EPR-S-SL-ST-Ox-I -primene u biološkim sistemima-

Σχετικά έγγραφα
UNIVERZITET U NIŠU ELEKTRONSKI FAKULTET SIGNALI I SISTEMI. Zbirka zadataka

PRAVA. Prava je u prostoru određena jednom svojom tačkom i vektorom paralelnim sa tom pravom ( vektor paralelnosti).

IZRAČUNAVANJE POKAZATELJA NAČINA RADA NAČINA RADA (ISKORIŠĆENOSTI KAPACITETA, STEPENA OTVORENOSTI RADNIH MESTA I NIVOA ORGANIZOVANOSTI)

3.1 Granična vrednost funkcije u tački

OPŠTA TEORIJA ELEKTRONSKE PARAMAGNETNE REZONANCIJE

Osnovni primer. (Z, +,,, 0, 1) je komutativan prsten sa jedinicom: množenje je distributivno prema sabiranju

SISTEMI NELINEARNIH JEDNAČINA

SEKUNDARNE VEZE međumolekulske veze

Računarska grafika. Rasterizacija linije

Kontrolni zadatak (Tačka, prava, ravan, diedar, poliedar, ortogonalna projekcija), grupa A

IZVODI ZADACI ( IV deo) Rešenje: Najpre ćemo logaritmovati ovu jednakost sa ln ( to beše prirodni logaritam za osnovu e) a zatim ćemo

Elementi spektralne teorije matrica

41. Jednačine koje se svode na kvadratne

I.13. Koliki je napon između neke tačke A čiji je potencijal 5 V i referentne tačke u odnosu na koju se taj potencijal računa?

IZVODI ZADACI (I deo)

KVADRATNA FUNKCIJA. Kvadratna funkcija je oblika: Kriva u ravni koja predstavlja grafik funkcije y = ax + bx + c. je parabola.

HEMIJSKA VEZA TEORIJA VALENTNE VEZE

Apsolutno neprekidne raspodele Raspodele apsolutno neprekidnih sluqajnih promenljivih nazivaju se apsolutno neprekidnim raspodelama.

Računarska grafika. Rasterizacija linije

Obrada signala

Iskazna logika 3. Matematička logika u računarstvu. novembar 2012

DISKRETNA MATEMATIKA - PREDAVANJE 7 - Jovanka Pantović

Kaskadna kompenzacija SAU

numeričkih deskriptivnih mera.

IspitivaƬe funkcija: 1. Oblast definisanosti funkcije (ili domen funkcije) D f

PARCIJALNI IZVODI I DIFERENCIJALI. Sama definicija parcijalnog izvoda i diferencijala je malo teža, mi se njome ovde nećemo baviti a vi ćete je,

Ispitivanje toka i skiciranje grafika funkcija

2log. se zove numerus (logaritmand), je osnova (baza) log. log. log =

Osnovne teoreme diferencijalnog računa

Pismeni ispit iz matematike Riješiti sistem jednačina i diskutovati rješenja sistema u zavisnosti od parametra: ( ) + 1.

ASIMPTOTE FUNKCIJA. Dakle: Asimptota je prava kojoj se funkcija približava u beskonačno dalekoj tački. Postoje tri vrste asimptota:

Elektron u magnetskom polju

MATRICE I DETERMINANTE - formule i zadaci - (Matrice i determinante) 1 / 15

Zadaci sa prethodnih prijemnih ispita iz matematike na Beogradskom univerzitetu

INTELIGENTNO UPRAVLJANJE

Teorijske osnove informatike 1

NOMENKLATURA ORGANSKIH SPOJEVA. Imenovanje aromatskih ugljikovodika

RAČUNSKE VEŽBE IZ PREDMETA POLUPROVODNIČKE KOMPONENTE (IV semestar modul EKM) IV deo. Miloš Marjanović

FTN Novi Sad Katedra za motore i vozila. Teorija kretanja drumskih vozila Vučno-dinamičke performanse vozila: MAKSIMALNA BRZINA

Elektrotehnički fakultet univerziteta u Beogradu 17.maj Odsek za Softversko inžinjerstvo

Inženjerska grafika geometrijskih oblika (5. predavanje, tema1)

KVADRATNA FUNKCIJA. Kvadratna funkcija je oblika: Kriva u ravni koja predstavlja grafik funkcije y = ax + bx + c. je parabola.

PT ISPITIVANJE PENETRANTIMA

4.7. Zadaci Formalizam diferenciranja (teorija na stranama ) 343. Znajući izvod funkcije x arctg x, odrediti izvod funkcije x arcctg x.

Eliminacijski zadatak iz Matematike 1 za kemičare

Sistemi veštačke inteligencije primer 1

S t r a n a 1. 1.Povezati jonsku jačinu rastvora: a) MgCl 2 b) Al 2 (SO 4 ) 3 sa njihovim molalitetima, m. za so tipa: M p X q. pa je jonska jačina:

18. listopada listopada / 13

10. STABILNOST KOSINA

2 tg x ctg x 1 = =, cos 2x Zbog četvrtog kvadranta rješenje je: 2 ctg x

MATEMATIKA 2. Grupa 1 Rexea zadataka. Prvi pismeni kolokvijum, Dragan ori

OM2 V3 Ime i prezime: Index br: I SAVIJANJE SILAMA TANKOZIDNIH ŠTAPOVA

ELEKTROTEHNIČKI ODJEL

Prvi kolokvijum. y 4 dy = 0. Drugi kolokvijum. Treći kolokvijum

3. razred gimnazije- opšti i prirodno-matematički smer ALKENI. Aciklični nezasićeni ugljovodonici koji imaju jednu dvostruku vezu.

5 Ispitivanje funkcija

Dvanaesti praktikum iz Analize 1

Trigonometrijske nejednačine

Pošto pretvaramo iz veće u manju mjernu jedinicu broj 2.5 množimo s 1000,

Mašinsko učenje. Regresija.

IZVODI ZADACI (I deo)

Klasifikacija blizu Kelerovih mnogostrukosti. konstantne holomorfne sekcione krivine. Kelerove. mnogostrukosti. blizu Kelerove.

STATIČKE KARAKTERISTIKE DIODA I TRANZISTORA

OBRTNA TELA. Vladimir Marinkov OBRTNA TELA VALJAK

OSNOVI ELEKTRONIKE VEŽBA BROJ 1 OSNOVNA KOLA SA DIODAMA

Ovo nam govori da funkcija nije ni parna ni neparna, odnosno da nije simetrična ni u odnosu na y osu ni u odnosu na

( , 2. kolokvij)

Operacije s matricama

FTN Novi Sad Katedra za motore i vozila. Teorija kretanja drumskih vozila Vučno-dinamičke performanse vozila: MAKSIMALNA BRZINA

Prediktor-korektor metodi

SEMINAR IZ KOLEGIJA ANALITIČKA KEMIJA I. Studij Primijenjena kemija

Linearna algebra 2 prvi kolokvij,

100g maslaca: 751kcal = 20g : E maslac E maslac = (751 x 20)/100 E maslac = 150,2kcal 100g med: 320kcal = 30g : E med E med = (320 x 30)/100 E med =

a M a A. Može se pokazati da je supremum (ako postoji) jedinstven pa uvodimo oznaku sup A.

Cauchyjev teorem. Postoji više dokaza ovog teorema, a najjednostvniji je uz pomoć Greenove formule: dxdy. int C i Cauchy Riemannovih uvjeta.

Zavrxni ispit iz Matematiqke analize 1

SPEKTROSKOPIJA SPEKTROSKOPIJA

Betonske konstrukcije 1 - vežbe 3 - Veliki ekscentricitet -Dodatni primeri

Nuclear. Magnetic. Resonance. Rezonantna apsorpcija radiotalasnog zračenja od strane. nalaze u magnetnom polju

Trigonometrija 2. Adicijske formule. Formule dvostrukog kuta Formule polovičnog kuta Pretvaranje sume(razlike u produkt i obrnuto

M086 LA 1 M106 GRP. Tema: Baza vektorskog prostora. Koordinatni sustav. Norma. CSB nejednakost

Novi Sad god Broj 1 / 06 Veljko Milković Bulevar cara Lazara 56 Novi Sad. Izveštaj o merenju

OBLAST DEFINISANOSTI FUNKCIJE (DOMEN) Pre nego što krenete sa proučavanjem ovog fajla, obavezno pogledajte fajl ELEMENTARNE FUNKCIJE, jer se na

Matematika 4. t x(u)du + 4. e t u y(u)du, t e u t x(u)du + Pismeni ispit, 26. septembar e x2. 2 cos ax dx, a R.

XI dvoqas veжbi dr Vladimir Balti. 4. Stabla

Antene. Srednja snaga EM zračenja se dobija na osnovu intenziteta fluksa Pointingovog vektora kroz sferu. Gustina snage EM zračenja:

( ) ( ) 2 UNIVERZITET U ZENICI POLITEHNIČKI FAKULTET. Zadaci za pripremu polaganja kvalifikacionog ispita iz Matematike. 1. Riješiti jednačine: 4

radni nerecenzirani materijal za predavanja R(f) = {f(x) x D}

Konstruisanje. Dobro došli na... SREDNJA MAŠINSKA ŠKOLA NOVI SAD DEPARTMAN ZA PROJEKTOVANJE I KONSTRUISANJE

Reverzibilni procesi

APROKSIMACIJA FUNKCIJA

MEHANIKA FLUIDA. Isticanje kroz otvore sa promenljivim nivoom tečnosti

PID: Domen P je glavnoidealski [PID] akko svaki ideal u P je glavni (generisan jednim elementom; oblika ap := {ab b P }, za neko a P ).

PARNA POSTROJENJA ZA KOMBINIRANU PROIZVODNJU ELEKTRIČNE I TOPLINSKE ENERGIJE (ENERGANE)

III VEŽBA: FURIJEOVI REDOVI

Riješeni zadaci: Nizovi realnih brojeva

I Pismeni ispit iz matematike 1 I

Pismeni ispit iz matematike GRUPA A 1. Napisati u trigonometrijskom i eksponencijalnom obliku kompleksni broj, zatim naći 4 z.

1 Afina geometrija. 1.1 Afini prostor. Definicija 1.1. Pod afinim prostorom nad poljem K podrazumevamo. A - skup taqaka

5. Karakteristične funkcije

Transcript:

EPR-S-SL SL-ST-Ox-I -primene u biološkim sistemima- Miloš Mojović

Elektron Paramagnetna Rezonancija OSNOVNI PRINCIPI I NEKE PRIMENE EPR je rezonantna apsorpcija mikrotalasnog zračenja od strane nesparenog elektrona u prisustvu magnetnog polja Terminologija Electron Paramagnetic Resonance (EPR) Electron Spin Resonance (ESR) Electron Magnetic Resonance (EMR) EPR = ESR = EMR

EPR opšti princip Energija M s ±½ M s = +½ ΔE=hν=gβB ΔB pp B = 0 B > 0 M s = -½ Magnetno polje (B) h Plankova konstanta 6.626196 x 10-34 Js ν frekvencija (GHz) g g-faktor (približno 2.0) β Borov magneton (9.2741 x 10-24 J/T) B magnetno polje (Gauss ili T) hν = gβb ν= (gβ/h)b = 2.8024 x B MHz za B = 3480 G ν = 9.75 GHz (X-band) za B = 420 G ν = 1.2 GHz (L-band) za B = 110 G ν = 300 MHz (Radiofrekvencija)

Kako se može e dobiti EPR signal? Drži i se konstantna mikrotalasna frekvencija a kontinualno se menja magnetno polje (starije CW mašine) Na konstantnom magnetnom polju primeni se puls elektromagnetnih talasa (novije mašine) analogno FT NMR Razvoj pulsnih EPR spektrometara je dugo bio ograničen nepostojanjem elektronike koja radi u nanosekundnim režimima i koja može e da registruje FID koji potiče e od relaksacija elektrona (mikrosekunde ili manje).

Shema EPR spektrometra

EPR cavity (rezonator( rezonator)

Princip detekcije signala u EPR spektroskopiji modulacija magnetnog polja Modulacija magnetnog polja skenira apsrorpcionu liniju i EPR spektar je prvi izvod apsorpcione linije ne da može

Klasični EPR instrument

Pulsni EPR FID Spektar

Pitanje: Čemu snimati spektar nesparenog elektrona i za to koristiti instrumente koji su jako skupi, ako se dobije samo ovo..?! Odgovor: Pitanje ne uzima u obzir različite ite interakcije spinova u sistemu i mogućnosti da se iz toga izvuku informacije o sistemu koji se istražuje

EPR Hamiltonijan Opšti princip čestice sa nesparenim spinovima rezonantno apsorbuju elektromagnetno zračenje kada se nalaze u magnetnom polju Ukupni Hamiltonijan H m = H BS + H BI + H SS + H IS magnetna spinska energija H BS H BI H SS H IS H Ee H Ek H e = H Ee + H Ek + H Q elektrostatička ka energija BS - Zemanova energija elektronskih spinova BI - Zemanova energija nuklearnih spinova SS - interakcija elektronskih spinova sa elektronskim spinovima - interakcija elektronskih spinova sa nuklearnim spinovima Ee - interakcija elektrona sa spoljašnjim električnim poljem Ek - interakcija jezgra sa spoljašnjim električnim poljem H Q - električna kvadrupolna interakcija

Elektron S (½) Jezgro I (½) Hiperfino o sprezanje Dodatno cepanje linija usled interakcija elektronskih i nuklearnih spinova M S =±½ M s +½ M I +½ -½ ΔE 1 ΔE 2 a -½ -½ +½ dublet B E = gβbs z + (ha 0 )S z I z E = gβbs z + (a)s z I z (ha 0 (Hz) -> a (G) g-faktor) Izborna pravila ΔM S = ±1 (elektron) ΔM I = 0 (jezgro) ΔE 1 = gβb + a/2 ΔE 2 = gβb -a/2 ΔE 1 ΔE 2 = a

Elektron S (½) Jezgro I (1) Hiperfino sprezanje M s M I +½ +1 +0-1 a M S =±½ ΔE 1 ΔE 2 ΔE 3 -½ -1 +0 +1 triplet B E = gβbs z + (ha 0 )S z I z E = gβbs z + (a)s z I z (ha 0 (Hz) -> a (G) g-faktor) Izborna pravila ΔM S = ±1 (elektron) ΔM I = 0 (jezgro) ΔE 1 = gβb + a ΔE 2 = gβb ΔE 3 = gβb -a

Tempon Hiperfino cepanje EPR linija 2I + 1 ( 14 N, I=1) Strukturna formula molekula nitroksida = stabilni slobodni radikal EPR spektar Tempona ( 14 N)

Da utvrdimo... Šta će e se desiti ako 14 N zamenimo sa 15 N??? 15 N-PDT EPR spektar 15 N je I=1/2, tj. moguće vrednosti magnetnog momenta su -1/2 i 1/2). Postoje sada dva dozvoljana prelaza i samo 2 linije Zamenom običnog vodonika deuteronima, (manji g N -faktor) manje je super hiper fino cepanje (dodatno se smanjuje širina linija)

Zašto EPR? Možemo detektovati i meriti slobodne radikale i paramagnetne vrste Visoka osetljivost (nanomolarne koncentracije) Nema "pozadinskih" mešajućih signala Kvalitativna & kvantitativna tehnika Načini detekcije Vrste koje imaju nesparen elektron same po sebi Primer: semihinoni, nitroksidi, prelazni metali... Vrste koje se mogu detektovati tehnikom spin-trapinga Vrste: superoksidni, hidroksilni, alkil, NO radikali... Spin-trapovi: DMPO, DEPMPO, EMPO...

Šta se meri pomoću u EPR-a? Pozicija pikova (g-faktor) Multipletnost (hiperfina interakcija) Oblik linije (širina linije, simetrija, itd.) Intenzitet (amplituda/površina pika) širina linije cepanje linija amplituda Sve ovo se koristi kao "otisak prsta" prilikom identifikacije vrste i količine ispitivane vrste

Primeri primene EPR Prelazni metali (Mn, Fe, itd..) Delokalizovani elektroni Spinske probe i spinski obeleživa ivači Slobodni radikali EPRI In vivo EPR spektroskopija

Mangan 55 Mn (I =5/2) 2I+1 pravilo = 6 linija Mn +2 /MgO (1:500) Uklanjanje spin-spin interakcije

Spinske probe i spinski obeleživa ivači Spinske probe stabilni (dugoživeći) slobodni radikali (nitroksidi) koji se ubacuju u sistem da bi se ispitala neka osobina Modifikacija osobina ručka Sterno zaklanjanje reaktivne grupe Spinski obeleživači (spin labels) nitroksidi vezani za druge molekule praćenje ponašanja obeleženih molekula

Spinske probe i obeleživa ivači (EPR spektri) TEMPONE Paramagnetni elektron spin-labela se nalazi u sp 3 orbitali između N i O. I N =1, a I O =0. Jezgro sa spinom 1 ima 3 moguće vrednosti magnetnog momenta (+1,0,-1) pa dolazi do cepanja oba energetska nivoa elektrona (m S =1/2 i m S =- 1/2) na po tri. Iz jednačine E = gβeb, vidimo da razlike u energiji vode ka različitim rezonantnim uslovima. Na osnovu izbornog pravila Δm S =±1 (spinski nivoi) i Δm I =0 (Zemanovi nivoi) moguća su 3 prelaza, pa postoje i 3 linije. +½ +1 +0-1 M I EPR spektar a M S =±½ ΔE 1 ΔE 2 ΔE 3 -½ -1 +0 +1 M I triplet B * Svaka linija je i dodatno proširena usled interakcije sa protonima (I=1/2) iz susednih CH 3 grupa (super hiper fina interakcija), vide se i 13 C (I=1/2) sateliti... ali, polako

Kretanje lipida u membrani Termalni pokreti hidrofobnog dela Uređenost unutrašnjosti membrane Lateralno kretanje lipida difuzija Transverzalno kretanje flip-flop

Fosfolipidne membrane kao modeli za ispitivanje osobina membrana.. Spontano S ili indukovano formiranje fosfolipidnog dvosloja Planarne membrane (black( film) Liposomi (lipidne vezikule) spontano ili sonifikacija SUV (out-in 65-35%) Problem je šta sa krajevima, pa se krajevi zakače za nešto LUV (out-in 50-50%) Small or large unilamellar vesicles MLV Multilamellar vesicles EM multilamelarne Goldžijeve strukture

Lipozomi - uređenost i fazni prelazi EPR spinske probe Selektivno obeležavanje pozicije duž lanca Fazni prelaz = gel (uređeno) neuređeno (tečni kristal) DS u vodi DS u membrani Uticaj pokretljivosti spinske probe na izgled EPR spektra Određivanje faktora uređenosti S fosfolipidnog dvosloja metodom EPR spinskih proba

Šta se dešava sa EPR spektrima spin-labela kada se ugrade u membranu??? C O O N O OH + H 2 O U vodenom rastvoru + Integrisan u membranu 7-DS Ukupan spektar 7DS-a ugradjenog u membranu potpuno odudara od onog iz rastvora. Do toga dolazi zbog anizotropije.

7-DS u membrani Membrana ima delimično no kristalni karakter pa utiču u i g i a anizotropija. Molekul 7-DS 7 pokazuje aksijalnu simetriju i pretpostavka je da može e slobodno da rotira oko te ose pa se efekti anizotropije gube u xy-ravni, tj B loc je ujednačeno eno u toj ravni pa se x i y osa izjednačavaju. Bitno je u kakvom je položaju u odnosu na spoljašnje magnetno polje postavljena osa molekula (paralelna sa z) u odnosu na vektor spoljašnjeg mag. polja. Za g-anizotropiju g važi i da je g =1/2(g x +g y ) i g z =g, a za a anizotropiju a =1/2(a x +a y ) i a z =a Zbog različitih itih g i g, i a i a vrednosti dobijamo različite ite spektre za dve idealne situacije: kada je osa molekula normalna u odnosu na B i kada je paralelna sa B 0,006 0,004 g = ½(gxx + gyy) A = ½(Axx + Ayy) 0,003 0,002 g// = gzz A// = Azz 0,002 0-0,002-0,004 3320 3340 3360 3380 3400 3420 3440 0,001 0-0,001-0,002 32803300332033403360338034003420 0, 0 0 3 0, 0 0 6 0, 0 0 2 0, 0 0 4 0, 0 0 1 0, 0 0 2 2A 0-0 -0, 0,000 12 & -0,0 0 4-0, 0 0 2 3 2 8 3 03 3 2 3 0 0 3 03 3 4 3 0 2 3 03 3 6 3 0 4 3 03 3 3 8 0 6 03 3 4 3 0 0 8 03 3 4 4 2 0 03 3 4 4 2 0 0 2A Naravno, kada je spin-label u membrani mi u jednom uzorku imamo obe situacije pa dolazi do superponiranja spektara i dobija se dobro poznati spektar.

5,7,12-DS u membrani Što je fluidnost veća, molekuli se slobodnije kreću u pa dolazi do postepenog gubitka anizotropije i spektar je sve sličniji onom iz rastvora. Spektri za dve ekstremne situacije postaju identični, ni, a ukupni spektar uži u zašto??? Širina spektralnih linija = (2τ 1 ) -1 + (1 + γ 2 e B 2 1 τ 1 τ 2 ) 1/2 τ -1 2 gde su: τ 1 i τ 2 longitudinalno i transverzalno relaksaciono vreme, B 1 je magnetna komponenta ulaznog zračenja) enja); γ e je žiromagnetni odnos. τ 1 opisuje gubitak magnetizacije, relaksaciju koja nastaje kroz proces gde apsorbovana energija prelazi u toplotu (spin-rešetkaetka relaksacija). τ 2 opisuje gubitak magnetizacije kroz gubitak faze, energija se prenosi sa elektrona na elektron (spin-spin relaksacija) Širina linije je u principu obrnuto proporcionalna brzini relaksacije. Kada je membrana rigidnija, spinovi su bliži i jedan drugome tako da lakše e dolazi do spinske difuzije, a veći i broj sudara doprinosi spin-re rešetkaetka relaksaciji. Relaksacija je tada brža, a linije šire. Kada se poveća a mobilnost molekula (spin-label label-a) a) u membrani relaksacija ide sporije, pa su i linije uže. u Ovo je još jedan faktor, osim anizotropije, koji daje direktnu vezu izmedju fluidnosti membrane i širine spektralnih linija. Fluidnost membrane se povećava od površine prema unutra. Polarne glave su relativno gusto spakovane na površini, međusobno m se privlače e ili odbijaju i interaguju sa vodom u okolini. Od njih se prema sredini membrane pruža(ju) masnokiselinski lanac koji nepolaran. U blizini glave on je slabo pokretan. Međutim M što se ide dalje od polarnog dela, hidrofobni rep je sve slobodniji i tu se može uočiti veća a fluidnost.

Određivanje faznih prelaza lipidnog dvosloja metodom EPR spin obeležavanja Fosfolipidi + Spinska proba T = 20 C 7-DS Gel ispod faznog prelaza S T = 75 C Tečni kristal iznad faznog prelaza temperatura

Lipozomi lateralna difuzija fosfolipida Spin-spin širenje Bliski kontakt spinova dovodi do širenja linije i indukuje da su obeleženi fosfolipidi u kontaktu Pojavljivanje tri linije ukazuje na razblaživanje lateralnom difuzijom

Lipozomi flip-flop flop- fosfolipida Asc na 0 o C 1 Asc na 30 o C 0.5 vreme

EPR i struktura proteina Ili šta sve treba uraditi i koliko se namučiti da bi se dobila struktura proteina, naročito ako je to membranski protein? Od svih proteina oko 30% su membranski proteini Do sada je poznata struktura 25,000 proteina, ali samo 80 membranskih proteina Primeri membranskih proteina a poznate strukture: Fotosintetski rear eakcioni i centri 1988 Nobel Prize in Chemistry: Deisenhofer,, Huber and Michel Rodopsini β-bure membranski proteini Membranski kanali (i.e. KcsA,, AQP) 2003 Nobel Prize in Chemistry: Agre and MacKinnon Citohrome C oksidaze

Šta je problem u određivanju strukture membranskih proteina? Difrakcija X-zraka i NMR su standardnene metode u određivanju strukture proteina Ove tehnike nisu najbolje rešenje enje za određivanje strukture membranskih proteina. Zašto to? X-zraci: nema kristala membranskih proteina, jer je struktura određena interakcijama u membrani NMR: membrane su anizotropni sistemi - NMR spektri visoke rezolucije se mogu dobiti samo za proteine u micelama, ali ne i u lipozomima - Obogaćivanje ivanje sa 13 C and 15 N je neophodno (komplikovano i izuzetno skupo)

Site-Directed spektroskopija Ispitivani protein: protein: M13 coat protein 50 amino kiselinskih ostataka Transmembranski ski protein Spektros troskopija bazirana na site-directed mutagenezi - Kao mesto obelezavanja koristi se Cys - Počinje se sa proteinom bez Cys - Pripremi se mutant sa jednom Cys (relativno bezbedne mutacije Cys zamenjuje Ala, Ser, ili Thr - Cys se obeleži i podobnim obelezivačem em za EPR ili fluorescentnu spektroskopiju - Protein se ubaci u fosfolipidni dvosloj

M13 protein sa prikačenim spinskim obeleživa ivačem Konsekutivno obeležavanje i merenje na pojedinoj lokaciji membrana-voda interface Pretpostavljena struktura

Obeležavanje spinskim obeleživa ivačem ZNAČI: Na Cys se nakači spin-label Može se raditi i izmena Ala, Ser ili Thr sa Cys (pravljenje proteina-mutanata) Analiza EPR spektara dobijenih labela može nam pomoći da odredimo strukturu membranskih proteina. Evo kako se to radi... 1 50 O N N O H S O N N O S O + O 5-maleimido-proxyl spin label Cys EPR aktivna AK Reakcija maleimido-proxyl spin labela sa proteinom koji ima cisteine

Šta se događa sa EPR spektrima? EPR informacije u zavisnodti od pokretljivosti i polarnost p okoline O N N O H S O N N O S O + O 5-maleimido-proxyl spin label Cys EPR aktivna AK Slobodna rotacija Ograničena anizotropna rotacija

EPR spektar proteina-mutanata 16 19 23 25 29 Polarni region 34 42 46 49 Gustina pakovanja oko spin-labela koji je zakačen za protein, srazmerna je 2A ZZ u EPR spektru. Upotrebom mutant-proteina (zamenom određenih AK sa Cys i kačenjem spin-labela, može se dobiti korisna informacija o okruženju. 2A zz

Oksimetrija ZAŠTO MERITI KISEONIK U BIOLOŠKIM SISTEMIMA? In vitro metabolizam, slobodni radikali In vivo - radioterapija tumora, ishemija, inflamacije, reperfuzije Kako? Klasičan pristup su elektrode ili merenje proizvodnje (gubitka) Teško ili nemoguće je ovako meriti unutarćelijski kiseonik Princip: EPR oksimetrija - Kiseonik je paramagnetik i menja (širi)( EPR linije Redukcija nitroksida je usporena u prisustvu kiseonika EPR senzori Nitroksidi i partikule (ugalj, mastilo, LiPc-kristal kristal litijum ijum ftalocijanina)

Kalibraciona kriva litijum ftalocianina (LiPc) na PO 2. (A) Primer kako se širina EPR linije LiPc menja sa pritiskom (0 mm Hg i 35.6 mm Hg O 2 ). (B) Kalibraciona kriva LiPC za različite PO 2 pokazuje linearnost.

EPR oksimetrija -biljke- Princip: Vrši se merenje širine EPR linije neke spinske probe koja zavisi od po 2 N 2 Kalibracija probe (širina linije vs. po 2 ) Profil koncentracije kiseonika duž membrane tilakoida (selektivno obeležavanje pozicija u membrani)

Šta se može e raditi metodom EPR kada su u pitanju kratkožive iveći i (μs)( ) slobodni radikali? EPR spin-trapping Spin trap = zamka za kratko živeće e radikale Metoda koja se koristi za hvatanje katkožive ivećihih radikalskih vrsta. Korste se substance koje zovemo spin-trapovi (hvatači i spinova) S.T. u reakciji sa slobodnim radikalima prave stabilnije EPR aktivno jedinjenje koje se može detektovati standardnom EPR metodom.

EPR spin-trapovi Ima ih veliki broj i predstavljaju veoma unosan biznis Cjena sitnica! (0.5g = 1000 ) Npr.: 0.5g Au 10 Svake godine na tržištu se pojavi novi trap koji je neznatno bolji od prethodnog Princip rada spin-trapova CH 3 CH 3 OH CH 3 N H + OH CH 3 N H O O Spin-trap (EPR neaktivna vrsta) Radikal Spin-adukt (EPR aktivna vrsta)

Postoje razni spin-trapovi Razlikuju se: po hemijskoj strukturi bočne grupe, stabilnosti trapa i adukata, EPR spektru, rastvorljivosti, načinu čuvanja. Neki su specifični za određene radikale, ali idealni trap bi trebalo da razlikuje više radikala koji se simultano proizvode u istom sistemu

Eksperimenti i kompjuterske simulacije su ukazale na postojanje reaktivnog vodonika (H-radikal) kod različitih bioloških sistema (Mojović et.al.) Postojanje reduktivne vrste u produkciji radikala ukazuje na moguće regulacione mehanizme u toku oksidatvnog stresa, ulogu radikala u nekim bolestima itd. Primer: uloga slobodnih radikala kod amiotrofične lateralne skleroze (ALS) Normalna osoba ALS pacijent Kompjuterska simulacija OH i H radikala Kod ALS pacijenata postoji povećana produkcija zlih OH radikala koja nije regulisana proizvodnjom dobrih H radikala EPR spin-trap spektri likvora

Prednosti i mane EPR spin-trappinga PREDNOSTI Možemo detektovati veoma kratkožive iveće radikalske vrste Možemo razlikovati više vrsta koje se prave u istom sistemu Potrebne male količine ine uzorka (μl)( Relativno jednostavna eksperimentalna tehnika MANE Relativno su skupi Većina se mora naknadno prečistiti što dodatno povećava cenu Spektri različitih itih adukata se često delimično preklapaju Simulacije EPR spektara je dosta teško izvesti sa 100% tačno nosti

IN VIVO EPR MRI EPR

Da li možemo koristiti EPR u biološkim sistemima "in vivo" ili"ex vivo"? Da! Ali postoji jedan "mali" problem! Biološki uzorci su "vodeni" i zbog toga podležu nespecifičnoj (nerezonantnoj) apsorpciji mikrotalsne energije, zato je dubina prodiranja mikrotalasa u uzorak mala. Ako povećamo mikrotalasnu snagu, dubina prodiranja se povećava ali... Problem dubine prodiranja se može rešiti i smanjenjem frekvencije mikrotalasa. Frekvencija Dubina prodiranja ~300 MHz ~750 MHz 1-22 GHz ~3 GHz 9-10 GHz > 10 cm 6-88 cm 1-1.51.5 cm 1-33 mm 1 mm Biološki uzorar Ljudi, pacov Pacov, miš Miš, srce pacova Mišiji iji rep, koža Uzorci "in" vitro" (~100 μl) Da, ali smanjenje frekvencije smanjuje vrednost B 0 a time i osetljivost hν = gβb Nema EPRI za ljude i verovatno ga nikada neće ni biti :( o EM zračenje slabi zbog dielektričnih gubitaka (B prolazi ali ne E jer mi nismo čista voda)

EPRI (Electron Paramagnetic Resonance Imaging) Dobijanje slika pomoću EPR-a a ( Spectral-spatial CW-EPRI): Zavisnost oblika EPR signala iz 2 rastvora nitroksida od smera gradijanta magnetnog polja B. Kako saznati prostorni polozaj pramagnetnih vrsta? Princip je menjati orjentaciju gradijenta magnetnog polja u odnosu na uzorak i zatim uraditi rekonstrukciju slike. Kako napraviti sliku u više od 1 dimenzije? Praviti gradijente B duž svih osa (X,Y,Z). Problemi? Uzorci često nemaju samo 1 pik (kao H u NMR-u) a i širina signala utiče na preklapanje pikova. Sta je dobro? Može se praviti image bilo čega što utiče na EPR spektar (ne samo 3D image već + nova dimenzija kao osobina sistema ). Spectral-spatial X-band X CW-EPR image

Kako to stvarno izgleda?

MRI v.s.. EPRI Postoje bitne razlike u osobinama jezgara i elektrona (žiromagnetni odnosi, hiperfine konstante cepanja, relaksaciona vremena). Zbog toga se MRI uvek izvodi u pulsnom režimu (RF-puls + frekventni, fazni i "slice" gradijenti magnetnog polja, uz razne sekvence tipa spin-eho eho.., 2D FT i rekonstrukcije slike iz voksela. EPRI se često izvodi u CW režimu uz rotirajuće magnetne gradijente. MRI ima do 10 6 puta veću koncentraciju spinova u sistemu, kao i do 10 6 duže relaksaciono vreme za te iste spinove. Prosečna širina EPR pikova je znatno veća u odnosu na raspolo položiv opseg magnetnog polja u odnosu na NMR signal H koji se posmatra u MRI. Pulsni EPRI zato zahteva vrlo preciznu i naprednu elektroniku uz brze računare unare koji će zadavati sekvence i dešifrovati dobijene rezultate.

EPRI primena EPR i tumori in vitro Objekat: Sferoidi (model za solidne tumore) 200μm Cilj: Ispitivanje viabilnosti tumora Tehnika: X-band EPRI Senzor: 15 N-PDT (sve ćelije) Kontrastni agens : Fe ( mrtve ćelije) 15 N-PDT ulazi svuda a Fe-kompleks ulazi samo u mrtve ćelije (a ne i u žive).

In vivo spektroskopija -površinska zavojnica- - Princip EPR snimanja putem korišćenja površinske zavojnice - Dubina prodiranja bitno zavisi od frenvencije mikrotalasa (dielektrične osobine i E vektor EM zračenja) - Koriste se manje frekvencije mikrotalasa (sve smo bliže RF oblasti) (L, S, X band). - Da se podsetimo: 1-2 GHz (L-oblast), 2-4GHz (S-oblast), 8-10 GHz (X-oblast), 35 GHz (Q-oblast) i 95 GHz (W-oblast) Surface-coil resonator

IN VIVO spektroskopija -KOŽA- Slobodni radikal idukovan antralinom (lek za psorijazu) - Psorijaza: Autoimuno oboljenje kože čili je uzrok nepoznat (veruje se da ima genetsku komponentu). - Jedan od načina tretmana protiv ove bolesti je tretman pomadama koje sadrže dithranol (anthralin). - Proučava se delovanje Antralina koji u interakciji sa određenim supstancama u koži stvara slobodne radikale. Kako ih izmeriti? - Koristi se L-band EPR oblast i površinska zavojnica koja se stavlja direktno na kožu - Upotrebljava se eksperimentalni nude-mouse Osoba obolela od psorijaze Nude mouse

EPR oksimetrija po 2 u srcu - Zašto i kako meriti kisonik? - Ishemija, hiperoksija, reperfuzija i oksidativni stres su najvažnije stvari koje treba pratiti u živim sistemima. Uzročnici su i posledica velikog broja patoloških stanja. - Moze li nam ovde MRI pomoći? Teško. - Langendorfova preparacija srca. U rastvor za preparaciju ubačen nitroksid. - Signal se razlikuje jer odr. delovi srca imaju razl. količinu O 2 (paramagnetik) - Uraditi EPRI snimanje, a kao dimenziju uzeti širinu EPR linije Ex vivo EPRI merenja u uslovima perfuzije nitroksidima

EPR oksimetrijao ksimetrija. Lokalizovane (implantirane) EPR oksimetrijske probe (po 2 ) Simultano merenje po 2 na 2 mesta u mozgu korišćenjem LiPC kristala -Subjekat: Mongolski gerbils -Nekopletan Willisov krug dozvoljava indukciju ishemije samo jedne strane mozga unilateralnom karotidnom okluzijom -Metod za praćenje ishemije Gradijant magnetnog polja EPR spektar dva LiPC kristala u dva režnja odražava razliku po 2 nakon unilateralne karotidne okluzije. T 2 * - nagnašena MRI slika mozga u koji su implantirani LiPC (po jedan u stvaki rezanj mozga). Tamne regije su veće odveličine LiPC kristala (<100 μm) zbog namerno izazvanih artefakata susceptibilnosti

In vivo EPR oksimetrija, obeležavanje avanje, tumori, radioterapija Količina kiseonika u tumoru je ključni faktor za uspešnu radioterapiju Tumori: Zračenjem izazvan fibrosarcoma RIF-1 i mammary adenocarcinoma MTG-B koji su zatim implanirani u miša. Površinske zavojnice EPRS na 1.2 GHz; Oksimetrijska proba: Fusinit Zračenje: jedna doza od 20 Gy 20 Gy Post-radijaciona deoksigenacija i reoksigenacija tumora zavisi od tipa tumora (prokrvljenosti?) Personalizovana radioterapija? Ali... $$$$$$$ po pacijentu

Kombinovana MRI & EPRI tehnika za proučavanje ROS upotrebom hidroksilamina NMR slika EPR slika EPR i NMR slike miša koji je doživeo šlog Preklopljena EPR/NMR slika - Oksidativni stres koji je izazvan reperfuzijom. - EPR signal dobija se tek oksidacijom hidroksilamina koji nije EPR aktivna vrsta a koji se injektuje u miša pre ishemije. -Poređenjem MRI i EPRI slike može se lokalizovati ishemično mesto i izvršiti kiseonično mapiranje. Kisonično mapiranje mišjeg mozga tokom ishemije