ΠΑΡΕΧΟΜΕΝΕ ΤΠΗΡΕΙΕ Κ.Ε.Δ.Τ. ΣΟΜΕΑ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΣΜΗΜΑ ΝΕΡΩΝ Είδοσ Δείγματοσ Εξεταηόμενθ παράμετροσ Μζκοδοσ Πρότυπο Κατάςταςθ 1. Νερά ανκρϊπινθσ κατανάλωςθσ, φυςικά μεταλλικά νερά, επιφανειακά νερά, νερά κολυμβθτικϊν δεξαμενϊν και νερά αναψυχισ 1. Καταμζτρθςθ καλλιεργιςιμων μικροοργανιςμών-μζτρθςθ αποικιών με εμβολιαςμό ςε κρεπτικό υλικό agar ςτουσ 22 2 ο C και ςτουσ 36 2 ο C 2.Ανίχνευςθ και καταμζτρθςθ Pseudomonas aeruginosa Ενςωμάτωςθσ Διικθςθσ από μεμβράνεσ (MF) 6222:2000 16266:2009 2. Νερά ανκρϊπινθσ κατανάλωςθσ, φυςικά μεταλλικά νερά και επιφανειακά νερά που προορίηονται για ανκρϊπινθ κατανάλωςθ 1. Ανίχνευςθ και καταμζτρθςθ Clostridium perfringens ςυμπεριλαμβανομζνων των ςπορίων Διικθςθσ από μεμβράνεσ (MF) 2. Ανίχνευςθ Salmonella spp. Προ-εμπλουτιςμοφ και διικθςθσ από μεμβράνεσ (MF) ISO 14189:2013 ISO 19250:2010 3. Νερά ανκρϊπινθσ κατανάλωςθσ, φυςικά μεταλλικά νερά, επιφανειακά νερά, καλάςςια νερά, νερά κολυμβθτικϊν δεξαμενϊν και νερά αναψυχισ 1.Ανίχνευςθ και καταμζτρθςθ κολοβακτθριοειδών και E. coli 2.Ανίχνευςθ και καταμζτρθςθ εντεροκόκκων εντερικισ προζλευςθσ Διικθςθσ από μεμβράνεσ (MF) Διικθςθσ από μεμβράνεσ (MF) 9308.01: 2014 7899.02: 2001 4. Νερά ανκρϊπινθσ κατανάλωςθσ 1. Ανίχνευςθ E.coli O157:H7 Προ-εμπλουτιςμοφ και διικθςθσ από μεμβράνεσ (MF) APHA 9260F 2. Ανίχνευςθ και καταμζτρθςθ Campylobacter spp Προ-εμπλουτιςμοφ και διικθςθσ από μεμβράνεσ (MF) ISO 17995:2005
Είδοσ Δείγματοσ Εξεταηόμενθ παράμετροσ Μζκοδοσ Πρότυπο Κατάςταςθ 3. Ανίχνευςθ Vibrio spp. Προ-εμπλουτιςμοφ APHA 9260H 1. Ανίχνευςθ και καταμζτρθςθ E.coli Διικθςθσ από μεμβράνεσ (MF) ΕΛΟΣ EN ISO 9308-1:2014 5. Λφματα 2. Ανίχνευςθ και καταμζτρθςθ εντεροκόκκων εντερικισ προζλευςθσ Διικθςθσ από μεμβράνεσ (MF) ΕΛΟΣ EN ISO 7899-2:2001 6. Νερό για αιμοδιάλυςθ και ςχετικζσ κεραπείεσ Καταμζτρθςθ καλλιεργιςιμων μικροοργανιςμών Ενςωμάτωςθσ ISO 13959:2014 7. Τγρό αιμοδιάλυςθσ για αιμοδιάλυςθ και ςχετικζσ κεραπείεσ Καταμζτρθςθ καλλιεργιςιμων μικροοργανιςμών Ενςωμάτωςθσ και Διικθςθσ από μεμβράνεσ (MF) ISO 11663:2014
ΣΜΗΜΑ ΣΡΟΦΙΜΩΝ ΚΑΙ ΕΜΦΙΑΛΩΜΕΝΩΝ ΝΕΡΩΝ Είδοσ Δείγματοσ Εξεταηόμενθ παράμετροσ Μζκοδοσ Πρότυπο Κατάςταςθ 1. Ανίχνευςθ Salmonella spp. Προεμπλουτιςμοφ ΕΛΟΣ ΕΝ 6579: 2003 1. Σρόφιμα 2. Ανίχνευςθ τθσ Listeria monocytogenes Προεμπλουτιςμοφ 11290.01: 1997/Amd1:2004 3. Απαρίκμθςθ τθσ Listeria monocytogenes Προεμπλουτιςμοφ κ Επίςτρωςθσ 11290.02: 1999/Amd 1:2004 4. Ανίχνευςθ E. coli Ο157:Η7 Προεμπλουτιςμοφ 16654:2001 5. Καταμζτρθςθ ταφυλοκόκκων κετικών ςτθν κοαγκουλάςθ (χρυσίηων σταφυλοκόκκος και άλλα είδθ) Επίςτρωςθσ 6888.01: 1999/ Αmd1:2004 6. Καταμζτρθςθ B. cereus Επίςτρωςθσ ISO 7932:2004 7. Οριηόντια μζκοδοσ για τθν απαρίκμθςθ των μικροοργανιςμών Σεχνικι μζτρθςθσ αποικιών ςτουσ 30 O C 8. Ανίχνευςθ και καταμζτρθςθ εντεροβακτθριακών Ενςωμάτωςθσ ISO 4833:2003 Ενςωμάτωςθσ ISO 21528-2:2004 9. Ανίχνευςθ Vibrio parahaemolyticus Προ-εμπλουτιςμοφ ISO/TS 21872-1:2007 10. Kαταμζτρθςθ (Cl. perfringens) Ενςωμάτωςθσ ISO 7937:2004 11. Καταμζτρθςθ ηυμών και μυκιτων α) ςε τρόφιμα Επίςτρωςθσ ISO 21527-1:2008 β) ςε γαλακτοκομικά προϊόντα Ενςωμάτωςθσ ISO 6611:2004 12. Καταμζτρθςθ οξυγαλακτικών βακτθρίων Ενςωμάτωςθσ ISO 15214:1998
Είδοσ Δείγματοσ Εξεταηόμενθ παράμετροσ Μζκοδοσ Πρότυπο Κατάςταςθ 13. Ανίχνευςθ Campylobacter spp Προ-εμπλουτιςμοφ ISO 10272-1:2006 14. Ανίχνευςθ Enterobacter sakazakii ςε γαλακτοκομικά προϊόντα Προ-εμπλουτιςμοφ ISO 22964:2006 15. Ε. coli O104 Ενςωμάτωςθσ Εςωτερικι Μζκοδοσ Εργαςτθρίου 16. ταφυλοκοκκικζσ εντεροτοξίνεσ Ανοςο-ενηυμικι (Vidas) 17. Καταμζτρθςθ των β- γλυκουρονιδάςθ κετικών Escherichia coli Ενςωμάτωςθσ ISO 16649-2:2001
ΣΜΗΜΑ ΣΡΟΦΙΜΟΓΕΝΩΝ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ (ΚΕΝΣΡΟ ΑΝΑΦΟΡΑ ΑΛΜΟΝΕΛΛΩΝ ΚΑΙ ΙΓΚΕΛΛΩΝ) Μικροοργανιςμόσ Εξζταςθ Μζκοδοσ Πρότυπο Κατάςταςθ 1. Κλινικά & περιβαλλοντικά ςτελζχθ αλμονελλϊν 1. Οροτυπία ςτελεχών ςαλμονζλλασ Οροςυγκόλλθςθ επί πλακόσ White Kauffmann Le Minor Scheme_2007, 9 θ ζκδοςθ 2. Ζλεγχοσ Μικροβιακισ Αντοχισ τθσ Salmonella spp.ςε: Ampicillin, Cefotaxime, Amoxicillin+clavoulanic acid, Ceftazidime, Chloramphenicol, Tetracycline, Trimethoprim, Nalidixic, Amikacin, Ciprofloxacin, Streptomycin, Kanamycin, Netilmicin, Tobramycin Μζκοδοσ Διάχυςθσ με Δίςκουσ Eucast, Version 4.0, June 2014 2. Shigella Οροτυπία ςτελεχών ςιγκζλλασ Οροςυγκόλλθςθ επί πλακόσ Αντιγονικό χιμα Συποποίθςθσ 3. E. coli Ανίχνευςθ Οροτφπου O:157 Σαχεία Οροςυγκόλλθςθ επί πλακόσ & οροςυγκόλλθςθ ςε ςωλινα Αντιγονικό χιμα Συποποίθςθσ Εσωτερικι Μζκοδος (ΜΔ -27) 4. Κλινικά & περιβαλλοντικά ςτελζχθ Ε. coli (VTEC) Ανίχνευςθ γονιδίων τοξινών (vtx1 και vtx2) Αλυςιδωτι Αντίδραςθ Πολυμεράςθσ (PCR) Bάςει του προτεινόμενου πρωτοκόλλου των: WHO Collaborating Centre for Reference and Research on E.coli Statens Serum Insitut, EU Reference Laboratory VTEC - Instituto Superiore di Sanita NAI
Μικροοργανιςμόσ Εξζταςθ Μζκοδοσ Πρότυπο Κατάςταςθ Ανίχνευςθ γονιδίων τοξινών (vtx1 και vtx2) RT-PCR ISO 13136:2012 5. Κλινικά & περιβαλλοντικά ςτελζχθ Ε. coli (VTEC) Εφρεςθ υπότυπου γονιδίων τοξινών Αλυςιδωτι Αντίδραςθ Πολυμεράςθσ (PCR) Bάςει του προτεινόμενου πρωτοκόλλου των: WHO Collaborating Centre for Reference and Research on E.coli Statens Serum Insitut 6. Κλινικά & περιβαλλοντικά ςτελζχθ Ε. coli Ανίχνευςθ γονιδίων λοιμογονικότθτασ άλλων πακοτφπων E.coli (ipah για Enteroinvasive, lt,sth,stp για Enterotoxigenic, aaic, aggr για Entreroaggregative, eae για Enteropathogenic E.coli) Αλυςιδωτι Αντίδραςθ Πολυμεράςθσ (PCR) Bάςει του προτεινόμενου πρωτοκόλλου των: WHO Collaborating Centre for Reference and Research on E.coli Statens Serum Insitut 7. Κλινικά & περιβαλλοντικά ςτελζχθ Ε. coli Εφρεςθ ορότυπου (10 ςυχνότεροι ορότυποι ςτθν Ε.Ε.) Αλυςιδωτι Αντίδραςθ Πολυμεράςθσ (PCR) Bάςει του προτεινόμενου πρωτοκόλλου των: WHO Collaborating Centre for Reference and Research on E.coli Statens Serum Insitut 8. Salmonella, Shigella, E. coli Μοριακι Συποποίοθςθ PFGE χετικά πρωτόκολλα: Pulsenet 9. Salmonella Προςδιοριςμόσ μονοφαςικών ςτελεχών S.Typhimurium Αλυςιδωτι Αντίδραςθ Πολυμεράςθσ (PCR) EFSA Journal 2010;8(10):1826
ΣΜΗΜΑ ΜΕΛΕΣΗ LEGIONELLA (ΚΕΝΣΡΟ ΑΝΑΦΟΡΑ LEGIONELLA Ν. ΕΛΛΑΔΟ ) Είδοσ Δείγματοσ Εξεταηόμενθ παράμετροσ Μζκοδοσ Πρότυπο Κατάςταςθ 1. Νερά Ανκρϊπινθσ κατανάλωςθσ, νερά κολυμβθτικϊν δεξαμενϊν, νερά αναψυχισ και άλλα είδθ νερϊν 1. Ανίχνευςθ και καταμζτρθςθ των Legionella spp. 2. Ανίχνευςθ και καταμζτρθςθ των Legionella spp. - Μζροσ 2: για νερά με χαμθλζσ βακτθριακζσ μετριςεισ Διικθςθσ από μεμβράνεσ (MF) ISO 11731:1998 Μζκοδοσ άμεςθσ διικθςθσ δια μεμβράνθσ ISO 11731-2: 2004 2. Ξζςματα ςωλθνϊςεων, δείγματα με ςτυλεό Ανίχνευςθ Legionella spp. Καλλιζργεια ςε εκλεκτικά κρεπτικά υλικά για Legionella (GVPC, BCYE, κ.α.) Εςωτερικι Μζκοδοσ Εργαςτθρίου 3. Κλινικά δείγματα (πτφελα, βρογχικζσ εκκρίςεισ, βρογχοκυψελιδικό ζκκριμα) Ανίχνευςθ Legionella spp. Καλλιζργεια ςε εκλεκτικά κρεπτικά υλικά για Legionella (BCYE, κ.α.) Manual of the American Society for Microbiology (2004) 4. Μικροβιακό ςτζλεχοσ Legionella Σαυτοποίθςθ είδουσ Οροτυπία (με χριςθ αντιορών για L. pneumophila, L. bozemanii, L. micdadei, L. gormanii κτλ Εςωτερικι Μζκοδοσ Εργαςτθρίου 5. Μικροβιακό ςτζλεχοσ Legionella Συποποίθςθ AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) Εςωτερικι Μζκοδοσ Εργαςτθρίου 6. Επιδθμιολογικι τυποποίθςθ περιβαλλοντικϊν και κλινικϊν δειγματων για Legionella pneumophila Μοριακι Συποποίθςθ Sequence-Based Typing (SBT) EWGLI, (αρχικά ζκδοςθ 4.1-14/10/2008και πλζον ζκδοςθ 5.0-08/10/2012)
ΣΜΗΜΑ ΜΕΛΕΣΗ ΣΗ ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΗ ΑΝΣΟΧΗ & ΝΟΟΚΟΜΕΙΑΚΩΝ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ (WHONET) Εξζταςθ Μζκοδοσ Πρότυπο Κατάςταςθ 1. Κλινικά & περιβαλλοντικά ςτελζχθ λοιπϊν Εντεροβακτθριακϊν Ζλεγχοσ Μικροβιακισ Αντοχισ ςε: Ampicillin, Amoxicillin+clavoulanic acid, Piperacillin, Piperacillin +tazobactam, Ticarcillin,Ticarcillin+clavoulanicac id, Cefoxitin, Cephalothin, Cefotaxime, Ceftazidime, Cefepime, Aztreonam, Imipenem, Meropenem, Ertapenem, Doripenem, Tetracycline, Sulphamethoxazole+ Trimethoprim, Amikacin, Gentamicin, Ciprofloxacin Μζκοδοσ Διάχυςθσ με Δίςκουσ Eucast, Version 4.0, June 2014 2. Ζλεγχοσ ευαιςκθςίασ Προςδιοριςμόσ Ελάχιςτθσ Αναςταλτικισ Πυκνότθτασ(EAΠ-ΜΙC) με ταινίεσ etest Eucast, Version 4.0, June 2014 3. Εκτζλεςθ φαινοτυπικϊν δοκιμαςιϊν για παρουςία β- λακταμαςϊν Combination and/ or approximation test with inhibitors Eucast, Version 4.0, June 2014 4. Aνίχνευςθ παρουςίασ γονιδίων αντοχισ γνωςτϊν νεϊτερων β- λακταμαςϊν (CTX-M, CMY, DHA, SHV και καρβαπανεμαςϊν (IMP, OXA-48) PCR Διεκνισ Βιβλιογραφία 5. Εντοπιςμόσ νεοεμφανιηόμενων γονιδίων β-λακταμαςϊν και προςδιοριςμόσ τθσ νουκλεοτιδικισ τουσ αλλθλουχίασ (sequencing) PCR-Αλλθλοφχθςθ Διεκνισ Βιβλιογραφία 6. Χαρτογράφθςθ γενετικοφ περιβάλλοντοσ γονιδίων αντοχισ PCR-Αλλθλοφχθςθ Διεκνισ Βιβλιογραφία
Εξζταςθ Μζκοδοσ Πρότυπο Κατάςταςθ 7. Μοριακι Συποποίθςθ Προςδιοριςμόσ αλλθλουχίασ πολυγενετικών τόπων (MLST) Διεκνισ Βιβλιογραφία 8. Ζλεγχοσ μεταβιβαςιμότθτασ γονιδίων αντοχισ μελζτθ πλαςμιδίων Πειράματα ςφηευξθσ Μεταμόρφωςθσ Ανίχνευςθ πλαςμιδίων DNA θλεκτροφόρθςθ Διεκνισ Βιβλιογραφία 9. Κλινικά & περιβαλλοντικά ςτελζχθ Εντεροβακτθριακϊν 1. Συποποίθςθ βακτθριδίων Εσωτερικι Μζκοδος (ΜΔ-26) με τθ χριςθ περιοριςτικών ενηφμων και θλεκτροφόρθςθ των κραυςμάτων DNA ςε παλλόμενο θλεκτρικό πεδίο γζλθσ (Pulsed Field Gel Electrophoresis PFGE) 2. Ανίχνευςθ των γονιδίων αντοχισ ςτα αντιβιοτικά blakpc & blavim &bla NDM Εσωτερικι Μζκοδος (ΜΔ-25) Αλυςιδωτι Αντίδραςθ Πολυμεράςθσ (PCR)
ΣΟΜΕΑ ΧΗΜΕΙΑ ΣΜΗΜΑ ΧΗΜΕΙΑ ΝΕΡΟΤ & ΣΡΟΦΙΜΩΝ Είδοσ Δείγματοσ Εξεταηόμενθ παράμετροσ Μζκοδοσ Πρότυπο Κατάςταςθ 1. Νερά ανκρϊπινθσ κατανάλωςθσ, φυςικά μεταλλικά νερά, επιφανειακά νερά, νερά κολυμβθτικϊν δεξαμενϊν 1. Προςδιοριςμόσ ολικισ ςκλθρότθτασ Ογκομετρικι APHA* 2340 C 2. Προςδιοριςμόσ αςβεςτίου Ογκομετρικι APHA* 3500-Ca B 3. Προςδιοριςμόσ μαγνθςίου Τπολογιςτικι APHA* 3500 -Mg B 4. Προςδιοριςμόσ ολικών διαλελυμζνων ςτερεών (TDS) ςτουσ 180 C τακμικι APHA* 2540 C 1. Προςδιοριςμόσ ph Με phμετρο APHA* 4500-H + Β 2. Νερά ανκρϊπινθσ κατανάλωςθσ, φυςικά μεταλλικά νερά, επιφανειακά νερά, νερά κολυμβθτικϊν δεξαμενϊν και λφματα 2. Προςδιοριςμόσ χλωριόντων 3. Προςδιοριςμόσ αλκαλικότθτασ Ογκομετρικι Ογκομετρικι APHA* 4500 - Cl - B APHA* 2320 B 3. Mθ επεξεργαςμζνα νερά ανκρϊπινθσ κατανάλωςθσ, νερά φυςικά μεταλλικά, επιφανειακά, υπόγεια νερά και λφματα 4. Προςδιοριςμόσ αγωγιμότθτασ Με Αγωγιμόμετρο APHA* 2510 B Προςδιοριςμόσ Νιτρωδών Φωτομετρικι MERCK 114547- WTW N5/25, με φωτομετρία 4. Νερά ανκρϊπινθσ κατανάλωςθσ, φυςικά μεταλλικά νερά, επιφανειακά, υπόγεια νερά και λφματα 1. Προςδιοριςμόσ Νιτρικών Φωτομετρικι 2. Προςδιοριςμόσ Θειικών Φωτομετρικι 3. Προςδιοριςμόσ ιόντων Αμμωνίου Φωτομετρικι MERCK 114563- WTW N2/25, με φωτομετρία MERCK 114548- WTW 14548, με φωτομετρία MERCK 114558- WTW A6/25, & MERCK 114739 WTW 14739, με φωτομετρία
Είδοσ Δείγματοσ Εξεταηόμενθ παράμετροσ Μζκοδοσ Πρότυπο Κατάςταςθ 4. Προςδιοριςμόσ φκορίου Φωτομετρικι MERCK 100809 με φωτομετρία 5. Προςδιοριςμόσ φωςφορικών Φωτομετρικι MERCK 114848 με φωτομετρία 1. Προςδιοριςμόσ Βιοχθμικά Απαιτοφμενου Οξυγόνου (BOD 5) 5 θμερών Μανομετρικι Εσωτερικι Μζκοδος (ΜΔ-111) βαςιςμζνθ ςτθν APHA* 5210 D 2. Προςδιοριςμόσ Χθμικά Απαιτοφμενου Οξυγόνου (COD) Φωτομετρικι Εσωτερικι Μζκοδος (ΜΔ-110) βαςιςμζνθ ςτθν APHA* 5220 D 5. Επιφανεικά νερά και λφματα 3. Προςδιοριςμόσ ολικών αιωροφμενων ςτερεών (ΣSS) ςτουσ 103-105 C τακμικι Εσωτερικι Μζκοδος (ΜΔ- 108) βαςιςμζνθ ςτθν APHA* 2540 D και ΕΛΟΣ ΕΝ 872:2005 4. Προςδιοριςμόσ Ολικοφ Φωςφόρου Φωτομετρικι MERCK P6/25 με φωτομετρία 1. Προςδιοριςμόσ εξαςκενοφσ χρωμίου Φωτομετρικι MERCK 114758, με φωτομετρία 6. Νερά ανκρϊπινθσ κατανάλωςθσ, φυςικά μεταλλικά νερά, επιφανειακά, υπόγεια νερά 2. Προςδιοριςμόσ ιδιρου Φωτομετρικι MERCK 114549- WTW, 14549, με φωτομετρία 3. Προςδιοριςμόσ Μαγγανίου Φωτομετρικι MERCK 101846, με φωτομετρία APHA*: American Public Health Association, American Water Works Association, Water Environment Federation, Standard Methods for the Examination of Water and Wastewater, 22st Edition, 2012