Αριθμός άρθρων στη βάση Pubmed 7000 6000 microbiota 6208 5000 microbiome 5254 4000 3000 2000 1000 1149 1269 0 286 296 152 171 35 36 1 2 3 4 5 1990 2000 2005 2010 2015
Ο «σύγχρονος» τρόπος παρουσίασης της γνώσης Ο «παραδοσιακός» τρόπος παρουσίασης της γνώσης
κοινότητα των μικροoργανισμών που διαβιούν στη γαστρεντερική περιοχή ενός ατόμου και αποτελείται από μέλη των βακτηρίων, των ιών τους (φάγων), των αρχαίων (archaea), των μυκήτων, καθώς και των ευκαρυωτικών μικροοργανισμών και επομένως μπορεί να χαρακτηριστεί ως μικροχλωρίδα του εντέρου. Το σύνολο των γονιδίων των μικροοργανισμών της εντερικής μικροχλωρίδας ενός ατόμου
Το σύνολο του γενετικού υλικού που απομονώνεται απο ένα οικοσύστημα (κόπρανα, βλεννογόνος) Το σύνολο των mrnas (ενεργά γονίδια) που απομονώνεται απο ένα οικοσύστημα Το σύνολο των πρωτεινών που απομονώνεται απο ένα οικοσύστημα (κόπρανα, βλεννογόνος) Το σύνολο των μικρομοριακών μεταβολιτών που υπάρχουν σε ένα οικοσύστημα Το οικοσύστημα αναλύεται σαν ένας ενιαίος οργανισμός
Συνομοταξία ή φύλο Ομοταξία ή κλάση Τάξη Οικογένεια Γένος Phylum Class Taxa Family Genus
Bacteroidetes dominance Prevotella dominance Ruminococcus dominance Arumugam, M., et al. (2011) Nature
Το μικροβίωμα διαφέρει μεταξύ νεογνών και ενηλίκων Το μικροβίωμα διαφέρει μεταξύ κατοίκων διαφορετικών χωρών
AIH HR 5.84 PSC HR 4.46 PSC 1.4 7.5% PBC HR 10.16 NAFLD HR 6.06 NAFLD 10% Ludwigson et al. Clin Gastroenterol Hepatol 2007 KARMIRIS et al. JCC 2016
Χολικά άλατα [εντερο-ηπατική κυκλοφόρία] Πυλαία Φλέβα [αποχέτευση του εντερικού βλεννογόνου]
Κίρρωση NAFLD, ALD, AUTOIMMUNE LIVER DISEASE
Ομοιοστασία εντερικού βλεννογόνου Εντερική χλωρίδα (10 12 μικροοργανισμοί/gm) Βλεννογονικοί φραγμοί Βλεννογονικό ανοσολογικό σύστημα (10 6 λεμφοκύτταρα/gm)
Η επίδραση της εντερικής ομοιοστασίας στο ήπαρ Λειτουργικός φραγμός Προστατευτική/αντι-φλεγμονώδης ανοσολογική αντίδραση έναντι εξωγενών αντιγόνων Ανοσοανοχή
Δυσλειτουργία εντερικού βλεννογόνου Εντερική χλωρίδα (10 12 μικροοργανισμοί/gm) Διαταραχή μικροβιώματος Βακτηριακή υπερανάπτυξη Βλεννογονικοί φραγμοί Ανεπάρκεια αντιμικροβιακού φραγμού Αύξηση διαπερατότητας Διαταραχή ανοσολογικής επιτήρησης Βλεννογονικό ανοσολογικό σύστημα (10 6 λεμφοκύτταρα/gm)
Η επίδραση της εντερικής δυσλειτουργίας στο ήπαρ Ανεπαρκής φραγμός Υπέρμετρη/διαρκής ενεργοποίηση προ-φλεγμονωδών μηχανισμών
Παθολογικός μηχανισμός Διαταραχή στη σύνθεση του μικροβιώματος Σύνδρομο υπερανάπτυξης μικροβίων στο λεπτό έντερο Αυξημένη διαπερατότητα του εντερικού επιθηλίου Διαταραχή ανοσολογικής αντίδρασης Διαταραχή μεταβολικής δραστηριότητας Νοσήματα στα οποία έχει παρατηρηθεί Κίρρωση NAFLD /NASH ALCOHOL- RELATED PBC PSC AIH
NATURE 2016
Δείκτης δυσβίωσης = Ευεργετικά Δυνητικά Παθογόνα Οι κιρρωτικοί ως σύνολο δεν διαχωρίζονται απο τον υγιή πληθυσμό ΑΛΛΑ διαχωρίζονται απο τον υγιή πληθυσμό υποομαδες κιρρωτικών Νοσηλεία Οργανική ανεπάρκεια Θάνατος J Hepatol. 2014 May ; 60(5): 940 947
Patient Discrimination Index (PDI): Καθορίζεται απο τη παρουσία 15 γονιδιακών βιοδεικτών και μπορεί να διακρίνει τους κιρρωτικούς με μεγάλη ειδικότητα Qin Ν, Nature 2014
Ηπατική νόσος Υπερανάπτυξη μικροβίων λεπτό έντερο
LPS scd14 β1 defensin Vlachogiannakos et al. 2009 Kaltsa et al. 2016
Ισχυρή συσχέτιση μεταξύ β1-defensin και scd14 στην ηπατική κυκλοφορία Ισχυρή επίδραση εντερικής «αποστείρωσης» στην συγκέντρωση LPS στην ηπατική κυκλοφορία Vlachogiannakos et al. 2009; Kaltsa et al. 2016
Κίρρωση - Πυλαία υπέρταση Βακτηριδιακή υπερανάπτυξη Αύξηση διαπερατότητας ΑΒΠ Καχεξία Σήψη Ανοσοδιέγερση Δυσβίωση Υπερδυναμική κυκλοφορία Ηπατική εγκεφαλοπάθεια Ενδοτοξιναιμία Ανοσοανεπάρκειας Βακτηριακή αλόθεση Ανεπάρκεια εντερικού βλεννογονικού φραγμού
79 ACLF patients 16S ribosomal DNA pyrosequencing 50 healthy controls Σαφής διαφοροποίηση των ασθενών με ACLF Ελάττωση βιοποικιλότητας και αφθονίας Bacteroidaceae, Ruminococcaceae, and Lanchnospiraceae Pasteurellaceae, Streptococcaceae, and Enterecoccaceae. Lachnospiraceae συσχέτιση με εγκεφαλοπάθεια Pasteurellaceae συσχέτιση με θάνατο Συσχέτιση συγκεκριμένων μικροοργανισμών(ruminococcaceae and Lachnospiraceae) με φλεγμονώδεις κυτταροκίνες (IL-6, TNF, IL-2) J Gastroenterol Hepatol 2015
Am J Gastroenterol 2016
First hits Second hits MICROBIOME
Ποντίκια χωρίς χλωρίδα (GF) δεν αναπτύσσουν παχυσαρκία ακόμη και σε διατροφή με πολύ λίπος και πολύ λίπος και υδατάνθρακες Ridaura et al. Science 2013, Walker AW et al. Science 2013
Διαφορετική μικροχλωρίδα μεταξύ παχύσαρκων και λεπτών ατόμων Οι ακριβείς μεταβολές δεν εχουν ταυτοποιηθεί Firmicutes/Bacteroidetes ratio A core gut microbiome in obese and lean twins Nature 2009 Η απώλεια βάρους σχετίζεται με διόρθωση της δυσβίωσης Turnbaugh PJ, Nature 2006;444:1027e31
GASTROENTEROLOGY 2012;143:913 916
Αφρικανικού-τύπου διατροφή Φυτικές ινες Υδατάνθρακες Δυτικού τύπου διατροφή Πρωτείνη Ζωικό λίπος Prevotella Bacteriodetes παχυσαρκία
Ανεπάρκεια inflammasome (NLRP6, NLRP3, IL-18) Δυσβιωτική χλωρίδα Prevotellaceae, Porphyromonadaceae, TM7 taxa Μικροβιακοί συνδέτες TLR4 and TLR9 στη πυλαία κυκλοφορία Ενδοηπατική παραγωγή TNF Στεατοηπατίτιδα
Diabetes56:1761 1772, 2007
Μικρότερη παραγωγή προφλεγμονωδών κυτταροκινών Μικρότερη ηπατική στεάτωση AJP-Gastrointest Liver Physiol 2011
Zhu L Hepatology 2013
Rao et al. 2008
Gastroenterology 2014;146:1513 1524
Killing bad bacteria : antibiotics Altering bacterial composition: probiotics Novel approaches Synthetic carbons acting locally as adsorbents FXR agonists Beta-blockers Targeting TLR pathway Fecal transplantation
Kalambokis, et al. CGH 2012; Vlachogiannakos et al. AP&T 2009
Ερωτήματα Η δυσβίωση αίτιο η αποτέλεσμα? Ποια είναι η καλή χλωρίδα? Μπορεί να διορθωθεί η δυσβίωση σε μεγάλη κλίμακα?