Mehanizmidejstvaenzima. Himotripsin

Σχετικά έγγραφα
SEKUNDARNE VEZE međumolekulske veze

Eliminacijski zadatak iz Matematike 1 za kemičare

SEMINAR IZ KOLEGIJA ANALITIČKA KEMIJA I. Studij Primijenjena kemija

Mehanizmi djelovanja enzima i regulacija aktivnosti enzima

Aminokiseline. Anabolizam azotnihjedinjenja: Biosinteza aminokiselina, glutationa i biološki aktivnih amina

Kiselo bazni indikatori

Kiselo-bazne ravnoteže

Osnovni primer. (Z, +,,, 0, 1) je komutativan prsten sa jedinicom: množenje je distributivno prema sabiranju

HEMIJSKA VEZA TEORIJA VALENTNE VEZE

Kaskadna kompenzacija SAU

3.1 Granična vrednost funkcije u tački

2 tg x ctg x 1 = =, cos 2x Zbog četvrtog kvadranta rješenje je: 2 ctg x

Zadaci sa prethodnih prijemnih ispita iz matematike na Beogradskom univerzitetu

Reverzibilni procesi

41. Jednačine koje se svode na kvadratne

PARNA POSTROJENJA ZA KOMBINIRANU PROIZVODNJU ELEKTRIČNE I TOPLINSKE ENERGIJE (ENERGANE)

1. Duljinska (normalna) deformacija ε. 2. Kutna (posmina) deformacija γ. 3. Obujamska deformacija Θ

Deformacije. Tenzor deformacija tenzor drugog reda. Simetrinost tenzora deformacija. 1. Duljinska deformacija ε. 1. Duljinska (normalna) deformacija ε

NOMENKLATURA ORGANSKIH SPOJEVA. Imenovanje aromatskih ugljikovodika

Novi Sad god Broj 1 / 06 Veljko Milković Bulevar cara Lazara 56 Novi Sad. Izveštaj o merenju

REAKCIJE ADICIJE. Karakteristične reakcije adicije su adicije na alkene

Grafičko prikazivanje atributivnih i geografskih nizova

CILJNA MESTA DEJSTVA LEKOVA

Osnovne karakteristike 3-D strukture molekula DNK i RNK

( ) ( ) 2 UNIVERZITET U ZENICI POLITEHNIČKI FAKULTET. Zadaci za pripremu polaganja kvalifikacionog ispita iz Matematike. 1. Riješiti jednačine: 4

S t r a n a 1. 1.Povezati jonsku jačinu rastvora: a) MgCl 2 b) Al 2 (SO 4 ) 3 sa njihovim molalitetima, m. za so tipa: M p X q. pa je jonska jačina:

UNIVERZITET U NIŠU ELEKTRONSKI FAKULTET SIGNALI I SISTEMI. Zbirka zadataka

O ili S kao nukleofili-acetali, ketali i hidrati (Adicija alkohola, vode, adicija tiola)

SADRŽAJ PREDMETA PREDAVANJA ~ PRINCIPI HEMIJSKE RAVNOTEŽE ~ KISELINE, BAZE I SOLI RAVNOTEŽA U VODENIM RASTVORIMA ~ RAVNOTEŽA U HETEROGENIM SISTEMIMA

STVARANJE VEZE C-C POMO]U ORGANOBORANA

Ispitivanje toka i skiciranje grafika funkcija

Obrada signala

18. listopada listopada / 13

Cauchyjev teorem. Postoji više dokaza ovog teorema, a najjednostvniji je uz pomoć Greenove formule: dxdy. int C i Cauchy Riemannovih uvjeta.

Operacije s matricama

3. razred gimnazije- opšti i prirodno-matematički smer ALKENI. Aciklični nezasićeni ugljovodonici koji imaju jednu dvostruku vezu.

LANCI & ELEMENTI ZA KAČENJE

POTPUNO RIJEŠENIH ZADATAKA PRIRUČNIK ZA SAMOSTALNO UČENJE

Pismeni ispit iz matematike Riješiti sistem jednačina i diskutovati rješenja sistema u zavisnosti od parametra: ( ) + 1.

C kao nukleofil (Organometalni spojevi)

ELEKTROTEHNIČKI ODJEL

Veleučilište u Rijeci Stručni studij sigurnosti na radu Akad. god. 2011/2012. Matematika. Monotonost i ekstremi. Katica Jurasić. Rijeka, 2011.

MEĐUMOLEKULSKE SILE JON-DIPOL DIPOL VODONIČNE NE VEZE DIPOL DIPOL-DIPOL DIPOL-INDUKOVANI INDUKOVANI JON-INDUKOVANI DISPERZNE SILE

RIJEŠENI ZADACI I TEORIJA IZ

Vježba: Uklanjanje organskih bojila iz otpadne vode koagulacijom/flokulacijom

Osnove biokemije Enzimska kinetika. Boris Mildner. Kinetika proučava brzine reakcija

DISKRETNA MATEMATIKA - PREDAVANJE 7 - Jovanka Pantović

I.13. Koliki je napon između neke tačke A čiji je potencijal 5 V i referentne tačke u odnosu na koju se taj potencijal računa?

IZRAČUNAVANJE POKAZATELJA NAČINA RADA NAČINA RADA (ISKORIŠĆENOSTI KAPACITETA, STEPENA OTVORENOSTI RADNIH MESTA I NIVOA ORGANIZOVANOSTI)

Elementi spektralne teorije matrica

IMOBILIZACIJA AKTIVNIH TVARI ZA BIOLOŠKO PREPOZNAVANJE

M086 LA 1 M106 GRP. Tema: Baza vektorskog prostora. Koordinatni sustav. Norma. CSB nejednakost

ÂÓÈÎ ÁÈ ÙÔ K ÙÙ ÚÔ 1 Ô KÂÊ Ï ÈÔ 1.1 E Ë Î ÙÙ ÚˆÓ ÚÔÎ Ú ˆÙÈÎ Î ÙÙ Ú

C C C C C C C C C C C C H C CH 2 H 3 C H. Br C CH 2. 1 konjugovane 2 izolovane 3 kumulovane C=C veze. C=C veze. C=C veze. 1,3-cikloheksadien

Pravilo 1. Svaki tip entiteta ER modela postaje relaciona šema sa istim imenom.

PRAVA. Prava je u prostoru određena jednom svojom tačkom i vektorom paralelnim sa tom pravom ( vektor paralelnosti).

Osnovne teoreme diferencijalnog računa

Derivati karboksilnih kiselina

ELEMENTARNIH REAKCIJA

Teorijske osnove informatike 1

Trigonometrija 2. Adicijske formule. Formule dvostrukog kuta Formule polovičnog kuta Pretvaranje sume(razlike u produkt i obrnuto

a) diamminsrebro hlorid b) srebrodimmin hlorid v) monohlorodiammin srebrid g) diamminohloro argentit

5. Karakteristične funkcije

Rešenje: X C. Efektivne vrednosti struja kroz pojedine prijemnike su: I R R U I. Ekvivalentna struja se određuje kao: I

1. razred gimnazije- opšti i prirodno-matematički smer STRUKTURA MOLEKULA HEMIJSKA VEZA

MATRICE I DETERMINANTE - formule i zadaci - (Matrice i determinante) 1 / 15

Kontrolni zadatak (Tačka, prava, ravan, diedar, poliedar, ortogonalna projekcija), grupa A

radni nerecenzirani materijal za predavanja

Zadaci iz trigonometrije za seminar

Sekundarne struktura proteina Fibrilni proteini

Periodičke izmjenične veličine

Riješeni zadaci: Nizovi realnih brojeva

Elektrotehnički fakultet univerziteta u Beogradu 16.maj Odsek za Softversko inžinjerstvo

IspitivaƬe funkcija: 1. Oblast definisanosti funkcije (ili domen funkcije) D f

Implementacija HE4 i ROMA indeksa u Klinici za tumore Centru za maligne bolesti KBCSM

IZVODI ZADACI (I deo)

- pravac n je zadan s točkom T(2,0) i koeficijentom smjera k=2. (30 bodova)

21. ŠKOLSKO/OPĆINSKO/GRADSKO NATJECANJE IZ GEOGRAFIJE GODINE 8. RAZRED TOČNI ODGOVORI

REAKCIJE ELIMINACIJE

PRAVAC. riješeni zadaci 1 od 8 1. Nađite parametarski i kanonski oblik jednadžbe pravca koji prolazi točkama. i kroz A :

Antene. Srednja snaga EM zračenja se dobija na osnovu intenziteta fluksa Pointingovog vektora kroz sferu. Gustina snage EM zračenja:

Supstituisane k.k. Sinteza Aminokiseline Biodegradabilni polimeri Peptidi. Industrijska primena Aminokiseline Stočarstvo Hiralni katalizatori

Klasa jedinjenja. Sufiks Prefiks Primer. 1 Katjoni -onijum -onio- amonijum. Karboksilne kiseline. -ska kiselina. karboksi- CH 3 etanska k.

PREDNAPETI BETON Primjer nadvožnjaka preko autoceste

IZVODI ZADACI ( IV deo) Rešenje: Najpre ćemo logaritmovati ovu jednakost sa ln ( to beše prirodni logaritam za osnovu e) a zatim ćemo

Računarska grafika. Rasterizacija linije

a M a A. Može se pokazati da je supremum (ako postoji) jedinstven pa uvodimo oznaku sup A.

ADICIJA AMINA NA KARBONILNU GRUPU. AldehIdi i ketoni

Apsolutno neprekidne raspodele Raspodele apsolutno neprekidnih sluqajnih promenljivih nazivaju se apsolutno neprekidnim raspodelama.

Sistemi veštačke inteligencije primer 1

PARCIJALNI IZVODI I DIFERENCIJALI. Sama definicija parcijalnog izvoda i diferencijala je malo teža, mi se njome ovde nećemo baviti a vi ćete je,

radni nerecenzirani materijal za predavanja R(f) = {f(x) x D}

π π ELEKTROTEHNIČKI ODJEL i) f (x) = x 3 x 2 x + 1, a = 1, b = 1;

3/25/2016. Hemijske komponente ćelije

Priveznice W re r R e o R p o e p S e l S ing n s

numeričkih deskriptivnih mera.

MEHANIKA FLUIDA. Isticanje kroz otvore sa promenljivim nivoom tečnosti

UKLANJANJE RASTVORENOG KISEONIKA IZ VODE UZ POMOĆ KATALIZATORA

ENZIMI KAO CILJNA MESTA DEJSTVA LEKOVA. Enzimi kao ciljna mesta dejstva lekova

Kvantitativni odnosi strukture i dejstva

Transcript:

Mehanizmidejstvaenzima Himotripsin

Principi katalize Specifična kiselo-bazna kataliza Elektrostatska kataliza Elektrofilna kataliza Nukleofilna kataliza (kovalentna kataliza)

Nukleofilna kataliza

Opšta kiselo-bazna kataliza log k 2 = A + β pk a Brønsted-ova jednačina log k 2 = A - α pk a Jonizaciono stanje katalizatora odredjuje i efikasnost katalize...

Intramolekularna kataliza Efektivna koncentracija grupe na enzimu: slučaj opšte bazne katalize Hidroliza aspirina efektivna koncentracija karboksilne grupe u aspirinu je 13 M

Efektivna koncentracija nukleofila u intramolekularnoj katalizi

Entropija Translaciona, rotaciona i unutrašnja

Elektrostatska kataliza E = e 1 e 2 /Dr Enzimi mogu da stabilizuju polarna prelazna stanja bolje od vode. 1. Dva ili tri fiksiranja dipola u enzimu mogu da stabilizuju naelektrisanje kao i voda. 2. Jonski par se može stabilizovati fiksiranim dipolima u enzimu efikasnije nego u vodi. Enzimi koriste delove strukture da solvatizuju, a ne vodu.

Kataliza jonima metala a) Elektrofilna kataliza Karboksipeptidaza (polarizacija amida na nukleofilni napad i stabilizacija tetrehedralnog intermedijera). b) Izvor hidroksilnih jona na neutralnom ph (karboanhidraza)

Kovalentna kataliza Elektrofilna kataliza formiranjem Šifove baze Metilenski ugljenik se aktivira i postaje nukleofilan. Karbonilni ugljenik se aktivira na nukleofilni napad zbog snažnog povlačenja elektrona ka protonovanom azotu.

Acetoacetat dekarboksilaza

Izopropil lizin je detektovan u hidrolizatu enzima!

Aldolaza i transaldolaza Katalizuju kondenzaciju aldola i povratnu reakciju uz formiranje Šifove baze (ugljenik je aktiviran u enaminu)

Piridoksal fosfat (elektrofilna kataliza)

Uklanjanje α-vodonika: racemizacija ili transaminacija

β-dekarboksilacija Izmena bočnog lanca

Nukleofilna kataliza

Mehanizam dejstva himotripsina

Mehanizmienzimima katalizovanihreakcija Redosled konverzije različitih kompleksa enzima kojima se S konvertuje u proizvod Brzine kojima se ovi kompleksi interkonvertuju Strukture Kinetičke studije X-ray kristalografija Protein inženjering Detekcija intermedijera Hemijsko obeležavanje i hemijske modifikacije bočnih ostataka u enzimima

Proteaze Serin proteaze Karboksil aspartil(kisele) proteaze Tiol(cistein) proteaze Cink proteaze Monomernienzimi, mase 15 35 kda Adenovirusi(cistein proteaze), pikornavirusi(serin proteaze), retrovirusi(aspartil proteaze). (N-termunus) S1 S1` veza se raskida

Familija serin proteaza - struktura

Serinproteaze Dva domena, katalitička trijada Asp-102, His-57, Ser-195 se nalazi izmedju dva domena Formira se acil-enzim. Nema direktnih dokaza za formiranje tetraedarskog intermedijera Indirektni dokazi: x-ray Enz-Inh kompleksa

Katalitičkatrijadau serinproteazama Katalitička trijada Asp-102, His-57, Ser-195 His jonizuje na ph 6.8 charge-relay system pka Asp neobično niska (2) Protein inženjeringom potvrdjena uloga katalitičke trijade

Doprinosoksianjonvezivnogmestakatalizi Nakon mutageneze katalitičke trijade (Ala), kataliza je smanjena, ali i dalje 1000 puta veća od spontane hidrolize Komplementarnost aktivnog mesta enzima prelaznom stanju reakcije (vibraciona spektroskopija)

Deacilacija Acilacija dodatna mesta vezivanja S1 S5 povećavaju k cat, ali neutiču nakm

Mehanizam dejstva himotripsina

Serin proteaze tetreadarski intermedijer Intermedijer se ne nagomilava tokom reacije Dokazi za njegovo postojanje su samo indirektni

Himotripsin struktura aktivnog mesta

Himotripsin neproduktivno vezivanje

Mehanizam dejstva himotripsina na amidnim supstratima

Hemijska modifikacija His-57 TPCK N-p-toluensulfonil-L-fenilalanin hloromehtilketon modifikuje His-57 himotripsina, ali ne i tripsina TLCK - N-p-toluensulfonil-L-lizin hlorometillketon modifikuje aktivno mesto tripsina, a neaktivan je na himotripsinu

Zimogeni aktivacija himotripsina

Krucijalna uloga Ile-16: eksperiment dvostrukog obeležavanja

Serin proteaze specifičnost prema supstatima (struktura vezivnog džepa) Himotripsin: Ile-16 i Asp-194 formiraju vezivni džep gradeći jonski most u okruženju niske dielektrične konstante

Odnosmehanizmadejstva himotripsinai drugihproteinaza (i) nukleofil napad na karbonilnu grupu + formiranje tetraedarskog intermedijera (ii) pozitivnonaelektrisanavrsta(ili NH-grupekojegrade vodoničnu vezu) povećava susceptibinost karbonilne grupe na nukleofilni napad i stabilizuje tetraedarski intermedijer (iii) donor protona