FARMACEUTSKO-BIOKEMIJSKI FAKULTET SVEUČILIŠTA U ZAGREBU IZVEDBENI LAN NASTAVE akademska godina 2008./2009. Naziv kolegija: BIOLOŠKA KEMIJA Naziv studija: Farmacija / Medicinska biokemija Godina studija: II godina Semestar studija: III semestar Nastava predviđena prema programu: Oblici Sati /tjedno Sati/semestralno izvođenja predavanja 2 30 nastave: seminari 1 (samomb) 15 vježbe 1 15 Ukupno sati nastave: Izvoditelji nastave: voditelj/ica, suradnik/ca Red. br. Ime i prezime Voditelj/ica, suradnik/ca Znanstveni stupanj (dr.sc. ili mr. sc.) Znanstveno-nastavno ili suradničko zvanje 1. Jerka Dumić Belamarić voditeljica dr. sc. izv. profesor 2. Julija Matijević-Sosa suradnica dr. sc. docent 3. Sanja Dabelić suradnica dr. sc. docent 4. Sandra Šupraha Goreta suradnica dr. sc. viša asistentica (znan. novakinja) 5. Ruđer Novak suradnik znan. novak 6. Sonja Čubrilo suradnik znan. novakinja
Izvedena nastava Datum Vrijeme (od do) Nastavnik/suradnik Oblik nastave Tema Studentska skupina 17.10.2008. 14.15- Sanja Dabelić seminar Uvodni seminar za vježbe V1, V2, V3, V4, V5, V6, V7, V8, V9, V10 24.10.2008. 14.15- Jerka Dumić Belamarić predavanje Uvodno predavanje; biokemija logika života, Sprega biokemije i molekularnih znanosti o životu; Biokemija kao temelj biomedicinskih znanosti; Važnost biokemije za farmaciju Uvjeti života. Kemijski sastav stanice (elementarni sastav žive tvari, svojstva vode, funkcionalne skupine i struktura biomolekula, svojstva biomakromolekula: usmjerenost, modularna građa, konformacijska dinamika, informacija, značenje nekovalentnih sila, komplementarnost i molekularno ustrojstvo stanice). Aminokiseline. roteogene aminokiseline. Ionizacijska svojstva aminokiselina. Kemijska svojstva aminokiselina. Neobične aminokiseline. 3.11.2008. 8-10 Sanja Dabelić seminar Titracijske krivulje aminokiselina. Ionizacijska svojstva aminokiselina i manjih peptida pri različitim ph. Sinteze manjih peptida, aktivacija i zaštićivanje skupina u sintezi. Metode odijeljivanja aminokiselina ili proteina iz smjese. Određivanje terminalnih skupina u peptidima (Edman, Sanger). Određivanje sekvence peptida preklapanjem fragmenata dobivenih specifičnim enzimima ili reagensima. (zadaci za vježbu) 7.11.2008. 14.15- Jerka Dumić Belamarić predavanje eptidna veza. Svojstva peptidne veze. Određivanje primarne strukture proteina. roteini. Klasifikacija proteina. rimarna, sekundarna, tercijarna i kvarterna struktura. Funkcionalne i strukturne domene. Biološki važni peptidi. roteini nativna konformacija. Denaturacija proteina. 13.11.2008. 8.15-9.45 Sanja Dabelić predavanje Nukleinske kiseline - nukleotidi, struktura nukleinskih kiselina. Komplementarnost dvostruke uzvojnice DNA.Konformacije DNA. Termička denaturacija DNA. RNA vrste RNA. Sekundarna, tercijarna struktura RNA. Ribosomi. Geni. Kromosomi. Genom. 17.11.2008. 8-10 Julija Matijević-Sosa seminar Svojstva i primjena otapala. Utjecaj strukture na polarnost otapala. Osnovne reakcije funkcionalnih skupina (alkeni, alkoholi, aldehidi i ketoni, karbonilna Napomena
skupina). regled reagenasa za određivanje reduktivnosti šećera (i aldoza i ketoza) te jednostavnih aldehida (zadaci) 20.11.2008. 8.15-9.45 Julija Matijević-Sosa predavanje Ugljikohidrati. Monosaharidi. Stereokemija monosaharida. Ciklizacija monosaharida. Kemijske reakcije monosaharida. Biološki važni derivati monosaharida. Glikozidna veza. Disaharidi. olisaharidi. Biološke uloge ugljikohidrata. Reduktivna svojstva ugljikohidrata. Glikozidi. 27.11.2008. 8.15-9.45 Julija Matijević-Sosa predavanje Lipidi klasifikacija lipida. Masne kiseline. Triacilgliceroli. Voskovi. Fosfolipidi i glikolipidi. Lipidi izoprenoidnog porijekla. Steroidi. Kolesterol. Steroidni hormoni. 1.12.2008. 8-10 Julija Matijević-Sosa seminar Aminokiseline. Reakcije aminokiselina (zajedničke i razlikovne).zajedničke i razlikovne obojene reakcije aminokiselina od viših peptida i proteina. Modificirane aminokiseline β-ak D-ak, γ-cooh u peptidnoj vezi rimjeri malih peptide. Standardne metode sinteze aminokiselina. Aminokiseline kao puferi. (zadaci za vježbu) 5.12.2008. 14.15-12.12.2008. 14.15- Jerka Dumić Belamarić predavanje Kolagen. Svila. Keratin. Hemoglobin. Imunoglobulin. Homologni proteini. Evolucija proteinske strukture. Biokemijske tehnike pročišćavanja proteina. Sedimentacijske tehnike. Kromatografske tehnike. Elektroforetske tehnike. Jerka Dumić Belamarić predavanje Glikani oligosaharidne strukture. Sinteza glikana. Glikokonjugati. Glikoproteini. roteoglikani. Glikolipidi. Glikozilfosfatidil-inozitolna sidra. Eritropoetin. Mucini. rioni. Heparin i hijaluronska kiselina. Lektini. Interakcije glikana i lektina kao temelj mnogih biološki važnih procesa. Sijalinske kiseline. tičja gripa. 15.12.2008. 8-10 Julija Matijević-Sosa seminar Ugljikohidrati. Ciklizacije svih vrsta monosaharida. Konformacije piranoznih i furanoznih prstenova. Zakretanje šećera: mutarotacija i fiksna skretnja kao razlikovna svojstva između reducirajućih i nereducirajućih šećera. Reakcije monosaharida. (zadaci za vježbu) 19.12.2008. 14.15- Jerka Dumić Belamarić predavanje Strukturna i funkcionalna obilježja membranskih lipida. Biološke membrane supramolekularne strukture s mnogobrojnim funkcijama. Micele, lipidni dvosloji,
9.1.2009. 14.15- liposomi. Fizikalno-kemijska svojstva bioloških membrana. Membranski proteini. Detergenti. Transport kroz membrane. Transportni mehanizmi (pasivni, olakšani, aktivni). Termondinamika/energetika i kinetika membranskog transporta. Koncentracijski i elektrokemijski gradijenti Jerka Dumić Belamarić predavanje Bioenergetika. Život neravnotežno ustaljeno stanje. Termodinamika bioloških reakcija energetski potencijal reakcija. Metastabilnost živog sustava, pokretačka sila bioreakcija Stanični koncentracijski odnosi. Termodinamički zakoni upravljaju biološkim procesima. ovezivanje endergonih i egzergonih reakcija, AT - energetska valuta, otencijal prijenosa skupina. 12.1.2009. 8-10 Julija Matijević-Sosa seminar Lipidi. Neke lipidne osnove počevši od izoprena Složenosti lipida (s obzirom na sadržaj glicerola ili sfingozida, fosfata ili šećera). Konformacije masnih kiselina i triglicerida. Reakcija saponifikacije. Konformacije steroidnih struktura. (zadaci za vježbu) 16.1.2009. 14.15-23.1.2009. 14.15- Jerka Dumić Belamarić predavanje Enzimi biološki katalizatori. Klasifikacja enzima. Aktivno središte. Specifičnost i ubrzanje. Izoenzimi. Koenzimi - uloga koenzima. Enzimska kataliza. Mehanizmi enzimske katalize. Jerka Dumić Belamarić predavanje Termodinamika enzimski kataliziranih reakcija. Brzina enzimske reakcije. Michaelis-menteničina kinetika. Inhibicija enzimskih reakcija. Regulacija metabolizma. 26.01.2009. 8-10 Sanja Dabelić seminar Hormoni (steroidni hormoni i hormoni aminokiselinskog, peptidnog i proteinskog karaktera). Struktura nukleinskih kiselina od osnovnih baza, povezivanja u nukleozid, nukleotid i nukleotide međusobno. Detaljno numeriranje, nomenklatura i vrste veza. Sparivanja dušikovih baza. (zadaci za vježbu) Sanja Dabelić seminar Enzimska kinetika.,uloge koenzima u holoenzimu, razlike i sličnosti koenzima, kofaktora i prostetičke skupine. Na primjeru NAD osnovna struktura tipičnog koenzima Seminar će biti održan u terminu prema dogovoru sa studentima
Vježbe V1 (srijedom 10-12 h): 22.10., 5.11., 19.11., 3.12., 17.12. 2008, 14.1.2009. V2 (srijedom 10-12 h): 29.10., 12.11., 26.11., 10.12. 2008, 7.1. i 21.1.2009. V3 (utorkom 10-12 h): 21.10., 4.11., 18.11., 2.12., 16.12.2008., 20.1. 2009. V4 (utorkom 10-12 h): 28.10., 11.11., 25.11., 9.12. 2008, 13.1.i 27.1. 2009. V5 (ponedjeljkom 10-12 h): 20.10., 3.11., 17.11., 1.12., 15.12.2008., 19.1. 2009. V6(ponedjeljkom 10-12 h): 27.10., 10.11., 24.11., 8.12. 2008, 12.1.i 26.1. 2009. V7 (utorkom 12-14 h): 21.10., 4.11., 18.11., 2.12., 16.12.2008., 20.1. 2009 V8(utorkom 12-14 h): 28.10., 11.11., 25.11., 9.12. 2008, 13.1.i 27.1. 2009 V9 (ponedjeljkom 8-10 h): 20.10., 3.11., 17.11., 1.12., 15.12.2008., 19.1. 2009. V10 (ponedjeljkom 8-10 h): 27.10., 10.11., 24.11., 8.12. 2008, 12.1.i 26.1. 2009 U skupinama V1-V9 (Farmaceutski smjer), u svakom od navedenih termina izvode se sljedeće vježbe: otenciometrijska titracija aminokiselina Gel-filtracija hemoglobina ročišćavanje imunoglobulina G iz humanog seruma Katekolaza Ugljikohidrati Lipidi Termička denaturacija DNA U skupini V10 (Medicinsko-biokemijski smjer), u svakom od navedenih termina izvode se sljedeće vježbe: otenciometrijska titracija aminokiselina Katekolaza Ugljikohidrati Lipidi Termička denaturacija DNA Doc. dr. sc. Julija Matijević-Sosa svi navedeni termini vježbi, osim 17.11, 1.12, 15.12, 12.1. od 8-10 Dr. sc. Sanja Dabelić termin ponedjeljak 8-10 osim 3.11. i 26.1. termin srijeda 10-12 osim 19.11. Dr. sc. Sandra Šupraha Goreta termin utorak 10-12 i srijeda 19.11. od 10-12
Ruđer Novak termin ponedjeljak 10-12 termin ponedjeljak 8-10 za datume: 3.11, 17.11, 1.12, 15.12, 12.1. i 26.1. Sonja Čubrilo termin utorak 12-14 redviđeno Oblici izvođenja nastave: Sati po studentskoj skupini u semestru Broj studentskih skupina Ukupno predavanja 30 30 seminari 15 15 vježbe 15 10 150 Ukupno sati nastave:_ 195 sati