Δξγαζηήξην Οξγαληθήο Χεκείαο Τκήκα Γηαρείξηζεο Πεξηβάιινληνο & Φπζηθώλ Πόξωλ Φωηνγξαθηθό πιηθό, (δηαθάλεηεο 16, 17 ) θαη κεηξήζεηο γηα θαηαζθεπή γξαθηθήο παξάζηαζεο (δηαθάλεηα 19), πξνεξρόκελα από ηελ εξγαζηεξηαθή έθζεζε απνηειεζκάηωλ ηωλ θνηηεηώλ θαη θνηηεηξηώλ ηνπ Δξγαζηεξίνπ Οξγαληθήο Χεκείαο, αθαδεκαϊθνύ έηνπο 2016-2017 Θενδωξόπνπινο Γεώξγηνο, Τζηγαξά Δπκνξθία, Ππξγηώηε Παλαγηώηα Αγγειηθή Απ. Γαιάλε Δ.ΓΙ.Π. Χεκείαο Αγξίλην 26/04/2017
Δμαίξεζε απνηειεί ε πξνιίλε, πνπ έρεη ηκηλνκάδα αληί ακηλνκάδα Δίλαη νξγαληθέο ελώζεηο πνπ πεξηέρνπλ δύν ιεηηνπξγηθέο νκάδεο, κηα βαζηθή ακηλνκάδα (-ΝΗ2) θαη κηα όμηλε θαξβνμπινκάδα (-COOH). Τα ακηλνμέα πνπ βξίζθνληαη ζηε θύζε είλαη πάλω από 200, όκωο κόλν 20 παξνπζηάδνπλ ελδηαθέξνλ, ηα νπνία είλαη νη δνκηθέο κνλάδεο ηωλ πξωηεϊλώλ. Σηα 20 απηά ακηλνμέα, ε ακηλνκάδα βξίζθεηαη ζε α-ζέζε ωο πξνο ηελ θαξβνμπινκάδα.
Ακηλνκάδα α-c Πιεπξηθή αιπζίδα Καξβνμπινκάδα α- αμινοξέα
Τα α- ακηλνμέα ζπλδένληαη κεηαμύ ηνπο κε πεπηηδηθό δεζκό θαη ζρεκαηίδνπλ ηα πεπηίδηα.
http://www.geneinfinity.org/images/aminoacids.jpg
Όζα δελ κπνξεί ν νξγαληζκόο λα ηα ζπλζέζεη από κόλνο ηνπ θαη πξέπεη λα ηα πάξεη από ηξνθέο. Όζα ν νξγαληζκόο κπνξεί λα ηα ζπλζέζεη κόλνο ηνπ. Απαραίτητα Αμινοξέα Μη απαραίτητα αμινοξέα Ιζηηδίλε Αιαλίλε Ιζνιεπθίλε Αξγηλίλε Λεπθίλε Αζπαξαγίλε Λπζίλε Αζπαξαγηληθό Ομύ Μεζεηνλίλε Κπζηεΐλε Φαηλπιαιαλίλε Γινπηακηληθό νμύ Θξενλίλε Γινπηακίλε Τξππηνθάλε Γιπθίλε Βαιίλε Πξνιίλε Σεξίλε Τπξνζίλε
Όια ηα ακηλνμέα, εμαηξνπκέλεο ηεο γιπθίλεο, έρνπλ ηνπιάρηζηνλ έλα αζύκκεηξν άηνκν άλζξαθα θαη είλαη νπηηθά ελεξγέο ελώζεηο. Τα πξωηεϊληθά ακηλνμέα αλήθνπλ ζηελ L-κνξθή. https://en.wikipedia.org/wiki/chirality_(chemistry) Άηνκν άλζξαθα κε 4 δηαθνξεηηθνύο ππνθαηαζηάηεο. Έρνπλ ηελ ηθαλόηεηα λα ζηξέθνπλ ην επίπεδν ηνπ πνιωκέλνπ θωηόο, δεμηά ή αξηζηεξά.
Χαξαθηεξίδνληαη ωο ακθνιύηεο, γηαηί έρνπλ ηελ ηθαλόηεηα λα δξνπλ άιινηε ωο νμέα, (λα δίλνπλ H + ) θαη άιινηε ωο βάζεηο, (λα δέρνληαη Η + ). Τα ακηλνμέα αλάινγα κε ην ph ηνπ δηαιύκαηνο ζην νπνίν βξίζθνληαη, έρνπλ ηελ ηθαλόηεηα λα ηνληζηνύλ από ηελ ακηλνκάδα,( θαηηόλ) από ηελ θαξβνμπινκάδα, (αληόλ) ή θαη από ηηο δύν (ηζνϊνληθή κνξθή - zwitterion ion). http://fac.ksu.edu.sa/sites/default/files/amino_acid_titration.pdf
Ολνκάδεηαη ε ηηκή ph θαηά ηελ νπνία ην ακηλνμύ βξίζθεηαη ζηελ ηζνϊνληθή ηνπ κνξθή. Σε απηή ηελ ηηκή ph, ην ζεηηθό θνξηίν ηνπ ακηλνμένο, εμηζώλεηαη κε ην αξλεηηθό. Κάζε ακηλνμύ έρεη δηαθνξεηηθό ηζνειεθηξηθό ζεκείν. Σηε κέζνδν δηαρωξηζκνύ ηωλ ακηλνμέωλ κε ειεθηξνθόξεζε, ρξεζηκνπνηνύληαη νη δηαθνξέο ηωλ ακηλνμέωλ ζηηο ηηκέο pi.
Στην αρχή Στο τέλος https://www2.chemistry.msu.edu/faculty/reus
http://www.mhhe.com/physsci/chemistry/carey5e/ch27/ch27-1-4.html
http://www.mhhe.com/physsci/chemistry/carey5e/ch27/ch27-1-4.html
https://biochemist01.wordpress.com/tag/equilibrium-equations/
http://www.geneinfinity.org/images/aapks.jpg
https://www2.chemistry.msu.edu/faculty/reusch/virttxtjml/protein2.htm#aacd6
Πξνζζέηνπκε 10 ml δηαιύκαηνο πδξνριωξηθήο γιπθίλεο 0,1M ζε πνηήξη δέζεωο ηωλ 100 ml, ην νπνίν είλαη εθνδηαζκέλν κε καγλήηε θαη βξίζθεηαη πάλω ζε αλαδεπηήξα. Μεηξνύκε ην ph ηνπ δηαιύκαηνο πδξνριωξηθήο γιπθίλεο.
Γεκίδνπκε κηα πξνρνΐδα κε δηάιπκα ΝαΟΗ 0,1 Μ. Πξαγκαηνπνηνύκε δηαδνρηθέο κεηξήζεηο ηνπ ph ηνπ δηαιύκαηνο, πξνζζέηνληαο ζην πνηήξη δέζεωο δόζεηο ηωλ 0,5 ml δηαιύκαηνο βάζεο. Σπλερίδνπκε ηε δηαδηθαζία έωο ην ph λα πάξεη ηηκή 12-12,5.
Καηαζθεπάδνπκε γξαθηθή παξάζηαζε ηωλ ηηκώλ ph ζπλαξηήζεη ηωλ ml ΝaΟΗ θαη από απηή ππνινγίδνπκε ηελ ηηκή ηνπ ηζνειεθηξηθνύ ζεκείνπ ηεο γιπθίλεο.
ph 13 12 11 10 9 8 7 6 5 4 3 1,7 2 1 0 1,89 1,92 2,38 2,68 3,67 Τηηινδόηεζε Γιπθίλεο 6,07 8,8 9,079,279,41 8,33 pk 1 pi 9,77 pk 2 10,1 10,71 11,36 11,6 11,74 11,87 11,91 11,99 0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 22 24 26 28 30 32 34 36 ml NaOH
Αγγελική Απ. Γαλάνη, «Σημειώζειρ Δπγαζηηπίος Οπγανικήρ Χημείαρ», Τμήμα Γ.Π.Φ.Π., Πανεπιζηήμιο Παηπών, Ηούνιορ 2016. Αλεξάνδπος Ν.Δ., Βάπβογληρ Α.Γ., «Οπγανική Χημεία», Δκδόζειρ Εήηη, 1996. JOHN MCMURRY «Οπγανική Χημεία», Μεηάθπαζη Βάπβογληρ Αναζηάζιορ, Οπθανόποςλορ Μισάληρ, Σμόνος Ηοςλία, Σηπαηάκηρ Μανώληρ, Πανεπιζηημιακέρ Δκδόζειρ Κπήηηρ, 2015. Darell Ebbing, Steven Gammon, «ΓΔΝΗΚΖ ΧΖΜΔΗΑ», Μεηάθπαζη Κλούπαρ Νικόλαορ, Δκδόζειρ Π. Τπαςλόρ, 2011. www.biochemist01.wordpress.com/tag/equilibrium-equations www.mhhe.com/physsci/chemistry/carey5e/ch27/ch27-1-4.html www.geneinfinity.org/images/aapks.jpg https://www2.chemistry.msu.edu/faculty/reusch/virttxtjml/protein2.htm#aacd6 www.chem.fsu.edu/chemlab/bch4053l/protein%20characterization/aa%20tit ration/index.html http://fac.ksu.edu.sa/sites/default/files/amino_acid_titration.pdf