Ταυτοποίηση βακτηρίων: συμβατικές και αυτοματοποιημένες μέθοδοι.

Σχετικά έγγραφα
Ταυτοποίηση βακτηρίων: συμβατικές και αυτοματοποιημένες μέθοδοι

Ταυτοποίηση βακτηρίων: συμβατικές και αυτοματοποιημένες μέθοδοι. Αναστασία Πάγκαλη Βιοπαθολόγος Κλινικός Μικροβιολόγος

Ταυτοποίηση Gram-αρνητικών αναεροβίων βακτηρίων

Ταυτοποίηση Gram-αρνητικών αναεροβίων βακτηρίων

Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών. Χρώση Gram. Δοκιμή καταλάσης. Δοκιμή οξειδάσης

ΙΑΤΡΙΚΗ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΙΙ

ISO/TS :2012 Kαταμέτρηση Salmonella spp μέθοδος mini MPN

Βασικές αρχές Ιατρικής Μικροβιολογίας

συγκέντρωσης αντιμυκητιακών για τον έλεγχο αντοχής των μυκήτων σε αντιμυκητιακά και

Περιγραφή και βασικός χειρισµός του οπτικού µικροσκοπίου.

ΙΑΤΡΙΚΗ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΙΙ

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

ΠΡΟΣ: Το Ψυχιατρικό Νοσοκομείο Αττικής έχοντας υπόψη:

ΔΗΜΟΚΡΙΤΕΙΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΘΡΑΚΗΣ ΤΜΗΜΑ ΙΑΤΡΙΚΗΣ

ΑΝΑΘΕΩΡΗΣΗ ΤΗΣ EN ISO 6579

ΚΕΦΑΛΑΙΟ IV ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ ΚΕΦΑΛΑΙΟ IV 1 V ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ

ΚΕΦΑΛΑΙΟ 8. Μεταβολισμός των Βακτηρίων

Εργαστηριακές Δοκιμασίες που πραγματοποιούνται στο Π.Ε.Δ.Υ Κρήτης.

ΤΟ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΚΛΙΝΙΚΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΣΤΟΝ ΕΛΕΓΧΟ ΤΩΝ ΝΟΣΟΚΟΜΕΙΑΚΩΝ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ

2 Ταινίες μέτρησης σακχάρου στο αίμα σε σακχαρόμετρο (ΣΕ ΚΟΥΤΙΑ) ΤΑΙΝΙΕΣ

ΙΖΗΜΑΤΙΝΟΑΝΤΙΔΡΑΣΕΙΣ

ΙΖΗΜΑΤΙΝΟΑΝΤΙΔΡΑΣΕΙΣ

ΕΛΛΗΝΙΚΗ ΗΜΟΚΡΑΤΙΑ ΥΠΟΥΡΓΕΙΟ ΥΓΕΙΑΣ

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

BD Triple Sugar Iron Agar (TSI Agar)

Προκαταρτική ταυτοποίηση Συμβατικές μέθοδοι. Μαρία Φουστούκου

ΜΕΘΟΔΟΙ ΑΝΙΧΝΕΥΣΗΣ ΚΑΙ ΑΡΙΘΜΗΣΗΣ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΩΝ ΠΟΥ ΒΡΙΣΚΟΝΤΑΙ ΣΕ ΧΑΜΗΛΟ ΠΛΗΘΥΣΜΟ ΣΤΑ ΤΡΟΦΙΜΑ

ΜΟΡΙΑΚΗ ΑΝΙΧΝΕΥΣΗ ΚΑΙ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΤΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΗΣ ΑΝΤΟΧΗΣ

Τίτλος Μαθήματος: Γενική Μικροβιολογία. Ενότητα: ΚΑΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ. Διδάσκων: Καθηγητής Ιωάννης Σαββαΐδης. Τμήμα: Χημείας

Γ.Ν.Α «Ο ΕΥΑΓΓΕΛΙΣΜΟΣ- ΟΦΘΑΛΜΙΑΤΡΕΙΟ ΑΘΗΝΩΝ ΠΟΛΥΚΛΙΝΙΚΗ» ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΚΟΥ ΤΜΗΜΑΤΟΣ - ΒΙΟΙΑΤΡΙΚΗΣ ΥΠΗΡΕΣΙΑΣ. ΘΕΟΔΩΡΟ ΝΙΑΡΧΑΚΟ (Διευθυντή Πωλήσεων)

ΕΚΦΕ ΕΥΡΥΤΑΝΙΑΣ Επιμέλεια: Καγιάρας Νικόλαος - Φυσικός Εργαστηριακή διδασκαλία των Φυσικών Μαθημάτων Καλλιέργεια βακτηρίων

BD Mac Conkey II Agar / Columbia CNA Agar with 5% Sheep Blood (Biplate)

ΙΑΤΡΙΚΗ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΙΙ

ΕΛΛΗΝΙΚΗ ΔΗΜΟΚΡΑΤΙΑ ΥΠΟΥΡΓΕΙΟ ΥΓΕΙΑΣ ΓΕΝΙΚΟ ΝΟΣΟΚΟΜΕΙΟ ΧΑΝΙΩΝ «ΑΓΙΟΣ ΓΕΩΡΓΙΟΣ» Χανιά, 17/11/2017 Αριθμ. Πρωτ.21109

Mικροβιολογία του νερού Χαρακτηριστικά βακτηρίων. Μ. ΑΡΒΑΝΙΤΙΔΟΥ-ΒΑΓΙΩΝΑ Καθηγήτρια Ιατρικής Σχολής, ΑΠΘ

ΙΑΤΡΙΚΗ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΙΙ

ΠΡΟΣ: ΚΟΙΝ.: Β ΤΑΞΗ ΗΜ ΕΡΗΣΙΟΥ ΚΑΙ ΕΣΠΕΡΙΝΟΥ ΕΠΑ.Λ. ΘΕΩΡΙΑ

ΑΝΤΙΔΡΑΣΤΗΡΙΑ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΚΟΥ

Σήµερα οι εξελίξεις στην Επιστήµη και στην Τεχνολογία δίνουν τη

ΠΡΟΣΚΛΗΣΗ ΕΚΔΗΛΩΣΗΣ ΕΝΔΙΑΦΕΡΟΝΤΟΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΡΟΜΗΘΕΙΑ ΑΝΤΙΔΡΑΣΤΗΡΙΩΝ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΚΩΝ ΕΞΕΤΑΣΕΩΝ ΓΙΑ ΤΙΣ ΑΝΑΓΚΕΣ ΤΟΥ ΓΝ-ΚΥ ΝΑΞΟΥ

ΕΛΛΗΝΙΚΗ ΔΗΜΟΚΡΑΤΙΑ ΥΠΟΥΡΓΕΙΟ ΥΓΕΙΑΣ Ψ.Ν.Α. «ΔΡΟΜΟΚΑΪΤΕΙΟ» ΝΠΔΔ ΙΕΡΑ ΟΔΟΣ 343 ΧΑΪΔΑΡΙ ΤΚ ΧΑΙΔΑΡΙ 19/11/2015

ΙΑΤΡΙΚΗ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΙΙ

ΟΝΟΜΑΤΟΛΟΓΙΑ ΚΑΙ ΤΑΞΙΝΟΜΗΣΗ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ

Ο ΙΟΙΚΗΤΙΚΟΣ ΙΕΥΘΥΝΤΗΣ ΙΩΑΝΝΗΣ ΚΟΥΡΛΑΣ ΚΑΘΕ ΕΝ ΙΑΦΕΡΟΜΕΝΟ. ηµόσια ιαβούλευση» ΠΡΟΣ:

Αλγόριθμοι ταυτοποίησης αεροβίων Gram (-) βακτηρίων

ΠΑΡΕΧΟΜΕΝΕΣ ΥΠΗΡΕΣΙΕΣ Π.Ε.Δ.Υ. ΚΡΗΤΗΣ

ΜΕΘΟΔΟΣ ΑΝΙΧΝΕΥΣΗΣ, ΤΑΥΤΟΠΟΙΗΣΗΣ ΚΑΙ ΑΝΤΙΒΙΟΓΡΑΜΜΑΤΟΣ ΟΥΡΟΓΕΝΝΗΤΙΚΩΝ ΜΥΚΟΠΛΑΣΜΑΤΩΝ.

Αλγόριθμοι για την ταυτοποίηση των αερόβιων Gram-θετικών κόκκων

Καλλιεργητικά υλικά και επιλογή τους στο Κλινικό Εργαστήριο. Τρόπος εμβολιασμού κλινικών δειγμάτων Ανάγνωση καλλιεργειών

ΜΕΘΟΔΟΙ ΕΛΕΓΧΟΥ ΤΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΗΣ ΕΥΑΙΣΘΗΣΙΑΣ ΣΥΝΕΡΓΕΙΕΣ ΚΑΙ ΚΑΜΠΥΛΕΣ ΘΑΝΑΤΩΣΗΣ

Βιολογία Θετικής Κατεύθυνσης

Προσδιορισμός MIC, MBC. Γεωργία Βρυώνη

Aνίχνευση του στρεπτοκόκκου ομάδας Β σε έγκυες γυναίκες: Καλλιέργεια, ή PCR;

ΟΙ ΠΡΩΤΕΣ ΕΜΠΕΙΡΙΕΣ ΤΟΥ ΤΜΗΜΑΤΟΣ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΩΝ ΤΟΥ ΝΟΣΟΚΟΜΕΙΟΥ ΛΑΜΙΑΣ

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Αλγόριθμοι ταυτοποίησης αεροβίων Gram (-) βακτηρίων

ΚΥΤΤΑΡΙΚΗ ΑΝΑΠΝΟΗ. Καρβουντζή Ηλιάνα Βιολόγος

ΚΟΛΟΒΑΚΤΗΡΙΟΕΙΔΗ ΕΝΤΕΡΙΚΗΣ ΠΡΟΕΛΕΥΣΗΣ ΚΟΛΟΒΑΚΤΗΡΙΟΕΙΔΗ ESCHERICHIA COLI

Εργαστηριακή Άσκηση 1 ΠΑΡΑΣΚΕΥΗ ΚΑΙ ΑΠΟΣΤΕΙΡΩΣΗ ΘΡΕΠΤΙΚΩΝ ΜΕΣΩΝ

Ανάπτυξη Mοριακών Tεχνικών Real-Time PCR για την Aνίχνευση Eντεροαιμορραγικών Στελεχών E. coli, Campylobacter jejuni και Salmonella spp.

Εργαστηριακή καλλιέργεια μικροοργανισμών

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Δ. Μείωση του αριθμού των μικροοργανισμών 4. Να αντιστοιχίσετε τα συστατικά της στήλης Ι με το ρόλο τους στη στήλη ΙΙ

ΕΠΙΠΤΩΣΕΙΣ ΡΥΠΑΝΤΩΝ ΣΤΗ ΖΩΗ ΤΩΝ ΚΥΤΤΑΡΩΝ

Προσδιορισμός Μικροβιακής Αντοχής Μέθοδοs Διάχυσης με Δίσκους ( Disk Diffusion Method)

BD BBL TM CHROMagar TM CPE

ΕΡΓΑΣΙΑ ΣΤΟ ΜΑΘΗΜΑ ΤΗΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΥΠΕΥΘΥΝΟΣ ΚΑΘΗΓΗΤΗΣ:Κ.Κεραμάρης ΑΡΧΕΣ ΚΑΙ ΜΕΘΟΔΟΛΟΓΙΑ ΤΗΣ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ

Πανελλήνιος Μαθητικός Διαγωνισμός για την επιλογή στην 11η Ευρωπαϊκή Ολυμπιάδα Επιστημών - EUSO 2013 Σάββατο 19 Ιανουαρίου 2013 ΒΙΟΛΟΓΙΑ

Καλλιεργητικά υλικά και επιλογή τους στο Κλινικό Εργαστήριο. Η ανάπτυξη της βακτηριακής καλλιέργειας.

Τίτλος Μαθήματος: Γενική Μικροβιολογία. Ενότητα: ΔΙΑΤΡΟΦΗ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ. Διδάσκων: Καθηγητής Ιωάννης Σαββαΐδης. Τμήμα: Χημείας

Προσδιορισμός ομάδας ABO - Rh στα ερυθρά

Κεφάλαιο 1: Εισαγωγή. Κεφάλαιο 2: Η Βιολογία των Ιών

BD CHROMagar Orientation Medium

ΣΥΣΤΗΜΑΤΑ ΑΝΑΕΡΟΒΙΑΣ ΕΠΩΑΣΗΣ ΚΑΙ ΘΡΕΠΤΙΚΑ ΥΛΙΚΑ. Ορφανίδου Μαρία Επιμελήτρια Β Βιοπαθολόγος Γ.Ν.Α. «Γ. Γεννηματάς»

ΑΡΧΗ 1ΗΣ ΣΕΛΙ ΑΣ Γ ΗΜΕΡΗΣΙΩΝ

Γενικές αρχές απομόνωσης και ταυτοποίησης αναερόβιων μικροβίων

7. Βιοτεχνολογία. α) η διαθεσιμότητα θρεπτικών συστατικών στο θρεπτικό υλικό, β) το ph, γ) το Ο 2 και δ) η θερμοκρασία.

Ο ρόλος και η σημασία των μοριακών τεχνικών στον έλεγχο των. μικροβιολογικών παραμέτρων σε περιβαλλοντικά δείγματα για την προστασία

Δ Ι Α Κ Η Ρ Υ Ξ Η ΑΡΙΘΜ. 40/2013

ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΠΡΟΔΙΑΓΡΑΦΕΣ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΚΟΥ ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΠΡΟΔΙΑΓΡΑΦΕΣ ΑΝΑΛΥΤΩΝ 1. ΣΥΣΤΗΜΑ ΕΠΩΑΣΗΣ ΚΑΙ ΑΝΙΧΝΕΥΣΗΣ ΑΙΜΟΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΩΝ ΚΑΙ ΜΥΚΟΒΑΚΤΗΡΙΔΙΟΥ

Κεφάλαιο 7: ΑΡΧΕΣ ΚΑΙ ΜΕΘΟΔΟΛΟΓΙΑ ΤΗΣ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ

ΠΑΡΕΧΟΜΕΝΕΣ ΥΠΗΡΕΣΙΕΣ Π.Ε.Δ.Υ. ΘΕΣΣΑΛΙΑΣ

ΕΝΟΤΗΤΑ 8: Η ΕΛΕΥΘΕΡΩΣΗ ΤΗΣ ΕΝΕΡΓΕΙΑΣ 8.2 AΕΡΟΒΙΑ ΑΝΑΠNOH

ΑΥΤΟΜΑΤΟ ΣΥΣΤΗΜΑ ΓΙΑ ΤΗ ΔΙΕΝΕΡΓΕΙΑ ΜΟΡΙΑΚΩΝ ΕΞΕΤΑΣΕΩΝ ΜΕ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑ REAL-TIME PCR

ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ ΜΙΚΡΟΒΙΩΝ ΚΑΙ ΠΑΡΑΓΩΓΗ ΕΝΕΡΓΕΙΑΣ ΜΕΤΑΒΟΛΙΚΗ ΠΟΙΚΙΛΟΜΟΡΦΙΑ ΣΥΝΘΗΚΕΣ ΕΠΩΑΣΗΣ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΩΝ

BD CHROMagar Orientation Medium / Columbia CNA Agar (Biplate)

ΑΣΚΗΣΗ 8 Η. ΕΝΖΥΜΑ ΠΑΡΑΣΚΕΥΗ ΠΡΟΪΟΝΤΟΣ ΟΞΥΓΑΛΑΚΤΙΚΗΣ ΖΥΜΩΣΗΣ. Εργαστήριο Χημείας & Τεχνολογίας Τροφίμων

ΟΙ ΜΟΡΙΑΚΕΣ ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΣΤΗΝ ΙΑΤΡΙΚΗ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ. Eφη. Πετεινάκη

ΓΥΜΝΑΣΙΟ ΑΠΟΣΤΟΛΟΥ ΑΝΔΡΕΑ ΕΜΠΑΣ ΣΧΟΛΙΚΗ ΧΡΟΝΙΑ ΒΑΘ.:... / 25 ΟΛΟΓΡ.:... ΓΡΑΠΤΕΣ ΠΡΟΑΓΩΓΙΚΕΣ ΕΞΕΤΑΣΕΙΣ ΜΑΪΟΥ - ΙΟΥΝΙΟΥ 2019 ΥΠΟΓΡ.:...

ΓΕΝΙΚΗ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ. Μαντώ Κυριακού 2015

Καλλιέργεια και τυποποίηση των μικροβίων. Ιωάννης Γ. Ρούτσιας, MD, PhD Επίκουρος καθηγητής Ανοσολογίας/Μικροβιολογίας

Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών. Εργαστήριο: Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

ΑΡΧΗ 1ΗΣ ΣΕΛΙ ΑΣ Γ ΗΜΕΡΗΣΙΩΝ

ΑΠΑΝΤΗΣΕΙΣ ΣΤΗ ΧΗΜΕΙΑ ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΗΣ ΚΑΤΕΥΘΥΝΣΗΣ

ΑΞΙΟΛΟΓΗΣΗ ΤΟΥ RAPID POLYMYXIN NP TEST ΣΤΗΝ ΑΝΙΧΝΕΥΣΗ COLISTIN ΑΝΘΕΚΤΙΚΩΝ (ColR) KLEBSIELLA PNEUMONIAE

Είδος μικροοργανισμού και αληθής βακτηριαιμία

Τίτλος Μαθήματος: Γενική Μικροβιολογία. Ενότητα: ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ. Διδάσκων: Καθηγητής Ιωάννης Σαββαΐδης. Τμήμα: Χημείας

Μονάδες 6 ΘΕΜΑ Β. ιαθέτουμε υδατικό διάλυμα CH 3 COONa συγκέντρωσης 0,1 Μ ( ιάλυμα 1 ). Β1. Να υπολογίσετε το ph του διαλύματος 1.

ΠΑΝΕΛΛΑΔΙΚΕΣ ΕΞΕΤΑΣΕΙΣ Γ ΤΑΞΗΣ ΗΜΕΡΗΣΙΟΥ ΓΕΝΙΚΟΥ ΛΥΚΕΙΟΥ & ΠΑΝΕΛΛΗΝΙΕΣ ΕΞΕΤΑΣΕΙΣ Γ ΤΑΞΗΣ ΗΜΕΡΗΣΙΟΥ ΕΠΑΛ (ΟΜΑΔΑ Β )

3. ΑΝΤΙΔΡΑΣΤΗΡΙΑ Το VRESelect αρ. καταλόγου περιέχει 20 πλάκες ανά συσκευασία.

Transcript:

Ταυτοποίηση βακτηρίων: συμβατικές και αυτοματοποιημένες μέθοδοι.

1. Inoculation The Five I's 5. Identification 2. Incubation 4. Inspection 3. Isolation

Ταυτοποίηση βακτηρίων Εχει σαν στόχο την κατάταξη ενός μικροοργανισμού σε συγκεκριμένο γένος, είδος, ορότυπο, βιότυπο, είδος αντοχής

Ταυτοποίηση βακτηρίων Ορισμός: κατάταξη ενός μικροοργανισμού σε συγκεκριμένο γένος, είδος, ορότυπο, βιότυπο, είδος αντοχής με τη χρησιμοποίηση δοκιμασιών που στηρίζονται σε : Μορφολογικά χαρακτηριστικά Μορφολογία στη χρώση Gram Καλλιεργητικά χαρακτηριστικά (απαραίτητα θρεπτικά υλικά, συνθήκες επώασης, μορφολογία αποικιών) Μεταβολικές ιδιότητες (=διάσπαση υποστρωμάτων, παραγωγή ενζύμων κ.α) Ελεγχος διαφόρων αντιγονικών παραγόντων των μικροοργανισμών, χαρακτηριστικών για κάθε είδος Την ανίχνευση χαρακτηριστικών αλληλουχιών βάσεων στο γενετικό υλικό των μικροοργανισμών με τεχνικές DNA

Ταυτοποίηση βακτηρίων Ορισμός: κατάταξη ενός μικροοργανισμού σε συγκεκριμένο γένος, είδος, ορότυπο, βιότυπο, είδος αντοχής με τη χρησιμοποίηση δοκιμασιών που στηρίζονται σε : Μορφολογικά χαρακτηριστικά Καλλιεργητικά χαρακτηριστικά (απαραίτητα θρεπτικά υλικά, συνθήκες επώασης, μορφολογία αποικιών) Μεταβολικές ιδιότητες (=διάσπαση υποστρωμάτων, παραγωγή ενζύμων κ.α) Ελεγχος διαφόρων αντιγονικών παραγόντων των μικροοργανισμών, χαρακτηριστικών για κάθε είδος Βιοχημική ταυτοποίηση Την ανίχνευση χαρακτηριστικών αλληλουχιών βάσεων στο γενετικό υλικό των μικροοργανισμών με τεχνικές DNA Μορφολογία στη χρώση Gram Ορολογική ταυτοποίηση / τυποποίηση Μοριακή ταυτοποίηση / τυποποίηση

Δοκιμασίες χρήσιμες στην ταυτοποίηση Πρωταρχικό ρόλο στην ταυτοποίηση παίζει η Βιοχημική ταυτοποίηση στην οποία εκμεταλευόμαστε τις μεταβολικές ιδιότητες των μικροοργανισμών, όπως: η διάσπαση διαφόρων υποστρωμάτων ( απαραίτητες θρεπτικές ουσίες), παραγωγή ενζύμων ( απαραίτητα για τις μεταβολικές αντιδράσεις και τη λειτουργία της αναπνοής)

Δοκιμασία καταλάσης Ελέγχει την παρουσία του ενζύμου καταλάση, που διασπά το παραγόμενο κατά τη διάσπαση των υδατανθράκων Η 2 Ο 2 σε Η 2 Ο και Ο 2. Χρησιμοποιούμε Η 2 Ο 2 3% και μικροβιακό καλλιέργημα σε αντικειμενοφόρο πλάκα (+): παραγωγή φυσαλίδων

Δοκιμασία κοαγκουλάσης (πηκτάσης) Ελέγχει την ικανότητα των σταφυλοκόκκων να προκαλούν πήξη του πλάσματος με τη βοήθεια του ενζύμου κοαγκουλάση που παράγουν σε δύο μορφές, τη συνδεδεμένη στο κυτταρικό τοίχωμα (clumbing factor) και την ελεύθερη που ελευθερώνεται από το (ΜΚ) Χρησιμοποιούμε: δοκιμάσια πλακός για τη συνδεδεμένη (εναιώρημα σταφυλοκόκκου + αναραίωτο πλάσμα ή αντιδραστήριο με σωματίδια latex) (+):παραγωγή κροκίδων ------------------------------------------------------ δοκιμασία σωληναρίων για την ελεύθερη (εναιώρημα σταφυλοκόκκου + αραιωμένο κατάλληλα πλάσμα ανθρώπου ή εμπορικού σκευάσματος επώαση 4h) (+): παραγωγή πήγματος

Η 2 Ο 2 καταλάση Η 2 Ο + Ο 2 Σταφυλόκοκκοι: (+) καταλάση Στρεπτόκοκκοι: (-) καταλάση Δράση κοαγκουλάσης στο ινωδογόνο του πλάσματος ανθρώπου ή κουνελιού και συγκόλληση βακτηρίων Έλεγχος ελεύθερης κοαγκουλάσης Έλεγχος συνδεδεμένης κοαγκουλάσης S. aureus: (+) κοαγκουλάση Σταφυλόκοκκοι: (-) κοαγκουλάση

Δοκιμασία οξειδάσης Ελέγχει αν ο μικροοργανισμός διαθέτει το ένζυμο cytochrome oxidase, απαραίτητο στην μετατροπή NADH NAD + H 2 O Χρησιμοποιούμε tetramethyl-pphenylenodiamine σε διάλυμα (1%), δισκία, ταινίες ή ραβδία και φρέσκες αποικίες (+) : μπλε χρώμα σε 10 Ox(+): Pseudomonas Ox(-): Salmonella, Shigella, Proteus, Acinetobacter

Δοκιμασία οπτοχίνης Ελέγχει την ευαισθησία ενός (ΜΚ) στην οπτοχίνη (ethyl hydrocupreine hydrochloride), που ενεργοποιεί αυτολυτικά ένζυμα του (ΜΚ) και προκαλείται λύση του (ΜΚ) Χρησιμοποιούμε αιματούχο αγαρ, δισκία οπτοχίνης, επώαση σε CO2 5% για 24 ώρες (+): ζώνη αναστολής 10 mm Χρήσιμη στη αδρή διάκριση πνευμονιοκόκκων - α αιμολυτικών στρεπτοκόκκων.

Δοκιμασία βακιτρακίνης 0.04U Ελέγχει την ευαισθησία ενός (ΜΚ) στο αντιβιοτικό βακιτράκινη Χρησιμοποιούμε αιματούχο άγαρ, δισκία βακιτρακίνης, επώαση για 24 ώρες. (+): αναστολή ανάπτυξης. Χρήσιμη στη διάκριση β αιμολυτικού στρεπτοκόκκου ομάδας Α (GAS) από άλλους β- αιμολυτικούς στρεπτοκόκκους.

Δοκιμασία βακιτρακίνης 0.04U Ελέγχει την ευαισθησία ενός (ΜΚ) στο αντιβιοτικό βακιτράκινη Χρησιμοποιούμε αιματούχο άγαρ, δισκία βακιτρακίνης, επώαση για 24 ώρες. (+): αναστολή ανάπτυξης. Χρήσιμη στη διάκριση β αιμολυτικού στρεπτοκόκκου ομάδας Α (GAS) από άλλους β- οι περισσότεροι αιμολυτικούς στρεπτόκοκκοι στρεπτοκόκκους. ομάδας Α (>95%) παρουσιάζουν ζώνη αναστολής ανάπτυξης γύρω από το δισκίο, αντίθετα με 83-97% των υπολοίπων στρεπτόκοκκων

Δοκιμασία παραγόντων ανάπτυξης X / V Ελέγχουμε την εξάρτηση των αιμοφίλων από τους παράγοντες Χ (protoporphyrin) και V (αιμίνη), που βρίσκονται στο αίμα, για να αναπτυχθούν. Χρησιμοποιούμε: υλικό χωρίς αίμα και δισκία ποτισμένα με παράγοντες X/V/XV σε απόσταση 3.5 mm, επώαση σε 5% CO2 18-24 h Ελέγχουμε για ανάπτυξη γύρω από τους δίσκους (εξάρτηση από το συγκεκριμένο παράγοντα)

Δοκιμασία παραγόντων ανάπτυξης X / V Ελέγχουμε την εξάρτηση των αιμοφίλων από τους παράγοντες Χ (protoporphyrin) και V (αιμίνη), που βρίσκονται στο αίμα, για να αναπτυχθούν. Χρησιμοποιούμε: υλικό χωρίς αίμα και δισκία ποτισμένα με παράγοντες X/V/XV σε απόσταση 3.5 mm, επώαση σε 5% CO2 18-24 h Ελέγχουμε για ανάπτυξη γύρω από τους δίσκους (εξάρτηση από το συγκεκριμένο παράγοντα)

Δοκιμασία θερμοευαίσθητης νουκλεάσης (DNάσης) Ελέγχει την παρουσία της εξωκυττάριας DNασης που υδρολύει το αδιαλυτο σε ΗCL DNA σε διαλυτά ολιγονουκλεοτίδια Χρησιμοποιούμε : υλικό με DNA επώαση 18-24 h μετά την επώαση πλημύρισμα του καλλιεργήματος με 1Μ (3.6%) ΗCL Ελέγχομε για διαυγή άλω γύρω από τον θετικό μάρτυρα και το εξεταζόμενο (ΜΚ) (+): παρουσία διαυγούς άλω (S. aureus, Serratia κ.α.) (-): απουσία διαυγούς άλω ή άλως < του μάρτυρα (CNS κ.α )

Δοκιμασία ινδόλης Ελέγχει την ικανότητα του (ΜΚ) να παραγει το ένζυμο τρυπτοφανάση που υδρολύει το αμινοξύ τρυπτοφάνη σε ινδόλη και αλδεύδη Χρησιμοποιούμε : πεπτονούχο ζωμό με 1% τρυπτοφάνη επώαση 18-24 h αντιδρστήριο Kovacs (p dimethyl amino benzaldehyde, amyl alcohol, HCL) (+): ροζ δακτύλιος στην επιφάνεια (πχ E. coli ) (-): άχρωμος δακτύλιος στην επιφάνεια (πχ Klebsiella spp)

Δοκιμασία εσκουλίνης Ελέγχει την ικανότητα του (ΜΚ) να υδρολύει, παρουσία χολής, την άχρωμη εσκουλίνη σε γλυκόζη και εσκουλετίνη, η οποία παρουσία Fe ++ παράγει μαύρο σύμπλεγμα. Χρησιμοποιούμε: άγαρ εσκουλίνης σε τρυβλίο ή σωληνάρια ή ζωμό εσκουλίνης επώαση 4-24 h (+): παραγωγή μαύρου χρώματος (πχ εντερόκοκκος, S. bovis )

Δοκιμασία κινητικότητας Ελέγχει την ικανότητα των (ΜΚ),κυρίως των βακτηριδίων και σπανίως των κόκκων, να κινούνται λόγω ύπαρξης μαστιγίων. Χρησιμοποιούμε: ημίρευστο άγαρ σε σωληνάριο,με ή χωρίς χρωστική εμβολιασμό με βαθειά νύξη επώαση 18-24 h σε 35-37 0 C (+):διάχυση και θόλωση του υλικού -------------------------------------------------- Το αποτέλεσμα εξαρτάται και από τις συνθήκες επώασης. Π.χ. Y. enterocolitica κινητή σε 20-25 0 C και ακίνητη σε 30 0 C

Escherichia: mot +/- Shigella: mot Edwardsiella:mot + Salmonella: mot + Arizona:mot + Citrobacter:mot + Klebsiella:mot Hafnia:mot + Serratia: mot + Enterobacter:mot + Proteus: mot + Providencia: mot + Pseudomonas: mot + Έλεγχος κινητικότητας

Δοκιμασία ουρεάσης Ελέγχει την ικανότητα των (ΜΚ) να διασπούν την ουρία σε δύο μόρια αμμωνίας, με το ένζυμο ουρεάση που διαθέτουν, με αποτέλεσμα την αύξηση του ph του υλικού Χρησιμοποιούμε: Θρεπτικό ζωμό με ουρία και δείκτη ερυθρό της φαινόλης, σε ph 6.8 επώαση 18-24 h σε 35-37 0 C (+): ροζ χρώμα από την αλλαγή του δείκτη με την αύξηση του ph σε 8.4 Πχ. Proteus spp, Helicobacter/campylobacters

Δοκιμασία O-NPG (o-nitrophenyl-b-galactopyranoside) Ελέγχει την παρουσία της b-galactosidase στον (ΜΚ) η οποία μαζί με την περμεάση προκαλεί τη διάσπαση της λακτόζης σε γαλακτόζη και γλυκόζη. ----------------------------------- Περμεάση: εισάγει τη λακτόζη στο κύτταρο, ενώ η γαλακτοσιδάση τη διασπά. Μερικά (ΜΚ) έχουν μόνο γαλακτοσιδάση και αδυνατούν να διασπάσουν τη λακτόζη (βραδέως ζυμούντα) --------------------------------------------------- Χρησιμοποιούμε : διάλυμα O-NPG (έχει ίδια δομή με τη γαλακτόζη) επώαση 18-24 ω σε 35-37 0 C (+): κιτρινο χρώμα (Πχ βραδέως ζυμούντα την λακτόζη εντεροβακτηριακά,ναϊσέριες κ.α)

Άλλες δοκιμασίες Χρησιμοποίηση υδατανθράκων Δοκιμασία οξείδωσης/ζύμωσης γλυκόζης Δοκιμασία απαμίνωσης φαινυλαλανίνης Δοκιμασία αποκαρβοξυλίωσης λυσίνης Δοκιμασία χρησιμοποίησης τριών σακχάρων κ.α.

Σκεπτικό ταυτοποίησης Συνδυάζουμε όλα τα χαρακτηριστικά που διαθέτουμε για ένα συγκεκριμένο (ΜΚ) και σταδιακά καταλήγουμε στην ταυτοποίηση του εφαρμόζοντας γνωστούς αλγόριθμους

Βιοχημική Ταυτοποίηση (χεριού) (Ι) Μέθοδος διασταύρωσης αποτελεσμάτων ή σκακιέρα Ελέγχεται μεγάλος αριθμός βιοχημικών δοκιμασιών (CDC), πχ για τα εντεροβακτηριακά 47, οι οποίες τα κατατάσσουν σε 28 γένη, 121 είδη και βιοτύπους και πολλά χωρίς όνομα. Τα αποτελέσματα των ΒΔ, για τους ενδεικτικούς μικροοργανισμούς είναι αποτυπωμένα σε μεγάλους πίνακες. Οριζόντια και κάτω από κάθε δοκιμή αναφέρεται το ποσοστό θετικού αποτελέσματος για κάθε μικροοργανισμό. Ανατρέχοντας στους πίνακες αυτούς με τα αποτελέσματα των ΒΔ του άγνωστου μικροοργανισμού τον ταυτοποιούμε.

Βιοχημική Ταυτοποίηση (χεριού) (ΙΙ) Μέθοδος διακλαδιζόμενου ή διχοτόμου διαγράμματος ροής Μέθοδος απλούστερη Ξεκινώντας από τη Gram χρώση(+/-), τη μορφολογία και μία ή δύο χαρακτηριστικές προκαταρκτικές ιδιότητες, πχ οξειδάση (+/-) και ζύμωση της γλυκόζης προχωράμε στην εφαρμογή διαφόρων άλλων ΒΔ και με την αξιολόγηση πάντα του (+/-) αποτελέσματος καταλήγουμε στην τελική ταυτοποίηση των μικροοργανισμών

Gram (-) βακτηρίδια Κόκκοι/ Κοκκοβακτηρίδια Βακτηρίδια Αερόβια/ Δυνητικά αναερόβια Αυστηρά αναερόβια Αερόβια/ Δυνητικά αναερόβια Αυστηρά αναερόβια Acinetobacter Kingella Moraxella Neisseria Veillonella Επόμενος πινακας Bacteroides Fusobactrrium Prevotella..

Αερόβια /δυνητικά aναερόβια Gram(-) βακτηρίδια Μικρά /πολύμορφα Ανισομεγέθη αραιοχρωματικά Ευθείες πλευρές Καμπυλομορφα Actinobacillus Bordetella BrucellaPasteurella Haemophillus Acinetobacter Bartonella Legionella Oxidase (+) Oxidase (-) Campylobacter Helicobacter Arcobacter Pseudomonas Aeromonas Burkholderia Flavobacterium Alcaligenes Enterobacteriaceae Stenotrophomonas Acinetobacter

Εμπορικά κωδικοποιημένα Συστήματα ταυτοποίησης (Ι) Χαρακτηριστικά υποστρώματα σε αποξηραμένη μορφή βρίσκονται σε ειδικούς υποδοχείς πάνω σε ταινίες ή πλάκες και προορίζονται για Gram(+) και (-) αερόβια βακτήρια, Gram (-) αζυμωτικά βακτήρια, Αιμοφίλους / Ναϊσσέριες, Σταφυλόκοκκους και Στρεπτόκοκκους, Κορυνοβακτηρίδια, Βακίλους, Αναερόβια, Μύκητες κ.ά. Τα υποστρώματα ανασυστήνονται με την εφαρμογή του μικροβιακού εναιωρήματος, ορισμένης πυκνότητας της κλίμακας Mac Farmland και εφαρμόζονται αναερόβιες συνθήκες,όπου χρειάζονται. Γίνεται επώαση για 18-24 ώρες Προστίθενται ή όχι αντιδραστήρια, αξιολογείται η χρωματική μεταβολή και βαθμολογείται το αποτέλεσμα Αθροίζεται η βαθμολογία ανά τρείς αντιδράσεις και ο τελικός αριθμός διαβάζεται είτε σε βιβλία είτε σε πρόγραμμα υπολογιστή

Εμπορικά κωδικοποιημένα Συστήματα ταυτοποίησης (ΙΙ) Η τελική ταυτοποίηση προκύπτει από τη σύγκριση του Χ αριθμού με τους αντίστοιχους της βάσης δεδομένων κάθε συστήματος και την εύρεση του ποσοστού ομοιότητας Στο αποτέλεσμα αναφέρονται: - ομοιότητα 90%: η ταυτοποίηση δεν έχει πρόβλημα - ομοιότητα περίπου 90%: η ταυτοποίηση μπορεί να ολοκληρωθεί με 1-2 συμπληρωματικές δοκιμασίες - ομοιότητα χαμηλή: η ταυτοποίηση απορρίπτεται -excellent, very good, acceptable ID =/=90% -questionable, doubtful ID: η ταυτοποίηση επαναλαμβάνεται

Κωδικοποίηση Συστήματος Ανάγνωσης Το αποτέλεσμα των ΒΔ είναι + ή Ο υπολογιστής στον προγραμματισμό του δέχεται μόνο θετικά ή αρνητικά στοιχεία στο δυαδικό σύστημα αριθμών 1 και 0 Τα αποτελεσματα των ΒΔ εισάγονται στον υπολογιστή σαν 1 τα (+) και 0 τα (-).πχ 101 010 000 111 111 011 100 Οι δυαδικοί αριθμοί μετατρέπονται στο οκταδικό σύστημα αριθμών από 0-7. Έτσι έχουμε 5 2 0 7 7 6 1 στο προηγούμενο. Ο αριθμός αυτός είναι ο βιότυπος Η ταυτοποίηση με τον τρόπο αυτό εκατομμυρίων στελεχών έχει δημιουργήσει ισχυρές και αξιόπιστες βάσεις δεδομένων οι οποίες εμπλουτίζονται συνεχώς.

Εμπορικά Συστήματα ταυτοποίησης API - biomerieux [20 και 32 δοκιμασιών, διάφορα είδη] BBL Crystal Becton Dickinson Micro ID Remel Enterotube - Becton Dickinson Microscan systems Dade Behring (Siemens) Sensititre systems κ.α. Έχουν ακρίβεια, μεγάλη διάρκεια ζωής Είναι εύκολα στη χρήση Δίνουν ξεκάθαρα αποτελέσματα ΑΡΚΕΙ ΝΑ ΕΜΒΟΛΙΑΖΟΝΤΑΙ ΜΕ ΚΑΘΑΡΟ ΚΑΙ ΦΡΕΣΚΟ ΚΑΛΛΙΕΡΓΗΜΑ Σε οποιαδήποτε αμφιβολία επανελέγχουμε τις εκτιμήσεις μας και ανατρέχουμε στις σημειώσεις των συστημάτων.

Ταυτοποίηση Gram(+) και (-) βακτηριδίων και μυκήτων Βιοχημική ταυτοποίηση με έτοιμα συστήματα: συστήματα προπαρασκευασμένων αντιδραστηρίων-υλικών σε ειδικές θέσεις API (Analytical Profil Index) π.χ. ΑΡΙ 20Ε Enterotube II Computer-assisted numerical codes API 20E: 7-ψήφιοι αριθμοί Enterotube II: 5-ψήφιοι αριθμοί

Ημιαυτόματα και Αυτόματα ταυτοποιητικά Συστήματα Αποτελούνται από το όργανο εμβολιασμού, το όργανο επώασης και τον υπολογιστή για την εισαγωγή των δημογραφικών στοιχείων του ασθενούς και την ανάγνωση των αποτελεσμάτων Χρησιμοποιούν μεγάλο αριθμό υποστρωμάτων, εως και 96, κλεισμένα σε κάρτες (Vitek) ή πλάκες (Phoenix, Microscan), τα οποία αποτελούν τα Panels των διαφόρων συστημάτων O εμβολιασμός γίνεται εύκολα και προτυπωμένα, με μικρή ανθρώπινη παρέμβαση Κατά την επώαση γίνεται συνεχής παρακολούθηση της αντίδρασης, η οποία είναι χρωματομετρική ή φθοριομετρική Όπου χρειάζεται γίνεται αυτόματα προσθήκη αντιδραστηρίων Το τελικό αποτέλεσμα δίνεται σε 2-12 ώρες

Αυτοματοποιημένα συστήματα

Εμπορικά Συστήματα αυτόματης ταυτοποίησης Vitek System (biomerieux) Phoenix System (Becton Dickinson) Microscan Walkaway System (Siemens) Wider Sensititre autoidentification System (Oxoid)

Vitek 2 σύστημα Μέθοδος μικροαραίωσης Κάρτα 64-μικροϋποδοχών Μια υποδοχή ελέγχου Υποδοχές προμετρημένων ποσοτήτων 19-20 αντιμικροβιακών παραγόντων σε συνδυασμό με υλικό καλλιέργειας Πλήρωση, σφράγισμα της κάρτας και τοποθέτησή της στην μονάδα επώασης/ανάγνωσης του οργάνου Παρακολούθηση ανάπτυξης σε κάθε υποδοχή της κάρτας ανά 15min (φθορισμός, θολερότητα, χρώμα) Προσδιορισμός MIC σε 4-18 ώρες Επαγωγή αποτελεσμάτων για 4-10 επιπλέον αντιβ. Αποτελέσματα για 23-30 αντιβιοτικά/κάρτα Advanced EXPERT System (AES)

60 & XL Εναιώρημα σε: 3mL 0.45-0.50% NaCl 41 0.50-0.63 McF

Ταυτοποίηση Phoenix σύστημα Μικρομέθοδος Panels ταυτοποίησης και αντιβιογράμματος Αντιβιόγραμμα 84 πηγαδάκια + 1 μάρτυρας ανάπτυξης τουλάχιστον 3 αραιώσεις / αντιβιοτικό Προσδιορισμός MIC όχι υπολογιζόμενη MIC Διπλός τρόπος ανάγνωσης Θολερότητα σαν δείκτης ανάπτυξης Χρώμα ως αντίδραση μικροβιακού μεταβολισμού Μέτρηση ανάπτυξης κινητικής μορφής / 20 min

43

Ορολογική ταυτοποίηση Τυποποίηση (II) Γρήγορη ταυτοποίηση σε κλινικά δείγματα Μηνιγγιτιδογόνα βακτήρια σε ΕΝΥ Πνευμονιόκοκκος σε αίμα,πλευριτικό υγρό κ.ά Στρεπτόκοκκος ομάδας Α σε φαρυγγικό επίχρισμα ----------------------------------------------------------------- Αναπνευστικοί ιοί (γρίπης, RSV, adeno) σε ρινικό έκπλυμα --------------------------------------------------------------------------------------------- ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΥΝΤΑΙ. Αντιοροί, RSV. Αντιδραστήρια latex. Ανοσοχρωματογραφία

Ορολογική ταυτοποίηση / Τυποποίηση (I) Απαιτείται για κλινικούς και επιδημιολογικούς κυρίως λόγους: Συμπλήρωμα της βιοχημικής ταυτοποίησης Ομαδοποίηση αιμολυτικών στρεπτοκόκκων (Α,Β,C,D,F,G) Ομαδοποίηση αιμοφίλων (a,b,c,d,e,f) Ομαδοποίηση Salmonella, Shigella, E. coli Ομαδοποίηση N. meningitidis (A,B,C,D,X,Y,Z,W135 ) Τυποποίηση πνευμονιόκοκκων Τυποποίηση βρουκελλών (B. melitensis, B. abortus ) Ταυτοποίηση S.aureus