Celični'stiki' Vrsta&povezave:'' celica.celica' celica.matriks'

Σχετικά έγγραφα
CITO T SKE K L E ET E

Združevanje celic v tkiva. Lodish 4: 22. poglavje

Biokemija)večceličnih)sistemov)

!#$%!& '($) *#+,),# - '($) # -.!, '$%!%#$($) # - '& %#$/0#!#%! % '$%!%#$/0#!#%! % '#%3$-0 4 '$%3#-!#, '5&)!,#$-, '65!.#%

ΖΕΡΔΑΛΗΣ ΣΩΤΗΡΙΟΣ ΤΟ ΟΥΤΙ ΣΤΗ ΒΕΡΟΙΑ (1922-ΣΗΜΕΡΑ) ΘΕΣΣΑΛΟΝΙΚΗ

Ειδικά Κεφάλαια Βιοχηµείας

2. Membranski proteini značilnosti zgradbe, vrste in različne naloge proteinov.

SIGNALNE POTI, KI REGULIRAJO IZRAŽANJE GENOV

ENCIMI V ORGANIZIRANIH SISTEMIH

Zgradba in dinamika biološke membrane

Funkcije proteinov (pogojene s strukturo)

Funkcije proteinov (pogojene s strukturo)

Funkcije proteinov (pogojene s strukturo)

Biokemija I, 25. predavanje 1. del, , A. Videtič Paska. Proteini - splošno

ΓΗ ΚΑΙ ΣΥΜΠΑΝ. Εικόνα 1. Φωτογραφία του γαλαξία μας (από αρχείο της NASA)

ΜΟΡΙΑΚΗ ΑΝΑΤΟΜΙΚΗ ΜΟΡΙΑΚΗ ΑΝΑΤΟΜΙΚΗ ΕΠΙΘΗΛΙΑΚΟΥ ΚΥΤΤΑΡΟΥ

ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΑ ΚΑΤΑΠΟΝΗΣΕΩΝ ΤΩΝ ΦΥΤΩΝ ΑΛΑΤΟΤΗΤΑ

Ποιες περιοχές εμφανίζουν υψηλή αλατότητα στο έδαφος

Ο ΡΟΛΟΣ ΤΩΝ ΚΑΝΝΑΒΙΝΟΕΙ ΩΝ ΚΑΤΑ ΤΗΝ ΕΜΒΡΥΪΚΗ ΑΝΑΠΤΥΞΗ

6. ΤΕΛΙΚΗ ΙΑΘΕΣΗ ΤΑΦΗ Γενικά

ZVIJANJE PROTEINOV, RAZGRADNJA IN USMERJANJE

IZBIRNI PREDMET, APRIL/MAJ 2013 STRUKTURA IN FUNKCIJA PROTEINOV. 2. predavanje: Od 1D do 3D strukture proteinov 1. del.

Τμήμα Γεωτεχνολογίας & Περιβάλλοντος

!"!# ""$ %%"" %$" &" %" "!'! " #$!

IONOTROPNI in METABOTROPNI receptorji. Klara Kropivšek

επικινδυνότητας του ρυπαντικού φορτίου των

Appendix B Table of Radionuclides Γ Container 1 Posting Level cm per (mci) mci

Diferencialna enačba, v kateri nastopata neznana funkcija in njen odvod v prvi potenci

I. OSNOVNI STRUKTURNI PRINCIPI

UPORABA POLYHIPE-BIOKOMPATIBILNIH

Η ΦΛΕΓΜΟΝΩ ΗΣ ΑΝΤΙ ΡΑΣΗ ΤΟΥ ΓΑΣΤΡΙΚΟΥ ΒΛΕΝΝΟΓΟΝΟΥ ΣΤΗ ΛΟΙΜΩΞΗ ΜΕ ΕΛΙΚΟΒΑΚΤΗΡΙ ΙΟ ΤΟΥ ΠΥΛΩΡΟΥ ΠΡΙΝ ΚΑΙ ΜΕΤΑ ΤΗ ΘΕΡΑΠΕΙΑ

Funkcije proteinov (pogojene s strukturo)

ΕΞΩΚΥΤΤΑΡΙΟ ΣΤΡΩΜΑ ΚΥΤΤΑΡΙΚΟΙ ΣΥΝΔΕΣΜΟΙ

I S L A M I N O M I C J U R N A L J u r n a l E k o n o m i d a n P e r b a n k a n S y a r i a h

a 2,5 b 2,5 upplemental Figure 1 IL4 (4h) in Ja18-/- mice IFN-γ (16h) in Ja18-/- mice 1,5 1,5 ng/ml ng/ml 0,5 0,5 4ClPh PyrC 4ClPh PyrC

dinamična mreža proteinskih filamenata građeni od proteina koji mogu spontano da polimerišu u citoskeletne filamente FUNKCIJE: Oblik ćelije Funkciona

Table S1A. Generic EMT signature for tumour

1. študentska anketa izbira preferenčnih (pod)področij dela in dveh preferenčnih mentorjev

Estimation of grain boundary segregation enthalpy and its role in stable nanocrystalline alloy design

ΕΡΓΑΛΕΙΑ ΧΕΙΡΟΣ - ΑΝΑΛΩΣΙΜΑ ΚΩΔΙΚΟΣ ΠΕΡΙΓΡΑΦΗ Μ.Μ ΤΙΜΗ

π π ELEKTROTEHNIČKI ODJEL i) f (x) = x 3 x 2 x + 1, a = 1, b = 1;

BIOLOGIJA CELICE ODGOVORI NA VPRAŠANJA

BIOLOGIJA CELICE. Uredil Primož Pirih Društvo študentov biologije

Ι Ε Θ Ν Ε Σ Ρ Ο Τ Α Ρ Υ Π Ε Ρ Ι Φ Ε Ρ Ε Ι Α

Funkcije proteinov, pogojene s strukturo

Odvod. Matematika 1. Gregor Dolinar. Fakulteta za elektrotehniko Univerza v Ljubljani. 5. december Gregor Dolinar Matematika 1

ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΠΑΤΡΩΝ ΤΜΗΜΑ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΤΟΜΕΑΣ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ, ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΚΥΤΤΑΡΟΥ & ΑΝΑΠΤΥΞΗΣ

Funkcije. Matematika 1. Gregor Dolinar. Fakulteta za elektrotehniko Univerza v Ljubljani. 21. november Gregor Dolinar Matematika 1

Πορεία ανακρυστάλλωσης: Τα συνήθη βήματα μιας ανακρυστάλλωσης είναι τα ακόλουθα:

Λιπίδια - Δομή και Λειτουργία

Encimi. Splošne lastnosti - osnove delovanja, specifičnost, energijski vidik nekatalizirane in encimsko katalizirane reakcije

Φασματοσκοπία υπεριώδους-ορατού (UV-Vis)

PONOVITEV SNOVI ZA 4. TEST

March 14, ( ) March 14, / 52

Ασκήσεις 5& 6. Διαμόρφωση Βιομορίων μέσω Φασματοσκοπίας NMR. Σύγκριση & Ανάλυση Δομών Βιομορίων

BIOLOGIJA CELICE TEZE PREDAVANJ ZA 1. LETNIK ŠTUDENTOV BIOKEMIJE

-! " #!$ %& ' %( #! )! ' 2003

ΟΡΜΟΝΕΣ ΥΠΟΔΟΧΕΙΣ ΟΡΜΟΝΙΚΗ ΔΡΑΣΗ

Strukturni in funkcijski vidiki bioloških interakcij

Νευροφυσιολογία και Αισθήσεις

DNA in RNA: zgradba in vloga. Velika predavalnica IJS,

Μικρά αμινοξέα. Βιοχημεία Ι Β-3

A N A L I S I S K U A L I T A S A I R D I K A L I M A N T A N S E L A T A N S E B A G A I B A H A N C A M P U R A N B E T O N

FUNKCIJA PROTEINOV, PRIMERI FIBRILARNI PROTEINI. α KERATIN

DNA Repair - Part II Repairing double strand breaks

Nature Medicine doi: /nm.2457


Predicting Peptide Binding to. Major Histocompatibility Complex (MHC) molecules

Encimi v zunajceličnem matriksu

encouraged to use the Version of Record that, when published, will replace this version. The most /BCJ

IspitivaƬe funkcija: 1. Oblast definisanosti funkcije (ili domen funkcije) D f

KODE ZA ODKRIVANJE IN ODPRAVLJANJE NAPAK

Properties of Nikon i-line Glass Series

PROTEINI POVEZANI S PRENOSOM SIGNALOV. Funkcije proteinov

SUPPLEMENTAL INFORMATION. Fully Automated Total Metals and Chromium Speciation Single Platform Introduction System for ICP-MS

encouraged to use the Version of Record that, when published, will replace this version. The most /BCJ BIOCHEMICAL JOURNAL

Tretja vaja iz matematike 1

Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Ερευνητικό Κέντρο Αθηροθρόμβωσης. Σ. Παπαδάκη 1, Σ. Σιδηροπούλου 1, Β. Χαντζηχρήστος 1, Μ. Πασχόπουλος 2, Α.

Μοντελοποίηση του υναµικού ράσης (Action Potential) σε καρδιακά κύτταρα για περιπτώσεις γενετικής βλάβης στα ιοντικά κανάλια Νατρίου και Καλίου

Nukleinske kisline. Nukleotidi. DNA je nosilka dednih genetskih informacij.

Τροποποιείται απ : αριθ. σελίδα ηµεροµηνία

Εισαγωγή στις πρωτεΐνες Δομή πρωτεϊνών Ταξινόμηση βάσει δομής Βάσεις με δομές πρωτεϊνών Ευθυγράμμιση δομών Πρόβλεψη 2D δομής Πρόβλεψη 3D δομής

Αλληλεπίδραση ακτίνων-χ με την ύλη

EΘΝΙΚΟ ΚΑΙ ΚΑΠΟΔΙΣΤΡΙΑΚΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΑΘΗΝΩΝ ΕΙΔΙΚΟΣ ΛΟΓΑΡΙΑΣΜΟΣ ΚΟΝΔΥΛΙΩΝ ΕΡΕΥΝΑΣ ΓΡΑΜΜΑΤΕΙΑ ΕΠΙΤΡΟΠΗΣ ΕΡΕΥΝΩΝ


Study on anti-hyperlipidemia mechanism of high frequency herb pairs by molecular docking method

CPT. Tsuchiya. beta. quantitative RT PCR QIAGEN IGFBP. Fect Transfection Reagent sirna. RT PCR RNA Affymetrix GeneChip Expression Array

Πίνακας ρυθμίσεων στο χώρο εγκατάστασης

Νόµοςπεριοδικότητας του Moseley:Η χηµική συµπεριφορά (οι ιδιότητες) των στοιχείων είναι περιοδική συνάρτηση του ατοµικού τους αριθµού.

Zvijanje proteinov. Zvijanje proteinov je proces, pri katerem iz razvite (denaturirane) oblike nastane zvita, funkcionalna oblika.

! "# $ % $&'& () *+ (,-. / 0 1(,21(,*) (3 4 5 "$ 6, ::: ;"<$& = = 7 + > + 5 $?"# 46(A *( / A 6 ( 1,*1 B"',CD77E *+ *),*,*) F? $G'& 0/ (,.

Supplementary figures for MED13 dependent signaling from the heart confers leanness by enhancing metabolism in adipose tissue and liver.

OIKONOMIKO ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΑΘΗΝΩΝ ΣΧΟΛΗ ΟΙΚΟΝΟΜΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ

STRUKTURNE LASTNOSTI AMINOKISLIN

HONDA. Έτος κατασκευής

vaja Kvan*ta*vno določanje proteinov. 6. vaja Kvan*ta*vno določanje proteinov. 6. vaja Kvan*ta*vno določanje proteinov

KX-TG6612GR. μ. 9. μ Panasonic. μ μ. μ μ SMS. μ /

metriva 1. DietQuest, CE 3410 ( ) CE 7210 ( ), CECIL INSTRUMENTS,, 232, 266, 270 & 274nm. Cecil Instruments,., metriva. Cecil,,,,.

..,..,..,..,..,.. $#'().. #*#'!# !" #$% &'( )*%!"( %+

Razgradnja maščobnih kislin. Ketonska telesa H + NAD+ NADH. Pregled metabolizma MK. lipoprotein-lipaza. maščobne kisline.

Transcript:

Celični'stiki' Vrsta&povezave:'' celica.celica' celica.matriks' Povezava&in&adhezija&omogoča:'' zvezo'med'celico'in'skupnostjo'' kompartmentizacijo' prepoznavanje'in'signalizacijo' proliferacija,'diferenciacija,'migracija' delitev'mehanskih'obremenitev' Tri&funkcionalne&oblike&celičnih&stikov.'

Celični'stiki' tesni&stiki&(occluding*junctions)' neprepustni'sloj' sidrni&stiki&(anchoring*junctions)' mehanska'povezava'med'sosednjimi' celicami'ali'med'celicami'in'ecm.'' pritrditvena&mesta&aktinskih&<ilamentov' adherentne*povezave*celica6*celica& (adhezijski'pasovi)' adherentne*povezave*celica6matriks&(fokalni' stiki)' pritrditvena&mesta&inetrmediarnih& <ilamentov' stiki*celica6celica*(dezmosom)' stiki*celica6matriks*(hemidezmosom)' komunikacijski&stiki&(communication* junctions)*namenjeni'prevajanju'kemičnih' in'električnih'signalov' presledkovni&stiki&(gap*junctions)' kemične&sinapse&'

'''1.'Tesni'stiki' Epitelijske'in'endotelijske'!selektivno&prepustne'bariere' Celice'so'med'seboj'zatesnjene.' ' Primer'GIT:''.'prenos'glukoze'v'celico'' (Na + 'glukozni'simport/apikalno)'.'difuzija'na +' iz'celice'' (olajšana'difuzija'preko'transporterjev/bazolateralno)' '

'''1.'Tesni'stiki' Stik'vzdržuje'vrsta'TM'proteinov'(homoMilna'adhezija)' klaudin,'okludin,'tricelulin' JAM'(junctional'adhesion'proteins)' 65#kDa# 2#izoobliki# 22-24#kDa# 24#izooblik# 40#kDa# 4#izooblike# 521# 211# 300# ZO1,'.2,'.3'proteini'(ZO:'zonula'occludens)'(PDZ,'SH3'domene)''

'''2.'Sidrni'stiki' Kompleks'dveh'tipov'proteinov:' Intracellularni'sidrni&proteini' (plaki)'vezani'na'aktin'ali' intermediarni'milament' TM&adhezijski&protein&z'ic'delom'na' sidrni'kompleks'in'z'ec'domeno'na' ECM'ali'na'drug'TM'adhezijski' protein.' Dve'različni'funkcionalni'obliki'sidrnih'stikov:' adherentne'povezave'in'dezmosomi'(celica.celica,'kadherini)' fokalne'povezave'in'hemidezmosomi'(celica.ecm,'integrini)'

'''2.'Sidrni'stiki:'' 'Celica.celica:'adherentna'povezava' epitelijske'celice' adhezijski'pasovi' aktinska'vlakna' sidrni'proteini' catenin' vinkulin' α.aktinin' kadherin' transcelularna'mreža'

'''2.'Sidrni'stiki:'' 'Celica.celica:'dezmosomi' epitelijske'celice' oblika'gumba'' intermediarni'milament' Povezovalci'citoskeleta'in'TM' adhezijskega'proteina:' plakoglobin' desmoplakin' Adhezijski'proteini'(kadherini):' desmoglein' desmokolin' Avtoimunsko'obolenje'pempighus*

'''2.'Sidrni'stiki:'' 'Celica.celica:'dezmosomi' epitelijske'celice' oblika'gumba'' intermediarni'milament' Povezovalci'citoskeleta'in'TM' adhezijskega'proteina:' plakoglobin' desmoplakin' Adhezijski'proteini'(kadherini):' desmoglein' desmokolin' Avtoimunsko'obolenje'pempighus* dezmosomski#s6ki#med##celicami#epidermisa#

Pemphigus'foliaceus' 9'let'razvoja' zamenjava'plazme,'kortikosteroidi,'rituximab'/remisija' mycophenolate'mofetil'(imunosupressor),'kortikosteroidi'

'''2.'Sidrni'stiki:'' 'Celica.matriks:'fokalni'stiki' povezava'ecm'in'citoskeleta'(aktin)' TM'protein'je'integrin' α.aktinin,'milamin,'talin,'vinkulin' mišica.vez'povezava'(myotendinous* junction)' '''''Celica.matriks:'hemidezmosomi' morfološko'podobni'dezmosomom' omogočajo'natezne'lastnosti'(gumbki)' povezujejo'bazalno'površino'epitelijskih'celic' na'bazalno'lamino'' intermediarni'milament'(keratin)'' plektin'

Presledkovni'stiki'

'''3.'komunikacijski''stiki:'' 'Celica.celica:'presledkovni'stiki' nimajo'jih''mišične'in'krvne'celice' koneksin,'konekson' vrzel'2.4'μm' določena'propustnost' ph,'ca 2+' akcijski'potencial' jetrne'celice/na' živčne'celice' peristaltično'delovanje'srca'

Citoskelet' 3'vrste'Milamentov' mikromilamenti' mikrotubuli' intermediarni'milamenti' različne'funkcije' dinamične'mreže' snopi' strukturna'opora' Milamenti'z'nateznimi' lastnostmi' veliko'število'konstruktov''

MikroMilamenti:''aktin' sestavljanje'na'različne' načine' različne'kombinacije'v' isti'celici' vse'povezane's'površino' celice'in'zunanjostjo' G.aktin' F.aktin'

G.'in'F.aktin' G.aktin'='globularni'monomer''''' F.aktin'='Milamentozni'aktin' 6'aktinskih'genov,'pri'vretenčarjih:'' 4'α'izooblike'v'm.c..'(v'kontraktilnih' strukturah)' β.'aktin'v'nemišičnih'c.'' γ.'aktin'v'nemišičnih'c.,'stresna'vlakna' 10%'vseh'celičnih'komponent'' (do'5%'v'nemišičnih'c.)'' evolucijsko'zelo'ohranjena'' 45'kDa' globoka'špranja'z'vezavnim'mestom'za'atp'in'mg 2+' aktinski'milament'je'iz'2'verig,'medsebojno'ovitih' strukturna'in'funkcijska'polarnost'f.aktina' (+),'kjer'se'dodaja,'(.),'kjer'laže'poteče'hidroliza' '

Povezovanje'aktinskih'Milamentov' različna'urejenost'aktinskih' molekul'znotraj'iste'celice' različni'povezovalci' različne'konstrukcije' Duchennova''mišična' distromija'(distromin)'

Miozin' motorni'proteini'vezani'na' aktinska'vlakna' pretvorba'kemične'v' mehansko'energijo' hidroliza'atp' sodelujejo'pri:' premikanju'organelov'' mišični'kontrakciji' celični'migraciji' 40'genov'za'miozin'(človek)' bipolarni'milamenti' domenska'ureditev'proteina' '

Miozin' različne'strukture' miozina' različne'povezave'

Aktin.polimerizacija' 3'faze'polimerizacije'' nukleacija' dodajanje'podenot'na'oba'konca' konec.ravnotežje's'prostim'g.aktinom' dodajanje'je'hitrejše'na'(+)'koncu' disociacija'enaka'na'obeh'koncih' celično'premikanje'na'osnovi'polimerizacije' aktina'

Aktin'.'celična'migracija' gibanje,'kot'posledica'nastanka''lamelipodijev' lamelipodiji'tvorijo'fokalne'stike'' zadnji'del'celice'se'skrči' vsebina'c.'se'prenese'v'sprednji'del' vzpostavi'se'nov'adhezijski'kontakt,'stari'popusti' (de.adhezija)' gibanje'je'rezultat'mehanskih'sil,'ki'jih'generira' citoskelet.' celice'se'ne'morejo'premikati,'če'so'premočno' vezane'ali'sploh'niso' kontraktilna'vlakna'stisnejo'telo'celice'v'smer' gibanja' fokalni'stiki' dinamična'aktinska'mreža' '

Aktin.celična'migracija' specimični'rastni' faktorji'' lizofosfatidilna' kislina'(lpa)' aktivacija'majhnih' GTP.proteinov' specimičen'odgovor'

Intermediarni'Milamenti' 8.12'nm'strukture' biokemijsko'so'mnogo'bolj' heterogeni' njihovo'izražanje'je'tkivno' pogojeno' imajo'veliko'natezno'trdnost' nimajo'intrinzične'polarnosti' so'mnogo'bolj'stabilne' značilni'za'živali' 40'kliničnih'motenj'

Intermediarni'Milamenti' 70'različnih'genov''''' (5'poddružin)' ohranjeni'α.helični' del''(310'ak)' N.'in'C.'konca'sta' globularna'in'različna' dimer'osnovna' gradbena'enota' nadaljna'asociacija'v' tetramer'(simetrija)' ustvarjena' simetričnost zato' tudi'ni'polarnosti)'

Keratin' kisli'keratini' bazični'keratini' dimer'iz'ene'bazične'in' ene'kisle'verige' najbolj'raznolika' skupina' trdni'keratini'' lasje'in'nohti' bogati's'cys' mehki,'cito.keratin' epitelijske'celice' citokeratini'asocirajo' z'dezmosomi'

Adhezija'celic' nastanek'tkiva'preko'adhezije'celic' prekursorske'celice' selektivna'adhezija'

glavna'skupina'cam' Ca 2+' 100'različnih' klasični'kadherin' kadherin'e'(epitelij/'tudi'v' možganih)' kadherin'n'(nerve/'tudi'v' Mibroblastih)'' kadherin'p'(placenta)' kadherin've'(vascular'epithelial)' EC.,'TM.,'IC.'domena' ohranjenost'strukture' DrosoMila'(8/16'Ig'ponovitev'in' druge'domene)' desmosomski'kadherini'(najbolj' podobni'klasičnim)' protokadherini'(negativno' regulirajo'klasično'kadherinsko' adhezijo)' Mlamingo'kadherini'(urejajo' planarno'celično'polarnost)' Kadherini'

Klasični'kadherin' EC&domena& 5'Ig'ponovitev'(110'ak)'s'Ca 2+' vezavnimi' mesti' tvori'homomilne'interakcije'(trans 15630* nm)'preko'ec1' močno'ohranjeno'zaporedje'odgovorno'za' vezavo'ca 2' Vezava'Ca 2+' ima'različne'vloge:' - vzdržuje'rigidnost''ektodomene'z'značilno' obliko,'ki'je'kritična'za'trans'vezavo'(kot'90 o ' med'ec1'in'ec5)' - Ca 2+' strukturno'favorizira'odpiranje'verige' TM&&ena'vijačnica' IC&domena& močno'ohranjena'klasičnih'kadherinov'' vezavno'mesto'p120'in'βekatenin&' asociacija'z'α.kateninom'in'dalje'z' aktinskimi'milamenti'

Kadherini:'mehanizem'adhezivne'povezave' trans*povezava'dveh'ec'domen'ec1' domen'' izmenjava'n.končnega'dela'verige'' (EC1'domene)'z'adhezijskim' partnerjem'' tip'i:'trp2'' tip'ii:'trp2'+'trp4'in'še'hidrofobne' interakcije'' VE'kadherin:''Trp2+Trp4' tipi'in'tip'ii'se'medsebojno'ne' izmenjujeta' heteromilne'izmenjave'znotraj' družine'

Kadherini:'model'mreže' cis'interakcije'med'ec1'in' EC2'dveh'protomerov' mesto'interakcije'na' nasprotni'strani'od'mesta'pri' trans'povezavi' vse'interakcije'so'šibke'

Elektronska'tomograMija'celic'kože' dezmosomi'in*situ*

Kompleksnost'povezave'kadherin.aktin' Proces'preoblikovanja'(zorenje'celice'v' smislu'stika'celica.celica)' ' fokalni'stik' proces'preoblikovanja' tvori'ob'začetnem'kadherin/kadherin' kontakt' prisotnost'vinkulina'pogojena'(napetost/ pritisk/tenzija)' miozinska'kontraktilnost'radialno' usmerjena' bazolateralni'stik' umiritev'procesa' manj'tenzije,'odsotnost'vinkulina' α.katenin'v'skrčeni'obliki' prehod'med'obema'oblikama'je' dinamičen' adherentni'stik'pri'polariziranih'celicah' tvori'se'f.aktinski'pas,'ki'povezuje'celice' aktivnost'miozina/rekrutacija'vinkulina' fokalni#s6k# bazolateralni# #s6k# adherentni#s6k## polarizirane#celice#

Kompleksnost'povezave'kadherin.aktin' Strukturna'in'signalizacijska'vloga'α.katenina'pri' preoblikovanju'tkiva:' α.katenin' vezavno'mesto'f.aktin'in'β. katenin' centralna'domena'α.katenina' 'D4/D3a'interakcija' vezavno'mesto'za'vinkulin' rekrutiranje'adapterskih' proteinov' centralni'del'je'ključen'za' regulacijo'in'deluje'na'osnovi'sile'

Selektini' Levkociti' poseben'adhezijski'sistem' selektni'(ca 2+' odvisni)' L.selektin'(levkociti)' P.selektin'(trombociti)' E.selektin'(endotelijske'c.)' pomagajo'pri'migraciji'celic'v'tkivo' prepoznajo'oligosaharide'na'endotelijskih'c.' nizka'adhezijska'aminiteta' aktivacija'integrinskega'sistema' obratno,'na'mestu'vnetja'endotelijske'c.' izražajo'selektine.prepoznajo'oligosaharide' na'levkocitih'in'trombocitih'

N.CAM' Neural'Cell'Adhesion'Molecule' 20'različnih' za'razliko'od'kadherinov'in' selektinov'ne'potrebujejo'ca 2+' spadajo'v'naddružino'z'ig'domenami' izraža'se'v'različnih'celicah,'vključno' ž.c.' nekatere'oblike'vezano'sialno'kislino' 'antagonisti'adhezije' tudi'signalizacijska'vloga' (fosforilacija'preko'asociacije's'tyr' kinazo)'

Transmembranski'proteini' EC1# Imajo#homologne# domene#podobne# funkcije?# fragment#p41## kot#inhibitor#cp# -# Tg1#zanka# EC3# C-konec# EC2# membrana# Tg1'domena'v'fragmentu'p41/inhibitor'cisteinskih'proteaz'(rdeče)' Tg1'domena'v'EpCAM/strukturna'vloga'pri'dimerizaciji' Tg1'domena'IGFBP'/vezava'rastnega'faktorja' TG!'domena'SMOC'/odgovorna'za'razvoj'oči'in'okončin'

EpCAM'

EpCAM = Epithelial Cell Adhesion Molecule Epitelijska Celična Adhezijska Molekula Ca 2+ kadherini klavdini in okludini druge molekule: IgSFCAM selektini... EpCAM integrini tesni stiki adhezijski pas dezmosomi hemidezmosomi fokalni stiki

EpCAM = Epithelial Cell Adhesion Molecule Epitelijska Celična Adhezijska Molekula Znana dejstva: homofilna od Ca 2+ neodvisna adhezija celica-celica (oligomeri) izražanje: epitelijske celice, matične in karcinomske celice jedrno signaliziranje proliferacija N-gly EpEX TM heliks EpIC TACE prezenilin-2 α-aktinin c-myc, EpIC + FHL2 + β-katenin + Lef-1 aktinski filamenti

Priprava materiala N-gly EpEX (242 aa) 3 NxS/T! QxS/T membrana wt neglikozilirana mutanta kda wt EpEX neglik. dimer 46 kda monomer 28 kda 60 45 30 ph 7.4 ph 4.7 20

Struktura#dimera#zunajceličnega#dela# 90 # 90 # membrana# 90 # pogled# s#strani# pogled# od#zgoraj# 90 # mesta#glikozilacije#

Struktura podenote N ND CD N C majhna domena z disulfidi stabilizirano jedro novo zvitje C TY ni disulfidov zvitje ni novo, podobno zvitje pri redkih nesorodnih proteinih z disulfidi stabilizirano jedro ni inhibitor katepsinov (zanka!) nova vloga domen TY: dimerizacija p41 EpCAM Do sedaj znane vloge domen TY: inhibitorji (p41, nidogen, testikan) vezava IGF (IGFBP) mesta cepitve (tiroglobulin)

cis$dimer#epcam$ EC1# E124# E164# D171# R57# K60# R58# K54# Tg1# zanka# EC3# C-konec# membrana# EC2# R103# R102# K83# D107# E109#

dimerizacija#tm#heliksa# TM#zaporedje#(23#ak):#AGVIAVIVVVVIAVVAGIVVLVI# 1#µs# NAMD#MD#simulacija;## POPC#lipidna#faza# (POPC#=#1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine)# 1,1#µs# 2#µs# 4#µs# 5#µs# t#=#0# 50#Å# Pavšič*M,*Gunčar*G,*Djinović6Carugo*K*in*Lenarčič*B,*objava*v*pripravi'

NMR#struktura##Trop2ic# EpCAM :! Trop-2:!!SRKKRMAKYEKAEIKEMGEMHRELNA!!TNRRKSGKYKKVEIKELGELRKEPSL! membrana# mesto& fosforilacije& && N N mo.v&za&& vezavo&&pip2& C# Trop-2#IC# Nestrukturirana#domena#v#citoplazmi##verjetno# pridobi&helično&strukturo&ob#kontaktu#s#tarčnim# proteinom#(ak6nin,#fhl-2#protein#).# # C# PTrop-2#IC#

Model#trans-tetramera# adhezijska#enota#je#tetramer## EC1#domene#niso#v#kontaktu# razdalja#med#obema#membranama##~10#nm# EC2# cis-dimer# EC3# membrana# EC1# ClusPro#umeščanje# 10#nm# 5#nm# cis-dimer# membrane# Pavšič*M,*Gunčar*G,*Djinović6Carugo*K*in*Lenarčič*B,*objava*v*pripravi' trans-tetramer#

Model#adhezijske#mreže# stabilni#adhezijski#kontak6#in#cis-oligomeri##via$ec1$$ kontak6#v#kristalu#&#računalniško#umeščanje:#cis-interakcije#dveh#cis-dimerov#via#ec1# kon6nuirne#adhezijske#regije$ EC1# pogled#od# zgoraj# EC1# EC1# EC1# EC1# EC1# EC1# pogled# od#zgoraj## EC1# pogled#s## strani## pogled#s# strani## trans-tetramer# cis-tetramer# membrane# 90 # pogled#s#strani## membrane#

Model#adhezijske#mreže# EC&EpCAM&& EpCAM&TM&regija& IC&EpCAM&& α>ak.nin& Stabilni#adhezijski#kontak6#kot#posledica#interakcije## med#tetramernimi#adhezijskimi#enotami##$ Pavšič*M,*Gunčar*G,*Djinović6Carugo*K*in*Lenarčič*B,*objava*v*pripravi'

EpCAM#se#strukturno#razlikuje#od#klasičnih#CAM#(kadherini,#integrini,#selek6ni,#Ig#naddružina)# EpCAM# 30-40#nm# 10#nm# 4#nm# tetraspanin& claudin>7& klaudin# # E-#kadherin# Povečano#izražanje#EpCAM#poruši&obstoječo&celično&povezavo&na#osnovi#kadherinov.& Pri#rakas6h#celicah#tvori#EpCAM#kompleks&s&klaudinom>7&in&&tetraspaninom&(predstavljajo# močan#metastatski#potencial).# EpCAM#je#tarča#terapij&na&osnovi&Ab&!#strukturni#podatki#predstavljajo#dobro#osnovo#za# izboljšanje#obstoječih#terapij#in#razvoj#novih.#

Anti-EpCAM DARPini DARPini - Designed Ankyrin Repeat Proteins majhni proteini (~14 kda) ena domena: N-cap, eden ali več modulov, C-cap ( + + )n N-cap osrednji modul C-cap N-končni del človeškega ankirina (12 ponovitev ANK); PDB ID 1N11 (Michaely in sod., 2002) pogled z vrha pogled s strani

Anti-EpCAM DARPini!90! N stranski pogled C pogled z vrha Randomizirani položaji (krogle) v kontaktu z EpEX N C! 90!!90! N stranski pogled C pogled z vrha

Premik'miozina'vzdolž'aktinskega'Milamenta' miozinska'glava'uporablja' ATP'za'premik'aktinskega' Milamenta.'''''''''''''''''''''''''''' po'vezavi'atp'se'mioz.' glava'sprosti'iz'milamenta' hidrolize'atp'in'rotacija' glave' vezava'na'aktin' sprostitev'p i 'in'sprostitev' energije'za'premik'aktina' sprostitev'adp'in' nadomestitev's'svežim' ATP'