1 ο Εκπαιδευτικό υμπόςιο Π.Ε.Β. ςτθ μεκοδολογία Αλλθλοφχθςθσ DNA Νζασ Γενιάσ (NGS) 7 και 8/12/2017 Η ΠΑΝΕΛΛΗΝΙΑ ΕΝΩΗ ΒΙΟΕΠΙΣΗΜΟΝΩΝ (Π.Ε.Β.) ςε ςυνεργαςία με τθν Αιματολογικι Κλινικι τθσ Ιατρικισ χολισ Πανεπιςτθμίου Ακθνών, Χώροσ : Πανεπιςτθμιακά Κτίρια, Γουδι Η Π.Ε.Β. ςτθν προςπάκεια να ςυμβάλλει ςτθν ενθμζρωςθ και εκπαίδευςθ των νζων κυρίωσ ςυναδζλφων ςε νζα μεκοδολογικά και τεχνολογικά μζςα που χρθςιμοποιοφνται ςτθν ςφγχρονθ Βιολογία, διοργανϊνει το 1ο Εκπαιδευτικό υμπόςιο ςτθν Αλλθλοφχθςθ DNA Νζασ Γενιάσ (Next Generation Sequencing:NGS). Επιλζξαμε τθν μεκοδολογία NGS γιατί ςιμερα αποτελεί τον πλζον ςφγχρονο τρόπο μελζτθσ τθσ αλλθλουχίασ των νουκλεϊνικϊν οξζων με πλθκϊρα εφαρμογϊν που πολλαπλαςιάηονται κακθμερινά. Η NGS επιτρζπει τθ μαηικι ταυτόχρονθ αλλθλοφχθςθ DNA από μικρι ποςότθτα δείγματοσ, με μεγάλθ ακρίβεια και ςε υποπολλαπλάςιο χρόνο ςε ςχζςθ με τθν κλαςςικι μεκοδολογία (Sanger sequencing). Αυτά τα χαρακτθριςτικά ζχουν φζρει επανάςταςθ ςτθν Βιολογία όςο αφορά ςτον προςανατολιςμό ερευνϊν και εφαρμογϊν, ςτθν ταχφτθτα απαντιςεων ςε αναλφςεισ ακόμα και ςυνόλου εξωνίων και γονιδιωμάτων, ςτθν ολιςτικότερθ προςζγγιςθ ερωτθμάτων και ςυγκεκριμζνων νοςθμάτων. Σο ςυμπόςιο απευκφνεται ςε νζουσ με πτυχίο Βιοεπιςτθμϊν (όχι ςε φοιτθτζσ) που επικυμοφν να γνωρίςουν τθν NGS αλλά ακόμθ δεν ζχουν αρχίςει να χρθςιμοποιοφν αυτιν τθν μεκοδολογία. Περιλαμβάνονται οι βαςικζσ ζννοιεσ και αρχζσ μεκόδου τθσ NGS και οριςμζνεσ από τισ ςυχνότερεσ εφαρμογζσ ςε κζματα υγείασ. Οι μετζχοντεσ πρόκειται να ενθμερωκοφν για τθν τεχνικι, τισ δυνατότθτεσ και τισ εφαρμογζσ τθσ NGS, όπωσ και να πλθροφορθκοφν για τα βιοπλθροφορικά εργαλεία που τουσ επιτρζπουν να "ςχεδιάςουν" μια ανάλυςθ NGS ςε επίπεδο γονιδίου ι γονιδιώματοσ. Κατά τθ διάρκεια του ςυμποςίου κάκε ςυνάδελφοσ κα ζχει τθν ευκαιρία
να εκπαιδευτεί ςτθν χριςθ ειδικοφ λογιςμικοφ οπτικοποίθςθσ αποτελεςμάτων NGS, όπου κα αναλφςει «δικό του» περιςτατικό και κα αξιολογιςει τα αποτελζςματα των ευρθμάτων του με τθν βοικεια ςτοιχείων των βάςεων δεδομζνων. Σα λογιςμικά που κα χρθςιμοποιθκοφν είναι ελεφκερθσ πρόςβαςθσ ςτο διαδίκτυο για να μποροφν να χρθςιμοποιθκοφν για μελλοντικι εξάςκθςθ ι/και εφαρμογζσ. χετικι βιβλιογραφία με το Αναλυτικό πρόγραμμα, τισ μεκοδολογίεσ τθσ NGS, τισ γενικζσ και ειδικζσ βάςεισ δεδομζνων και τα προγράμματα που κα χρθςιμοποιθκοφν κατά το ςυμπόςιο, κα δοκεί ςτουσ μετζχοντεσ πριν τθν διενζργεια του υμποςίου. Σόςο ςτο επιςτθμονικό όςο και ςτο εκπαιδευτικό μζροσ μετζχουν ζμπειροι ςυνάδελφοι που είχαν ι/και ζχουν άμεςθ προςωπικι εμπειρία ςε NGS μεκοδολογίεσ και εφαρμογζσ τθσ και υπάρχει πρόβλεψθ ϊςτε ςτουσ ςυμμετζχοντεσ να αντιςτοιχεί ζνασ εκπαιδευτισ ανά 5 άτομα. τουσ ςυμμετζχοντεσ κα χορθγθκεί πιςτοποιθτικό παρακολοφκθςθσ. Κόςτοσ εγγραφισ Σο κόςτοσ του ςυμποςίου είναι: για τα μζλθ τθσ ΠΕΒ: 50 ευρϊ για τα μζλθ ΠΕΒ που είναι άνεργα: 30 ευρϊ (Ειδικι τιμι μόνο με επίδειξθ κάρτασ ανεργίασ εν ιςχφ) για τα μθ μζλθ: 120 ευρϊ. Προκεςμία υποβολισ διλωςθσ ςυμμετοχισ Η προκεςμία υποβολισ διλωςθσ ςυμμετοχισ είναι ζωσ 20/11/2017 με μζγιςτο αρικμό ςυμμετοχϊν 25 άτομα. Θα τθρθκεί απόλυτθ ςειρά προτεραιότθτασ για τθ ςυμμετοχι. Προτεραιότθτα εγγραφισ κα ζχουν οι ςυνάδελφοι Bιοεπιςτιμονεσ.
Σρόποσ διλωςθσ ςυμμετοχισ. Για τθν καταγραφι τθσ διλωςθσ ςυμμετοχισ κα πρζπει Α) πρϊτα να γίνει κατάκεςθ των χρθμάτων ςτον παρακάτω λογαριαςμό: Σράπεηα Πειραιώσ Αρικμ Λογ. : 6749-113614- 229 IBAN: GR29 0171 7490 0067 4911 3614 229 Δικαιοφχοσ : Πανελλινια Ζνωςθ Βιοεπιςτθμόνων και Β) κατόπιν αποςτολι με θλεκτρονικό ταχυδρομείο ςτθ γραμματεία τθσ ΠΕΒ (e-mail: grammateia@gmail.com) του αποδεικτικοφ κατάκεςθσ με ταυτόχρονθ διλωςθ των εξισ ςτοιχείων: Ονοματεπϊνυμο : Μζλοσ ΠΕΒ ι όχι : Εργαηόμενοσ/θ ι όχι : Βιολόγοσ ι άλλθ ειδικότθτα : (υνθμμζνθ: θ απόδειξθ κατάκεςθσ και εφόςον υπάρχει και θ κάρτα ανεργίασ) Παρακάτω παρατίκεται το πρόγραμμα του Εκπαιδευτικοφ υμποςίου. Η Οργανωτικι Επιτροπι Μάνοσ Παπαδάκθσ, Κωνςταντίνοσ Κεςανόπουλοσ, Αγγελικι Μελίδου
Πρόγραμμα Εκπαιδευτικοφ υμποςίου ςτθν Αλλθλοφχθςθ DNA Νζασ Γενιάσ (NGS) Πζμπτθ 7-12-2017 15.00-15.30 Ειςαγωγι ςτθν Μεκοδολογία (τι είναι θ NGS ανάλυςθ, πϊσ γίνεται και ποιζσ δυνατότθτεσ ζχει) Μελίδου Α. 15.30-16.30 Επίδειξθ NGS (Ion Torrent-ΑntiSel) 16.30-17.00 Χριςθ Βάςεων Δεδομζνων Μαροφλθσ Β. 17.00-17.30 Οπτικοποίθςθ Αποτελεςμάτων NGS- Χριςθ Integrated Genomics Viewer (GV) Παπανικολάου Β. 17.30-18.00 Διάλειμμα 18.00-20.00 Hands on Workshop Διερεφνθςθ πραγματικϊν περιςτατικϊν μζςω IGV * από κάκε ςυμμετζχοντα *Ο κάκε ςυμμετζχων κα πρζπει να φζρει και το δικό του PC Εκπαιδευτζσ Παπανικολάου Β, (υντονιςτισ), αμαρά Ρ, Μαροφλθσ Β, Δαρμανι Ε, τφλιοσ Γ. Παραςκευι 8-12-2017 16.00-16.30 Καταςκεφαςε το δικό ςου πάνελ για τθν ανάλυςθ NGS (χεδιαςμόσ και Εφαρμογζσ) Μαροφλθσ Β. 16.30-16.50 Κυςτικι Κνωςθ αμαρά Ρ. -Περιςςότερα γονίδια, περιςςότερεσ απαντιςεισ με τθ χριςθ του NGS ςτον Αγιαννιτόπουλοσ Κ. 16.50-17.20 κλθρονομοφμενο καρκίνο - Κλινικι εφαρμογι του NGS ςτθν ανεφρεςθ ςτοχευμζνθσ κεραπείασ ςτον καρκίνο Ευςτακιάδου Χ.
Παραςκευι 8-12-2017 17.10-17.40 HLA γονοτφπιςθ αςαρϊλθ Δ. 17.40-18.10 Αλλθλοφχθςθ ςυνόλου των Εξωνίων και Κλινικι αξιοποίθςθ (WES) Λιλάκοσ Ν. 18.10-18.30 Διάλειμμα 18.30-19.00 Μθ Επεμβατικόσ Προγεννθτικόσ Ζλεγχοσ(NIPT) Χριςτοποφλου Γ. Η ςυμβολι τθσ NGS ςτθν ανίχνευςθ και 19.00-19.30 ταυτοποίθςθ μικροβίων και τθν ανίχνευςθ μεταλλάξεων ανκεκτικότθτασ Μελίδου Α. 19.20-19.40 Φυλογενετικι ςυςχζτιςθ Βακτθρίων Κεςανόπουλοσ Κ. Ζωσ 21.00 υηιτθςθ Λιξθ ςυμποςίου Ειςθγθτζσ - Εκπαιδευτζσ Αγιαννιτόπουλοσ Κωνςταντίνοσ M.Sc., Μοριακόσ Βιολόγοσ, Genekor I.A.E. Ευςτακιάδου Χρυςοφλα M.Sc., Μοριακόσ Βιολόγοσ,Genekor I.A.E. Δαρμανι Ελεάνα, Βιολόγοσ ΜSc, Eurogenetica AE Κεςανόπουλοσ Κωςταντίνοσ, Βιολόγοσ,PhD Λιλάκοσ Ντίνοσ, Βιολόγοσ PhD, Anti Sel, Αφοι ελίδθ Μαροφλθσ Βαςίλθσ, Βιολόγοσ MSc, Neolab Μελίδου Αγγελικι, Βιολόγοσ PhD, Επίκουρθ κακθγιτρια Μοριακισ Μικροβιολογίασ- Ιολογίασ, εργαςτιριο Μικροβιολογἰασ, Ιατρικι ςχολι, Αριςτοτζλειο Πανεπιςτιμιο Θεςςαλονίκθσ. Παπαδάκθσ Μάνοσ, Βιολόγοσ PhD, Neolab. Παπανικολάου Βαςίλθσ, Βιολόγοσ PhD αςαρώλθ Διμθτρα, Βιολόγοσ, Anti Sel, Αφοι ελίδθ αμαρά Ροφλα, Βιολόγοσ PhD, Genotype τφλιοσ Γιάννθσ, Βιολόγοσ MSc Χριςτοποφλου Γεωργία, Βιολόγοσ PhD, Science Lab