Αθήνα, 26 Νοεμβρίου 2014 Αρ. Πρωτ.: 3450 ΠΡΟΣΚΛΗΣΗ ΕΚΔΗΛΩΣΗΣ ΕΝΔΙΑΦΕΡΟΝΤΟΣ Το Ελληνικό Ινστιτούτο Παστέρ, στο πλαίσιο υλοποίησης του έργου με τίτλο: «Ανάπτυξη Βιοαισθητήρων Τύπου Ταινίας Ξηρών Αντιδραστηρίων για την Ανίχνευση Ιικών Σωματιδίων, Αντισωμάτων και Νουκλεϊκών Οξέων, ως ένα Ολοκληρωμένο Σύστημα Ανάλυσης Ιών που Απειλούν το Περιβάλλον: Εφαρμογή στην Ανίχνευση της Ιογενούς Νέκρωσης του Νευρικού Συστήματος Ιχθύων (ιός Noda)» (LS9_448) πρόκειται να προβεί στην προμήθεια με απευθείας ανάθεση των κάτωθι αντιδραστηρίων εργαστηρίου. ΠΡΟΜΗΘΕΙΑ ΑΝΤΙΔΡΑΣΤΗΡΙΩΝ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟΥ (CPV: 33690000-3) α/α Είδος Περιγραφή Συσκευασία Ποσότητα Τιμή μονάδας (ευρώ, χωρίς ΦΠΑ) 1 In-Fusion HD Cloning Plus CE (Clontech Laboratories, Inc) Κιτ για κλωνοποίηση ενός ή περισσοτέρων PCR κομματιών σε οποιονδήποτε φορέα (vector), με υψηλή απόδοση, υψηλή πιστότητα και συγκεκριμένη κατεύθυνση. Το κιτ κλωνοποίησης να περιέχει: αντιδραστήριο κλωνοποίησης, που απομακρύνει πλασμιδιακό DNA που δεν έχει μετασχηματιστεί και κατάλοιπα της αντίδρασης PCR, επιδεκτικά κύτταρα Stellar (στέλεχος E. coli HST08), που παρέχοθν υψηλή αποδοτικότητα μετασχηματισμού και δυνατότητα διαλογής με μπλε και λευκές αποικίες, και CloneAmp HiFi PCR Premix, που παρέχει εξαιρετική ακρίβεια και απόδοση για τον πολλαπλασισμό του DNA amplification. 10 Rxns 2 245
2 NucleoSpin Gel and PCR Cleanup Kit (MACHEREY- NAGEL) 3 NucleoSpin Plasmid kit (MACHEREY- NAGEL) Κιτ για καθαρισμό DNA κομματιών από ενζυμικές αντιδράσεις, π.χ. PCR, και από πηκτές αγαρόζης. Από αρχικό όγκο 200 µl PCR ή 200 mg πηκτής αγαρόζης. Να χρησιμοποιεί τεχνολογία Silica Membrane με spin columns. Να συγκρατεί DNA 25 µg, με απόδοση τουλάχιστον 15μg, για 30 µl DNA, μεγέθους 100-500 bp. Ο όγκος έκλουσης να είναι 10-30μL. Η διαδικασία να επιτυγχάνεται σε λιγότερο από 10 λεπτά για 6 καθαρισμούς PCR μίγματος ή 20 λεπτά για 6 καθαρισμούς πηκτών αγαρόζης. Να περιλαμβάνει κολόνες, κολόνες συλλογής, σωληνάρια συλλογής, Binding Buffer NT1, Wash Buffer NT3, Elution Buffer NE. Nα διατίθεται σε συσκευασία των 50 απομονώσεων. Κιτ για απομόνωση πλασμιδιακού DNA από βακτήρια E.coli που περιέχουν πλασμίδια. Τα πλασμίδια να απελευθερώνονται από τα βακτήρια με τη μέθοδο της SDS/ αλκαλικής λύσης. Από αρχικό όγκο καλλιέργειας 1-5 ml (high copy)/ 5-10 ml (low copy). Να χρησιμοποιεί τεχνολογία Silica Membrane με spin columns. Να παρέχει DNA με τυπική απόδοση 20 μg/ 40 µg. Ο όγκος έκλουσης να είναι 50μL. Η ικανότητα πρόσδεσης DNA να είναι 60 µg. Να απομονώνονται πλασμίδια μεγέθους < 15 kbp. Η διαδικασία 50 prep 1 90 50 prep 1 70
να επιτυγχάνεται σε λιγότερο από 30 λεπτά. Να περιλαμβάνει κολόνες, κολόνες συλλογής, Resuspension Buffer A1, Lysis Buffer A2, Neutralization Buffer A3, Wash Buffer AW, Wash Buffer A4 (Concentrate), Elution Buffer AE, RNase A (lyophilized). Nα διατίθεται σε συσκευασία των 50 απομονώσεων. 4 Agarose Αγαρόζη για τεχνικές μοριακής βιολογίας. Να διαλύεται εύκολα και να δημιουργεί γέλη σε σύντομο χρόνο. Σε συσκευασία των 100gr. 100 g 1 80 5 KAPA Taq DNA Polymerase Recombinant (2x500 units) 6 Primer forward (50nmol) Taq DNA Πολυμεράση, ανασυνδυασμένη, από θερμόφιλο βακτηριακό στέλεχος, Thermus aquaticus strain. Να έχει συγκέντρωση 5 units/ml. Να συνοδεύεται από 10Χ Reaction buffer C χωρίς Mg2+ & 10Χ Reaction buffer D χωρίς Mg2 & Mg 25mM. Σε συσκευασία των 1000 units. Σύνθεση ολιγονουκλεοτιδίων - εκκινητών (forward primers) σε ποσότητα 50nmol, τα οποία μπορεί να φέρουν σήμανση στο 5' ακρο τους (Biotin/ NH2/ SH/ Digoxigenin/ Fluorescein/ etc) καθαρισμένα με HPLC or PAGE. Η απόδοση σε OD260 να είναι μεγαλύτερη του 4. Να υπάρχει η δυνατότητα αποστολής σε aliquots προκαθορισμένης συγκέντρωσης. Να δοθεί τιμή ανά βάση. 1000 u 1 114 1 500
7 Primer reverse (50nmol) Σύνθεση ολιγονουκλεοτιδίων - εκκινητών (reverse primers), σε ποσότητα 50nmol, τα οποία μπορεί να φέρουν σήμανση στο 5' ακρο τους (Biotin/ NH2/ SH/ Digoxigenin/ Fluorescein/ etc) καθαρισμένα με HPLC or PAGE. Η απόδοση σε OD260 να είναι μεγαλύτερη του 4. Να υπάρχει η δυνατότητα αποστολής σε aliquots προκαθορισμένης συγκέντρωσης. Να δοθεί τιμή ανά βάση. 1 500 8 Probe (50nmol) Σύνθεση ιχνηθετών (probes), σε ποσότητα 50nmol, τα οποία μπορεί να φέρουν σήμανση στο 5' ακρο τους (Biotin/ NH2/ SH/ Digoxigenin/ Fluorescein/ etc) καθαρισμένα με HPLC or PAGE. Η απόδοση σε OD260 να είναι μεγαλύτερη του 4. Να υπάρχει η δυνατότητα αποστολής σε aliquots προκαθορισμένης συγκέντρωσης. Να δοθεί τιμή ανά βάση. 1 500 9 IPTG (Isopropylβ-Dthiogalactoside) IPTG Molecular biology grade. DNases/RNases/Proteases free. 5 gr 1 85 10 Protino Ni-NTA Columns 1 ml (MACHEREY- NAGEL) Στήλες καθαρισμού ανασυνδυασμένων πρωτεϊνών σημασμένων με ουρά πολυιστιδινών μέσω χρωματογραφίας συγγένειας μετάλλου. Ο όγκος της στήλης να είναι 1 ml. Το σύστημα να είναι συμβατό με σύριγγα. Ο προσδέτης να είναι Nitrilotriacetic acid (NTA). Το υλικό υποστήριξής του να είναι 6 % cross-linked beaded 5 x 1 ml columns 1 175
agarose, με μεγέθη beads 45 165 μm. Η στήλη να προσδένει έως 50 mg πρωτεΐνης. Nα διατίθεται σε συσκευασία των 5 x 1 ml στηλών. 11 Protino Ni-NTA Agarose (MACHEREY- NAGEL) Μικροσωματίδια καθαρισμού ανασυνδυασμένων πρωτεϊνών σημασμένων με ουρά πολυιστιδινών μέσω χρωματογραφίας συγγένειας μετάλλου. Τα σωματίδια είναι κατάλληλα για πρόσδεση πρωτεΐνης μετά από ανάμιξη στο διάλυμα έκφρασης και έκλουση σε στήλη λόγω βαρύτητας. Ο όγκος της στήλης να είναι 1 ml. Ο προσδέτης να είναι Nitrilotriacetic acid (NTA). Το υλικό υποστήριξής του να είναι 6 % cross-linked beaded agarose, με μεγέθη beads 45 165 μm. Το υλικό να βρίσκεται σε 50 % υδατικό διάλυμα, επεξεργασμένο με Ni2+. Η στήλη να προσδένει έως 50 mg πρωτεΐνης. Nα διατίθεται σε συσκευασία των 25mL. 25 ml 1 315 12 kpni-hf (ΝΕΒ) Περιoριστικό ένζυμο KpnI-HF. Τα περιοριστικά ένζυμα υψηλής πιστότητας (High Fidelity-HF ) έχουν 100% δραστικότητα στο CutSmart Buffer. Χρόνος δράσης 5-15 min με δυνατότητα ολονύκτιας πέψης χωρίς καταστροφή του DNA. Το προϊόν να περιέχει 4000 units KpnI-HF, 10X CutSmart Buffer, 6X Gel Loading Dye, Purple. 4000 u 1 58
13 HindIII-HF (NEB) Περιoριστικό ένζυμο HindIII-HF. Τα περιοριστικά ένζυμα υψηλής πιστότητας (High Fidelity-HF ) έχουν 100% δραστικότητα στο CutSmart Buffer. Χρόνος δράσης 5-15 min με δυνατότητα ολονύκτιας πέψης χωρίς καταστροφή του DNA. Το προϊόν να περιέχει 10000 units HindIII- HF, 10X CutSmart Buffer, 6X Gel Loading Dye, Purple. 10000 u 1 49 14 ΦX174 DNA- HaeIII Digest (ΝΕΒ) 15 RNeasy Mini Kit (Qiagen) 16 QIAexpress Type IV Kit (Qiagen) ØX/Hae III Digest, συγκέντρωσης 1000 μg/ml αποτελούμενο από 11 double-stranded DNA fragments. Το προϊόν να περιέχει και Gel Loading Dye, Blue (6X). Πλήρες kit για την ταχεία απομόνωση Total RNA από κύτταρα ζώων, ιστούς ζώων και ζύμες, και τον καθαρισμό RNA από ακατέργαστα μίγματα διεργασιών και αντιδράσεων RNA (π.χ. πέψη με DNase ή πρωτεϊνάσες, αντιδράσης λιγάσης και επισήμανσης RNA. Να χρησιμοποιεί τεχνολογία Silica Membrane με spin columns. Η διαδικασία να επιτυγχάνεται σε λιγότερο από 30 λεπτά. Να περιλαμβάνει κολόνες, κολόνες συλλογής, σωληνάρια συλλογής, Buffer RLT, Buffer RW1, Buffer RPE, RNase-Free Water. Nα διατίθεται σε συσκευασία των 50 απομονώσεων. Κιτ που περιέχει 5 μg από κάθε πλασμίδιο-φορέα (vector): pqe- 30, pqe-31, pqe-32 (N-terminal 6xHis) και 10 ml Ni-NTA αγαρόζη. Πλήρες κιτ για την έκφραση και 50 gel lanes 3 68 50 preps 1 284 1 702
τον καθαρισμό ανασυνδυασμένων πρωτεϊνών σημασμένων με πολυ-ιστιδίνη. 17 Superscript II Reverse Transcriptase (Invitrogen) 18 Hi-Flow Plus 180 Membrane Cards 19 G041 Glass Fiber Conjugate Pad Rolls 20 C083 Cellulose Fiber Sample Pad Roll Η αντίστροφη μεταγραφάση SuperScript II είναι γενετικά τροποποιημένο ένζυμο, ώστε να έχει μειωμένη δραστικότητα RNase H, γεγονός που εμποδίζει την καταστροφή των μορίων RNA κατά τη σύνθεση του cdna, καθιστώντας εξαιρετική την απόδοση της αντίδρασης. Το προϊόν να περιέχει 10000 units SuperScript II, συγκέντρωσης 200 U µl, 5X first-strand buffer και 100 mm DTT. Μεμβράνες νιτροκυτταρίνης προ-τοποθετημένες σε πλαστικό υπόστρωμα που περιλαμβάνει τρεις επιπλέον θέσεις για την κατασκευή βιοαισθητήρων τύπου ταινίας. Να έχουν διαστάσεις 6 cm x 30 cm και capillary flow time 180 sec/4 cm. Μεμβράνη (pad) από ίνες υάλου για την κατασκευή βιοαισθητήρων τύπου ταινίας. Να έχουν διαστάσεις: πλάτος 8mm, μήκος 100m, διαστάσεις φίλτρου 0.8cm x 100m. Μεμβράνη (pad) από νιτροκυτταρίνη για την κατασκευή βιοαισθητήρων τύπου ταινίας. Να έχουν διαστάσεις: πλάτος 17mm, μήκος 100m, διαστάσεις φίλτρου 1.7cm x 100m. 10000 u 1 151 100 cards 1 450 1 roll 1 46 1 roll 1 26 Προϋπολογισμός 4.889,00
Η Δράση «Ενίσχυση Μεταδιδακτόρων Ερευνητών/τριών» του ΕΠΕΔΒΜ με Δικαιούχο την Γενική Γραμματεία Έρευνας και Τεχνολογίας συγχρηματοδοτείται από το Ευρωπαϊκό Κοινωνικό Ταμείο (ΕΚΤ) και από Εθνικούς Πόρους. Ο Προϋπολογισμός της δαπάνης είναι μέχρι του ποσού των 4.889,00 (πλέον Φ.Π.Α) Καταληκτική ημερομηνία: 02-12-2014 Πληροφορίες: Γραφείο Προμηθειών του Ε.Ι.Π. Λ. Βασ. Σοφίας 127, Αθήνα Αναστάσιος Μαΐδης Τηλέφωνο: 210 6478847 E-mail: maidis@pasteur.gr Ο Οικονομικός Υπεύθυνος του Ε.Ι.Π. Ιωάννης Κούσκος ΕΥΡΩΠΑΪΚΗ ΕΝΩΣΗ ΕΥΡΩΠΑΪΚΟ ΤΑΜΕΙΟ ΠΕΡΙΦΕΡΕΙΑΚΗΣ ΑΝΑΠΤΥΞΗΣ Υπουργείο Παιδείας, Δια Βίου Μάθησης και Θρησκευμάτων ΓΓΕΤ ΕΥΔΕ-ΕΤΑΚ