Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Σχετικά έγγραφα
Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

Οικονομετρία. Πολλαπλή Παλινδρόμηση. Στατιστικός έλεγχος γραμμικού συνδυασμού συντελεστών. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Οικονομετρία. Εξειδίκευση του υποδείγματος. Μορφή της συνάρτησης: Πολυωνυμική, αντίστροφη και αλληλεπίδραση μεταβλητών

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Οικονομετρία. Συστήματα συναληθευουσών εξισώσεων Το πρόβλημα της ταυτοποίησης. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης. Διδάσκων: Λαζαρίδης Παναγιώτης

Ιστορία της μετάφρασης

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

Εκκλησιαστικό Δίκαιο. Ενότητα 10η: Ιερά Σύνοδος της Ιεραρχίας και Διαρκής Ιερά Σύνοδος Κυριάκος Κυριαζόπουλος Τμήμα Νομικής Α.Π.Θ.

Γεωργική Εκπαίδευση. Θεματική ενότητα 2 2/2. Όνομα καθηγητή: Αλέξανδρος Κουτσούρης Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας και Ανάπτυξης

Οικονομετρία. Συστήματα συναληθευουσών εξισώσεων Συνθήκες ταυτοποίησης. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης. Διδάσκων: Λαζαρίδης Παναγιώτης

Θεσμοί Ευρωπαϊκών Λαών Ι 19 ος -20 ος αιώνας

Μικροοικονομική Ανάλυση Ι

ΦΥΣΙΚΟΧΗΜΕΙΑ ΤΡΟΦΙΜΩΝ Ι

Γενικά Μαθηματικά Ι. Ενότητα 12: Κριτήρια Σύγκλισης Σειρών. Λουκάς Βλάχος Τμήμα Φυσικής ΑΝΟΙΚΤΑ ΑΚΑΔΗΜΑΪΚΑ ΜΑΘΗΜΑΤΑ

Αρχές Βιοτεχνολογίας Τροφίμων

Εκκλησιαστικό Δίκαιο

Οικονομετρία. Εξειδίκευση του υποδείγματος. Μορφή της συνάρτησης: Γραμμική, διπλή λογαριθμική, ημιλογαριθμική. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης

Θεσμοί Ευρωπαϊκών Λαών Ι 19 ος -20 ος αιώνας

Οικονομετρία. Ψευδομεταβλητές Δύο ή περισσότερες ψευδομεταβλητές που επιδρούν στην σταθερά της συνάρτησης. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης

Ιστορία της μετάφρασης

Οικονομετρία. Συστήματα συναληθευουσών εξισώσεων Μέθοδοι εκτίμησης. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης. Διδάσκων: Λαζαρίδης Παναγιώτης

Μικροβιολογία Τροφίμων ΙΙΙ

Οικονομετρία. Απλή Παλινδρόμηση. Πληθυσμός και δείγμα. H μέθοδος Ελαχίστων Τετραγώνων. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης

Γενικά Μαθηματικά Ι. Ενότητα 15: Ολοκληρώματα Με Ρητές Και Τριγωνομετρικές Συναρτήσεις Λουκάς Βλάχος Τμήμα Φυσικής

Εκκλησιαστικό Δίκαιο

Οικονομετρία. Ψευδομεταβλητές Ψευδομεταβλητές που επιδρούν στην κλίση της συνάρτησης. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης

Θερμοδυναμική. Ανοικτά Ακαδημαϊκά Μαθήματα. Πίνακες Νερού σε κατάσταση Κορεσμού. Γεώργιος Κ. Χατζηκωνσταντής Επίκουρος Καθηγητής

Οικονομετρία. Ψευδομεταβλητές Μία ψευδομεταβλητή που επιδρά στην σταθερά της συνάρτησης. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης

Μικροοικονομική Ανάλυση Ι

Γαλακτοκομία. Ενότητα 11: Νοθεία Γάλακτος, 1ΔΩ. Τμήμα: Επιστήμης Τροφίμων και Διατροφής Του Ανθρώπου

Οικονομετρία. Συστήματα συναληθευουσών εξισώσεων Ανηγμένη μορφή και βασικές υποθέσεις. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης

Εισαγωγή στην Διατροφή

Μικροοικονομική Ανάλυση Ι

Λογιστική Κόστους Ενότητα 12: Λογισμός Κόστους (2)

Εισαγωγή στους Αλγορίθμους

Βιοπληροφορική. Ενότητα 9: Αναζήτηση Ομοιοτήτων σε ΒΔ Ακολουθιών - Στατιστική Σημαντικότητα, 1 ΔΩ. Τμήμα: Βιοτεχνολογίας Όνομα καθηγητή: Τ.

Εργαστήριο Χημείας Ενώσεων Συναρμογής

Μικροοικονομική Ανάλυση Ι

Μικροοικονομική Ανάλυση Ι

Οικονομετρία. Πολλαπλή Παλινδρόμηση. Στατιστικός έλεγχος σημαντικότητας δύο ή περισσοτέρων συντελεστών ταυτόχρονα

Θεσμοί Ευρωπαϊκών Λαών Ι 19 ος -20 ος αιώνας

Οικονομετρία. Ετεροσκεδαστικότητα Μέθοδοι εκτίμησης. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης. Διδάσκων: Λαζαρίδης Παναγιώτης

Μικροοικονομική Ανάλυση Ι

Οικονομετρία. Αυτοσυσχέτιση Μέθοδοι εκτίμησης. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης. Διδάσκων: Λαζαρίδης Παναγιώτης

Υγιεινή Εγκαταστάσεων Βιομηχανιών Τροφίμων

Οικονομετρία. Απλή Παλινδρόμηση. Έλεγχοι υποθέσεων και διαστήματα εμπιστοσύνης των συντελεστών. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης

Οδοποιία IΙ. Ενότητα 14: Υπόδειγμα σύνταξης τευχών θέματος Οδοποιίας. Γεώργιος Μίντσης ΑΡΙΣΤΟΤΕΛΕΙΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΘΕΣΣΑΛΟΝΙΚΗΣ

Μικροοικονομική Ανάλυση Ι

Παράκτια Τεχνικά Έργα

Εισαγωγή στην Διοίκηση Επιχειρήσεων

Αξιολόγηση μεταφράσεων ιταλικής ελληνικής γλώσσας

Βιοπληροφορική. Ενότητα 5: Στοίχιση ακολουθιών ανά ζεύγη, 2 ΔΩ. Τμήμα: Βιοτεχνολογίας Όνομα καθηγητή: Τ. Θηραίου

Εισαγωγή στους Αλγορίθμους

Βιοπληροφορική. Ενότητα 10: Αναζήτηση Ομοιοτήτων σε ΒΔ Ακολουθιών - Blast, (2/2) 1ΔΩ. Τμήμα: Βιοτεχνολογίας Όνομα καθηγητή: Τ.

Οικονομία των ΜΜΕ. Ενότητα 9: Εταιρική διασπορά και στρατηγικές τιμολόγησης

ΓΕΝΙΚΗ ΚΑΙ ΑΝΟΡΓΑΝΗ ΧΗΜΕΙΑ

Λογιστική Κόστους Ενότητα 8: Κοστολογική διάρθρωση Κύρια / Βοηθητικά Κέντρα Κόστους.

Αρχές Βιοτεχνολογίας Τροφίμων

Βιοπληροφορική. Ενότητα 15: Φυλογενετική Ανάλυση, 1 ΔΩ. Τμήμα: Βιοτεχνολογίας Όνομα καθηγητή: Τ. Θηραίου

Στρατηγικό Μάρκετινγκ

Οικονομετρία. Απλή Παλινδρόμηση. Υποθέσεις του γραμμικού υποδείγματος και ιδιότητες των εκτιμητών. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης

Ανοικτά Ακαδημαϊκά Μαθήματα στο ΤΕΙ Αθήνας. Βιοστατιστική (Ε) Ενότητα 3: Έλεγχοι στατιστικών υποθέσεων

Οικονομετρία. Απλή Παλινδρόμηση Βασικές έννοιες και τυχαίο σφάλμα. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης. Διδάσκων: Λαζαρίδης Παναγιώτης

Ανοικτά Ακαδημαϊκά Μαθήματα στο ΤΕΙ Αθήνας. Βιοστατιστική (Ε) Ενότητα 1: Καταχώρηση δεδομένων

Μικροοικονομική Ανάλυση Ι

ΦΥΣΙΚΟΧΗΜΕΙΑ ΤΡΟΦΙΜΩΝ Ι

Βιοπληροφορική. Ενότητα 10: Αναζήτηση Ομοιοτήτων σε ΒΔ Ακολουθιών - Blast, (1/2) 1ΔΩ. Τμήμα: Βιοτεχνολογίας Όνομα καθηγητή: Τ.

Συμπεριφορά Καταναλωτή

ΦΥΣΙΚΟΧΗΜΕΙΑ ΤΡΟΦΙΜΩΝ Ι

Οικονομετρία. Συστήματα συναληθευουσών εξισώσεων. Βασικές έννοιες. Τμήμα: Αγροτικής Οικονομίας & Ανάπτυξης. Διδάσκων: Λαζαρίδης Παναγιώτης

Μεθοδολογία Έρευνας Κοινωνικών Επιστημών Ενότητα 2: ΣΥΓΚΕΝΤΡΩΣΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΩΝ ΜΑΡΚΕΤΙΝΓΚ Λοίζου Ευστράτιος Τμήμα Τεχνολόγων Γεωπόνων-Kατεύθυνση

Μικροοικονομική Ανάλυση Ι

Βιοπληροφορική. Ενότητα 7: Στοίχιση ακολουθιών ανά ζεύγη Τεχνικές Στοίχισης Ακολουθιών, (1/2) 1ΔΩ. Τμήμα: Βιοτεχνολογίας Όνομα καθηγητή: Τ.

ΦΥΣΙΚΟΧΗΜΕΙΑ ΤΡΟΦΙΜΩΝ Ι

Εκκλησιαστικό Δίκαιο

Ανοικτά Ακαδημαϊκά Μαθήματα στο ΤΕΙ Αθήνας. Βιοστατιστική (Ε) Ενότητα 2: Περιγραφική στατιστική

Διπλωματική Ιστορία Ενότητα 2η:

Εργαστήριο Χημείας Ενώσεων Συναρμογής

Μέθοδοι Γεωργοοικονομικής & Κοινωνιολογικής Έρευνας

Οινολογία Ι. Ενότητα 3: Το σταφύλι στο οινοποιείο: Μέθοδοι οινοποίησης. Κοινές κατεργασίες οινοποίησης (1/3), 1ΔΩ

ΣΥΣΤΗΜΑΤΑ ΗΛΕΚΤΡΙΚΗΣ ΕΝΕΡΓΕΙΑΣ ΙIΙ

ΣΥΣΤΗΜΑΤΑ ΗΛΕΚΤΡΙΚΗΣ ΕΝΕΡΓΕΙΑΣ ΙIΙ

ΣΥΣΤΗΜΑΤΑ ΗΛΕΚΤΡΙΚΗΣ ΕΝΕΡΓΕΙΑΣ ΙIΙ

Διδακτική της Περιβαλλοντικής Εκπαίδευσης

Διοικητική Λογιστική

Transcript:

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο Ενότητα 10: Μοριακή Βιολογία και Μικροβιολογία Τροφίμων (1/2), 1ΔΩ Τμήμα: Επιστήμης Τροφίμων και Διατροφής Του Ανθρώπου Διδάσκοντες: Ευστάθιος Ζ. Πανάγου Πασχαλίτσα Τρυφινοπούλου Αναστάσιος Σταματίου

Μαθησιακοί Στόχοι Η εξοικείωση των φοιτητών με όρους που άπτονται στην επιστήμη της μοριακής βιολογίας. Η κατανόηση της δυναμικής των διαφόρων μοριακών τεχνικών με σκοπό την χρήση τους στην Μικροβιολογία τροφίμων. Η πραγματοποίηση επιλεγμένων μοριακών μεθόδων στο εργαστήριο και την επιλογή της καταλληλότερης τεχνικής που μπορεί να εφαρμοστεί για την εξυπηρέτηση του σκοπού του κάθε πειραματικού σχεδιασμού.

Λέξεις Κλειδιά Μοριακές τεχνικές Γονιδιωματική ανάλυση (Genomics) Τρανσκριπτομική ανάλυση (Transcriptomics) Πρωτεομική ανάλυση (Proteomics) Ηλεκτροφόρηση Απομόνωση γενετικού υλικού Αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης Αλληλουχία

Η Αρχή DNA RNA ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ 1953: ο Francis Crick και ο James Watson αποκαλύπτουν την δομή του DNA 1958: ο Francis Crick αναφέρεται στο κεντρικό δόγμα της μοριακής βιολογίας

Κεντρικό δόγμα της μοριακής βιολογίας DNA RNA ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ Το DΝΑ περιέχει αποθηκευμένες ακριβείς οδηγίες οι οποίες καθορίζουν τη δομή και λειτουργία του οργανισμού. Εξασφαλίζεται η μεταβίβαση των γενετικών πληροφοριών από ένα κύτταρο στα θυγατρικά του. Το RNA μεταφέρει την πληροφορία η οποία καθορίζει τι είδους πρωτεΐνη θα παραχθεί. Οι πρωτεΐνες είναι υπεύθυνες για τη δομή και λειτουργία των κυττάρων και κατά επέκταση και των οργανισμών.

Πεδία έρευνας μεταγραφή μετάφραση DNA mrna Πρωτεΐνες genomics transcriptomics proteomics

Πλεονεκτήματα Μοριακών μεθόδων Αποφυγή των μειονεκτημάτων της χρήσης κλασικών μεθόδων όπως αβεβαιότητα αποτελεσμάτων, πληθώρα διαφορετικών δοκιμών, εξάρτηση αποτελεσμάτων από το τρόφιμο, τις εργαστηριακές συνθήκες ή και τον αναλυτή. Υπάρχουν γενετικοί δείκτες που μπορούν να διαχωρίσουν τους μικροοργανισμούς σε επίπεδο είδους ή ακόμα και σε επίπεδο στελέχους. Τα τελευταία χρόνια έχουν αναπτυχθεί τεχνικές που δεν απαιτούν απομόνωση μικροοργανισμών και ονομάζονται μέθοδοι ανεξάρτητης καλλιέργειας (culture independent methods).

Εφαρμογές στην Mικροβιολογία τροφίμων Ανίχνευση / ταυτοποίηση αλλοιογόνων και παθογόνων μικροοργανισμών. Παρακολούθηση και περιγραφή της μικροχλωρίδας του τροφίμου. Περιγραφή των ειδικών αλλοιογόνων μικροοργανισμών. Παρατήρηση των αλλαγών στην έκφραση των γονιδίων ενός μικροοργανισμού σε διαφορετικές συνθήκες ανάπτυξης ( πχ. θερμοκρασία και μέσο ανάπτυξης, συνθήκες ανταγωνισμού ή stress). Ανίχνευση γονιδίων (πχ πρωτεόλυσης, γλυκόλυσης). Ενσωμάτωση γονιδίων (πχ φθορισμού).

Ανάλυση πρωτεϊνών (proteomics) 1. SDS PAGE (Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis): Ηλεκτροφόρηση Πηκτής Πολυακριλαμιδίου Δωδεκανοθειικού Νατρίου 2. 2 - D ( Two Dimensional): Δυσδιάστατη ηλεκτροφόρηση

SDS PAGE 1/2 Αρχές Λειτουργίας Εφαρμογές Ανάλυση του συνόλου των πρωτεϊνών της καλλιέργειας. Ανάλυση με βάση το μοριακό τους βάρος. Διαχωρισμός - ομαδοποίηση μικροοργανισμών σε επίπεδο είδους.

SDS PAGE 2/2 Sa ec 2 3 4 5 6 31 32 33 34 35 sa 6 34 30 40 50 60 70 80 90 100 G (VK101) D (VK108) A (VK23) B (VK6) E (VK32) F (VK20) C (VK19)

2 D 1/2 Αρχές Λειτουργίας Εφαρμογές Ανάλυση πρωτεϊνών. Ανάλυση αρχικά με βάση το ισοηλεκτρικό τους σημείο και σε δεύτερη φάση με βάση το μοριακό τους βάρος. Παρακολούθηση αλλαγών στις εκφραζόμενες πρωτεΐνες εξαρτώμενες από τις συνθήκες ανάπτυξης ( πχ. θερμοκρασία και μέσο ανάπτυξης, συνθήκες ανταγωνισμού ή stress).

2 D 2/2 Ταυτοποίηση με φασματοσκοπία μάζας

Γονιδιωματική ανάλυση (genomics) 1. PCR (Polymerase Chain Reaction): Αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης 2. RAPD (Random amplified polymorphic DNA ) 3. PCR-DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis) 4. Sequencing analysis 5. RFLP (Restriction fragment length polymorphism) 6. PFGE (Pulsed field gel electrophoresis): Ηλεκτροφόρηση αγαρόζης εναλλασσόμενου πεδίου 7. FISH (Fluorescence in situ Ηybridisation)

PCR 1/3 Αρχές Λειτουργίας Εφαρμογές Χρησιμοποιείται για τον πολλαπλασιασμό μιας συγκεκριμένης αλληλουχίας DNA. Τα στάδια που περιλαμβάνει είναι : αποδιάταξη του DNA (denaturation), προσαρμογή των εκκινητών στο DNA εκμαγείο (annealing) και επιμήκυνση των εκκινητών (extension). Είναι εξαιρετικά επιλεκτική και ευαίσθητη μέθοδος.

PCR 2/3

PCR 3/3 DNA Ανάμιξη DNA, Εκκινητών (primers), πολυμεράσης (Taq), dntp s (deoxynucleotide triphosphates), buffer solution Thermocycler Στάδια αντίδρασης PCR Ηλεκτροφόρηση σε πηκτή αγαρόζης

Βιβλιογραφία Νυχάς, Γ.Ι. Σημειώσεις στη Μικροβιολογία Τροφίμων. Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών Martin R. Adams and Maurice O. Moss (2008) Food Microbiology, 3rd Edition, RSC Publishing, London, UK. Jay, J.M. (2000) Modern Food Microbiology, 6th Edition, Aspen Publishers, Maryland, USA.

Άδειες Χρήσης Το παρόν εκπαιδευτικό υλικό υπόκειται σε άδειες χρήσης Creative Commons. Για εκπαιδευτικό υλικό, όπως εικόνες, που υπόκειται σε άλλου τύπου άδεια χρήσης, η άδεια χρήσης αναφέρεται ρητώς.

Χρηματοδότηση Το παρόν εκπαιδευτικό υλικό έχει αναπτυχθεί στo πλαίσιo του εκπαιδευτικού έργου του διδάσκοντα. Το έργο «Ανοικτά Ακαδημαϊκά Μαθήματα Γεωπονικού Πανεπιστημίου Αθηνών» έχει χρηματοδοτήσει μόνο την αναδιαμόρφωση του εκπαιδευτικού υλικού. Το έργο υλοποιείται στο πλαίσιο του Επιχειρησιακού Προγράμματος «Εκπαίδευση και Δια Βίου Μάθηση» και συγχρηματοδοτείται από την Ευρωπαϊκή Ένωση (Ευρωπαϊκό Κοινωνικό Ταμείο) και από εθνικούς πόρους.

Σημείωμα Αναφοράς Copyright Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών 2015. Τμήμα Επιστήμης Τροφίμων και Διατροφής του Ανθρώπου, Ευστάθιος Πανάγου/ Πασχαλίτσα Τρυφινοπούλου/ Αναστάσιος Σταματίου, «Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο». Έκδοση: 1.0. Αθήνα 2015. Διαθέσιμο από τη δικτυακή διεύθυνση: https://mediasrv.aua.gr/eclass/

Σημείωμα Αδειοδότησης Το παρόν υλικό διατίθεται με τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Αναφορά, Παρόμοια Διανομή 4.0 [1] ή μεταγενέστερη, Διεθνής Έκδοση. Εξαιρούνται τα αυτοτελή έργα τρίτων, π.χ. φωτογραφίες, διαγράμματα κ.λ.π., τα οποία εμπεριέχονται σε αυτό και τα οποία αναφέρονται μαζί με τους όρους χρήσης τους στο «Σημείωμα Χρήσης Έργων Τρίτων». Η άδεια αυτή ανήκει στις άδειες που ακολουθούν τις προδιαγραφές του Oρισμού Ανοικτής Γνώσης [2], είναι ανοικτό πολιτιστικό έργο [3] και για το λόγο αυτό αποτελεί ανοικτό περιεχόμενο [4]. [1] http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ [2] http://opendefinition.org/okd/ellinika/ [3] http://freedomdefined.org/definition/el [4] http://opendefinition.org/buttons/

Διατήρηση Σημειωμάτων Οποιαδήποτε αναπαραγωγή ή διασκευή του υλικού θα πρέπει να συμπεριλαμβάνει: το Σημείωμα Αναφοράς το Σημείωμα Αδειοδότησης τη δήλωση Διατήρησης Σημειωμάτων το Σημείωμα Χρήσης Έργων Τρίτων (εφόσον υπάρχει) μαζί με τους συνοδευόμενους υπερσυνδέσμους.