνπνίεζεο 4. Κιηληθά & πεξηβαιινληηθά ζηειέρε Ε. coli (VTEC) Αλίρλεπζε γνληδίωλ ηνμηλώλ (vtx1 θαη vtx2) Αιπζηδωηή Αληίδξαζε Πνιπκεξάζεο (PCR) Εζωηερική Μέθοδος (ΜΔ -27) Bάζεη ηνπ πξνηεηλόκελνπ πξωηνθόιινπ ηωλ: WHO Collaborating Centre for Reference and Research on E.coli Statens Serum Insitut, EU Reference Laboratory VTEC - Instituto Superiore di Sanita NAI
Μηθξννξγαληζκόο Εμέηαζε Μέζνδνο Πξόηππν Καηάζηαζε 5. Κιηληθά & πεξηβαιινληηθά ζηειέρε Ε. coli (VTEC) Δύξεζε ππόηππνπ γνληδίωλ ηνμηλώλ Αιπζηδωηή Αληίδξαζε Πνιπκεξάζεο (PCR) 6. Κιηληθά & πεξηβαιινληηθά ζηειέρε Ε. coli Αλίρλεπζε γνληδίωλ ινηκνγνληθόηεηαο άιιωλ παζνηύπωλ E.coli (ipah γηα Enteroinvasive, lt,sth,stp γηα Enterotoxigenic, aaic, aggr γηα Entreroaggregative, eae γηα Enteropathogenic E.coli) Αιπζηδωηή Αληίδξαζε Πνιπκεξάζεο (PCR) 7. Κιηληθά & πεξηβαιινληηθά ζηειέρε Ε. coli Δύξεζε νξόηππνπ (10 ζπρλόηεξνη νξόηππνη ζηελ Δ.Δ.) Αιπζηδωηή Αληίδξαζε Πνιπκεξάζεο (PCR) 8. Salmonella, Shigella, E. coli Μνξηαθή Σππνπνίνεζε PFGE ρεηηθά πξωηόθνιια: Pulsenet 9. Salmonella Πξνζδηνξηζκόο κνλνθαζηθώλ ζηειερώλ S.Typhimurium Αιπζηδωηή Αληίδξαζε Πνιπκεξάζεο (PCR) EFSA Journal 2010;8(10):1826
3. ΣΜΗΜΑ ΜΔΛΔΣΗ LEGIONELLA (ΚΔΝΣΡΟ ΑΝΑΦΟΡΑ LEGIONELLA Ν. ΔΛΛΑΓΟ ) Είδνο Δείγκαηνο Εμεηαδόκελε παξάκεηξνο Μέζνδνο Πξόηππν Καηάζηαζε 1. Νεξά Αλζξώπηλεο θαηαλάισζεο, λεξά θνιπκβεηηθώλ δεμακελώλ, λεξά αλαςπρήο θαη άιια είδε λεξώλ 1. Αλίρλεπζε θαη θαηακέηξεζε ηωλ Legionella spp. 2. Αλίρλεπζε θαη θαηακέηξεζε ηωλ Legionella spp. - Μέξνο 2: γηα λεξά κε ρακειέο βαθηεξηαθέο κεηξήζεηο Γηήζεζεο από κεκβξάλεο (MF) ISO 11731:1998 Μέζνδνο άκεζεο δηήζεζεο δηα κεκβξάλεο ISO 11731-2: 2004 2. Ξέζκαηα ζσιελώζεσλ, δείγκαηα κε ζηπιεό Αλίρλεπζε Legionella spp. Καιιηέξγεηα ζε εθιεθηηθά ζξεπηηθά πιηθά γηα Legionella (GVPC, BCYE, θ.α.) 3. Κιηληθά δείγκαηα (πηύεια, βξνγρηθέο εθθξίζεηο, βξνγρνθπςειηδηθό έθθξηκα) Αλίρλεπζε Legionella spp. Καιιηέξγεηα ζε εθιεθηηθά ζξεπηηθά πιηθά γηα Legionella (BCYE, θ.α.) Manual of the American Society for Microbiology (2004) 4. Μηθξνβηαθό ζηέιερνο Legionella Σαπηνπνίεζε είδνπο Οξνηππία (κε ρξήζε αληηνξώλ γηα L. pneumophila, L. bozemanii, L. micdadei, L. gormanii θηι 5. Μηθξνβηαθό ζηέιερνο Legionella Σππνπνίεζε AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) 6. Επηδεκηνινγηθή ηππνπνίεζε πεξηβαιινληηθώλ θαη θιηληθώλ δεηγκαησλ γηα Legionella pneumophila Μνξηαθή Σππνπνίεζε Sequence-Based Typing (SBT) EWGLI, (αξρηθά έθδνζε 4.1-14/10/2008θαη πιένλ έθδνζε 5.0-08/10/2012)
4. ΣΜΗΜΑ ΜΔΛΔΣΗ ΣΗ ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΗ ΑΝΣΟΥΗ & ΝΟΟΚΟΜΔΙΑΚΩΝ ΛΟΙΜΩΞΔΩΝ (WHONET) Εμέηαζε Μέζνδνο Πξόηππν Καηάζηαζε 1. Κιηληθά & πεξηβαιινληηθά ζηειέρε ινηπώλ Εληεξνβαθηεξηαθώλ Έιεγρνο Μηθξνβηαθήο Αληνρήο ζε: Ampicillin, Amoxicillin+clavoulanic acid, Piperacillin, Piperacillin +tazobactam, Ticarcillin,Ticarcillin+clavoulani cacid, Cefoxitin, Cephalothin, Cefotaxime, Ceftazidime, Cefepime, Aztreonam, Imipenem, Meropenem, Ertapenem, Doripenem, Tetracycline, Sulphamethoxazole+ Trimethoprim, Amikacin, Gentamicin, Ciprofloxacin Μέζνδνο Γηάρπζεο κε Γίζθνπο CLSI:Μ2- Α11, Vol. 32, No. 1 CLSI:M100- S23, Vol.33 No.1 2. Έιεγρνο επαηζζεζίαο Πξνζδηνξηζκόο Διάρηζηεο Αλαζηαιηηθήο Ππθλόηεηαο (EAΠ-ΜΙC) κε ηαηλίεο etest Οδεγίεο Καηαζθεπαζηή 3. Εθηέιεζε θαηλνηππηθώλ δνθηκαζηώλ γηα παξνπζία β- ιαθηακαζώλ Combination and/ or approximation test with inhibitors CLSI: M100-S20-U Βηβιηνγξαθία 4. Aλίρλεπζε παξνπζίαο γνληδίσλ αληνρήο γλσζηώλ λεώηεξσλ β- ιαθηακαζώλ (CTX-M, CMY, DHA) θαη θαξβαπαλεκαζώλ (IMP, NDM, OXA) PCR 5. Εληνπηζκόο λενεκθαληδόκελσλ γνληδίσλ β-ιαθηακαζώλ θαη πξνζδηνξηζκόο ηεο λνπθιενηηδηθήο ηνπο αιιεινπρίαο (sequencing) PCR-Αιιεινύρεζε 6. Υαξηνγξάθεζε γελεηηθνύ πεξηβάιινληνο γνληδίσλ αληνρήο PCR-Αιιεινύρεζε
Εμέηαζε Μέζνδνο Πξόηππν Καηάζηαζε 7. Μνξηαθή Σππνπνίεζε Πξνζδηνξηζκόο αιιεινπρίαο πνιπγελεηηθώλ ηόπωλ (MLST) 8. Έιεγρνο κεηαβηβαζηκόηεηαο γνληδίσλ αληνρήο κειέηε πιαζκηδίσλ Πεηξάκαηα ζύδεπμεο Μεηακόξθωζεο Αλίρλεπζε πιαζκηδίωλ DNA ειεθηξνθόξεζε 9. Κιηληθά & πεξηβαιινληηθά ζηειέρε Εληεξνβαθηεξηαθώλ 1. Σππνπνίεζε βαθηεξηδίωλ Εζωηερική Μέθοδος (ΜΔ-26) κε ηε ρξήζε πεξηνξηζηηθώλ ελδύκωλ θαη ειεθηξνθόξεζε ηωλ ζξαπζκάηωλ DNA ζε παιιόκελν ειεθηξηθό πεδίν γέιεο (Pulsed Field Gel Electrophoresis PFGE) 2. Αλίρλεπζε ηωλ γνληδίωλ αληνρήο ζηα αληηβηνηηθά blakpc & blavim Εζωηερική Μέθοδος (ΜΔ-25) Αιπζηδωηή Αληίδξαζε Πνιπκεξάζεο (PCR)
ΣΟΜΔΑ ΥΗΜΔΙΑ ΣΜΗΜΑ ΥΗΜΔΙΑ ΝΔΡΟΤ & ΣΡΟΦΙΜΩΝ Είδνο Δείγκαηνο Εμεηαδόκελε παξάκεηξνο Μέζνδνο Πξόηππν Καηάζηαζε 1. Πξνζδηνξηζκόο νιηθήο ζθιεξόηεηαο Ογθνκεηξηθή APHA* 2340 C 2. Πξνζδηνξηζκόο αζβεζηίνπ Ογθνκεηξηθή APHA* 3500-Ca B 1. Νεξά αλζξώπηλεο θαηαλάισζεο, θπζηθά κεηαιιηθά λεξά, επηθαλεηαθά λεξά, λεξά θνιπκβεηηθώλ δεμακελώλ 3. Πξνζδηνξηζκόο καγλεζίνπ Τπνινγηζηηθή APHA* 3500 -Mg B 4. Πξνζδηνξηζκόο ριωξηόληωλ Ογθνκεηξηθή APHA* 4500 - Cl - B 5. Πξνζδηνξηζκόο αιθαιηθόηεηαο Ογθνκεηξηθή APHA* 2320 B 6. Πξνζδηνξηζκόο νιηθώλ δηαιειπκέλωλ ζηεξεώλ (TDS) ζηνπο 180 C ηαζκηθή APHA* 2540 C 2. Νεξά αλζξώπηλεο θαηαλάισζεο, θπζηθά κεηαιιηθά λεξά, επηθαλεηαθά λεξά θαη ιύκαηα 1. Πξνζδηνξηζκόο νιηθώλ αηωξνύκελωλ ζηεξεώλ (ΣSS) ζηνπο 103-105 C ηαζκηθή Εζωηερική Μέθοδος (ΜΔ- 108) βαζηζκέλε ζηελ APHA* 2540 D θαη ΔΛΟΣ ΔΝ 872:2005 2. Πξνζδηνξηζκόο ph Με phκεηξν APHA* 4500-H + Β 3. Πξνζδηνξηζκόο αγωγηκόηεηαο Με Αγωγηκόκεηξν APHA* 2510 B 3. Mε επεμεξγαζκέλα λεξά αλζξώπηλεο θαηαλάισζεο, λεξά θπζηθά κεηαιιηθά, επηθαλεηαθά, ππόγεηα λεξά θαη ιύκαηα Πξνζδηνξηζκόο Νηηξωδώλ Φωηνκεηξηθή MERCK 114547- WTW N5/25, κε θωηνκεηξία 4. Νεξά αλζξώπηλεο θαηαλάισζεο, θπζηθά κεηαιιηθά λεξά, επηθαλεηαθά, ππόγεηα λεξά θαη ιύκαηα 1. Πξνζδηνξηζκόο Νηηξηθώλ Φωηνκεηξηθή 2. Πξνζδηνξηζκόο Θεηηθώλ Φωηνκεηξηθή MERCK 114563- WTW N2/25, κε θωηνκεηξία MERCK 114548- WTW 14548, κε θωηνκεηξία 5. Νεξά αλζξώπηλεο θαηαλάισζεο, θπζηθά κεηαιιηθά 1. Πξνζδηνξηζκόο ζηδήξνπ Φωηνκεηξηθή MERCK 114549- WTW 14549, κε θωηνκεηξία
Είδνο Δείγκαηνο Εμεηαδόκελε παξάκεηξνο Μέζνδνο Πξόηππν Καηάζηαζε 2. Πξνζδηνξηζκόο θζνξηνύρωλ Φωηνκεηξηθή MERCK 100809 κε θωηνκεηξία 6. Νεξά αλζξώπηλεο θαηαλάισζεο, θπζηθά κεηαιιηθά λεξά, επηθαλεηαθά, ππόγεηα λεξά Πξνζδηνξηζκόο εμαζζελνύο ρξωκίνπ Φωηνκεηξηθή MERCK 114758, κε θωηνκεηξία 7. Φπζηθά κεηαιιηθά, επηθαλεηαθά, ππόγεηα λεξά θαη ιύκαηα Πξνζδηνξηζκόο ηόληωλ Ακκωλίνπ Φωηνκεηξηθή MERCK 114558- WTW A6/25, κε θωηνκεηξία 1. Πξνζδηνξηζκόο Βηνρεκηθά Απαηηνύκελνπ Ομπγόλνπ (BOD) 5 εκεξώλ Μαλνκεηξηθή Εζωηερική Μέθοδος (ΜΔ- 111) βαζηζκέλε ζηελ APHA* 5210 D 8. Λύκαηα 2. Πξνζδηνξηζκόο Υεκηθά Απαηηνύκελνπ Ομπγόλνπ (COD) Φωηνκεηξηθή Εζωηερική Μέθοδος (ΜΔ- 110) βαζηζκέλε ζηελ APHA* 5220 D 9. Tξόθηκα Πξνζδηνξηζκόο ph Με phκεηξν APHA* 4500-H + Β APHA*: American Public Health Association, American Water Works Association, Water Environment Federation, Standard Methods for the Examination of Water and Wastewater, 22st Edition, 2012