ΙΝΑ Ν Ρ Α Ι Ρ Ο Ε Τ Ε Α Τ Ι Α ΡΕ Ρ Ι Ε ΑΣ Α ΜΕΛ Ε Ε Λ Τ Ε Η Τ Σ ΜΙΚΡΟ Ρ ΒΙ Β ΟΛ Ο Ο Λ ΓΙ Γ ΚΗΣ Π ΟΙΟΤΗ Τ ΤΑ Τ Σ Α Υ Υ Α Τ Α Ω Τ Ν



Σχετικά έγγραφα
ISO/TS :2012 Kαταμέτρηση Salmonella spp μέθοδος mini MPN

ΑΝΑΘΕΩΡΗΣΗ ΤΗΣ EN ISO 6579

ΜΕΘΟΔΟΙ ΑΝΙΧΝΕΥΣΗΣ ΚΑΙ ΑΡΙΘΜΗΣΗΣ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΩΝ ΠΟΥ ΒΡΙΣΚΟΝΤΑΙ ΣΕ ΧΑΜΗΛΟ ΠΛΗΘΥΣΜΟ ΣΤΑ ΤΡΟΦΙΜΑ

ΜΕΘΟΔΟΛΟΓΙΕΣ ISO ΑΝΑΛΥΣΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΩΝ- ΔΕΙΚΤΩΝ ΜΟΛΥΝΣΗΣ ΝΕΡΟΥ

Β Σ Α Ι Σ ΚΕ Κ Σ Ε ΜΙ Μ ΚΡ Κ Ο Ρ ΒΙ Β ΟΛΟ Λ ΓΙΚΕ Κ Σ Ε Σ ΠΑΡ Α Α Ρ Μ Α Ε Μ Τ Ε ΡΟ Ρ Ι ΣΤ Σ Ο Τ Ν

ΚΟΛΟΒΑΚΤΗΡΙΟΕΙΔΗ ΕΝΤΕΡΙΚΗΣ ΠΡΟΕΛΕΥΣΗΣ ΚΟΛΟΒΑΚΤΗΡΙΟΕΙΔΗ ESCHERICHIA COLI

Περιγραφή και βασικός χειρισµός του οπτικού µικροσκοπίου.

ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΤΡΟΦΙΜΩΝ

Ερμηνεία αποτελεσμάτων για μικροβιολογικές παραμέτρους και διορθωτικές ενέργειες

ΠΑΡΕΧΟΜΕΝΕΣ ΥΠΗΡΕΣΙΕΣ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟΥ ΥΓΙΕΙΝΗΣ & ΕΠΙΔΗΜΙΟΛΟΓΙΑΣ

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΑΣΚΗΣΗ 3 Η ΜΚΡΟΒΙΟΛΟΠΚΟΣ ΕΛΕΓΧΟΣ ΝΕΡΟΥ

BD Triple Sugar Iron Agar (TSI Agar)

Εργαστηριακές Δοκιμασίες που πραγματοποιούνται στο Π.Ε.Δ.Υ Κρήτης.

Εργαστηριακή καλλιέργεια μικροοργανισμών

ΠΑΡΕΧΟΜΕΝΕΣ ΥΠΗΡΕΣΙΕΣ Π.Ε.Δ.Υ. ΘΕΣΣΑΛΙΑΣ

Μικροβιολογικός έλεγχος νερού Άσκηση 3η

ISO : Οριζόντια μέθοδος ανίχνευσης Σαλμονέλλας

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΠΑΤΡΩΝ ΙΑΤΡΙΚΗ ΣΧΟΛΗ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΥΓΙΕΙΝΗΣ ΜΟΝ. ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑΣ

Μικροβιολογική Ποιότητα Υδάτων και Δημόσια Υγεία

Ταυτοποίηση Gram-αρνητικών αναεροβίων βακτηρίων

ΕΡΓΑΣΗΡΙΑΚΕ ΜΕΘΟΔΟΙ ΓΙΑ ΣΙ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΚΕ ΠΑΡΑΜΕΣΡΟΤ ΚΑΙ ΣΗ ΛΕΓΕΩΝΕΛΛΑ

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΑ ΔΙΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΩΝ ΔΟΚΙΜΩΝ ΑΝΙΧΝΕΥΣΗΣ ΣΑΛΜΟΝΕΛΛΩΝ ANNEX D ISO 6579:2002 PT 0088 SALMONELLA IN POULTRY VLA / VETQAS

ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΑ. Κεφάλαιο 3 Ένζυμα που Χρησιμοποιούνται στην Τυροκομία

ΒΙΟΜΗΧΑΝΙΑ Θρεπτικά υλικά έτοιμα προς χρήση

BD DCLS Agar, Modified / Hektoen Enteric Agar (Biplate)

Ταυτοποίηση Gram-αρνητικών αναεροβίων βακτηρίων

ΙΑΤΡΙΚΗ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΙΙ

Υγιεινή Τροφίμων. Παθογόνοι μικροοργανισμοί που σχετίζονται με τα τρόφιμα. Τροφοτοξινώσεις & Τροφολοιμώξεις

ΠΑΡΕΧΟΜΕΝΕΣ ΥΠΗΡΕΣΙΕΣ Π.Ε.Δ.Υ. ΚΡΗΤΗΣ

Ανάπτυξη Mοριακών Tεχνικών Real-Time PCR για την Aνίχνευση Eντεροαιμορραγικών Στελεχών E. coli, Campylobacter jejuni και Salmonella spp.

ΚΕΦΑΛΑΙΟ IV ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ ΚΕΦΑΛΑΙΟ IV 1 V ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΤΡΟΦΙΜΩΝ & ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΚΗΣ ΑΝΑΛΥΣΗΣ

BD BBL TM CHROMagar TM CPE

Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών. Χρώση Gram. Δοκιμή καταλάσης. Δοκιμή οξειδάσης

ΜΕΛΕΤΗ ΤΗΣ ΜΙΚΡΟΧΛΩΡΙ ΑΣ ΝΩΠΟΥ ΠΡΟΒΕΙΟΥ ΓΑΛΑΚΤΟΣ ΚΑΙ ΣΥΣΧΕΤΙΣΗ ΤΗΣ ΜΕ ΤΗΝ ΥΓΙΕΙΝΗ ΚΑΙ ΤΗΝ ΠΟΙΟΤΗΤΑ ΤΟΥ

1ST OLYMPUS INTERNATIONAL CONFERENCE ON SUPPLY CHAINS, 1-2 OCTOBER, KATERINI, GREECE

BD CHROMagar Orientation Medium

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Επιμέλεια : Dr Ιωάννης Δετοράκης

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

Οι Μικροοργανισμοί σαν Δείκτες Ασφάλειας των Τροφίμων

ΣΗΜΕΙΩΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΣΜΕΝΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑΣ. Μαντώ Κυριακού

Υγιεινή πόσιμων υδάτων ρ. Λάμπρος Νούσης

ΚΑΤΑΛΟΓΟΣ. Βιομηχανικής Μικροβιολογίας

ΗΜΕΡΙΔΑ «Ολοκληρωμένη Περιβαλλοντική Διαχείριση Κτηνοτροφικών Αποβλήτων»

Δειγματοληψίες ύδατος για την αναζήτηση μικροοργανισμών

Υγιεινή Τροφίμων. Αλλοιογόνοι μικροοργανισμοί των τροφίμων. Αλλοίωση τροφίμων

BD BBL Enterotube II

Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών. Μικροβιολογικά Θρεπτικά Υποστρώματα

ΠΑΡΕΧΟΜΕΝΕΣ ΥΠΗΡΕΣΙΕΣ ΔΙΚΤΥΟΥ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΩΝ ΔΗΜΟΣΙΑΣ ΥΓΕΙΑΣ - ΔΙΑΠΙΣΤΕΥΜΕΝΕΣ. Είδος Δείγματος Εξεταζόμενη παράμετρος Μέθοδος Πρότυπο

ΕΠΙΔΗΜΙΟΛΟΓΙΑ ΥΔΑΤΟΓΕΝΩΝ ΚΑΙ ΤΡΟΦΙΜΟΓΕΝΩΝ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΧΡ. ΖΗΛΙΔΗΣ ΗΜΕΡΙΔΑ ELQA

ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΤΡΟΦΙΜΩΝ

Εθνικό Σύστημα Διαπίστευσης. Παράρτημα F1/8 του Πιστοποιητικού Aρ.689-2

Εμπειρία και συμπεράσματα από τις πειραματικές τυροκομήσεις γραβιέρας στην Κρήτη. Η χρήση του νωπού γάλακτος προβάτων και αυγών για την παραγωγή

Βιολογία Θετικής Κατεύθυνσης

BD CHROMagar Orientation Medium / Columbia CNA Agar (Biplate)

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών. Εργαστήριο: Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

BD CLED Agar (Bevis)

Παθογόνοι μικροοργανισμοί και Τροφικές ασθένειες

BD BBL CHROMagar ESBL (Biplate)

Σημειώσεις για την εργαστηριακή άσκηση ΑΝΑΛΥΣΗ ΓΑΛΑΚΤΟΣ του Εργαστηρίου Ανάλυσης και Τεχνολογίας Τροφίμων Καθηγητής Ιωάννης Ρούσσης.

"Ποιότητα Νερών - Ο Ρόλος του Περιφερειακού Εργαστηρίου ηµόσιας Υγείας"

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι Εργαστήριο

Εργαστηριακή Άσκηση 1 ΠΑΡΑΣΚΕΥΗ ΚΑΙ ΑΠΟΣΤΕΙΡΩΣΗ ΘΡΕΠΤΙΚΩΝ ΜΕΣΩΝ

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

Δ. Μείωση του αριθμού των μικροοργανισμών 4. Να αντιστοιχίσετε τα συστατικά της στήλης Ι με το ρόλο τους στη στήλη ΙΙ

Χρήση για εργασίες εργαστηριακής κλίμακας

ΤΑΥΤΟΠΟΙΗΣΗ GRAM (-) ΒΑΚΤΗΡΙΔΙΩΝ

ΚΕΦΑΛΑΙΟ 8. Μεταβολισμός των Βακτηρίων

Τίτλος Μαθήματος: Γενική Μικροβιολογία. Ενότητα: ΔΙΑΤΡΟΦΗ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ. Διδάσκων: Καθηγητής Ιωάννης Σαββαΐδης. Τμήμα: Χημείας

εργαστηριακό έλεγχο Κατσιαφλάκα Άννα Βιοπαθολόγος,Msc Επικ. Επιμελήτρια Β Εργαστήριο Υγιεινής κι Επιδημιολογίας

Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών. Η απαρίθμηση του μικροβιακού πληθυσμού στα τρόφιμα

Μικροβιολογική Υγιεινή Τροφίμων και Ύδατος σε περίοδο οικονομικής κρίσης. Χ. Πανούλης Κτηνίατρος Μικροβιολόγος Υγιεινολόγος Τροφίμων Π.Ε.Δ.Υ.

ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ Ι) ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΗ. της. Συνέπεια βακτηρίων αύξησή τους Η. της. αναπαραγωγής είναι η πληθυσμιακή. απλή. διαίρεση διχοτόμηση.

Ταυτοποίηση βακτηρίων: συμβατικές και αυτοματοποιημένες μέθοδοι

BD CLED Agar / MacConkey II Agar (Biplate)

Μικροβιο λογικός έλεγχος ποιότητας σε γενόσημα φάρμακα

ΣΚΟΠΟΣ ΤΗΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ Η Η σύγκριση µεθόδων για την καταµέτρηση E.coliσε σύγκριση µε την επίσηµη µεθοδο που προτείνει η Ευρωπαϊκή οδηγία για την ποιότητα

ΕΘΝΙΚΗ ΣΧΟΛΗ ΔΗΜΟΣΙΑΣ ΥΓΕΙΑΣ ΕΙΔΙΚΟΣ ΛΟΓΑΡΙΑΣΜΟΣ ΚΟΝΔΥΛΙΩΝ ΕΡΕΥΝΑΣ. Λ. Αλεξάνδρας 196, Αθήνα

Τίτλος Μαθήματος: Γενική Μικροβιολογία. Ενότητα: ΚΑΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ. Διδάσκων: Καθηγητής Ιωάννης Σαββαΐδης. Τμήμα: Χημείας

Aντιμικροβιακή αντοχή Escherichia coli από χοίρους στα στάδια του απογαλακτισμού και της πάχυνσης σε 14 ελληνικές εκτροφές

Προκαταρτική ταυτοποίηση Συμβατικές μέθοδοι. Μαρία Φουστούκου

ΝΕΕΣ MΟΡΙΑΚΕΣ ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΤΥΠΟΠΟΙΗΣΗ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ

BD Mac Conkey II Agar / Columbia CNA Agar with 5% Sheep Blood (Biplate)

ΠΑΡΕΧΟΜΕΝΕΣ ΥΠΗΡΕΣΙΕΣ Κ.Ε.Δ.Υ.

ΛΟΙΜΩΞΕΙΣ ΣΤΟ ΔΙΑΒΗΤΙΚΟ ΠΟΔΙ Επιδημιολογία των παθογόνων στελεχών στην Ελλάδα

Μικροβιολογία Τροφίμων Ι

BD Modified CNA Agar BD Modified CNA Agar with Crystal Violet

Μικροβιολογία Καλλιέργεια µικροοργανισµών

Εντεροβακτηριοειδή. Salmonella-Shigella

7. Βιοτεχνολογία. α) η διαθεσιμότητα θρεπτικών συστατικών στο θρεπτικό υλικό, β) το ph, γ) το Ο 2 και δ) η θερμοκρασία.

Διακήρυξη 93/ Οι ενδιαφερόμενοι να υποβάλουν τις προσφορές τους στο Γραφείο Προμηθειών του 401 ΓΣΝΑ.

Από τον Δρ. Φρ. Γαΐτη* για το foodbites.eu

ΑΡΙΣΤΟΤΕΛΕΙΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΘΕΣΣΑΛΟΝΙΚΗΣ ΤΜΗΜΑ ΓΕΩΠΟΝΙΑΣ ΤΟΜΕΑΣ ΕΠΙΣΤΗΜΗΣ ΚΑΙ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ ΤΡΟΦΙΜΩΝ

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΑΣΚΗΣΗ 11 ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΟΣ ΠΛΗΘΥΣΜΟΥ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΩΝ ΓΑΛΑ ΚΑΙ ΓΙΑΟΥΡΤΙ Ιωάννης Ρούσσης

ΚΑΣΑΛΟΓΟ ΠΑΡΕΥΟΜΕΝΩΝ ΤΠΗΡΕΙΩΝ

Transcript:

ΣΕΜΙΝΑΡΙΟ ΕΤΑΙΡΕΙΑΣ ΜΕΛΕΤΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΚΗΣ ΠΟΙΟΤΗΤΑΣ Υ ΑΤΩΝ 9-11 ΝΟΕΜΒΡΙΟΥ 2009, ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΠΑΤΡΩΝ, ΡΙΟ «ΧΡΗΣΗ ΧΡΩΜΟΓΟΝΩΝ ΥΛΙΚΩΝ ΣΤΟ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΝΕΡΟΥ» ρ. ΓΕΩΡΓΙΑ ΒΑΣΙΛΑΝΤΩΝΟΠΟΥΛΟΥ ΝΟΕΜΒΡΙΟΣ 2009

Τι άλλο θα µπορούσε να ανιχνευθεί στο νερό;

Τι µπορεί να ανιχνευθεί σε µια σταγόνα νερού;

ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΑ ΠΑΡΟΥΣΙΑΣΗΣ ΣΕΜΙΝΑΡΙΟΥ Τι είναι τα χρωµογόνα και φθορογόνα υλικά;ποια είναι η ανάγκη χρησιµοποίησης τους; Ποιος είναι ο βιοχηµικός τους µηχανισµός; Ποιο είναι το πεδίο εφαρµογής τους; Ποια είναι τα πλεονεκτήµατα της χρήσης χρωµογόνων / φθορογόνων υλικών; Παρουσίαση χρωµογόνων / φθορογόνων υλικών και µικροοργανισµών, για την ανίχνευση των οποίων χρησιµοποιούνται. Φύση δειγµάτων που αναλύονται µε χρωµογόνα / φθορογόνα υλικά. Βασικές αρχές ανάλυσης µικροβιολογικών παραµέτρων µε χρωµογόνα / φθορογόνα υλικά. Ιδιαιτερότητες χρήσης χρωµογόνων / φθορογόνων υλικών. Πληροφορίες από την βιβλιογραφία για τον τρόπο χρήσης και την απόδοση των χρωµογόνων / φθορογόνων υλικών. Χρήση των χρωµογόνων / φθορογόνων υλικών για την ανίχνευση ολικών κολοβακτηριοειδών και στελεχών Escherichia coli, στελεχών Salmonella, στελεχών Clostridium perfringens στο µικροβιολογικό εργαστήριο της Υπηρεσίας Ελέγχου Ποιότητας Ύδατος της Ε.Υ.Α.Π.

Η µικροβιολογική ανάλυση της ποιότητας του νερού βασίζεται στην καλλιέργεια βακτηρίων σε θρεπτικά υποστρώµατα

ΧΡΩΜΟΓΟΝΑ ΣΥΣΤΑΤΙΚΑ ΠΟΥ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΥΝΤΑΙ ΣΤΗΝ ΑΝΙΧΝΕΥΣΗ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΩΝ Ολικά κολοβακτηριοειδήκαι και στελέχη Escherichia coli: o- phenyl-β-d-galactopyranoside (ONPG) p-nitro-phenyl-β-d-galactopyranoside (PNPG) 4- methylumbelliferyl-β-d-galactopyranoside (MUGal) 5-bromo-4 chloro- 3 indoxyl-β-d-galactopyranoside (X-Gal) 4- methylumbelliferyl-β-d-glucuronide (MUG) indoxyl-β-d-glucuronide (IBDG) 5-bromo-4 chloro- 3 indoxyl-β-d-glucuronide (X-Glu) Στελέχη Salmonella: 4- methylumbelliferyl-caprylate (MUCAP) 3,4 cyclohexenoesculetin-β-d-galactoside 5-bromo-4 chloro- 3 indoxyl-β-d-galactopyranoside Ανίχνευση κόκκων: 5-bromo-4 chloro- 3 indoxyl-α-d-galactopyranoside 4- methylumbelliferyl-α-d-galactopyranoside

ΠΛΕΟΝΕΚΤΗΜΑΤΑ ΧΡΗΣΗΣ ΧΡΩΜΟΓΟΝΩΝ / ΦΘΟΡΟΓΟΝΩΝ ΣΥΣΤΑΤΙΚΩΝ Εξοικονόµηση χρόνου (ταχύτερη διεξαγωγή αποτελέσµατος) Μεγαλύτερη ευαισθησία (ευαίσθητες βιοχηµικές αντιδράσεις) Εξοικονόµηση υλικών και σκευών (ελαχιστοποίηση επιβεβαιωτικών ανακαλλιεργειών) Μεγάλη διακριτική ικανότητα από τους µη-στόχους µικροοργανισµούς Ευνοϊκή ανάπτυξη τραυµατισµένων µειωµένης ζωτικότητας µικροοργανισµών Μικρότερος κόπος αναλυτή

ΒΙΟΧΗΜΙΚΟΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΣ ΡΑΣΗΣ Λακτόζη lac Z γονίδιο lac Y γονίδιο β-galactosidase β-galactosidase permease Γαλακτόζη + Γλυκόζη

ΒΙΟΧΗΜΙΚΟΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΣ ΡΑΣΗΣ 4- methylumbelliferyl-β-d-glucuronide (MUG) (άχρωµο) Η 2 Ο + β-d-glucuronidase uid A γονίδιο Glucuronic acid 4-methylumbelliferon (άχρωµο) (φθορίζον)

ΑΛΛΕΣ ΜΕΘΟ ΟΙ ΧΡΗΣΗΣ ΧΡΩΜΟΓΟΝΩΝ / ΦΘΟΡΟΓΟΝΩΝ ΚΑΙ ΑΝΙΧΝΕΥΣΗΣ ΤΗΣ ΡΑΣΗΣ ΤΩΝ ΕΝΖΥΜΩΝ Προσθήκη σε καλλιεργητικά υλικά µικροβιολογικής ανάλυσης. PCR (ανίχνευση γονιδίων lac Zκαι lac Y και uida). ELISA (ανοσολογικά ταχέα tests). Solid phase cytometry Σπεκτροφθοροµετρία (GLUase assay, GALase assay). CHEMISCAN RDI. COLIFAST.

ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΟΙ / ΧΡΩΜΟΓΟΝΑ ΦΘΟΡΟΓΟΝΑ ΥΛΙΚΑ Ολικά κολοβακτηριοειδή και στελέχη Escherichia coli: Colilert/18 (Indexx), Chromocult Coliform agar CCA (Merck), LMX (Merck), mx-gal medium, CCCFS (Merck), CHROMagar ECC, CHROMagar + pyruvate CECCP, ONPG-MUG test, Colisure test(indexx), m- Coliblue 24 test (Hach Co.), E* Colite TM test (Charm Sciences, Inc), Readycult Coliforms 100 P/A test (Merck), Harlequin TBGA (LabM), Harlequin E.coli/coliforms medium (LabM), m-lactose Glucuronide agar m-lga (Oxoid), TBX (Oxoid), MI agar, CHROMagar E.coli, Coli ID (Biomerieux), Fluorocult Brila broth (Merck), Fluorocult DEN lactose peptone broth (Merck), Fluorocult ECD agar (Merck), Fluorocult SB (Merck), Fluorocult MacConkey agar (Merck), Fluorocult VRB agar (Merck). Στελέχη Listeria: ΑLOA, RAPID L monocytogenes. Στελέχη Escherichia coli O157:H7 : MacConkey sorbitol agar+bcig, Rainbow agar O157, Fluorocult O157 agar (Merck). Στελέχη Salmonella: ABC Salmonella (Oxoid), CHROMagar Salmonella medium (BBL), Harlequin ABC Salmonella (labm), Chromogenic Salmonella Esterase CSE agar, Rambach agar, Salmonella Detection and Identification medium (Biomerieux), Hi-Chrome Salmonella medium (Fluka). Στελέχη Clostridium perfringens: TSC-supplement Fluorocult (Merck), m-cp medium + SR188 (Oxoid) Στελέχη Staphylococcus aureus: CHROMagar staph aureus (BBL) Παθογόνοι µικρ/ισµοί σε δείγµα ούρων: CPS ID2 (Biomerieux), CHROMagar orientation medium, Uriselect3 medium (Sanofi Diagnostics Pasteur), Rainbow agar UTImediun (Biolog), Chromogenic UTI medium (Oxoid).

ΠΕ ΙΟ ΧΡΗΣΗΣ ΧΡΩΜΟΓΟΝΩΝ ΦΘΟΡΟΓΟΝΩΝ ΥΛΙΚΩΝ Έλεγχος ποιότητας πόσιµου νερού. Έλεγχος ποιότητας επιφανειακού νερού. Έλεγχος ποιότητας θαλάσσιου νερού. Έλεγχος ποιότητας εµφιαλωµένου νερού. Έλεγχος ποιότητας νερού από επεξεργασία λυµάτων. Έλεγχος ποιότητας γάλακτος και γαλακτοκοµικών. Έλεγχος ποιότητας κρέατος. Έλεγχος ποιότητας έτοιµου φαγητού. Έλεγχος µικροοργανισµών εδάφους. Έλεγχος παθογόνων µικροοργανισµών σε κόπρανα. Έλεγχος παθογόνων µικροοργανισµών σε ούρα.

ΠΡΟΒΛΗΜΑΤΙΣΜΟΙ ΣΤΗΝ ΑΝΑΛΥΣΗ ΝΕΡΟΥ ΜΕ ΧΡΩMΟΓΟΝΑ-ΦΘΟΡΟΓΟΝΑ ΥΛΙΚΑ Παρά την εκλεκτικότητα των θρεπτικών υλικών, υφίστανται τα ψευδώς (+) για την ανίχνευση β-γαλακτοσιδάσης και β-γλυκουρονιδάσηςαποτελέσµατα Η Η επιλογή της βέλτιστης θερµοκρασίας επώασης του υλικού. Η Η επιλογή του βέλτιστου χρόνου επώασης του υλικού. Η Η εκτίµηση του χρωµατισµού αποικιών που αναπτύσσονται σε χρωµογόνα υλικά. Παρά την εκλεκτικότητα των θρεπτικών υλικών, υφίστανται τα ψευδώς (-) για την ανίχνευση β-γλυκουρονιδάσηςαποτελέσµατα σε φθορογόναυλικά. Ο Ο φυσικός φθορισµός των αποικιών Ψευδοµονάδας. Οι απαραίτητες επιβεβαιώσεις µε βιοχηµικά τεστ. Η Η ιδιαιτερότητα της φύσης του δείγµατος νερού, που αναλύουµε.

ΜΙΚΡΟΡΓΑΝΙΣΜΟΙ ΠΟΥ ΑΠΟΜΟΝΩΝΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΧΡΩΜΟΓΟΝΑ - ΦΘΟΡΟΓΟΝΑ ΥΛΙΚΑ ( β- GALACTOSIDASE ΘΕΤΙΚΑ) Aeromonas hydrophila/caviae Alcaligenes species Enterobacter clocae Enterobacter sakazakii Pantoea (enterobacter agglomerans) Erwinia nigrifluens Escherichia coli Escherichia vulneris Hafnia alvei Serratia liquefaciens Serratia plymuthica Serratia rubidaea Shewanella putreficiens Staphylococus species Tatumella ptyseos Vibrio fluvialis Stenotrophonomas maltophila Yersinia enterocolitica Yersinia frederiksenii Yersinia kristensenii Serratia fonticola Rahnella aquatilis Pseudomonas species Leclercia adecarboxylata

GRAM-ΑΡΝΗΤΙΚΑ ΒΑΚΤΗΡΙΑ ΜΕ ΕΝΕΡΓΟΤΗΤΑ β-d-glucuronidase ΕΙ ΟΣ ΑΡΙΘΜΟΣ ΘΕΤΙΚΩΝ ΣΤΕΛΕΧΩΝ ΓΙΑ β-gluase ΠΟΣΟΣΤΟ % Citrobacter 4/193 2 Edwardsiella 0/7 0 Enterobacter 1/291 0.3 Escherichia 2252/2395 94 Hafnia 0/111 0 Klebsiella 3/640 0.4 Proteus 0/854 0 Salmonella 277/749 36.9 Arizona 29/69 42 Serratia 3/96 3.1 Shigella 367/524 50.9 Yersinia 6/62 9.6 Pseudomonas 2/114 1.7 Aeromonas 0/135 0 Vibrio 0/70 0 Erwinia 0/14 0 Alcaligenes 0/2 0 Acinetobacter 0/2 0 Moxarella 0/1 0

ΒΙΟΧΗΜΙΚΕΣ Ι ΙΟΤΗΤΕΣ ΣΤΕΛΕΧΩΝ ESCHERICHIA COLI ΕΙ ΟΣ INDOLE ΠΟΣΟΣΤΑ ΘΕΤΙΚΩΝ ΑΝΤΙ ΡΑΣΕΩΝ MR VP CITRATE LACTOSE GAS FROM LACTOSE H2S KCN β-gluase E.adecarboxylata >90 >90 0 <10 >90 >95 <10 >90 (-) E. blattae 0 100 0 50 0 0 0 0? E. coli 98 99 0 1 95 95 1 3 (+) E.coli ανενεργή 80 95 0 1 25 25 1 1 (+) E. fergusonii 98 100 0 17 0 0 0 0 (-) E. hermanii 99 100 0 1 45 45 0 94 (-) E. vulneris 0 100 0 0 15 15 0 15 (-)

Φωτογραφία ηλεκτρονικού µικροσκοπίου Escherichia coli

ΤΟ Υ ΡΕΥΤΙΚΟ ΣΥΣΤΗΜΑ ΤΗΣ ΑΘΗΝΑΣ

ΣΥΓΚΡΙΣΗ ΥΛΙΚΩΝ ΣΕ ΕΙΓΜΑΤΑ ΕΠΙΦΑΝΕΙΑΚΟΥ ΝΕΡΟΥ ΜΕΘΟ ΟΙ / ΥΛΙΚΑ ΟΛΙΚΑ ΚΟΛ/ΕΙ Η (n=120) Νo (%) ΕΙΓΜΑΤΩΝ ΘΕΤΙΚΩΝ ΓΙΑ ΣΤΕΛΕΧΗ E.coli (n=120) LSB broth (35 o C/ 48hrs) 120 (100%) 96 (80%) Colilert (35 o C/ 48hrs) 100 (83.3%) 99 (82.5%) M-ENDO LES agar (35 o C/ 24hrs) 120 (100%) 95 (79%) Tergitol 7 agar (35 o C/ 24hrs) 120 (100%) 112 (93.7%) CCA agar (35 o C/ 24hrs) 120 (100%) 114 (95%) m-fc agar (35 o C/ 48hrs) 111 (92.5%)

ΣΥΓΚΡΙΣΗ ΥΛΙΚΩΝ ΣΕ ΕΙΓΜΑΤΑ ΠΟΣΙΜΟΥ ΝΕΡΟΥ ΜΕΘΟ ΟΙ / ΥΛΙΚΑ ΟΛΙΚΑ ΚΟΛ/ΕΙ Η (n=120) Νo (%) ΕΙΓΜΑΤΩΝ ΘΕΤΙΚΩΝ ΓΙΑ ΣΤΕΛΕΧΗ E.coli (n=120) LSB broth (35 o C/ 48hrs) 3 (2,2%) 3 (2,2%) Colilert (35 o C/ 48hrs) 21 (17,8%) 31 (26%) M-ENDO LES agar (35 o C/ 24hrs) 36 (30 30%) 30 (25 25%) Tergitol 7 agar (35 o C/ 24hrs) 60 (50%) 42 (35%) CCA agar (35 o C/ 24hrs) 79 (66%) 50 (42%) m-fc agar (35 o C/ 48hrs) 24 (20%)

ΣΥΓΚΡΙΣΗ ΥΛΙΚΩΝ ΣΕ ΕΙΓΜΑΤΑ ΠΟΣΙΜΟΥ ΝΕΡΟΥ ΜΕΘΟ ΟΙ / ΥΛΙΚΑ ΟΛΙΚΑ ΚΟΛ/ΕΙ Η Νo ΑΠΟΙΚΙΩΝ ΕΙΓΜΑΤΩΝ ΘΕΤΙΚΩΝ ΓΙΑ ΣΤΕΛΕΧΗ E.coli µέση τιµή S.D. ελάχιστη τιµή µέγιστη τιµή µέση τιµή S.D. ελάχιστη τιµή µέγιστη τιµή LSB broth (35 o C/ 48hrs) 4 2 0 15 2 2 0 11 Colilert (35 o C/ 48hrs) 6 4 0 18 3 2 0 11 M-Endo Les agar (35 o C/ 24hrs) 3 1 0 10 1 0 0 3 Tergitol 7 agar (35 o C/ 24hrs) 19 27 0 100 5 4 0 100 CCA agar (35 o C/ 24hrs) 21 19 0 200 6 5 0 200 m-fc agar (35 o C/ 48hrs) 4 2 0 200

Φωτογραφία από τρυβλίο petri µε αποικίες κολοβακτηριοειδώνµε CCA άγαρ

Φωτογραφία από τρυβλίο petriµε αποικίες κολοβακτηριοειδώνµε CCA άγαρ

Φωτογραφία από τρυβλίο petri µε αποικίες κολοβακτηριοειδώνµε CCA άγαρ

ΣΥΓΚΡΙΣΗ ΥΛΙΚΩΝ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΑΣ ΣΤΕΛΕΧΩΝ ΣΑΛΜΟΝΕΛΛΑΣ ΜΕΘΟ ΟΣ ΚΛΑΣΣΙΚΗ: Φιλτράρισµα σε µεµβράνες νιτρικής κυτταρίνης δείγµατος επιφανειακού νερού όγκου πέντε (5) λίτρων, επώαση στους 35 ο C/24 hrs σε Bacto peptone, µετεµβολιασµός σε Rappaport Vassiliadis broth και Selenite Cystine enrichment broth, επώαση στους 35 ο C/24 hrs, επίστρωση τρυβλίων µε Brilliant Green agar (modified) και S.S. agar (modified), επώαση στους 35 ο C/24 hrs, µετεµβολιασµός ύποπτων αποικιών σε Klinger Iron agar, ορολογική ταυτοποίηση µε αντιoρούς H και Ο, και βιοχηµικό τεστ ΑPI20E, ορολογική ταυτοποίηση µε αντιορούς από το Κέντρο Αναφοράς Σαλµονέλας Σιγκέλας (ΕΣ Υ). ΜΕΘΟ ΟΣ ΧΡΩΜΟΓΟΝΟΥ HARLEQUIN SALMONELLA ABC MEDIUM: Φιλτράρισµα σε µεµβράνες νιτρικής κυτταρίνης δείγµατος επιφανειακού νερού όγκου πέντε (5) λίτρων, επώαση στους 35 ο C/24 hrs σε Bacto peptone, µετεµβολιασµός σε Rappaport Vassiliadis broth και Selenite Cystine enrichment broth, επώαση στους 35 ο C/24 hrs, επίστρωση τρυβλίων µε Harlequin Salmonella ABC medium (labm), επώαση στους 35 ο C/24 hrs, µετεµβολιασµός ύποπτων αποικιών σε Klinger Iron agar, ορολογική ταυτοποίηση µε αντιoρούς H και Ο, και βιοχηµικό τεστ ΑPI20E, ορολογική ταυτοποίηση µε αντιορούς από το Κέντρο Αναφοράς Σαλµονέλας Σιγκέλας (ΕΣ Υ). ΜΕΘΟ ΟΣ ΧΡΩΜΟΓΟΝΟΥ ABC SALMONELLA : Φιλτράρισµα σε µεµβράνες νιτρικής κυτταρίνης δείγµατος επιφανειακού νερού όγκου πέντε (5) λίτρων, επώαση στους 35 ο C/24 hrs σε Bacto peptone, µετεµβολιασµός σε Rappaport Vassiliadis broth και Selenite Cystine enrichment broth, επώαση στους 35 ο C/24 hrs, επίστρωση τρυβλίων µε ABC Salmonella (Oxoid), επώαση στους 35 ο C/24 hrs, µετεµβολιασµός ύποπτων αποικιών σε Klinger Iron agar, ορολογική ταυτοποίηση µε αντιoρούς H και Ο, και βιοχηµικό τεστ ΑPI20E, ορολογική ταυτοποίηση µε αντιορούς από το Κέντρο Αναφοράς Σαλµονέλας Σιγκέλας (ΕΣ Υ). ΜΕΘΟ ΟΣ ΧΡΩΜΟΓΟΝΟΥ HI-CHROME SALMONELLA MEDIUM: Φιλτράρισµα σε µεµβράνες νιτρικής κυτταρίνης δείγµατος επιφανειακού νερού όγκου πέντε (5) λίτρων, επώαση στους 35 ο C/24 hrs σε Bacto peptone, µετεµβολιασµός σε Rappaport Vassiliadis broth και Selenite Cystine enrichment broth, επώαση στους 35 ο C/24 hrs, επίστρωση τρυβλίων µεhi-chrome Salmonella medium (Fluka), επώαση στους 35 ο C/24 hrs, µετεµβολιασµός ύποπτων αποικιών σε Klinger Iron agar, ορολογική ταυτοποίηση µε αντιoρούς H και Ο, και βιοχηµικό τεστ ΑPI20E, ορολογική ταυτοποίηση µε αντιορούς από το Κέντρο Αναφοράς Σαλµονέλας Σιγκέλας (ΕΣ Υ).

Φωτογραφία τρυβλίου Petri µε αποικίες κολοβακτηριοειδών και Σαλµονέλας

Μικτή καλλιέργεια Σαλµονέλας/ κολοβακτηριοειδών σε τρυβλίο Harlequin Salmonella ABC agar (LabM)

Μικτή καλλιέργεια Σαλµονέλας κολοβακτηριοειδών σε τρυβλίο ABC Salmonella agar (Oxoid)

Μικτή καλλιέργεια Σαλµονέλας κολοβακτηριοειδών σε τρυβλίο Harlequin Salmonella ABC agar (LabM)

καλλιέργεια Σαλµονέλας σε τρυβλίο Hi-Chrome Salmonella agar (Fluka)

καλλιέργεια Σαλµονέλας σε τρυβλίο Hi-Chrome Salmonella agar (Fluka)

Μικτή καλλιέργεια Σαλµονέλας / κολοβακτηριοειδών σε τρυβλίο ABC Salmonella agar (Oxoid)

Μικτή καλλιέργεια Σαλµονέλας κολοβακτηριοειδών σε τρυβλίο Harlequin Salmonella ABC agar (LabM)

ΣΥΓΚΡΙΣΗ ΥΛΙΚΩΝ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΑΣ ΣΤΕΛΕΧΩΝ CLOSTRIDIUM PERFRINGENS ΜΕΘΟ ΟΣ ΚΛΑΣΣΙΚΗ: Φιλτράρισµα σε µεµβράνες νιτρικής κυτταρίνης δείγµατος νερού όγκου εκατό (100) µικρόλιτρων, επώαση στους 35 ο C/48 hrs σε TSC + SR088E, υπό αναερόβιες συνθήκες καταµέτρηση µαύρων αποικιών και βιοχηµικό τεστ ΑPI20Α. ΜΕΘΟ ΟΣ ΧΡΩΜΟΓΟΝΟΥ m-cp AGAR + SR188: Φιλτράρισµα σε µεµβράνες νιτρικής κυτταρίνης δείγµατος νερού όγκου εκατό (100) µικρόλιτρων, επώαση στους 44 ο C/24 hrs σε m-cp agar + SR188, υπό αναερόβιες συνθήκες καταµέτρηση αποικιών και έκθεση σε ατµούς ΝΗ4ΟΗ, καταµέτρηση αποικιών µε ροζ/κόκκινη απόχρωση, και βιοχηµικό τεστ ΑPI20Α.

ιήθηση,επώαση και αρίθµηση ΑΡΧΗ ΤΗΣ ΜΕΘΟ ΟΥ Το m-clostridium Perfringens (m-cp) medium (CM992 & SR188) είναι ένα εκλεκτικό και χρωµογόνο θρεπτικό υλικό για την τυπική ταυτοποίηση του Clostridium perfringensσε δείγµατα νερού. Ηέλλειψη ενεργότητας β-d-γλυκοσιδάσης (ένα ένζυµο που συµµετέχει στη ζύµωση της γλυκόζης), η ζύµωση της σακχαρόζης και η παρουσία όξινης φωσφατάσης, χρησιµοποιούνται για τη διαφοροποίηση τυπικών αποικιών Cl. perfringensαπό άλλα είδη Clostridium. Η έλλειψη ενεργότητας της β-d-γαλακτοσιδάσης σηµαίνει, πως το Cl. perfringens δεν διασπά τοχρωµογόνο, το indoxyl-β-d-glucoside, στο θρεπτικό υλικό. Επιπλέον, καθώς οι οργανισµοί διασπούν τη σακχαρόζη στο θρεπτικό µέσο, µειώνοντας το ph, ο δείκτης ιώδες της βρωµοκρεσόλης (bromocresol purple) αλλάζει από ιώδες σε κίτρινο. Αυτό έχει ως αποτέλεσµα, χαρακτηριστικές σκούρες κίτρινες αποικίες του Cl. perfringens. Η πλειοψηφία των υπολοίπων ειδών Clostridium εµφανίζονται είτε ωςµωβ αποικίες, λόγω της έλλειψης ζύµωσης της σακχαρόζης, είτε ως µπλε/ πράσινες αποικίες, όπου ο οργανισµός συνεχίζει να διασπά indoxyl-β-d-glucoside και σακχαρόζη.

Επιβεβαίωση Οι τυπικά θετικές αποικίες (ύποπτες) του Cl. perfringens µπορούν να εξεταστούν περαιτέρω για την ενεργότητα όξινης φωσφατάσης µε έκθεση σε ατµούς NH 4 OH (υδροξειδίουτου τουαµµωνίου) αµµωνίου)για 20-30 δευτερόλεπτα. Οιαποικίες Cl. perfringens µετατρέπονται από κίτρινες σε κόκκινες, καθώς η διφωσφορική φαινολοφθαλεΐνη διασπάται από την όξινη φωσφατάση. Σε αποικίες, που δεν διαθέτουν όξινη φωσφατάση, δεν παρατηρείται καµία αλλαγή χρώµατος. Η διεξαγωγή αυτού του επιπλέον τεστ είναι σηµαντική, καθώς υπάρχει ένας πολύ µικρός αριθµός µη-cl. perfringens κλωστριδίων, πουπαράγουν κίτρινες αποικίες. Αυτές οι αποικίες, ωστόσο, παραµένουν κίτρινες µετά την έκθεση σε υδροξείδιο του αµµωνίου,καθώς είναι όξινηςφωσφατάσης-αρνητικές αρνητικές.

Χρησιµοποιούµενα αντιδραστήρια

ιαδικασία επιβεβαίωσης: έκθεση σε ατµούς υδροξειδίου του αµµωνίου για 20-30 δευτερόλεπτα

Φωτογραφία αποικιών Clostridium perfringens µετά την επώαση

Φωτογραφία αποικιών Clostridium perfringens µετά την έκθεση σε ατµούς ΝΗ 4 ΟΗ

Φωτογραφία αποικιών Clostridium perfringens πριν και µετά την έκθεση σε ατµούς ΝΗ 4 ΟΗ